TCONS_00018150 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00018150
Unique NameTCONS_00018150
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2981

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00018150 ID=TCONS_00018150|Name=TCONS_00018150|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2981bp
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Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00018150-protein

>TCONS_00018150-protein ID=TCONS_00018150-protein|Name=TCONS_00018150-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=971bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000290:220622..270068-

Legend: exonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00018150 ID=TCONS_00018150|Name=TCONS_00018150|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=49447bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000290:220622..270068- (Clytia hemisphaerica)
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TATGGCATTGGCTTTATTGTACCTCAAGACAAATAATCTATACCTGGTTA
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AGGTCTCCTCTTCTTCGGTACGGGAGATCTTCACTTGGTGAAAATTCTTC
TACGTGAGATCGGAAAACCACCTGGTGTAGAGATCGAGTCCTCTAATGAT
CGTGAAAGTCATGCATTGTCAGCTGGTTTGGCCCTTGGTATGATCATGAT
AGGTGGGCATGCGTTGACAACTGTTGCTCTACTCATCGGAACAGCTGCAA
CGAAGTTGATTCGACCTGGATTTTACTTAATAAATTGAAATATTCCGAGT
TGAATGCGAGTCACTCAGGATTTCTTTTCGCACTCGGATTGATGGGCCAT
TTGTCGTCACTTCCCAAACTTCACCTCCATGACTATCTTATAAAGCAATA
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AACTTCCACAATGGCGTTGCTGCTGGTTTGAAGATTGCTCGAGAAAACTG
CAAGAGGGATGTTAACTTTAGGTACAGCAGAACCAAAATCATCGAAAGCA
GTCATTATTCCAACTCTTGACCTCAGTGGCAGATCATCTACAAGTGATCA
TGCATTTGCCAAAGAAGAAGAATCGAAATTGTTGATACTCAGTAAAAGAA
CAATGTCGCTTTCAGTTGCAAGATGTTCGAGATACGGTTCAAAGACGACT
TGCGAGTACACGAAGTGAAACGTCTCCTAAATTCATCGGTTCCTGTTACT
GTTAGCGTGGAACAAAAACCAGACATGAAGACGAAGATGATAAAGATGGC
ATGTTAATTGATGAACAGGTCGGGAAGATATTGTGTCTTTGAAACAATTG
GAATTGAAGGAGAACACCAACTTGTCTTCCAAACTAAAACCGTCTCACGT
TTCACTGCAGATGACTTGGACAAGCTACCCATAGGCTATCAAATTCCAAT
CAAAGAGATCTTTCATCACACTAGAAGCACGAATCAAATTGCAATGTCGC
TAGAAACTGCCATGTTCCTTGCAAAGAATCATTAGTTGACACCATTATTA
ATATCATGCTAAAAGAAGTTTAAGATATTTGCAACGATTTCAAAATACAC
TCAAAGTACATCAAGCTCATCAGACCCCGAAGAGATGCTAGCACAATTGA
AATTGGCTGGGTTTTGGTTCAACGCGACCATTAAATTTTGAAATCATCAA
AGAACTGTCCAATTCTATGTAAACTCCGTTGATCAGTGGTTTGTATATGA
TGCAATGTCGAATCCGATGTGAAAACCAATTCCAAAAGATTGAAAATCTT
GATCATACGAGATATTGAAAACAATAGACTATCGGTGTATGATTTCCAAC
