TCONS_00015123 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00015123
Unique NameTCONS_00015123
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2078

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00015123 ID=TCONS_00015123|Name=TCONS_00015123|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2078bp
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GCACATTTTTGCTGCTAGCAGAGGGAAAGCAATACCATCCTATACCCACC
TTCTTTCACCAACGTGATTCCCATGGTAAACCACTTGATGCCAATAGAAC
TGATTTTCATCTGAAAGGACCCTTTGTCAATCAAATTGATATTAAGAACA
ATCTAGAGGCATCTTTAAAAGTTTGGCCAGAGGAAGTAGAAAATGCAGGA
CAAGTTACAATTCTTTGGGAAGGAATTCCTAATCCCACAAGTGGAGACCG
AATTGGATATTATTGTCCTTATTATGACAACCCTGCACATGGACTTGATT
ATATCGATGTCACCAAATCACCAACTTGGCAAGAAGGATATGGTTATTAC
ACAGTCAAATTATACAACATGCGATCTCCTTGTGCATTCAGATATTACAG
TGGTGGCAAAACTTTGGTTGCCATTAGCAACAAAGTGAGGTTTACAAATG
GCGATGCTTTTGCTCCACTTCAAGTTCACTTGGCCATGACAATTAAACCT
ACTGAGATGAGAGTTATGTGGGTTGCTGCCAAAGttgATAGTGGTATCAA
AGTGAGTTATGGTAAAACCAAAGCTTTGGGTACGACACAAACAAAGTTCA
CTGCAAACACATACAAAGCCTCAGACATGTGTGAAGCAAATGCTAACACA
ACTGGATTTTGGGATCCTGGATATATTTATGATGTTTTGTTGACCGACTT
GGAACCCAACACAAGATACTATTACTCGTGTGGTACGGAAGAGTTCATGA
GCCCAGTGGCCAATTTCACAACCCCTATGGCAGCAGGTGACAAAACACCT
TTCAATTACATTGTTTACGGTGATATGGGATTAGAGCCTTTCCCAGAAGG
AATCGAGACAGCGAAATTGGTACGCCAAGAAATTGATGATAATGATGTTC
GCTTTGTTTATCACCATGGAGATATCTCTTATGCACGCGGATATGCTTAT
ATTTGGGACCAATGGTTTGACCTGATCCAACCTTATGCATCTTTGATCCC
TTACATGGTCGGTGTTGGAAACCATGAGCAAGATCATATGAATGGACATG
AACACGACCCATCCAACCAACCAAACTTCCATCCTACATGGTTCAATGGA
TACACTGACTCTGGCGGCGAATGTGGTGTTCCAACTGTTCATCGATTCCA
CATGCCTGATAATGGCCTCAAACTTTACTGGTACAGTTACGATTATGGCA
TGGTTCACATGGTGGTGTTTAGTACAGAACACGATTACCGCCCAGGATCA
CAACAATATAAATGGTTGGAGAATGATTTGAAGAATGTTGATCGCAAGAA
AACTCCTTTTGTGATCGTAAGCGGGCATCGACCAATGTATTGTAGTGAAT
ATGGTCCAGTTGATTACAAAACTACTATCCACATGCAACAGTATGTAGAA
GATCTCTTATACGAACACAAAGTAGATTTAGGTCTGTGGGCGCACTACCA
TTCATACGAGAGAACATGCAAAGTCTACCGCAATGAATGCCGGGAAGATG
GTATCTTACATTTGATGATTGGATCTGCAGGAAAACAATTGGACAGTGAG
AAATGGTATAAGAAAGAATGGTCTGCATACCATGATCGTAACTATGGTTA
CGGAAGATTCTCTGTCAAAAATTCAACTCATATTTTTTTCGAGTTTGTTC
AAGATAGTATCGATAAAGTCGTCGATTCTGTGTGGATCACCAAATGAATT
AATCGAATATCGTCTTAGGTGATAAATCGCGATTTTCCTGACTGATTACT
ATTTGCCAAGCCACATTCATGAGATAAAAGTTCGGATATTTTGATGAATA
GTACCAACATCTTGGAGTGGCCAAGCCATGAAATTTActtaaaatgttaa
atttttctCAAGATGGACGTTATTTTTTCACCATCAAAGccttttcacca
tttttttacttatactttttttaattttgtacattttatGCATCATATTT
TCGAAGTAAATATTTAAAACTCTTTTGCCACTGTCCTCGATTTCTTCAGC
TTCTGTAAGAGGATTGGCTAAATCATGA
