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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00018964 ID=TCONS_00018964|Name=TCONS_00018964|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2883bp
ATGGAAGGAGGATTTTCAAGCGATCACGTGTAATCTCTTTTACTCGAACA
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GATAAGTCTAACGAAGTAGAGAACAATAAGACAACAAATCAAGATTTATC
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TCATAAAAAGACGAAACTTTAAGTAAAAGTGAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000314:53892..61563+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00018964 ID=TCONS_00018964|Name=TCONS_00018964|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7672bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000314:53892..61563+ (Clytia hemisphaerica)
ATGGAAGGAGGATTTTCAAGCGATCACGTGTAATCTCTTTTACTCGAACA
CGTGCACGGGGAACATAAATTTGTTCaatttaaggaaatttcgagttacg
gAATAAGGTTTATGAGACATTGTTTACTGGAGGGACGAGAAaagttgttc
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GTACAGGGGTGTATAAAACACGacttctgaattttaattaattttcaacA
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tttcaatctaatggaaacagtttccttttcgggttattttcgccttcccg
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GtatatttttcatcatttcctAAAAAGAAACAAAGCACGAAACACAAAAG
AAGACAAAAAGAAGAATCAATTGtagataaaaattttattaattgTTATT
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AGTGATATTACTATTGttcttcttttgtgtttatGGCTTTTGTTCTTTCT
GAAACAtgataaatgaagaagaaaacaaagagaCTCTCGCAGTGCAATCT
AGAACACATGTTTTAAGGGGCTTTTgttttcagtctttttcttgctttga
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CANtgatttttcgttttctttttttttccactCTCGAGATTTTTAACATG
TTTCAatatcgaatttcaatcagagATCGACTTAAGTCGGTTTAAGTTTG
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tttcttaacttttgagGAATTGAGTCATTCTTAGTTTGGAAGAAGGTCGA
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GGAAATTCCCCGAACCTTTTCCTCATTTATGAAGATGTGTACTGATCTTA
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GACAACAAAAATCGACGCATGCGCAATGAGTATCATATCATCAACGAGTA
GCCCTCCTATGGAACTCAGTATGAATCCAGACGACTTAGTATGGAAAAAC
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TCAAGTAGTTCGTATTCATCAAGGTCACATGATCGATGAAGATGATGCGC
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GTCACAGGTCAAGATATTTACGGTCGCGAATTGAATATTCCGCTATCGTG
NTTGAGAATGTCACAGGTCAGGATATTTATGGTCGCGAATTGAATATTCC
GCTATCGTGTCCATTTAAGTTACGTGTTATCGCCATGACATCACCCCGTA
CTTTTAAAGACATTCGTGAACTTTGTTACTGTGAATCACCACCAAGTTTC
GTGACACTGCAACAAGACGCTTTAGGTTGTGACGATATTGAATTGACAGC
AGACACAATATTAGAGCTTAAAGATAAAGTTATGACTGGCGATGGTGATA
TCGCGGGACTGAATTGTCGAGTCGACGATCAAAACGATAACGACGGTCGC
ACGATCACTCTCCCGATGCATTTTGTGGGAAGCTTCACAGAGACATTTTC
ATACCAGCAACTTCATAAGCGTTACATTGTTGCAGAtttgattaaagaat
ttaaattaCCAATCAATGTACAATTTTTGAGTAATACAGAGAAAAACTCA
TCTTATGGGCCACATTTGGGACTTTTAACCCTTGAACGTAAACGAGCTAT
GAACTCTATACTGGCCACAACAATCATTGACAATGTGAGACATGCATTGA
CATTCTCAGCTGAGCTACCAGTCACTATTCAAGTTGCTACTGGAATTAAG
AAGAGTCCTTATCGTTACCCGAACAGTCAATCACAAGttgatttaaagaa
