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transcript sequence >TCONS_00021067 ID=TCONS_00021067|Name=TCONS_00021067|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2270bp GAGAATTAAAGAATATTtatttcatcataaagaaatGAGAATGGTTTGCT GTGGTGTGAAAATTATCTGGTTCGCCACACACGGGGAGTAAAATTAAACA gcgaaataattgaaaaatattgcgtgtttattgtgattttttacctctgg aaagtatttttgtattttgcggCAATTGATATTCGAAATATTCACGTTAC GTTAACGCGAGCTGGTAATAAAATTTGCGTTGGTAAAATTAATTGGTTAT CTTTTGAAGCTCTGGCGAAAACTTTTAGTGGACTTTTGATTAATTTGAGT TGGTACACCACTTTGATTGGAGTTGTGAAATTTAATTTATGAAAGTATAA CCACAGATTGGAAAATTCAAGatCAAACTCAGATTCTGCGGAACACTAAA AAATTAcgaaattgaaaagaaacacgAAGAAAAGTTGAGAAGAATAATTG GGAAAAAATGCTGTCGTCTTTGGTACTTTTGATTGGATGCGCATGTTCAT GTCTGGCTGCTCCAGCTATCGACTATATGACAAAATGCGAGCGTACACTG CATACTGAATGTGTTTTACAAATCGGAAGTTCCAAACAATTCGAAGAAAA ATGTCAGCCGGATGAACTACTGAAGTGTTTACGCAATACAATGTTGAGTA ACGTTTGTACCGTAGAAGATTCAGATACATTACCGACCATCAAACAACTA ATAAGTTACGTGgagagaaaattcaaaaaggatccaaaattttgtcaaga aagaagaaaactAAAATCTTTTGTCGAAAGATTGCAATACACATTTAAAG TTCAAGGAGAAGGCATTGAATTTACTGACCCCCGGAACATTCAAGAATTC GGATCCGGATCGGCTGAAAATGGTCAAGTTCCGGATGATACGGAAACTGA TGGAGAAGATgacgatgacgatgatgatAACAAAGATGACATCATCAAGA ATGATatcattaaaaagaatgatggtAGCAAAGAAGCGACGACTataaca aaaacgaaagtggaaaAAAGCATTGAAACAAACTCTGTTAAAAAAGAtag taaattttggaaaaaaacatcaaaGTTGATCAACAGAGGCAAAAATGAAC GAGGGAAAGTACAAAATATTGTCTACTTTGATGACCAGAAAGCGAGTAAG AAAAGGAAACAAAAGGAGGATGAGAAAAGACTTCAAAAAGCATGGCAAGC TTTGAAAATGCGATATCAAAAATggtatgaaaattcaaaatactaTCGGT GATAATTTGTTTTACAAAGGATAAACGATCCGTCGTGTTTAATAAAATGT TACTTAGAAAATAAGATTAGCGGTAAAAAGTTACTCTTCAGGCGATagaa aagagtacaatatagcCAAATACTACAGGGAAGCTACTCAACAATGGTTG TAAAATAAGAATTGCTTGGCATTGGACGGCGAAAAAGCCATGCCACATTT CTGGAATGGTTGAATATTTTAATGTGACTGTTTATTGCCCCAATTATAAT ATGGTTTGTTTTTGCTTAGTCTTCTATGATGTGTACATTGAGGTCAAGCT ATTTACCATATCGCAGCatattaaaaatttagaaaggCATTATGGATTTG GaattaaattattatttttaatttatttgctTTCTTATTGGTTTTCGTGT TCTGTATAATGTGGTGGTACTTGCGCCAGAAATATTTTGGTATTGCCCAT AGAGTTTCTTGGGAGTAAAAAAGTTATCAAGATTTTAATCCCTTTATAGA GTAATTTGTCACAAAAGTGTACAAGCCTTATAAAAACCCCTACCCCAAAA TGCTGCCAAAGCGGTGCAGCACTTTTATCACTACCTCCACCCCCGGTAAT GAAGTATTCATATTCATTAATGTTTGGCTTAGTAAGTTTCCAACGTGTAa ccttttttgtaaataaatagagtagaaaacattgtttttttgctttgaag aaaatttattaGATTATAAATATTTATAGATAATATATTACTATATATTG