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000204:23388..37273-

Legend: exon
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>TCONS_00015123 ID=TCONS_00015123|Name=TCONS_00015123|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13886bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000204:23388..37273- (Clytia hemisphaerica)
TTTAGAAATTTTTAAATTGATAATGAAGTCCCTAGGGCTTCTAACATTAT
GCACATTTTTGCTGCTAGCAGAGGGAAAGCAATACCATCCTATACCCACC
TTCTTTCAGTAAGTATCACCTATTCAAAATGGTTTGAACTTTTGATAAAT
AATTGAATTTTTACTGAAATTCAATAGCATTTTTAAATACTTCAAATGAA
TGTTTTTCAACATGAATGGTTTCGTTCTTTCTTGTAACATGAACCTTTTC
TTGAGTTCTTAATCAAAATATTTTATTTCGGGAAATCATATGATAAACGT
AACTGAAAGAGTTATAAAATCAAAGACTTGCCTTGTCAAATTTCACTGTT
TGTTATTGTATAATCATTTCCCTTTGACTTCCTCATTTAAATCACCTTTC
TTTTATCTTAGCCAACGTGATTCCCATGGTAAACCACTTGATGCCAATAG
AACTGATTTTCATCTGAAAGGACCCTTTGTCAATCAAATTGATATTAAGA
ACAATCTAGAGGCATCTTTAAAAGTTTGGCCAGAGGAAGTAGAAAATGCA
GGACAAGTTACAATTCTTTGGGAAGGAATTCCTAATCCCACAAGTGGAGA
CCGAATTGGATATTATTGTCCTTATTATGACAACCCTGCACATGGACTTG
ATTATATCGATGTCACCAAATCACCAACTTGGCAAGAAGGATATGGTTAT
TACACAGTCAAATTATACAACATGCGATCTCCTTGTGCATTCAGATATTA
CAGTGGTGGCAAAACTTTGGTTGCCATTAGCAACAAAGTGAGGTTTACAA
ATGGCGATGCTTTTGCTCCACTTCAAGTTCACTTGGCCATGACAATTAAA
CCTACTGAGATGAGAGTTATGTGGGTTGCTGCCAAAGGTATGATTTGAAT
TAGAAAATCTTATGTTCTTACAAATATATTGTCAGGAAAATTAAAACCAA
CAACTGGTCTTTATTTGACCTTAATCCATATATTAGCTGTAAAATTAAGT
CAAGCTACATCTACATTTTGCATCTTTCTCAATTATAAATTTTGTAAATT
TTAGTTGATAGTGGTATCAAAGTGAGTTATGGTAAAACCAAAGCTTTGGG
TACGACACAAACAAAGTTCACTGCAAACACATACAAAGCCTCAGACATGT
GTGAAGCAAATGCTAACACAACTGGATTTTGGGATCCTGGATATATTTAT
GATGTTTTGTTGACCGACTTGGAACCCAACACAAGATACTATTACTCGTG
TGGTACGGAAGAGGTAAAACAAGCTTATTCAAGATCCCACTCAAGAAGAT
CTACTGAATGAGTGACAGTCAACGTGGCTTTGATCAACCTTTAAGACAGC
TTGACCTTTCTTTTCCAAAAGGGTTCATTGGTATGAGGCAAAATATCAGT
ATGTTACCTACACCCCAATACTAAGATTGCCTAAAGAGCATTTTTTTGAA
AGTTACTGGGGCATTGGCTTTCTTTTGATGTATCTGACGTCAAAACAAGT
CGTTTAGTTTTGAAAAACCCTCAGTCCATATGAAATATTTTAAAAAGGCC
TATCCCGTAAGTTTTATAAAGCTATCCATGCCAGTCAAACAAATTAACTA
CTTTCTAACATGGCTTCTTTAATTGAATATATAAGTTTTATCTATGGCCT
TCAGAATGAAGGAAAAACTTTGATTTTAATTTTTTCAAAATATAAGGCTC
ACAAAACTTTAAAAATTCCCCTTTAAAATTGAGGCTCTAGAACTCAGGCC
CTTAATAAATAAAGTAGCAAGTGATTCATCCATAAATAGTTGATCTCCAT
AAGATATTCCTTTTCGTGTAAGATGATTCCTTGACCTTTTTTTTGCAGTT
CATGAGCCCAGTGGCCAATTTCACAACCCCTATGGCAGCAGGTGACAAAA
CACCTTTCAATTACATTGTTTACGGTGATATGGGATTAGAGCCTTTCCCA
GAAGGAATCGAGACAGCGAAATTGGTACGCCAAGAAATTGATGATAATGA
TGTTCGCTTTGTTTATCACCATGGAGATATCTCTTATGCACGCGGATATG