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AGAATGTACAACCGAACAAGAAGCTCCACAGATGCTTCTTCAAGATATAG
TTCAACCACATCAGTACCAGAGCTACCCAAAAAGACACAATCAACCTCGA
CAATTGTTAAAAATCGTAACAAGAGCTTAGATCTTGGAAAGAATTTTgag
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GAAAGATAAGAATGGACGAAACAAACAGAAAAGTCAAGACGAATTAGATG
AAACTCGCTCGTTCATTCAGAGTGACGATGGTCATTCGACTACCGATCTC
CTATCGATCGCACCGACCTCAAACGGGAGTGACAGTATTGGGAACGAGTC
TTTCTCCCGAATCACCGAATGTATGGAAGCCATGACGATGTCGATTGACC
AAACAATGACTCCTGGTCGCCGACGAAGACACAGTCGCAAGGGAAGTGGT
GACTCGGGGATTTGTCTATCAGGACGTAAACATCCACGCTCCCGATCTTT
ATCTAGATCCAGATCCCGAATGTCGCCCGATGCACCGTCAAGCAATCCAA
GTGACACGATTGATACGTTTTCTGAATGGAGTTTACCGATGAATTTGAAG
GATTCGCCGTCATCGggaagaaaaacttattcttctCAAGGTGGATCAAG
CTCTAGTTACTTATGGGGTGTTGACTCAAATCTGATTAGCACAGAACAAG
AAAACCAACCGGCAACCGATGACTATCAAACAGACTTTTTAACTAACCAA
AATACAATCAACATGATGAATTTTCATAACACTGAAAAAGATAAGTCTAA
CGAAGTAGAGAACAATAAGACAACAAATCAAGATTTATCACCTTTAACTT
CAAGACAGTTAGAGAGTATTAACGAAATACGACAATTAAACGAAGATGGC
GTCTGTCGCGTATTAGAGACATTGAACTTTTACGACTTCAAAGATATATT
CACACAAAATCAAATTAACGGTGAACTTTTATTAGACCTTGAAATTGACG
ATTTGGTCAATGACCTTAAATTATCGTTATTCCAAGCCAAGAAAATTGTG
AAATATATAAAAGGTTGGCGCCCGCAATCTGAGGACAGACAAATTACTGA
GGCTTCCCGAAGGAATAGTCTAAACCCAAGAGACTGGTCGGAAAATGACG
TTCTCTTACACATGACCACTATTAACTTAATTGATTTCGGTAACTTCTGT
ATCAAGAATCAAGTCAATGGAGATTTATTATTGGATATCTTAGACAAAGA
AACATTAAATTCACTTAAAAATGATCATAAAGTGAAAATCTCAAATTTGG
AATCaaagaaacttttgaatttcGTCGTTAAGGGGTGGAGACCTGATGTG
TCACCCAAAAAATCGGCactattgtaaaaaaaaaaacaatgtaatTTATT
CCGTAACATTTATAAACAAACGGGTCAGCAATAAACTGAAACGAACTACT
GGTGGAAAATATCTAAATAAAGTATTTTAGCATAAATTAGAAATATGGTA
AAAAAGTGATGTATGAAGATatcttatttattttaaaatgtattttaacA
TAAAAACCTATATAATCTTGTAACTTGTAAAAAATATTGTCATAAAAAGA
CGAAACTTTAAGTAAAAGTGAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00018964-exon-sc0000314-1491911889:53892..54071 | TCONS_00018964-exon-sc0000314-1491911889:53892..54071 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018964-exon-sc0000314-1510915933:53892..54071 | TCONS_00018964-exon-sc0000314-1510915933:53892..54071 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018964-exon-sc0000314-1575043694:53892..54071 | TCONS_00018964-exon-sc0000314-1575043694:53892..54071 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018964-exon-sc0000314-1491911889:58861..61563 | TCONS_00018964-exon-sc0000314-1491911889:58861..61563 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018964-exon-sc0000314-1510915933:58861..61563 | TCONS_00018964-exon-sc0000314-1510915933:58861..61563 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018964-exon-sc0000314-1575043694:58861..61563 | TCONS_00018964-exon-sc0000314-1575043694:58861..61563 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000314 | supercontig | sc0000314:53892..61563 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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