TCONS_00018827 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00018827
Unique Name	TCONS_00018827
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	13215

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000309:323600..355880+

transcript sequence

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CACCCTTGTCTCGGTATTGATGATTCAGATGGTAAGACTGTTGTGGCAAA
CGAGAAATGCAAAGACATGTTTTACTTCGATAACGCAGGTCACATGATAC
ATCTTAATAGCGGGCGGTGTATCAAGAAGGATGGGGCGGGAGGATTGGTA
GCGGATACTGATTCTTGCGATCAGAAATTCACGGGGGATGGAAAAGGTGA
AATTGAGACTTCTTACCCAGACTCCAAATGCATCACTGCCACTAATCATG
CACCAGTAGTGGTTTCTGGCGCCGCTTGTTCCACTTCAACCACTCAATAT
GAATTTTTAGTTTATAAAGACAAAGAATATGACtataaagAGTTCGAaca
gcgattttacaaattgcCGGCTCAAAATCTCAAATACAAAGACGCGAAAG
AAGAATGCAAGAAGTACGGGCTGGAGTTACCAATGTTGAAAACGCAATAC
GAACTGGACATGTGGAAAAAACTGGTCAGCGACCATTCCTTACAAACCTC
TTATAACATGGGAACGCACAGAAAAGATTTTGTTGATCAATATGTTTGGG
ATGACGGTACGCCCAATGACATGGCTCCCACTTCAGGAAGTACTAGATGT
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GTGACATCATTTCATCAAACTTTCACCGCCAACGAAGACTTTCTTTCGGC
TCGAATGGTTTCAACATTGCAATGACCAATACGTCAGAATTCCACGCTTT
ATTCCAAGTCAACGTGGCTGGAAAGTACGGTCGCCTAACGCTGAACATTT
CCAACCGTCTGATATGGAACCATctaggttttgtttttaacaaGAAGGAA
AATGCCATACTAGCGCACGCAAATGGCAAAATAGCAGGAAAATCGTACTT
GGCAGAAGCCCTCCTCCCTCGACCACGAAATTACAAATACAATCGAATCC
TTTTGTTCGGTCAGTTGCAGTACATAAAAAGTTCTCTCAATCAACATTCG
ATGTCAGAGTTGCGGATGTGGAGATACCCTTTGCACGGTGATGTCTTCCA
GCGCATGACGACCTCAGTTACGTACGACTTTTCGGAACTTCATTGGACCG
CTATGGAGACTTTCAAATACAACTTCAGTAGCGTTTGTTCAGATCCCCAA
CAACTGACTGGTCCATGTAATGACATCTCTACCATCAACCTTCAACGTGA
TTTACATGCATCCACAATTGGAGTTGTTCCACGATGTGAGTGGTGGTCTG
GTCGAGGTGAAGACATCATTGTTGATCATGGTAAATCTTTATCCAAGGAA
GAATGTCTTCAAACGTGTTATGATGTCACAAGTAATTACTCACAAGCATC
CTCTAAAGTCAACGGGGTATCTTTTGGCGTAACACCTACCAGACAAAGTA
CCTATGGGAAATGCTTGTGTATTTTTTCACACGGGGCGTTGGTAAATACG
ACGAATGATGACGCGTCTTACAAAACATGTGTATTTCCTCTACCAGTTTA
TTATGGGTTGGTTACCAATGGTGGTACTGTATTACAAATTGCTTTCACCC
CGAACAGAGAGTGGATATATGCTATCGGTTTGAACTTCAAGCTGCATTAT
CTGAATACGGTGACTTCCGTTTGGGAATCAAAACCCTATGATTGTCAGCA
GGTGGAAGTCGATCCCTCTTACAAGAAATGGTTTCGTCACAACAACATTA
TCAAAGACGAGTCAGGCCTAGAATATTCGAGTGCCGATTGTGATTCTTTC
GTTGTGGACGACCAGTTTTTAGGGTGTCGTAAAACAAGCAAAGAAGTATA
CATAAGAAGCAAGGTGTTCGAAAAATCAAACTGGACACTTTTAACTGATG
GAGCAACTCAGGTGCGAGTAGCAGTAGACGGTCGATGGTACATTTACGAT
GATAGCACTAAGGACATTGCGGAAGTGAAGAGGGCGACGGGTGAGAAACA
GATCGTGGCCAACGCCCTTGCTGGAGGTTTCATAACCTTTTTTCAATCAT
TTGATGTGACGCCCAGCCAAAAAGTCGTCATAGCAACCAATATGGGTGTA