gataaaattatttctttttttgaaaactgaCATATCTTTGGTCATGAATA TGAATGAGACTGAAAAGCCGTCTCAAAGTTAATATACGGGACAAAAATGA CGGCTAAGAATCTGAATGTAGTAATTTTTGGTGACAAAAAATATctacct tttttcaaaatatatgtcGTAGGACAAAAAAAGGCATTTTAATGTATTAT ATAAAgagaaattagtaaaaaattgcgtttattatttaaaatctattgtt aaaaagtcagaaaaatatAC Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00021067-protein >TCONS_00021067-protein ID=TCONS_00021067-protein|Name=TCONS_00021067-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=264bp
MLSSLVLLIGCACSCLAAPAIDYMTKCERTLHTECVLQIGSSKQFEEKCQ PDELLKCLRNTMLSNVCTVEDSDTLPTIKQLISYVERKFKKDPKFCQERR KLKSFVERLQYTFKVQGEGIEFTDPRNIQEFGSGSAENGQVPDDTETDGE DDDDDDDNKDDIIKNDIIKKNDGSKEATTITKTKVEKSIETNSVKKDSKF WKKTSKLINRGKNERGKVQNIVYFDDQKASKKRKQKEDEKRLQKAWQALK MRYQKWYENSKYYR Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000377:176603..189351- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00021067 ID=TCONS_00021067|Name=TCONS_00021067|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12749bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000377:176603..189351- (Clytia hemisphaerica) GAGAATTAAAGAATATTTATTTCATCATAAAGAAATGAGAATGGTTTGCT
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GTTTGGCTTAGTAAGTTTCCAACGTGTAACCTTTTTTGTAAATAAATAGA
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TAATTTTTGGTGACAAAAAATATCTACCTTTTTTCAAAATATATGTCGTA
GGACAAAAAAAGGCATTTTAATGTATTATATAAAGAGAAATTAGTAAAAA
ATTGCGTTTATTATTTAAAATCTATTGTTAAAAAGTCAGAAAAATATAC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000377:176603..189351- >TCONS_00021067 ID=TCONS_00021067|Name=TCONS_00021067|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=2385bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000377:176603..189351- (Clytia hemisphaerica) TTCAAGGAGAAGGCATTGAATTTACTGACCCCCGGAACATTCAAGAATTC GGATCCGGATCGGCTGAAAATGGTCAAGTTCCGGATGATACGGAAACTGA TGGAGAAGATGACGATGACGATGATGATAACAAAGATGACATCATCAAGA ATGATATCATTAAAAAGAATGATGGTAGCAAAGAAGCGACGACTATAACA AAAACGAAAGTGGAAAAAAGCATTGAAACAAACTCTGTTAAAAAAGATAG TAAATTTTGGAAAAAAACATCAAAGTTGATCAACAGAGGCAAAAATGAAC GAGGGAAAGTACAAAATATTGTCTACTTTGATGACCAGAAAGCGAGTAAG AAAAGGAAACAAAAGGAGGATGAGAAAAGACTTCAAAAAGCATGGCAAGC TTTGAAAATGCGATATCAAAAATGGTATGAAAATTCAAAATACTATCGGT GAAATGCGAGCGTACACTGCATACTGAATGTGTTTTACAAATCGGAAGTT CCAAACAATTCGAAGAAAAATGTCAGCCGGATGAACTACTGAAGTGTTTA