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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00015219 ID=TCONS_00015219|Name=TCONS_00015219|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3326bp ttttcttcgaTTTTATTTCCTGGTTTGCTTAGTTTTTATCAGTCTGATTG GGAAGTGATGAAAAAAAGACACGAGCCACGAAGTCTTGTTGTAAGTCTAA ACAATATTAACAAATACAAAACCACTGAACAACCTTAcaacaacaagaag aagaaTTCAGAGAAGATTTACAACAACCAAACTCCATCACGGCTACTCCA AGGAAAATCAATTGGATCCAACCATATATCATTATTGAATGGCTGCTGTT CCCTTAGCATTAAAGatacCAGAATCAATTTCTACAAACTCAACAAACGG CTCAATAAATAAAGACCGAGCTCCTAAGCTACATCGTCCCTACAGTCTCT CTGACAGTGAGGACGAAAAAGCTGAGAAGAAAAGTGAAGTTCCGCCTACT AGTCTATTAAGTGTAGTTTCTACGCTATCCACAAAAGACGCAATGAATCT CATATATACGAACACATTTCAAAAATCACCGCTCGCCGCATTCCCGTACG AGAGCAGCTACAATGGCGCACCAGACACGCTTTTCCGTGGAATGCCTTCA TTATCCAATGGTATCGGGCGTTCACCGCCTCCATTAGAAAAAATGCGACG CGAAAAGGCCGCAGGGGAAGACTCCGTTTTCGCCAATTCTCCAGACCCTC GTTCGCCTTTCGCAAGAGTATTTGATTATAATTGGAGTAATTCGGTCACC GATCGTAAACCGTTGTATGAAAACGGAAGTTTACCAACGTCAACTTCTTA CGATGCTCTTCTTAAAGCGAACTATGAGAAAATGAGATTTTCTGTTCCCT TCAGAGACTCACCACCTATATCCTCCGCCGTGGGTGAAATCAATCCTCCG TCACGCTCACCAACTAAAGCACGCATGAAATACACACCCATGAGGGAGAA CATTTTCAGCGATTCCCTTGCAACGACTAGCGGAGGAGTGGCAAAATCAC CCACCATGTTCTTTTCACGTGGCTCAACAGAGGATCGCAAACCGTACCGC CGAGAAACAGACTTAGTTCGGAGCATGAATCTACACAGCGCTGCGGCTAG TCAATACGATTTGGACCACAACCCATTGAAGATTATCCAGAGCCCAAGCT ACCAGGTTAAGCAACGACATCTTAGTGAATCGCTCCCTGATAAACGATCA AGTGTAAGTAGTGCCTTCTCTGTCATAAGGCCCCATTTCCAGCGCATGTA TGAGAGGGAGAGCGGTTATAACAGTGACCCTTCTGAGAAAGGGAAAAAAC TCTTCAAACCTTACGAAACATTTGAGAAAAGTAAAATCTACGCACGACGA CATTCGGAAAATTACAGACCAGCTTTAAACGGGAACAATGGTGCAGATAT TGACAAAGAAATTGGGGTCAGTAGATTACACGTTTCAGATGAAGCAAGCA AAGAAGCTTTACAAGCTTTCGACGCGCATGTGCAGAAAATGATGGCTGAG AAATCAAGATTACAAGGACCGGCACCCATCGGGTCACCAAAACTGGCCTC AATGAGCCGGCCTAAAGAACCGATGGCGATTCAATGTTCAACTATTGATA GCAGTATGCCGCAAACGTCGACGACATTAACGAATGTCGCCGATTTGTCA CACGGCGTCGGTGGTTTGCTGGGATTGACGCGAATCGCGAATGAACATTT GGGACAAGCCATTGCGAAGGAAAAGAAACGCTCAAAAAaCAACAACTGTT TACATTTATGGCAATTCTTACGCACTGTACTCgaagaagaaaaagacaaa ccGAATCGGTGTATCGAATGGACAAATCGGGAAAGAGGCGAATTCCGATT AATCAAAACAGCCGTTATTGCGGACCTTTGGGGACAATCTAAAAATCGAA AATGTATGACGTATGAGAAGATGGCGCGTGCTATGCGTTATTactataaa atgaaaatcttggaGAAAGTACCTCACAAGAGACTACATTTCCGGTTCGG TGAAAAAATGTTGGCCCGCGTACTGGACCCTAATACAATTAAGCCGTTTC GGCGTATGAGCACCGGGGACCAACATATGCGACCGGCAAATGGAACTAAT GGCTATTATTCAGGACCACCGCCTCCGCTGCAAATGTTACGTCGTGGTTC GATTGATGGATTGAATTCGCCTGGAGTTATCTCCTCTTATCAGGGTGGCC GCCTTGGAAGTCAAAGTGATTGTCCACCCACGCCCATGACTCCATTATCG CCTTGCACACCAATGACACCTTTAACGCCCTGCACACCGGGCGTAAACCG AACACCCGTTATTATGTCTCGTTCAACCAATGTTTTCTTCCCGCCAGATT CTCCATTACCCAAACTCGAAAACTACGAATCAAAATCACCGCCAAGAAAC GGGCGTCAAAATTCACCACCCACCACCTATCTTCAGCAGCAACGATTACC CCAACAAAGTCAGCCAATCAAAGACGAATTTAACAGAAATTTACCAATAA AAGAGGAGTATAACAGAAATCAGCCAATCACTGAGGAGTATAACAGAAAT CAGCCAATCAAAGAGGAGTTTAATAAAAATCACCCAATCAAGGAAGAGGA TGATAGACTGTCAGAATCAACGGCAACGACCACTTCTAAAGATGGCGTCG