TCONS_00013172 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00013172
Unique Name	TCONS_00013172
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	7411

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000162:472705..498459-

transcript sequence

>TCONS_00013172 ID=TCONS_00013172|Name=TCONS_00013172|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7411bp
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GTCAAAACAAATGAAGGGGAAATTCAAGTCGATGTTTGGCAAGAAACCCT
CTGGTGCTCCTTTTGATAAGGAATCTTGCAAAAGTATTATAACCAGAGAA
ATCCTTaagGACATTGATAGATCACAGCCCATTCTTCAACGTATTCGAAA
TTTGAAAGAATTATCCGAAGTTGTCACTGTAAAAGTAATGGAAGAGCATG
AGATTGAGGCACTATTATTCACTGTCAACGATTTATTGGACAAGTCTATA
AGTGGTGATGGAAGACAAGCTGCTTTACAATTTCTCATCGCAATCACTAA
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AAAGTACTGACTGATGATGGTAAAAAATTGGACTATTGTGAACAAATAGG
GCCTTTTCTTGATGGGTTGATGGAAGAAGCACTTGATTCACCAAATGCTG
TGGCATTCCTTGAATACTTGGTGAAGATCGTCCATTACCATTCAAGTTTT
TTGGACAAGAGTATTGTATGTTCCATTGTCAGTAAAACATGTGATTTCTG
CAATAATGCAAATGGAGAACAAGACATAGAGAGTTCCTTACTACTTCTGG
ATGCAACTGTTCGGTACGGTGGTCTGCCAGCAGAAGGGTTACTACCATTG
ATCGAAACTCTTTGCCGGACTGTAAACATTGAACGTTTCTGTCAAAGCAG
CTGGAAGTTGATGAGGAATTTGATTGGAACCAAATTAGGACATACTGCTG
TTTTTATCATGTGTCAAATATTAGAAGACAACCATCACATCCTTGATGTA
ATTCTTCTACGTGGTGCTGTCTTCTTCATCGGTATGAGCATCTGGGGCTC
CAAACGAGTTGCCAGTCTACGGTACTCGCCTCTCCACGTCCTCTCATCCT
TCAAAGTATGCTTGCAGTGTAATCACCATCTGGTGGCTCNGCCTCTCCAC
GTCCTCTCATCCTTTAAAGTATGCTTGCAGTGTAATCACCATCTGGTGGC
TCATGAGGTAGTGCTTTCACTACAACGCCTTGTCAAGAAGTTTGGAGAAG
AACAAGAAATCATCACGTGGGACATACTGATGGATattgttgaaaatatt
cttcacaTGATCGATAGAGGGGATGCTGATAAGACGAGCATCCTTTTCAA
ACAGACACACGAACTTCTCACCAACACTGAGGCTTTATATGTGGAGGAGA
AGTTTTATGGATCAGCAGAGCGATTCTTTAAGATTTTAACAAATTGTGCC
AAAGACAGACCGGAAGAATCTATCTCGACGATTCTTGGTTATTATGAAGA
TCGAATCGATCCAAACACGGTCGAATGGAGTGATATATTTGAACAGATTC
TCATTACTAATTTGAAACAAGAAACGAGAAGTGGCGTCAAAGTTCGTGTC
CTGGAAACTATCAAAAACATTTACTCGAGATATCGACACCGACACGAGGA
TGACATTCTTTCCTATATTCTTCACGGACACGTCAGCGATATGGTGTACG
ATAATGATAAAGACATCCGAAAAAGTGTTGGTTATCTCCTCTCGTACATC
CTCAAACACTGCTGTGCTGACAAATACCCTGAAGTTTTAAAAGTGGTGGC
GGAATTCTTATCTTATATCTCTCTTGGTAAAGATGTGACTCGATTCAATG
TCATGGAAGATATTTCGATTGTTGTTGACGCTCTTATAAACACTTTTGAG
TCTCGACTTTTCGAACCATCAAATATTTACATTGTTGGTATGCTGGAGAT
CCTGATCAAACACTTAAACGATCACTTCACCATCAACATCACTTCCATCG
CTGCCGGAAAAATACGGCGCAAGATTTTCGAACTCTTACTTGCCTTGCGT
TCAAATGAATATCACTTTCTTGGAATCAAGTTGAAAGAAAATGGTGTCAA
ATTCTCAACACATGCAATATTCAAACCTCTGGATAGCGAAATTTTCAATA
ACTCTGCTTCACGTCCTTACTTCGTGGATTTTGATTTCCAACAAGCGTTC
GAGGGTTTgttgaaatgtttgaaaaacgaACTTGATTGGAATGTCCTTGA
ACTTGTTTTGAAAAGTATTGTCAAACAGTTAGAAGATAAAAATTTGTACG
TCTATTGTCAATGCAACATGAATAAGTTATGCGCAGTCCTCTGTACCATC
