TCONS_00018829 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00018829
Unique Name	TCONS_00018829
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	13214

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000309:323601..355880+

transcript sequence

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ACCCTTGTCTCGGTATTGATGATTCAGATGGTAAGACTGTTGTGGCAAAC
GAGAAATGCAAAGACATGTTTTACTTCGATAACGCAGGTCACATGATACA
TCTTAATAGCGGGCGGTGTATCAAGAAGGATGGGGCGGGAGGATTGGTAG
CGGATACTGATTCTTGCGATCAGAAATTCACGGGGGATGGAAAAGGTGAA
ATTGAGACTTCTTACCCAGACTCCAAATGCATCACTGCCACTAATCATGC
ACCAGTAGTGGTTTCTGGCGCCGCTTGTTCCACTTCAACCACTCAATATG
AATTTTTAGTTTATAAAGACAAAGAATATGACtataaagAGTTCGAacag
cgattttacaaattgcCGGCTCAAAATCTCAAATACAAAGACGCGAAAGA
AGAATGCAAGAAGTACGGGCTGGAGTTACCAATGTTGAAAACGCAATACG
AACTGGACATGTGGAAAAAACTGGTCAGCGACCATTCCTTACAAACCTCT
TATAACATGGGAACGCACAGAAAAGATTTTGTTGATCAATATGTTTGGGA
TGACGGTACGCCCAATGACATGGCTCCCACTTCAGGAAGTACTAGATGTC
AGAAAGTTCTTTCAGGTGCATCTTTGGCCGATAAGAATTGTGGAAGCGCT
GAAACAAACATCATCTGCCAAGTACCTGGACGTCGCTTCATGAACTATAG
TGACATCATTTCATCAAACTTTCACCGCCAACGAAGACTTTCTTTCGGCT
CGAATGGTTTCAACATTGCAATGACCAATACGTCAGAATTCCACGCTTTA
TTCCAAGTCAACGTGGCTGGAAAGTACGGTCGCCTAACGCTGAACATTTC
CAACCGTCTGATATGGAACCATctaggttttgtttttaacaaGAAGGAAA
ATGCCATACTAGCGCACGCAAATGGCAAAATAGCAGGAAAATCGTACTTG
GCAGAAGCCCTCCTCCCTCGACCACGAAATTACAAATACAATCGAATCCT
TTTGTTCGGTCAGTTGCAGTACATAAAAAGTTCTCTCAATCAACATTCGA
TGTCAGAGTTGCGGATGTGGAGATACCCTTTGCACGGTGATGTCTTCCAG
CGCATGACGACCTCAGTTACGTACGACTTTTCGGAACTTCATTGGACCGC
TATGGAGACTTTCAAATACAACTTCAGTAGCGTTTGTTCAGATCCCCAAC
AACTGACTGGTCCATGTAATGACATCTCTACCATCAACCTTCAACGTGAT
TTACATGCATCCGCAATTGGAGTTGTTCCACGATGTGAGTGGTGGTCTGG
TCGAGGTGAAGACATCATTGTTGATCATGGTAAATCTTTATCCAAGGAAG
AATGTCTTCAAACGTGTTATGATGTCACAAGTAATTACTCACAAGCATCC
TCTAAAGTCAACGGGGTATCTTTTGGCGTAACACCTACCAGACAAAGTAC
CTATGGGAAATGCTTGTGTATTTTTTCACACGGGGCGTTGGTAAATACGA
CGAATGATGACGCGTCTTACAAAACATGTGTATTTCCTCTACCAGTTTAT
TATGGGTTGGTTACCAATGGTGGTACTGTATTACAAATTGCTTTCACCCC
GAACAGAGAGTGGATATATGCTATCGGTTTGAACTTCAAGCTGCATTATC
TGAATACGGTGACTTCCGTTTGGGAATCAAAACCCTATGATTGTCAGCAG
GTGGAAGTCGATCCCTCTTACAAGAAATGGTTTCGTCACAACAACATTAT
CAAAGACGAGTCAGGCCTAGAATATTCGAGTGCCGATTGTGATTCTTTCG
TTGTGGACGACCAGTTTTTAGGGTGTCGTAAAACAAGCAAAGAAGTATAC
ATAAGAAGCAAGGTGTTCGAAAAATCAAACTGGACACTTTTAACTGATGG
AGCAACTCAGGTGCGAGTAGCAGTAGACGGTCGATGGTACATTTACGATG
