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transcript sequence >TCONS_00012895 ID=TCONS_00012895|Name=TCONS_00012895|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1418bp ggaaaatttagttttgtGTGTCGCTGTAAATCGTTGAATGAATGAAGAAA AAGTCTTGACTGGAgaaatgtatttttgaaaatattatcttttttgtttt gatcataATTGAAAAATGGTGGAGAATAATTTGCGATGCATTGCTTTTGT TGCAGTATTGTTTTTTGTATTACAAGGAGCAATGTCAAAGATATTCAACA TCGAGATTTCAGATGGTATTGTGAACCAGAAGATAATCAATGGATCAAGT TACATTACAAAAACGGGCGATTTTACCGTTAAAATATCAGATGAAAAAGG AACAATTCCACTTCCGACAGCGAATGTAGAATCGTTACCTAGTTCATGTA ATAGAATTTCTGGTGAACCTGCCCCTAACCTTTTCTGTGTCAATACAGCT TCTGGAGACATTTATGTCACGACAGTGGCGGATTTTGAATATCTTGGTGG TCAGAATTTCACTTTATCCATAGCTGTAAAAATTGTTAATTCACCAGCAG AAACGACCACTTTAAACGTACATTTCACGGATGAATGTCGAGCTACAAGC AAACCATACCAGGATCTTCTAGATAACGAATGCCAACTTTTTAGTAATAC TATTACGAGGGGTTTTGGACTTACCGCGGGTAGTAAATCGACAGGTTTTC GATATACCAGACGGTCTTTTGAACGGTTGCTTATAGATATGACTATTCTA CGATCGACTTTCGGTAACCGGGTTGGCAATGCTACTCTACTTATAACGGA GATCTTGAATGAAGGTACGCGAGAAATCTCATTAGATTCAATTCCTTTCG TGGTACCAGAAGGAACCAGTGATGTTACAGTGCCGTTAAGTTTTAAAGAC AATGCCGAACTCAGTAGATCTTTCCGATTTACAATCAGCTTTGGAGGCTC AGCACTTCTTCTCAATACAAATTCTATTAAATTACGAGAAATCATATCGT GGAATCAATGCAGAAGGCCGGAATGTGTTTCTGCGTATAAAGAATGGAAA AAGCACGTGGCAACATCTGAACCTAAATGCAAGAAAGATACTGGAAATGT TGAACGGTATTTTGAGAGATGCATAAATTTGGATCCAGTATTTACAACAA CTCCCTTGATTGATGGCACCATGATCGATAACTGCATGTACCGTTCAATG TTTGCTTTCGATCAAAAATATACATATCTTTTAATTAACGGCGTTCGAcg agattttgaattaattctaCCGCAACGCAAAAAGCGTTCATTGGATGAAA ACCATTTCACTGCCGGGTTGCCTAGATACCAAATAATGTCATTCAATGAC GTTGGAGATGTTCaatgcgccatctttgatcCTGAACGCATGAAAGCTCC TGCTCTTTCGAACGTCACTAGATTTTCCTTCGCCCTACCAAGATTCGCGG GAACACCTACATATAATG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000157:139046..152875- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00012895 ID=TCONS_00012895|Name=TCONS_00012895|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13830bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000157:139046..152875- (Clytia hemisphaerica) GGAAAATTTAGTTTTGTGTGTCGCTGTAAATCGTTGAATGAATGAAGAAA
AAGTCTTGACTGGAGAAATGTATTTTTGAAAATATTATCTTTTTTGTTTT
GATCATAATTGAAAAATGGTGGAGAATAATTTGCGATGCATTGCTTTTGT
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CTATATTTTTCTAATGTGATTGTTTTGATTTACAGCCGCCATCTTTATGG
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CTATCATAGAGTAGCTAAAACGTCAGGACATAAAAGTAAACAACCATGGT
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AATCTTCTGTAGACGTTTTGAAATCTTTACTGGTACTAATATTTATTCCT
TGCTGCATTCCTGTATATTATATAATAACACTATAGTCTTGTTTCTTCTT
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TGGCATTCTTAGCTTGAGTAGCAAAATTCCATGATGGTGATATTCTTAGC
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CAAACTCTTGATTACAGATTCCTTATTTAGACTTGGGCACCATAAATCCA
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GACTTTTCTTGTTAATTCGAACGCTAATACATCTTTTCAACCGTAGTCGC
GCGGTCAGGCGCGTCCGACTTTATTATATTTAATTATCTTCCTAAACTCG
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TGAAAATTTCTATTGTAATACTGGAAAGGCTAGTTTACTTTACCAAACCG
AAAAACCCGTTTGACTGTTTTTACAAATGATCACCAAGTTCCTACTAGTA
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TCATGTAATAGAATTTCTGGTGAACCTGCCCCTAACCTTTTCTGTGTCAA
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TTGGTGGTCAGAATTTCACTTTATCCATAGCTGTAAAAATTGTTAATTCA
CCAGCAGAAACGACCACTTTAAACGTACATTTCACGGATGAATGTCGAGC
TACAAGCAAACCATACCAGGATCTTCTAGATAACGAATGCCAACTTTTTA