TAAGTAAGATGAAACTATGAAATTAACACTTTGGTTATTGAGTTATTTTC
CATTTTGTCTCGTTTTGTCTTCATTTATATAATTGATTTCTTCTTCAGTC
ATGTTTGCAAAGTATTTTTAAATGGCTTGTATTGCATAAAATCATAGATT
TCTAAAAACCAATCTTATTAAAATTTATCTTCAAAGGCTTATATTTGGGA
CCAATGGTTTGACCTGATCCAACCTTATGCATCTTTGATCCCTTACATGG
TCGGTGTTGGAAACCATGAGCAAGATCATATGAATGGACATGAACACGAC
CCATCCAACCAACCAAACTTCCATCCTACATGGTTCAATGGATACACTGA
CTCTGGCGGCGAATGTGGTGTTCCAACTGTTCATCGATTCCACATGCCTG
ATAATGGCCTCAAACTTTACTGGTCAGTAAAATTATCAGCTGTAAATTCG
TCACATTTTTTATTACAATGATTCAAGTTTGAAAACACCATTTTCACATT
TATTTATGTTTGCCTGAGTAATGCCCGAATTTCTTTTGTACATTTACAGG
TACAGTTACGATTATGGCATGGTTCACATGGTGATGTTAAGTACAGAACA
CGATTATCGCCCAGGATCACCTCAATATGTTTGGTTGGAGAATGATTTGA
AGAGTGTGGACAGAACGAAAACTCCTTTTGTCCTGGTTGGAGGACACAGA
CCAATGTATTGCAGTGAATCCGTTTATCGTAAGTTGGCCTTCTTTGGTTA
TATTATGCTTGTAAGGGGTGAATTTTCACCAAAATTTCTATTCCATTTTT
CAAAATCAATATCATTTCACATTTTCTAGCTGATTATGTTGTGGCTCTTC
GAATGCAACAATATTTTGAAGATTTGCTGTACAAATACAAAGTGGATGTT
GGCTTGTGGGCTCACTACCATTCATATGAAAGAACTTGCAAGGTCTACCG
TAATGAATGTCGGGATGATGGTATCTTGCATCTCGTTATTGGATCTGGAG
GTCAAACATTAGATGTGGACAAATGGTATCCAAAAGAATGGTCAGTCTTC
CACAAAGATGATTATGGTTATGGTAGATTCTCTGTCAAAAATTCAACTCA
TATTTTCTTTGAGTTTGTTCAAAACAGAAGTCAGAAGGTGATTGACTCTG
TCTGGATCTCCAAGTAAACACACAAGGGTAGTTGAGTGATAAATAGGAGG
AAAAGGGAGTTTTTAAAAATTCGTCCCTTGGTATATAAGAGTAAATTATA
AAAGCTGATAAAAAATTATTTTCAAATTAGCTTCAAGAAGATTTTAACGG
TAATAGAACGAGGGAATTTTTTTGGGTAATGGTTTTTAAAATTAATAACA
TAATTTTTGAATGGTAATTGGGTGTTTTAGATCCTAAAAATAATTATTTT
TGTGAATGTGTTTTAAGTGTGTTAATAATGTTAATTTTTTATCTCTTGTT
TTTACGATTGTTTTTATCATATTTTGCATTTCTACTTTGTTTACTAAACG
CCTTTGTATATCTTATCAATGTATTCCTACATCTCTTCACTTTATATAGT
TGGATTTTAAGAACTGAAGTTACAATGCTACAATACACAAAGTTTGTGAT
CAGTTTGATCCAAGTTAAGCAGTTAATTGTAGTTTCAGTACTTCCACTTT
GCTTCATTGTATTTTTCGATTTGGGAGGTGTTAGATGGGCTTCAACGCTA
TATTCTCAGCCTTATTGGAACATTTTTGAACTTTTAGATCCTGAGATCTG
AAGGTCCTAAGACTTAAGTCTAATGTTGAAACTCTAAGTAGAGTACTTCC
GAACTGTACTTCAAAGCACTTAAAAATCACTTGTGGTTTTAAAGTTTTGA
GGGAATTCCCCTTTTGTGTGAAATATTTCGGCGCCGATTGTAGTTGAAGG
AATACAGTATTTTGTTATCATGTTATTCATTCTATATTACTATATTATTA
ATAATATAATCCGATATATAATATTTTCTATCAGAAATATATTTTTGGCT
GATTTTATCTTGTCTCCTAGCTTTAAAGTAAGGCTTTTTTCGAATATCTA
TTTATTTAGCCTGTAAACTTCAATGTTTTGATAAGGTTTTTATCTAACTA
ACTAACATTTTTACTATGTTTTAGATGATAAAAATGAAATAACAGTACAT
CAAGTAAAATGAAATTTTCAATATTTCTATGGGTGTGCACATGTTGTGTT
GTGGTGGCCCATGAGAAAGGTCCCCTTCCTGTGCCTACCTATTTTCAGTA
AGTTGTATTGATATTAGACTTTTATTAAGATATCAGATGTGTCATAAATG
ATTTTTTTTTTCATTTTAGCATATCTTTTGATTTAATGGACCAAATTTTA
ATAAATAATCCATCAAAGTTTAAGTCTATTTTTCTATTTCAAATATAATC
