TCONS_00016213 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00016213
Unique NameTCONS_00016213
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2249

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00016213 ID=TCONS_00016213|Name=TCONS_00016213|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2249bp
TTCGTAACTTGAGCTTTCAGATTTAACCTATAGAAATTTACACCTTCGGT
CGTTTTGAAGTATAACCCGGGATATAAACAACTTTTTATTTATGCAAGTC
ATATCATAACAAATCATCGTTCGATGCAAAACGCTTTAAAGCAAAACTCG
TGTCAACAAAAATTggtttttataatttatttgaaaaatagaCGTTTGCT
TTGTGTGTCGATGGTAACGCTTTGAAGCAAAACTCATGTCAACAAAAATT
GGTTTTTATAATTTACTTAAAAAATAAGCATTCGTTTTGTGTGTCAATGG
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AACTTATATCTTGCAAGTTTCGATTTGCCAATAGCTATGGCTCAAATATG
GTATTGCAAAGAGCACCCTTGAGTGCAAATGTTTGGGGATTTGGCGAGGA
AGGTCAGAAAGTTGAAGTGACTGTCACTAATGCCCAACACGAGGTCCAAC
AAACTAAAGATACAACAGTCAAGAAAGACTGGAACGGGAATGCtgtttgg
tctgtaaaattatCACCTATGAAAGCAGGAGGTCCTTACAATGTCACCGC
AAAGTCCAACAATGTACAAATCGTTCTATCCAATCTATTATTCGGAGATG
TATGGCTGTGTAGTGGACAGAGCAACATGCAATTTACTGTCGGCATGAGC
ACAACAGCAGATGAAGAAATAGCGTCGGCACAAAACCATTCCGATATAAG
ACTTTTCTCTCTCAACCAATTTGCATCTGAGAAACCATTACAAGATTTTG
ACCTCAACAATGTCCTCTTGAAATGGTCTGTAGCTTCAAAAGATACCGTT
GGAGGTCCTGCTTGGAAATATTTCTCAGCATTGTGTTGGATGTATGGTCG
ACGATTATATGATCAATACAAAATCCCTATTGGTTTAGTTGATAGTGATT
GGGGAGGTACCTGTGCTGAGGCTTGGTCATCACCGGAGGCTCTGGCGAAG
TGTGGTTTGAAGAAGAACTCTGTTCAAACTAGAGGGGATAGGGTACGCTT
GAAACGAGACGTACTGGTTGAACGAACAGTTTATGAAGATTCTAATGTTG
ATCCAAACTCATATTCAGTATTATGGAATTCTATGATTCGTCCTTTTTTG
AATATGACAATCAAAGGTGCTATTTGGTACCAAGGTGAACATAATACGAT
TGTGAATAAAGAttattacgcatgcgtattcCCAGAGATGATCAATAATT
GGAGAAAGAAATGGTTTGAGGGAACTGATGGTTCAACGGATCAGATGTTT
CCTTTTGGTTTTGCTCAGCTAGCAACAGTCGGGGctgatttttcatcaaa
aaggcCCGACTTTGCAAAGATCCGATACGAACAGACAGCAAATTACGGTT
ATGTTCCAAACCAGCAACAACAAAACGTCTTTATGGCCGTTGCTATGGAT
CTCCCTGACGACAAATCACCATTCGGCTCTATCCACCCACGTGATAAAGC
AACAGTCGCTGATAGGCTAGTATTGGGAGCACGTGCTTTAGTTTATGGCG
AGTCTAGTATCAATTTTCAAGGACCAATTATGGATACATGTTCTTTGTTT
AATTATGGGGGGAATTTTGGAATCAAAGTTGCGTTTAGGAATGCTGAAAA
AGGAATACAAGTTAAGGGTCCGACTGGTTTTGAGgTCAAGGCATCTGGTT
CAACAGAATGGACACCTGCCGAGATAATTTCACCATCTGATGATCACCAA
AGTATTTTACTATCTCTTCCTTTTGAACCTTCATTAAACGTCACAATGGT
TCGATACGCTTGGTCCCAGACTCCTTGCGAGTACAAGAAATGTGCTGTTT
ACTctattgaaaatgatttaccAAGCCCACCCGGAGTTTGCTTCATTCCT
tgatttctttagaaaaatagtAGTGGTGAAAGATTTCTTTAAACTGATTT
TATAACATTTTCATAAATGTTAGACCTACTAATTTATATTAATCGAGACT
TTAAAACCTCCGgtaaatttgataatttttatgGTAAGATTTAACATATG
AATATTAATTTTTATAGATCTTTCTTTTTTACAATGATCAATTCACgaca
aaaattgtaaatatcatttgatattttgttgtttttagtcACCTTCTTGA
AATCTGTAATCCGAGTGAATTTAAACATCAAACTAAGGTATCTGGCCTCG
ATAAATTTcctgttttttcaaatttactcTAAGCAGCATACAGACGAAG
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00016213-protein

