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transcript sequence >TCONS_00021039 ID=TCONS_00021039|Name=TCONS_00021039|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3958bp TAAAAGAACATGGTTCCAATATGTTTAAGTATGATCCTGGTTGAAGACGA CGTTCGTGTAAAGGTTTGTGTTGTGGAGAACGGGTGTAGCAAAGTACACG TATAACGCACCACTTGGCAGTTGGTATGGTTTTGTTGTGGCTTCGCTTTT CGCTCCCTGCCGCCTGCCGCCGTCTGGCCTGGATGGAACCCAAAGAtgaa agaagccattgtagtgcaatgtttacatttttggaaagttctaAAATGGT AGAAGAAGCTCTGTAAATAAAAATTAGACTCTTTTACGTGTTGTGTCGTT CACCACGTTGAGTTGAATTGGTTGGTTATATTTTAAAGGCTTGATTCATA CTTTTGCTTTGATACATTTGATTCTCAATATCAACGTCATACTTTGAAGT TCTGTTTATCCTCTCAGTTAGTATATTTTAAGTTCACCTCTGATTGGATA TATAAACACTGCCTCGAAAGACAACAGGAAACATATGATTATGAATGAAG GGTAGTGTTTTATAGGTAGTAGAACCTAGAGGTGccttgtttttcatttg tttcatacTTCAATTGGTAATTTTAGTGATTGCTAAAGTATTTGGAGAAG CATTTGCTCTCTGACTGGATGAGGTGCTCTGCATTGTGGTGGTGGCGCAC AAAcaatttttagtaaaaaaaccATTCCTTTCATCTTTTAGtgaatagaa aaagaaagtagcATTACATGAATCAAAATGACAGAAATGGTTATCATGCC AACAGATGAACGTATCCCACCGATGGGATCAGAAGCTGCAGATACACACT TCAATGAAACTGCTGCATACGATCCTAAATTAAATACAAGAGACTTATCA CATAATAATAACAAACAATGTATTCCTCATTACGAACATTGGAAGGACAG CTTACCAGATCTATTAGATGACACAGAaggatataaattattttacgAAT TTCTAGAGCAAGATAAAAGTATCACGTTATTTGAATGTTGGTATTGCTGC AATCAATATCGTAACTTGCCACCAACTAGAACTAGTGCCAAAGACATTTA TCATAGATTTGTAAAGAAAAAGGACCCACATATTCCAATTTCTGAtcaag caagaaataatttggtATTGAGGATAAAGGCTAACGATATTACAGAAAAA ATTTATGAGGAAATTGAAAAGGAAGTTTACACTAATTTAAGGGACAtttg ttatccaaaatttttaaaatcagactGTTTTAATCAATATTGCGAAAGTT CTGGTCAAATGCGGTATGCAGAATATAATACCGATTATGGAAAGCCATCA ACAAAATATAGTGGAGTCCTTGATCACATTGACAAGCATGACCAGTATCA ACCTCAATCAAGATCAGAtTATGAAAGGCAGTATGAATGCGCCCGTCATC CACACCACGATCGAGTTCACGGACCCTCATCCAATTATGACGATCATCAT AGCATGCCGTCAGATTATGATCGTAGCTCTATAACAGATTCCAAAACTTC CATggGATCAAGTAGTCGACACGGTAGACCGTCTCGAGGTCACAATCGCG ATTACGATGGACCAATGGACGTTAACAATTTCAAGCCGCGTACGCAGCGA ATCAATCAAGATCGCATGAAACCGATGAAACCGACAGACTTTGCTGCACT TTTGAcgcaaaaacttgaaaaagtttTGATCGACCGAACTAGAGATGGCC ATGATAATTCGTCACACCATTCTCATGGTGACTCAATGGATCTGTCTTCA ATGAAACATCATCTACCAGGTGGACACAACAGTCGAGTACCACCCCACCA TCAACCTCACATACACGATTTCGATGGCCAGAGTGAGAGTGACGCCCAAT CTTGGGTGCTCTCTGACCGGCCAAGCGTCGCCGGACAATCATCACATAGT GGCTCACACAGTggtattttaatgaaaaataaagcaaaagaaCTCAGAGA TAAAATTCATCATCATATTCGAAGTGACTTGAAAGAATGTCGTTGTGCTG AGTGCCGCCTCACGCCCTCCGTACATTCGGGCGGTCGTCACGAACACGAT TCGCATGCACGACACGGTGGCTCAGAACATGGTTTTTATCCACACAGTAG TAATAGTAACTCTTATAATTATTCCAATGATACAATACAAGACCGATACA ATACAATGTCGTCATCATCTCACCATCGTGGTTCCTCGCGCACGCGTGAA ACGCACCCGCATCCAGATGCTGCACCACCATTAGACACTAGTAAAATTTA TTCTTGGATGGAGAAAAACGAACGTTACCAACATCAAAAATCGTACCCAG ACCCCTCCCCGTCACCTTCTTTACGTCGAAAGAAAGCACCTATACAATAT