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transcript sequence >TCONS_00015837 ID=TCONS_00015837|Name=TCONS_00015837|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3522bp tttttttaccaaaCCCCTCATGTCTATTAATCACATTTTTTATTTGCTAC TTTCTTTTTGTCACACAAGTCATTTTGTATACATGTTTCATGTCAATTTG gtatataaaaatcaaaaataaatctaatacAAGAGTTCGAATATTTTGAA GTAAAGAAGTTAAATGTGAAGACAATCAAAGCCATCATCATACAAAACCG GCGAAAGAATCTTtcaAAAACGAACTACTAAAGATCAATGGAAGTACACA ATCCTGTTGAATACCATCATGGACCAACCATGGAGAGACCATATTCAACA CGTCACGAATCTTACTACTCAAGTCGACTCACAATGGATGATTCCGAAAT TATCACACTTCATCCTCTAATCATTGGAAAAGACATTGTTGTCTGTATGC CAGAAGTTAATAAAGTGTTACGTAATGTATACCAAGTCTTATCACAAGCC AATTACTATTTATCTAAGCATGGGATTACATCTCGACGATATACAGGCGC CCAGTTGATCCGGATCAAAATGTTGGGCATTTTAGGACATGAAGccaaag tttgttcttatattttgcAAAGAGATGCTGAGAGGATTTTCGATAGTTTT GACGTCAGTGGAGACAGCCGTAAATCCACCCGTATCCAGTGGATGGAGCC CGTATTATTAGATGAAAAACCGATGCCTCAATCTACGACCCGTAGCAATT CATCCACGAATAGCAAGAACGATCAGCAGCAGGACGGCCCGGTCAAAGTT CATCTTTTTAAACTGAATGACGATATTATAGTCTGTGCACCTGAAGTTCA AAAAGTAGTCCAGTCTAATTTCCACCAAGGTGCAACAGTCGGTTATTATT TCACCAAACTTGGTATTGTGCCTTACAAGTTTATCCATACATCACATCTA GATAAGATAAAGGAACTAGGAATTGTGAAGAAATGCGCAGTCCATTGTAC TTATATTTTGAAAGATGACGCATTAAGAGTCTTTGAAGCATACGGTATGA CACAAGATCAAATTGAAAATCATGTTGAATTCCTTGATGTGATGGTGTTA GCTGAAGGAACCTCCAGATCGtggaaaaataagaaagaacGTTCATCACC GTCAACAAGTAGCCTAGAATCACCGCGCGGTGGAAACTGCTTATCACCAG CCAGCAACGTGTCTGACTACTCTGGCAAACATGATCTAGAGACCGAGGAT TATGCTCAAGCCTCTGATAAAGATATGACtgttcatattttcattgtCGA AGGAAATGAAGTTGTCTGCATGCCTGATATccataaaattgttcaaaata tcCACGGCAATTCCATCCAAGTCAATTACTACTTTAATAAACTCAAAGTT CAAAAACGCCGTTTTTGTTTTGCTCATTTACGTGAACTAAAGAGTCGTAA TATTTTACAGAACAATGCAACGTATTGTACTTACGTGCCAAAATCAGATG CTGAGAAACTATTCCAGATTTACTGTTTGGTGGATGATCCAAAGTTGAAA GGAGTCCAATGGTCAGAACCAGTGAACTTGGATAACAAAATCTCCAATTT AGCGTCACCGACACTATCAGAACCAGATACCAACGTTTTTGATGACAACG AAAAAGAATTAGTGGTACATACGTTTACAATGGAAAATAGTACCGTGGTA ATTACAGTTCCGGATGTTCACCGGGTTGTAGATTTCCTTGATGAACAGAG CGCATCTCTTGATTACCATTTCCGGAAACTCGGTATCGCGAAATGTCGCT TTACATACGCTCAACTCCATCAATTACGCCGCCTCAACGTCATTAAACGT CCAACCGTATGTACGTACATTGCCAAACATGATGTTAATCGCTTGTTGAA AATGTATGAGACCGAACGTAACAGACACCGGATGAATAAAGTCAAATTTT TACCACCGGTACAGCTAGTACGCGGAACTCCCCCTCAACAACAAACCGGA AACCCGAAATACATCAAACGTGAAAAATCACCTCCTAAAATCAAAACTAA CGGTCGACAGTCGCCATCGCCCACCAAGGTGATGTCCCCCTACCACCAGC CCGCGTCTCCTACCACTGAACGAGCACCTACCAGTTTCACCAAGCCACCT ACCTCCTCCCCACCCAACCCACACCAAGAAGAAGACATGCCATCCTCACA CTCAGTCGCTATCACGCACATTCAAAGCATCCATCCAACCATTGATTGCC CGATTGTTATCCCGAACGGAGATTATGACCCGATGAAAGCTGGTCGGGAT AACGGTGAAAGCGATCGCAAAAGATCACATGAGAACCCGGATTCACCTTC taacaataaaaaattcaaatttGGAGATGCAACTTATGAAAGTTTGGTCC GAGAAAACTCACGCAAAGAAGATGAACTCAGAATTTTGCATGACGGTTAT CAACGTGAAATCAAGGATGAACGAAGTAAACGACAAACGGCCGAGCGAGT TTTAAACGAGTTGAAAGACCAACACAAACGAGAGATGACAGAACTACGAG AAGAATTACGAAAATTGAAAGAGGAGAAGTTAGACAGCAAATTGAAAATC TTCCATCGAGGAAATGTGGATGATCACGATTCGCCTTTAAGTAATGGCTT CCATGAAGATTGATCTGGATACCACTCTATGGTCCTTATGTTGGTCATGT