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transcript sequence >TCONS_00015057 ID=TCONS_00015057|Name=TCONS_00015057|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1756bp
TTTTTTGTCTAACGTCAATCAAATTaaaatcaaagattgTTTGGATTTTA
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TTTAGG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000203:251631..265922- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00015057 ID=TCONS_00015057|Name=TCONS_00015057|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14292bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000203:251631..265922- (Clytia hemisphaerica)
TTTTTTGTCTAACGTCAATCAAATTGTAAGGTTTTCTTTCTAAACTTTCA
GATTTATCATATATACCCTCCCACTCTCCTATTCTCTCAATACAAATAAA
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ACATTACATTACATTACTCCCATCACATAAGTTTTACAATTACTTAAGAG
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CCTACCATAATATAAAGTAACAAAAAAAAAGGTTGTCTGTAAAAATTTGT
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AAATTAACATGAGAAACTAAAACTAATTCATTTTCAATTTAATTTTCTTA
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ATCCCTGCGAAAAATCAGGAAATCCCTCATCCGCGAAAATTAATCCCCGC
GAAATCTTAAAATTTCGCGGATGAGCTCAACCCCGAAATTTAATCCCCGC
GAAAATTTATCCCATTAAAGTAAGTAAAGCGTCTTGGGCAAGATTGACCT
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CATTTTCAGTCTGATTGGCCCGGGGGGGGGGGGGTCGGTAGTAAAATCTC
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AAAAATAGCTAAAAAATGATTATTTCTGTGACACATTTTTCACTTAGTGC
AAAAATTAATGTTTTGCCCTTAGAATTAAAGTCTTTTTTATATTGACAAA
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GAAAGTTTAAACATGTGGCTGATGTTTTGATGTGACTTTTAATAGTTTTG
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GTCTGCCTGGGTTTCCAAAGCCCTAACAAAGGTTCACACACAGACTGTTT
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CTTTGTGATCTAAGGCAATTTGTATTTTTTTTTAAATTTTGAGCTTGGAT
TCCCAGGCTAGGATGATTAAAGATGACCTGTCTGGTCTGGTCTGGTTGGT
ATTTTACAGACCAGATTGTAGACTTGACGAAAATTATTTGCTACTTTTCC
TCCTGGTAAAATCATCTAATTAACTGATTGACTAGTTTGATCTGACTGAA
ATTTGTTCCCGAAGGCTGATTTGTCAAATAAAAGAGACTAGTAACAAAAA
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TCCACCTGCTGGAACTCGTGAACTACTGAAGCTTTTGACTTGAAATTTTC
ACCAGTGATAGATATTGGCTATCTAAGAAGGTTGCANTGCTGGAACTCAG
GAACTACTGAAGCTTTTGACTTGAAATTTTCACCAGTGATAGATATTTGC
TATCTAAGAAGGTTGCAATTTAATTTCAATTTGGTCACGTGAGTGGTTGG
TATTTTACAGACCAGACCATGTTTTACCAGAAATGCTCACTTTCAGCATT
ACCACCCGGGCGATTTTGCTAAAATTTTGGCTGCAAGCTTCTATTATCAA
TACCTAACACTTGTCAAAATTTAAATTAAAAAGCATATTTCAATCAATAG
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AAAACACAGCCAATCAAATTCTGTTATTATTTCACTGGTGATACTTTCTT
AGAAAAACACGTAAGTTTTTTAAATTTTAATAAGTGAGGACAGCGCTAAA
TTTCCTGTTGTAAATTTTTTGGGGCAGAACTCTGCCTCACAGCCTGAACA
GGACGGGTTCATATACATCAGTTTATAAAATTCCAGGACAGGTCTTCTGT
CTAATCAATATATCGAATAAGTAATAAGTTCAGTATTACCATACTGCCCT
GGTTGGAAATTCTCTATTCTGTTTTATGGAATTGAGACTTTTAGTTGAGA