GGATTAAATTTTTTTTTAATTCCTACAACTCGAGAAAATCTATTTCAGAG
AGGATAACTTATTTCTGGAACACCTGGTACCCAGTAATGAATTCCAAAGT
GTGTCCACATTTATCAAGTAATTATTCTATTTTCAGTCGCCGGCATGAAA
ATGGATCAATCGTAAATGCCAAAGATCCAAGAACTAGAAACTGGATGGAT
GGTCCCTTCGATAACAGAATCTCTCAAGAAAATATCGATGCTAAATTGAA
AGTATGGCCTGAGGAAGTTGAAAATGCAGGACAAGTGACTGTATTGTGGG
AAGGTATTCCCAATCCAACCAAAGATGATCGCATTGGATATTATTGTCCA
TTTTACGACAATCCTAAACACGCACTGGATACTATTGATGTCACAAAATC
ACCGACCTGGCATGAAGGATATGGTTATTACACAGTCAATTTGTTCAACA
TGAGAGCTGCTTGTGTCTTTCGATACTACAACAGTGCTAAAGCTCTTGTA
GCTGTCAGTAACAAAGTGAAATTCACCAATGGAGATATCTATTCTCCGCT
TCACGTTCATTTATCCATGACCAACAAACCTACGGAGATGAGAGTGATGT
GGAACTCCGCAAAAAGTAAGTCAACTGGTCGGCTGCTGGCATCCACTAAC
GGATTCGTGCTTCTTATAAACCTATATTACTCTGTACCAGAGTGTATCTC
ACGTTTACCGCTTCGTAGTACACTCTGTGCGCATTGTCTGTTTGATAAAA
AAAAATTCCCGTACGGAGACCTCTGCGATGAAGTATGATTTATAAATAGC
AACACTTCTCTCATCGTCTCCCCTCTCTTACCCACACTCTATCGTAGCAG
TCTGTTTGAAAAATCTCAAATGAGAAAAGACAATGACAACAGACCCTCTA
TACTACGGCAACGAATTTTGAAATTAGCCGTAGATATCGGATCTGTGTAC
AGAAAATACCTATATTGGTAAAGGTCTACGATTCAGACTAGTGAACTGGT
TTAATATTAAATGCCTTGAAGGGATAATTCTTAGTATGCGAAAGTAGTAT
TTTTTATAACGAAAGCATCCAAAAATAGCAGATTTTGACCATTGTGTCTC
TAGTTTTAGTAAGACGTTTTCGTTAGAAAAATGACTTGCACANGGCAGGT
TTTGACCATTGGGTCTCTAGTTTTAGTAAGACAGTTGTCGAATCCCAACT
TTTTTCGGGTGTTTTCGTTAGAAAAATGACTTGCACATATCAAGACTTTG
AAGTTTGACTTACAGATAACTTCTCTAAGCATGAGAGAACCCTCTGAACT
TTAGGAAGGTATCTAGACACAAACATTGAAAATGTATGTTCTTTCCTCCA
CACTTATTGTGGGTATGTTTTTACAAAGATAGCCTTGTTTTACTCGGCAT
TCCTTTTAATCATTCTTTTGATTTCACTTTTCAGTCGACAGGGGTATCTT
ATGTCGGTATGGCAAGTCCAAAGTGTTCAATATGACTCAAACAACCTTCG
AATCACATACATACAAAGCCTCAGACATGTGTGAATCACCTGCGAATAAC
AATGCTACCTGGTACTGGGATCCTGGATATATTTATGATGTTTTGCTGAC
CGAATTGGAACCCAACACAAGATACTATTACTCGTGTGGTACAGAAGAGG
TAAAATTCTGTTCAAAAATGTTTCATGATATTCATGACCTAATGTTTTAC
ACGGAAGCACCCAAAACACCGGGGTGTTTTGCCACTAATTTTTAAATAAA
ACATTACGTCATGAATATCATTTCGACTAATTATTCAAGAATTTAGTTTT
ATCACTTTGGCAGGAAAAATTGTTAATATATATTCCTGTATTTATTTTGC
TGTTGACCAATCTCTGAAGTGTAATAAAAACTCATTTTGTGGCTAAAAAC
ACTTTGGTTTAAGGGCATCGTTTAACGTATCACATACAATTTGCTTACAC
AGCATTTTTGAACAAAAGAAAAAACAATTAGCTCCCCTTCCCTTACCACG
CGATTATAAATTTTAAGAAATTGATTGTTTATTCTGCTTTGTCAACATAG
AGGTGCGTCTTTTTCTCTAAATCATAAAAAGTATCTTTAACTCTTATTTT
CCTCCCATAGTACATGACTCCAACATACAACTTCACGACACCAATAACAC
CAGGAGATAAAACTCCTTTCAACTTCATTGTGTATGGTGATATGGGTCTT
GAAGCATTCCCTGAAGGAATTGAAACTGCCAAGTTAGTTCGCCAAGAAAT
CGATTCGCACGATGTTCGATTCGTTTATCACCATGGAGATCTCTCATACG
CCACCGGTTTGGTTTGTAGCAAATTTTTTCTTGTGTTCCACCTGGTTAAT
GTCCAGGGTGTCAGATTCACTTCAAAAAGATGCTTTGCAAATGTACCAAT