ATCAACGATAAAACCTTcttcaacaaaatgaaaaacgtCCCGACTACGAT
GACCATGtctgaattacgtaatcttatcTTCCCGATTCTCTCCACTTTGT
CAACATATCATTCATACTTGGTCAAAGATCGTCAAGTAGAGTTATTGACC
TCTATTGAGTTTGGATTGCAGACACGCAGTGCATTAACATGTGTATCATG
TCTTACTGTTTGTGTCCTGGAGATGCAAGGCATCATGAAGAGAATTTTAC
CTTCAATGTTGGTCAAACTATCGCAAATTGCATCTTCTGAAATGATGTCT
AATGCAATACTCAAATTTTTATCCACGTTGAAAGAAATCCCAAGTTTATA
TTCCAATTTCGTTGAAGAGCAATACATGAGTATTTTCGCGATGGCTTTAC
CATACACAGATTGTTTGAAGTATACACGGTACATTGTGACGCTGGCACAC
CAAGTCATCGCTGATTGGTTCACAAGGTGTAAGTTAATGTTCCGCAAAGA
TTTTGTCTCCATCATCGTTGCTGCGTTGAAATCACACACCACAGAAAAAG
ATGAGAGAGACTCGATGGAGTTACAAAAGGATATGACGGATGTGTGTCTC
GACATGATGGCTCGATATTCATTTTCCTTGCACCGGGGGCAACCGAAACG
TAGCGCCTTGGTAGACTTTCTTCTATCTCAAGGATCGTCACAAACTTGGC
TGGTTGGAAACATGCTAGTTACTGTGACCACCAGTAATACAGAAAATGAG
CAGTGTGATTGCTACAAATGGAAAAACAAGAAATATTCAATGGATTTAGA
CAGCTCTGGGAACGGCTTCAAATTCGATCACCGCCATCAAAGACCACATT
ATCACCATGAAGTCAACGAGGATTCTAGGGCAGAAAGCTCAACAAAACCC
ATCAACTTGACGAAATTGACGCAGAAAATAGTTGAACAAAATAACTCCTT
TTCACCGTCTGAAAAACTTCTCTTCAGTCGGCAagGCTcgaaagcagttg
acggtattatTGAAGATGACGAAGAAAGCGAAAGTGGAAGTGAACACGCT
GAAGATGAGCATCAACATTTCATTCTCAATGATCAAAGCAATGAAGAGGA
GCACCAACCTATATTCTACCCTGACAATCCGCctcttcaaaaagaaaatt
cagaaaacacACAAAACCTTCCCCTCAACGGACGTGATGATGTAATGAAA
AAACAACACGATAAGGAGGCGTCTCCCACTTTACGCCCTCCTCGCTCTTC
AAATGTTTCCCTTACACCGCCCTCTCCAACCAAAATTGATTGCTATTGCG
TTTGCTCTGGATGGGCGGAAATTGTTATTCAACGCCCTACTGGTAAAATC
TCTTGGTTGATGAAACTTGAGAATCGAGAGCTGATGAATTTGGAAGATTT
TTCggatttgttgttgttgagaaaAAGTTTAGAACGTGAAAATACTNTTG
GACGATTTTTCggatttgttgttgttgagaaaAAGTTTAGAACGTGAAAA
TACTCCCTCCATATCAGAATCATTGAAGTCGACGGACTCTGAAGTCTGGA
AACAATCGCAAGGTTCCGATACGTCGAGCACAAACTCCTTCAGAAACAAG
CGTCGGTTTAGTACGGGATCTATTGATGATTCCATATTACAGCAATTAGA
GACATCGCCAGTCCTCCCTATCAAGCGCACCGTACCAACCATCAAAATCC
CTGAGAAACGCGCGCTCACAAAAACTTTATCACACCCATCACATGTCCTC
CCCACCACACGGCAACGGTCGTCCAGCTTCAATACGGTCGTTAATAAAGA
CTCCAACGACAACAAAGACTCGACCCAAACAAAAGCGGAAAACTTCTGGT
CGCCAAATTTCGTCTTTTTACAATTGTTCTATTCGTCTTTTGGCAATGTC
TTTGAAAATGCACCTATTCTGCTCGATCAAACAGAGGCCATGCAACGTAC
CatcaaaattttgcacaaaattCCAGCCTTCAATACGCACAAATTCGGTG
TTCTGTATGTCGGACAGGGCCAAGAAAACAGTGAAATTGACATTCTGGAG
AACGATTTTGGATCCATCCGATACACCAACTTCTTGGTAGGACTTGGTGA
AATCATCAGTTTGAGCAACAGTACGGAAGACTATTATACAGGTGGTCTGT
CACCCGGAGAAGACGGCAAATTTGCTTGCGTCTGGAAGGATGACACTACG
CAAGTAATTTTCCACGTGGCAACTCTGATGCCGTTCAAGACAACAGATAC
GAAATGTATCTCCAAGAAGCGACATATCGGTAACGACTTTGTCACCATCA
TTTACGATGATTCTGAAAACGGATACTCTTTCGGCACCATCAAGGGTCAG
TTTAATTATGCAGAAATTGTCATTCGACCGGTCGAATACGCAAACAACGT
GGTATATGTTCGGTTGAAACAAAACAGTAAAATCATTTGTTTGGACTCGC
AAACAATTTCGGACTCCAATCTGGCCATCCTTGTTCGTCAAATGGCTATA
CATACAAACaTGGCGTTAGTCACAGAGAAAGGCGGAGAGAAAACGACCAA
CGCCTTCGCGTCAAACTGGCTTCAGAGACTTCGCCAAATCAAGCGAATTA