TTTCTTTACATTGGAAATAACGGATGGGTGGAAATTAATAATGATAAAGA
CACCTATTACGTCCGTGCTATTGATGATTATTATGCTTACGTCTTGGAAG
ATGGCGTTCCACGCCCAAAGCAAATACCCCTCGGAAGAAtACAACTACCT
GGCTACAGTTTGATCCCGCAGATTGAAGCGAATTACGAACTTGCGAGAGA
AAGTTGCCAAGACCAGGGTGGTGACGTCATATCCAATTTCAACACCACAC
AAGATTTTGCTGCCGCTTACCACATGGTTGACAAAGCTGGCCAAGCATTT
TTTTGGTTCGGTGCCAAAGATCCAAACACAGATTCGGATCGGAAATTTTA
CCAACTAAATGGTAACATGCTTATACACGCTCCTTGGGGCGTTCCCGTAG
AGCTGGCTAATCCAGCTGAGCAATGCGTCATTTACAAGAAAGAATACTTT
GGTGATGCTCCTTGTGAATTTACTGCTGGTACTGGAGCTTCAAGCCAATG
TCAGGtgCCTGTAATTCCTTGGCTACGCACTGAACTTCCTGTGGAAGTTT
CTTTAGTGAAGACGCCCACTTCTTGTCAAACAGTTAACGATGGGATTGTC
GAGATACCCAAGGTGGACGGTACCAATGGAAACTCCGCCACTTTCATTTT
CTCCAGGACCAACATCACTCAAGATATGACCATCAAAAATGCTTTCCTTA
AATTCTATCCGTCAGAAGATTCTGACGTCAATAGTGATGTCATTTCGTAT
CTGATTGGTCTATTATACAGACCTTACGATTCGATCGATTGTAATGACTT
GGATGATATATCAAATCAAGAACTTATAATACCAATCCTGTGGAATGTGT
CTGCTGAATGGCGTACGACCAAACCAGTCGTTTCTCCAGACATCTCCAAA
CTGATCAATTTTCTTGTTCGAAAGAAAACATGGAATAGTGAATCGACTTT
CCAGATTCTTTTGACTCCTTTATCAACCAGTATCCAATCCACCAGAAAGA
TACTGATCAATCAAACAGAATTGGTCCTGAATTACGAGAACAACTTCCCT
AACCGTTACATGCTGAAGAAGTCCATCTTCTCACCAGTACCATCCATCGA
TACTATCATCATTGGACCCTTCCACCCAAACATCCAAACTGTCTCCTTTT
GGATACACATGAAAGGTCCACATTGTGGGAATTTGTTTGTGTGGACAAAC
GGGAACTTGATGATGCAGCTCAGTGAGGAGCTTGCAGATGATTGGAAACA
TTTGTGGATAGATGTGCGTGGCAATAATGGCGAGCCTACCGAAATAATGT
TCGTGTCTATCAATAACCAGGGATCAAAAGGCCATTTTGCATTCGACCAC
TTCGTCGGATATCCGCACGCTGATTTGGCGGTTCACGGTGACGAAGTTGC
TACGTACGATTCTAAAAACAAAACTTTTTACATTGGACTGCTAGAAGAAT
TTGGGATCCCCATCCCGAAAGTGATGTACCCTTTTCAAAAGGACGCTGGT
GATCAGGACTTCGGTTTGTTCGGGTTGAATCTAGCTTGGCATAAAGCAAG
ACTCATCAATGAAGAGAAGTACTACGGAACggataaatacgattttttGA
GGCATATGTTCTATTATGGCGCGCAAACAGAAAGAGGGAAGCAACCGTGG
GCGTATATTTATAATGAAGATATGACGCCTTTTACGAGTTTGGTAGATAC
CTCATCTTCATTTACGTTTGTCACTCATTTGAAGTACGATGATTTGCAGT
TGGGTTATGTACAAGATAAGATGCAATACGTCCGCGCCAATGGCACTATC
TTCATGTTCCAAAATGAGAAAACTAAATTAACAGTTCGAGATTACCCAGA
AGGCATAGCTGTGAGAGTACATAATTCGAGCGGTCATCCAGTGGTTGAAA
GGTTCATACCCATTCGCAAACACCACGTCTACTTTGCCATCTCTTACCAA
AACGGATATGGTTCTGTTTATCTTGATGATGAGTTACGTACCACGTTCCA
AGTAGACCACGCTATATTGACGCCTTTCCCAAAGAAAttgatcttcttct
ttgatCCGGACGATGAATTTGAACTACCGATTACTGCTACCAAGGCAGAC
TCAGAAAAACAGCAACAAACGATTCGAAACGTCCGTTTTCGTGGTTCTAT
CTCCTGTTTTCAAGCTTTCGATCAAGCTTTAACTTTGCAACAGATTAAGC
AAGTTGAATTTTGTCCAAACAGACAAGGTCGTATCTATCATCGGAAGAGT
TGTGAAGACGGtggagaaaaaattatttttaatgccAATTGTGTTTGCCA
AGACTATAATAACCGATACATTACCAGGACTTGTCGATCAGCATTAAAAG
ATACTGTTTATGAAAACGCTTTGGAATATCTACCTTTCGATATACCGAAC