ACTTTCGTTCGGCTAAGGAAAGATTTCATGCATAGAATCACGGATTTAAT AAAGGCCCTCTAAAAATTAAATCTATGACAGAATCAACCAGAAGTTCTAG CCATTCCTACAGTATGTCCAATTGATTTACAATCATTGATAATGAAGGTA CTGGCAGCACTATCGTTCATTACAATGGATTACATAGtcaataaaaacat tgaaatatgaGCGATGGGACATTTGTATCCTCGACAATGCCAAGGTAATC GATGGGGATTGTTTTGACAGAATTCAACTACATGCACAACAGTAGCGTGG TGGATCGACCAAAATTcgggcaaactggggaggcaatttcagaaaatttt gattttggcgctctctatcaaatgaaaattattaTCTTTTTGATCGAAAA CTGCCAGGTGTAAAGGTGTTTAAAagcaaaggggcgccgaaattagtaat AAGAGGCGTCgccctgcccccccccccatgccaccacgctactgacaCAA TATTTTTACCCATAAAAACGAAAACGTGGATTTTCTTTGAAGATTACGAA GAAAACCCAATTTCCAGGTCACCACTAGAATTAACTGCAATGTTAGAACT TTCACATACCCATATATTTCTATAGTTTATAATATCGTAgttaaagtaat gaaaattattttttcaatactggcagtttcatgtttttacaaacAATCCT CAGTTGAAAATAATTTTTTTCAAAAAATTATTTTCAACTGAGGATTGTTT GTAAAAACATGAAACTGccagtattgaaaaaataattttcattactttaa cTACGATATAACGCTTCTAACTTCGGTTGGTTAAGCACTCTTTTGATGGA TGAAAGCATTGCTTCAACAAAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000217:97476..118961- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00015837 ID=TCONS_00015837|Name=TCONS_00015837|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=21486bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000217:97476..118961- (Clytia hemisphaerica) TTTTTTTACCAAACCCCTCATGTCTATTAATCACATTTTTTATTTGCTAC
TTTCTTTTTGTCACACAAGTCATTTTGTATACATGTTTCATGTCAATTTG
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GGTACATTCTATAGTCTCAATTGTTAAAGCAAAGATTTATTATACACTGG
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CAGAAAACAATTGATGTTCTAGCTTTGTCCGCAAAGGACAACTGTCATGG
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ATTTTCAATTGGAAATATCTTTCCAAGACTGTCCCCGGAAGAGCTGAAAT
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TGATTGAATTAGCCTTTACTTTTAGATAGGTCACCACTGGAGGTCTCCAG
AAATCAGCAAAATGGCTTGCTTCCCTTGAGTTTCCTTTCATTTTATCTCA
TCCCGCTCTATTCATTTTTTTGACGACAATTCTTCTTCCGAAATACAATT
TTAAGTACTGGATGGATTAAGCCTATTTTTTTGTTTTTCAGCTTTTTCCT
GTTTTCTGAGTTTTTGTAAGTCATTTTGAAAATCAAAATTTCAATTTTTG
CCTTATTTGCCTTATTTATTTCCATCCCCAGTTCAAAGTTTGGAAGTTTC
ATATTAGTTGAAACTATGCTCCTGAAAACTGATTAGGATTTTACAAGACC
CCCCCCCTCCCGTTATCAATTCTTGAAAAAAATTTAGGTAGAACATATAC
ACTCATTTTGCTTGATAAAGGGGGCTTATAAGCATACGAGAAATTACTCC
TTGTCTCATTAGTTCAATTTTCAAAACAAAATGTGAATTCTGAATTTTCC
AAGCTTCCAGCTATACTTAGCATTATGTTTTTCAAAGTTGAGCCTCAGTT
TGCTTATAAACGTTATGCTTGTAGAAAAAAGATAATAGTCGGTTTAATTT
CTTTTCTATACACCTTTCCCGAATTGTTATTTAGGCTTTTTTACTTTTTT
GTTTTAATGTTTGAATGTTTCTATTATTTAGTTTCATAAAATTGTATGTC
GCAAAACTAAACAAATAAAAAAAAAATTATGAAAAAAGCACTTCCGGTTC
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AACGAGGCCGGGCTGTATGTTTTAGTTTTTACAAGGGATTTCACCGTGAA
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CAGCATGCACTTGTCTTTATAGGAGGAATACAAATATATAGTTTTCAATA
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GTTTGATTTTTCCGTAACTAACACACCCACCCCCTTCTCACAGACCACAG
GGATTTAAATTATTTTGTTTTCAAATCAGAAAATTTAGTGTGTATGGGCA
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TTTTCTTTAGAATATTTTCGCCATTTTCAAATTTTGAGGTGTACGCGTAT