GAACAAAAGTGGACAACGAAGCTAATAAAACGCTTCCAAATGATTTTACC
ATTTACACCTAAATTATTACTGCTCCGAATCGGAGTGCATATTTTATCag
tttttttatacaaattatcGTCAAAATGAGAGATTTAATTTATACTACTT
AAGCTAGACTGGCAGTTTTAGATAACCTTTGATAAAGTTTTGATAAGATT
TCTTAAAATGGAATTTTCTTGATAAGAAAGTCGTAAAAACTTGAACAAAA
CTggctatttttaaaaaaaagataaaaagttgaaaaaggtgtaaaacCCA
CCAAGTAAATTTTTCACACCCAAATCGAATCAAACGTTCTTTGAAAGCAG
CAAGTGATGCGATTAATTCACactatttttattgaaaatttatgaaaata
agatatttttataacaaaagaagttgaaaaataacaaaagaaaaaaggta
caatgaagtttaaaataatattttcctttcattattttttggtAGGTATA
ATTATTAGTGACCTTTAATTAACTGATAGCGTGTTTTAAAAAGCTTTGTT
TTGATGAGAGCACGAAATTTGTATGAGTTGAGTATAAATTGTTTCTCTGT
GAAAACGAATTAAAAACAGCCAGGGGAAAGGTTTCGACACGAAAATTGCC
TTCTTGTAGCATTTATTATATGAGTTTTTCTTTACCCTTCGCCACATTTA
ATACCGCACTTATTAACCTCAATATTCTTTCAagacaaaaaattctcgaa
taAAGAAAGACAGCCTACCCGAATTTCAAATAGAGGAAGGAGAAATTCTT
TATAAAGATCCCCTTAACAATGATTTTTTACCCCTACCCCCATTTCTTTA
AATTCCTTGCTCTTTTCTCTATTTCTGTTGAactttggttgtttttttag
aaaaaatatgcCGAGCCGAGAAGAATCAGTCGCGTGCTTTTATCATACGA
TTTAATCAGCCTCATTTCCACGGCTGGCAGCATTTTGGACACATTTCAAT
ACTTCAAAAGTGAAAACAAAGCGCACTTATTGAGATTTGTTGTGCTTACT
CATCAACTGTTTGGGTATTTGTGGAGACATCTCACAAAGACGTTCATAGT
CTCTCGACAGCAACGAGCACAGGAAGAAATCGACCCTTAAAGTTGTGCAA
gAGATTGGcatcaagaacagatattttatcaactcaaacacacacagaca
gagatagcgaaaaaaaagttataaaacaTGGAGAATACAGATCACAGTCG
ATGGTTTCATCCTTCAATGTATTTATATCAAGACAGTAGTGCAGCATTGG
CCGCCAACACAAACCCAAGTGCTTTATCACAACCGTACGGCAATGATGGA
AGTGCCGGTGAACATTATTATAACCATACACCGGTCAACCCTGGGAGCGG
TGGCGGACACACAAACGATATATCACGTCCTTTGAATGGTCACTCATCTT
TCTTATGTCATCCCGTTTCACCACACTCGCCTCCTACAAATACCTCTGAA
AATATCGGCAGTTGTTCGTCACGGCTTTATCTACCGCCTAACTCTTGTCG
AAGTGCACAGGGTGTTCATTCCAATACTTCATACAACCAATCGTCCATGT
GGTCGCATATGACTTCAGTCGGATCACTCAGTCTACCGCAATTTTCATCC
GCCCACAACCACAGTTCACACAACACTAAAGAATCACCAATAACTTCAGC
CCTGGATAACTCACCGATCTATAACGCAGATGACCCGAAATTGAAATTAC
AGAACAGTTTACAGAACTATCCATCATTTCCACCTCATTTATACCCACAG
TACGGTGGCAGTGAATATTCGAGTGTTGGAGCGACCGCTTTTGATATGTT
GACCGGTTTCCCGAAATGTCGACCCATTAGCCGATCAAATTCTGCGGAAG
GTCGGGAATGTATGAATTGCGGCGCTACGACGACGCCATTATGGAGGAGA
GACACACGTGGTCATTATCTATGCAACGCATGTGGTCTTTATCACAAAAT
GAACGGCGCTAATCGACCTCTCATCAAACCCAAGCGAAGATTGGTAAGTA
AATCACAAGCACGGCGGACGGGaattatttgttcgaattgtAAAACATCA
CAAACGACACTATGGAGGAGAAATGGAAACGGAGAGCCAGTCTGTAATGC
ATGCGGTTTATACTATAAGTTACACAAGATCAACCGTCCTTTAACGATGA
AAAAAGATGGCATCCAAACACGTAACAGAAAATCCTCCGGCAAAatgaaa
aagtcaaagaaagaaaattcaatttATTCAGACGCCGCCGTTCACCACCA
TCAGTTATCGTACGCGGGCGGTATACACCCTCAAACAATGCTCCCCGATA
GTTTATATTCCACCACCCCTGGTAATCACATGAACAATACAGAAATTCGA
ACTGTCTGTTAATTaacattgatattttttaattttcttcaatTAGCGAA
AAATGTTTGATTTATTTAAAGATTTATATATCCTTTACAGAAAGTATTAT
ATGGGGAATGGGGGATCGGGCTGGGAGGGCTATAATATTTTAACATGAGT
TTAACTGAGGA