>TCONS_00016213-protein ID=TCONS_00016213-protein|Name=TCONS_00016213-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=531bp
MQLILIITALVLKSQLISCKFRFANSYGSNMVLQRAPLSANVWGFGEEGQ
KVEVTVTNAQHEVQQTKDTTVKKDWNGNAVWSVKLSPMKAGGPYNVTAKS
NNVQIVLSNLLFGDVWLCSGQSNMQFTVGMSTTADEEIASAQNHSDIRLF
SLNQFASEKPLQDFDLNNVLLKWSVASKDTVGGPAWKYFSALCWMYGRRL
YDQYKIPIGLVDSDWGGTCAEAWSSPEALAKCGLKKNSVQTRGDRVRLKR
DVLVERTVYEDSNVDPNSYSVLWNSMIRPFLNMTIKGAIWYQGEHNTIVN
KDYYACVFPEMINNWRKKWFEGTDGSTDQMFPFGFAQLATVGADFSSKRP
DFAKIRYEQTANYGYVPNQQQQNVFMAVAMDLPDDKSPFGSIHPRDKATV
ADRLVLGARALVYGESSINFQGPIMDTCSLFNYGGNFGIKVAFRNAEKGI
QVKGPTGFEVKASGSTEWTPAEIISPSDDHQSILLSLPFEPSLNVTMVRY
AWSQTPCEYKKCAVYSIENDLPSPPGVCFIP
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000231:155051..181096-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00016213 ID=TCONS_00016213|Name=TCONS_00016213|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=26046bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000231:155051..181096- (Clytia hemisphaerica)
TTCGTAACTTGAGCTTTCAGATTTAACCTATAGAAATTTACACCTTCGGT
CGTTTTGAAGTATAACCCGGGATATAAACAACTTTTTATTTATGCAAGTC
ATATCATAACAAATCATCGTTCGATGCAAAACGCTTTAAAGCAAAACTCG
TGTCAACAAAAATTGGTTTTTATAATTTATTTGAAAAATAGACGTTTGCT
TTGTGTGTCGATGGTAACGCTTTGAAGCAAAACTCATGTCAACAAAAATT
GGTTTTTATAATTTACTTAAAAAATAAGCATTCGTTTTGTGTGTCAATGG
TTTTGCGATGCAACTAATACTGATTATAACAGCATTGGTTCTTAAAAGTC
AACTTATATCTTGCAAGTTTCGATTTGCCAATAGCTATGGCTCAAATATG
GTATTGCAAAGAGCACCCTTGAGTGCAAATGTTTGGGGATTTGGCGAGGA
AGGTCAGAAAGTTGAAGTGACTGTCACTAATGCCCAACACGAGGTCCAAC
AAACTAAAGATACAACAGTCAAGAAAGGTAGGGTTTCGGAACTGAACTGT
CATCCTAACCCATTCCCACTTACGAAAAAATATCGTCCCGTAATATCGTG
CATGAATATTACATTGTGATAAACAGGCAGGAGCATACACTTAACAAAAG
CAAAATAGTAATCTGATTGAGAAATGCGACATTAAAATTCTTATAGTCCA
TCTCACAGATTAAATTTCAGATAAAGCTAAAACTATGATTCTAACGGTAA
TCCCAACCAAGAGAATCACGCTGAAATGAGAAACTCATCCTATCAAAATC
AATCCCTTATTGAATTTCACCTCCTTGACTTTAATCTAGTCACTTTTTAG
TCCAGAGTCCTAACCTAAATTTTTGGAAAATAAAGGATAAAGTTTTTAGA
ATTGGTTTGAATAATTTTTTTATCAGTCCTTATTTTAGGATTACCTATCA
CGAAGTCTTATAAAAGTCTCTTAAATGGAATACTCTCAAAGTGTCAAAAA
AATCGTTGATGCAGACCCAGTTGGCACGCTGGCACACAACGTTGTTTCAA
CGTTTATCTAATGCTCACAACGCCTATATAACGTTAGATGAACGTTGAAA
CAACGTTGTGTGCCAGCTGGGGAGACGATTGACTACCGATTTCTGTCTAA
TGCCGTCCCCGGGGGGCACTCATATGGTCAGACCCACGGCATGTGCCGCC
CTTAAGGGTAAGTTTTTTGAGACCCTCCAAATGCACTGTAAGGATGTACT
TTTGATAGAGGTAGTGCACTCTTTTAGCTGAATATACTGTAAGCCATTCG
ATTGTTTTTTATTCCCTCCGCGAATTTTTGTAAAAACTTGTGTGACCTAT
AAATGATCGAATTTTCTCTTCTCACACCACGCATCTTTATACAAGTGATA
AGCTTGTATGGTGTGTTTGTGTTAAAATTAAAATGTCAGACAGTAGTGAA
ACTTCAAGTGATGAGCGAACCACTCTTCGTCAAAATGTTGCTGCCAAAAA
GAATGCAAATAAAAAATTCAAACCGAATAAATCATTTAGAGAAGTTGCTC
TACAGAGGGCTTTGAAAACTTATGTAATTTCAAACATTGTGGATAGTTAT
AATGTTCTTGCGATAAGAGTGCTGTGGAAGGAGGAGAATTATTCGGATAT
GTTTACAAGAAGGCGAGATTTGGAGAATATATTCAAGGATATTGTTCCAG