ATAGCACTAAGGACATTGCGGAAGTGAAGAGGGCGACGGGTGAGAAACAG
ATCGTGGCCAACGCCCTTGCTGGAGGTTTCATAACCTTTTTTCAATCATT
TGATGTGACGCCCAGCCAAAAAGTCGTCATAGCAACCAATATGGGTGTAT
TTCTTTACATTGGAAATAACGGATGGGTGGAAATTAATAATGATAAAGAC
ACCTATTACGTCCGTGCTATTGATGATTATTATGCTTACGTCTTGGAAGA
TGGCGTTCCACGCCCAAAGCAAATACCCCTCGGAAGAAtACAACTACCTG
GCTACAGTTTGATCCCGCAGATTGAAGCGAATTACGAACTTGCGAGAGAA
AGTTGCCAAGACCAGGGTGGTGACGTCATATCCAATTTCAACACCACACA
AGATTTTGCTGCCGCTTACCACATGGTTGACAAAGCTGGCCAAGCATTTT
TTTGGTTCGGTGCCAAAGATCCAAACACAGATTCGGATCGGAAATTTTAC
CAACTAAATGGTAACATGCTTATACACGCTCCTTGGGGCGTTCCCGTAGA
GCTGGCTAATCCAGCTGAGCAATGCGTCATTTACAAGAAAGAATACTTTG
GTGATGCTCCTTGTGAATTTACTGCTGGTACTGGAGCTTCAAGCCAATGT
CAGGtgCCTGTAATTCCTTGGCTACGCACTGAACTTCCTGTGGAAGTTTC
TTTAGTGAAGACGCCCACTTCTTGTCAAACAGTTAACGATGGGATTGTCG
AGATACCCAAGGTGGACGGTACCAATGGAAACTCCGCCACTTTCATTTTC
TCCAGGACCAACATCACTCAAGATATGACCATCAAAAATGCTTTCCTTAA
ATTCTATCCGTCAGAAGATTCTGACGTCAATAGTGATGTCATTTCGTATC
TGATTGGTCTATTATACAGACCTTACGATTCGATCGATTGTAATGACTTG
GATGATATATCAAATCAAGAACTTATAATACCAATCCTGTGGAATGTGTC
TGCTGAATGGCGTACGACCAAACCAGTCGTTTCTCCAGACATCTCCAAAC
TGATCAATTTTCTTGTTCGAAAGAAAACATGGAATAGTGAATCGACTTTC
CAGATTCTTTTGACTCCTTTATCAACCAGTATCCAATCCACCAGAAAGAT
ACTGATCAATCAAACAGAATTGGTCCTGAATTACGAGAACAACTTCCCTA
ACCGTTACATGCTGAAGAAGTCCATCTTCTCACCAGTACCATCCATCGAT
ACTATCATCATTGGACCCTTCCACCCAAACATCCAAACTGTCTCCTTTTG
GATACACATGAAAGGTCCACATTGTGGGAATTTGTTTGTGTGGACAAACG
GGAACTTGATGATGCAGCTCAGTGAGGAGCTTGCAGATGATTGGAAACAT
TTGTGGATAGATGTGCGTGGCAATAATGGCGAGCCTACCGAAATAATGTT
CGTGTCTATCAATAACCAGGGATCAAAAGGCCATTTTGCATTCGACCACT
TCGTCGGATATCCGCACGCTGATTTGGCGGTTCACGGTGACGAAGTTGCT
ACGTACGATTCTAAAAACAAAACTTTTTACATTGGACTGCTAGAAGAATT
TGGGATCCCCATCCCGAAAGTGATGTACCCTTTTCAAAAGGACGCTGGTG
ATCAGGACTTCGGTTTGTTCGGGTTGAATCTAGCTTGGCATAAAGCAAGA
CTCATCAATGAAGAGAAGTACTACGGAACggataaatacgattttttGAG
GCATATGTTCTATTATGGCGCGCAAACAGAAAGAGGGAAGCAACCGTGGG
CGTATATTTATAATGAAGATATGACGCCTTTTACGAGTTTGGTAGATACC
TCATCTTCATTTACGTTTGTCACTCATTTGAAGTACGATGATTTGCAGTT
GGGTTATGTACAAGATAAGATGCAATACGTCCGCGCCAATGGCACTATCT
TCATGTTCCAAAATGAGAAAACTAAATTAACAGTTCGAGATTACCCAGAA
GGCATAGCTGTGAGAGTACATAATTCGAGCGGTCATCCAGTGGTTGAAAG
GTTCATACCCATTCGCAAACACCACGTCTACTTTGCCATCTCTTACCAAA
ACGGATATGGTTCTGTTTATCTTGATGATGAGTTACGTACCACGTTCCAA
GTAGACCACGCTATATTGACGCCTTTCCCAAAGAAAttgatcttcttctt
tgatCCGGACGATGAATTTGAACTACCGATTACTGCTACCAAGGCAGACT
CAGAAAAACAGCAACAAACGATTCGAAACGTCCGTTTTCGTGGTTCTATC