GTAATACTATTACGAGGGGTTTTGGACTTACCGCGGGTAGTAAATCGACA
GGTTTTCGATATACCAGACGGTCTTTTGAACGGTTGCTTATAGATATGAC
TATTCTACGATCGACTTTCGGTAACCGGGTTGGCAATGCTACTCTACTTA
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CCTTTCGTGGTACCAGAAGGAACCAGTGATGTTACAGTGCCGTTAAGTTT
TAAAGACAATGCCGAACTCAGTAGATCTTTCCGATTTACAATCAGCTTTG
GAGGCTCAGCACTTCTTCTCAATACAAATTCTATTAAATTACGAGAAATC
ATATCGTGGAATCAATGCAGAAGGCCGGAATGTGTTTCTGCGTATAAAGA
ATGGAAAAAGCACGTGGCAACATCTGAACCTAAATGCAAGAAAGATACTG
GAAATGTTGAACGGTATTTTGAGAGATGCATAAGTAAGAATCACTCAAAT
CTGTAAAATCTCACTTTTGTAATGTTTTGGCTTCTCGATGTTTACTACAG
ATGATACCCAGGGTACTAGGGTTGGCAGATGAGGGGTATATGTGGATGGG
ACCTCCAAAAACCGACCCTTAGAGAGACTTTTTTGAAAGAAAAATTCTTT
GATTTTTGAAAAATCTTCTAAGGTCTTAAAGTATTTGTGATCTGTTTCTT
TAATATAATTTTAACTGTATTAAAAGCACTACTGTATTTTAGAAATTTTT
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ATGATTCCCACTTTTTTTATAAAAGTATTACTTGAAGACTTGAAGAAATA
TTATCACCTTTGCATTGCTCTCAAAACGAGGCAGTCGTTGCACTTAGAAT
AATTCATAAAAAGGCCCATACCACTATGACTTTGTATTGATGTTATTTTT
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ATCCAGTATTTACAACAACTCCCTTGATTGATGGCACCATGATCGATAAC
TGCATGTACCGTTCAATGTTTGCTTTCGATCAAAAATATACATATCTTTT
AATTAACGGCGTTCGACGAGATTTTGAATTAATTCTACCGCAACGCAAAA
AGCGTTCATTGGATGAAAACCATTTCACTGCCGGGTTGCCTAGATACCAA
ATAATGTCATTCAATGACGTTGGAGATGTTCAATGCGCCATCTTTGATCC
TGAACGCATGAAAGCTCCTGCTCTTTCGAACGTCACTAGATTTTCCTTCG
CCCGTGAGTATTTTAAATTCTTTTTTCCTGACGAATAAGGGTACTGTAAG
GATTATTGAATGACTTTTGTAAACAAAATAATGTTATTCATATATCACCA
TACTCCGTATAAAACTCTGGTCTGGAAGCCTATTGTTTTAACTATTTGCT
ATCGCTTCCCTTCCTGGGATTGGTTCAACATATAATCACGTGATCAAAAA
TGGAACAAGACAAACTACCTCAAAAAAGTTCAATGTAGAACAATAAAAAG
AAACAAAAGGCTTCCAGACCGGGGAATTTCAATACAGATTCCACCTACAT
GTCTAAAAAACGACGACAGTCGTTTTTTCCTGTATATATTTTTCTTGTTC
TTACAAGCGTGCACGTTACATAATTTCATTGCTGTCAACAGACCCGGCGG
AAGCGGGGAGACTGGAGAGACTTAAGCCTCCCCACTTTTGAGCAAAAGTA
TTTTTTTCTCAAATTCCTAGCGAATTTTATCTCATTTTGAGCCTTCAACT
TCCCCACTTTTACGGTTTTTCCGCCGGGTCTTGTTAAGATACTACTAGTA
CTATGCTGTGCATAAACAATATAGATATCCTTTTCCCCTTCTTTCAGTAC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00012895-exon-sc0000157-1575043694:152700..152875 | TCONS_00012895-exon-sc0000157-1575043694:152700..152875 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012895-exon-sc0000157-1575043694:140543..141442 | TCONS_00012895-exon-sc0000157-1575043694:140543..141442 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012895-exon-sc0000157-1575043694:139673..139981 | TCONS_00012895-exon-sc0000157-1575043694:139673..139981 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012895-exon-sc0000157-1575043694:139046..139078 | TCONS_00012895-exon-sc0000157-1575043694:139046..139078 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012895-exon-sc0000157-1510915933:152700..152875 | TCONS_00012895-exon-sc0000157-1510915933:152700..152875 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012895-exon-sc0000157-1510915933:140543..141442 | TCONS_00012895-exon-sc0000157-1510915933:140543..141442 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00012895-exon-sc0000157-1510915933:139673..139981 | TCONS_00012895-exon-sc0000157-1510915933:139673..139981 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000157 | supercontig | sc0000157:139046..152875 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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