AACACAAGTAGGTCACAGAACTCTCAACAGCCTATTGCGCAAGATACGGG CATGCCGTTATTACCACAACCTGACCCAGACAATGTTTTACAAGAGGTTA AACGGAAACTGGAAGAACCCTCACGATCACAACAAAATCATCACCGATCT TCaagacaacaacaacaatatcATACGCCCCATTATGAGGGCGGATACCA CCCTCATCACGATAATCAATCAATGGCTTCTGCTCCTTGGTCGATGTCTG ATAACTCTTCAATTATTTCTTATAACCCTTCACAAGTTTCTACCGTACCT TCATCTGCGTCTAGATTATGGAACGCTCAAGGTTATTACAAAGATGCCGG TAGTGAAGTCAGAGACGATCGTTGCACGCCTAGCGAAGTTCACTCGCAAG CAGCTTCTAAACACAGCGGTCCGCGTAGCGTGACACGTAGTGATCATATG AGCGCTGCACGCAGTGATCATCACAGTGACGTAAGATCACAATCGACGGG AATTAGTTACGGCAGTGACGGTAGTAAAGGACGTTCTTCTTCttctaaaa ataaaactgtTATCACGTATTATTACGGTAGTGAACCTATCCCGTACCGT ATTAGCGTTCCGACTACGGAGGTTACGTTGTCACAATTCAAACTCGAAAC CAAACGTGGTAATTATCGCTTTTTTTTCAAGACTGTTTCCAGTGTCGATG GTGAGGTTGTTTGGGAAGAATTCAAAAACGATGATGATGTCCTACCTAAA TTTAATGATAAAATTGTTGGCAAAGTCGATAAGATCTAATTGACTTTGGT TTTTGGATTTATTTGTTGTTATTGTTTGGATTATTTCTCTTAATGATAAT CATGACGGAATTGTTGTTAATGTGGACCAAGTTTTGATTCTACCATAATG AACTTATaatatttatgacgtaatgttttaaacAGAAGCACCCTAAAAGA CCAAACAGCCGGTCTAATTTTGAATTAAACAATAAACTAGGCCCTGGCTA TTTTGGGTGCTTGCGTCTGAAAAATTCCGACATGAATGATTGATCATGAA TTGATAAATgcgttgtttttttatatagaTCCTCGTGTTaatgattacgt catgaatattattGTCCGCTTGGTTATATTATCactgtcttttttttttc aaatttatgctCTGCATTTAAAACTTTATCACTATTTATATTTTGCCAAT TCTTCTACCCCTGTTTGATACCCCTAAatatttgttcaattttttaccTT CCTCGTACAGGTTCGGGAatcgaaattcattttgacaaatttgaactttt tgccaAGTGTCAAGATATTCTTTCCTTGCTTACTCTTGGCTTTACCTTTC CAACTTTCTTCCTTTTTCCTTTTATATTCCttcctaaattttttaaaata gatattttacaattttctccCTTTAAGTTAATATACAATATACTGAAaag agttttattttttactagATTTATCTTACTACCCCATGATTGTATGATAT TTTAAGATAAACCCCGAAATATACCCCTTTATAATTACACCCCAATATtg tgaaaaaatgaaataatatcaaaaaatacaacaaaaggaaaaatgtgaaa attaacaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000377:135504..149964+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00021039 ID=TCONS_00021039|Name=TCONS_00021039|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14461bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000377:135504..149964+ (Clytia hemisphaerica) TAAAAGAACATGGTTCCAATATGTTTAAGGTAGCGTTTTACCCTTAATCC
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TTCCAACTTTCTTCCTTTTTCCTTTTATATTCCttcctaaattttttaaa
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Ttgtgaaaaaatgaaataatatcaaaaaatacaacaaaaggaaaaatgtg
aaaattaacaa
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00021039-exon-sc0000377-1491911889:135504..135532 | TCONS_00021039-exon-sc0000377-1491911889:135504..135532 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000377 | supercontig | sc0000377:135504..149964 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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