TCONS_00016945 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00016945
Unique NameTCONS_00016945
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1302

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00016945 ID=TCONS_00016945|Name=TCONS_00016945|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1302bp
CATTACAAAAGATTTGATGAAACAGTCGGTAGCAACAATGAAGAAATACT
TCCACAAGGTGAATTGTATAACCAGCAACGTAATATCAAGCATTACAAAA
TATTTGATGAAACAGTCGGTAGCAACAATGAAGAAATACTTCCACAAGGT
GAATTGTATAACCAGCAACGTAATATCAAGCATTACAAAAGATTTGATGG
AACAGTCGGCAACAACAATGGCGGAATACATCGACAAGATGGCGGCCAGC
AAAGTAGTATAAAGCGTTACAAAAGGTTTGATGAAAAAACTGGTATGGAT
TCATACAAAGAAGCAAAAGAAGCTCATCAACAGAAAACGTTGAAATCTAG
CCTGGATAAATTAAAGAATCAAGCATTAGACCCGTTTCCTATTACATGGA
ATTATACAGATAAATATTCTAACCGAACATTTGGTGTTACTCGAAACAGT
ATTGCGTTAAAGTCACAACCCACTGAATGTGTATACGCTGTCAATAAAGT
GAGACGTTTACACGGACTTCCAGAATTATCTTGGGCCACAGATATCGCAT
ATACGGCACAAGAATGGGCGCTCGCATTAGCCCAGATTGATAAAGGTTGT
GAAGCTACTCACGATGATTATCCAAATTTATGGTTCAATGGAAAAGAAAT
AAGATTGggtgaaaacatttttctttcagatgataaattttttgatgatt
gtGCACAATCAATTGCTGCCTGGTACAATGAACAATTCAAAGGTACCCAT
TACAACTACGATAAACCAGTGTACAACGTGGATCCGAACGGCCACGGTCA
TTTTATAACACTGATGTGGCCGACAACGAAATATTTTGGTGTGGGAATAT
CTTATGATTACGATATCGAATGTACCTACACTGTAGCTCGTTTTGATGGT
GTTCCAAACgaaaatgatttttacaaaaGCAGGTACAGAATCCCGAAACC
TAAAGAAAaggtGACTGTGACAGAGGCTTATTTGACACCGAAGAAGCAAC
CACCACCAGTCGTCTACTTTTTATACATCCCCAGTGAAGGCGGATGGACA
GAATGGATTGACGTCTCAACTTGTAGTACAACTTGTGGCAAGGGATTCAA
AGTTCAACGCCGTTTTTGCATCACTCCCGAATCTTTGAATGGGCATCCAC
CAAATTGTGGTGCGGACAAAGAGAGAATGCAAATCATAATGTGCGAACGA
CAGGTTGTCTGTCCAGGGGATAACgatgaaagaaagaaagacgGAATTTG
CGAGGACAAGACTCCTAATTTTTGCAAGAGAAAAGTCACACCAGGCAATG
GT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000255:93480..111636+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00016945 ID=TCONS_00016945|Name=TCONS_00016945|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18157bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255:93480..111636+ (Clytia hemisphaerica)
CATTACAAAAGATTTGATGAAACAGTCGGTAGCAACAATGAAGAAATACT
TCCACAAGGTGAATTGTATAACCAGCAACGTAATATCAAGCATTACAAAA
TATTTGATGAAACAGTCGGTAGCAACAATGAAGAAATACTTCCACAAGGT
GAATTGTATAACCAGCAACGTAATATCAAGCATTACAAAAGATTTGATGG
AACAGTCGGCAACAACAATGGCGGAATACATCGACAAGATGGCGGCCAGC
AAAGTAGTATAAAGCGTTACAAAAGGTTTGATGAAAAAACTGGTATGGAT
TCATACAAAGAAGCAAAAGAAGCTCATCAACAGAAAACGTTGAAATCTAG
CCTGGATAAATTAAAGAATCAAGCATTAGACCCGTTTCCTATTACATGGA
ATTATACAGATAAATATTCTAACCGAACATTTGGTGTTACTCGAAACAGT
ATTGCGTTAAAGTCACAACCCACTGAATGTGTATACGCTGTCAATAAAGT
