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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00021201 ID=TCONS_00021201|Name=TCONS_00021201|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3948bp
ATAATTTTGTCATCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCa
ataaaaaagacttttgtCGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGG
ACTTTTTTCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTCAGGT
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TATAAATTTTGTCGTACTAAAGTTTAAGTTCATGTAAAATAGTTTTGTCA
TCAGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAATGAAAAAGACT
TTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTTTTCATC
AGTCAAGTCAAGTCAAGTCAGTCTCATTTAATGTAAAGGTTTTTTCTTGT
CAACCAATTCATTGTTAGAAATTTTGTCGTAATAAAGTTTAAGTTCATGT
AAAATAGTTTTGTCGTCTGTCAAGATGTTTATTTGATGTAAGATTTGAAT
ATCAAGTTTCAGTCAGTGGCAGACTCTTTACTGGCAGTCAAATCAAGTTT
CAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGTCAAG
TTTCAGTCATAGTCAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTC
ATCGGTCAAGTCAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCAT
CGGTCAAGTCAAGCTTAGGATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTC
AATGTCAAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAAC
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CGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGAC
AAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCAAGTTTCAGTCAACG
TCAAATAGTTTTGTCGTAAGTCAAGTTTCAGTTAATGTAAAAGAGCTTTG
TCGTCAGTCAAATCAAGTTTCAATCAatataaaagttttttgttgtcagt
caagtcaagtcaagtttcagttaaaatccgggtcataatatttgagaaaa
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ctggaagggtagagttttaacattagacttaagaccttaggtaggatctg
aggatccaaaagtacaagaatggtccaatagcgCTTAGAATATatcctgg
aagtctataaactcctcccgaattgaaatattcgattaaatttaacaaat
agcccaaaagcgactttctcgcccgaactttaaatttaGTAAACAAGGTA
ATAccgaaattctcaatatattttgaccgagagtGTAGAGTAAAAGAGTT
TTGTCGTCAGTAAGTTTGAAATTGTTTAATCATCAGTCAAGCCAAGTTTA
GTCAATTTCaaatagttttttcaaaattcagtcaAGTCAAGTTTTCAGTT
AATGTAAAAGAGTCTATTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTAAAGTAA
AAGAGTTTTGTCGTCAGTCAATTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTT
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AGTTTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTTGTCGTCA
GTCAAGCCAAGTTAAGTTTCAGTCAGAGTGGGAGAGTTTTGTCATCAGTC
AAGTCAAGTTTCAATCAATATAAATGAGTCTATTCGTCAGTCGAGTCAAG
TTTTCAGTTAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCCAGTTTCAGT
CAATGTCAAATAGTTTTATCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTA
AAATAGTTTTTTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTCAAATAGT
TTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGATATTTTCGTCA
GACAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTC
AAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTTTAA
GTCAATGTCAAATAGTTTTGTCAAGTTTCACTCAACGTCAAATAGTTTTG
TCGTAAGTCAAGTTTCAGTTAATGTAAAAGAGCTTTGTCGTCAGTAAATT
CAATTTTCAGTCAGAGTAAAAGAGCTTTGTCGTCAGTCAAATCAAGTTTC
AATCAATATAAAAGGTTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTCAAGTTTCAGT
TAAAATCcgggtcataatatttgagaaaaaaaggaaaattcccaTGAAAT
CTTATAGTCACAAACAATTTCGAAGCGCtctggaagggtagagttttaac
attagacttaagaccttaggtaggatctgaggatccaaaagtacaagaat
ggtccaatagcgCTTAGAATATatcctggaagtctataaactcctcccga
attgaaatattcgattaaatttaacaaatagcccaaaagcgactttctcg
cccgaactttaaatttaGTAAGCAAGGTAATACCGaaattcccaatatat
tttgaccgagagtGTAGAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCTTTAAGTTTGAAA
TTGTTTAATCATCAGTCAAGCCAAGAGTTTAGTCAATTTcaaacagtttt
ttcaaaattcagtcaAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTATTC
GTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTC
AAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTCTCGTCGGTCAAGTCAAG
CTTAGTCAATGTAAACTACTTTTTTCGTCAGACAAGTAAAGTTTCAGCTA
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TTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTTGTCGTCAGTC
AAGCCAAGTTAAGTTTCAGTCAGAGTGGGAGAGTTTTGTCATCAGTCAAG
TCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTTGTCGTCAGTCAAGCCAAGTT
AAGTTTCAGTCAGAGTGGGAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTTTCA
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CGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGACTTTTTTCGTCAGACA
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GGTTTCAGTCAAAGTAAAGCAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAACTTCAG
TcaaagtaaaataattttgtcgTCAGTCAAGTCAGGTTTCAGTCAAAGTA
AAGCAGTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATTGTA
GCCGATGAAAAAACATTGTAAGCTGACTGACAGACAGTTTCGTTATCTAG
GTTTACAAAATGTcagtaaaatataaaaagaaattaaaaaattaaaaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000379:257258..265009- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00021201 ID=TCONS_00021201|Name=TCONS_00021201|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7752bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000379:257258..265009- (Clytia hemisphaerica)
ATAATTTTGTCATCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCA
ATAAAAAAGACTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGG
ACTTTTTTCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTCAGAG
GTCTCATTTAATGTAAGAGTTTTTTATTGTCAACCAATTCATTGTTATAA
ATTTTGTCGTACTAAAGTTTAAGTTCATGTAAAATAGTTTTGTCATCAGT
CAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAATGAAAAAGACTTTTGT
CGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTTTTCATCAGTCA
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AGTTTTTTATTGTCAACCAATTCATTATTATAAATTTTGTCGTACTAAAG
TTTAAGTTCATGTAAAATAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCGAGTTTAGTCA
AGTCGAGTTTCAGTCAATGAAAAAGACTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGT
TTAGTCAGAGTAATGGACTTTTTTCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAGG
TCAGGTCAGAAGTCTCATTTAATGTAAGAGTTTTTTATTGTCAACCAATT
CATTGTTAGAAATTTTGTCGTGATAAAGTATAAGTTCATCTAAAATAGTT
TTGTCGTCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAATGTAAAAGAATATTCTCGTCA
GTCAAGTCGAGTTCAGTCAATTCGAGTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTT
GTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCACTTAACGTAATAGAGTTTTGTCGTCA
GTCAAGTCAAGCTTAGTCAGATTAAGGGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCA
AGTCAAGTCAAGTCAGTCTCATTTAATGTAAAGGTTTTTTCTTGTCAACC
AATTCATTGTTAGAAATTTTGTCGTAATAAAGTTTAATTTCATGTAAAAT
AGTTTTGTCGTCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAAGTAAAAGAATATTGTC
GTCAGTCAAGTCGAGTTCAGTCAATTCGAGTTTCAGTCAATGTAAAATAG
TTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTCTCACTTAATGTAATAGAGTTTTGTC
GTCAGTCAAGTCAAGCTTAGTCAGAGTAAGGGATTTTGTCATCAGTCAAG
TCAAGTCAGTCTCATTTAATGTAAAGGTTTTTTCTTGTCAACCAATTCAT
TGTTAGAAATTTTGTCGTAATAAAGTTTAAGTTCATGTAAAATAGTTTTG
TCGTCTGTCAAGATGTTTATTTGATGTAAGATTTGAATATCAAGTTTCAG
TCAGTGGCAGACTCTTTACTGGCAGTCAAATCAAGTTTCAGTCATAGTCA
ATTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCATAG
TCAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTC
AAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAA
GCTTAGGATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAG
TTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGATATTTTCGTC
AGACAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGT
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AGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCAAGTTTCAGTCAACGTCAAATAGTTTT
GTCGTAAGTCAAGTTTCAGTTAATGTAAAAGAGCTTTGTCGTCAGTCAAA
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AGTTTTAACATTAGACTTAAGACCTTAGGTAGGATCTGAGGATCCAAAAG
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TCCTCCCGAATTGAAATATTCGATTAAATTTAACAAATAGCCCAAAAGCG
ACTTTCTCGCCCGAACTTTAAATTTAGTAAACAAGGTAATACCGAAATTC
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AGTTTGAAATTGTTTAATCATCAGTCAAGCCAAGTTTAGTCAATTTCAAA
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TCTATTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTAAAGTAAAAGAGTTTTGTC
GTCAGTCAATTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTCTCGTCGGTCA
AGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACTACTTTTTTCGTCAGACAAGTAAAGTT
TCAGTTATTGTAAAAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAA
GTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTTGTCGTCAGTCAAGCCAAGT
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AATCAATATAAATGAGTCTATTCGTCAGTCGAGTCAAGTTTTCAGTTAAA
GTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCCAGTTTCAGTCAATGTCAAATA
GTTTTATCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTTT
CGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCGGT
CAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGATATTTTCGTCAGACAAGTCAAGT
TTAAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCA
ATGTCAAATAGTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAA
TAGTTTTGTCAAGTTTCACTCAACGTCAAATAGTTTTGTCGTAAGTCAAG
TTTCAGTTAATGTAAAAGAGCTTTGTCGTCAGTAAATTCAATTTTCAGTC
AGAGTAAAAGAGCTTTGTCGTCAGTCAAATCAAGTTTCAATCAATATAAA
AGGTTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTCAAGTTTCAGTTAAAATCCGGGT
CATAATATTTGAGAAAAAAAGGAAAATTCCCATGAAATCTTATAGTCACA
AACAATTTCGAAGCGCTCTGGAAGGGTAGAGTTTTAACATTAGACTTAAG
ACCTTAGGTAGGATCTGAGGATCCAAAAGTACAAGAATGGTCCAATAGCG
CTTAGAATATATCCTGGAAGTCTATAAACTCCTCCCGAATTGAAATATTC
GATTAAATTTAACAAATAGCCCAAAAGCGACTTTCTCGCCCGAACTTTAA
ATTTAGTAAGCAAGGTAATACCGAAATTCCCAATATATTTTGACCGAGAG
TGTAGAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCTTTAAGTTTGAAATTGTTTAATCAT
CAGTCAAGCCAAGAGTTTAGTCAATTTCAAACAGTTTTTTCAAAATTCAG
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AAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTC
AGTCAATGTCAAATAGTTTTCTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGT
AAACTACTTTTTTCGTCAGACAAGTAAAGTTTCAGCTATTGTAAAATAGT
TTTGTCATCAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAAGTC
AAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTTGTCGTCAGTCAAGCCAAGTTAA
GTTTCAGTCAGAGTGGGAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTTTTCAG
TTAATGTAAAAGAGTCTTGTCGTCAGTCAAGCCAAGTTAAGTTTCAGTCA
GAGTGGGAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTTTCAATCAATATAAAT
GAGTCTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAAAGTAAAATAGTTTT
GTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTTAGTCAATGTAAAATAGTTTTTTCGTCA
GTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGT
CAAGCTTAGTCAATGTAAACGACTTTTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCA
GTTATTGTAAAAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCGAATTTCAGTTAATGT
AAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTCAAATAG
TTTTGTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCG
TCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAAAGTAAAATAATTTTGTCGTCAGTCAA
GTCAGGTTTCAGTCAAAGTAAAGCAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAACT
TCAGTCAAAGTAAAATAATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAGGTTTCAGTCAA
AGTAAAGCAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAACTTCAGTCAAAGTAAAAT
AATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAGGTTTCAGTCAAAGTAAAGCAGTTTTGT
TGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTTTCGTCAATC
AAGTCAAGTTTCAGTCAAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAATTCAA
GTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAG
TCAATGTAAAATAGTTTTTTCGTCAGTCAAGTCAATTTTTCAGTCAATGT
AAAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGACTT
TTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTTAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTC
AGTCAAGTCCAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGT
CAAGTTTTCAGTCAATGTAAAATGGTTTTTTCGTCAGTCAAGTCAAGTTT
TCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAAT
GTAAACGACTTTTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTTAAAGTAAAAGA
GTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGT
CGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGT
CAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCA
AGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTC
AGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAA
GTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAG
AGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTG
TCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAG
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AAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTT
CAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTA
AGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAA
GAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTT
GTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCA
GTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGT
CAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTT
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AAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTT
TTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGT
CAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAA
GTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGC
TTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGT
TTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTA
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TTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCG
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GTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTC
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GCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCA
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TCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTTTCGTCAATAAA
GTCAAGTTTCAGTCAAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGT
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AA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00021201-exon-sc0000379-1575043694:264867..265009 | TCONS_00021201-exon-sc0000379-1575043694:264867..265009 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021201-exon-sc0000379-1575043694:264411..264638 | TCONS_00021201-exon-sc0000379-1575043694:264411..264638 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021201-exon-sc0000379-1575043694:260328..263800 | TCONS_00021201-exon-sc0000379-1575043694:260328..263800 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021201-exon-sc0000379-1575043694:257258..257361 | TCONS_00021201-exon-sc0000379-1575043694:257258..257361 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021201-exon-sc0000379-1510915933:264867..265009 | TCONS_00021201-exon-sc0000379-1510915933:264867..265009 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021201-exon-sc0000379-1510915933:264411..264638 | TCONS_00021201-exon-sc0000379-1510915933:264411..264638 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021201-exon-sc0000379-1510915933:260328..263800 | TCONS_00021201-exon-sc0000379-1510915933:260328..263800 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021201-exon-sc0000379-1510915933:257258..257361 | TCONS_00021201-exon-sc0000379-1510915933:257258..257361 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021201-exon-sc0000379-1491911889:264867..265009 | TCONS_00021201-exon-sc0000379-1491911889:264867..265009 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021201-exon-sc0000379-1491911889:264411..264638 | TCONS_00021201-exon-sc0000379-1491911889:264411..264638 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021201-exon-sc0000379-1491911889:260328..263800 | TCONS_00021201-exon-sc0000379-1491911889:260328..263800 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021201-exon-sc0000379-1491911889:257258..257361 | TCONS_00021201-exon-sc0000379-1491911889:257258..257361 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000379 | supercontig | sc0000379:257258..265009 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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