AACTCCGTCTGCTTTTCTCTTACTATAACAATACTCATCACAAACTATTG
AAGATGAACTATGTTTCAAAGAAATATGCTGAGCTCTTTTCCAATATACT
CTACGAATGTGTCAGACAAGAAAAGCTGGATGTGTTAAATCGATATCTGG
CCATCGAAAAGCTCGAATGCGTAAAAGCATTTTCATCGGCCACCAATGTT
GTTTTGTTTGAAGAAATGTTTTGTCATTCTAAAGATGGCGATAAGGGTTT
TCGAAATTTATTGGGAAGGACATTCACAAATCAATCTGAAAAGTCAATTA
TGGCTGGATCAAATACAAAACATATTTGTCAAAAAGAAAGCAGGATATCT
ATCTTACGCTGAGGATCCGAAGATAACAACCCTGGGTCCTCGATATTTAT
CCATCGCTCTGACAGTACCGAAGAAAAACAAGAGACTTTGAATTATCCTG
AATCGAGAGTGAAGATGTTATCTCCATGTTTCATCCCTGAATCAAAATAT
ATCAAAAAGATTCCATCTACAAGCGCTACGTCATTTATACGTGTTAGCCT
GTGAACCGCGTCTCTTTGTAACACGGGATGTGGATAACAAGAACATCTGC
TACACACCTATTGAAGTTACTTTAAAAATATACCCTAAAAACAGATGATA
TTGCGATTGCTTCATTACTATGTGCTGTTTATCCAAAATGGCCAATTAGT
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ATGGCGCGTCAGTTACGTAAGCGAACAAACGACGTATCCTATGGCAACCA
TATGGCTATTCATATGGCGATCGGTTTTCTTTTCCTTGGCGGTGGAAGGT
TGGTGGAAAAGTCATACTTGAGCAATGCTTAAATACAGTTTTAGTATCTT
TGTCGATCTTACCTTGGTTGAAGATAATTCGAAAGTTGCGCGAATCATCT
TATTCAGAAGAAGTATTACAGAATTTGCGCAATCAGTGGATCCTTCTTGG
CACTGTCTCTGAAGTTCGCAGCCAGTTGTAATGCTCATGCATTTAACATG
ATGTACGCTGAATTACTGGAATCTTTGCAAAGTAAATCATTTCTAATGAT
TGGCTGGACACAAGAGTTATGCTATCGTTCAACTTGATCATGTGGGATAC
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GCCAACTCTGTTAAGGTGATTGTATCGGAAGCTACAATGGATTCATTGAA
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CTGCTCCGGCTGCTATTATGGCATTGGCTTTATTGTACCTCAAGACAAAT
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CTTCCGCTCTATCGCTAGGTCTCCTCTTCTTCGGTACGGGAGATCTTCAC
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TCCACAATGGCGTTGCTGCTGGTTTGAAGATTGCTCGAGAAAACTGCAAG
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GAGATCTTTCATCACACTAGAAGCACGAATCAAATTGCAATGTCGCTAGA
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GGCTGGGTTTTGGTTCAACGCGACCATTAAATTTTGAAATCATCAAAGAA
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GAATGTGTCAGACAAGAAAAGCTGGATGTGTTAAATCGATATCTGGCCAT
CGAAAAGCTCGAATGCGTAAAAGCATTTTCATCGGCCACCAATGTTGTTT
TGTTTGAAGAAATGTTTTGTCATTCTAAAGATGGCGATAAGGGTTTTCGA
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CGCTCTGACAGTACCGAAGAAAAACAAGAGACTTTGAATTATCCTGAATC
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CGCGTCAGTTACGTAAGCGAACAAACGACGTATCCTATGGCAACCATATG
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GGAAAAGTCATACTTGAGCAATGCTTAAATACAGTTTTAGTATCTTTGTC
GATCTTACCTTGGTTGAAGATAATTCGAAAGTTGCGCGAATCATCTTATT