TTAAAGTGTTGATAAGCTGTGTTACCGCAATGGAAAAGGGTGAAGAGTTA
GATACGGGACTAAGTTTTTGGATGGCATTTGATTGGCCAGATATCACAGC
AAACAAGTTCGAGAACATGCTATGCAAAAAGGTTATGGAGTCTGGTGTTA
AAATCGATTCGTGCAAGGGAGTCAAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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ATTTTGTTACAATTTTTGGTCGATTTGTTACAACTTGATACAGCTTAATA
CGCTTTGTTACTGCTTGTTACATACTTTTTGCACGGAAGGTGGAATTTTG
AGACAGTGGTGACAGCATTTTTTATAAATTTTGAAGATCTAAATTTTGTT
ACAACTTTTGGTCGATTTGTTACAACTTGATACAGCTTAATACGCTTTGT
TACTACTTGTTACATACTTTTTACACGGAAGGTGGAATTTTGAGACAGGG
GTGACAGCATTTTTTATAAATTTTGAAGATCTAAATTTTGTTACAATTTT
TGGTCGATTTGTTACAACTTGATACAGCTTAATACGCTTTGTTACTGCTT
GTTACATACTTTTTACACGGAAGGTGGAATTTTGAGACAGGGGTGACAGC
ATTTTTTACAAATTTTGAACATCTAAATTTTGTTACAACTTTTTGTCGAT
TTGTTACAACTTGTTACATCTTGATACCCTTTGTTACTTCTTGTTACATA
CTTTTTACACGGAAAGTCGAATTTTGAGACAGGGGTTACAGCATTTTTTC
GAATTTTGAACATCTAAATTTTGTTACAATTTTTGGTCGATTTGTTACAA
CTTGATACAGCTTAATACGCTTTGTTACTGCTTGTTACATACTTTTTACA
CGGAAGGTGGAATTTTGAGACAGGGGTGACAGCATTTTTTATAAATTTTG
AAGATCTAAATTTTGTTACAACTTTTGTTCGATTTGTTACAACTTGATAC
AGCTTGATACCCTTTGTTACTTCTTGTTACATACTTTTTACACGGAAAGT
CGAATTTTGAGACAGGGGTTACAGCATTTTTTACAAATTTTGAACATCTA
ATATTTGTTACAATTTTTGGTCGATTTGTTACAACTTGATACAGCTTAAT
ACGCTTTGTTACTGCTTGTTACATACTTTTTACACGGAAGGTGGAATTTT
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TGTAACAAGGCGTATCAAGGTGTAACAAGCTGTAACAACATGTAACAAAT
AGACCAATACTTGTAACAAAACTATTTTCGAACTTTTCCTATGAAAACTT
GGAACAAGGTGTATCAAGGTGTAACAAGCTGTAACAACATGTAACAAATA
GACCAAAACTTGTAACAAGACTTTTTTCGAACTTTTCCTATGAAAACCTG
TAACAAAGTGTATCAAGGTGTAACAAGCTGTAACAACATGTAACAAATAG
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TGCCGTCCAAAAGATTAAGGTACTATATAGTGGTAGTGATAGTTACGCTT
TCAGTTTCTATTGGTTGAGCACTCTACTGATAAATAAAAGCATCCCATTA
TTTTTGTTCAATTATTCTAATAGACTGGAACGGGAATGCTGTTTGGTCTG
TAAAATTATCACCTATGAAAGCAGGAGGTCCTTACAATGTCACCGCAAAG
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GAATCGATTTTTAGTTAATCAAAAATTTGCCCTGATCTAAGGGGTGCCCC
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CCAATTTGCATCTGAGAAACCATTACAAGATTTTGACCTCAACAATGTCC
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TATTTAGTCCTCATATCCCAAATGTCGGGTATTGTTGTACATTTTTCATG
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CGATAAAATCTCCTACCCTTTCTGGAAAAACCGGCAGAAATAGCCCTTTT
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ATTTTGAAACACATTGTAATTGTAAAGTTCAATTTCTCCATTAGTATATA
TTCAGCTGCTCTATTTTTATTCCAACCGGTGAAAACTTTCAAATGCATAC
AAGTAGAAGAAATTTCTCGTATACACTCCTGGAAAATTGAAACGATTTAA
CAGATACTCACGAAATAAACTCCAAAGTTGCCAGAGACAACTACGCTGTT
ACATCCCCTTCTCACAGACCCACTGGAACCCCTTCCCACTGGAGAAATTG
GCCAAAATATCGTCCCCGGTGGAAAATGATTCTCTAGTTTTTTGTCCCCA
CTGAAAAAAATTAACTAGACAAATCCTCACTGCAAAATATTTTGCTATTT
TTGCCATCCCCACTGAATTTTCTGACTATAAAACAAAAGAATTGAAATTC