TTTTCATAAGAATGTACTCTAATAAGAATATTTATGGTAAAATTGGCCGA
AAAATAAGAATATACTAAGAATGTCTAATCATAAAATTTAATCTTTGATC
TTGTGCGTCTTCTAAAAACTGCTTTTAGCACCCTTGGTTTCTCGACGCCC
CTCTAGAGAAACTGCTCTGGGGCATGGGCATTTCACGCCTTCGCCCTGAT
TCGAATATTACTAACTACTGCGTCTAGTACTTGAAATCTATATTCAATTT
CTTTAAAATATGTGCATAATTTATACAAATCGAAATCTTCGGTTATACAC
GCTTTTTTTTTTATAAGAATGGTGTTTTTTCATTTCATCATGGATATTCT
TAACTTTTTGGCGAAAATCATCCAAAAATATTCTTACGGAATTNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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CCATGATGGGAATATTCTTACCATATTCTTAATTTTTTGGCCATTTTCAT
CATGGACATTCTTATAAAGTGTATTCTTATAAAAAAAGGGTGTATTCACC
GCACTCTAAAATAAATGACTGGAATGGTCGTCTCCATTTTAATTTCTGTT
GTAAATTTGATCTATAAATTAGTTATGAATTTCATGTTACAAATTACACT
GTCTCAAAATGTTACACGCTTTTTTTATAAGAATATTCGTATCATGATGA
AATTGGCCACAAATTGAGCATATGCTAATAATGCCATCATGGGGTATGGC
AACTGAACCTAAGAATGCCATTTTTAGAGTATTTTACCTGTAAATTACCA
ATTATTCCCCATCAACGCTAAAAAGTTTCACAAACTGAATTCCAAGTCTT
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AATATTCACGATGAATTGAAAAACACCATTCTTATAAAATAAGTGTATGT
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TAGTTTCGATTTCACGGTTGAGTAGTTTAAAGTTTAACAAATGTTTATAA
TTTCATTTTATTTCTTTGTTTATGTGATTTCTAATTTCTAAAAATTTGAT
TATGTTATTAAATATTTTGAATAAACTTTTAGAAAGTTTGAAAATTCAAT
TTTTTTTGGTATTTGAATTTTCTGAAAAATTTCGAAAAAATTGTTGAAAT
ATTATGGAAATGTTCTTGAGATTAGCTTGATATTCTGTACGTATTTCTCG
GATTTTAATACAAATTTTATCATTATAAAATTATTATATTCGTAATATAT
GACAAACAATGTCACATATAAGTTTTTACACAATGGTTGTGAGAAATTAA
ATATTGATCAAAAAATTATTTTCATCATAAAAAAGGATATTTATTTATAT
ACAAAATGTCAATAAAGTTATGTTGAAGTGTCAAAGAGCTTTAATAAAAA
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GAGAGGTATTATTCTTTTGTTTATTAGCTCAAATCTCCTTCAAAACTGTT
ATTTTTTTCAATGTTTATTTTTCTATATATCTTGACTGTGTTTTCTTAAA
CAAATAACTAAAAAAATTGACTTTAGCATCATTCACTACCAAACTCCATT
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GTAATACATTACATACACAATATAATACAATGCATAGTACATAGTACAAT
ACATAGGAGGTATTTGGTTAAATAAGGTATTAGGTTATGGTATTGATTTA
TGCTATGAGTTTCAAAATTTTCTGATCCCTTGTGATTGTGAGTTTTTGTT
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TTGGGAAAATACTAAGTACTGATGCCATTGACTTGTTTTGCCTTAGGTTG
ATTTGTTTATCTGATGGTTGACAACTCGGGGTTATGATTTATATACAGAA
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AAACTGCGAAATTTCCTCTCTAAGGTTCAATTTTCAATCATTTGCTCAGA
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AATGTATACCAAGTCTTATCACAAGCCAATTACTATTTATCTAAGCATGG
GATTACATCTCGACGATATACAGGCGCCCAGTTGATCCGGATCAAAATGT
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CAGATACCAACGTTTTTGATGACAACGAAAAAGAATTAGTGGTACATACG
TTTACAATGGAAAATAGTACCGTGGTAATTACAGTTCCGGATGTTCACCG
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GCCAACTTACTTATGTACCATTTAAAGTGCTTTCGCCGTCGTATTGGGTC
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GTCCTTATTACCCATGATTCATTTAAACCGTGAAATGGTCTGGTGTTGCA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000217 | supercontig | sc0000217:97476..118961 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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