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000162:472705..498459-

Legend: exon

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>TCONS_00013172 ID=TCONS_00013172|Name=TCONS_00013172|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=25755bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000162:472705..498459- (Clytia hemisphaerica)
TGAAAATATAAATTATTTTGAAAATTGTTACATGATATTTGTGAGAACAT
GTCAAAACAAATGAAGGGGAAATTCAAGTCGATGTTTGGCAAGAAACCCT
CTGGTGCTCCTTTTGATAAGGAATCTTGCAAAAGTATTATAACCAGAGAA
ATCCTTAAGGTATTTTTTTTTATTTTCTTACTTTTTAACCAATTTGTGTT
TTATTTTAAATATATACTGCTTTCTCAAAAAAAAAATAGTTTTGTAATTT
TTTCTTCGATAACCTTTTCAATTTTAAGGGGATCTCGTGTAACTTATGGC
ATGTCCAAAAAGCCATAAGTTTGCCGCAGAACATTGGGGGCCTTAGACAT
GTTCATTCATACCTTTAAAGAAGCATATTAGAATGTAGAATTTAAAACTG
CCTGTTAATAGAAATTTCTTTTTTACCCAAAAAAGTTATTAGGCAAAAAC
CAAAAAATGCTGACGTCAGCAAAACTTTTTTTTTAAATAACTCCTTTGGT
CCAAATTTCATGTTTATACCATCAACCAAACTGGAGTTATTCAAAAAACA
AGTTTTGCTGACGTCATCATTTTTTGGTTTTTGCGTAATAACTTTTTTGG
GAAAAAAAATTTTTTATTAACACGCTTCTTTAAAGGTATGAATGAACATA
TCTAAGGCAAAATGAAGTCATTGTGACTTCCAAAAAAAGATTTCTAAGCT
AATATTGAGTTTCTTGCTTTGAACTTTTTAAAAAAAAAGTTAAAACCCAC
TCTTATAAAATGAATAGGTGATTTCTCAGGTATAAATTTTGAATTATTTG
AGCTTGATGTGCCAATTGTAGATTTTTTCTTCTTTTCTGTCATTATAGGA
CATTGATAGATCACAGCCCATTCTTCAACGTATTCGAAATTTGAAAGAAT
TATCCGAAGTTGTCACTGTAAAAGTAATGGAAGAGGTCTGTTTTTGGTTA
TCTAATATGTAAAAATAATTCAGTTTGCTGGTGGTAAAATTCTTTCCCCT
TCAAAACTAATTTTATATAGTGACTTTGTAATTTGTATCAAAATTTCCAC
TAACTATTCTACAAATCTTTTTTAAGAACAACCCTTTGGGAATAAATTTT
ATCTGCATTTTCTAATAGTATTTTATTGAACTATTAATATTATATACCAT
ATGATTTTCAGCATGAGATTGAGGCACTATTATTCACTGTCAACGATTTA
TTGGACAAGTCTATAAGTGGTGATGGAAGACAAGCTGCTTTACAATTTCT
CATCGCAATCACTAATGGACAGGTTGGAAAAACTCCTGACAATTTTTTCT
TCTCATTGCTGCAGTATTATCCTGAGAATTATCGAAACTACAAACAACTT
TCAACAGCCCTAAAATTAAATAAAAGTATAAATCTTTTTACTTTAGATGA
GCATAGGTTTCAGTTATTTGACAAAAGTTTTGCAATTGGAAAAGGATTAT
TGTCTTTTAGAATGAACGATTGGGAATTTTACGGAGTCACATATTTAGAG
TGATTGTGGAGCATGATGTTCAAGAGGACCTTCAATTTAGGTTTGTTTCT
GTTTATATTATGATTTTTTATTTTCATGAGATTATTGTTTTATAAAGTTA
ATTTACGTGATCTAAAATGAGTAGTTTCTTGTTGAAATTTCCTATACACT
TATTTACTTTTTTTATATTCGTTTTAATGTATTTTGAAAACTCCAATCTT
TAGAATCGCACTCTTGAAAGTACTGACTGATGATGGTAAAAAATTGGACT
ATTGTGAACAAATAGGTAACGTGCCCTTCCTATTTTCATCTTGTAACCTT
TCAAACCCGACAGGCGTGTATACACGTTCTAAATTTGCCAATATACCAAG
TCCTAGACTTTAAGGCTATAACTCCTGACCACTTGATTTAAAAGGGTATA
AAAAACGACTTTACTTTAGAAAGAGTAGAAAAAAAACCTTTCTGACGGTA
CCAAAACCATTGTCTAGCTCTCAAGTTACAAGCTTTTATGTCAGTTTGAA
ATTTTGCATTTAAAAAAAAGATTGAAAATTTTCACATTCCTCAAAAAATG
TTGTGCGCTGGAAAGGTTAAATAAAATTTCAATTTCTTTAGAAACTACTC