GAGACGTTTACACGGACTTCCAGAATTATCTTGGGCCACAGATATCGCAT
ATACGGCACAAGAATGGGCGCTCGCATTAGCCCAGATTGATAAAGGTTGT
GAAGCTACTCACGATGATTATCCAAATTTATGGTTCAATGGAAAAGAAAT
AAGATTGggtgaaaacatttttctttcagatgataaattttttgatgatt
gtGCACAATCAATTGCTGCCTGGTACAAGTAAGTTCGATCATTCTGTACG
ATATTGacctacacgcttttttctttataagaatgtaaATCCATTTTATC
ATAGATATTCCTAACTATAATCCTAAAgtattcttacaacattcttaggt
aaggatcctaattcagactagatttaaacatttagtacatacgtctcaag
cataaattggcatttttgtaaaaggagtgagccttacttgggggtaattg
gtaatttataattgaaaaatggcattcttagttTGAGTAGCCAAATtcaa
tgatggtgatattcttagcatattcttaattttttggcaattttcatcat
ggacattcttataaagtgtattcttataaaaaaaagcgtgtagctgGTCA
TTTTCACAGTTAACCTAAGTCCAAAATTATCAGTATTTAGAGCTTCTTAA
CTTTGGTATAAACTGCAATTATGGACAAAAATGTTGACACAAAAGCGAAT
TCTAAGCTGCTTCCCCCTTTCCCCCATTTACAATGTCCAATGCTTGGTGT
GACGGCCGTGCGGACTGAACATTGCAGCTGGGGAAAGGGGGGAGactttt
ttctatatttttactACAAATTCCtgtgtttttctcaaacatgTTTGTCC
ATGATTGTTTTCTCAAATTCTAAACCATTCTCCTTTTCTCAAATTAAGAG
CTAAAAGTTGTCAGTTGATAATCACGAACCTATAACCCTACACGAGAAGT
GACTACAGTTGAGacctagtttagacggccgactttctgccttGCCTTCC
GTCGTTTATGACGAAAGTTGACAGTCAAAAGTCAATACAATGCCTTCATT
TGACGtctctttcaatctttttcaagcaaagatttgaaACTGCAAATTTA
CCGTCAATCTTGTGCCGTCTCTCACATCGAAAGGAGGCAAGGCAGAAAGT
CGACTGTCTAAACTAGGTCTGTCTCCCGCttattcgaactcgaacgggaa
tGTTATTTGTTCGAGTTACAAAGAGAAAATACTTTATAGAAGGTACTAAA
TGGGGCTGGAAACaagatcgaattatagaaagattcgcaTAAAAGAAGCT
CGAATAAGCGAATGTTTGTATATCAACTGTCAGTCATCCCCGATTAGTGG
CGCCACTTACTTTTAACATGTGAAATATTTCATTCTGTTTTTTATAAGTG
AACAATTCAAAGGTACCCATTACAACTACGATAAACCAGTGTACAACGTG
GATCCGAACGGCCACGGTCATTTTATAACACTGATGTGGCCGACAACGAA
ATATTTTGGTGTGGGAATATCTTATGATTACGATATCGAATGTACCTACA
CTGTAGCTCGTTTTGATGGTGTTCCAAACgaaaatgatttttacaaaaGC
AGGTACAGAATCCCGAAACCTAAAGAAAGTAAGTTCCAACCCAGCTTGGC
ACACAacgctgtttcaacgttcatctaacgttatatggacgttgtgaaca
ttagatgacgttgaaacaacgttttgcaCCAGCTGGGAAACTACATTTTG
CAATAAACACGAACAGAGTGCTAAAGACCCCCGGCCctaaaaattactaa
aaaaacAAGTAACTTGGCTTACAAATATTGCCCTGAAACTAATTATGGAC
TGTGAAGGCAACCATAAgcaactaaaaataatttttttttgttatccCGA
CATTAACATTATCAAAGTCGAGGTTAAAAAGTCAATCTTGGTTAAATCCA
TCAGCGAAATTATAAAGGTTGATATCCTAATAATCCTGAAAATCCTTAGC
AACTCCACCTCTGAAAATTGGAgctgtttataaaaaatatgtacagGCAT
AAATCTTCGTATCCAGCGCTAAACTCGAAAAATTTTCATCGGCCATCCAa
ataaagttttatttcatactCTAACTTAAATTAACACAATGATCTCAGAC
TTgtcttaaaagaaaagaaaaattggaagctTAGCGAAAATTGGAAAGCT
GAATAAATGATATACCGTTTAGTTGATCTCTATATTTTAATTCATGTCAG
CCATTTCGTCAGCCTTTGGTGATCTTTCAGCTTACCAAGATCGAAAATAT
AatcagttttttattttaatctttcatctttttcatccTTAAATAAAATG
ACAGAGTTAAAAAAAGGCATCTGGAATTAGGACAACAATACGGTAgtttt