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TTTTTTATCCTCACTGATTGAATAAATCCGACCGGGTCTGTGAGAAGGGG
GTGTACTGTTGAATTTAAAATAAAATTCACCCGATAAAATAAGATTCCAA
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AAATATTTCTCAGCATTGTGTTGGATGTATGGTCGACGATTATATGATCA
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GTTTTTTGTTTCTTGGGTAAAGTTTATGTCAGTTAGAAACAGGCAGTCTT
TGAGGGTTGCTTGAAGTTAATTTGATTTCGCCGAATCGATTTACAATGAA
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TCTTTAAGAAAAGTTAATCGTTTTTTCGTAGATTGGCTTGGAATTCTGAT
CGTCTTTCAAACACTTCTGATTGGTTGTTTTATATCACAAAGATTTAACT
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TATTCAGCCTCCCCGCTTTCACCGGGCCTGTTTGAGAGCCAAGTGGAATC
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TCTTCAATTTTCAGCTAGCAACAGTCGGGGCTGATTTTTCATCAAAAAGG
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TGGGAATGAGGATTCATGTATTTCCTGTCAGGTGAAATATTAGGACACCC
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TTTTTCTTACCTTGGAACAACAGAATTCCTATCTTCTTTGGAATTTCGAT
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GTCAATTTAATGTTCACAACGTCCATTAAACGTTAGATGAATGTTAAAAC
AACGTTGTGTGTCAGCCAAGAAGTGAACAAAGGGACTGCCACCATTTTTA
TCATTTCACCGCATTTTTATTTTCGTTTTAGGTCAAGGCATCTGGTTCAA
CAGAATGGACACCTGCCGAGATAATTTCACCATCTGATGATCACCAAAGT
ATTTTACTATCTCTTCCTTTTGAACCTTCATTAAACGTCACAATGGTTCG
ATACGCTTGGTCCCAGACTCCTTGCGAGTACAAGAAATGTGCTGTTTACT
CTATTGAAAATGATTTACCAAGCCCACCCGGAGTTTGCTTCATTCCTTGA
TTTCTTTAGAAAAATAGTAGTGGTGAAAGATTTCTTTAAACTGATTTTAT
AACATTTTCATAAATGTTAGACCTACTAATTTATATTAATCGAGACTTTA
AAACCTCCGGTAAATTTGATAATTTTTATGGTAAGATTTAACATATGAAT
ATTAATTTTTATAGATCTTTCTTTTTTACAATGATCAATTCACGACAAAA
ATTGTAAATATCATTTGATATTTTGTTGTTTTTAGTCACCTTCTTGAAAT
CTGTAATCCGAGTGAATTTAAACATCAAACTAAGGTATCTGGCCTCGATA
AATTTCCTGTTTTTTCAAATTTACTCTAAGCAGCATACAGACGAAG

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>TCONS_00016213 ID=TCONS_00016213|Name=TCONS_00016213|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=9576bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000231:155051..181096- (Clytia hemisphaerica)
GTCAAGGCATCTGGTTCAACAGAATGGACACCTGCCGAGATAATTTCACC
ATCTGATGATCACCAAAGTATTTTACTATCTCTTCCTTTTGAACCTTCAT
TAAACGTCACAATGGTTCGATACGCTTGGTCCCAGACTCCTTGCGAGTAC
AAGAAATGTGCTGTTTACTCTATTGAAAATGATTTACCAAGCCCACCCGG
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TATGTTCCAAACCAGCAACAACAAAACGTCTTTATGGCCGTTGCTATGGA
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TACCTGTGCTGAGGCTTGGTCATCACCGGAGGCTCTGGCGAAGTGTGGTT
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GACGTACTGGTTGAACGAACAGTTTATGAAGATTCTAATGTTGATCCAAA
CTCATATTCAGTATTATGGAATTCTATGATTCGTCCTTTTTTGAATATGA
CAATCAAAGGTGCTATTTGGTACCAAGGTGAACATAATACGATTGTGAAT
AAAGATTATTACGCATGCGTATTCCCAGAGATGATCAATAATTGGAGAAA
GAAATGGTTTGAGGGAACTGATGGTTCAACGGATCAGATGTTTCCTTTTG
GTTTTGCTCAGAGCACAACAGCAGATGAAGAAATAGCGTCGGCACAAAAC
