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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00025544 ID=TCONS_00025544|Name=TCONS_00025544|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1845bp TCGAGTTTTAAGTTTCAGATCCGTAACAAGTTCAATCGTATCACGAAAAT CCAGTGCCAAGAGTGTCGGAAGTAATCGAAGTAAAGGCACCAGTCGATCT TTTACAACCACTCGTAGTTACACTACCAACCGTAGCAATGGAACTGTTAC ATCCCAAAGCAGCTACATCAAGAAAAATTCCGGAAATTTTGACGGTAGTA ATGATCGCTCTCGCCGAAAATCATCGTTGCAACGAAAATCATCGGCTTCG AGCCGTAGAGAACAACTCATAGCAGATTTTTATCGAGATTTGGAAGAACT AGACGAGGAACGAAGTTGTTCCGACTCTTccgatgatgaaaatgatagcC GCGGAAACGGAAGTCGGaatcgaaataaaaagaaattaaagaaaggACGA ATAGAAGTAGAGGAAGTCAAAAGTCATCAACGTGTCCAAGAATATTTGAT GAAACTCGAACATACAGAACCCCCGGAAATTTTTGAGGAGGACGAGGGAA TTCGTTCGGATATGTCAGACGGTAGATTAGGCTCGTCTTATAATAGTAAC TACAGTAACGATATCCCTATGGAAACTAATAAAAATGATAACAATAATGG CGGACGTAAAAGTGAACCGAGATACATAAAACGACCGAACCCTCCCGATA ATATGATCGCTGATTTGGAAGATTCACCGAGAACGCACCGACTTAAAGTT CGGGACGAATACCGAAAATCGCGAAACGATAAACAAGACTCTAATAAATA TGACGTCAATAAAAATAACGTCGGAAAGAAAACTCGTTCTGCAAATTACA CGCCTCGAGTGTTACCCCAACATCCAAAAGAAATCGAACTGATTGATAAA AATTTACGTGAAAGTTTTAATAATAAACGAAAACCGAGTAATAACGACTA TAAACGAGTTTCGGTTCACGAAGACTTATATATGAACGATAGTGGTAGCG AATCATCCTGTTCAACAGATTCGGCACACGGTTCAACTCACTCCATCTCT ACCGTTAGTTCCATCTCAGTAGCAcagaaacaccaaaacaaacaaattca tCAGTTAAGTTTTAAAACAACGGTACCCAAAAATTTTATACCAggacaac aacaaaaacatatACTGGACTCACAACGTAAAAAGACAAATCGAAAACcg aaaaaagtttcattttgttTCAGAGGTATTCCTTTCAGAGTTTACAATAA TACACCGAGAACTCATAGGGCGTTAGCTCACGCAGGGTGTATTGCCCTCA TTATTCCCGCCCCTGGTAATCACAAATGTAGACATTAACTTTTCGctata cacgtctttttttttaaagaaactagttttaccaagcagcctcaatgttt cttaagaaatcggccttttgagctttaaatgtttcttacatgtttctaaa ctttttgacataattagccttggaaggttcttataaaaaaacgaattaaa aaatgttattttctcattctcagcctcagcatgtttcttagatatttctt agtttttaggcattctgagcctcatgtttcttaaaagtgtgtttcttaaa aaaaaaaagacgtgtagaAGAGTATTGTTTAAATCATATGATGTTGCAAT GTTGAACCAAAGAACATGGGCTTCCTAGCTCGGACATTATATTTGTACTG GACTGGtttaaattattcaaaatagtattttttttaagttttgtgaATCT TAATTAAAACGCACTTTTAGTTCtgttcaataaaaaaacttcttttttta agaaaatgaagacaCAAAAATGACCTAAAAAGAGTCCTACTATTGCCTTC TTCAAAAAGAGTTTTCTCTAGAGTTCAGGCCTAGAATACACGCAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000539:78724..88323+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00025544 ID=TCONS_00025544|Name=TCONS_00025544|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9600bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000539:78724..88323+ (Clytia hemisphaerica) TCGAGTTTTAAGTTTCAGTAAGTATTCATTATGTCAAATTCTTTGAGGTC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00025544-exon-sc0000539-1491911889:78724..78740 | TCONS_00025544-exon-sc0000539-1491911889:78724..78740 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00025544-exon-sc0000539-1491911889:86496..88323 | TCONS_00025544-exon-sc0000539-1491911889:86496..88323 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00025544-exon-sc0000539-1510915933:86496..88323 | TCONS_00025544-exon-sc0000539-1510915933:86496..88323 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00025544-exon-sc0000539-1575043694:86496..88323 | TCONS_00025544-exon-sc0000539-1575043694:86496..88323 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000539 | supercontig | sc0000539:78724..88323 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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