AAAATTAAAGGTGTGAAAAATGTCATGGACCTTACAACCACTAACCCTCA
AGTGCAATTCACTTCCGGTCCGGTCAATACTGGAATCTGCGTCAACGGTG
ATGTGGCTGTCCAAATTGGCACGATGTCCAGCAGTTGTTTGGAGACATTG
ACAGGGACTTGCGATTCTGGTTATGCAATTGCTGTATGGTTGTTCGTTGG
TGAACACTATTTTGATGAAACGATCGAAGTTTTTAGATTCAACGAGTTTT
CTGTGGAAGTCGTTTTTGAATCAGACGAaagcaaaataaatcaaaccTTC
AATTTCAAGATGGCAGGATGTGGTACATTATCAAAAGTCATCGGCATCCG
GACCGTGCACCAATATACTGTCATCATCGCCTCTGCTAAAGCAAACTACC
AACTCTACATTGATGCTGAATATATTGGTGAAGAGAGTTGTACGGGTAGT
GGACCATGGCCTGCGACGCAAACTTTGACGGTCGGTGGTGCCAGTCGAGT
GTGCATTGATGATTTTGCGATCTCTACTTCAGCCACAATGAACTTCCCTG
AAAACTTTTACACATCGCTCGTCAAAGGTACGTTTAGTTCCGATCCACAA
GTGCTTGGGTTGAAGACACAGATCAGTATTCCAGAGATATTGGTGACAGG
ACCGACGTCAGATGATTATTTAGAAATGTTTCAAGACACATCATCAGAAT
CATCACAAATCCTCATCGAAACTATCAACGAAATTATAATGCAAAAAATC
TCATATTTACTTCCGAACTTTTATTCCGTCCAAGTCAACAAGCTGAGTTA
CGGGCGTGAAAATATGGTGAGGGCGGAAAATGTCTTGATCAACTTTCAAA
CGTTATCATTGGCTGAGCTACAAGTTTTCGAAGATTGTCCAATCAAACTT
ACTTACAACGGGAAGGACTTAGAGATTAATTGTGATGGAATGAAACCCGT
CTACGGGCTGAGTCAAATCGAAGTTGAGGGCGTTGGCGTCACACAATACA
AGGCGGAAGTAAGGGTGGTCAACCGCCTCCCAATCCACGACAGCTACCAT
CTTGGCTTTAAAATTCGTTTGGAAGCCATCACAGAGTACGGCAATGGAAC
GGTTCAGGAGGAAACCCATTACACGGGTGTGGGAACGTTTCCTTTTGATG
TGGAGTTAGGGAAGCGATACAACGCAACAGTTTGGGCGATCACACACGAA
GGCGTAGGCGTGGGGACGACACATGAATTCATATCACTGGGTGACTATCC
ACATTACCCACCCAACGCCACAGCGTACAACACCTCACTGACCAGCCTCA
ATGTCAGCATCGATAACTTCCCAGAAGATTTATGGAATGACATCGAAATC
TGGTACCTATTGTATTACAAAGAGTTTGACAATGATCCGGAAAAAGATAA
TAATATTACCGCATACACTGAAGTCCGTATTGATCGTGACCCGAACAGAG
AGATGAATCATACTTATGCGATTGAAGGATTGGCAATATTCACCAATTAC
TCCATCTTGGTGAGAGTTGCCAACGTTAATGGTGAAGGGCCTCTCTTCAA
TTTGTCATGCTACACCAAGGAGAGCACACCTGAAGCACCGCCAGAATTGG
CCGCCCTTACGCCCGTTGACAACCGCCTTGAGATTAAATGGAATTATACA
GACGACATCCACATATGGAATGATTTCACACTTGAGAAATTTGGAATCAC
TCTGACGTCTGTTTTCCCTCAGAACACGAAGATTGATGGCCCTTTCACCT
ACTTTGTATCACCTGACACGTTCACGCAACTGTCAGATGAGCTGGATTAC
TTTAGAGTATACAGAATCACGTTAACCACACACACCAAGAGTGGCCCCGG
TCCAACTGTTGATTTTTGTCAAGTTACTAATTCTTATTATCCACAAGGTC
GTCCACAAACAGTCGACATTCTTGGAGTCGATCGAACCTCCATGAATTTT
TCGATCGGTCAAGTTGACGTGACCGAAGAAGGAGGGGTTATTATGAATTA
CACCATAACCTACACATCTGTTGATTGGCCAGATACTCTACACACAATCG
TTACTGACAGCATCATCCACAGTGAAGCTAATTGGAACATTTGGAACAGC
TATTCATCCTTCCCACCCACAGGGTGCGCTGATCTCCCTCCATCGTCGGT
TCTCATGGGTTACAACCTACAAGACCTCACTCCAAATACTAACTACTCGT
TCAGTGTGATCGCTTGCAACCAATACGGTTGTGGACAAACAGATAACGTC
ACCACTGTTGTTTACGGGCAAACATTACCTGATATTCCATCTTGTTTCCC
AAACATCACGCTAGTCGCCAACACTTCTTCGGAAAGCATCAGAGTGGAAT
GGTCGCATTTGACTCATTTTTGTGGATATGGGAATCTGGTGCAGTATCAT