TTTATTGAAAATGAATAAATACCAACTGACTTATTATTGACTTTACGGCA
ACATTGTTATCAGTAACTTAGTTTATACAATTTTCCTATCATTTATGTTT
CAGGCCTACATCTGGGAGCAATGGTTTCATTTGATCCAGCCTTACGCCTC
CCTCATCCCTTACATGGTTGGCATAGGAAACCACGAATACGACCATGTCA
GTGGACATGCCAAAGACCCTTCAAAGCAACCCAACTTTCGCCCTTCATGG
TTCAATGGAGGAACAGATTCTGGAGGTGAATGTGGAGTACCAATGTTTCA
TCGCTGGCATATGCCAGACAATGGTCTTGCTATTTATTGGTATTTGTTCC
CTATTTGCAAATTTTAAAAATAATTACAGTACTTTTTCGGCCCTTTTTAC
GTTGGCCCTTATTTGCGTTTTTTTTCTTCGTCGCTGGCGAGATAAGAGCG
GGTGTAAGGGAAGGGATTTAAATTAGGGCTGGGCTAAAATGGAAAAAAAT
TGCTAGCTTTGGCGTAATTTTAAGGCCGGCGCTTGATTAGGGCGTGTAAA
AGGGTCATTAAGATTAAGGTACTTGACTTTATTCTATCAGAACTTTGGTT
AGTTTTAGGTTCAGGTTAGTTTTCAACATGATCGAGTAAAGAGGAAGGTA
GTGTAGACAAATATTCAAGTCTATTAAACAATAAGTGCGCACTCTTTTGT
GTTTTCATGCAGAAATTAATTCAATGTAATTATGGTAATATTTTTAAACG
TAGTCTCCACATAGTAGCAACAGTTATTCTGAACAAATTTTTTGACGGTG
AGCTCAAATTTGTTCGAATTATGGAATTTCCGAGTTATGGAGGCCGGGTT
ATAATAAGGAATTGTTTAGTAAAGGAACAAGAAAACTCGTCCAAATTTAG
GATACATTCGAGTAAAGGAGGTTCGAGTTCTTGAGATTCAACTGTTGTTT
GGTCTTGTATCTAATTTCAATCAACGAACAATCTAGCAAAATTTGTTTCC
CACTTGCAGGTACAGTTATGATTATGGCATGGTTCACATGGTGATGTTAA
GTACAGAACACGATTACCGCCCAGGATCACCTCAATATATTTGGTTGGAG
AATGATCTGAAGAGTGTAGATCGAACGAAAACACCTTTCATTATGGTTGG
AGGGCATAGACCGATGTATTGTAGCGAAGCTTACCCAGGTATAACAAACC
AGAGTTTGCAAGTTATTAAAAATTCACTCCTTATAATATTGTTTGGTTAG
TGTGAATCACTAGTCCATGTTCACTAGGTAGCCTCGGTTAGGGTTTTTGT
GGTATAGTTTTAATGGTGTTTAAGCATGTTATTACCCATTTTGATTCTCT
GTTTCAAAGTGTAACTCATTTTCCCTGGAATCTCTAACTTATTTGTAAGC
ATCAATATTGGTTTTCTTCTTATTCCAGTGAATTATGGTATTGCCTTGCA
CATGCAACAATATTTCGAAGACATGTTTTATAAATACAAAGTGACCGTTG
GTTTATGGGCTCACTATCATGCTTATGAGCGAACGTGCAAGGTCTACCGC
AACGAATGCAGGGATGATGGTATCCTACATCTGCTCATCGGGTCTGGTGG
CAGAAGCTTGGATCGAGACGAATGGTACAAAAAAGAATGGTCAGTTTTCC
ACAAGACAGATTACGGTTATGGAAGATTCTCAGTCAAGAATTCAACGCAC
ATCTTTTTCGAATTTGTTGAGAATAGCAGTCAAACGGTGCTCGATTCTGT
TTGGATCACCGCTGATTGATTAATTGAATGCAGGGATAAGATACAGGTTT
GATGCTAGTTGTTAATAGATTAGAGTTTAAAAAGTAGTAATGTTTTGTGA
ATTGTGAATCGTACAAAATATGAATCGGTGTGGAGAGTATAACCTTTCCT
TTCCTTTAATCGCGACATTTTTTAAAATAGTATGAGTCACGTAGATTCAT
GTGATTTAGCTTGTATAATTAGAATGTTGATCTTGACTACATATCACGTC
TGAAAAGCTTCAAAGTTGTGATGTCAAAAAAGATAATTAATTATAATTTA
TACACGTTGGTATGATCTATTCATGCCTTTGATCGTTTTTAATAATACCA
ATTAATTTCATTGTAGATATTTTATGTAAATCTTTTTTTTATATGTTTTT
TTTTTAAATTACATAATTTTTTGTTTAGCATTTTGTGGTTCGTAGAAAAT
ATATAAGATGTTTAAAAAACAAGACAAGTCACGGGTTACTAGTTGGTATC
ATAAAAAGTTTTTAGACAGGAATTGACTTGTCTCATGATAGAGGACCTCA
CATAGAACTTTGTTGCTCTCACGAAAACGATTGTTGATTTTGATACCCTT
GTCAACAGAGCTCTCTTATAACTGGTCCTTTCCTGTTGTGATGTTTTTCT