TCCTGTTTTCAAGCTTTCGATCAAGCTTTAACTTTGCAACAGATTAAGCA
AGTTGAATTTTGTCCAAACAGACAAGGTCGTATCTATCATCGGAAGAGTT
GTGAAGACGGtggagaaaaaattatttttaatgccAATTGTGTTTGCCAA
GACTATAATAACCGATACATTACCAGGACTTGTCGATCAGCATTAAAAGA
TACTGTTTATGAAAACGCTTTGGAATATCTACCTTTCGATATACCGAACA
AAATTAAAGGTGTGAAAAATGTCATGGACCTTACAACCACTAACCCTCAA
GTGCAATTCACTTCCGGTCCGGTCAATACTGGAATCTGCGTCAACGGTGA
TGTGGCTGTCCAAATTGGCACGATGTCCAGCAGTTGTTTGGAGACATTGA
CAGGGACTTGCGATTCTGGTTATGCAATTGCTGTATGGTTGTTCGTTGGT
GAACACTATTTTGATGAAACGATCGAAGTTTTTAGATTCAACGAGTTTTC
TGTGGAAGTCGTTTTTGAATCAGACGAaagcaaaataaatcaaaccTTCA
ATTTCAAGATGGCAGGATGTGGTACATTATCAAAAGTCATCGGCATCCGG
ACCGTGCACCAATATACTGTCATCATCGCCTCTGCTAAAGCAAACTACCA
ACTCTACATTGATGCTGAATATATTGGTGAAGAGAGTTGTACGGGTAGTG
GACCATGGCCTGCGACGCAAACTTTGACGGTCGGTGGTGCCAGTCGAGTG
TGCATTGATGATTTTGCGATCTCTACTTCAGCCACAATGAACTTCCCTGA
AAACTTTTACACATCGCTCGTCAAAGGTACGTTTAGTTCCGATCCACAAG
TGCTTGGGTTGAAGACACAGATCAGTATTCCAGAGATATTGGTGACAGGA
CCGACGTCAGATGATTATTTAGAAATGTTTCAAGACACATCATCAGAATC
ATCACAAATCCTCATCGAAACTATCAACGAAATTATAATGCAAAAAATCT
CATATTTACTTCCGAACTTTTATTCCGTCCAAGTCAACAAGCTGAGTTAC
GGGCGTGAAAATATGGTGAGGGCGGAAAATGTCTTGATCAACTTTCAAAC
GTTATCATTGGCTGAGCTACAAGTTTTCGAAGATTGTCCAATCAAACTTA
CTTACAACGGGAAGGACTTAGAGATTAATTGTGATGGAATGAAACCCGTC
TACGGGCTGAGTCAAATCGAAGTTGAGGGCGTTGGCGTCACACAATACAA
GGCGGAAGTAAGGGTGGTCAACCGCCTCCCAATCCACGACAGCTACCATC
TTGGCTTTAAAATTCGTTTGGAAGCCATCACAGAGTACGGCAATGGAACG
GTTCAGGAGGAAACCCATTACACGGGTGTGGGAACGTTTCCTTTTGATGT
GGAGTTAGGGAAGCGATACAACGCAACAGTTTGGGCGATCACACACGAAG
GCGTAGGCGTGGGGACGACACATGAATTCATATCACTGGGTGACTATCCA
CATTACCCACCCAACGCCACAGCGTACAACACCTCACTGACCAGCCTCAA
TGTCAGCATCGATAACTTCCCAGAAGATTTATGGAATGACATCGAAATCT
GGTACCTATTGTATTACAAAGAGTTTGACAATGATCCGGAAAAAGATAAT
AATATTACCGCATACACTGAAGTCCGTATTGATCGTGACCCGAACAGAGA
GATGAATCATACTTATGCGATTGAAGGATTGGCAATATTCACCAATTACT
CCATCTTGGTGAGAGTTGCCAACGTTAATGGTGAAGGGCCTCTCTTCAAT
TTGTCATGCTACACCAAGGAGAGCACACCTGAAGCACCGCCAGAATTGGC
CGCCCTTACGCCCGTTGACAACCGCCTTGAGATTAAATGGAATTATACAG
ACGACATCCACATATGGAATGATTTCACACTTGAGAAATTTGGAATCACT
CTGACGTCTGTTTTCCCTCAGAACACGAAGATTGATGGCCCTTTCACCTA
CTTTGTATCACCTGACACGTTCACGCAACTGTCAGATGAGCTGGATTACT
TTAGAGTATACAGAATCACGTTAACCACACACACCAAGAGTGGCCCCGGT
CCAACTGTTGATTTTTGTCAAGTTACTAATTCTTATTATCCACAAGGTCG
TCCACAAACAGTCGACATTCTTGGAGTCGATCGAACCTCCATGAATTTTT
CGATCGGTCAAGTTGACGTGACCGAAGAAGGAGGGGTTATTATGAATTAC