TAGAATACAATTTAGATAGTCAGGCAGACAAATTTTCCTGCACCACATAC
TAAAAAGTCTTTTGATAGGCTATTCTAACCTGTTCTAACCCATAGATTTA
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GAAATTTCTCCTACCATTAAATTATGTCTAGGTATCTTTAGACAGAAAAG
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GATTTAGATTTTAGTAGATTTAGATTTGATATTTTTCATTGTATTAACAC
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GTATGAATTATTAATGAAGGGCTACTTGTCTAAATTTAATTTAATCATGT
TAGTAGCTCCACATATTTTCCTTCCATTTTCCCTCACAATTATTAAGAAT
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CTTTGTTTTTTTTTCTTTTTTTCACTTTCAAAATGAAAAAAGGATTTCGA
CATAACTCTAGTTTCAAAGGAAAACATGGGATAGATAACACTTTCTGGAG
CCAACTTAACCAATATATTTTTCTCGAATTTGAATATATTTTGAGAAAAC
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ATGTTTTGAATTTGTTTTACTAAGTACAATTTTGTTTTGAGCCTCTAACA
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GATTTGAATATGTTTGAATCATGGTTATTTAGAAATTTGGGTTTAAGTTG
TTTTTTTAATTTGCTGGTTTATTTCCGAGCAAATGCTTTTGTTAGGTTTA
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TATCTTTAGTTTAAACTGCATCGTTTGATGTTTGTTTACACGTTTTTTTT
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ATTTTCGCCATTTTTTGAGTATTTTTATGTCCATTTTCTTAAGAAATTGG
GTGATTATTTATAGAGTCCGCGAAGCCTTAAAATGTTCTTAATTTTTTCT
TAACATTTTGGTCATATCGAAGCCTTTTGTTCTTATAAAAAAACGTGTAC
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TTGTTTCTGGTGAAGGCGTGATTTTGGTGAGAAAATTGAAATTTGGTATG
CTCTCAAGAAGCGAAAATAAATTTTTTCCTACTTTCTATTTCATTTTACA
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AGGCCTTCTTATCAACATCGTTTAAAGTTTGATTGATACTTTTGTTAAGA
TGCTATCTATTTGAAATTTCTTTTTTAAGAACTGCGAAATCAACGAGGAT
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CTTTCTCAGGGATTTGCAATGGAAACGGTTCTGTAATTGTAATGTCTGTA
ATCTATAATGAAAGTGTATTTTGTAACAATTACAGTATTTGAGAGGTCAG
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CACAAGCACTCGATGAAGAGGAAGTATCGAGTCGAAGTGTCAAAAACCAC
TTGACAACACTTCTCAATCAATAATACGGAAAAAGTCTCATGACACAATT
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GATCTAGTTTTCATCTTATTTTAGGTACTCTATCTTTATAAAAAAAATCT
CATCTTTTAAGAGTTATTACTCGGCTATAAGTTAAACGTTATCATTGATT
TGAGGCACATACTGTAGTTGCTTATAAAGAATGTTTTACTGACAATGTTC
TTATCATTAAAAGGACCTATTTTTGAACATACTAAAACAGTCTTCTCATC
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TTGTTCCGTCCTACACAGATAAGTTTGTCAAAAGGTGAATTAGTATAGGA
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CTTTGTTGAATTGAATTCCCACCATGAGGTGAAAGTAACGTTTGTGTTTC
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TGGGGTTTCTCAATTGTGATATTTCATGAAATAACGGGACTGTGAAGTAC
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TTGAAAAGGCCTGAACAACAAACTAATGGAATGCTAGTTTATTCTCAGGT
ACGATTTTGTTCTTGAATATAATATTTTATAAGGCTCGTGAAACTACGTG
ATCAGAAGTCATGACTTCTATTGAAAGTTCTATTGAAACGGTCAAGAAAT
ATCCTAGCCTGCTTCTGTCATTCCGTTTTTAACGAAACGTTTTAGGCTAT
CTAGTTCGACTGTGATGTAGTAATACCATACTAATAATGTTCCCCTTTTC
CATGTATTTCAAAAGTCTATAAATGTTTCAAATTTATTAGGAAATGAGGG