TAAGAAACTGCTAGATTGTATTTGCATTTGACATGCTTTTGTTGTGGTTG
TACCCTTGTTTATTCTTTATACTTATAGTTATCTTTCTCTCTCTAGAAAT
ACTAAAAAATGAATTAACAAAAATTAAACTAACAAATTAACACAACAAAT
TAAAATGAAGGCTGTTGCATATTTGGCGGGGTTCATTTTGAATTTTGTTG
GATTGAATGGCAAAGGTTACCATCCTGTACCAACTTTTTTCAAGTAGGTG
GAATTATTTTCTCTTGACAAAGCGAAACCTCTGCTCAGTCATCATGTATA
TCGCATAACTTCAAATGAGAACCAACTTTTCGACACCTTCGTTCAGGAGT
TTGTTCAATGATGGTCACTACGATTAATTTAGGGTTCCCTATATGGTTCT
TATGCTTTCTGCTTTTCGTTTTGCACTGTGTACACTTATTTGCAAGTCGT
TTTTAACCCAAAATATTTTGAACACTTTTTTTTATATATATAAGAACATA
AGGCTTCGATGGCCGAAATATTAAGAACAATTTAAGAACATTAGATTACA
AGAACATTAGGAACATTTTTAGACTTAAAACTCAAAAAGTTAAGAACATC
CCAAGGCTTCAAAAATTTTGGATGTTCTTATGAAAAACACGTGTAGTAAC
GGGATTTTTACGTCAGAAATTCTGTATTATTCATCTTTCAGTCGAAAATA
CCCAAATGGGTCGATGGTGGATGCAAATCGCCCTGATTTTAAAATGGAAG
GACCTTTTGAAAATAATATGGATCTCAATAATATGAAAGCTTTGCTAAAA
GTTTGGCCAGAAGAAGTCGAAAATGCAGGACAAGTGACAGTTCTATGGGA
GGGAATTCCCAATCCAACCAAAACANCTGTGTGTCTGTGTGTGTGTCTGT
CTCTCTGTCTGTCACAAAAACTTTAGGGCAGCCTGGAGACTTTAAAAATG
CTTGGATTTGGCTGAAATTCGGCACACTTGTTCCTTGGGTGAATATCTGG
GTTTTTTTTTTCATTTTTCAAAAATTTTGTTTTTTGGGGCCTGGGGACGA
GTTTTTCGCCAAAACGAGGCTAAAGCTTTGGGGCAGCCTGGAGACGTTAA
AAAATGTTGGATTTGGCTGAAATTTGGCTCACTTGTTCATTGGGTGAATA
TCTGGGGTAATTTTTTCATTTTTCAAAAATTTAGATTTTTGGGGCCTGGG
GACGAGTTTTTCGCCAAAACGAGGCTAAAACTTTGGGGCAGTCTGGAGAC
GTCAAAAATTGTTGGATTTGGCTGAAATTCGGCACACTTGTTCCTTGGGT
GAATATCTGGGGGTCTACAATTGGGCCTATAATTTGAAGCCACTGAAGTT
GAGCCCAGTGCGTTGCGCACGTTCGACTATTTTAAATTAGAACCAACATG
GAGGTATAAAGAAAAACAGGAGATTTATGTTATTATAACCACCCTCTTCA
TACGATTAAAGTTAAGAGATTTGCATGCTCATTATGGTATATTGTGTATT
TTTAATGAGCTCTTTGTTCATTGGTGAAATCTTATTGGCTCATTTAAGTG
TTAGAAAAAAGATGAGACGAGATCCATTCTTTCTTATATCTGCTTATATC
GGTGTAAGAAAATATTTGAACACCGTTTTTATAAACGATAAAAACGTGTC
AAACTCTTCATTAAAAAAAAAACGTCTGTAGATTAATCAAATTCAATTGT
TTCATTTATCAGTCGCTGAAGGCATCCAAGTGCGTTATGGTAAAACAAAA
GACCTTGACAAAACACAAACGAAATATACCGTCAAAACTTACAAAGCTTC
AGACATGTGTGAACCTCCTGCTAACACAACTGGATTTTGGGATGCTGGGT
ATATTTATGATGTTTTGTTGACTGACTTGGAACCCAACACGAAATATTAT
TACTCCTGTGGTAGTAGAGAGGTAAACAATTAAATACAATTTGGCTAAAA
AAACCACACATTTCTGATATCGAAATAGGTTGCACTCTCCACTCTTTTTT
TTATAAGAGAAATCCGTTTAGAAGAGATGGTAAATTTTAGTTCAAATGAA
AAGGAGAGCTGTTTAATGCAGGCTTTACACTGGACGAAACCCATATCACT
TCATATGTATCATTTTTCTGAATCTTCTATAATATTCTCTTTCAGATTAT
GTCATCTGTTTACAACTTCACCACCCCTTTGAAAGGAGGAGACAGAACGC
CCTTCAATTTCATTTCTTACGGGGACATGGGGACCAGTTCTTTCGCCGAA
CAAACAGCCAAATTGGTTCACCAAGAGATCAATGAGAATGATATCAAATT
TGTTTACCATGCAGGGGACATCTCTTACGCTCGTGGATATGTAAGAAATC
ATTTTAAATCACATTTGAAAATCTTTGAAAGAAAATCATTAATTTGAGTG
