TCONS_00025631 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00025631
Unique NameTCONS_00025631
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1467

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00025631 ID=TCONS_00025631|Name=TCONS_00025631|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1467bp
tctacatggttTTATTTCTGCGTCGGCAAATTTGATTCCAGGCAGAGCCA
AAGCTTACCAGAAAATCTACAATACTTATTTTGATTCGATTTTAACTCTG
CTGTGATTTGATTGCAAATATCACTTACTTGAAGTTTCATTTTAGTGGTC
GCACATTTTAACCAGAAATATACTTGCCTGGATTTGAATTTATGAAATAT
GGAGTCACTGATAATTTCCAAAAACAAATACTAGCAACTCAAATGGCTTG
AAAGAATTTCGAGATTTTCCGATTTCGCAATCAGGAAACAGGAGgtaaaa
tatcatatttccatCATCGAATGTATCTTAATCATAAAACTTCCAGAAGC
ACCAATCCgaattcaaaagatttttacagAAGAATCATACGTAAAGAGAA
TCAAAAATCATAATCGAATAATTCTACAGATAACAGATAACAGagtagaa
gaagaaaaattccaCCATGGGAAATCATACAAGTACTGGGAACGAGACGA
CAAAAGCACCTTGCACAACTGCATTCACTACTGGGAAACTAGACATCACC
AGTGGACAACGTGCAATCCTAATCGCTATTGATTTGAGCATCCTTTTCGT
CAATCTGTGTGCAAATGTACTCTCTATATACGCTTTAGTGAAGTCGCAAC
AAATCAAACGTAGACCTTCTATTTCATTGTTGGTCTATCTTTGTATGAGT
GATTGTTGTTTTGCCATCACAGCACAAACTTTATTTGCTGTAAAGATCTT
CCATCCAGAACTGCCATGCTCTTTTGACCTTATAGTGGAATTTTCATCAT
CTGTTCTAGCTGATTTATCGCTTTGTTTAGTGGTGCTTATAGCGATCTCC
CGGTACATTCATACAAGACACATGATACGCGTAAAGCAAATTATCACCCA
TACACGAGTCAACATCGCTTTTTTGTTGGCTTTTATCGTAGCTGGATCAA
TGTCTTTAATATCATTGTTAGCTGATAGTAATGGGGATGTCGACGCTTAC
CTACAGACAGAGATTTTCCAGACTTTTATTGGCGTTCTTTTAATCGTGCT
GGTTGTATTGATATACAGGCGTACAGAGCTTGTTGCCAAACGACGTAAAG
CCGTTTCAAGCTACATGATGCATTATACGGCATATTCAGAGAAAGTTTTA
CGTAAAATCATGTTGTCTACTTTATGTACCCTGCTGCCGCTTAGAATCCC
GTTTTTCTGTTCAACCGTCATCAAAGCCGTCGTGTCAGACCGAAGTGGCC
GCCGTCTATCTTGGTGGATGCAATTTACACATTTAGGGTGTTACGCCCTT
TTTTGTTTGAGTGCGGGCGCCAACGCCCTCATCTTCTTGTATAATAATAG
GCACGCAAGTAAATTGATTCGATTTCAATGGGAGAAGTTTACGATCTTCC
TCGGTGTTCGGAAGCAAGGTAAAATGCCAACTTTGGAAATACGTCTCCCc
agtttgaccaaaatttg
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000541:148357..165077+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00025631 ID=TCONS_00025631|Name=TCONS_00025631|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16721bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000541:148357..165077+ (Clytia hemisphaerica)