CAAACTGCCCAAAATGAAAATCATGTTTGAAGGCTACTTTAAAGGATTTT
TTTTGCGTCACGAAACATTCTTCCGCGAAAGTATTATTTTTCCCTTCAAA
CCTTACCCGAATGTTATTGCTCTAAATGTTAAAACATTCTTTCATACATT
GTTTTATTTTAGGGCCTTTTCTTGATGGGTTGATGGAAGAAGCACTTGAT
TCACCAAAGTAATTATTTTTACTTTGTTTGTTCAATCTTTCATGTCTTTT
CGAGGAGATTTGCCACTCATGAAGTATTAGAAGGGGGCCAAGCCTCGGGT
TCCGTGACATCTTTTCTACCACCTAGCCATTTTTAGTCTATTCCAAAGAA
CAGTATATTACAAGATATTTTTGAGAAGGAGAATGCGGATTAGGCCCGGG
AAAGTTTTTTATGACAAAAATAGTGACGCCATAGACAAAACTGCAAGGGA
AAATAAGGGGTAGAGAAATAGCTGATTTTCAAAAGTCAAAATAAACGAAA
ATGATTGGTACCTGATAGAGCATGAAATTCTGAGCAAAAAAAATGTATTA
CAACAACTCTCTGACTAAAACACACAAAGAAATACAGCCACTTGAAGTTC
AAAAACATACCGACGTCAGTAGTACGATCAAGACAAGATTTGACGTCAAA
TCACAGTAGAGCTGACAGTTAGTTGGTCTTAAAGCGGCTGTATTCCTTTG
TGTGTTTTAGTCAGAGAATTGTTGTAATACAATTTTTTTGCTCAGAATTT
CATGCTCTATCAGATGGTACCAATCATTTTCGTTTATTTTGACTTTTGAA
AATAAGCTTTTTCTCTACCCCTTATTTTCCCTTGCAGTTTTGCCTATGGC
GCCACTATTTTGGTCATAAAAGGTTTTCCCGGGTCTAATCCGCGTCCTCC
CTCTCAAAAATATCTTGTAATATACTGTTCTTTAGAATAGACTAAAAATG
GCTAGGTCGTAGAAAAGATGTCACGGAACCCCAGGCTTGGCCCCCTACTA
TATAATATGATACCTAAAATTACTAGTAGCGATTGTCTTTTGTGATGTAT
AATGGGCAAACTTTTATTTGTGAAAATCTTCTTGTTTCAGTGCTGTGGCA
TTCCTTGAATACTTGGTGAAGATCGTCCATTACCATTCAAGTTTTTTGGA
CAAGAGTATTGTATGTTCCATTGTCAGGTACCTAAAATATTGTTTCCGTT
TGTGTTAATTATATACCTAAAATACGTTTCAAGAAAGTATTTTAATAGGT
TTCCAGGAAAGTTTTAAGTTACAATCTCCCTTCCTTTTTTCCAGTAAAAC
ATGTGATTTCTGCAATAATGCAAATGGAGAACAAGACATAGAGGTGTGAT
ATTTTTTATTTTGATTCGGAGACAGAAGAGAATTTCTTCTATGGATGTTT
CTTCTCTCACCCTGATCTCTATTGTCTCATTCCCTTCTAGCTCTTACGTT
TTCACTTCAAAATCACCCAAATCTAAACTGAACTTTCATAAATTTATTTG
ACCGACCTTCCCACCTATGGTCGGGTGAAGTAGCCTGAGTAATATAGTAA
ATGAATTTTCATAATTTACATATTTGTTTTTTCAGAGTTCCTTACTACTT
CTGGATGCAACTGTTCGGTACGGTGGTCTGCCAGCAGAAGGGTTACTACC
ATTGATCGAAACTCTTTGCCGGACTGTAAACATTGAACGTTTCTGTCAAA
GCAGCTGGAAGGTAAAGTTATCTGTGGTAAATGTTATCTGTGGTAAATGT
TGACTTTGATTTTACATGATTTTACCAGGGAACGATGGCAATTAATTTTT
TTTAATTTTTTTCCAAAGATTTAATCATTGCTTTGTTCTTATCTTTTCTT
AGTTGATGAGGAATTTGATTGGAACCAAATTAGGACATACTGCTGTTTTT
ATCATGTGTCAAATATTAGAAGACAAGTAAGTAAAATTGTTAATATCATG
ACGGTTTGCAGGTAAAGCTCTGTCTGTTTCTTATAAAGATTGAGAAACTA
CGTTTGAAAGGCTTCCCCTAAAAAGGTGTATTTGAATATTTTTTAAGCCG
AAAGTCGAACTTTTTTAAACAAATGAGGGCTCTTGCAAACAGGAAGACCG
ACTTTTTTCCAAATTTCGCATTGTATGTATAAATGACTTAGATCTGTCTT
CGTCCATCACTGTTTACTTCTATAATTTAAACTATAAAACTTGCAATGAA
TCATAATAGAATCTTATAAAGTTTGTTACTTGGATTTGATACACTTTTCG
TTTCAGCCATCACATCCTTGATGTAATTCTTCTACGTGGTGCTGTCTTCT
TCATCGGTATGAGCATCTGGGGCTCCAAACGAGTTGCCAGTCTACGGTAC
TCGCCTCTCCACGTCCTCTCATCCTTCAAAGTATGCTTGCAGTGTAATCA
CCATCTGGTGGCTCNGCCTCTCCACGTCCTCTCATCCTTTAAAGTATGCT