ctcttattttcacAAGGTTTTCCAACTTTCCCTTTGTTAATGATATAATT
AAATATCatctttaatttattttatttttcagaggtGACTGTGACAGAGG
CTTATTTGACACCGAAGAAGCAACCACCACCAGTCGTCTACTTTTTATAC
ATCCCCAGTGAAGGCGGATGGACAGAATGGATTGACGTCTCAACTTGTAG
TGTAAGTGGTAGCCAATAAGAATTTTAACAACGCTGATTAAAGGCCAGTG
TAAAGACCAGTGtccggtatcggaattgcaattgtttcaattgttttaaa
agtttgttttggacacgtgattttaattgttctctttaatgacacgtggt
ttgcgcaatgttatattttactacttttatatccctttaacgttagatgg
acgttgaaataacgttagGTGTCAGCTAGGCAACCAACTTCCTTTCTCTT
TTGCAGACAACTTGTGGCAAGGGATTCAAAGTTCAACGCCGTTTTTGCAT
CACTCCCGAATCTTTGAATGGGCATCCACCAAATTGTGGTGCAGACAAAG
AGAGAATGCAAATCATCATGTGCGAACGACAGGTTGTCTGTCCAGGGGAT
AACgatgaaagaaagaaagacgGTTAGTCACAACTTTTTAACCCTTTTAA
CGATTGCTATTTTCTTGCTAGGTTCTTGGAATTCCTTTTAATTTTAGTTC
AGTTTAGCTTTCAAACTCGGAGCCTCAAAGATTCTGGTAGAAAGCAATAT
CAGTACTTTATCCATGGTAGATAATACGTtgtcaaaaagtgagcaaaata
taACGTCAAAGTTTCAGAATACCACTGAAAATTGCTGGGAAAATAGGTAA
CCCTTTCCCCCAGCAGACGACCTCCCAACGACTTTTCACCGTTCTTTTAA
CAACGGCACTAGGGGAAAGAGTGGGAGGGGGAGTTCAAATCATACTCTTG
TATCACCATTTAAGTTCAGGATTGTACCACAATACAATTATAATCACAGT
TATAAATACCTCTAAGTTAATCTAAGTTAAAACTACTTATATGTTGATTT
GTCTTCTGTACGTAGCACATTCACTGTACCCGGAAAAAACGGGGCATAAT
TTTATATGTGCTTAAGAATTCCATATACAAANTTTTCTCTTTTGCAGACA
ACTTGTGGCAAGGGATTCAAAGTTCAACGCCGTTTTTGCATCACTCCCGA
ATCTTTGAATGGGCATCCACCAAATTGTGGTGCGGACAAAGAGAGAATGC
AAATCATAATGTGCGAACGACAGGTTGTCTGTCCAGGGGATAACgatgaa
agaaagaaagacgGTTAGTCACAACTTTTAAACCCTTTTAACGATTGCTA
TTTTCTTGCTAGGTTCTTGGAATTCCTTTTAATTTTAGTTCAGTTTAGCT
TTCAAACTCGGAGCCTCAAAGATTCTGGTAGAAAGCAATATCAGTACTTT
ATCCATGGTAGATAATACGTtgtcaaaaagtgagcaaaatataACGTCAA
AGTTTCAGAATACCACTGAAAATTGCTGGGAAAATAGGTAACCCTTTCCC
CCAGCAGACGACCTCCCAACGACTTTTCACCGTTCTTTTAACAACGGCAC
TAGGGGAAAGAGTGGGAGGGGGAGTTCAAATCATACTCTTGTATCACCAT
TTAAGTTCAGGATTGTACCACAATACAATTATAATCACAGTTATAAATAC
CTCTAAGTTAATCTAAGTTAAAACTACTTATATGTTGATTTGTCTTCTGT
ACGTAGCACATTCACTGTACCCGGAAAAAACGGGGCATAATTTTATATGT
GCTTAAGAATTCCATAtacaaattgtttttttctagGAATTTGCGAGGAC
AAGACTCCTAATTTTTGCAAGAGAAAAGTCACACCAGGCAATGGTCGTAA
AGAATGCCGACAAAAAGATACGAAAGAACAAATGACACGTGATTGCAAGA
AGACATGCCGTTTTTGCGAGCGTgagtctgtctgtctgtctgtctgtctg
tctgtctgtctgtctgtctgcgCTTTTGTAATATCACACCATAACACAAC
CAAAACTGCAACATTGTctccgtgtattccaggctttatctacgttactg
attgacgccagagaatactaTCTAGCGCTATCACTAAGCATTGAAAATGC
TGGTAATACACACGGAACGAGGTTGCCaaaactgtttaacaatttCTATC
CGTTTATGACATGTCCCGAGGATTGAGAATCTGTCGGTATAATATCAAAT
AGCAATTGTGGATCGACACAAAAAGCGTTCAAAGGGTGCAAGAATTGTCT
TCAAATTTGAGAAACATCCAAATCATGGATATGGACTATGGATATCGTGC
ATTCTTTCTTTGCGCATCATATTTAACTAGATCTAGAGcgataaatttta
