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transcript sequence >TCONS_00014375 ID=TCONS_00014375|Name=TCONS_00014375|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1149bp GAACAACATTGAACTAACTTATCAAGAgttcaaaaatttcaagttgaagt tattttgattttttggttttggtttgGTTAACGATGACGATGTTCTTCAT TTTGCTTTTCACCTCCTTGTTCATATGCCTCAATGGAGAGGAGAAAGATA TGGAATACGAGAGCAAAATGGCGCAATGGAAATGTAAACTGAGCTATGGC ACATCAAGGCCGCATGTCTCGGCCTCATTCGCACACTGTTTCAAACATCC AAGCCAATACTGTCGTCAACATGCCGTTTCAATGAATGGCTGTAAGCAAT ACAAAAATATGGGTTTATACTGTTGTTCTATGCAGACTATTGATAAAAAG CTGACCCGTAAATTCAAGAATTATGAATCGCCAGAATTCATGACCAGAGA GCAGTTCTTGTCTATCACGTCAAACGAAGATCGGGCTCTTCAGATGTTCT TGTTTTTCGCAATGGATGTGAAGATAGGTAACATTAAATCGAAGGAAGAG ATGGCTGCGTTCATTTCATTGGTTATGATGGATACTCATTTCTTAACTAA CATGGAGGAACATCTCTCTAAAGAAATTATGGTAGAGTTCGAAAAACACA AATATTTTGATCACATCAAATACATTGGACGTGGTGCTCTTCACGTTAAA GGACTGGCTTTCTACCAATGGATTTCAACGACTTTGAACGCATTTCGGGC TAGTTTTGATAATGTCACTGAAGACCAGATAAAGCCCCTCAATTTTattt acCTGAAACATTGCTTTTTCCAACAATGGCATTCCAATCGGCCGCCATAA CATGGAGGTATTCGTACTCTGCTATCACAAATCATTCGAAATCTGGACAG TCGTTTAGTGAACTTTCGGACGGAGATGTAGACAACCTGGCACAGATTTT GTACCATTTGAAAGGAAACATTGTCCAGTTACCAAAGTTGCTCAATATCT GGAAAAGAGTCAGATTGGTTTTGAATACCAGGAACCCGTCACCTGTAATG GATATCCCGCAAATAGGATTGTACTCTGAATGCATGTACGAACCTCTGTG TAGGGGTATGGTAAGGATGGATCCTGTCCTTTGTAAACCAAAAGGCATCA TCCCAAGAATTGCATGTGAAGGTGCGAACAAGATTTTCAAATACCGTcg Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000187:267298..284608+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00014375 ID=TCONS_00014375|Name=TCONS_00014375|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17311bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000187:267298..284608+ (Clytia hemisphaerica) GAACAACATTGAACTAACTTATCAAGAgttcaaaaatttcaagttgaagt
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CCCATATTAGAGGAAGCTTATCCAGTATTGAGTCTGACTAGTCCACCCCC
GAGTCCACCATTTCAATTCCAGTTGGTCGTCAAACAGCgtcattcgaatg
ttttgaaattcaaacgCTCGAAAATCTAAGGTTAAATAGAAACAACACGG
TGGACCAGTCGActtaaaaactgaaatttttattctggtctgtaaaattt
aaaagCCAGCGCAAAGATTTTTCGTGAAACAGCAGCGCTACACTAGATGA
AATGTGTCTTTGCGTTTAGCCAGCAGGTAGCCGTTATgggggcgcaatca
gtcctaGTTAGCCGTGATTCATTTTGTTCGTTAAAATGACCTATGACAAT
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GGCATTCCAATCGGCCGCCATAACATGGAGGTATTCGTACTCTGCTATCA
CAAATCATTCGAAATCTGGACAGTCGTTTAGTGAACTTTCGGACGGAGAT
GTAGACAACCTGGCACAGATTTTGTACCATTTGAAAGGAAACATTGTCCA
GTTACCAAAGTTGCTCAATATCTGGAAAAGAGTCAGATTGGtaggttttt
ttataaagaacgaTCTCGTGAGCCCGGTCACTGCTGACCTTggcttgacg
gccgacgggaacgtgccgctggagtttgaaaaatagaccctgtcagatat
gaatatttggtaaatctgggaccctgtcagaaagaCTTAAACCCTGAAAA
GTGGCCAAAATaactaaaagtagacgaaaaattgaaaacccTTCTAATTT
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AGTGCCCCGCCCCGGGCTCACGAGTCACAGATCAGGGCCTACAACATTGT
TTCCTGTTATAGAATTGAAATTTCCCGACGATCCCCAAAACAATATCTTT
ATTTGGTGCTATCAAGTAGTTTCTTTACTCTTCATTAGGGAGTGAATATT
CTTTCCTAGCgcaatacacccctgtatcacagacccgaaaacttggcaaa
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CCGAAATTATCcgcactggattttttaatcttggaacaatagaatttcta
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TCTACAACACGAACCTTTTTCAGACTTCAAACTGGTCATTTTTCTTGTTG
GCCAAACAgtttgtgtcaatttttttcggactaGTCCAAAGGTTTGTtga