ACCATAACCTACACATCTGTTGATTGGCCAGATACTCTACACACAATCGT
TACTGACAGCATCATCCACAGTGAAGCTAATTGGAACATTTGGAACAGCT
ATTCATCCTTCCCACCCACAGGGTGCGCTGATCTCCCTCCATCGTCGGTT
CTCATGGGTTACAACCTACAAGACCTCACTCCAAATACTAACTACTCGTT
CAGTGTGATCGCTTGCAACCAATACGGTTGTGGACAAACAGATAACGTCA
CCACTGTTGTTTACGGGCAAACATTACCTGATATTCCATCTTGTTTCCCA
AACATCACGCTAGTCGCCAACACTTCTTCGGAAAGCATCAGAGTGGAATG
GTCGCATTTGACTCATTTTTGTGGATATGGGAATCTGGTGCAGTATCATA
TCGGGGTTTTGGATGATGACCTTTATCAAGAATGGATTCAGAATAAATCT
ATGATCGACTTGGATTTAGCTCCAACAGTGACACAAACAACTGAAAACTT
TACCGAATTTGATGGTTTGAAAAATTACTGGAAATATTCTGTGTTTGTGA
TATATGAAAATGTAGTCGGGAAAGGACCAATATCGGATTTGTTCTCGACT
TTTACGGCGGAAGATGtaccCACATCTGCACCATTTCTGGTCACCTCAGA
AGCATTCAACTCCTCGGCTCTCTCCATTAACATAACTATTCCAATCCGAG
AAAACCGAAACGGAATCATTATCGGTTATCAAGTAACCCTAGTCAACGAA
ATCgaggaaactttcaaaaagaattACTCGGTAGCTCATTTGATTCAATG
GAACAACACTGAACCATCTGGTGACGATATATTGACCAGTGTTTTGTTTG
GTGATTTGAAAGCGTATTTCAACCACACAGTGACTGTCCAAGCCTTCACC
AAAGTTGGATTGGGACCTTCTTCTGAACCGTTCATCTCGCGAACTGGTCA
AAGTgTACCAACCGCACCGCCTTCCAACATCAGTTACAGTCACGTGACTC
CGAACAGCTCAGTGATTGGTTGGATGCATATTCCGTATTTGAACCGGCAT
GGTGTTCCTTCAAGTTTCATTCTCAATGCATCGGGTATCCTTGCCAATGG
AACTCTCGATTCCCTGGGTCCTTTCAATGTTTCTGCTCATCCTGATACTC
CGGAGTTTGATTTCATGATTGAGAACCTGTTTCCAAAGACTATTTATAAC
GTTACGCTGATCGGTTGCACGCGTATTGGTTGCGGCCCGCCAACTGGAAT
AACTTTTGAAACGCTTGAGATGGCGCCTTCTTCGTTCCCTCTTCAAATCA
CCAATGTCAACAACACGGAAATGGAGAAACTTCTCGTCCAATGGTCCGAT
ATTTTATCCATGGACAAACGTGGTATTATCACTCATTACTACATTCAATT
TACCAAAATCAACCACACATGGGATACCGTGGACTCACTACCTAAACTTC
AAATTGTTAGATTATCTTCAAATGACAATGATAGCATGACCACATACGAT
AGAACAGAGATAGTTCCACTTGAAGGTCATTTTATCCTTGACGAAGAACT
TTTTTATTCGACCTGGTTAACCGGTCTGGGAGATTTGGAGAATTACACAG
ATTACAAGATAAGCATCGCCGGAAAAACATCTGCTGGTGTTGGACCGTAC
AGCCCTGAATTTGTCTTCAGAACAGTGGAAAATGTGCCAAGTTTCTATCC
GGTCATCAACAGCACTGGGGAAGTTTCAGCTTTCGAGGTCTTCGTCAGAT
TTCCGAACCTAACTCGACCATACCACCAGGGTGTGTTGTTAGGGTATAAA
GTGTATTACCAAGAGATTGATTTGATCCAAGATTGTATCGACGGAGGGTA
CCATTTCACAACTAATTGTTCGCTGAGGATGTCATCGATCAACAAAACCA
TCATTGAGCTGGAGACACCAGAGATTGATCTCTTTGCACCTCCACCCATC
CCTGGTGAAGAGGATGAGATTGATGAGAACATCTACgaaatgattttgtt
tgatCTGTTACCAGGAGTCAACTACACTGTCtgtttgactgcttttacgg
tGGCAGGAGTTGGTCCTGAATATTGCACATGGGCACGGACGGAAGATGCT
ATACATGGCAATTGGACGGATTGGACGGACTGGGGCAATTGTGATCAGAC
GTGTGGTCAAGGTATTCAGATGAGATACAGGTGGTGTATCAACCCTGTAC
CAGACAACGGAGGTGATTATTGTGTTGGTGATGGCAATGAAACGAGATGG
TGCAATGAAATCCCTTGTGACGGATATTATCTCGCCAACTCTTATACAAA