CATTCCGATATAAGACTTTTCTCTCTCAACCAATTTGCATCTGAGAAACC
ATTACAAGATTTTGACCTCAACAATGTCCTCTTGAAATGGTCTGTAGCTT
CAAAAGACTGGAACGGGAATGCTGTTTGGTCTGTAAAATTATCACCTATG
AAAGCAGGAGGTCCTTACAATGTCACCGCAAAGTCCAACAATGTACAAAT
CGTTCTATCCAATCTATTATTCGGAGATGTATGGCTGTGTAGTGGACAGA
GCAACATGCAATTTACTGTCGGCATGATGCAACTAATACTGATTATAACA
GCATTGGTTCTTAAAAGTCAACTTATATCTTGCAAGTTTCGATTTGCCAA
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GCCCAACACGAGGTCCAACAAACTAAAGATACAACAGTCAAGAAAGGTCA
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GATGATCACCAAAGTATTTTACTATCTCTTCCTTTTGAACCTTCATTAAA
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AATGTGCTGTTTACTCTATTGAAAATGATTTACCAAGCCCACCCGGAGTT
TGCTTCATTCCTTGACTAGCAACAGTCGGGGCTGATTTTTCATCAAAAAG
GCCCGACTTTGCAAAGATCCGATACGAACAGACAGCAAATTACGGTTATG
TTCCAAACCAGCAACAACAAAACGTCTTTATGGCCGTTGCTATGGATCTC
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ATCAATACAAAATCCCTATTGGTTTAGTTGATAGTGATTGGGGAGGTACC
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GAAGAACTCTGTTCAAACTAGAGGGGATAGGGTACGCTTGAAACGAGACG
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TGGTTTGAGGGAACTGATGGTTCAACGGATCAGATGTTTCCTTTTGGTTT
TGCTCAGAGCACAACAGCAGATGAAGAAATAGCGTCGGCACAAAACCATT
CCGATATAAGACTTTTCTCTCTCAACCAATTTGCATCTGAGAAACCATTA
CAAGATTTTGACCTCAACAATGTCCTCTTGAAATGGTCTGTAGCTTCAAA
AGACTGGAACGGGAATGCTGTTTGGTCTGTAAAATTATCACCTATGAAAG
CAGGAGGTCCTTACAATGTCACCGCAAAGTCCAACAATGTACAAATCGTT
CTATCCAATCTATTATTCGGAGATGTATGGCTGTGTAGTGGACAGAGCAA
CATGCAATTTACTGTCGGCATGATGCAACTAATACTGATTATAACAGCAT
TGGTTCTTAAAAGTCAACTTATATCTTGCAAGTTTCGATTTGCCAATAGC
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GGGATTTGGCGAGGAAGGTCAGAAAGTTGAAGTGACTGTCACTAATGCCC
AACACGAGGTCCAACAAACTAAAGATACAACAGTCAAGAAAGGTCAAGGC
ATCTGGTTCAACAGAATGGACACCTGCCGAGATAATTTCACCATCTGATG
ATCACCAAAGTATTTTACTATCTCTTCCTTTTGAACCTTCATTAAACGTC
ACAATGGTTCGATACGCTTGGTCCCAGACTCCTTGCGAGTACAAGAAATG
TGCTGTTTACTCTATTGAAAATGATTTACCAAGCCCACCCGGAGTTTGCT
TCATTCCTTGACTAGCAACAGTCGGGGCTGATTTTTCATCAAAAAGGCCC
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GCTGATAGGCTAGTATTGGGAGCACGTGCTTTAGTTTATGGCGAGTCTAG
TATCAATTTTCAAGGACCAATTATGGATACATGTTCTTTGTTTAATTATG
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GGTGCTATTTGGTACCAAGGTGAACATAATACGATTGTGAATAAAGATTA
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TTGAGGGAACTGATGGTTCAACGGATCAGATGTTTCCTTTTGGTTTTGCT
CAGAGCACAACAGCAGATGAAGAAATAGCGTCGGCACAAAACCATTCCGA
TATAAGACTTTTCTCTCTCAACCAATTTGCATCTGAGAAACCATTACAAG
ATTTTGACCTCAACAATGTCCTCTTGAAATGGTCTGTAGCTTCAAAAGAC
TGGAACGGGAATGCTGTTTGGTCTGTAAAATTATCACCTATGAAAGCAGG
AGGTCCTTACAATGTCACCGCAAAGTCCAACAATGTACAAATCGTTCTAT
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CAATTTACTGTCGGCATGATGCAACTAATACTGATTATAACAGCATTGGT
TCTTAAAAGTCAACTTATATCTTGCAAGTTTCGATTTGCCAATAGCTATG