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GTCTCTGAAGTTCGCAGCCAGTTGTAATGCTCATGCATTTAACATGATGT
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GTACCCACCTTAGATTGGATGGAAGAAATTGTACCAGGGCATGGTAGCCA
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GGAAGAAATTGTACCAGGGCATGGTAGCCAACTCTGTTAAGGTGATTGTA
TCGGAAGCTACAATGGATTCATTGAAACCGGACCACGTGCTTTATAGGGA
GGGAGATACAGTAAATACTGATGTCACTGCTCCGGCTGCTATTATGGCAT
TGGCTTTATTGTACCTCAAGACAAATAATCTATACCTGGTTATAACGATT
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AAAATCTTGGATTGGGATGTTTTCAACTTGCTGTATAATTACATCAACCG
TGGAAAGAAAAATGAACTGAATCGGTACGAAAAATACGGACGCATATAAA
CTGCTATGTTTGCATTTGGATTCCCTATTCCCGCCTACAGTATTGGAGCT
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ATCGGAAAACCACCTGGTGTAGAGATCGAGTCCTCTAATGATCGTGAAAG
TCATGCATTGTCAGCTGGTTTGGCCCTTGGTATGATCATGATAGGTGGGC
ATGCGTTGACAACTGTTGCTCTACTCATCGGAACAGCTGCAACGAAGTTG
ATTCGACCTGGATTTTACTTAATAAATTGAAATATTCCGAGTTGAATGCG
AGTCACTCAGGATTTCTTTTCGCACTCGGATTGATGGGCCATTTGTCGTC
ACTTCCCAAACTTCACCTCCATGACTATCTTATAAAGCAATAAAACTGTT
CAAATACCACAGTCAGATCTGAACGCGCTTCTATTATGGCCCAACTTCCA
CAATGGCGTTGCTGCTGGTTTGAAGATTGCTCGAGAAAACTGCAAGAGGG
ATGTTAACTTTAGGTACAGCAGAACCAAAATCATCGAAAGCAGTCATTAT
TCCAACTCTTGACCTCAGTGGCAGATCATCTACAAGTGATCATGCATTTG
CCAAAGAAGAAGAATCGAAATTGTTGATACTCAGTAAAAGAACAATGTCG
CTTTCAGTTGCAAGATGTTCGAGATACGGTTCAAAGACGACTTGCGAGTA
CACGAAGTGAAACGTCTCCTAAATTCATCGGTTCCTGTTACTGTTAGCGT
GGAACAAAAACCAGACATGAAGACGAAGATGATAAAGATGGCATGTTAAT
TGATGAACAGGTCGGGAAGATATTGTGTCTTTGAAACAATTGGAATTGAA
GGAGAACACCAACTTGTCTTCCAAACTAAAACCGTCTCACGTTTCACTGC
AGATGACTTGGACAAGCTACCCATAGGCTATCAAATTCCAATCAAAGAGA
TCTTTCATCACACTAGAAGCACGAATCAAATTGCAATGTCGCTAGAAACT
GCCATGTTCCTTGCAAAGAATCATTAGTTGACACCATTATTAATATCATG
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GGGTTTTGGTTCAACGCGACCATTAAATTTTGAAATCATCAAAGAACTGT
CCAATTCTATGTAAACTCCGTTGATCAGTGGTTTGTATATGATGCAATGT
CGAATCCGATGTGAAAACCAATTCCAAAAGATTGAAAATCTTGATCATAC
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CTGCTTTTCTCTTACTATAACAATACTCATCACAAACTATTGAAGATGAA
CTATGTTTCAAAGAAATATGCTGAGCTCTTTTCCAATATACTCTACGAAT
GTGTCAGACAAGAAAAGCTGGATGTGTTAAATCGATATCTGGCCATCGAA
AAGCTCGAATGCGTAAAAGCATTTTCATCGGCCACCAATGTTGTTTTGTT
TGAAGAAATGTTTTGTCATTCTAAAGATGGCGATAAGGGTTTTCGAAATT
TATTGGGAAGGACATTCACAAATCAATCTGAAAAGTCAATTATGGCTGGA
TCAAATACAAAACATATTTGTCAAAAAGAAAGCAGGATATCTATCTTACG
CTGAGGATCCGAAGATAACAACCCTGGGTCCTCGATATTTATCCATCGCT
CTGACAGTACCGAAGAAAAACAAGAGACTTTGAATTATCCTGAATCGAGA