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aacaaaaggtttGGATGACaagaatattaagaacaagttaagaatatctt
aagGCTTTGTGGGCTTTAAAACACCCGATTCCTTAGAGAAATGAACGAAA
ATAAGAATTTTAGGCTTAgaactcgaaaatttaagaatatctaaaggcat
taaaaaaatttggattttcttatataaaaaaatacgtGTATGTGTTGCTA
GTTGCTTTTTGCGTTGGCATGTTGCCCCATGAGTAACAACATCGATTTAA
GCACGATTCCATATCTCCTGACACGaagtgcaaaaaaaattgtaaccGCC
TTTAAAGTAAAAAGGTGTTGTTTTTACTTACTGTTAGAGATTAAAACCCT
AATTAGTCCAAGGTACCTAAAAGCAAAAATACAGTCGCCTCTCTTAAAAT
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GGGAATCAATCTTTTcgctcgaattacagaaagattcgaattacagaggt
tCGAATAAGGGAGAGTACGAACCATCaatgataaaaataatatcTCCTCA
TACATCCATCTCCGTATTTAATATATTTGGAACCTACACCGAGACCTTGA
CAACTTAAAGCGCCATGTCACTGGAAAAGAAGGACCCCAATATCAGCAAT
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CTGGTATAATTCTAAAAAAATACTCCCTTGTAGCCCTTGCACACTCCCTA
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CTATGAAATGAATTGGTCTTTATTTTCAGGTTTTGAATACCAGGAACCCG
TCACCTGTAATGGATATCCCGCAAATAGGATTGTACTCTGAATGCATGTA
CGAACCTCTGTGTAGGGGTATGGTAAGGATGGATCCTGTCCTTTGTAAAC
CAAAAGGCATCATCCCAAGAATTGCATGTGAAGGTGCGAACAAGATTTTC
AAATACCGTcg
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00014375-exon-sc0000187-1491911889:267298..267423 | TCONS_00014375-exon-sc0000187-1491911889:267298..267423 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00014375-exon-sc0000187-1510915933:267298..267423 | TCONS_00014375-exon-sc0000187-1510915933:267298..267423 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00014375-exon-sc0000187-1575043694:267298..267423 | TCONS_00014375-exon-sc0000187-1575043694:267298..267423 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00014375-exon-sc0000187-1491911889:276657..277051 | TCONS_00014375-exon-sc0000187-1491911889:276657..277051 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00014375-exon-sc0000187-1510915933:276657..277051 | TCONS_00014375-exon-sc0000187-1510915933:276657..277051 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00014375-exon-sc0000187-1575043694:276657..277051 | TCONS_00014375-exon-sc0000187-1575043694:276657..277051 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00014375-exon-sc0000187-1491911889:281517..281737 | TCONS_00014375-exon-sc0000187-1491911889:281517..281737 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00014375-exon-sc0000187-1510915933:281517..281737 | TCONS_00014375-exon-sc0000187-1510915933:281517..281737 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00014375-exon-sc0000187-1575043694:281517..281737 | TCONS_00014375-exon-sc0000187-1575043694:281517..281737 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00014375-exon-sc0000187-1491911889:284427..284608 | TCONS_00014375-exon-sc0000187-1491911889:284427..284608 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00014375-exon-sc0000187-1510915933:284427..284608 | TCONS_00014375-exon-sc0000187-1510915933:284427..284608 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00014375-exon-sc0000187-1575043694:284427..284608 | TCONS_00014375-exon-sc0000187-1575043694:284427..284608 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000187 | supercontig | sc0000187:267298..284608 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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