TCONS_00016742 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00016742
Unique Name	TCONS_00016742
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	803

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000248:84927..97926-
coding sequence from alignment at sc0000248:84927..97926-

transcript sequence

>TCONS_00016742 ID=TCONS_00016742|Name=TCONS_00016742|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=803bp
CTGCAACACCAGAGATGTTGGTAAATTCAACTACGGAATGTCTTTTGGAA
TGTAGAAAGTTGCAGACAGATAATGCTTTGATGACAATCAATAGCTCATG
TTTCTGCACTTTTAAGGATTGCTCAAAAGATAAAAAGGAAGGCTCCTTGG
CTACATTTTATAAAGCTAAAAGACTTTCAATCATCGAAAATGTATGTTTT
CAAGCAAGAGAAAGTTATGGTATTATCAAGATCCCAAGAAGTGGTGCCGT
CAACGCTTTCAAATTAGTACATGTCTCAGGCGCTGCAAAATGTGGTCTTG
GATCAACTTCAAATTGGGGATGCCTGCCAAATTTCTCAACGAACTATGTT
TGCATTGTGCTTGCAGATGATAAAGGGAAAAAGATTGCACCCCCTGGTGC
AGTGAGTACAGGTTACGTCATTGTAGGTGCAGACGTCACATCTAAGGNCC
CCTGGTGCAGTGAGTACAGGTTACGTCATTGCAGGTGCAGACGTCACATC
TAAGGTGTTGAATCTATCATTGGAATGGGCTTCTTACGAAGTCACGGAAG
GTCAAGAATTAAGACTTTATCATTCAGAAGTCTTCTTTCATGATTACTAT
GATGACAACGTGGGTTCACATTGTGTAGATGTCATCTTATCATTCGATGA
AATGTAAAGAACTATAAAATGAAAGACAAATATTATGATTACCGGAACTA
AGAAGTCAAGATAGAAATTAATAATTAAAGCACCTAAGCATGGaataatt
tatttcaaatttctgCTGTAAAAAAAGTACATTACTTCAAGTTTCATGTC
TTA

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00016742-protein

>TCONS_00016742-protein ID=TCONS_00016742-protein|Name=TCONS_00016742-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=166bp
ATPEMLVNSTTECLLECRKLQTDNALMTINSSCFCTFKDCSKDKKEGSLA
TFYKAKRLSIIENVCFQARESYGIIKIPRSGAVNAFKLVHVSGAAKCGLG
STSNWGCLPNFSTNYVCIVLADDKGKKIAPPGAVSTGYVIVGADVTSKXP
WCSEYRLRHCRCRRHI