GTGAAGATGTTATCTCCATGTTTCATCCCTGAATCAAAATATATCAAAAA
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CGTCTCTTTGTAACACGGGATGTGGATAACAAGAACATCTGCTACACACC
TATTGAAGTTACTTTAAAAATATACCCTAAAAACAGATGATATTGCGATT
GCTTCATTACTATGTGCTGTTTATCCAAAATGGCCAATTAGTTCTAAAGA
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TCAGTTACGTAAGCGAACAAACGACGTATCCTATGGCAACCATATGGCTA
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CTGAAGTTCGCAGCCAGTTGTAATGCTCATGCATTTAACATGATGTACGC
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CCACCTTAGATTGGATGGAAGAAATTGTACCAGGGCATGGTAGCCAACTC
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CTATCGCTAGGTCTCCTCTTCTTCGGTACGGGAGATCTTCACTTGGTGAA
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AAGAAAAATGAACTGAATCGGTACGAAAAATACGGACGCATATAAACTGC
TATGTTTGCATTTGGATTCCCTATTCCCGCCTACAGTATTGGAGCTCAAA
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CTTCGGTACGGGAGATCTTCACTTGGTGAAAATTCTTCTACGTGAGATCG
GAAAACCACCTGGTGTAGAGATCGAGTCCTCTAATGATCGTGAAAGTCAT
GCATTGTCAGCTGGTTTGGCCCTTGGTATGATCATGATAGGTGGGCATGC
GTTGACAACTGTTGCTCTACTCATCGGAACAGCTGCAACGAAGTTGATTC
GACCTGGATTTTACTTAATAAATTGAAATATTCCGAGTTGAATGCGAGTC
ACTCAGGATTTCTTTTCGCACTCGGATTGATGGGCCATTTGTCGTCACTT
CCCAAACTTCACCTCCATGACTATCTTATAAAGCAATAAAACTGTTCAAA
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GGCGTTGCTGCTGGTTTGAAGATTGCTCGAGAAAACTGCAAGAGGGATGT
TAACTTTAGGTACAGCAGAACCAAAATCATCGAAAGCAGTCATTATTCCA
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AGAAGAAGAATCGAAATTGTTGATACTCAGTAAAAGAACAATGTCGCTTT
CAGTTGCAAGATGTTCGAGATACGGTTCAAAGACGACTTGCGAGTACACG
AAGTGAAACGTCTCCTAAATTCATCGGTTCCTGTTACTGTTAGCGTGGAA
CAAAAACCAGACATGAAGACGAAGATGATAAAGATGGCATGTTAATTGAT
GAACAGGTCGGGAAGATATTGTGTCTTTGAAACAATTGGAATTGAAGGAG
AACACCAACTTGTCTTCCAAACTAAAACCGTCTCACGTTTCACTGCAGAT
GACTTGGACAAGCTACCCATAGGCTATCAAATTCCAATCAAAGAGATCTT
TCATCACACTAGAAGCACGAATCAAATTGCAATGTCGCTAGAAACTGCCA
TGTTCCTTGCAAAGAATCATTAGTTGACACCATTATTAATATCATGCTAA
AAGAAGTTTAAGATATTTGCAACGATTTCAAAATACACTCAAAGTACATC
AAGCTCATCAGACCCCGAAGAGATGCTAGCACAATTGAAATTGGCTGGGT
TTTGGTTCAACGCGACCATTAAATTTTGAAATCATCAAAGAACTGTCCAA
TTCTATGTAAACTCCGTTGATCAGTGGTTTGTATATGATGCAATGTCGAA
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TATTGAAAACAATAGACTATCGGTGTATGATTTCCAACAACTCCGTCTGC
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GTTTCAAAGAAATATGCTGAGCTCTTTTCCAATATACTCTACGAATGTGT
CAGACAAGAAAAGCTGGATGTGTTAAATCGATATCTGGCCATCGAAAAGC