ATCGGGGTTTTGGATGATGACCTTTATCAAGAATGGATTCAGAATAAATC
TATGATCGACTTGGATTTAGCTCCAACAGTGACACAAACAACTGAAAACT
TTACCGAATTTGATGGTTTGAAAAATTACTGGAAATATTCTGTGTTTGTG
ATATATGAAAATGTAGTCGGGAAAGGACCAATATCGGATTTGTTCTCGAC
TTTTACGGCGGAAGATGtaccCACATCTGCACCATTTCTGGTCACCTCAG
AAGCATTCAACTCCTCGGCTCTCTCCATTAACATAACTATTCCAATCCGA
GAAAACCGAAACGGAATCATTATCGGTTATCAAGTAACCCTAGTCAACGA
AATCgaggaaactttcaaaaagaattACTCGGTAGCTCATTTGATTCAAT
GGAACAACACTGAACCATCTGGTGACGATATATTGACCAGTGTTTTGTTT
GGTGATTTGAAAGCGTATTTCAACCACACAGTGACTGTCCAAGCCTTCAC
CAAAGTTGGATTGGGACCTTCTTCTGAACCGTTCATCTCGCGAACTGGTC
AAAGTgTACCAACCGCACCGCCTTCCAACATCAGTTACAGTCACGTGACT
CCGAACAGCTCAGTGATTGGTTGGATGCATATTCCGTATTTGAACCGGCA
TGGTGTTCCTTCAAGTTTCATTCTCAATGCATCGGGTATCCTTGCCAATG
GAACTCTCGATTCCCTGGGTCCTTTCAATGTTTCTGCTCATCCTGATACT
CCGGAGTTTGATTTCATGATTGAGAACCTGTTTCCAAAGACTATTTATAA
CGTTACGCTGATCGGTTGCACGCGTATTGGTTGCGGCCCGCCAACTGGAA
TAACTTTTGAAACGCTTGAGATGGCGCCTTCTTCGTTCCCTCTTCAAATC
ACCAATGTCAACAACACGGAAATGGAGAAACTTCTCGTCCAATGGTCCGA
TATTTTATCCATGGACAAACGTGGTATTATCACTCATTACTACATTCAAT
TTACCAAAATCAACCACACATGGGATACCGTGGACTCACTACCTAAACTT
CAAATTGTTAGATTATCTTCAAATGACAATGATAGCATGACCACATACGA
TAGAACAGAGATAGTTCCACTTGAAGGTCATTTTATCCTTGACGAAGAAC
TTTTTTATTCGACCTGGTTAACCGGTCTGGGAGATTTGGAGAATTACACA
GATTACAAGATAAGCATCGCCGGAAAAACATCTGCTGGTGTTGGACCGTA
CAGCCCTGAATTTGTCTTCAGAACAGTGGAAAATGTGCCAAGTTTCTATC
CGGTCATCAACAGCACTGGGGAAGTTTCAGCTTTCGAGGTCTTCGTCAGA
TTTCCGAACCTAACTCGACCATACCACCAGGGTGTGTTGTTAGGGTATAA
AGTGTATTACCAAGAGATTGATTTGATCCAAGATTGTATCGACGGAGGGT
ACCATTTCACAACTAATTGTTCGCTGAGGATGTCATCGATCAACAAAACC
ATCATTGAGCTGGAGACACCAGAGATTGATCTCTTTGCACCTCCACCCAT
CCCTGGTGAAGAGGATGAGATTGATGAGAACATCTACgaaatgattttgt
ttgatCTGTTACCAGGAGTCAACTACACTGTCtgtttgactgcttttacg
gtGGCAGGAGTTGGTCCTGAATATTGCACATGGGCACGGACGGAAGATGC
TATACATGGCAATTGGACGGATTGGACGGACTGGGGCAATTGTGATCAGA
CGTGTGGTCAAGGTATTCAGATGAGATACAGGTGGTGTATCAACCCTGTA
CCAGACAACGGAGGTGATTATTGTGTTGGTGATGGCAATGAAACGAGATG
GTGCAATGAAATCCCTTGTGACGGATATTATCTCGCCAACTCTTATACAA
ACTGCAACCAAACATGCTCTAGTGTGTCAGAAGACTTTTTGTGTATCCCT
ACTTTCACCCCATTTACACGAGATCTTCACAATTTCCCTCGTGATCCGAA
CCATTACAACAGGACAATCGAGGTGACATGTGAACCGACCCATAACAATC
ACAGTCAATCGATCCACCCTTCCTTTGATATGACGGATAAATCATGCCAG
GGTTTCGAGCATCCTCCAAAGATGATTGATTGTGCTTCAAAACCAGATTC
GCCAACTGATCGAAGGTTGTGTTATTGTGGCGATGAAGACGTAATGAACT
TCTTGGAATGGGGTTTGTGGTCACCGTGCACAAAGTCATGTGCAATTGGA
ACACGCAAAAGAAGTCGTGAGTGTGCTGTAGACGATGAAGCCAGGTTTTG
TCCGGAAGAAAAAATGTCCGATACTCAAGATTGTAACGCATTCCCTTGCC
CAAtcaatggTCAATGGGGAAACTGGACCGACTTTGGGGCGTGCACAGTG
