TCONS_00018145 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00018145
Unique NameTCONS_00018145
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length3785

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00018145 ID=TCONS_00018145|Name=TCONS_00018145|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3785bp
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Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00018145-protein

>TCONS_00018145-protein ID=TCONS_00018145-protein|Name=TCONS_00018145-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=1086bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000290:177701..190916-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00018145 ID=TCONS_00018145|Name=TCONS_00018145|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13216bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000290:177701..190916- (Clytia hemisphaerica)
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This transcript is a part of the following gene feature(s):
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR003392Ptc/Disp
IPR000731SSD
Vocabulary: Cellular Component
TermDefinition
GO:0016021integral component of membrane
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00018145 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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