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GGGAAGGACATTCACAAATCAATCTGAAAAGTCAATTATGGCTGGATCAA
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GGATCCGAAGATAACAACCCTGGGTCCTCGATATTTATCCATCGCTCTGA
CAGTACCGAAGAAAAACAAGAGACTTTGAATTATCCTGAATCGAGAGTGA
AGATGTTATCTCCATGTTTCATCCCTGAATCAAAATATATCAAAAAGATT
CCATCTACAAGCGCTACGTCATTTATACGTGTTAGCCTGTGAACCGCGTC
TCTTTGTAACACGGGATGTGGATAACAAGAACATCTGCTACACACCTATT
GAAGTTACTTTAAAAATATACCCTAAAAACAGATGATATTGCGATTGCTT
CATTACTATGTGCTGTTTATCCAAAATGGCCAATTAGTTCTAAAGATAAC
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TTACGTAAGCGAACAAACGACGTATCCTATGGCAACCATATGGCTATTCA
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CATACTTGAGCAATGCTTAAATACAGTTTTAGTATCTTTGTCGATCTTAC
CTTGGTTGAAGATAATTCGAAAGTTGCGCGAATCATCTTATTCAGAAGAA
GTATTACAGAATTTGCGCAATCAGTGGATCCTTCTTGGCACTGTCTCTGA
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GCTTTATAGGGAGGGAGATACAGTAAATACTGATGTCACTGCTCCGGCTG
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GTTATAACGATTCATCTCAAAATCAAGGGAGCTTTCAAATATTCCAAGGG
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CGCTAGGTCTCCTCTTCTTCGGTACGGGAGATCTTCACTTGGTGAAAATT
CTTCTACGTGAGATCGGAAAACCACCTGGTGTAGAGATCGAGTCCTCTAA
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TGATAGGTGGGCATGCGTTGACAACTGTTGCTCTACTCATCGGAACAGCT
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CCATTTGTCGTCACTTCCCAAACTTCACCTCCATGACTATCTTATAAAGC
AATAAAACTGTTCAAATACCACAGTCAGATCTGAACGCGCTTCTATTATG
GCCCAACTTCCACAATGGCGTTGCTGCTGGTTTGAAGATTGCTCGAGAAA
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GACTTGCGAGTACACGAAGTGAAACGTCTCCTAAATTCATCGGTTCCTGT
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ACACTCAAAGTACATCAAGCTCATCAGACCCCGAAGAGATGCTAGCACAA
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TCAAAGAACTGTCCAATTCTATGTAAACTCCGTTGATCAGTGGTTTGTAT
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TCTTGATCATACGAGATATTGAAAACAATAGACTATCGGTGTATGATTTC
CAACAACTCCGTCTGCTTTTCTCTTACTATAACAATACTCATCACAAACT
ATTGAAGATGAACTATGTTTCAAAGAAATATGCTGAGCTCTTTTCCAATA
TACTCTACGAATGTGTCAGACAAGAAAAGCTGGATGTGTTAAATCGATAT
CTGGCCATCGAAAAGCTCGAATGCGTAAAAGCATTTTCATCGGCCACCAA
TGTTGTTTTGTTTGAAGAAATGTTTTGTCATTCTAAAGATGGCGATAAGG
GTTTTCGAAATTTATTGGGAAGGACATTCACAAATCAATCTGAAAAGTCA
ATTATGGCTGGATCAAATACAAAACATATTTGTCAAAAAGAAAGCAGGAT
ATCTATCTTACGCTGAGGATCCGAAGATAACAACCCTGGGTCCTCGATAT
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CCTGAATCGAGAGTGAAGATGTTATCTCCATGTTTCATCCCTGAATCAAA