GCGTGTGGTTTTGGGCGTCGCTACCGCCAACGTGAATGCAACAATCCGAA
GCCAGCGTTAGGTGGTGAAGATTGTCCTTTTGGTGTGGTTGTTGATTTCT
TGGAAGGATGCAATGCTTACCCTTGTCCCATTCATGGCGGTTGGGGTGCG
TGGTATGAGATTGAAGAGTGTACACAACCATGTGGTTTGGGAGGTGTCGA
GAGACAGCGTCGTTATTGCAATTCTCCACTACCACAATATGACGGACGGC
CCTGTAACGGTCCTAGTGAACGCTTCTACAAATGCAACGAACATATTGTC
TGTGAAAacGAACTGGCGATCACCTATAAACTTCGTTTCATCAACGAAAC
ATGGGATTACCGGCTAGTGTATGACAACACCAATGAATTCCGTGACTTCT
CAACACGACTCACCGATAATATAAATCTGCTGCATTCTAACAATTCGGAC
AAAATCAAGGATACCATATTGGATGTGACCTGTAATAAATTGGAACGTGG
CAGTGTTATAGCAAACTTTACAATCCGTTATTGGGAGATCAGTTCGGCAC
AAATCGTTCTAATGCAACACGCGATCGAAGAGGACAAATTCATCAACGAT
ATGcctcttcaaaaaatcaatatctcttCTGACCAAGtCCCAAGCATGTT
ATTACACGCGACAGCCCAGTCCTACTCTCCCTTCTCCATCAATGTCACGT
GGAGCGATCTGAATGTCAACACGAGCGAATTGTATCTCTATTATATCTTC
TGGCGCCAACTGGCCGTTGAACCAGCCACATGGAGCGTCAAAGGTTTCAA
TAATACAGGACCGAACCAATTGATCGATTTATTGCCGGCCACGTGGTATG
GGATCCGCATTTCGGCTTCCTTTCAATCTGGAAATGGAATCGCAACTGAA
GAAATAAAAGTCATCACCCTTGAAGGAGCTCCGTACATTGGTCCTCCGAA
TATGACGGCTGATATCAACGGTCAGACCTCTGTATTCATCAGCTGGTTAC
CAATCTCCTCATCCCAGGTCCCCGGGAACCTTCTCGGCTACCGGTTACGT
TACAAGCTGTATCACGATTCACGAAACCAATCACAAGTCATTACTTTAGA
TGCGTTCACTCACAATCGAATGTTGACGGGCTTGAAAGCATTCTCTTACT
ATTGGATCGAGGTTGTCGGCTTCACCAACGCTGGCGAAGGACCACATTCA
CTGGTTGTCATCAAAACACCTCCAGGACCTCCTGATATCGCACCACCGAA
TGCCACTATGTCAGATAAATACCACATCAACGAGATCAAAGTTCAATGGG
ATGCTATTCCAAGAGAATTTGAGAACGGTCGAATTTCTGGATACAAAGTG
ACTTGGGAATTGCATCAGAAATTCGGACGAGATGTTCCCGTTAATGAAGA
AACTGTACCCGAGGAAGCTTTCGACCGATTCACGTTAGGTTACACTATCA
AAGGTCTTCACGCCAACTCTATTTACAAAGTCTCTTTGTTCGGTTATTCA
CCTCAAGGTGATGGCCCAAAACATGTGGAATATGTTTccacGTGTAAATG
CCCACCCATTATTTACAACAATTTCTTCAACTCTCAACCTTACATTGATT
ACAACAAAAAATTGATCGAGATGGCTGGATTGTTTCCGCATCTTTTGCAG
ATGATCATAACCAACGTCTGTACTGGTACTTGCAACTCCTACAACCATTC
CGTTATTTACTATGACCGCACTTCATCCGGTGATCCATCTTCAAAGAAAA
ACGAAGtcggtgtccggaaaaaaatcGGACAGTCAGCTCATATGAATTTC
CCGATTCAAGGGCTTGTTTCTATGAAAAAGTTCCAAGGCGACCATCCTTT
CGTTAGCTTGGTACCTTTCCAAGGGACAGCTTTCGTTGTGTTTCACGAAG
CTGTCAAATCGGTCGGCTTCATCGGTCTCTTTAAAGCTGTCTTCAACGCT
TGGGCAGTTGTGGTGATCTCGTGTTTAATGGCTTGGCTTTGTGGTTGTGT
TTATTGGTTCACCGAACAAACTTCCGAAACAAGTGAGATCAACCTTCAAA
GTGCGCTGATTGGCCAAATTCAAGGATTCTGGATCAGCTTTATTACTATG
ACAACTGTTGGaTACGGTGATATCAACCCTTCGACCTTCCCTTCCAAAGT
TCTTATGATTCTCTGGGCGCTAATTGGTTTGGTGGTGTTTGGGTTGACCA
TGGGTGTGATTGGATCAGGTTTGGTCGTCAACACACAACCTGCAACACTT
AAGATATATGGCACTCCGACTGCTGTGATTGAGGGGACATTTGAGAATCG
GTTGGCCATTTACCGCAACGCCGACTTGACGCACAACAAAACCTATGAAG