CTTCGGACAATTCTATTAATGCAGACGAAGAGTCGGATAGTGAACTTATC GTTGATATGGACTAATTTGTATAGAAATTGTGCTAACATTGTAGATAATG AAAAGGCCTAATTAAGCGTAAATCTATAACTTTGGGACAAGTTCgtgttt ttacaagctctttttgATTTGGTTAAGTGGTTAACCTCTAATAAATCAAT tctattactttttctaaagaacgcgggCGGCAGCTCTAtaacttcaaatg accaatgagtgaagtatcttgtaataAATTCAACTCTTTCCATAACTCTT AGGTGGCGAGATGTTAAGgacaaaatttcttttaagaGTTTAAGGTTGCC ATAAAATTCGAAATAGCAAGAATCGTAAAAGTAAAGTAACAATTTTTTGA ATCCGCTAAAGTGGATAGTGGTAGCAAAGGAGTGTAAAGTATTTAGAAAT ATTGGATTTTTTAGTGTGGGCgcaatttatttttttaccgGCGTTGTATA TAGTATATGTNGATAGTGGTAGCAAAGGAGTATAAAGTATTTAGAAATAT TGGATTTTTTAGTGTGGGCgcaatttatttttttaccgGCGTTGTATATA GTATATGTTATATAATGTTATATCAGTTGAAGGTTTtaatgtgaattatt ttttatccCCAATTTATTATTTCAGTTAAAGAAAgttctttttaaagaat tcaACTTGCACATTACATAGTTAAGA Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00015219-protein >TCONS_00015219-protein ID=TCONS_00015219-protein|Name=TCONS_00015219-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=808bp
MAAVPLALKIPESISTNSTNGSINKDRAPKLHRPYSLSDSEDEKAEKKSE VPPTSLLSVVSTLSTKDAMNLIYTNTFQKSPLAAFPYESSYNGAPDTLFR GMPSLSNGIGRSPPPLEKMRREKAAGEDSVFANSPDPRSPFARVFDYNWS NSVTDRKPLYENGSLPTSTSYDALLKANYEKMRFSVPFRDSPPISSAVGE INPPSRSPTKARMKYTPMRENIFSDSLATTSGGVAKSPTMFFSRGSTEDR KPYRRETDLVRSMNLHSAAASQYDLDHNPLKIIQSPSYQVKQRHLSESLP DKRSSVSSAFSVIRPHFQRMYERESGYNSDPSEKGKKLFKPYETFEKSKI YARRHSENYRPALNGNNGADIDKEIGVSRLHVSDEASKEALQAFDAHVQK MMAEKSRLQGPAPIGSPKLASMSRPKEPMAIQCSTIDSSMPQTSTTLTNV ADLSHGVGGLLGLTRIANEHLGQAIAKEKKRSKNNNCLHLWQFLRTVLEE EKDKPNRCIEWTNRERGEFRLIKTAVIADLWGQSKNRKCMTYEKMARAMR YYYKMKILEKVPHKRLHFRFGEKMLARVLDPNTIKPFRRMSTGDQHMRPA NGTNGYYSGPPPPLQMLRRGSIDGLNSPGVISSYQGGRLGSQSDCPPTPM TPLSPCTPMTPLTPCTPGVNRTPVIMSRSTNVFFPPDSPLPKLENYESKS PPRNGRQNSPPTTYLQQQRLPQQSQPIKDEFNRNLPIKEEYNRNQPITEE YNRNQPIKEEFNKNHPIKEEDDRLSESTATTTSKDGVASDNSINADEESD SELIVDMD Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000205:139400..185078- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00015219 ID=TCONS_00015219|Name=TCONS_00015219|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=45679bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000205:139400..185078- (Clytia hemisphaerica) TTTTCTTCGATTTTATTTCCTGGTTTGCTTAGTTTTTATCAGTCTGATTG
GGAAGTGATGAAAAAAAGACACGAGCCACGAAGTCTTGTTGTAAGTCTGT
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GTTGTGGGTTCCAACCCCCCGGGTCATACCAAAGATTTCCAAAATCGTAC
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TCAGAATTATATCCTTGTCTCAACTGTATAAATAACGAAACAAAGTTTAC
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AAGAAGTCCTTATTTTTTAAAATTCAAAGCAATTTCCTTGTCTTTATTGT
CTTGACCAAGTAAACTTATCAATATTTGTCGATAATCATCTTCAGATTCG
GTATTTTTGATTCGATTTTAAAGCTTTGTGAAATTTTCAGTCTTTGTTTA
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CTGCAGTTTCCAGTTTTATGATGATAGAGATTTTTCATATATGCTTAAGT
TGCGTAAACGTACGTCATTACGGAAGCAAACGTTTGATTCGGGTTACTTA
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ACACCCTTGTCTTACAGCTTTCTCAATTGGGATAGAAATTCTATTGTTCC