TGCAGTGTAATCACCATCTGGTGGCTCATGAGGTAGTGCTTTCACTACAA
CGCCTTGTCAAGAAGTTTGGAGAAGAACAAGAAATCATCACGTGGGACAT
ACTGATGGATATTGTTGAAAATATTCTTCACATGATCGATGTATGTATAT
TTTATTGGATTTTCTGTCTTGGGTCCCTCGTATCACGTTATGAGTACAGT
CTCATAATAGAGGGTAAAAAGTAGTTGAAGATTAAAAAGACTTCAAGAAG
TTGACAACGATTATTTCACAATTTTTACTTCGCAAATTCATATTTTGGTT
CCTATGAAAAATATGTAAAGCGGTAACGCGACGGTTACATTTATTTGCCT
ACATTTATGGTTTCATATATATTTCTGCAAATGAAAATACTGTAAAAAAA
TTTAGTTTATACCGGGTGCGCCACAAAAAAGTTTCTCTCTTCAAAACTTA
TTTTCCCGAAATCTAAAAATTTTAAAAGAACCATTCCTATTCAATTGGAA
AGAAGATATATAAACTTAACTTTTGATGGGTCATTTATTAAATTCGGTTC
ATTAGTTCGAAAGTTATGCTCTATTGAATAAAAAAGTTACTTTCTGAAAG
TGCTCAAAAACGTTAAAAATCGACCTATCAAATTAAACAGAAGCATAATA
ACATGAGGCATCAGTATTTTCGTTTCAGTCATTAAAAATGATAATTAGCT
GTCTAATTGACCGTTTGTTATATAAAGGAAGATTGAATTTCAATAAAAGG
CAGAAGATTCGACGAAAAAAGCCAAAAAATCTGGTAAAATTTATAAAAAT
ACATCAAATATGGGTTTCGAAGTACATCCAGCCTTACATAGACTTTATCT
AGTCTAGAACCAAAAATCTGTGGAAGATTTCGTTAAAAGTAAATTGGAAT
GATTTTAATGAACATTTTAAACCCTTTCGTTCAATCAGTTTCAAAATTTA
TGTGTTTAATAATTATTGAAAAATGGTCTTAATCATGTAAAGCCTCTTGC
GATTGCCAATTTTAAAATAAAAACTTAATAGGTCGATTTTTAACGTTTTC
GGGCACTTTCTGAAAGTAACTTTTTTATTCAATTGAGCATAACTTTTGAT
CCAATAAATCGAATTTAATAAATGACCCATCAAAATTTAAGTTTATCTTT
CTGATGGAATAGGAATTGTTAGTTTAATTTTTAATTCTTAGATTTCGAAA
AAATCAGTTTCAAAGAGAGAAACTTTTTTGTGGCGCACCCGGTACCTCTT
AGAAACGTCCTTCCAATCCCTGCATGAAAATTAGTTTTCCACTGGCTTGG
GGCAAGTGTCAATTTATATGACTTTCGAGCAGGTCTAAAAGATGGAAAAA
AGAAGTTTTTTAATTCAAGGGATATCTTTTTTTGTCTTTAGAGAGGGGAT
GCTGATAAGACGAGCATCCTTTTCAAACAGACACACGAACTTCTCACCAA
CACTGAGGCTTTATATGTGGAGGAGAAGTTTTATGGATCAGCAGAGCGAT
TCTTTAAGATTTTAACAAATTGTGCCAAAGACAGACCGGTAGGTATTTCT
TTTTTCAAAATATCAAAGACTTTAAGATAATTCGTATTGTCTCTTAATCG
TGTCCTTTTTAAAAACGAAAAGCCCTGTTTGGAATCTGTAGGGAAAAGTG
AACACGAGGAAACTGAAAATGTTACCATATTGGTTTCTCCATAATTTGCC
TTTTACTCAAAAGATAGATTAGGAGTTTCTAACAGTTGCTATATACAGTG
AAATCTCCATAACTCGAACACGCACGAGGAACACAAATTTGTTCGAGTTG
TAGAGATTCCACTGTACACACCTTTGAAAACATTTTATAGGAAGAATCTA
TCTCGACGATTCTTGGTTATTATGAAGATCGAATCGATCCAAACACGGTC
GAATGGAGTGATATATTTGAACAGATTCTCATTACTAATTTGAAACAAGA
AACGAGAAGTGGCGTCAAAGTTCGTGTCCTGGAAACTATCAAAAACATTT
ACTCGAGATATCGACACCGACACGAGGTAAGCGAGTTCGACTAGTCATCT
TTCTGATGAAAAGAAAGAAACAGACTACAATACATATTATGAGACTTATA
AGAAAACTTCTATAACTTTAGCTGAAGAGCATTTGATTTTGAAACATAAT
GTGATTGGCCTAAATAACTATCTCTGCCATCAAAGCAAACGTTTTGAAGC
AAACCGCTTTGTTTATTTGGTCTCTTAGGATGACATTCTTTCCTATATTC
TTCACGGACACGTCAGCGATATGGTGTACGATAATGATAAAGACATCCGA
AAAAGTGTTGGTTATCTCCTCTCGTACATCCTCAAACACTGCTGTGCTGA
CAAATACCCTGAAGTTTTAAAAGTGGTGGCGGAATTCTTATCTTATATCT
CTCTTGGTAAAGATGTGACTCGATTCAATGTCATGGAAGATATTTCGATT