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000248:84927..97926-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00016742 ID=TCONS_00016742|Name=TCONS_00016742|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13000bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000248:84927..97926- (Clytia hemisphaerica)
CTGCAACACCAGAGATGTTGGTAAATTCAACTACGGAATGTCTTTTGGAA
TGTAGAAAGTTGCAGACAGATAATGCTTTGATGACAATCAATAGCTCATG
TTTCTGCACTTTTAAGGATTGCTCAAAAGATAAAAAGGAAGGCTCCTTGG
CTACATTTTATAAAGGTAAATACAACAAAGGTTTTGGCAGGCACGACGGA
AGCTTTTTATATCTGGTACGGCGAATGAGGAAATTTAAGCGATTTTATAG
CGATTTTACCGACGAAGAGGAAAACTTCGGGTATTTTTGTGAAAATCTGG
TACGGCAGCCGCCGTACCTGCCGTACCCGTTGCGTCGTGCCTGTTTGGGA
ACTATTTATTTTAATAGAAACGGCCAAAAATGACAAAAACGACCAATTTC
ACTGTTCTGTAACTTTTTATCCAAGGAAGAGACGAAAAATCTGAATACAG
ATTTGAAACTAAAGTCTAATCACGATAAGTGTGCACTCTTTTTTCTTTTT
ACCTATAACTTTTGAAGGAATTCTGTGGAAGCCCGAAACAGTGTGGTGTG
TTACAACGCTCTTTATTGATTCAGAGGCTAGAAAAATACAAAGAAAGCCT
AATTAGAATTTAAAATGAAATAAAAATAGCTAAGTTCCGAATTCCGGAAA
TCGGTCAGCTCCGGATGGAAAGGGCCAATACCGGAATACGGAAAACTATA
CGGAACTCCAAAAGTAAAGTGGCCCTAGAGCAAACAGAGGGCGAATAGAG
GCCAGAAATAGAGTATGAAGCCAAATCGACCAAAGGACCAAATGCAATGC
CCAAAAGACTAACGGTCTGTGACCAGAAAAACGGCTAGGAAAATGACTCC
AAGATCGACTAAACGAAAGTCACAGACCAGGTCAAAAGGTGANNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNAGTAACTCGTTCAGCTCATTGTGAGTGCCCTCGAAAGTTAATGCTG
TCTCGTTGTACTGTTGAAGTCGACTCTTGATAAGACTTTGATCCAGCAGG
GCTAATGTTTCCATCATAGACTTGCCTCGTTTCTCTAATCTGTTGAGAAG
TCTTTTTCGTTCAGCAAATAAGTTTTGAATGCGTGATTTCTTACCCTTCT
CAGTTAGTTGTCTTTCTCTTTTTGGGTAGCGACGAGTTGGGGATAGAGCT
GTTGCACCAAGTAAAAGCGATCCTGTTTCATCATCTTGAGATGGTATGCT
CTGTTTGTCATCAGGTTCCTCGACAACTTGGGTACCTGCACGACTAGCGT
CTCCCTCATCTCTGGGTTGATTGACTTCTATGGCGGTCTGGTCAACTTCT
ATGGTGGTCCGGTCAACATCTGTGACGGTACGGTCAACATCTGTGGTGGT
ACGGTCAACATCTCCATCTCCATTGTGAACTCCAACGAGTTCTAGGGGAC
GATCGACATCGTCTCCATTCATCCTTATGTTTCACTTTGTGGAAGCCCGA
AACAGTGTGGTGTGTTACAACGCTCTTTATTGATTCAGAGGAGAAAGCCT
AATTAGAATTTAAAATGAAATAAAAATAGCTAAGTTCCGAATTCCGGAAA
TCGGTCAGCTCCGGATGGAAAGGGCCAATACCGGAATACGGAAAACTATA
CGGAACTCCAAAAGTAAAGTGGCCCTAGAGCAAACAGAGGGCGAATAGAG
GCCAGAAATAGAGTATGAAGCCAAATCGACCAAAGGACCAAATGCAATGC
CCAAAAGACTAACGGTCTGTGACCAGAAAAACGGCTAGGAAAATGACTCC
AAGATCGACTAAACGAAAGTCACAGACCAGGTCAAAAGGTGANNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCTCCAACGAG
AAGTGAAAATGGAGTTTCTACAAACTCCTCAAAACGTCTACACGCTCTCA
TAACAATTTCTAGATTGAATTCAAAAGCAAAAAAGGGCGATATAAAAATA
