TCONS_00024133 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00024133
Unique NameTCONS_00024133
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length3710

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00024133 ID=TCONS_00024133|Name=TCONS_00024133|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3710bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000476:89722..124761-

Legend: exon
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>TCONS_00024133 ID=TCONS_00024133|Name=TCONS_00024133|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=35040bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000476:89722..124761- (Clytia hemisphaerica)
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TCONS_00024133-exon-sc0000476-1491911889:112060..112306TCONS_00024133-exon-sc0000476-1491911889:112060..112306Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00024133-exon-sc0000476-1491911889:111702..111805TCONS_00024133-exon-sc0000476-1491911889:111702..111805Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00024133-exon-sc0000476-1491911889:92900..92941TCONS_00024133-exon-sc0000476-1491911889:92900..92941Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00024133-exon-sc0000476-1491911889:92486..92579TCONS_00024133-exon-sc0000476-1491911889:92486..92579Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00024133-exon-sc0000476-1491911889:91668..92012TCONS_00024133-exon-sc0000476-1491911889:91668..92012Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00024133-exon-sc0000476-1491911889:90960..91100TCONS_00024133-exon-sc0000476-1491911889:90960..91100Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00024133-exon-sc0000476-1491911889:89722..90127TCONS_00024133-exon-sc0000476-1491911889:89722..90127Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000476supercontigsc0000476:89722..124761 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 6.85217e-10 0 0.0324477 0.278155 0.450974 1.1145 0.991805 0 1.07315 8.59542e-05 0.608031 109.964 100.351 0.00601223 0.000209718 0 1.64417e-06 2.52755 3.75626 0.614464 1.11025 0 0 0.166911 0 0.147727 0.228499 0 0.271565
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00024133 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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