CTGCAACCAAACATGCTCTAGTGTGTCAGAAGACTTTTTGTGTATCCCTA
CTTTCACCCCATTTACACGAGATCTTCACAATTTCCCTCGTGATCCGAAC
CATTACAACAGGACAATCGAGGTGACATGTGAACCGACCCATAACAATCA
CAGTCAATCGATCCACCCTTCCTTTGATATGACGGATAAATCATGCCAGG
GTTTCGAGCATCCTCCAAAGATGATTGATTGTGCTTCAAAACCAGATTCG
CCAACTGATCGAAGGTTGTGTTATTGTGGCGATGAAGACGTAATGAACTT
CTTGGAATGGGGTTTGTGGTCACCGTGCACAAAGTCATGTGCAATTGGAA
CACGCAAAAGAAGTCGTGAGTGTGCTGTAGACGATGAAGCCAGGTTTTGT
CCGGAAGAAAAAATGTCCGATACTCAAGATTGTAACGCATTCCCTTGCCC
AAtcaatggTCAATGGGGAAACTGGACCGACTTTGGGGCGTGCACAGTGG
CGTGTGGTTTTGGGCGTCGCTACCGCCAACGTGAATGCAACAATCCGAAG
CCAGCGTTAGGTGGTGAAGATTGTCCTTTTGGTGTGGTTGTTGATTTCTT
GGAAGGATGCAATGCTTACCCTTGTCCCATTCATGGCGGTTGGGGTGCGT
GGTATGAGATTGAAGAGTGTACACAACCATGTGGTTTGGGAGGTGTCGAG
AGACAGCGTCGTTATTGCAATTCTCCACTACCACAATATGACGGACGGCC
CTGTAACGGTCCTAGTGAACGCTTCTACAAATGCAACGAACATATTGTCT
GTGAAAacGAACTGGCGATCACCTATAAACTTCGTTTCATCAACGAAACA
TGGGATTACCGGCTAGTGTATGACAACACCAATGAATTCCGTGACTTCTC
AACACGACTCACCGATAATATAAATCTGCTGCATTCTAACAATTCGGACA
AAATCAAGGATACCATATTGGATGTGACCTGTAATAAATTGGAACGTGGC
AGTGTTATAGCAAACTTTACAATCCGTTATTGGGAGATCAGTTCGGCACA
AATCGTTCTAATGCAACACGCGATCGAAGAGGACAAATTCATCAACGATA
TGcctcttcaaaaaatcaatatctcttCTGACCAAGtCCCAAGCATGTTA
TTACACGCGACAGCCCAGTCCTACTCTCCCTTCTCCATCAATGTCACGTG
GAGCGATCTGAATGTCAACACGAGCGAATTGTATCTCTATTATATCTTCT
GGCGCCAACTGGCCGTTGAACCAGCCACATGGAGCGTCAAAGGTTTCAAT
AATACAGGACCGAACCAATTGATCGATTTATTGCCGGCCACGTGGTATGG
GATCCGCATTTCGGCTTCCTTTCAATCTGGAAATGGAATCGCAACTGAAG
AAATAAAAGTCATCACCCTTGAAGGAGCTCCGTACATTGGTCCTCCGAAT
ATGACGGCTGATATCAACGGTCAGACCTCTGTATTCATCAGCTGGTTACC
AATCTCCTCATCCCAGGTCCCCGGGAACCTTCTCGGCTACCGGTTACGTT
ACAAGCTGTATCACGATTCACGAAACCAATCACAAGTCATTACTTTAGAT
GCGTTCACTCACAATCGAATGTTGACGGGCTTGAAAGCATTCTCTTACTA
TTGGATCGAGGTTGTCGGCTTCACCAACGCTGGCGAAGGACCACATTCAC
TGGTTGTCATCAAAACACCTCCAGGACCTCCTGATATCGCACCACCGAAT
GCCACTATGTCAGATAAATACCACATCAACGAGATCAAAGTTCAATGGGA
TGCTATTCCAAGAGAATTTGAGAACGGTCGAATTTCTGGATACAAAGTGA
CTTGGGAATTGCATCAGAAATTCGGACGAGATGTTCCCGTTAATGAAGAA
ACTGTACCCGAGGAAGCTTTCGACCGATTCACGTTAGGTTACACTATCAA
AGGTCTTCACGCCAACTCTATTTACAAAGTCTCTTTGTTCGGTTATTCAC
CTCAAGGTGATGGCCCAAAACATGTGGAATATGTTTccacGTGTAAATGC
CCACCCATTATTTACAACAATTTCTTCAACTCTCAACCTTACATTGATTA
CAACAAAAAATTGATCGAGATGGCTGGATTGTTTCCGCATCTTTTGCAGA
TGATCATAACCAACGTCTGTACTGGTACTTGCAACTCCTACAACCATTCC
GTTATTTACTATGACCGCACTTCATCCGGTGATCCATCTTCAAAGAAAAA
CGAAGtcggtgtccggaaaaaaatcGGACAGTCAGCTCATATGAATTTCC