ctttcaatacaGCGTTTGTCTGAAAGCCACGTCGGTCACACTTCATTTCC
TATCCAATAATTTCTCTCTAGCCATCTGCcttaaactgattttttttatt
ttcagcttGTATGAATTACCACAGAGATTGTCCAGGTTACGCGTCCGTCA
GTTATGGTTATTGCACTGATGATAAGTACAGTGCTTGGATGGAATGGAAA
TGTGCTAGATCATGTGGTTATTGTAACCAAAGTGAGTTAAANNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAACTTCTGATA
AAAGAGAATCATGTTGAACCTTTCATCTCTTACCATAACCACGGTCAGAG
ATAAGCAAGTACTTCCCATAAAACACGGTCAGTATTACATGCATGAGAGa
tcaacaatgatagaaatCAATTTGATTTTCCTCTTAACtaatatatttaa
atattttgactaaaagttcataatttttctttaacttcTGATAAAACAGA
ATCATGTTGAACCTTTCATCTCTTACCATAACCACGGTCAGAGATAAGCA
AGTACTTCCCATAAAACACGGTCAGTATTATATGCATGAGAGATCAACAA
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNtgatttttcatggaaattcactgcactgtaagggtccgattttag
aagccaaattttgggccgaacgtatggtcgatttcagatcgagtgccccc
cccgggggcaatgcttaagttttttttaagatttgagcatggatatgctt
ataagagtTATGGCTATCAATAAAAAGTCGTAAAGTGTGTATTATCAACT
TCAATACTTATTTCACCCGACCAAAATTTGCCACAACTTTTTTTCTAGTT
CTGTTAGTGTTTATTTCGAAATATTAATCTAGTGCACTGTAACGTACAAA
TTCCCAATTATAGATACGATTTCTCAATATgaggaaaaaatccaaaaaaa
tttaaatccctTTTTTGGCAATGTCTATAGTTGATAAAGAATTTACTGAT
TACCCGAGTTaggaaaataaaattcttaCTGTTAATATATGCTGACGgtt
taaatctttaatttacATGCGGTATTTTTTAGAGTGGCGGGACAAAGACC
ATAGTGCCTGTATGTGTATGTGATGGAGGGATGAACAATGCGTATATCTC
AGGTGACACAAATGTCGTTTCGACGCCCATCTAACGTTCACGAGGTCCAT
TGACGTATATTCAACGTTCATTTGACGTCCAcagtagtctagcaagctac
acgtttttttttttataagaacgtcaaaaattttcgaagccttcggatgt
tcttagttttttggatttgaagcctaaaaatgttcttaaaatgttcttaN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNacattttgatg
taatttcttaagaaaatgcatgtttttaagtctccaaagccttagaatgt
tcttagaatgttcttaaatttttgggcctcgaagccttatgttcttatat
agtttgttcttataaaaaaaagaacgtgtagacgactaatttatacatat
agtagaaataaagcaaaaagtaatgaatggaacaattttagtcgtctaga
aacctttgtgcactaactccaaacaaaaaaaaaagagtcaattaatatcg
caattaaaattttttcctgctcaaaataattcttgagaaaaaaaaatatg
tgtggatttgtgtattgaaagtttttcatttgagttgatttcgttttgag
agtttgttNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNtccagtcgtttatacaaactaa
atcccgtattattattattattattattattattagtattggtattatta
gtattacacgcattataaacgactccagtctacgtCCACAGCCATTGAAT
GGTTTTACCTGAAAGAAGAACATTTGAATTTGTTAAAGATTGACGTTTTT
ACTACTGGTATTAATAGAATTAACGTTCGACTAATACTATCTGATGGATA
AATGGCTCGTTAACGAAACTCAAATGAAACCATTGCTTGGTTGTAAAAAT
CATCATCTACTGTAAATGAAACAAATAATGGACGGATATTGCCTTGTTTA
CTTAAATAGGCAGCAACGCTCATTGCAGGACGGCACTACATAGACCAAGC
ACGGCATTGTAGAGTTAAATATATCCTTCATCAGAGAAAGACAACAGTTA
TATTCCGTAATCCTTCTCCTGATTTAATTCATTAATCTGCAAATTTACCG
TCAATCTTGTGCCGTCTCTCACATCGAAAGGAGGCAAGGCAGAAAGTCGA