GAGAAATTGTGCATTGGAGCATTAAAAACTAATTAAATTAAACATTAAGA
CGCGATATCATACGCTAATTCCCAAATGGGAATATAGCTACCAAAACAAC
ATACGTCATAATATGACAAGTCTCTTGAGGCCAATGTTATCATGGCCGCA
ACAAATTCTTCAATCTTCATAAATTTGGTATCGTTGGAGAGATATTTGTG
AGTGGAACAATTTGAAATAAAAAGGCTATAAAAAAATTCTAAAAACGAAG
TTGAAAATAAAGAAGATCTTGTAGAAAAGTGCTATAACTTTTACTAACAA
ATTTCACTAGAAATTTCACTAAAATATTTATTCAATATAAAGTTATGATA
CAAAGTTAATAAGTGATTGACTCCCCAAAAACAGCAGAAAACAGCGTTTT
TAGACGTCAATCAGCTTATAACTTAGTTTGATATCTTTTGACTGAATTTT
TGAGAATTTTTTCACAATGATGACGTTCGATGATCAAGGATTCAATTCAG
TGAAAATGATAGTTATAGCACTTTCTACAAGATCTTCATTTTTTTCTTCT
TCATTTCCATCTTCATTTTTAGAATTTTTTTAAAGATTTTTTCATTTCAA
ATTGTTCCACTCGCTAATATCTTTCCAATGATACGAGATGTATAAAGATC
GAAGAATTCCTTCAAAAGTTACAAGGTAAAAGAAAAAAGAGTGCACACTT
ATCGTGAATAGACTTAAGCAAGGTTCAAATTAAAAAAAAAATTCATGTCA
TGTTTTTTAAAACAATAGAAAAAATCTTCTTCATTTTTCATCTTCCTTCT
TCTTCATTTTTCAACTTTTCAAAAACCTTTTGTCCTTTAGATTGTTTTCT
TTGGAAATTTCTTTCCAACGGTGTATAACTTTTCAACATAGAATGAATGG
TGCTGAGAAAATGCTCAAAAGAACAGTAAAAGTGTCCACATACTTTTGAG
GCAGACTTTAGATGTAATGGGTGATAGTTCCGTGAGAATGCCATCTTGAG
AGTTAAGGACGAAATTATGACATGGTCATCAATTTATTCACATTTCCCTG
CGTTTTGTTTCCCCGCTCAGACATTTTCCAAGAATATAATGAAAATGAAA
ATGATTATATACTATACATTTTCCTACAAAGTCAAAAATGCACTAACATC
TATTTTAAATTAAAGTATAATTTTACAAACTAGTTTCTCAAGTGCAATAT
GATTAAAGAATAATAAGATGTTACAATTTACAAAGCTAAATTTCTTTCCA
ATGGTGCATAGCTTTCTTTCAAACAAAGGCTTGATGGGTGCTGAGAAAAT
GTCAAAAACTAATGTGTCCACAAACTTTTGAGACAGACTTTACGATGGAT
CGAATGGCCTTTTTATTTTATCATTTAAGTACAAATATGTTAGCTTAAAG
ATGTAGAAACGGGTCAAAATCAGTCTGAGCATCTAAGCCTTTATTTTTAT
ATGAAACTTCCTTACAGCTACTCGTTTATCAAATAAATATCCCTCCTAGA
GAAGAGCGCTTACTTGAAGGGAGCGTTAATTTATTTGAGTTCTCCTCATT
TTTTACTTACAGCTAAAAGACTTTCAATCATCGAAAATGTATGTTTTCAA
GCAAGAGAAAGTTATGGTATTATCAAGATCCCAAGAAGTGGTGCCGTCAA
CGCTTTCAAATTAGTACATGTCTCAGGCGCTGCAAAATGTGGTCTTGGAT
CAACTTCAAATTGGGGATGCCTGCCAAATTTCTCAACGAACTATGTTTGC
ATTGTGCTTGCAGATGATAAAGGGAAAAAGATTGCACCCCCTGGTGCAGT
GAGTACAGGTTACGTCATTGTAGGTGCAGACGTCACATCTAAGGNCCCCT
GGTGCAGTGAGTACAGGTTACGTCATTGCAGGTGCAGACGTCACATCTAA
GGTGTTGAATCTATCATTGGAATGGGCTTCTTACGAAGTCACGGAAGGTC
AAGAATTAAGACTTTATCATTCAGAAGTCTTCTTTCATGATTACTATGAT
GACAACGTGGGTTCACATTGTGTAGATGTCATCTTATCATTCGATGAAAT
GTAAAGAACTATAAAATGAAAGACAAATATTATGATTACCGGAACTAAGA
AGTCAAGATAGAAATTAATAATTAAAGCACCTAAGCATGGAATAATTTAT
TTCAAATTTCTGCTGTAAAAAAAGTACATTACTTCAAGTTTCATGTCTTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000248:84927..97926-

