TCONS_00023350 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00023350
Unique NameTCONS_00023350
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1012

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00023350 ID=TCONS_00023350|Name=TCONS_00023350|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1012bp
GCAGAcatcttattcaattttctgAAATAGTCCTAAGTATATGAAAATAT
cttaataaattttcttttcattgaaaACCTTCCAGCCGAAGATAAAGAAG
CTATTGATTTTCAAGTTCAAGATAAAGAAGGTGATCCTGGAATTGAAAAG
ACAAAATTGCTCTTTGATGCAGCCCTTCCGGAAGAAGATTCGTCGTTTTC
AGATTTGCAAACTGTCTCATCTCTTCAAAAGAAACCAGCTTCCATCAATA
CAAAAAGTACAACATCTCACgaatcaacaaaatcaaacaaagagCTTTCG
TTTCCTATCCAAAAAGATCAAACAATGTCAGAAGATTATATGTTACCTTT
TAAGAAGAAATCGTCTTCAAATGAAAATAAAAAGACAAAATTGCTCTTTG
ATGCAGCCCTTCCGGAAGAAGATTCGTCGTTTTCAGATTTACAAACTGTC
TCACCTCTTCAAAAGAAACCAGCCTCCATCAATACCAAAAGTACAACATC
TCACGAATCAACAAACTCAAACAAAGAGCTTTCGTCTCCTATCAAAAATG
ATCAAACAATGTCAGAAGAAGAAGATATGTTACTTTTTAAGAAGAAATCA
TATCCAAATGAAAGTACGTTTCTTTTTCCACTTGAGCAATCTTTATTAAT
TACATCTGCTGCATCTCCTTTAGAAAGCAAAGCAACTCGGCcaattaatt
ctttttcatcGAGCCAACAAGAACAATCCCATCATAGTGCTGCACCTAAA
GGTAGTTAttactaaatttttgaaaagcgaTAGATAGTATCATGACAATT
GTGCAACAGTTTTCAGTCATTGTGAAATGCCTTAAGGGAAAATATGGCGG
ATTTGGtgcattttctttcttttctctaATGGTTTGTTACTTATTGACGT
TTTACAGATTTTATCATGTTTCCTGTTGTActagaaaaatcattttcaat
tacACATCCTGATTCtccttcagaaaaaaaatcaacttcgcCAATCAATT
CTTTCTCGTCGA
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000452:96383..115749+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00023350 ID=TCONS_00023350|Name=TCONS_00023350|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=19367bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000452:96383..115749+ (Clytia hemisphaerica)
GCAGAcatcttattcaattttctgAAATAGTCCTAAGTATATGAAAATAT cttaataaattttcttttcattgaaaACCTTCCAGCCGAAGATAAAGAAG CTATTGATTTTCAAGTTCAAGATAAAGAAGGTGATCCTGGAATTGGTAAG AAATCGTAAAAAAATCCCTAATAAATGTTGGGAAAACGTAACTTCCACTC aacaatatctttccaacggtaccaaATTTATTAAGATTGAAACATCTCTC TTTCTCCTAGAAAAGACAAAATTGCTCTTTGATGCAGCCCTTCCNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATGGTTCGTCACTAATTGACGTT TTACAGAATTTATCATGTTTCCTGTTGTActagaaaaatcattttcaatt acAGATCCTGATTCTCCttcagaaaaaatatcaacttcgCCAATCAATTC TTTCTCATCGATCCAACAGGAAAAATCATGTCAAAGTTCTTCACCTAAag gaataaatttttaaaaagcgaTAGGAACATAACATAAGTAGTGTTATTTA ACCCCTTTTAAGGCTGCTCTACCCACGAGAATAATAAGATGAATTCGACT AGAATTTTCTGTTTGAACTGTTATTCTTGTGCAAACTACACGcaggaatt