CTGTCTAAACTAGGTCTGTCTcccgctaattcgaactcgaacgggaatGT
TATTCGTTCGAGTTACAAAGAGAAAATACTTTATAGAAGGTACTAAATGG
GGCTGGAAACaagatcgaattatagaaagattcgcaTAAAAGAAGCTCGA
ATAAGCGAATGTTTGTATATCAACTGTCAGTCATCCCCGATTAGTGGCGC
CACTTACTTTTAACATGTGAAATATTTCAttctgtttttttataagtGAA
CAATTCAAAGGTACCCATTACAACTACGATAAACCAGTGTACAACGTGGA
TGCGAACGGCCACGGTCATTTTATAGCACTAATGTGGCCgacaacaaaat
attttggtgtGGGAATATCTTATGATTACGATATCGAATGTACCTACACT
GTAGCTCGTTTCGATGGTGTTCCAAACgaaaatgatttttacaaaaGCAG
CTACAGAATCCCGAAACCTAAAGAAAGTAAGTTCCAACCCAGCTTGGCAC
ACAacgctgtttcaacgttcatctaacgttatatggacgttgtgaacatt
agatgacgttgaaacaacgttttgcaCCAGCTGGGAAACTACATTTTGCA
ATAAACACGAACAGAGTGCTAAAGACCCCCGGCCCTAAAAATTACNGCTA
CATTTTGCAATAAACACGAACAGAGTGCTAAAGACCCGGCCctaaaaatt
actaaaaatacAAGTAACTTGGCTTACAAATATTGCCCTGAAACTAATTA
TGGACTGTGAAGGCAACCATAAGcacctaaaaaaaaattttttgttatcC
CGACATTAACATTATCAAAGTCGAGCGTAAAAAGTCAATCTTGGTTAAAT
CCATCAGCGAAATTATAAAGTTTGATATCCTAATAATCCTGAAAATCCTT
AGCAACTCCACCTCTGAAAATTGGagttgtttataaaaaatatgtacagG
CATAAATCTTCATATCCAGCGCTAAACTCGACAAATTTTCATCGGCCATC
CAaataaagttttatttcatactCTAACTTAAATTAACACAATGATCTCA
GACTTgtcttaaaagaaaagaaaaattggaagctTAGCGAAAATTGGAAA
GCTGAATAAATGATATACCGTTTAGTTGATCTCTATATTTTAATTCATGT
CAGCCATTTCGTCAGCCTTTGGTGATCTTTCAGCTTACCAAGATCGAAAA
TATAatcagttttttattttaatctttcatctttttcatccTTAAATAAA
ATGACAGAGTTAAAAAAAGGCATCTGGAATTAGGACAACAATACGGTAgt
tttctcttattttcacAAGGTTTTCCAACTTTCCCTTTGTTAATGATATA
ATTAAATATCatctttaatttattttatttttcagaggtGACTGTGACAG
AGGCTTATTTGACACCGAAGAAGCAACCACCACCAGTCGTCTACTTTTTA
TACATCCCCAGTGAAGGCGGATGGACAGAATGGATTGACGTCTCAACTTG
TAGTGTAAGTGGTAGCCAATAAGAATTTTAACAACGCTGATTAAAGGCCA
GTGTAAAGACCAGTGtccggtatcggaattgcaattgtttcaattgtttt
aaaagtttgttttggacacgtgattttaattgttctctttaatgacacgt
ggtttgcgcaatgttatattttactacttttatatccctttaacgttaga
tggacgttgaaataacgttagGTGTCAGCTAGGCAACCAACTTCCTTTCT
CTTTTGCAGACAACTTGTGGCAAGGGATTCAAAGTTCAACGCCGTTTTTG
CATCACTCCCGAATCTTTGAATGGGCATCCACCAAATTGTGGTGCAGACA
AAGAGAGAATGCAAATCATCATGTGCCAACGACAGGTTGTCTGTCCAGGG
GATAACgatgaaagaaagaaagacgGTTAGTCACAACTTTTTAACCCTTT
TAACGATTGCTATTTTCTTGCTAGGTTCTTGGAATTCCTTTTAATTTTAG
TTCAGTTTAGCTTTCAAACTCGGAGCCTCAAAGATTCTGGTAGAAAGCAA
TATCAGTACTTTATCCATGGTAGATAATACGTtgtcaaaaagtgagcaaa
atataACGTCAAAGTTTCAGAATACCACTGAAAATTGCTGGGAAAATAGG
TAACCCTTTCCCCCAGCAGACGACCTCCCAACGACTTTTCACCGTTCTTT
TAACAACGGCACTAGGGGAAAGAGTGGGAGGGGGAGTTCAAATCATACTC
TTGTATCACCATTTAAGTTCAGGATTGTACCACAATACAATTATAATCAC
AGTTATAAATACCTCTAAGTTAATCTAAGTTAAAACTACTTATATGTTGA
TTTGTCTTCTGTACGTAGCACATTCACTGTACCCGGAAAAAACGGGGCAT
AATTTTATATGTGCTTAAGAATTCCATAtacaaattgtttttttctagGA