ATATATCAAAAAGATTCCATCTACAAGCGCTACGTCATTTATACGTGTTA
GCCTGTGAACCGCGTCTCTTTGTAACACGGGATGTGGATAACAAGAACAT
CTGCTACACACCTATTGAAGTTACTTTAAAAATATACCCTAAAAACAGAT
GATATTGCGATTGCTTCATTACTATGTGCTGTTTATCCAAAATGGCCAAT
TAGTTCTAAAGATAACAGTTGATGGCAGGTTCGGGTAATATTACTATATT
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TCTTTGTCGATCTTACCTTGGTTGAAGATAATTCGAAAGTTGCGCGAATC
ATCTTATTCAGAAGAAGTATTACAGAATTTGCGCAATCAGTGGATCCTTC
TTGGCACTGTCTCTGAAGTTCGCAGCCAGTTGTAATGCTCATGCATTTAA
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TGATTGGCTGGACACAAGAGTTATGCTATCGTTCAACTTGATCATGTGGG
ATACACTCGTACCCACCTTAGATTGGATGGAAGAAATTGTACCAGGGCAT
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TGAAACCGGACCACGTGCTTTATAGGGAGGGAGATACAGTAAATACTGAT
GTCACTGCTCCGGCTGCTATTATGGCATTGGCTTTATTGTACCTCAAGAC
AAATAATCTATACCTGGTTATAACGATTCATCTCAAAATCAAGGGAGCTT
TCAAATATTCCAAGGGACAGACAACATGAAAATCTTGGATTGGGATGTTT
TCAACTTGCTGTATAATTACATCAACCGTGGAAAGAAAAATGAACTGAAT
CGGTACGAAAAATACGGACGCATATAAACTGCTATGTTTGCATTTGGATT
CCCTATTCCCGCCTACAGTATTGGAGCTCAAAATCCCACGGATCAGTCAG
ACGGCTTCCGCTCTATCGCTAGGTCTCCTCTTCTTCGGTACGGGAGATCT
TCACTTGGTGAAAATTCTTCTACGTGAGATCGGAAAACCACCTGGTGTAG
AGATCGAGTCCTCTAATGATCGTGAAAGTCATGCATTGTCAGCTGGTTTG
GCCCTTGGTATGATCATGATAGGTGGGCATGCGTTGACAACTGTTGCTCT
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ACGCGCTTCTATTATGGCCCAACTTCCACAATGGCGTTGCTGCTGGTTTG
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AACCAAAATCATCGAAAGCAGTCATTATTCCAACTCTTGACCTCAGTGGC
AGATCATCTACAAGTGATCATGCATTTGCCAAAGAAGAAGAATCGAAATT
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TCCAAAAGATTGAAAATCTTGATCATACGAGATATTGAAAACAATAGACT
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GAGCTCTTTTCCAATATACTCTACGAATGTGTCAGACAAGAAAAGCTGGA
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CCTGGGTCCTCGATATTTATCCATCGCTCTGACAGTACCGAAGAAAAACA
AGAGACTTTGAATTATCCTGAATCGAGAGTGAAGATGTTATCTCCATGTT
TCATCCCTGAATCAAAATATATCAAAAAGATTCCATCTACAAGCGCTACG
TCATTTATACGTGTTAGCCTGTGAACCGCGTCTCTTTGTAACACGGGATG
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ATCCAAAATGGCCAATTAGTTCTAAAGATAACAGTTGATGGCAGGTTCGG
GTAATATTACTATATTAAAGATGGCGCGTCAGTTACGTAAGCGAACAAAC
GACGTATCCTATGGCAACCATATGGCTATTCATATGGCGATCGGTTTTCT
TTTCCTTGGCGGTGGAAGGTTGGTGGAAAAGTCATACTTGAGCAATGCTT
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ATGCTCATGCATTTAACATGATGTACGCTGAATTACTGGAATCTTTGCAA
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This transcript is a part of the following gene feature(s):