CGTTTCTAGTTATAATCTTAATGAATTGTTTTTCAAGATTTAATAAAAGA
CATCGCAATTTGTTATCATTTAATGGCCTCGTTTGACGGATATTGGTGTC
AGAAAAAGATAAATTGCTTTTCCACGCAAATACATTAGAGGTCTCTCTCT
CATGCAAAATGTCTTCATATATCATAAAAAGTTTTTAGCGGTGAAAGAGT
TTCGGATTTTTCTTTTCTGTAATTTTCTTCTTTTTTGGCGGTCTGTCTAA
AAGTTTCCAAGCCAAGGAAAGCGTATAAGTTAAAAGTATTTTCGGTAGGT
ATATCCTAAGTAATGCACAGACTACGTTACTTTTTTACATGCCACATACT
AGCATTTTTTCTTCCCAGAATCTAAGTCTATGAAACCCCAATGTGGACCG
GCATTCTAAGTCACCTATTCTTTATTTTCTCTTCACTTTATTTCTTCTTC
CATTTGTAATTCCCACACCGTATATTCAATTTTCTAAATTTTTCATAAAT
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TTTTCGTTCCTTGTTCATAATAAATTCATAAAACCTGGTTGATTGCTCAT
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GACCATATGACAGCTTTCTCATATAGACCACATATAAGTTGTTTTAACAT
CATATCTAACAAGATTTTCTTTCGCTATCTGTATGTATTTCTTCTATGGG
GCCATGCTGCCAGTCTGTCAAAACTCACTGCAGTAGAGCAGATTTCTGTC
TCGCCTTCTCAATGCATGTATGTATGTTTTTTGTTTTGATTTTCAGACTC
GTCATAATAAATGTTCGTGTGTGTTATAATGTTTCCGTTATAAATTTTGA
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AAGTAGTTGTAATTTTTTTCTCTTATTAAAGAGGGCTAAGAGGCNTTTTC
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AGAGGTCTTGAGAACAGGAAATGAAAAGAATTCAGTACTACGTCTCTCTA
TGTCATTTTTCGAGTTGTTTTGGAACTATTCGTTTGTCTTGCACTATGAT
GAAAACATGTACTGTAGTGTGTGGGAAAGGTCATGTGAAGTTATGTTGTT
AGGTTTGTATTCTATTCGTCATGAACTTTTTAGACACATTCTAACGGAAC
TAGGTACTCAATCATGTTTGTTTTTCTTTAGTGTATTTCATTTTGTGGAG
AATCTTATTATCCTTGAAGAACTCTTCTATGTTCTCTGCCTTGGTAATAA
AGTTGTGGCCGACCGTAGGGGTGGAAAATCTCATGTTTGNCCTTGGTAAT
AAAGTTGTGGCCGACCGTGGGGGTGGAAAATCTCATGTTTAGTTTGTTGT
CTATAATTTTTTTAGTTGCCAGTTAGCACGCCCAGTTGAATGCGTGCATA
AATAGATGCCATCTTTCTTGGGGATGGACATGGATAATGGATATTAGTTT
TGATAAAAGATAAGAATATTTTCAATTTTGAAGAAGTAAATTTTCAAAGA
CGTTGAATTGCACAAAAGAGACACCTTTTTCATAAGGATGCCGTTTTGTT
TTGCTTGTAGTCTAGGTTGTTAACGTTTTATTACTAAACCTTCATTTTGA
CATTCGTGGCTTTTTTCGCGGTTAAGGATTAGAGCTACGATGGGCGGAAG
TTGATAATGCTTTAATACTTCCGTTACGCAACTGCAGTTTTGAAACTTGT
GGTTGGAAAGATCTTTTGTGTGCTCTTGTTTTCGATTATGATAGTTTCAG
TAAATAATGATTAATTAATTAAGAGTTTAATTATGATGACTTTATTGGAC
ATTTCCAGAGAGTTATTTTAGAAACTGAACACATGTAGTAATAACGGCAG
ACGACGGCTGATCTTTACTTTCACGCAAAAATGGGGAAAATCTATAACAT
TTTTCATCATTCTGATTCTAAGTTTTTGTTATTTCGCGTAGAAACTGACC
CTAGTATTTGTGGGGTTTAAAAATAGTGAGACACACACTAGGAAAACAAA
TTTGTGCCAGTTTTGGAGAGATTGACTTATAGAAGCTTGTTTTAAATAAT
GGTCAATTTATGGAGACTGTAATGTTACTCTTGGGTACCTAATATTCGGG
GAGGGGGGTTGGAAAATTTTCGAAAAATTAATTAGCGGGGTGGACGGCTA
TTAGAAACCCGAGAGTGGTAGTTTTCATGACACAATGTTACTGAATTGAC
ACACACAAAACATAATATCTTAATCAAAACATCAAAGGAAAGGTTTAATG
ACTTTGACATTTTCGACGTAATACAGCNATATCTTAATCAAAACATCAAA
CGAAAGGTTTAATGACTTTGACATTTTCGACGTAATACAGCTTGTCTTTT
TGACAGATGAGATGCTGTAATGTTCAAATAAAATGCCGTAACATCTGCCT
TTTCATGTTTGTTCACGTATACGGTTTGAATACATAAGTCACCTGTCATT
TATGAGAAATCATATAATTTGAATGTTGTTTTATACATATGTGAGGTGCC
ATTTAAGATGACATTGTTTATTTGATTGTCAACCTTGAAGGGTGGCTTAC
TTACCACTCTAACTTTATTTGTTGCGAATAAGTTTATATGATTGTGACTT