gaaaaaaatgtaaattagataatacttgaagaattttcTAATATCCCTTT ATAATGTTGAATTCTTCTTCAAACTACCCATGAGAATAAAAACCACGTGT CCTTTTAAATGTCCGGTAGAAATCAATCATATACTCCACTACAAAGTCTT GTTCTAAGATTGAAGTTTCATtcttgtgaaaatggtaattatagcaCTAT TATACAAGAAGTtcatttcatcttcattttttgaagtttttcaaataaNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCTTTCTCCTAGAAAAGA CAAAATTGCTCTTTGATGCAGCCCTTCCGGAAGAAGATTCGTCGTTTTCA GATTTGCAAACTGTCTCATCTCTTCAAAAGAAACCAGCTTCCATCAATAC AAAAAGTACAACATCTCACgaatcaacaaaatcaaacaaagagCTTTCGT TTCCTATCCAAAAAGATCAAACAATGTCAGAAGATTATATGTTACCTTTT AAGAAGAAATCGTCTTCAAATGAAAATAGTACGTTTCCTTTTCCACTTGA GCCATCTTTATTAATTACATCTGCTGCATCTCCTTTAGAAAGCAAAGCAA CTCGGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNAATGGTTCGTCACTAATTGACGTTTTACAGAATT TATCATGTTTCCTGTTGTActagaaaaatcattttcaattacAGATCCTG ATTCTCCttcagaaaaaatatcaacttcgCCAATCAATTCTTTCTCATCG ATCCAACAGGAAAAATCATGTCAAAGTTCTGCACCTAAaggaataaattt ttaaaaagcgcTAGGAACATGACATCAGTAGTGTTATTTAACCCCTTTTA AGGCCGCTCTACCCACGAGAATAATAAGATGAATTCGACTAGAATTTTCT GTTTGAACTGTTATTCTTGTGCAAACTACACgcaagaattgaaaaaaatg taaattagataatacttgaagaattttcTAATATCCCTTTTAATGTTGAA TTCTTCGTCAAACTACCCATAAGAATAAAAACCACGTGTCCTTTTAAATG TCCGAACTGAAATTAATCATATACTCCACTACAATGTCTTGTTCTAAGAT TGAAGTTTCATtcttgtgaaaatggtaattatagcaCTATTATACAAGAA GTtcatttcatcttcatttttNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTATCATGTTTCCTGTTGTActagaaaaa tcattttcaattacAGATCCTGATTCtccttcagaaaaaaaatcaacttc gcCAATCAATTCTTTCTCGTCGATCCAACAGGAAAAATCATGTCAAAGTT CTTCACCCAAaggaataaatttttaaaaagcgaTAGGAACATGACATCAG TAGTGTTATTTAACTCTTTTTAAGGCCGCTCTACACACGAGAATAATAAG ATGATTTCGACTAGAATTTTCTGTTTGAACTGTTATTCTTGTGCAAACTA CACAcaggaattgaaaaaaatgtaaattagataatacttgaagaattttc TAATATCCATTTTAATGTTGAATTCTTCTTCAAACTACCCATAAGAATAA AAACCACGTGTCCTTTTAAATGTCCGAACTGAAATCAATCATATACTCCA CTACAATGTCTTGTTCTAAGATTGAAGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNATGTCCGAACTGAAATCAATCATATACTCCACTACA ATGTCTTGTTCTAAGATTGAAGTTTCATtcttgtgaaaatggtaattata gcaCTATTATACAAGAAGTccatttcatcttcattttttgaagtttttca aataactttttatttaaaattattccactcaacaatatctttccaacggt accaaAATTATTAAGATTGAAACATCTCTCTTTCTCCTAGAAAAGACAAA ATTGCTCTTTGATGCAGCCCTTCCGGAAGAAGATCCGTCGTTTTCAGATT TGCAAACTGTCTCACCTCTTCAAAAGAAACCAGCCTCCATCAATACACAA AGTACAACATCTCACgaatcaacaaaatcaaacaaagagCTTTCGTCTCC TATCCAAAAAGATCAAACAATGTCAGAAGAAGAAGATATGTTACCTTTGA AGNTAACTCTTTTTAAGGCCGCTCTACACACGAGAATAATAAGATGAATT CGACTAGAATTTTCTGTTTGAACTGTTAGTCTTGTGCAAACTACACGCAG