ACGTCCTCTCTGTGTTACGAGACGTTGCTGACAAGAAAATCGAACTTGCT
CTCATTGATGCAAACTCTCTCGCAGGCTACGAAAACGAAATGAAGAGACT
TAGTTTGGCTATTGGCAAAATTTACGTAACCGAGAGTTGTTTCGGGGTGG
TTTTGACAGATGGCTTCGAAGCGATGGAAGATGACGTTCGTAGCTTTGTT
ATGTCACAGTCAGCCGAAATTAGTGCGTTCATTTCAAGCAAAGTTGCACA
ATTAGAGccATACAGCTTGGAGGTGGAGGAGAAAATTCTCACCGACGAAG
AGTTTAACAGTTTATTCGTTAATTGTGGTATTCTATTGATTGTGCTCTCC
TTCTTTGGGATGCTTCATACTTTACGTCTGCATCTCAAAAGCAAATCGGA
AGTTCACCCTGAAGatCACGAAGATTCAGAATTTATTCTAAGTGAGATTG
AATCATTGGTCGATGACTTTAACGAATCATTTGAATCAAAAGTCGAGGGC
CTGGAGAACCGGCACACAACAGAACTTCAACATCTGGCATCACTTCATCA
GAACTATAAAAGACTTTTATTgagaaaaggttttgaaaaggGAAAAGTTG
TTCATGCTCTTGAGAACACCCACCAAAAAGCAGCTCATAAAATTGTCAAG
gtcaaaacgaaagaaaaatacGAGCGGATCCTGAAAAAACAGGAATATTT
CAACATGAAAGAGCAAGAGGAAAAATGAAAGgtaaaacagaaagaaaaat
aattttttagaagatttttaaagcattttgcattttttatacATACGAat
cttatttataaaaactcatttacaaaaatttaatttatatgTGACTAAAA
TATATGTAGAATATTATATTCGATTTTTGTTGAGTTAAATCACATCATAT
CTCAACAGGTTCATCTACCATCGCTTGGTAAGCGCCTTTCTTCCATATGG
CTTGAAAGTTCGATTTTAAAAGTGATGTCATTTGAAATTGAACAGAAAAG
TATAATTATATTGTTCTAGTTTGCTTTTTTCAGCAAATGTTTCTAAATAA
AGGACAGGGCAATATCAGTTTGCCAACATGACTTGCTTTTACATCACAAT
CGACTCGAGGAGGAGATTAATCATTATCATtctaattttattattttcgt
cATTGGTTAAAATATTTTGTGAGCAAGATAAATTATGATCCGTCGTATCT
TCTCTGTATAGAGGACAATGCTTTCGACTCCCATGCAACAGTTCTACTTT
TATGGTCTACCACCGCCAACTTTTACAGTTCCACTCCTCTTTCCTCTTGT
TTTACCTTCAATCTTTGACGATGTTGAACTCGATGACTGTTTGAACCTTA
TCACCGAGCGGTGAAGAGGGCGGAGAAGCAGGCTCGGGCGTTATGGGTGA
ATTATTTTCTTCATCGTCACTTGAAGCCCCTATGTAAATACCAGAGTCTA
ATTTCCTTAAGTTCTGTTTCTCTGTATTTATTGTTAAGGGAGATAAAGGA
TTTGAAGGTGATTCA

transcript from alignment at sc0000309:323600..355880+

Legend: exon

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cagcGAAGAGCGTTCCAGGATCTTACATCATGATTTTGGATGATGATAAA
CACCCTTGTCTCGGTATTGATGATTCAGATGGTAAGACTGTTGTGGCAAA
CGAGAAATGCAAAGACATGTTTTACTTCGATAACGCAGGTCACATGATAC
ATCTTAATAGCGGGCGGTGTATCAAGAAGGATGGGGCGGGAGGATTGGTA
GCGGATACTGATTCTTGCGATCAGAAATTCACGGGGGATGGAAAAGGTGA
AATTGAGACTTCTTACCCAGACTCCAAATGCATCACTGCCACTAATCATG
CACCAGTAGTGGTTTCTGGCGCCGCTTGTTCCACTTCAACCACTCAATAT
GAATTTTTAGTTTATAAAGACAAAGAATATGACtataaaggttggttttt
caaaatgCTTTTCTATTATTTCAATATCGAAATCTATTTTCTATCCTCTG
ATGCAACAGCTTCACTCTACCATTTTTCGCACGAAAAATTAATTTGTTAC
TTTTGTAGGTTTGTAGTATGCAAGCTTGTCCGGAATGGATTCTGGACGCC
CCGGAGGGGGAgttgattaaaaatattttctttagcGAGAGGCGTGCATT
TgaagggggtgtttaaaagAGGAGGGCATTTATTCGAATTAAAACGGTAT
TTAATTTTCCCCATCTATTTGCAAGAACATTAGCATACTTTTACATGGTC
TTTCTTCCCCTTTATTTTCAGAGTTCGAacagcgattttacaaattgcCG