AAAACCTGGCATCGTTTGCAACTACAAAGTTAGTTTTTTTCTCTATGTAC
TATGTACTAAAGAATGTCACTTTTACTCTACAGTGTGTCCCAAAAAAGCG
GACAAATTTTTGATTGAAGTAGAATCCTCAAAACTCATTATCTCAAGTGA
GTTTAGAATAATTGAAGTAAGATTAAAATTCTTTGTTCAATCGATGGATA
TATAATTCTCAAGATAATTGAGTATGTTTTTGAGATTGAAATATTAAGTA
TATAAGTCACAAAATTTCACATGGATACGAGGATTTTACTTTATATGAAA
TTTTGTCTGTTTTTTTTGGAACATTGTATTTTAACATTCTTAAAATTGTC
TTGATTATTCAGGCGTATATTTGGGATCAATGGTTCGATATGATTCAGCC
AATGGCATCAGTTGTTCCTTACATGGTCTCTCTTGGAAATCATGAATATC
AACATCTGATTGGATGGGAGAAAGAACCTTTCCACTTTCCACCCTTCAAA
CCATCATGGTTCAATGCTGGTAGAGGATCTTTTGGTGAATGTGCGAAACC
CACGCTCAATCGTTTTCACATGCCTGAAAATGGACTGAGCTTGTTATGGT
ATGTCTATAAACCCTTCAAACCTGAAAGACGCCTATGCTCTTTTTTTTTA
AGAGTATAAAGATAGTTGTAAAAGTTGGAAATTTTCATAATCTTCAAACA
GCAGCAAATTTTCATTTTTATATTCTGAGGCCAAATGTCTGACTCTTTAC
TTCTGAAGTAGTAATTGACTTATGAACTGGTATGACTTAAACATAATTTT
CCATAAGCTTCCGTATTTAAACCTACGTCTCAATGGGAAATCAACCAAAT
TAATTATTTTTGCAGGTACAGTTACGATTATGGCATGGTTCACATGGTGG
TGTTTAGTACAGAACACGATTACCGCCCAGGATCACAACAATATAAATGG
TTGGAGAATGATTTGAAGAATGTTGATCGCAAGAAAACTCCTTTTGTGAT
CGTAAGCGGGCATCGACCAATGTATTGTAGTGAATATGGTCCAGGTATGT
AACTAAGCTGCACTGTTCGCCTACTCGCTGTTTCGGGAATTTCTCAAAAT
GAAGCATTTCCCCAAATAGGTTGTAGATTAGTTGGATTGAAATTTAGATT
GAGTAGGTGCATGATTCTTGGTAAATTAAGTATTATTCCTGTCTCTTTGC
GTTAAAGAAAAACGCTGTCAGCAGTTGCTTTATAATCTAGGATTCCATCT
ACATATTTAAGTATAGTTGAATTGCAACCCTTTCTCAAGGTATTAGCGAG
TTTATGTGTGTGTTTTTGTACGGTGGAGACGGTTAGCTTCCGATTTGACT
AGATCCTGATCAACTGTGGACGACGGTAAGCAAGCACTTATACCGTCCTC
CATTTTGCGGGTTAGAAGTGCGGGTTATTCCGAATTGCTTCAGTCACTCC
GCCGTCCTCTAAAGTGAAAATACTTAAGTCGCTAGTAACCACAATTTTAG
CGGATTCTTTATATCGTAAAGAATTCTGATTACTTTTAAAACTATAATAT
GAACCATTCCGTTCTAGTTGATTACAAAACTACTATCCACATGCAACAGT
ATGTAGAAGATCTCTTATACGAACACAAAGTAGATTTAGGTCTGTGGGCG
CACTACCATTCATACGAGAGAACATGCAAAGTCTACCGCAATGAATGCCG
GGAAGATGGTATCTTACATTTGATGATTGGATCTGCAGGAAAACAATTGG
ACAGTGAGAAATGGTATAAGAAAGAATGGTCTGCATACCATGATCGTAAC
TATGGTTACGGAAGATTCTCTGTCAAAAATTCAACTCATATTTTTTTCGA
GTTTGTTCAAGATAGTATCGATAAAGTCGTCGATTCTGTGTGGATCACCA
AATGAATTAATCGAATATCGTCTTAGGTGATAAATCGCGATTTTCCTGAC
TGATTACTATTTGCCAAGCCACATTCATGAGATAAAAGTTCGGATATTTT
GATGAATAGTACCAACATCTTGGAGTGGCCAAGCCATGAAATTTACTTAA
AATGTTAAATTTTTCTCAAGATGGACGTTATTTTTTCACCATCAAAGCCT
TTTCACCATTTTTTTACTTATACTTTTTTTAATTTTGTACATTTTATGCA
TCATATTTTCGAAGTAAATATTTAAAACTCTTTTGCCACTGTCCTCGATT
