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transcript sequence >TCONS_00018046 ID=TCONS_00018046|Name=TCONS_00018046|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=251bp TGGCTTTGGCttttaatttctcaaaaaacgACACCAAGAGGATTTAGCTC TTTTTGACTCTTTCTGAAATAAGCAGGAATGTACGTCAAAGTATTGTTGG ATGGACTAAAGAAACTTGGATGTGACACTGGTTTAGATACGAAGAATATT TGCTGTGAACCATGCGAACCCCGTTTGACTGCTGCTTTCGATACTGATCG AAAAGAACTTCGATCATTACCAGCACCTTACAAGACCGATTGTGGAAAGA A Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000284:154842..171560+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00018046 ID=TCONS_00018046|Name=TCONS_00018046|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16719bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000284:154842..171560+ (Clytia hemisphaerica) TGGCTTTGGCttttaatttctcaaaaaacgACACCAAGAGGATTTAGCTC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00018046-exon-sc0000284-1491911889:154842..154917 | TCONS_00018046-exon-sc0000284-1491911889:154842..154917 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018046-exon-sc0000284-1510915933:154842..154917 | TCONS_00018046-exon-sc0000284-1510915933:154842..154917 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018046-exon-sc0000284-1575043694:154842..154917 | TCONS_00018046-exon-sc0000284-1575043694:154842..154917 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018046-exon-sc0000284-1491911889:160900..160945 | TCONS_00018046-exon-sc0000284-1491911889:160900..160945 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018046-exon-sc0000284-1510915933:160900..160945 | TCONS_00018046-exon-sc0000284-1510915933:160900..160945 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018046-exon-sc0000284-1575043694:160900..160945 | TCONS_00018046-exon-sc0000284-1575043694:160900..160945 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018046-exon-sc0000284-1491911889:162229..162313 | TCONS_00018046-exon-sc0000284-1491911889:162229..162313 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018046-exon-sc0000284-1510915933:162229..162313 | TCONS_00018046-exon-sc0000284-1510915933:162229..162313 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018046-exon-sc0000284-1575043694:162229..162313 | TCONS_00018046-exon-sc0000284-1575043694:162229..162313 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018046-exon-sc0000284-1491911889:171517..171560 | TCONS_00018046-exon-sc0000284-1491911889:171517..171560 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018046-exon-sc0000284-1510915933:171517..171560 | TCONS_00018046-exon-sc0000284-1510915933:171517..171560 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00018046-exon-sc0000284-1575043694:171517..171560 | TCONS_00018046-exon-sc0000284-1575043694:171517..171560 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000284 | supercontig | sc0000284:154842..171560 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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