TATATCGAGTAGGGATGGCTTTAGACCAGCGTCCGAGATTCAGGAAAGGC
CTTAAAACAGGTTTTCGTAGGGCACCCCTTACAAATTTTTTATATTATGC
TCCTAATAGGGTGTAGAATGGACAAAAAAAATTTGTCCTTCGAATCTCCT
GCAGTTTTCGAGTGAATCGATATTTAGTTAATCGATAGAACTTACTAACG
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CGTGAAAAGTAGTTAAAGAAAATGGGGTTATTTGTTTCGACCATCTGGTG
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CTTTCCGATTCTTATGGCTCGAAAAAGTGCGATCAAAGCGCGCGCAAGTG
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TTTTCAATTGTATTTCTCTACAAAGGAGTCGGTGTTTTTATGCAGAACAA
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ATAGTATATGTTATATAATGTTATATCAGTTGAAGGTTTTAATGTGAATT
ATTTTTTATCCCCAATTTATTATTTCAGTTAAAGAAAGTTCTTTTTAAAG
AATTCAACTTGCACATTACATAGTTAAGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000205:139400..185078- >TCONS_00015219 ID=TCONS_00015219|Name=TCONS_00015219|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=7281bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000205:139400..185078- (Clytia hemisphaerica) ACAACAACTGTTTACATTTATGGCAATTCTTACGCACTGTACTCGAAGAA GAAAAAGACAAACCGAATCGGTGTATCGAATGGACAAATCGGGAAAGAGG CGAATTCCGATTAATCAAAACAGCCGTTATTGCGGACCTTTGGGGACAAT CTAAAAATCGAAAATGTATGACGTATGAGAAGATGGCGCGTGCTATGCGT TATTACTATAAAATGAAAATCTTGGAGAAAGTACCTCACAAGAGACTACA TTTCCGGTTCGGTGAAAAAATGTTGGCCCGCGTACTGGACCCTAATACAA TTAAGCCGTTTCGGCGTATGAGCACCGGGGACCAACATATGCGACCGGCA AATGGAACTAATGGCTATTATTCAGGACCACCGCCTCCGCTGCAAATGTT ACGTCGTGGTTCGATTGATGGATTGAATTCGCCTGGAGTTATCTCCTCTT ATCAGGGTGGCCGCCTTGGAAGTCAAAGTGATTGTCCACCCACGCCCATG ACTCCATTATCGCCTTGCACACCAATGACACCTTTAACGCCCTGCACACC GGGCGTAAACCGAACACCCGTTATTATGTCTCGTTCAACCAATGTTTTCT TCCCGCCAGATTCTCCATTACCCAAACTCGAAAACTACGAATCAAAATCA 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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: Biological Process
Term | Definition |
GO:0006355 | regulation of transcription, DNA-templated |
Vocabulary: Molecular Function
Term | Definition |
GO:0003700 | transcription factor activity, sequence-specific DNA binding |
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GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category |
Term Accession |
Term Name |
biological_process |
GO:0006355 |
regulation of transcription, DNA-templated |
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sequence-specific DNA binding |
molecular_function |
GO:0003700 |
transcription factor activity, sequence-specific DNA binding |
Blast
BLAST of TCONS_00015219 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: EHF (ETS homologous factor OS=Homo sapiens GN=EHF PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 92.8189 bits (229), Expect = 4.390e-20 Identity = 44/97 (45.36%), Postives = 62/97 (63.92%), Query Frame = 2
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The following BLAST results are available for this feature:
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