GAATTGAAAACAAATGTAAATTAGATAATACTTAAAGAATTTTCTAATAT CCCCTTTAATGTTGAATTCTTCTTCAACTACCCATAAGAATAAAAACCAC GTGTCCTTGTAAATGTCCGAACTGAAATCAATCATATACTCCACTACAAT GTCTTGTTCTAAGATTGAAGTTTCATtcttgtgaaaatggtaattatagc aCTATTAAACAAGAAATCcaattcatcttcattttttgaagttttccaaa taactttttatttaagaTTATTCCACTCaacaatatctttccaacggtac caaATTTATTAAGATTGAAACATCTCTCTTTCTACTAGAAAAGACAAAAT TGCTCTTTGATGCAGCCCTTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCTCAC gaatcaacaaaatcaaacaaagagCTTTCGTCTCCTATCCAAAAAGATCA AACAATGTCAGAAGAAGAAGATATGTTACCTTTTAAGAAGAAATCATCTC CAAATGAAAGTACGTTTCTTTTTCCACTTGAGCAATCTTTATTAATTACA TCTGCTGCATCTCCTTTAGAAAGCAAAGCAACTCGGCcaattaattcttt ttcatcAACCCAACAAGAACAATCCCATCATAGTGCTGCACCTAAAGGTA GTTAttactaaatttttgaaaagcgaTAAATAGTATCATGACAATTGTGC AACACTTTTCAGTCATTGTGAAATGCCTTAAGGGAAAATATGGCGGATTT GGtgcattttgtttcttttctctaATGGTTTGTCACTAATTGACGTTTTA CAGAATTTATCATGTTTCCTGTTGTActagaaaaatcattttcaataaCA CATCCTGATTCTCCTTcagaaataaaatcaacttcGCCAATCAATTCTTT CTCGTCGATCCAACAGGAAAAATCATGTCAAAGTTCTTCACCTAAaggaa taaatttttaaaaagcgaTAGGAACATGACATCAGCAGTGTTATTTAACC CTTTTTAAGGCCGCTCTACACACAAGAATAATAAGATGAATTCGACTAGA ATTTTCTGTTTGAACTGTTATTCTTGTGCAAACTGCACGcaggaattgaa aaaaaatgtaaattagataatacttgaaaaattttctaatatCCCTTTTA ATGTTGAATTCTTCTTCAAACTACCCATAAGAATAAAAACCACGTGTCCT TTTAAATGTCCGAACTGAAATCAATCATGTACTCCACTTCAATGTCTTGT TCTAAGATTGAAGTTTCATTCTTGtgaaaatctatatattaatacgctta aacgtgtgtgtttacaaggttttgtaaaaagttttcgaaaatctaacaaa gctctacaaagcctcctcttcatggcgttgaaccatcatctttttgcact ttaagcagatttcctaccactagactaaatTTGAGACACCAAtatgctat tttctattcaccaagtttggagcttgatcagttaaaatcaaccttctttc caaatttcttttgtcaatttaaagaattcttattcagatattctttaaaa ctttctgtttacaatagcggctccctatcactttcaaaactttttaaaac atttttatataatCTTTTGTCCCGGTTTCAACTTTggtttttttgaagaa tgtgcaTTCTTCTGAACCAGTAAGCCAACTGTGGCTTGCATAAAATTAGT TACTTCATTCAAGGATATAGTAAGAGtgtctttcaaactttcactttgaa attgtctttctaatctatatattaatacgcttaaacgtgtgtgtttacaa cgttttgtaaaaagttttcgaaaatctaacaaagctctacaaagcctcct cttcatggcgtTGAACCATCATCTTTTTTCTCCTTAAGCAGATTTCccac cactagactaactttgagaccccaagatactattttctattcaccaacTT TGGAGCTTGatggtttttttctgtttacaatagcggctcccttatcactt tcaaaacttttcaaagtctttcaaagtcaccctcgaatgtccaactacga tggctagccacgatggctaagacgatctaaaatatacttttgctaagtca tttatttaattgtggtttaaaattgcaatgcaatgttaattttttttctc ttttatttcctaaaatcaaaatcaaatcatcgaTCCTTTCCGTTAGAATT TTGTAGTGATTCACTGGATTGGTtcacgcagcgtgcgacgctgcgcatac