CGCAATACAATGTTGAGTAACGTTTGTACCGTAGAAGATTCAGATACATT ACCGACCATCAAACAACTAATAAGTTACGTGGAGAGAAAATTCAAAAAGG ATCCAAAATTTTGTCAAGAAAGAAGAAAACTAAAATCTTTTGTCGAAAGA TTGCAATACACATTTAAAGATGCTGTCGTCTTTGGTACTTTTGATTGGAT GCGCATGTTCATGTCTGGCTGCTCCAGCTATCGACTATATGACAATTCAA GGAGAAGGCATTGAATTTACTGACCCCCGGAACATTCAAGAATTCGGATC CGGATCGGCTGAAAATGGTCAAGTTCCGGATGATACGGAAACTGATGGAG AAGATGACGATGACGATGATGATAACAAAGATGACATCATCAAGAATGAT ATCATTAAAAAGAATGATGGTAGCAAAGAAGCGACGACTATAACAAAAAC GAAAGTGGAAAAAAGCATTGAAACAAACTCTGTTAAAAAAGATAGTAAAT TTTGGAAAAAAACATCAAAGTTGATCAACAGAGGCAAAAATGAACGAGGG AAAGTACAAAATATTGTCTACTTTGATGACCAGAAAGCGAGTAAGAAAAG GAAACAAAAGGAGGATGAGAAAAGACTTCAAAAAGCATGGCAAGCTTTGA AAATGCGATATCAAAAATGGTATGAAAATTCAAAATACTATCGGTGAAAT GCGAGCGTACACTGCATACTGAATGTGTTTTACAAATCGGAAGTTCCAAA CAATTCGAAGAAAAATGTCAGCCGGATGAACTACTGAAGTGTTTACGCAA TACAATGTTGAGTAACGTTTGTACCGTAGAAGATTCAGATACATTACCGA CCATCAAACAACTAATAAGTTACGTGGAGAGAAAATTCAAAAAGGATCCA AAATTTTGTCAAGAAAGAAGAAAACTAAAATCTTTTGTCGAAAGATTGCA ATACACATTTAAAGATGCTGTCGTCTTTGGTACTTTTGATTGGATGCGCA TGTTCATGTCTGGCTGCTCCAGCTATCGACTATATGACAATTCAAGGAGA AGGCATTGAATTTACTGACCCCCGGAACATTCAAGAATTCGGATCCGGAT CGGCTGAAAATGGTCAAGTTCCGGATGATACGGAAACTGATGGAGAAGAT GACGATGACGATGATGATAACAAAGATGACATCATCAAGAATGATATCAT TAAAAAGAATGATGGTAGCAAAGAAGCGACGACTATAACAAAAACGAAAG TGGAAAAAAGCATTGAAACAAACTCTGTTAAAAAAGATAGTAAATTTTGG AAAAAAACATCAAAGTTGATCAACAGAGGCAAAAATGAACGAGGGAAAGT ACAAAATATTGTCTACTTTGATGACCAGAAAGCGAGTAAGAAAAGGAAAC AAAAGGAGGATGAGAAAAGACTTCAAAAAGCATGGCAAGCTTTGAAAATG CGATATCAAAAATGGTATGAAAATTCAAAATACTATCGGTGAAATGCGAG CGTACACTGCATACTGAATGTGTTTTACAAATCGGAAGTTCCAAACAATT CGAAGAAAAATGTCAGCCGGATGAACTACTGAAGTGTTTACGCAATACAA TGTTGAGTAACGTTTGTACCGTAGAAGATTCAGATACATTACCGACCATC AAACAACTAATAAGTTACGTGGAGAGAAAATTCAAAAAGGATCCAAAATT TTGTCAAGAAAGAAGAAAACTAAAATCTTTTGTCGAAAGATTGCAATACA CATTTAAAGATGCTGTCGTCTTTGGTACTTTTGATTGGATGCGCATGTTC ATGTCTGGCTGCTCCAGCTATCGACTATATGACAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00021067-exon-sc0000377-1575043694:188981..189351 | TCONS_00021067-exon-sc0000377-1575043694:188981..189351 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000377 | supercontig | sc0000377:176603..189351 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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