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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00021205 ID=TCONS_00021205|Name=TCONS_00021205|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4879bp
TGTCATCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCaataaaaa
agacttttgtCGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTTT
TCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTCAGGTCAGAGGT
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TCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTTTTCATCAGTCAAG
TCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTCAGAAGTCTCATTTAATGTAAGAGTTTTT
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TCATCTAAAATAGTTTTGTCGTCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAATGTAAA
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AGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTAGTCAGATTAAGGGAGTTTTG
TCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAATCTCATTTAATGTAAAGGTTTTTT
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TGAATATCAAGTTTCAGTCAGTGGCAGACTCTTTACTGGCAGTCAAATCA
AGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAG
TCAAGTTTCAGTCATAGTCAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTT
TTGTCATCGGTCAAGTCAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTT
GTCATCGGTCAAGTCAAGCTTAGGATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTT
CAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATG
TAAACGATATTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATAGT
TTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGT
CAGACAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCAAGTTTCAGT
CAACGTCAAATAGTTTTGTCGTAAGTCAAGTTTCAGTTAATGTAAAAGAG
CTTTGTCGTCAGTCAAATCAAGTTTCAATCAatataaaagttttttgttg
tcagtcaagtcaagtcaagtttcagttaaaatccgggtcataatatttga
gaaaaaaaggaaaattcccaTGAAATCTTATAGTCACAAACAATTTCGAA
GCGCtctggaagggtagagttttaacattagacttaagaccttaggtagg
atctgaggatccaaaagtacaagaatggtccaatagcgCTTAGAATATat
cctggaagtctataaactcctcccgaattgaaatattcgattaaatttaa
caaatagcccaaaagcgactttctcgcccgaactttaaatttaGTAAACA
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GTTTAGTCAATTTCaaatagttttttcaaaattcagtcaAGTCAAGTTTT
CAGTTAATGTAAAAGAGTCTATTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTAA
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AGTTTTCTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACTACTTTTTTC
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AGTCGAGTTTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTTGT
CGTCAGTCAAGCCAAGTTAAGTTTCAGTCAGAGTGGGAGAGTTTTGTCAT
CAGTCAAGTCAAGTTTCAATCAATATAAATGAGTCTATTCGTCAGTCGAG
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ATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGATATTTT
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AAATTCAATTTTCAGTCAGAGTAAAAGAGCTTTGTCGTCAGTCAAATCAA
GTTTCAATCAATATAAAAGGTTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTCAAGTT
TCAGTTAAAATCcgggtcataatatttgagaaaaaaaggaaaattcccaT
GAAATCTTATAGTCACAAACAATTTCGAAGCGCtctggaagggtagagtt
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tctcgcccgaactttaaatttaGTAAGCAAGGTAATACCGaaattcccaa
tatattttgaccgagagtGTAGAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCTTTAAGTT
TGAAATTGTTTAATCATCAGTCAAGCCAAGAGTTTAGTCAATTTcaaaca
gttttttcaaaattcagtcaAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTC
TATTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGT
CAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTCTCGTCGGTCAAG
TCAAGCTTAGTCAATGTAAACTACTTTTTTCGTCAGACAAGTAAAGTTTC
AGCTATTGTAAAATAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAAGT
CAAGTTTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTTGTCGT
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TTTCAATCAATATAAATGAGTCTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGT
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TTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGACTTTTTTCGTC
AGACAAGTCAAGTTTCAGTTATTGTAAAAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGT
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CAGTTAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTCAAT
TTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTcaaagtaaaata
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TTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTAAAATGGTTTTTTCG
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TCAGTTAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTT
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AGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTT
TGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTC
AGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAG
TCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000379:259598..265002- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00021205 ID=TCONS_00021205|Name=TCONS_00021205|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5405bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000379:259598..265002- (Clytia hemisphaerica)
TGTCATCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAATAAAAA
AGACTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTTT
TCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTCAGAGGTCTCAT
TTAATGTAAGAGTTTTTTATTGTCAACCAATTCATTGTTATAAATTTTGT
CGTACTAAAGTTTAAGTTCATGTAAAATAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCG
AGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAATGAAAAAGACTTTTGTCGTCAGT
CAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTTTTCATCAGTCAAGTTAAG
TCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTCAGAGGTCTCATTTAATGTAAGAGTTTTT
TATTGTCAACCAATTCATTATTATAAATTTTGTCGTACTAAAGTTTAAGT
TCATGTAAAATAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAG
TTTCAGTCAATGAAAAAGACTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCA
GAGTAATGGACTTTTTTCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTC
AGAAGTCTCATTTAATGTAAGAGTTTTTTATTGTCAACCAATTCATTGTT
AGAAATTTTGTCGTGATAAAGTATAAGTTCATCTAAAATAGTTTTGTCGT
CTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAATGTAAAAGAATATTCTCGTCAGTCAAGT
CGAGTTCAGTCAATTCGAGTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTGTCGTCA
GTCAAGTCAAGCTTTCACTTAACGTAATAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGT
CAAGCTTAGTCAGATTAAGGGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTCAAG
TCAAGTCAGTCTCATTTAATGTAAAGGTTTTTTCTTGTCAACCAATTCAT
TGTTAGAAATTTTGTCGTAATAAAGTTTAATTTCATGTAAAATAGTTTTG
TCGTCTGTCAAGTCGAGTTTAGTCAAAGTAAAAGAATATTGTCGTCAGTC
AAGTCGAGTTCAGTCAATTCGAGTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTGTC
GTCAGTCAAGTCAAGCTCTCACTTAATGTAATAGAGTTTTGTCGTCAGTC
AAGTCAAGCTTAGTCAGAGTAAGGGATTTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTC
AGTCTCATTTAATGTAAAGGTTTTTTCTTGTCAACCAATTCATTGTTAGA
AATTTTGTCGTAATAAAGTTTAAGTTCATGTAAAATAGTTTTGTCGTCTG
TCAAGATGTTTATTTGATGTAAGATTTGAATATCAAGTTTCAGTCAGTGG
CAGACTCTTTACTGGCAGTCAAATCAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAA
ATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCATAGTCAAGTT
TCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGTTTC
AGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCAAGCTTAGG
ATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTC
GTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGATATTTTCGTCAGACAAG
TCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTT
CAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGACAAGTCAAGTTTAAGTCAAT
GTCAAATAGTTTTGTCAAGTTTCAGTCAACGTCAAATAGTTTTGTCGTAA
GTCAAGTTTCAGTTAATGTAAAAGAGCTTTGTCGTCAGTCAAATCAAGTT
TCAATCAATATAAAAGTTTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTCAAGTTTCA
GTTAAAATCCGGGTCATAATATTTGAGAAAAAAAGGAAAATTCCCATGAA
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ATGGTCCAATAGCGCTTAGAATATATCCTGGAAGTCTATAAACTCCTCCC
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CGCCCGAACTTTAAATTTAGTAAACAAGGTAATACCGAAATTCTCAATAT
ATTTTGACCGAGAGTGTAGAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTAAGTTTGA
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GTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTC
AATTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTCTCGTCGGTCAAGTCAAG
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CAGTCAGAGTGGGAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTTTCAATCAAT
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TGTTGTCAGTCAAGTCAAGTCAAGTTTCAGTTAAAATCCGGGTCATAATA
TTTGAGAAAAAAAGGAAAATTCCCATGAAATCTTATAGTCACAAACAATT
TCGAAGCGCTCTGGAAGGGTAGAGTTTTAACATTAGACTTAAGACCTTAG
GTAGGATCTGAGGATCCAAAAGTACAAGAATGGTCCAATAGCGCTTAGAA
TATATCCTGGAAGTCTATAAACTCCTCCCGAATTGAAATATTCGATTAAA
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TTTTTTCGTCAGACAAGTAAAGTTTCAGCTATTGTAAAATAGTTTTGTCA
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GTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAAAGTAAAATAGTTTTGTCGTCA
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AGTCAATGTAAACGACTTTTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTTATTG
TAAAAGAGTTTTGTCATCAGTCAAGTCGAATTTCAGTTAATGTAAAAGAG
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GTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCGTCAGTCA
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TTCAGTCAAAGTAAAGCAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAACTTCAGTCA
AAGTAAAATAATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAGGTTTCAGTCAAAGTAAAG
CAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAACTTCAGTCAAAGTAAAATAATTTTG
TCGTCAGTCAAGTCAGGTTTCAGTCAAAGTAAAGCAGTTTTGTTGTCAGT
CAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTTTCGTCAATCAAGTCAA
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CAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCA
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GTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAG
AGTTT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00021205-exon-sc0000379-1575043694:264867..265002 | TCONS_00021205-exon-sc0000379-1575043694:264867..265002 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021205-exon-sc0000379-1575043694:264099..264638 | TCONS_00021205-exon-sc0000379-1575043694:264099..264638 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021205-exon-sc0000379-1575043694:259598..263800 | TCONS_00021205-exon-sc0000379-1575043694:259598..263800 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021205-exon-sc0000379-1510915933:264867..265002 | TCONS_00021205-exon-sc0000379-1510915933:264867..265002 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021205-exon-sc0000379-1510915933:264099..264638 | TCONS_00021205-exon-sc0000379-1510915933:264099..264638 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021205-exon-sc0000379-1510915933:259598..263800 | TCONS_00021205-exon-sc0000379-1510915933:259598..263800 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021205-exon-sc0000379-1491911889:264867..265002 | TCONS_00021205-exon-sc0000379-1491911889:264867..265002 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021205-exon-sc0000379-1491911889:264099..264638 | TCONS_00021205-exon-sc0000379-1491911889:264099..264638 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021205-exon-sc0000379-1491911889:259598..263800 | TCONS_00021205-exon-sc0000379-1491911889:259598..263800 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000379 | supercontig | sc0000379:259598..265002 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
