TCONS_00014207 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00014207
Unique Name	TCONS_00014207
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4792

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000183:341225..363210+

transcript sequence

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>TCONS_00014207 ID=TCONS_00014207|Name=TCONS_00014207|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=21986bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000183:341225..363210+ (Clytia hemisphaerica)
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GAAGCTTCCAACTGAAGAAAAgtggttttatttttatctttttatcccGC
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AAGCCGGAAGAAAAGTTTTATTGTTAACTATTCAAATCATATTGCACTTG
GGAGATTCACAGGTTTTATTCATCTAAACAGAATTTCAGAAAATGGGAAT
TATGAGATTTTCAATCAAAGATAAAAAATCGAGTCCGCAATATTTCTTTC
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TACTCGCACTTGTCGAAGTAATTTCATGTTTATTTCGAATTCGACCTCTT
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TATAATCGGATTCGATAAAGTCTTTAAAGCGATAAATGTGAAGCCCCACA
TATTCAACACTGTTGTCCAATCGGTGTCGATCCCCGACAGCCATGCAGCT
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ATCCACTTTTGATATCGACGTCGACTTTTCTAAAGACTTTTTTCTATCGG
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ATTGTAAATCTTGATGTGAATGAAAAAACTATACCCACCAATCAATACAA
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ATAGTGGAATACATATTAAGCCGTATAGAAAGTCACTAATTGCAGCGTTC
ATTAGGAGATAGTTGGATGGTGTTTTTAGTGTTGGGGTTTGATAGATCGC
CAGAATGACCAAGAAGTTTGAAATGATGGTTGATGCACCAATAATGAGAT
TGACGCCGATCGATGCCAGGATCGCATTCACATTGGAATCGTCTAATGGA
TACTTGGTGCCTAAAAGATAGAAAAATGCTCGGTCTAATTTACTTTCCAT
TTTGCGGCCCGGACTCCTCGTAGAATATGCAATTTTATGATTGTATCAAT
TTAGCTCAAACAAGGGGCAGAAAATGAGTCATTTGATTCGATAGATTTTC
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TACACCTAGTCTGTTTTTAGACCTATAGTTTGTGCTCCAAAAAGCTTACC
CAAAAGTATATCAAGATAAAAACATTTAACGGACTGAGTCTCAAAATCAT
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AATTTGAACCATCATCCAAAGTATCATTTTTGGTCATTTCCTTTGTGTTT
CAACTTCATATAAAATATTATTGGATTTTTAATGAGACAGTAACGTGACC
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TCCTCAAACACTTACTCAAGTCAATATTATATAATCAATATATTCTCTGT
CATATGATTGAATCTATAATAAATAGCACTTAAAAGATTATGAATAAGAT
AATTATAAAAGATGCAATTCAATTCTCATAGCTATTACATACAAAAGTAC
CTACATTATCTTGGACTCCATAGGAGCTCTCTTTATCATCCTGAACTTTG
TAAACATCCTCACTATGAATATTTCATAAACATACACCCGCCTACTCTAT
TCAAACTTTTAATCAAGGAGGTATTGGAAACTGACAATGCTCATCtttat
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GTCGGCAAAGTCGTCACAACACTTACCACATTCGACACAGCAAACACAAG
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TAAAGTCGATCGCTCGCGTGACAATCTAGGCGTCATTGAAGAAGGCCGAG
GCGCGAGCCCGAAAGTAGAAAGCAGGAATACGCCAGGTAATAACAGTATT
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GAGGATGATGGTATTTTTCTCGTTGGGAAAAATTTTTGCAGATTTATTCC
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTGTAGTTGAGTGTAATTTGCATGCA
GGCGTAGTTAACGcgaagggtgatgggattgaatttcggtcaaacagaaa
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_007950	XLOC_007950	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000183	supercontig	sc0000183:341225..363210 +

Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00014207 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: MELK (Maternal embryonic leucine zipper kinase OS=Homo sapiens GN=MELK PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 280.026 bits (715), Expect = 7.290e-80
Identity = 144/261 (55.17%), Postives = 194/261 (74.33%), Query Frame = 2

Query:  170 ELSKYYEDKNKVLGSGGFAKVILAEHIATGQKVAIKVMNKNYLKKKDDLHRAYNEIYALKHLSHQHVCQLFEVFECEEFIYLVIEHCPGGELFDYIVTKKRLEEREARYLFSQILSAVAHFHKHGYAHRDLKPENMLLXXXXXXXXXXFGLSAKPENGLTSALRTRAGSVLYASPELISGEPYFGDKTDIWSLGVVLYALLCGFLPFDHESTVELYKKIKKGEFAXXXXXXXXXXXXXNGMLETDPKRRITIEKILSHPWM 952
            EL KYYE  ++ +G+GGFAKV LA HI TG+ VAIK+M+KN L    DL R   EI ALK+L HQH+CQL+ V E    I++V+E+CPGGELFDYI+++ RL E E R +F QI+SAVA+ H  GYAHRDLKPEN+L D+   +K+IDFGL AKP+      L+T  GS+ YA+PELI G+ Y G + D+WS+G++LY L+CGFLPFD ++ + LYKKI +G++  P WLSP S+ LL  ML+ DPK+RI+++ +L+HPW+
Sbjct:    6 ELLKYYE-LHETIGTGGFAKVKLACHILTGEMVAIKIMDKNTLGS--DLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYIISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPKGNKDYHLQTCCGSLAYAAPELIQGKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVMALYKKIMRGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWI 263

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00014207 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00014207 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
MELK	7.290e-80	55.17	Maternal embryonic leucine zipper kinase OS=Homo s...	[more]

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TCONS_00014207 (transcript) - C. hemisphaerica