tctacatggttTTATTTCTGCGTCGGCAAATTTGATTCCAGGCAGAGCCA AAGCTTACCAGAAAATCTACAATACTTATTTTGATTCGATTTTAACTCTG CTGTGATTTGATTGCAAATATCACTTACTTGAAGTTTCATTTTAGTGGTC GCACATTTTAACCAGAAATATACTTGCCTGGATTTGAATTTATGAAATAT GGAGTCACTGATAATTTCCAAAAACAAATACTAGCAACTCAAATGGCTTG AAAGAATTTCGAGATTTTCCGATTTCGCAATCAGGAAACAGGAGgtaaaa tatcatatttccatCATCGAATGTATCTTAATCATAAAACTTCCAGAAGC ACCAATCCgaattcaaaagatttttacagAAGAATCATACGTAAAGAGAA TCAAAAATCATAATCGAATAATTCTACAGATAACAGATAACAGagtagaa gaagaaaaattccaCCATGGGAAATCATACAAGTACTGGGAACGAGACGA CAAAAGCACCTTGCACAACTGCATTCACTACTGGGAAACTAGACATCACC AGTGGACAACGTGCAATCCTAATCGCTATTGATTTGAGCATCCTTTTCGT CAATCTGTGTGCAAATGTACTCTCTATATACGCTTTAGTGAAGTCGCAAC AAATCAAACGTAGACCTTCTATTTCATTGTTGGTCTATCTTTGTATGAGT GATTGTTGTTTTGCCATCACAGCACAAACTTTATTTGCTGTAAAGATCTT CCATCCAGAACTGCCATGCTCTTTTGACCTTATAGTGGAATTTTCATCAT CTGTTCTAGCTGATTTATCGCTTTGTTTAGTGGTGCTTATAGCGATCTCC CGGTACATTCATACAAGACACATGATACGCGTAAAGCAAATTATCACCCA TACACGAGTCAACATCGCTTTTTTGTTGGCTTTTATCGTAGCTGGATCAA TGTCTTTAATATCATTGTTAGCTGATAGTAATGGGGATGTCGACGCTTAC CTACAGACAGAGATTTTCCAGACTTTTATTGGCGTTCTTTTAATCGTGCT GGTTGTATTGATATACAGGCGTACAGAGCTTGTTGCCAAACGACGTAAAG CCGTTTCAAGCTACATGATGCATTATACGGCATATTCAGAGAAAGTTTTA CGTAAAATCATGTTGTCTACTTTATGTACCCTGCTGCCGCTTAGAATCCC GTTTTTCTGTTCAACCGTCATCAAAGCCGTCGTGTCAGACCGAAGTGGCC GCCGTCTATCTTGGTGGATGCAATTTACACATTTAGGGTGTTACGCCCTT TTTTGTTTGAGTGCGGGCGCCAACGCCCTCATCTTCTTGTATAATAATAG GCACGCAAGTAAATTGATTCGATTTCAATGGGAGAAGTTTACGATCTTCC TCGGTGTTCGGAAGCAAGGTAAAAGTACgttatcattttttttctattct ttatttctttattcCTCCCCGTAACTCAAACTTTATCCTTATTCTGAAAG GGCTCCTAGTAGATTAGGCTAGGCAGATTCATGTATTTCCTTTGTTAAGG TATGTCACAAATCTGACGTATTACAATGACTGTAGGGGGGGTAATATGAG AGGAAACCTAACATTAAAGTATTTTAATAGCACATTTTCTCAACAAAAAC CTTTGCATCCCAAAGATTCTTATATAGCTATTTGactatgaaaatttaat attcGTCCATAAGTGGTGCACCTTCCAATCCCCCCTAGCTGTGAGCNTAT TTCATTGTTGGTCTATCTTTGTATGAGTGATTGTTGTTTTGCCATCACAG CACAAACTTTATTTGCTGTAAAGATCTTCCATCCAGAACTGCCATGCTCT TTTGACCTTATAGTGGAATTTTCATCATCTGTTCTAGCTGATTTATCGCT TTGTTTAGTGGTGCTTATAGCGATCTCCCGGTACATTCATACAAGACACA TGATACGCGTAAAGCAAATTATCACCCATACACGAGTCAACATCGCTTTT TTGTTGGCTTTTATCGTAGCTGGATCAATGTCTTTAATATCATTGTTAGC TGATAGTAATGGGGATGTCGACGCTTACCTACAGACAGAGATTTTCCAGA CTTTTATTGGCGTTCTTTTAATCGTGCTGGTTGTATTGATATACAGGCGT ACAGAGCTTGTTGCCAAACGACGTAAAGCCGTTTCAAGCTACATGATGCA TTATACGGCATATTCAGAGAAAGTTTTACGTAAAATCATGTTGTCTACTT TATGTACCCTGCTGCCGCTTAGAATCCCGTTTTTCTGTTCAACCGTCATC AAAGCCGTCGTGTCAGACCGAAGTGGCCGCCGTCTATCTTGGTGGATGCA ATTTACACATTTAGGGTGTTACGCCCTTTTTTGTTTGAGTGCGGGCGCCA ACGCCCTTATCTTCTTGTATAATAATAGGCACGCAAGTAAATTGATTCGA TTTCAATGGGAGAAGTTTACGATCTTCCTCGGTGTTCGGAAGCAAGGTAA