>TCONS_00016742 ID=TCONS_00016742|Name=TCONS_00016742|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=1002bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000248:84927..97926- (Clytia hemisphaerica)
CTAAAAGACTTTCAATCATCGAAAATGTATGTTTTCAAGCAAGAGAAAGT
TATGGTATTATCAAGATCCCAAGAAGTGGTGCCGTCAACGCTTTCAAATT
AGTACATGTCTCAGGCGCTGCAAAATGTGGTCTTGGATCAACTTCAAATT
GGGGATGCCTGCCAAATTTCTCAACGAACTATGTTTGCATTGTGCTTGCA
GATGATAAAGGGAAAAAGATTGCACCCCCTGGTGCAGTGAGTACAGGTTA
CGTCATTGTAGGTGCAGACGTCACATCTAAGGNCCCCTGGTGCAGTGAGT
ACAGGTTACGTCATTGCAGGTGCAGACGTCACATCTAAGCAACACCAGAG
ATGTTGGTAAATTCAACTACGGAATGTCTTTTGGAATGTAGAAAGTTGCA
GACAGATAATGCTTTGATGACAATCAATAGCTCATGTTTCTGCACTTTTA
AGGATTGCTCAAAAGATAAAAAGGAAGGCTCCTTGGCTACATTTTATAAA
GCTAAAAGACTTTCAATCATCGAAAATGTATGTTTTCAAGCAAGAGAAAG
TTATGGTATTATCAAGATCCCAAGAAGTGGTGCCGTCAACGCTTTCAAAT
TAGTACATGTCTCAGGCGCTGCAAAATGTGGTCTTGGATCAACTTCAAAT
TGGGGATGCCTGCCAAATTTCTCAACGAACTATGTTTGCATTGTGCTTGC
AGATGATAAAGGGAAAAAGATTGCACCCCCTGGTGCAGTGAGTACAGGTT
ACGTCATTGTAGGTGCAGACGTCACATCTAAGGNCCCCTGGTGCAGTGAG
TACAGGTTACGTCATTGCAGGTGCAGACGTCACATCTAAGCAACACCAGA
GATGTTGGTAAATTCAACTACGGAATGTCTTTTGGAATGTAGAAAGTTGC
AGACAGATAATGCTTTGATGACAATCAATAGCTCATGTTTCTGCACTTTT
AAGGATTGCTCAAAAGATAAAAAGGAAGGCTCCTTGGCTACATTTTATAA
AG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_009360	XLOC_009360	Clytia hemisphaerica	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00016742-protein	TCONS_00016742-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00016742-exon-sc0000248-1575043694:97762..97926	TCONS_00016742-exon-sc0000248-1575043694:97762..97926	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00016742-exon-sc0000248-1575043694:84927..85564	TCONS_00016742-exon-sc0000248-1575043694:84927..85564	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00016742-exon-sc0000248-1510915933:97762..97926	TCONS_00016742-exon-sc0000248-1510915933:97762..97926	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00016742-exon-sc0000248-1510915933:84927..85564	TCONS_00016742-exon-sc0000248-1510915933:84927..85564	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00016742-exon-sc0000248-1491911889:97762..97926	TCONS_00016742-exon-sc0000248-1491911889:97762..97926	Clytia hemisphaerica	exon
TCONS_00016742-exon-sc0000248-1491911889:84927..85564	TCONS_00016742-exon-sc0000248-1491911889:84927..85564	Clytia hemisphaerica	exon

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000248	supercontig	sc0000248:84927..97926 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.0597268	0	0.0676258	0	0.32218	0.0636477	0.0767883	0.143777	0.100661	0	0	0	0.119167	0	0	0	0.0448367	0	0	0	0.0577473	0.422507	1.16419	1.18293	1.66728	3.37663	0	0.0874031	0	0.135082

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00016742 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00016742 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00016742 (transcript) - C. hemisphaerica