CGATTCAAGGGCTTGTTTCTATGAAAAAGTTCCAAGGCGACCATCCTTTC
GTTAGCTTGGTACCTTTCCAAGGGACAGCTTTCGTTGTGTTTCACGAAGC
TGTCAAATCGGTCGGCTTCATCGGTCTCTTTAAAGCTGTCTTCAACGCTT
GGGCAGTTGTGGTGATCTCGTGTTTAATGGCTTGGCTTTGTGGTTGTGTT
TATTGGTTCACCGAACAAACTTCCGAAACAAGTGAGATCAACCTTCAAAG
TGCGCTGATTGGCCAAATTCAAGGATTCTGGATCAGCTTTATTACTATGA
CAACTGTTGGaTACGGTGATATCAACCCTTCGACCTTCCCTTCCAAAGTT
CTTATGATTCTCTGGGCGCTAATTGGTTTGGTGGTGTTTGGGTTGACCAT
GGGTGTGATTGGATCAGGTTTGGTCGTCAACACACAACCTGCAACACTTA
AGATATATGGCACTCCGACTGCTGTGATTGAGGGGACATTTGAGAATCGG
TTGGCCATTTACCGCAACGCCGACTTGACGCACAACAAAACCTATGAAGA
CGTCCTCTCTGTGTTACGAGACGTTGCTGACAAGAAAATCGAACTTGCTC
TCATTGATGCAAACTCTCTCGCAGGCTACGAAAACGAAATGAAGAGACTT
AGTTTGGCTATTGGCAAAATTTACGTAACCGAGAGTTGTTTCGGGGTGGT
TTTGACAGATGGCTTCGAAGCGATGGAAGATGACGTTCGTAGCTTTGTTA
TGTCACAGTCAGCCGAAATTAGTGCGTTCATTTCAAGCAAAGTTGCACAA
TTAGAGccATACAGCTTGGAGGTGGAGGAGAAAATTCTCACCGACGAAGA
GTTTAACAGTTTATTCGTTAATTGTGGTATTCTATTGATTGTGCTCTCCT
TCTTTGGGATGCTTCATACTTTACGTCTGCATCTCAAAAGCAAATCGGAA
GTTCACCCTGAAGatCACGAAGATTCAGAATTTATTCTAAGTGAGATTGA
ATCATTGGTCGATGACTTTAACGAATCATTTGAATCAAAAGTCGAGGGCC
TGGAGAACCGGCACACAACAGAACTTCAACATCTGGCATCACTTCATCAG
AACTATAAAAGACTTTTATTgagaaaaggttttgaaaaggGAAAAGTTGT
TCATGCTCTTGAGAACACCCACCAAAAAGCAGCTCATAAAATTGTCAAGg
tcaaaacgaaagaaaaatacGAGCGGATCCTGAAAAAACAGGAATATTTC
AACATGAAAGAGCAAGAGGAAAAATGAAAGgtaaaacagaaagaaaaata
attttttagaagatttttaaagcattttgcattttttatacATACGAatc
ttatttataaaaactcatttacaaaaatttaatttatatgTGACTAAAAT
ATATGTAGAATATTATATTCGATTTTTGTTGAGTTAAATCACATCATATC
TCAACAGGTTCATCTACCATCGCTTGGTAAGCGCCTTTCTTCCATATGGC
TTGAAAGTTCGATTTTAAAAGTGATGTCATTTGAAATTGAACAGAAAAGT
ATAATTATATTGTTCTAGTTTGCTTTTTTCAGCAAATGTTTCTAAATAAA
GGACAGGGCAATATCAGTTTGCCAACATGACTTGCTTTTACATCACAATC
GACTCGAGGAGGAGATTAATCATTATCATtctaattttattattttcgtc
ATTGGTTAAAATATTTTGTGAGCAAGATAAATTATGATCCGTCGTATCTT
CTCTGTATAGAGGACAATGCTTTCGACTCCCATGCAACAGTTCTACTTTT
ATGGTCTACCACCGCCAACTTTTACAGTTCCACTCCTCTTTCCTCTTGTT
TTACCTTCAATCTTTGACGATGTTGAACTCGATGACTGTTTGAACCTTAT
CACCGAGCGGTGAAGAGGGCGGAGAAGCAGGCTCGGGCGTTATGGGTGAA
TTATTTTCTTCATCGTCACTTGAAGCCCCTATGTAAATACCAGAGTCTAA
TTTCCTTAAGTTCTGTTTCTCTGTATTTATTGTTAAGGGAGATAAAGGAT
TTGAAGGTGATTCA

transcript from alignment at sc0000309:323601..355880+

Legend: exon

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agcGAAGAGCGTTCCAGGATCTTACATCATGATTTTGGATGATGATAAAC