ggctagtggTAATTATAGCACTATTAAACAAGAAggtcatttcattttca ttttttgaagtttttcaaataactttttatttaaaattattccgctcaac aatatctttccaacggtaccaaATTTGTTAAGATTGAAACATTCCTTAAA TGGTTACAGCCGAAACAAAAAAGATAAGAATACATTGATTTGATAATTTC TTGTTTTGTTTCTGTTTCTAGGCATGTCAATATGGTATCAGCCAAGAGCG TTTAAGAAGAAAACAATAATGAGTGTCCTTTATCTTGGACACGATATTGT CGTTGGTAGAGAAAGCCTTTCCGAATGTGATGACAATAAGATGGTAAAAC TTTCTggactgaaaatcaaacaagcAAAAGAAATACTAAAAACTATGAGG AAAAAATATAATAAGGAAAGTGACCACACATTGTTTCAAGCCTTTTATGA AAAGGCAAAATTGCTCTTTGATGCAGCCCTTCCGGAAGAAGATCCGTCGT TTTCATATTTGCAAACTGTCTCACCTCTTCAAAAGAAACCAGCCTCCATC AATACACAAAGTACAACATCTCACgaatcaacaaaatcaaacaaagagCT TTCGTCTCCTATCCAAAAAGATCAAACAATGTCAGAAGAAGAAGATATGT TACCTTTGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNAATTACATCTGCTGCATCTCCTTTAGAAAGCAAAGCAACTCGG CcaattaattctttttcatcGACCCAACAAGAACAATCCCATCATAAGTG CTGCACCTAAAGGTAGTTAttactaaatttttgaaaagtgatagATAGTA TCATGACATTTGTGCAACACTTTTCAGTCATTGTGAAATGCCTTAAGGGA AAATATGGCGGATTTAGtgcattttgtttcttttctctaATGGTTTGTCA CTAATTGACCTTTTACAGAATTTATAATGTTTCCTGTTGTActagaaaaa tcattttcaattacAGATCCTGATTCtccttcagaaaaaaaatcaacttc gcCAATCAATTCTTTCTCGTCGATCCAACAGTAAAAATCATGTCAAAGTT CTTCACCTAAaggaataaatttttaaaaagtgataggAACATGACATCAG TAGTGTTATTTAACTCTTTTTAAGGCCGCTCTACACAcgagaataataaa atgaattggactaaaattttctgtttgaacTGTTATTCTTGTGCAAACTA cacgcagaaatttaaaaaaaaatgtaaattagataatacttgaagaattt tcTAATATCCCTTTTAATGttgaattctttttcaaactacCCATAAGAAT AAAAACTACGTGTCTTTTTAAATGTCCGAACTGAAATCAATCATATACTC CACTACAATGTCTTGTTCTAAGATTGAAGTTTCATtcttgtgaaaatggt aattatagcaCTATTANTTTTCAGTCATCGTGATATGCCTTAAGGGAAAA TATGGTGGATTTGGtgcattttgtttcttttctctaATGGTTTGTCACTA ATTGACGTTTTACAGAATTTATCATGTTTCCTGTTGTActagaaaaatca ttttcaattacACATCCTGATTCtccttcagaaaaaaaatcaacttcgcT TATCAAATCTTTCTTGTCGATCCAACAGGAAAAATCATGTCAAAATTCTT CACCTAAaggaataaatttttaaaaagcgaTAGGAACATGACATCAGTAG TGTTATTTAACCCTTTTTAAGGCCGCTCTACACACGAGAATAATAAGATG AATTCGACTAGAATTTTCTGTTTGAACTGTTATTCTTGTGCAAACTGCAC GcaggaattgaaaaaaattgtaaattagataatacttgaagaattttcTA ATATCCCTTTTAATGTTGAATTCTTCTTCAAACTACCCATAAGAATAAAA ACCACGTGTCCTTTTAAATGTCCGAACTGAAATCAATCATATACTCCACT ACAATGTCTTGTTCTAAGATTGAAGTTTCATtcttgtgaaaatggtaatt atagcaCCATTAAACAAGAAGTtcatttcatcttcattttttgaagtttt tcaaataactttttatttaaaattatctcactcaacaatatctttccaac ggtaccaaATTTATTAAGATTCAAACATCTCTCTTTCTACTAGAAAAGAC AAAATTGCTCTTTGATGTAGCCCTTCCGGAAGAAGATTCGTCGTTTTCAG ATTTGCAAACTGTCTCACCTCTTCAAAAGAAACCAGCCTCCATCAATACA AAAAGTACAACATCTCACgaatcaacaaaatcaaacaaagtgCTTTCGTC