GCTCAAATATGGTATTGCAAAGAGCACCCTTGAGTGCAAATGTTTGGGGA
TTTGGCGAGGAAGGTCAGAAAGTTGAAGTGACTGTCACTAATGCCCAACA
CGAGGTCCAACAAACTAAAGATACAACAGTCAAGAAAGGTCAAGGCATCT
GGTTCAACAGAATGGACACCTGCCGAGATAATTTCACCATCTGATGATCA
CCAAAGTATTTTACTATCTCTTCCTTTTGAACCTTCATTAAACGTCACAA
TGGTTCGATACGCTTGGTCCCAGACTCCTTGCGAGTACAAGAAATGTGCT
GTTTACTCTATTGAAAATGATTTACCAAGCCCACCCGGAGTTTGCTTCAT
TCCTTGACTAGCAACAGTCGGGGCTGATTTTTCATCAAAAAGGCCCGACT
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CAGCAACAACAAAACGTCTTTATGGCCGTTGCTATGGATCTCCCTGACGA
CAAATCACCATTCGGCTCTATCCACCCACGTGATAAAGCAACAGTCGCTG
ATAGGCTAGTATTGGGAGCACGTGCTTTAGTTTATGGCGAGTCTAGTATC
AATTTTCAAGGACCAATTATGGATACATGTTCTTTGTTTAATTATGGGGG
GAATTTTGGAATCAAAGTTGCGTTTAGGAATGCTGAAAAAGGAATACAAG
TTAAGGGTCCGACTGGTTTTGAGATACCGTTGGAGGTCCTGCTTGGAAAT
ATTTCTCAGCATTGTGTTGGATGTATGGTCGACGATTATATGATCAATAC
AAAATCCCTATTGGTTTAGTTGATAGTGATTGGGGAGGTACCTGTGCTGA
GGCTTGGTCATCACCGGAGGCTCTGGCGAAGTGTGGTTTGAAGAAGAACT
CTGTTCAAACTAGAGGGGATAGGGTACGCTTGAAACGAGACGTACTGGTT
GAACGAACAGTTTATGAAGATTCTAATGTTGATCCAAACTCATATTCAGT
ATTATGGAATTCTATGATTCGTCCTTTTTTGAATATGACAATCAAAGGTG
CTATTTGGTACCAAGGTGAACATAATACGATTGTGAATAAAGATTATTAC
GCATGCGTATTCCCAGAGATGATCAATAATTGGAGAAAGAAATGGTTTGA
GGGAACTGATGGTTCAACGGATCAGATGTTTCCTTTTGGTTTTGCTCAGA
GCACAACAGCAGATGAAGAAATAGCGTCGGCACAAAACCATTCCGATATA
AGACTTTTCTCTCTCAACCAATTTGCATCTGAGAAACCATTACAAGATTT
TGACCTCAACAATGTCCTCTTGAAATGGTCTGTAGCTTCAAAAGACTGGA
ACGGGAATGCTGTTTGGTCTGTAAAATTATCACCTATGAAAGCAGGAGGT
CCTTACAATGTCACCGCAAAGTCCAACAATGTACAAATCGTTCTATCCAA
TCTATTATTCGGAGATGTATGGCTGTGTAGTGGACAGAGCAACATGCAAT
TTACTGTCGGCATGATGCAACTAATACTGATTATAACAGCATTGGTTCTT
AAAAGTCAACTTATATCTTGCAAGTTTCGATTTGCCAATAGCTATGGCTC
AAATATGGTATTGCAAAGAGCACCCTTGAGTGCAAATGTTTGGGGATTTG
GCGAGGAAGGTCAGAAAGTTGAAGTGACTGTCACTAATGCCCAACACGAG
GTCCAACAAACTAAAGATACAACAGTCAAGAAAGGTCAAGGCATCTGGTT
CAACAGAATGGACACCTGCCGAGATAATTTCACCATCTGATGATCACCAA
AGTATTTTACTATCTCTTCCTTTTGAACCTTCATTAAACGTCACAATGGT
TCGATACGCTTGGTCCCAGACTCCTTGCGAGTACAAGAAATGTGCTGTTT
ACTCTATTGAAAATGATTTACCAAGCCCACCCGGAGTTTGCTTCATTCCT
TGACTAGCAACAGTCGGGGCTGATTTTTCATCAAAAAGGCCCGACTTTGC
AAAGATCCGATACGAACAGACAGCAAATTACGGTTATGTTCCAAACCAGC
AACAACAAAACGTCTTTATGGCCGTTGCTATGGATCTCCCTGACGACAAA
TCACCATTCGGCTCTATCCACCCACGTGATAAAGCAACAGTCGCTGATAG
GCTAGTATTGGGAGCACGTGCTTTAGTTTATGGCGAGTCTAGTATCAATT
TTCAAGGACCAATTATGGATACATGTTCTTTGTTTAATTATGGGGGGAAT
TTTGGAATCAAAGTTGCGTTTAGGAATGCTGAAAAAGGAATACAAGTTAA
GGGTCCGACTGGTTTTGAGATACCGTTGGAGGTCCTGCTTGGAAATATTT
CTCAGCATTGTGTTGGATGTATGGTCGACGATTATATGATCAATACAAAA
TCCCTATTGGTTTAGTTGATAGTGATTGGGGAGGTACCTGTGCTGAGGCT
TGGTCATCACCGGAGGCTCTGGCGAAGTGTGGTTTGAAGAAGAACTCTGT
TCAAACTAGAGGGGATAGGGTACGCTTGAAACGAGACGTACTGGTTGAAC
GAACAGTTTATGAAGATTCTAATGTTGATCCAAACTCATATTCAGTATTA
TGGAATTCTATGATTCGTCCTTTTTTGAATATGACAATCAAAGGTGCTAT