ACCCTTGTCTCGGTATTGATGATTCAGATGGTAAGACTGTTGTGGCAAAC
GAGAAATGCAAAGACATGTTTTACTTCGATAACGCAGGTCACATGATACA
TCTTAATAGCGGGCGGTGTATCAAGAAGGATGGGGCGGGAGGATTGGTAG
CGGATACTGATTCTTGCGATCAGAAATTCACGGGGGATGGAAAAGGTGAA
ATTGAGACTTCTTACCCAGACTCCAAATGCATCACTGCCACTAATCATGC
ACCAGTAGTGGTTTCTGGCGCCGCTTGTTCCACTTCAACCACTCAATATG
AATTTTTAGTTTATAAAGACAAAGAATATGACtataaaggttggtttttc
aaaatgCTTTTCTATTATTTCAATATCGAAATCTATTTTCTATCCTCTGA
TGCAACAGCTTCACTCTACCATTTTTCGCACGAAAAATTAATTTGTTACT
TTTGTAGGTTTGTAGTATGCAAGCTTGTCCGGAATGGATTCTGGACGCCC
CGGAGGGGGAgttgattaaaaatattttctttagcGAGAGGCGTGCATTT
gaagggggtgtttaaaagAGGAGGGCATTTATTCGAATTAAAACGGTATT
TAATTTTCCCCATCTATTTGCAAGAACATTAGCATACTTTTACATGGTCT
TTCTTCCCCTTTATTTTCAGAGTTCGAacagcgattttacaaattgcCGG
CTCAAAATCTCAAATACAAAGACGCGAAAGAAGAATGCAAGAAGTACGGG
CTGGAGTTACCAATGTTGAAAACGCAATACGAACTGGACATGTGGAAAAA
ACTGGTCAGCGACCATTCCTTACAAACCTCTTATAACATGGGAACGCACA
GAAAAGATTTTGTTGATCAATATGTTTGGGATGACGGTACGCCCAATGAC
ATGGCTCCCACTTCAGGAAGTACTAGATGTCAGAAAGTTCTTTCAGGTGC
ATCTTTGGCCGATAAGAATTGTGGAAGCGCTGAAACAAACATCATCTGCC
AAGGTTTGCCGTTACTGATGAATCTAGTGATTTCTTTGCTCACTCTATAA
GATTTAAATTGAAATAGAACCAAAATTCgatcaaaatctttcaatcacTT
TTTTGGTTTTAGCAGCTAggttttagaaattttataaaattaatATAAAA
CAATATACACAGTGTTCTATTAAAGTAGAATCTAAACAGCAATTATTCTT
TGTGCTTCCTTGCAGTACCTGGACGTCGCTTCATGAACTATAGTGACATC
ATTTCATCAAACTTTCACCGCCAACGAAGACTTTCTTTCGGCTCGAATGG
TTTCAACATTGCAATGACCAATACGTCAGAATTCCACGCTTTATTCCAAG
TCAACGTGGCTGGAAAGTACGGTCGCCTAACGCTGAACATTTCCAACCGT
CTGATATGGAACCATctaggttttgtttttaacaaGAAGGAAAATGCCAT
ACTAGCGCACGCAAATGGCAAAATAGCAGGAAAATCGTACTTGGCAGAAG
CCCTCCTCCCTCGACCACGAAATTACAAATACAATCGAATCCTTTTGTTC
GGTCAGTTGCAGTACATAAAAAGTTCTCTCAATCAACATTCGATGTCAGA
GTTGCGGATGTGGAGATACCCTTTGCACGGTGATGTCTTCCAGCGCATGA
CGACCTCAGgtaatagcttcttttaatagTTTTGActcttcattgaaaat
gaatatgtaaaataaagaagaaactaCGTTTGATTCTAGAAACCTTCATT
TTTGATGAGAGGTGCACTAAAGTTTCTTGATTTCAACTAACTATTTTTCT
AAGAGAATTCTTGCAATGACTTTGGtctttttctttgtctttctttttct
tttgtcttttgtcttttgtcttttgtctttGGTCATCGACTTGCATTTCT
TTGCTGTTTTACCTTTTCGACAGTTCACCTTTTCGAGGAACTAACTTTCG
GTGTTATCAGAGTTATAAAAAAAATAGCTTCAAAGTATCCCTATACCACA
AGTCAGTAGCaccaaaggttaaaaaatcacttttatatAATTAATTTTCC
AtctttaatttcgaaaaaaaatggaaTTATTTTTTCTCTTCAATTTCAAT
TGTCTTTTCGCCGGTATAGTTTGTTAAGATTGAATCATTCGTTGATAAAT
ACAGCTTTCGAGCGCCTTTTAGACTTTCCAAGGTGGATACTCTGATCGTT
CATTTGGGAATACAGGACCCAcgccatgaaattgaaattgaaattgaggG
GGTCAATGAATATATAGTCTACCtgccggttttctggaaaactGTATGAC