TCCTATCCAAAAAGATCAAACAATGTCAAAAGAAGAAGATATGTTACCTT TTAAGAAGAATTCATCTCCAAATGAAAGTACGTTTCCTTTTCCACTTGAG CAATCTTTATTAATTACATCTGCTGCATCTCCTTTAGAAAGCAAAGCAAC TCGGCCAATTAATTCTTTTTCGTCGACCCAACAAGAACAATCCCATCATA GTGCTGCACCTAAAGGTAGTTAttactaaatttttgaaaagcgaTAGATA GTATCATGACAATTGTGCAACAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGATCCAACAGGAAA AATCATGTCAAAGTTCTTCACCTAAaggaataaatttttaaaaagcgaTA GGAACATGACATCAGTAGTGTTATTTAACCCTTTTTAAGGCCGCTCTACA CACAAGAATAATAAGATGAATTCGACTAGAATTTTATGTTTGAACTGTTA TTCTTGTGCAAACTGCACGcaggaattgaaaaaaaatgtaaattagataa tacttgaagaattttcTAATATCCCTTTTAATGTTGAATTCTTCTTCAAA CCACCCATAAGAATAAAAACCACGTGTCCTTTTAAATGTTAGAACTGAAA TCAATCATATACTCCACTACAATGTCTTGTTCTAAGATTGAAGTTTCATt cttgtgaaaatggtaattatagcaCTATTAAACAAGAAGTTCATNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA AGAAGTtcatttcatcttcattttttgaagtttttcaaataactttttat ttaaaattattccactcaacaatatctttccaacggtaccaaATTTATTA AGATTCAAACATCTCTCTTTCTACTAGAAAAGACAAAATTGCTCTTTGAT GCAGCCCATCCGGAAGAAGATTCGTCGTTTTCAGATTTGCAAACTGTCTC ACCTCTTCAAAAGAAACCAGCCTCCATCAATACAAAAAGTACAACATCTC ACgaatcaacaaaatcaaacaaagagCTTTCGTCTCCTATCCAAAAAGAT CAAACAATGTCAGAAAAAGAAGATATGTTTCCTTTTAAGAAGAAATCATC TCCAAATGAAATTGCGTTTCCTTTTCCACTTGAGCAATCTTTATTAAGTA CATCTGCTGCATCTCCTTTAGAAAGCAAAGCAACTCGGCAGATTAATTCT TTTTCATCGACCCAACAAGAAGAATCCCATCATAGTGCTGCACCTAAAGG TAGCTAttactaaatttttgaaaagcgaTAGATAGTATCATGACAATTGT GCAACACTTTTCATTCATTGTGAAATGCCTTAAGGGAAAATATGGCGGAT TTGGtgcattttctttcttttctctaATGGTTTGTCACTAATTGACGTTT TACAGAATTTATCATGTTTCCTGTTGTActagaaaaatcattttcaatta cACATCCTGATTCtccttcagaaaaaaaatcaacttcgcCAATCAATTCT TTCCCATCGATCCAACAGGAAAAATCATGTCAAAGTTCTTCACCTAAagg aataaatttttaaaaagtgataggAACATGACATCGGTAGTGTTATTTAA CCCTTTTTAAGGCCGCTCTACACACGAGAATAATAAGATGAATCCGACTA GAATTTTCTGTTTGAACTGTTATTTTTGTGCAAACTACACGcaggaattg aaaaaaaaatgtaaattagaTTATACTTGAAGAATTTTCTAATATCCCTT TTAATGTTGAATTCTTCTTCAAACTACCCATAAGAATAAAAACCACGTGT CCTTTTAAATGTCCGAACTGAAATCAATCATATACTCCACTACAATGTCT TGTTCTAAGATTGAAGTTTCATtcttgtgaaaatggtaattatagcaCTA TTATACAAGAAGTtcatttcatcttcattttttgaagtttttcaaataac tttttatttaaaattattcaactcaacaatatctttccaaaagtaccaaa tttattaaaattgaaACATCTCTCTTTCTACTAGAAAAGACAAAATTGCT CTTTGATGCAGCCCTTCCGGAAGAAGATTCGTCGTTTTCAGATTTACAAA CTGTCTCACCTCTTCAAAAGAAACCAGCCTCCATCAATACCAAAAGTACA ACATCTCACGAATCAACAAACTCAAACAAAGAGCTTTCGTCTCCTATCAA AAATGATCAAACAATGTCAGAAGAAGAAGATATGTTACTTTTTAAGAAGA