GCTCAAAATCTCAAATACAAAGACGCGAAAGAAGAATGCAAGAAGTACGG
GCTGGAGTTACCAATGTTGAAAACGCAATACGAACTGGACATGTGGAAAA
AACTGGTCAGCGACCATTCCTTACAAACCTCTTATAACATGGGAACGCAC
AGAAAAGATTTTGTTGATCAATATGTTTGGGATGACGGTACGCCCAATGA
CATGGCTCCCACTTCAGGAAGTACTAGATGTCAGAAAGTTCTTTCAGGTG
CATCTTTGGCCGATAAGAATTGTGGAAGCGCTGAAACAAACATCATCTGC
CAAGGTTTGCCGTTACTGATGAATCTAGTGATTTCTTTGCTCACTCTATA
AGATTTAAATTGAAATAGAACCAAAATTCgatcaaaatctttcaatcacT
TTTTTGGTTTTAGCAGCTAggttttagaaattttataaaattaatATAAA
ACAATATACACAGTGTTCTATTAAAGTAGAATCTAAACAGCAATTATTCT
TTGTGCTTCCTTGCAGTACCTGGACGTCGCTTCATGAACTATAGTGACAT
CATTTCATCAAACTTTCACCGCCAACGAAGACTTTCTTTCGGCTCGAATG
GTTTCAACATTGCAATGACCAATACGTCAGAATTCCACGCTTTATTCCAA
GTCAACGTGGCTGGAAAGTACGGTCGCCTAACGCTGAACATTTCCAACCG
TCTGATATGGAACCATctaggttttgtttttaacaaGAAGGAAAATGCCA
TACTAGCGCACGCAAATGGCAAAATAGCAGGAAAATCGTACTTGGCAGAA
GCCCTCCTCCCTCGACCACGAAATTACAAATACAATCGAATCCTTTTGTT
CGGTCAGTTGCAGTACATAAAAAGTTCTCTCAATCAACATTCGATGTCAG
AGTTGCGGATGTGGAGATACCCTTTGCACGGTGATGTCTTCCAGCGCATG
ACGACCTCAGgtaatagcttcttttaatagTTTTGActcttcattgaaaa
tgaatatgtaaaataaagaagaaactaCGTTTGATTCTAGAAACCTTCAT
TTTTGATGAGAGGTGCACTAAAGTTTCTTGATTTCAACTAACTATTTTTC
TAAGAGAATTCTTGCAATGACTTTGGtctttttctttgtctttctttttc
ttttgtcttttgtcttttgtcttttgtctttGGTCATCGACTTGCATTTC
TTTGCTGTTTTACCTTTTCGACAGTTCACCTTTTCGAGGAACTAACTTTC
GGTGTTATCAGAGTTATAAAAAAAATAGCTTCAAAGTATCCCTATACCAC
AAGTCAGTAGCaccaaaggttaaaaaatcacttttatatAATTAATTTTC
CAtctttaatttcgaaaaaaaatggaaTTATTTTTTCTCTTCAATTTCAA
TTGTCTTTTCGCCGGTATAGTTTGTTAAGATTGAATCATTCGTTGATAAA
TACAGCTTTCGAGCGCCTTTTAGACTTTCCAAGGTGGATACTCTGATCGT
TCATTTGGGAATACAGGACCCAcgccatgaaattgaaattgaaattgagg
GGGTCAATGAATATATAGTCTACCtgccggttttctggaaaactGTATGA
CcataaactaaaaattttatgGTCAAGGAAGAAACAAATCGAAGAATTAT
CCGAATAATATCGACTGCGTCAATATCGAATCGAGCCCAATTGTATTTTG
GTGCTTAACGACTTTCCCATATCGAAACACGTTGATTTCAAAAGGTAAAT
TAATTGGCGCAAAAAATCGTGACCACATATATATTATGCACTATAGAAAT
TCTGGGTATAAAATGGTTTTtaaacttcatttttcttatacaGTTACGTA
CGACTTTTCGGAACTTCATTGGACCGCTATGGAGACTTTCAAATACAACT
TCAGTAGCGTTTGTTCAGATCCCCAACAACTGACTGGTCCATGTAATGAC
ATCTCTACCATCAACCTTCAACGTGATTTACGTAAGTCCTTTGAACAAGT
TTCAGAAAAGTATTtcttaaacattttttaattgatGAAGTGATTAGTTT
TATCGCAATTCCCTAATATgactgttttaaaattttgtgtaGATGCATCC
GCAATTGGAGTTGTTCCACGATGTGAGTGGTGGTCTGGTCGAGGTGAAGA
CATCATTGTTGATCATGGTAAATCTTTATCCAAGGAAGAATGTCTTCAAA
CGTGTTATGATGTCACAAGTAATTACTCACAAGCATCCTCTAAAGTCAAC
GGGGTATCTTTTGGCGTAACACCTACCAGACAAAGTACCTATGGGAAATG
CTTGTGTATTTTTTCACACGGGGCGTTGGTAAATACGACGAATGATGACG
CGTCTTACAAAACATGTGTATTTCCTCTACCAGGTAATTTTATTGATTAC