cataaactaaaaattttatgGTCAAGGAAGAAACAAATCGAAGAATTATC
CGAATAATATCGACTGCGTCAATATCGAATCGAGCCCAATTGTATTTTGG
TGCTTAACGACTTTCCCATATCGAAACACGTTGATTTCAAAAGGTAAATT
AATTGGCGCAAAAAATCGTGACCACATATATATTATGCACTATAGAAATT
CTGGGTATAAAATGGTTTTtaaacttcatttttcttatacaGTTACGTAC
GACTTTTCGGAACTTCATTGGACCGCTATGGAGACTTTCAAATACAACTT
CAGTAGCGTTTGTTCAGATCCCCAACAACTGACTGGTCCATGTAATGACA
TCTCTACCATCAACCTTCAACGTGATTTACGTAAGTCCTTTGAACAAGTT
TCAGAAAAGTATTtcttaaacattttttaattgatGAAGTGATTAGTTTT
ATCGCAATTCCCTAATATgactgttttaaaattttgtgtaGATGCATCCG
CAATTGGAGTTGTTCCACGATGTGAGTGGTGGTCTGGTCGAGGTGAAGAC
ATCATTGTTGATCATGGTAAATCTTTATCCAAGGAAGAATGTCTTCAAAC
GTGTTATGATGTCACAAGTAATTACTCACAAGCATCCTCTAAAGTCAACG
GGGTATCTTTTGGCGTAACACCTACCAGACAAAGTACCTATGGGAAATGC
TTGTGTATTTTTTCACACGGGGCGTTGGTAAATACGACGAATGATGACGC
GTCTTACAAAACATGTGTATTTCCTCTACCAGGTAATTTTATTGATTACG
TATAAAATTCTCTTTTCTCGAACCAATGTATACTAAAAGTACTATTTGTA
AGATTGAAATATATAGtagaatttgaaataaaaaaaagttcacaAATTTG
TCATTCTAAAAAGAGATCTTTTTTTTCCTTAACTTGACCTGGCAAATTTA
TCAAATTCAAATACTAAATTCTTCTCTTGTCTAGTTTATTATGGGTTGGT
TACCAATGGTGGTACTGTATTACAAATTGCTTTCACCCCGAACAGAGAGT
GGATATATGCTATCGGTTTGAACTTCAAGCTGCATTATCTGAATACGGTG
ACTTCCGTTTGGGAATCAAAACCCTATGATTGTCAGCAGGTGGAAGTCGA
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ctcaccaagaaacgagatgaaaaatcccggtttttagtgagaaGTTCGCT
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tttatacATACGAatcttatttataaaaactcatttacaaaaatttaatt
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


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Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00018829 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: HMCN1 (Hemicentin-1 OS=Homo sapiens GN=HMCN1 PE=1 SV=2)

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HSP 3 Score: 118.627 bits (296), Expect = 7.708e-26
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Query: 9302 INGQWGNWTDFGACTVACGFGRRYRQRECNNPKPALGGEDCPFGVVVDFLEGCNAYPCPIHGGWGAWYEIEECTQPCGLGGVERQRRYCNSPLPQYDGRPCNGPSERFYKCN 9637
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The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00018829 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00018829 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
HMCN1	7.162e-29	37.44	Hemicentin-1 OS=Homo sapiens GN=HMCN1 PE=1 SV=2	[more]

You are here

TCONS_00018829 (transcript) - C. hemisphaerica