AAGTACgttatcattttttttctattctttatttctttattcCTCCCCGT AACTCAAACTTTATCCTTATTCTGAAAGGGCTCCTAGTAGATTAGGCTAG GCAGATTCATGTATTTCCTTTGTTAAGGTATGTCACAAATCTGACGTATT ACAATGACTGTAGGGGGGGTAATATGAGAGGAAACCTAACATTAAAGTAT TTTAATAGCACATTTTCTCAACAAAAACCTTTGCATCCCAAAGATTCTTA TATAGCTATTTGactatgaaaatttaatattcGTCCATAAGTGGTGCACC TTCCAATCCCCCCTAGCTGTGAGCTGAAaggtaaaatttgaaatcactat cacgaaaatcgctaaaatttattcaaaaaatagcccaaatcacgcatcac acCTCAAATTATTTGGCCCTATCATGCATTTATcacaagcaaataaaaaa atgaagcaaccCATACGATAAAAAATCCTATTTGCCCAAATCGCAGTCGG GGAGGTGACATTTCAAATATCAAGGTTTTCTTTTATTCACAGGGAATAGC tcgttttgaaaatgattgtcaaAAATCTGTCAGAATAAAATTaaccaaaa tattattttgaaattttctggcgTGATACTAAggcatcaaaacaaacaag aaaagttgcgttctctgaattattttttatttaaaaatttatgaGCTTTT CTCTAACAACTACCTACTCAATGTATAAGGGAAACGCTAAATTACCGAAC GCAGGTGCAAGAGCTAAAAATACTTTTGTGTCGTACCACTCCCTATTTTT CAtccagttttgatttttcaacaatttcGATATCTGACTATTTTGTACAG TGGCCAAAGttccagaagcagccaccgaggcAAAACACGAAAAAGCCGTT CCTTTTTGCCagccaggagaaaatttctataaaatgaacATAATCGGGTT GTCCGGAACGGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAtgagtaaaaccatta gaacaaatatgtttgcggatttcaagtgatgtatggataccaatatcaac caatcacaggtgaaatcgaaactctcaataaaaaataaaccaaagagaag ccttaagcaaaatcaattaccgtgttaataatagatctcgtgaacctaca aagaactgtaataaaccagtgtatttatccttcataaatctctttgttta actttgatagatttaattaagtaaactttccagtgtgaacgcgcccAAAG TTTCAGTGAAAgcagaatacatgtttttttataagcattgcacttataag catatctaggctcagatatagGGAAAAATttagcatatggcaagcattgN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNtcaagctttcgacctaagcatctctgagcctgttttcggatt tttgtatgcttctaaaaaaaatcatgtaatatataaCCATTACAAGTTGG ATTGTCTCATTCGATCGTTTACCATAATATGTTCTCCGTCAATCAATCGA AATAGCACGATATACTCTTTCTCCGATGGCAGTCTTTTGAGGTATGATCA CGttgttatcatttcaaatttcgtTCAAGAACTTCAACGTATGGCAGCAT AAATGTCCAGCATCCAGTTAACAGCTAAAATGGAAAGGGAATTGCTTCAA TCATAAGCCATGATCTGCATGGTTAAAAGCAGGCGTCATGATGGATAGTT TTAATTTTCTACCAAGAAGGCCACACGACACAGGATATCAATGGAACTGA TCGTATCGGATGAAATGGTATGATGCGATAGAAAGGAATAACAAAAGCTC TCCAATACTGTATGCTTTCCTTAATTGCACCCTTAACACAAGTTAACTAC TACAAAACTTTCGTTGTTTTCTGGTATCTCAAaacacatttcttttattt tctcaaccattaattcaagtttgaaaaaaaaaacaatttaattttaattt ttttccatcatCCGGTCTAGAGGTTCCTTTCCAATGTCTGTAAACCAAAA AATTACCTTCCAAACCAGAAAATCGAAACATTTTTGCCCCTCCCTCTGAG ACGTTTAGCccattattcttaaattttgccaaaaatatgcATACTTTTTA GAAAGTGATTCAGCCCTTTGTAAGTTAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNcattttcataaactttaatc aatttcttatgttattttcttatttctttgtGTATTATTTAAAGAGTTAA ACCATTCAAATGAGACAGAAATCCAGACAGTAGAAAATATATAAACATAA TCATCGTATGTTTAGCAAGAATATTCCTTTGGCTAGTAAAACTTTGACGC AAAGCCAAATTTTGAGGATGAATCTCTCCCTGTCACCTGAATGTAGGACA CATGGCTGTTCATGTTTCAAAAGTATTTACCTATatagctataagcaaaa agcttgTACCCATGTCTTTTTTTAGCTATTAAAACATAATANNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNcagtggaggctaacatgcatagccctcaaatgaaaggcccggct ggtcattaaaatacgaaaataaatcgaaacaaaaatggtagagtagagta gagctgcgtttttgcgtttaaaatgttgttttgatttgggtaCAGTCGAc tactctaacttgggacgattggtcgaaacatgggactgttgcatatctgg tctgtatattcacttactgtaaaattgaaagtgaaatcatgtatttttaa TTACTCCGTTCCTTAACTccaatcaaatgactttggaggttcggtgaaat ggtggccgaattgccgttttaaatttttagatttcaagagaAGGAAATTT TCTATCTTTCTTCAACAAGattactttaatataatgcaaattatgcatgt aagttttatattaatacttcctttttgcatatgtttcgcatactttctaa gggaatttcaccacggccaGACAANAATgcaaattatgcatgtaagtttt atattaatacttcctttttgcatatgtttcgcatactttctaagggaatt tcaccacgaccagacaatctcaatcgaacggaattgacaatggaaccagt cgaaccaaatcgagaacacaatcgaccgattgaaattcgattgtcgaaca tTAATCCAAactccctaaaatctgataaataatcgatcacgaatcgatag ttgatcgattaactatttgattgatgattaatcaatttttgatcgatatg taatcgatcaaaagctgtgatcgatagccgatcgatttttaatcgatact taatttaatcgaagtataatcgatctataatcgataaacaatcgatgaca aaattgacagttatatcaatatgccttcttacctgtctttaaaaatataa attaaagtaatcacggaaaaggacgcaaaaataaaagacataagtgtgag aacagagtaatcaaactcgttagaaaaagtatataccattagaagtcata aaaaatagacctgaataaatgcaatcgaaataccagagaacttcataatt ccccaaacaacattacattacatgtcaaactcccattacataaattttac aattactacagagtagactacgctcgccaccgaagagatTTATTTGGAAA gtgtaattacattttattgttcgcttcttttttaaagattggccgggttg gaaaagtatgaatttctttgtacatattttacctaccccaaatatttagg aggctgagttttaaacaaatagtcaagttgaaacgaacgataaatgtatc aaggtctgttttatttaccccctggtgataacaaaagagacttaactcga tgttacaatccaattattgaaagtttacaagtctcggcctttttataatg agcgagacatacgttctctgattacgcaattttcatattgacattttcga ggcattttgatgtaactgattgatcgataaataatcgagctttgaaaaaa tcttgagtatcgattacctatcgattctatcggttaatcgatatctaatc cccattgattacttatcaattatttatcgattactcaagattatcgatta tatcgattaactacgcctggtttTTATACCTTAATTGCAGTAAAAATTGC TACTGCAATTTAGggatttataagaatcactcaCTCTGTATCTTGCTGAA GAAGAGCATTGCCATCATCATGTTCAGGTTCTAGACCACCAGTGACATca acgaccctggacaccgccgtacattgtacAGTGTTGTACGGTGGGTGTAC GGTGGGTACGGTGGGGTGTACGGTGGATTTCAAGTTAACCTATTTCACCA CCGTACCAAAAACATTTTAACTTGATTTCAGTTTCAGAAAGCATGCaaat ttttagatattcaacCGTGGTCGGACTTACTGANNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAA AATACACCTAAAAACTTTATACACGTATAGTTGAATGATGTCAACAACTA ATTCAGTTAATATTAACACTGCTAAAGGATAAATAGATCCCTTTACAATA CGAGTAtcagtgaaaaatttcaaaaaacatttctgtTTCGCCATTTTACT CTCCAAGATCGAGTTTTGAGCAAGACTAGTAACCGATCTTTTTTTCTCGC CTTGTACTGTAAACGGTGAACTCGCGATtgagttttttaatattttgtcg gAAAAAAGTAAACGGGTATATTTTGCTAGAAAATTCAACTGCATTATAAA TTAATCGTTCCTGGTTTCTGGAAAAGTACCCTACTGCAGTGGAACGggtc aatttttaataaatcagctgaatcaaaacatcaaaatgagCCGTTCCCCT CCAGTAGGGTGCTTTTCCAGGAAACATCTTGATCCGAGCTGGTNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNagc aaactttttgaaattttcccggAACGCCTAGGccatttccagctgagggg ggtCTCCGGAACGGCTTTTCCATCATTTGCCCTCGGTGGCTGCTTTCGAA GTTCACTGTATaataaaaaggttgaaattgaTTTGTCCAATAATACCCTT CGTTATCCAACTACCTAATGACGTTTTCGAATATTTTcaatatcagcttt tttatagacttttCAGCATCACATCCCAGGATTAGGTCTAAAAACACTGG TCTTTTTCCCTCTTTCCCATCCGCggcatttattttgaaatcggGCATAT GCCTCCCACAGCAAACGACTTTTGTCACCCTTTGCTTTTTTACACCTCAA ATTagcaatttcaaacaaaaagaaaaagttttccaaaaatgCTTGCGTAA TTCTTCCGAACATTCTTTTCTCACTTAGTGCCAACTTTGGAAATACGTCT CCCcagtttgaccaaaatttg
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_014387XLOC_014387Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00025631-exon-sc0000541-1491911889:148357..149780TCONS_00025631-exon-sc0000541-1491911889:148357..149780Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025631-exon-sc0000541-1510915933:148357..149780TCONS_00025631-exon-sc0000541-1510915933:148357..149780Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025631-exon-sc0000541-1575043694:148357..149780TCONS_00025631-exon-sc0000541-1575043694:148357..149780Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025631-exon-sc0000541-1491911889:165035..165077TCONS_00025631-exon-sc0000541-1491911889:165035..165077Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025631-exon-sc0000541-1510915933:165035..165077TCONS_00025631-exon-sc0000541-1510915933:165035..165077Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025631-exon-sc0000541-1575043694:165035..165077TCONS_00025631-exon-sc0000541-1575043694:165035..165077Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000541supercontigsc0000541:148357..165077 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.00557864 0 0 0 0.454062 0.000893562 0 0 0 0 0 0 0 0.00305928 0 0 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00025631 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top