TTTTTAGAAACGTTCAACCTGCTTTTACCTCTAGTTTAACCAACGGATAG
CGATTTTCTCAAAGCTTTTAGTATAAACTCAAGGCTTTAGCCTCTCCACT
TTCACTTTAGTATCCCTGGATTTCAATCATTTTATAAATATAAATATTCT
TCTCGTTTTAGAAAATCAAAGATTGTTTGGATTTTAACTTGAAAAAGATG
CGTAAGAAAAGCGTCAGTTGCGTCAATTTACGCCGGAGATTCGACAGCAA
GAACAATTCGTGTCATAATAACACCAATCAAAAATACGACAAAGTAAATA
GCGAAATATTTATATGTACAAAGAAAATTGATGATGGAATTTTACCGTTG
TTAGAGAGTGCTGGCTCCTTATCTAGCTTTAATAGTTTCACACCTGCAAC
GGAAGAAAGCTTTTTATTGGAGAGCTCGGATGAGGCGCCAAATACGAATA
AATCATCGGATTATGAGAACTGTAACAAACGTCGAACCAGGGGTAAAATA
AGATGTCTAAAACACCGTCCGCACTCATTATCTTTATCCGAACGGAATTT
GACAACCCGATTACAAGAGAACGTTAAACCCGATTCGGAATCAAGCAAAG
ACAATAATTCATCTTTATGCAAATCGAAAACAAATCTTACAAAGTGTTCG
CATAATACTGAAGATGCGCATTGTTGTGGGCAGCAAAAACACAAGAAATC
TTTGAAATCGAACGAATTGATAGACTCGCCTACCCAAGAGAATAATAACA
ATAATGATACCATTAACGAAGAAGCACAGATTTCTTTCAGTAAAGAACAA
CGCAGACGTTTAAAACAGAAAATGAGACAGCGACAGAAGTTTCAGGATAA
ATCGGTTTTCCTTGGTCTTTTTTAAACGCGTGCCTATTCTACATCTATTG
CAGATCGTTTTATTTTTTATATATACGCAGTTCTTTGGTTTCATACATTT
TCTTTTTGATAACATACGATGGTGAATTTTAATCCGCCACAGAACACGAC
GTACGTTTTACCCCGTTTATATATCATGATATTTTCTTTTGATGCTATAT
AATAGTTGTTATATAAAATCTTTGACTCGAAGCTTAGAACCAAATATCAT
TTTACCAAAGTCTCTTCTGTCGATTGGTTAAATCTCGAAATTTCCTTTCT
TTTCGATTATATTCATACGTTTTCGTGTCCTCAAATTCTAATTCTACTGA
TTGAGAAGACTCATTATCGTACAACAGCATAAAATTTCTAACCCCCTTGA
ATTATGTTGTTTATTCGCAATTGTTAACTCAAGATTATGTCATCTTTCCT
GTATGAAATACACGTTTTTTTTTATAAGAGCATCCAAAAATTTTGTTTAA
ACTCTTCGGATCTTTTTCAGTTTTAAGCCAAAAAATATTCTTAACATGTT
CTTATTTTCACCATTTTGTGACCATTTTTACCCATTTTCCTAAGAAATCG
GGTGTTTTCGAGTCCGTAAAGCCTTAAAATGTTCTTAACTTGTTCTTAAC
ATTTTTGCGACCGAAGCCTTTTTTCATATACGGTTTGTTCTTATTTAAAA
AAAAAAACGTGTACCTAAAATACCTGGATAATATTTCCTTTTCGAGATGA
GAAGAATGACTTGTTTTGACTTACCCAAATTTCAATTTATAGGCTATACA
TATTTTATATTTTTTACCTGCTTTATTAAGAAGTGTTTTTACCTCGAGAT
TTGAAATATTTATGTTTGATTATACGTTATATATTATTTTTTTTGGAAAA
TTTCTTTTGACACTAAAACTTTCATGATTGAATTCTCTAGCCAATTCATA
TACAATTACAAAATTTCGAAAGGCTTATATACTTTTAAACTGATAGCCTT
TGTACATGATTTTATTAAGATTGCTTATGTAAAAGATTTAGG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00015057-exon-sc0000203-1575043694:265898..265922 | TCONS_00015057-exon-sc0000203-1575043694:265898..265922 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00015057-exon-sc0000203-1575043694:251631..253361 | TCONS_00015057-exon-sc0000203-1575043694:251631..253361 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00015057-exon-sc0000203-1510915933:265898..265922 | TCONS_00015057-exon-sc0000203-1510915933:265898..265922 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00015057-exon-sc0000203-1510915933:251631..253361 | TCONS_00015057-exon-sc0000203-1510915933:251631..253361 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000203 | supercontig | sc0000203:251631..265922 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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