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TCONS_00018150-exon-sc0000290-1491911889:250518..250565TCONS_00018150-exon-sc0000290-1491911889:250518..250565Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018150-exon-sc0000290-1491911889:223487..223570TCONS_00018150-exon-sc0000290-1491911889:223487..223570Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018150-exon-sc0000290-1491911889:222851..222940TCONS_00018150-exon-sc0000290-1491911889:222851..222940Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018150-exon-sc0000290-1491911889:222400..222519TCONS_00018150-exon-sc0000290-1491911889:222400..222519Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018150-exon-sc0000290-1491911889:221784..221862TCONS_00018150-exon-sc0000290-1491911889:221784..221862Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00018150-exon-sc0000290-1491911889:220622..220748TCONS_00018150-exon-sc0000290-1491911889:220622..220748Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000290supercontigsc0000290:220622..270068 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.2295 3.05092 2.53216 2.10663 1.50442 0.738198 3.73009 4.31248 3.60352 4.23134 3.34614 3.13193 1.88488 1.63045 2.33964 3.52483 1.92755 3.25334 1.43506 1.24222 3.7475 3.148 5.36657 4.78225 5.20846 5.55002 2.60106 2.11041 3.34816 4.79047
Blast
BLAST of TCONS_00018150 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: APC1 (Anaphase-promoting complex subunit 1 OS=Homo sapiens GN=ANAPC1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 624.78 bits (1610), Expect = 0.000e+0
Identity = 360/927 (38.83%), Postives = 567/927 (61.17%), Query Frame = 1
Query:  100 SLVDTIINIMLKEGFTADDLDKLPIGYQIPIKEIFHHTRSTNQIAMSLETAMFLGREDIVSLKQLE--LKENTNLSSKLKPS--HDEDDKDGML-IDEQMFEIRFKDDLRVHEVKRLLNSSVPVTVSVEQKPDMNDHAFAKEEESKLLILSKRTMSLSVARGMLTLGTAEPKSSKAVIIPTLDLSGRSSTSNKTVQIPQSDLNA---LLLWPNFHNGVAAGLKIARENCKVDSTWILLNKLKYSELNASHSGFLFALGLMGHLSSLPKLHLHDYLIKGHALTTVALLIGTAATKIGTKNTDAYKLLCLHLDSLFPPTVLELKIPRISQTASALSLGLLFFGTGDLHLVKILLREIGKPPGVEIESSNDRESHALSAGLALGMIMIGQGTDNMKILDWDVFNLLYNYINRGKKNELIPGYNDSSQNQGSFQIFEGDTVNTDVTAPAAIMALALLYLKTNNLMVANSVKVIVSEATMDSLKPDHVLYRMLSFNLIMWDTLVPTLDWMEEIVPGYAELLESLQSKSFLMIGWTQEL------YYRICAISGSFLALSLKFAASCNAHAFNMMLPWLKIIRKLRESSYSEEVGGKVILEQCLNTVLVSLSILMAGSGNITILKMARQLRKRT-NDVSYGNHMAIHMAIGFLFLGGGRYTLKTDDIAIASLLCAVYPKWPISSKDNRFHLQALRHLYVLACEPRLFVTRDVDNKNICYTPIEVTLKETLNYPESRVKMLSPCFIPESKYIKKITTLGPRYLSIALTVPKKNNQL--WLDQIQNIFVKKKAGYLSYAEDPKGFRNLLGRTFTNQSE-----KLECVKAFSSATNVVLFEEMFCHSK---DGDKKYAELFSNILYECVRQEKLDVLNRYLAIEKIIRDIENNRLS-VYDFQQLRLLFSYYNNTHHKLLKMNYVSKTPLISGLYM 2802
