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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00021493 ID=TCONS_00021493|Name=TCONS_00021493|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2808bp CAATGATTGACAtcatgatataacatagtttgtatattataaaacgtaat atgttgcgcGGCGGAAAATAGAGTCTGAGACAACATCTACCCCCGAAAAA Aactcccgtcttcacgtttgttcctcttagatgaaactcgtcttagacta tagcatagtctagttTCAACCTTTTTGATTTAAACTACTTTTCTGGATTT TTTACAGAACGGATTTCCACGTTGCGTTACAACGACCATGTATTGTAACG AAGTTTGGCTTGATTGGTTTGATGGTTTTAATTTCTCTTATCGTAGGGGG GGGTCCAAAATtacactttttgagtttaaccgtcttttttaaattaattt ttcatgttgattCAGAATTATAACTCCTTTCAAATACAATGATTCCGTAC CCATTGCACATTGAAAAGTTGATAATTGTTTTTAGGAAAGCCTTAATTAT TTAAGGTtaagttaaaattaaaatcacTAGGCTATGTAGATAGCTAATTC ATTTTTCTTGACGAATACAGGGTTCATTCATTCTCCTTGACGAATACAGG GTTCAtccattttccttgaggaatacaagGTTAATCTTTTCTCCTACAGG GTCCATCCATTTTCCTAGAGGTATACAgggttcattcattttccttgagg taTACAGGGTTCAtccattttccttgaggaatacaagGTTAATCCTTTTT CCTACAgggttcattcattttccttgaggaatacagggttcatccatttt ccttgaggaatacaggttTCATCAATTTTCCTTGAGGTATACAgggttca ttcattttccttgaggaatacagagTTCATTTTATTCCTTGACGAATACA GGGTTCGtccattttccttgaggaataaagggttcattcattttccttga ggaatacagggtacattcattttccttgaggaatacagggtacatccatt ttccttgaggaataaagggttcattcattttccttgaggaatacagggta cattcattttccttgaggaatacaagGCTCGTCTATtctccttgaggaat acagggttcatggaatttttcatataattttaattcaaaattttaatcaa cTTCTCAAAGAACCCTTGTTTGAACAGACAGTCATATTTGTAGAAGTCCT TAATAATTAACACCAATAATATTGTAATTAAATCAACAGCTTAAAGgtct aatttatttttaaaaagcattagTTCATCAAATCAAGCAAGTACTTAAGG GATTGATAAAACAATAGCGCCTTTCGATTGGTTCGATAAACAACTATTTG AATGTAGGATTTTCAGATTCTATCTATTCGGTAAAAGGTCTATACATCCT TATGATTTTCATTGTAACTTATCCTTCTGAACGATGATATACGGCATGTT AAAGCCAATATCACTTTTGAATGTCCAATGCGGATAATCATTGCATTTGG AAGAAGTTTACTAGCTCAGgatatttttaacaatttgatttttgattttt acaacTTTGATTATATTCTAAGCAGACAAATTAAATGCAGCTCAGTCCAT GGGGTTGGATCAGTGGATAAAGTACTCAAAACTCTTTGTAATAAGGAATG TATAACCAGATGTTTTGATAAATGGAATCCAAGTACAAGAATCtcctttc aaaaatattgatttttgcaCATTTTTAGTAGGGTAGGATATACGCAAAAA CCGATTTGAAATTCGGAATCAACATGAAAATCTGATCTAAAACAAGTTgt tatcattaaatttttcattcaaagcTCATTCAAATTcgaacattttcaaa ttatcaattttccttGGTTTCAAAGATTTTAGTATAAAAAAACAGCCTCC CATACCAGGCCAAGGGTGAGAGCTATGACAAAACGAAtttcaaattcgga atcagcatgaaaaactgatttaaaaaagatatcacGTCACTAGAAAGCta ttcaaaatggaaaatttcaaaaacattgacTTTTGGCGGTCTTGGACGGT TTTCTGAAAAAAGAGATCTCTGGTAGCCGCCCAGGGGTAAGAGATATGGA AAAACGGATTTTGAATTCGGCATCAGcatgaaaaatcaatttaaagaaga tggttaaacataaaaatgtcctttttcaatcatttttggaCCCCCCCCCT ACATCGCTTTATTTAGCTATTCCATATATATTTGTACGCTTACAACCTAA ATAAGATAACATTAAGGGTAAAGGCTTTACTGGCAAACTGTCGAAggtat tgatttttttaatatactTAAAAGCACTTTCACTTGATATTCCCTTTTGT GGGAAATATTCTTTACCCCCTGAATATCTACTACCCTCATAGGCGGTTTT ATACCATATCGAACTTATCAGAATGAAGAGATTTGTTatcgtaatttcat tgtctttttaaCGAGGGTTGCACttcttcgcatgtttccgacgtagttgc tctattgtcttaaaatCCGTCAGTGGCCTGTTGGGTGaaagttttttgta aaaaagacaGGGCTTTGAAGACACATTCTCACTGGCTATTAATATCTGGT GGTGAAATCGACTCGTGCTGGCTAATTGCTCTGTTATTAATAAAAATGCC CTCTTTTCTCCTAATAAGTTTGGTGGGGGGACCCACCATGAAATAATGAA TACACAATAAATGAAATACACAAGAAGCACTTAATTTTTAGAAcgataaa atgtaatttttgatAATCAAAATAATCTAGAATCCGCGTGTCTATGTAAA TACAATTAttttaatttgtaaataattAACTAAATTTGGAGATTCTAATA TGGTAATA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000388:175259..178066+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00021493 ID=TCONS_00021493|Name=TCONS_00021493|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2808bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000388:175259..178066+ (Clytia hemisphaerica) CAATGATTGACAtcatgatataacatagtttgtatattataaaacgtaat
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TGGTAATA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00021493-exon-sc0000388-1491911889:175259..178066 | TCONS_00021493-exon-sc0000388-1491911889:175259..178066 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00021493-exon-sc0000388-1510915933:175259..178066 | TCONS_00021493-exon-sc0000388-1510915933:175259..178066 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00021493-exon-sc0000388-1575043694:175259..178066 | TCONS_00021493-exon-sc0000388-1575043694:175259..178066 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000388 | supercontig | sc0000388:175259..178066 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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