GTTGTTGACGCTCTTATAAACACTTTTGAGGTTGGTTGAAATGAAATTTG
TTAAGCATAAGTCTGTGGAAATGGTCTGATCCTCTTCTTGGTATCTCAAA
ATTCTTTGAAAAAAATGTAGGTCCTACAAGTTGTTCTTACTTTTAAGTCT
TGTCTACAACTCAATACCATACCAAAATTACCAACGAAAATATGACTTAA
ATTTAGCAATGGAAATTCAAAAGTGCCAAAAATATACACGGTCCAAGGAA
GAAAGTTTACTGTCAACGATATCTCTCGGCCCTTCTGTTTTTCTGGAACC
TTACTTAGTACATAGTAGTTCAACATTTTCGCACGGTATGGAGTCTCATG
ATTAATTATATAATTATTAATTATGTTTTCAGTCTCGACTTTTCGAACCA
TCAAATATTTACATTGTTGGTATGCTGGAGATCCTGATCAAACACTTAAA
CGATCACTTCACCATCAACATCACTTCCATCGCTGCCGGAAAAATACGGC
GCAAGATTTTCGAACTCTTACTTGCCTTGCGTTCAAATGAATATCACTTT
CTTGGAATCAAGTTGAAAGAAAATGGTGTCAAATTCTCAACACATGCAAT
ATTCAAACCTCTGGATAGCGAAATTTTCAATAACTCTGCTTCACGTCCTT
ACTTCGTGGATTTTGATTTCCAACAAGCGTTCGAGGGTTTGTTGAAATGT
TTGAAAAACGAACTTGATTGGAATGTCCTTGAACTTGTTTTGAAAAGTAT
TGTCAAACAGTTAGAAGATAAAAATTTGTACGTCTATTGTCAATGCAACA
TGAATAAGTTATGCGCAGTCCTCTGTACCATCATCAACGATAAAACCTTC
TTCAACAAAATGAAAAACGTCCCGACTACGATGACCATGTCTGAATTACG
TAATCTTATCTTCCCGATTCTCTCCACTTTGTCAACATATCATTCATACT
TGGTCAAAGATCGTCAAGTAGAGTTATTGACCTCTATTGAGTTTGGATTG
CAGACACGCAGTGCATTAACATGTGTATCATGTCTTACTGTTTGTGTCCT
GGAGATGCAAGGCATCATGAAGAGAATTTTACCTTCAATGTTGGTCAAAC
TATCGCAAATTGCATCTTCTGAAATGATGTCTAATGCAATACTCAAATTT
TTATCCAGTAAGCTATTTTTCTTCTAATGGTATTTTTATAAGATACTACT
TCCTTTGTAATTCATAAAACCTAGTCATTCATTCATTCATTCATTCATTC
ATTCATTCATTTCATATTCCTCCTTACTTTCCAGCGTTGAAAGAAATCCC
AAGTTTATATTCCAATTTCGTTGAAGAGCAATACATGAGTATTTTCGCGA
TGGCTTTACCATACACAGATTGTTTGAAGTATACACGGTACATTGTGACG
CTGGCACACCAAGTCATCGCTGATTGGTTCACAAGGTGTAAGTTAATGTT
CCGCAAAGATTTTGTCTCCATCATCGTTGCTGCGTTGAAATCACACACCA
CAGAAAAAGATGAGAGAGACTCGATGGAGTTACAAAAGGATATGACGGAT
GTGTGTCTCGACATGATGGCTCGATATTCATTTTCCTTGCACCGGGGGCA
ACCGAAACGTAGCGCCTTGGTAGACTTTCTTCTATCTCAAGGATCGTCAC
AAACTTGGCTGGTTGGAAACATGCTAGTTACTGTGACCACCAGTAATACA
GAAAATGAGCAGTGTGATTGCTACAAATGGAAAAACAAGAAATATTCAAT
GGATTTAGACAGCTCTGGGAACGGCTTCAAATTCGATCACCGCCATCAAA
GACCACATTATCACCATGAAGTCAACGAGGATTCTAGGGCAGAAAGCTCA
ACAAAACCCATCAACTTGACGAAATTGACGCAGAAAATAGTTGAACAAAA
TAACTCCTTTTCACCGTCTGAAAAACTTCTCTTCAGTCGGCAAGGTAAAA
TCTTTTTTTCCTGAAAGAATCGCCCAGGGGTGTATACAGCTGCAAGTTAC
TGACCCATAGCCGGGTGGTGTCTAATTTTGAATTACAAAAAAGTACCCGG
TACAACATTTGGGGTGGGGGTGGGTATATCTCATTTTAAGATAGTACCCG
GTACCTGATTTTGGTTTTTGGTGGGTAGAACTGATAAGAATTTCCTTATC
TTACCAAATCAGGACAGAAATTTAATTTAACGGAAATATATTTTTTGTTT
TCCTGATTTTCTAATTTTGAAAAATCAATGCAAGGCATTTTTCCAGGGTG
ATGTACCCATATTTTTCTTGGTAACCTTCTGAATTGGGGGGGGTCCCTTT
TACCACAAACAGTTAGTACCAAGGTACTAAAAACGAGGTGGTGAAATTTT
CCTGAAGATCAGGGTTAGTATCCTGAGGCAACACCCCCCTGAATCGCCTG
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