AATCATATCCAAATGAAAGTACGTTTCTTTTTCCACTTGAGCAATCTTTA TTAATTACATCTGCTGCATCTCCTTTAGAAAGCAAAGCAACTCGGCcaat taattctttttcatcGAGCCAACAAGAACAATCCCATCATAGTGCTGCAC CTAAAGGTAGTTAttactaaatttttgaaaagcgaTAGATAGTATCATGA CAATTGTGCAACAGTTTTCAGTCATTGTGAAATGCCTTAAGGGAAAATAT GGCGGATTTGGtgcattttctttcttttctctaATGGTTTGTTACTTATT GACGTTTTACAGATTTTATCATGTTTCCTGTTGTActagaaaaatcattt tcaattacACATCCTGATTCtccttcagaaaaaaaatcaacttcgcCAAT CAATTCTTTCTCGTCGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_013129XLOC_013129Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00023350-exon-sc0000452-1491911889:96383..96527TCONS_00023350-exon-sc0000452-1491911889:96383..96527Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00023350-exon-sc0000452-1510915933:96383..96527TCONS_00023350-exon-sc0000452-1510915933:96383..96527Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00023350-exon-sc0000452-1575043694:96383..96527TCONS_00023350-exon-sc0000452-1575043694:96383..96527Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00023350-exon-sc0000452-1491911889:98027..98260TCONS_00023350-exon-sc0000452-1491911889:98027..98260Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00023350-exon-sc0000452-1510915933:98027..98260TCONS_00023350-exon-sc0000452-1510915933:98027..98260Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00023350-exon-sc0000452-1575043694:98027..98260TCONS_00023350-exon-sc0000452-1575043694:98027..98260Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00023350-exon-sc0000452-1491911889:115117..115749TCONS_00023350-exon-sc0000452-1491911889:115117..115749Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00023350-exon-sc0000452-1510915933:115117..115749TCONS_00023350-exon-sc0000452-1510915933:115117..115749Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00023350-exon-sc0000452-1575043694:115117..115749TCONS_00023350-exon-sc0000452-1575043694:115117..115749Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000452supercontigsc0000452:96383..115749 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0.0876101 1.57205 2.20599 0 0.336311 0 0 0.0472649 0.208504 0.290968 0 0.0699562 0 0.21537 0.19674 0.388309 0.434006 0.976015 0.161379 0.554668 0.210693 0 0.318057 0.0642245 0.228996 0.510058 0.177651 0.532901 0.391996
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00023350 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top