TTGGTACCAAGGTGAACATAATACGATTGTGAATAAAGATTATTACGCAT
GCGTATTCCCAGAGATGATCAATAATTGGAGAAAGAAATGGTTTGAGGGA
ACTGATGGTTCAACGGATCAGATGTTTCCTTTTGGTTTTGCTCAGAGCAC
AACAGCAGATGAAGAAATAGCGTCGGCACAAAACCATTCCGATATAAGAC
TTTTCTCTCTCAACCAATTTGCATCTGAGAAACCATTACAAGATTTTGAC
CTCAACAATGTCCTCTTGAAATGGTCTGTAGCTTCAAAAGACTGGAACGG
GAATGCTGTTTGGTCTGTAAAATTATCACCTATGAAAGCAGGAGGTCCTT
ACAATGTCACCGCAAAGTCCAACAATGTACAAATCGTTCTATCCAATCTA
TTATTCGGAGATGTATGGCTGTGTAGTGGACAGAGCAACATGCAATTTAC
TGTCGGCATGATGCAACTAATACTGATTATAACAGCATTGGTTCTTAAAA
GTCAACTTATATCTTGCAAGTTTCGATTTGCCAATAGCTATGGCTCAAAT
ATGGTATTGCAAAGAGCACCCTTGAGTGCAAATGTTTGGGGATTTGGCGA
GGAAGGTCAGAAAGTTGAAGTGACTGTCACTAATGCCCAACACGAGGTCC
AACAAACTAAAGATACAACAGTCAAGAAAGGTCAAGGCATCTGGTTCAAC
AGAATGGACACCTGCCGAGATAATTTCACCATCTGATGATCACCAAAGTA
TTTTACTATCTCTTCCTTTTGAACCTTCATTAAACGTCACAATGGTTCGA
TACGCTTGGTCCCAGACTCCTTGCGAGTACAAGAAATGTGCTGTTTACTC
TATTGAAAATGATTTACCAAGCCCACCCGGAGTTTGCTTCATTCCTTGAC
TAGCAACAGTCGGGGCTGATTTTTCATCAAAAAGGCCCGACTTTGCAAAG
ATCCGATACGAACAGACAGCAAATTACGGTTATGTTCCAAACCAGCAACA
ACAAAACGTCTTTATGGCCGTTGCTATGGATCTCCCTGACGACAAATCAC
CATTCGGCTCTATCCACCCACGTGATAAAGCAACAGTCGCTGATAGGCTA
GTATTGGGAGCACGTGCTTTAGTTTATGGCGAGTCTAGTATCAATTTTCA
AGGACCAATTATGGATACATGTTCTTTGTTTAATTATGGGGGGAATTTTG
GAATCAAAGTTGCGTTTAGGAATGCTGAAAAAGGAATACAAGTTAAGGGT
CCGACTGGTTTTGAGATACCGTTGGAGGTCCTGCTTGGAAATATTTCTCA
GCATTGTGTTGGATGTATGGTCGACGATTATATGATCAATACAAAATCCC
TATTGGTTTAGTTGATAGTGATTGGGGAGGTACCTGTGCTGAGGCTTGGT
CATCACCGGAGGCTCTGGCGAAGTGTGGTTTGAAGAAGAACTCTGTTCAA
ACTAGAGGGGATAGGGTACGCTTGAAACGAGACGTACTGGTTGAACGAAC
AGTTTATGAAGATTCTAATGTTGATCCAAACTCATATTCAGTATTATGGA
ATTCTATGATTCGTCCTTTTTTGAATATGACAATCAAAGGTGCTATTTGG
TACCAAGGTGAACATAATACGATTGTGAATAAAGATTATTACGCATGCGT
ATTCCCAGAGATGATCAATAATTGGAGAAAGAAATGGTTTGAGGGAACTG
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GCAGATGAAGAAATAGCGTCGGCACAAAACCATTCCGATATAAGACTTTT
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GGCATGATGCAACTAATACTGATTATAACAGCATTGGTTCTTAAAAGTCA
ACTTATATCTTGCAAGTTTCGATTTGCCAATAGCTATGGCTCAAATATGG
TATTGCAAAGAGCACCCTTGAGTGCAAATGTTTGGGGATTTGGCGAGGAA
GGTCAGAAAGTTGAAGTGACTGTCACTAATGCCCAACACGAGGTCCAACA
AACTAAAGATACAACAGTCAAGAAAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_009059XLOC_009059Clytia hemisphaericagene
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016213-proteinTCONS_00016213-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00016213-exon-sc0000231-1575043694:162704..162873TCONS_00016213-exon-sc0000231-1575043694:162704..162873Clytia hemisphaericaexon
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TCONS_00016213-exon-sc0000231-1575043694:156617..156982TCONS_00016213-exon-sc0000231-1575043694:156617..156982Clytia hemisphaericaexon