ATTTGCGAGGACAAGACTCCTAATTTTTGCAAGAGAAAAGTCACACCAGG
CAATGGT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_009492XLOC_009492Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1491911889:93480..94207TCONS_00016945-exon-sc0000255-1491911889:93480..94207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1510915933:93480..94207TCONS_00016945-exon-sc0000255-1510915933:93480..94207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1575043694:93480..94207TCONS_00016945-exon-sc0000255-1575043694:93480..94207Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1491911889:95378..95607TCONS_00016945-exon-sc0000255-1491911889:95378..95607Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1510915933:95378..95607TCONS_00016945-exon-sc0000255-1510915933:95378..95607Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1575043694:95378..95607TCONS_00016945-exon-sc0000255-1575043694:95378..95607Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1491911889:96462..96580TCONS_00016945-exon-sc0000255-1491911889:96462..96580Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1510915933:96462..96580TCONS_00016945-exon-sc0000255-1510915933:96462..96580Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1575043694:96462..96580TCONS_00016945-exon-sc0000255-1575043694:96462..96580Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1491911889:97527..97692TCONS_00016945-exon-sc0000255-1491911889:97527..97692Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1510915933:97527..97692TCONS_00016945-exon-sc0000255-1510915933:97527..97692Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1575043694:97527..97692TCONS_00016945-exon-sc0000255-1575043694:97527..97692Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1491911889:111578..111636TCONS_00016945-exon-sc0000255-1491911889:111578..111636Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1510915933:111578..111636TCONS_00016945-exon-sc0000255-1510915933:111578..111636Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016945-exon-sc0000255-1575043694:111578..111636TCONS_00016945-exon-sc0000255-1575043694:111578..111636Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000255supercontigsc0000255:93480..111636 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.0359937	0	0.751026	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.0968335	0	0	0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00016945 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top