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The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


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Expression

Values :

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Blast

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BLAST of TCONS_00013172 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: TSC2 (Tuberin OS=Homo sapiens GN=TSC2 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 560.836 bits (1444), Expect = 3.902e-165
Identity = 320/923 (34.67%), Postives = 512/923 (55.47%), Query Frame = 1

Query:  136 IITREILKDIDRSQPILQRIRNLKELSEVVTVKVMEEHEIEALLFTVNDLLDKSISGDGRQAALQFLIAITNGQNERLGILRSHIFRVIVEHDVQEDLQFRIALLKVLTDDGKKLDYCEQ-IGPFLDGLMEEALDSPNAVAFLEYLVKIVHYHSSFLDKSIVCSIVSKTCDFCNNANGEQDIESSLLLLDATVRYGGLPAEGLLPLIETLCRTVNIERFCQSSWKLMRNLIGTKLGHTAVFIMCQILEDNHHILDVILLRGAVFFIGMSIWGSKRVASLRYSPLHVLSSFKVCLQCNHHLVAXPLHVLSSFKVCLQCNHHLVAHEVVLSLQRLVKKFGEEQEIITWDILMDIVENILHMIDRGDADKTSILFKQTHELLTNTEALYVEEKFYGSAERFFKILTNCAKDRPEESISTILGYYEDRIDPNTVEWSDIFEQILITNLKQETRSGVKVRVLETIKNIYSRYRHRHEDDILSYILHGHVSDMVYDNDKDIRKSVGYLLSYILKHCCADKYPEVLKVVAEFLSYISLG-------KDVTRFNV-MEDISIVVDALINTFESRLFEPSNIYIVGMLEILIKHLNDHFTINITSIAAGKIRRKIFELLLALRSNEYHFLGIKLKENGVKFSTHAIFKPLDSEIFN-NSASRPY-----------------FVDFDFQQAFEGLLKCLKNELDWNVLELVLKSIVKQLEDKNLYVYCQCNMNKLCAVLCTIINDKTFFNKMKNVPTTMTMSELRNLIFPILSTLSTYHSYLVKDRQVELLTSIEFGLQTRSALTCVSCLTVCVLEMQGIMKRILPSMLVKLSQIASSEMMSNAILKFLSTLKEIPSLYSNFVEEQYMSIFAMALPYTDCLKYTRYIVTLAHQVIADWFTRCKLMFRKDFVSIIVAALKSH-------TTEKD 2802
            IIT EIL+++     +  RIR + ++ EV   K  EEH +EAL   V DLL      + R A L  L AI  GQ ERLG+LR+  F+VI ++   EDL  R+ + K LTD+G+ + Y E+ +  F+   M+  L S     FL  LV +V ++S +LD+ I   +V   C  C       DIE SL +LDA V Y  LPAE L   I TLCRT+N++  C+  WKLMRNL+GT LGH+A++ MC ++ED  ++ D  LLRGAVFF+GM++WG+ R+ SLR SP                       VL SF   + C + +V++E+VLS+ RL+KK+ +E +++ WDIL++I+E +L  +   D+ +   +    H+LLT  E L  + +F+GS ER+F+++  CA  RPE S+  ++ Y    I P    W    + ++    + E+R  V+++VL+ +  +    R  +E+++++ ++   +S +  D D  +RK    LL  + + C    +  +L ++ + ++  SL        +DV  ++  +ED+   V  L+   +++L+     +   + E+L+ H+  H+  + T   A  IR + F+ LL LR++  H LG+  K+  V+FS + +   ++ E  +    S P                       +   F  LL+CLK E DW VL+LVL  + + L  K L     C++++LC+ LC++++      +++  P   + ++L   + P+L+ L +YH+YL K +Q E++  +E GL  R A  CV  L++C +EM  I+ + LP ++VKL+ I+++  M+  +L+FLSTL  +P LY NF  EQY S+FA++LPYT+  K+ +YIV LAH VIA WF RC+L FRKDFV  I   L+S+       T EKD
Sbjct:   39 IITAEILRELSMECGLNNRIRMIGQICEVAKTKKFEEHAVEALWKAVADLLQPERPLEARHAVLALLKAIVQGQGERLGVLRALFFKVIKDYPSNEDLHERLEVFKALTDNGRHITYLEEELADFVLQWMDVGLSS----EFLLVLVNLVKFNSCYLDEYIA-RMVQMICLLCVRTASSVDIEVSLQVLDAVVCYNCLPAESLPLFIVTLCRTINVKELCEPCWKLMRNLLGTHLGHSAIYNMCHLMEDRAYMEDAPLLRGAVFFVGMALWGAHRLYSLRNSP---------------------TSVLPSFYQAMACPNEVVSYEIVLSITRLIKKYRKELQVVAWDILLNIIERLLQQLQTLDSPELRTI---VHDLLTTVEELCDQNEFHGSQERYFELVERCADQRPESSLLNLISYRAQSIHPAKDGWIQNLQALMERFFRSESRGAVRIKVLDVLSFVLLINRQFYEEELINSVVISQLSHIPEDKDHQVRKLATQLLVDLAEGCHTHHFNSLLDIIEKVMAR-SLSPPPELEERDVAAYSASLEDVKTAVLGLLVILQTKLYTLPASHATRVYEMLVSHIQLHYKHSYTLPIASSIRLQAFDFLLLLRADSLHRLGLPNKDGVVRFSPYCVCDYMEPERGSEKKTSGPLSPPTGPPGPAPAGPAVRLGSVPYSLLFRVLLQCLKQESDWKVLKLVLGRLPESLRYKVLIFTSPCSVDQLCSALCSMLSGPKTLERLRGAPEGFSRTDLHLAVVPVLTALISYHNYLDKTKQREMVYCLEQGLIHRCASQCVVALSICSVEMPDIIIKALPVLVVKLTHISATASMAVPLLEFLSTLARLPHLYRNFAAEQYASVFAISLPYTNPSKFNQYIVCLAHHVIAMWFIRCRLPFRKDFVPFITKGLRSNVLLSFDDTPEKD 931

HSP 2 Score: 255.758 bits (652), Expect = 5.115e-68
Identity = 127/293 (43.34%), Postives = 189/293 (64.51%), Query Frame = 2

Query: 4040 VNKDSNDNKDSTQTKAENF--WSPNFVFLQLFYSSFGNVFENAPILL-DQTEAMQRTIKILHKIPAFNTHKFGVLYVGQGQENSEIDILENDFGSIRYTNFLVGLGEIISLSNSTED-YYTGGLS-PGEDGKFACVWKDDTTQVIFHVATLMPFKTTDTKCISKKRHIGNDFVTIIYDDSENGYSFGTIKGQFNYAEIVIRPVEYANNVVYVRLKQNSKIICLDS--QTISDSNLAILVRQMAIHTNMALVTEKGGEKTTNAFASNWLQRLRQIKRIRTKVDNEA---NKTLP 4888
            V +D+  ++ +T + AE     +P+FVFLQL++S F     N PILL +++++ +R++++L +IP+++THK  VLYVG+GQ NSE+ IL N+ GS RYT FL GLG +I L +   D  Y GGL   GEDG+F   W DD  Q +FH+ATLMP K  D     KKRH+GNDFV+I+Y+DS   +  GTIKGQFN+  +++ P++Y  N+V ++ +++ + +   S  + +SD NL  + RQMA+H NMA          T+ + S W+ RLR IKR+R ++  EA   N +LP
Sbjct: 1475 VERDALKSR-ATASNAEKVPGINPSFVFLQLYHSPFFGDESNKPILLPNESQSFERSVQLLDQIPSYDTHKIAVLYVGEGQSNSELAILSNEHGSYRYTEFLTGLGRLIELKDCQPDKVYLGGLDVCGEDGQFTYCWHDDIMQAVFHIATLMPTKDVDKHRCDKKRHLGNDFVSIVYNDSGEDFKLGTIKGQFNFVHVIVTPLDYECNLVSLQCRKDMEGLVDTSVAKIVSDRNLPFVARQMALHANMASQVHHSRSNPTDIYPSKWIARLRHIKRLRQRICEEAAYSNPSLP 1766

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00013172 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00013172 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
TSC2	3.902e-165	34.67	Tuberin OS=Homo sapiens GN=TSC2 PE=1 SV=2	[more]

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TCONS_00013172 (transcript) - C. hemisphaerica