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TCONS_00016213-exon-sc0000231-1491911889:155051..155615TCONS_00016213-exon-sc0000231-1491911889:155051..155615Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000231supercontigsc0000231:155051..181096 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.226084	0.186549	0.137837	0.134852	1.38372	1.22316	30.4752	37.2383	31.743	22.3823	35.1156	34.9903	28.1869	28.3956	30.7415	37.7243	13.904	13.7878	40.6716	37.8202	21.9599	22.784	17.4676	17.1859	8.60779	9.56532	3.64853	4.5555	66.4399	58.1142
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR013830SGNH_hydro
Blast
[Close]
BLAST of TCONS_00016213 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: SIAE (Sialate O-acetylesterase OS=Homo sapiens GN=SIAE PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 392.889 bits (1008), Expect = 4.381e-127
Identity = 216/516 (41.86%), Postives = 301/516 (58.33%), Query Frame = 2 
Query:  368 FRFANSYGSNMVLQRAPLSANVWGFGEEGQKVEVTVTNAQHEVQQTKDTTVKKDWNGNAVWSVKLSPMKAGGPYNVTAKSN----NVQIVLSNLLFGDVWLCSGQSNMQFTVGMSTTADEEIASAQNHSDIRLFSLNQFASEKPLQDFDLNNVLLKWSVASKDTVGGPAWKYFSALCWMYGRRLYDQYKIPIGLVDSDWGGTCAEAWSSPEALAKCGLKKNSVQTRGDRVRLKRDVLVERTVYEDSNVDPNSYSVLWNSMIRPFLNMTIKGAIWYQGEHNTIVNKDYYACVFPEMINNWRKKWFEGTDGSTDQMFPFGFAQLATVGADFSSKRPDFAKIRYEQTANYGYVPNQQQQNVFMAVAMDLPDDKSPFGSIHPRDKATVADRLVLGARALVYGESSINFQGPIMDTCSLFNYGGNFGIKVAFRNAEKGIQVKGPTGFEVKASGS--TEWTPAEIISPSDDHQSILLSLPFEPSLNVTMVRYAWSQTPCEYKKCAVYSIENDLPSPPGVCFI 1897
            FRFA+   ++MVLQ+ P  A +WGFG  G  V VT+   Q  + + K T+VK     +  W V L PMK GGP+ V A+      N  + + ++LFGDVWLCSGQSNMQ TV     A  E+++   +  +R+ S++   +E+ L+D  L  V L+WS  + + +G   +KY SA+CW++GR LYD  + PIGL+ S WGGT  EAWSS  +L  CG+ K                  + ++  DS   P+ +SVLWN+MI P  NMT+KG +WYQGE N   N D Y C FP +I +WR+ +  G+ G T++ FPFG  QL++  +  SS    F +IR+ QTA++GYVPN +  N FMAVAMDL D  SPFGSIHPRDK TVA RL LGARAL YGE ++ F+GP+ +   L  + G   +       +  +Q K    FE+        +W PA + + S   QS+ L++       V  +RYAW+  PCEYK+C +Y   + LP+PP + FI
Sbjct:   26 FRFASYINNDMVLQKEPAGAVIWGFGTPGATVTVTLRQGQETIMK-KVTSVKAH---SDTWMVVLDPMKPGGPFEVMAQQTLEKINFTLRVHDVLFGDVWLCSGQSNMQMTVLQIFNATRELSNTAAYQSVRILSVSPIQAEQELED--LVAVDLQWSKPTSENLGHGYFKYMSAVCWLFGRHLYDTLQYPIGLIASSWGGTPIEAWSSGRSLKACGVPK------------------QGSIPYDSVTGPSKHSVLWNAMIHPLCNMTLKGVVWYQGESNINYNTDLYNCTFPALIEDWRETFHRGSQGQTERFFPFGLVQLSSDLSKKSSDD-GFPQIRWHQTADFGYVPNPKMPNTFMAVAMDLCDRDSPFGSIHPRDKQTVAYRLHLGARALAYGEKNLTFEGPLPEKIELLAHKGLLNLTYY---QQIQVQKKDNKIFEISCCSDHRCKWLPASMNTVST--QSLTLAID-SCHGTVVALRYAWTTWPCEYKQCPLYHPSSALPAPPFIAFI 510
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00016213 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
SIAE4.381e-12741.86Sialate O-acetylesterase OS=Homo sapiens GN=SIAE P... [more]
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