TCTTCAGCTTCTGTAAGAGGATTGGCTAAATCATGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_008471XLOC_008471Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015123-exon-sc0000204-1575043694:37166..37273TCONS_00015123-exon-sc0000204-1575043694:37166..37273Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015123-exon-sc0000204-1575043694:36387..36862TCONS_00015123-exon-sc0000204-1575043694:36387..36862Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00015123-exon-sc0000204-1575043694:36011..36219TCONS_00015123-exon-sc0000204-1575043694:36011..36219Clytia hemisphaericaexon
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000204supercontigsc0000204:23388..37273 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	5.67811	7.80659	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.110355	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.469958	0	0.406536	0	0	0.158486
Blast
[Close]
BLAST of TCONS_00015123 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: ACP7 (Acid phosphatase type 7 OS=Homo sapiens GN=ACP7 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 156.377 bits (394), Expect = 3.804e-41
Identity = 120/372 (32.26%), Postives = 177/372 (47.58%), Query Frame = 2 
Query:  722 YIYDVLLTDLEPNTRYYYSCGTEEFMSPVANFTTPMAAGDKTPFNYIVYGDMGLEPFPEGIETAKLVRQEIDDNDVRFVYHHGDISYA--RGYAYIWDQWFDLIQPYASLIPYMVGVGNHEQDHMNGHEHDPSNQPNFHPTWFNGYTDSGGECGVPTVHRFHMPDNGLKLYWYSYDYGMVHMVVFSTE------HDYRPGSQQYKWLENDLK--NVDRKKTPFVIVSGHRPMYCSEYGPVD-------YKTTIHMQQY-VEDLLYEHKVDLGLWAHYHSYERTCKVYR----NECRE------DGILHLMIGSAG--KQLDSEKWYKKEWSAYHDRNYGYGRFSVKNSTHIFFEFVQDSID-KVVDSVWITK 1744
            YI+ V L  L P  +Y Y CG+ +  S    F         +P    V+GD+G +  P+ +     +R++        V H GD +Y   +  A + D++  LI+P A+ +PYM   GNHE+ +                  F+ Y             RF MP +   L WYS+D G  H++ FSTE      +      +Q++WLE+DL+  N +R   P++I  GHRPMYCS     D        +  +  + Y +EDL Y++ VDL LWAH HSYER   +Y     N  RE       G +H++ GSAG  ++L     + + WSA   + YGY R  + N THI  + V D  D K+VD VW+ +
Sbjct:   92 YIHRVTLRKLLPGVQYVYRCGSAQGWSRRFRFRALKNGAHWSP-RLAVFGDLGADN-PKAVPR---LRRDTQQGMYDAVLHVGDFAYNLDQDNARVGDRFMRLIEPVAASLPYMTCPGNHEERYN-----------------FSNYKA-----------RFSMPGDNEGL-WYSWDLGPAHIISFSTEVYFFLHYGRHLVQRQFRWLESDLQKANKNRAARPWIITMGHRPMYCSNADLDDCTRHESKVRKGLQGKLYGLEDLFYKYGVDLQLWAHEHSYERLWPIYNYQVFNGSREMPYTNPRGPVHIITGSAGCEERLTPFAVFPRPWSAVRVKEYGYTRLHILNGTHIHIQQVSDDQDGKIVDDVWVVR 429
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00015123 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
ACP73.804e-4132.26Acid phosphatase type 7 OS=Homo sapiens GN=ACP7 PE... [more]
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