GTATAAAATTCTCTTTTCTCGAACCAATGTATACTAAAAGTACTATTTGT
AAGATTGAAATATATAGtagaatttgaaataaaaaaaagttcacaAATTT
GTCATTCTAAAAAGAGATCTTTTTTTTCCTTAACTTGACCTGGCAAATTT
ATCAAATTCAAATACTAAATTCTTCTCTTGTCTAGTTTATTATGGGTTGG
TTACCAATGGTGGTACTGTATTACAAATTGCTTTCACCCCGAACAGAGAG
TGGATATATGCTATCGGTTTGAACTTCAAGCTGCATTATCTGAATACGGT
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agggctcatatcattTTATTATCCGTATTGCccctagcctatactagacg
tcaccctcgttttttctacgcaattaacgtctattcctctttgcgacttt
ttcgaatgttttgagccccggttttcgggctctaaacattcgattttttt
acgtcacttttaactttcgaagctccaaCAGTAGCAAacaaatcgaattt
gcgtcaaagcactcgaaaggcttctattttttgaaaatcgtcaaagtgga
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GCGTAAGAAGCAATAgaataaagaaattcaatttccttttttcgtttttt
tttcagccacGTGTAAATGCCCACCCATTATTTACAACAATTTCTTCAAC
TCTCAACCTTACATTGATTACAACAAAAAATTGATCGAGATGGCTGGATT
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TCCAAGGCGACCATCCTTTCGTTAGCTTGGTACCTTTCCAAGGGACAGCT
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ttatatgTGACTAAAATATATGTAGAATATTATATTCGATTTTTGTTGAG
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00018827 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: HMCN1 (Hemicentin-1 OS=Homo sapiens GN=HMCN1 PE=1 SV=2)

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Query: 9159 WGLWSPCTKSCAIGTRKRSRECAVDDEARFCPEE-KMSDTQD--CNAFPCPINGQWGNWTDFGACTVACGFGRRYRQRECNNPKPALGGEDCPFGVVVDFLEGCNAYPCPIHGGWGAWYEIEECTQPCGLGGVERQRRYCNSPLPQYDGRPCNGPSERFYKCNEHI-----------VCENELAITYKLRFINETW------DYRLVYDN-TNEFRDFSTRLTDNINLLH 9785
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HSP 3 Score: 118.627 bits (296), Expect = 7.708e-26
Identity = 61/167 (36.53%), Postives = 84/167 (50.30%), Query Frame = 3

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Identity = 45/112 (40.18%), Postives = 60/112 (53.57%), Query Frame = 3

Query: 9303 INGQWGNWTDFGACTVACGFGRRYRQRECNNPKPALGGEDCPFGVVVDFLEGCNAYPCPIHGGWGAWYEIEECTQPCGLGGVERQRRYCNSPLPQYDGRPCNGPSERFYKCN 9638
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Sbjct: 4528 VHGGFSQWSAWRACSVTCGKGIQKRSRLCNQPLPANGGKPCQGSDL--EMRNCQNKPCPVDGSWSEWSLWEECTRSCGRGNQTRTRT-CNNPSVQHGGRPCEGNAVEIIMCN 4636

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00018827 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00018827 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
HMCN1	7.162e-29	37.44	Hemicentin-1 OS=Homo sapiens GN=HMCN1 PE=1 SV=2	[more]

You are here

TCONS_00018827 (transcript) - C. hemisphaerica