            SL + ++  M   GFT  DL+ LP G  +PI++  +H R            + +GR+D+ S +  E  L +  ++ S   PS    E++ DGM  ++ ++  + + +DLRV +V+RLL S+ PV V+V Q P+++DH F +E+E++LL L +RTM+L V RGM TL +  P  ++ + IP L+L+GR+   N TV +   +++    +  W +FHNGVAAGLKIA  + ++DS WI+ NK K++EL   ++GFL ALGL GHL+ L  L++HDYL KGH +T++ LL+G +A K+GT +    +LL +H+ +L PPT  EL +P   Q A+ + +GL++ GT   H  ++LL EIG+PPG E+E   DRES++L+AGLALGM+ +G G++ + + D +V   LY Y+  G +     G +       S+QI EGDT+N DVT P A +ALA++YLKTNN  +A+ ++   +   +D +KP+ +L R L+  LI+WD ++P   W++  VP    + E+  S S + +  +++L         +  I+G+ L+L  +FA S N  AFN +  + K       S+ +  V G   LE CL+ VL+SL+++MAGSGN+ +L++ R L  +T  +++YG H+A HMA+G LFLGGGRY+L T + +IA+LLCA+YP +P  S DNR+HLQALRHLYVLA EPRL V  DVD    CY  +EVT K T  Y +++ ++++P  +PE   +K+I   GPRY  + + + K    L   L +   ++VK +AG LSY EDP G+++LL +T  N++      K E + AF+S   ++ F E FC         ++  +LFS++LYECV QE  ++L  Y+A+++ IR +    +S   +  Q++L+  ++++  H+    N+  +     GL+M
Sbjct:  925 SLAERLVVWMTNVGFTLRDLETLPFGIALPIRDAIYHCREQPASDWPEAVCLLIGRQDL-SKQACEGNLPKGKSVLSSDVPSGTETEEEDDGMNDMNHEVMSLIWSEDLRVQDVRRLLQSAHPVRVNVVQYPELSDHEFIEEKENRLLQLCQRTMALPVGRGMFTLFSYHPVPTEPLPIPKLNLTGRAPPRNTTVDLNSGNIDVPPNMTSWASFHNGVAAGLKIAPAS-QIDSAWIVYNKPKHAELANEYAGFLMALGLNGHLTKLATLNIHDYLTKGHEMTSIGLLLGVSAAKLGTMDMSITRLLSIHIPALLPPTSTELDVPHNVQVAAVVGIGLVYQGTAHRHTAEVLLAEIGRPPGPEMEYCTDRESYSLAAGLALGMVCLGHGSNLIGMSDLNVPEQLYQYMVGGHR-RFQTGMHREKHKSPSYQIKEGDTINVDVTCPGATLALAMIYLKTNNRSIADWLRAPDTMYLLDFVKPEFLLLRTLARCLILWDDILPNSKWVDSNVPQI--IRENSISLSEIELPCSEDLNLETLSQAHVYIIAGACLSLGFRFAGSENLSAFNCLHKFAKDFMTYL-SAPNASVTGPHNLETCLSVVLLSLAMVMAGSGNLKVLQLCRFLHMKTGGEMNYGFHLAHHMALGLLFLGGGRYSLSTSNSSIAALLCALYPHFPAHSTDNRYHLQALRHLYVLAAEPRLLVPVDVDTNTPCYALLEVTYKGTQWYEQTKEELMAPTLLPELHLLKQIKVKGPRYWELLIDLSKGTQHLKSILSKDGVLYVKLRAGQLSYKEDPMGWQSLLAQTVANRNSEARAFKPETISAFTSDPALLSFAEYFCKPTVNMGQKQEILDLFSSVLYECVTQETPEMLPAYIAMDQAIRRLGRREMSETSELWQIKLVLEFFSSRSHQERLQNHPKR-----GLFM 1840          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00018150 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
APC10.000e+038.83Anaphase-promoting complex subunit 1 OS=Homo sapie... [more]
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