TCONS_00025634 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00025634
Unique NameTCONS_00025634
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2136

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00025634 ID=TCONS_00025634|Name=TCONS_00025634|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2136bp
TCTATCTTTGTATGAGTGATTGTTGTTTTGCCATCACAGCACAAACTTTA
TTTGCTGTAAAGATCTTCCATCCAGAACTGCCATGCTCTTTTGACCTTAT
AGTGGAATTTTCATCATCTGTTCTAGCTGATTTATCGCTTTGTTTAGTGG
TGCTTATAGCGATCTCCCGGTACATTCATACAAGACACATGATACGCGTA
AAGCAAATTATCACCCATACACGAGTCAACATCGCTTTTTTGTTGGCTTT
TATCGTAGCTGGATCAATGTCTTTAATATCATTGTTAGCTGATAGTAATG
GGGATGTCGACGCTTACCTACAGACAGAGATTTTCCAGACTTTTATTGGC
GTTCTTTTAATCGTGCTGGTTGTATTGATATACAGGCGTACAGAGCTTGT
TGCCAAACGACGTAAAGCCGTTTCAAGCTACATGATGCATTATACGGCAT
ATTCAGAGAAAGTTTTACGTAAAATCATGTTGTCTACTTTATGTACCCTG
CTGCCGCTTAGAATCCCGTTTTTCTGTTCAACCGTCATCAAAGCCGTCGT
GTCAGACCGAAGTGGCCGCCGTCTATCTTGGTGGATGCAATTTACACATT
TAGGGTGTTACGCCCTTTTTTGTTTGAGTGCGGGCGCCAACGCCCTTATC
TTCTTGTATAATAATAGGCACGCAAGTAAATTGATTCGATTTCAATGGGA
GAAGTTTACGATCTTCCTCGGTGTTCGGAAGCAAGGTAAAAgATCGCAAG
TCCGGCCCACGCCTGCAGAGGGCGTAATCCCGCCCTTAGTTCAACCTGTC
GTAACAACTGGATGGTACGATCAATATGTACCAACCGAAGCTCCCACAAC
CTTGAGTACCGCTGTTATAggaaaaaagGTATGGCGAGACGAACGGCGCG
AGAAGAGATTGAAGAAGAAACGTAGACGCATGCGCCGACAACGACGGATG
ATGCAAGAGAAGAAACGAATGGAGCAGGAATCCAGACAACAAGAAGAGCC
AGTACAAGAAAAACGTAAAGGGTGGCAACTATTGAAGGCGTACGATAAAC
GGCGTCAAGAGGCCGAGTTGCTAGCGGCCGGATATTCCTCATCTGGGGCC
AGTCGTAGGAATAATGAGGATCATATCGTATCGTCGTTGCGTTGCGATTA
CAGTCATCAGcatcaccatcaccatcatTCGGATGAATTGAGTTACGGCC
CCCGATCGAAACGGATAGGGAAGTATGTTGTTCACTTCCCTGCTATTTTT
GATCGGTTTATATTAACGCAACGGCAACGGAACAGCTTGAAAGAGCAATG
CAATGAAGCGAAGATGTATGATGACCGAATGAGTGATTCATCTTCCGTTG
ATCGTAGGCCAAGAAAACGAGTAACTTTCAAAATCATGTCTTATCCAACA
GCTGATAGCTGAAAGATACGAAGTTTGTTGCATTGCATCCCTTTGACAGT
TTGAGATTTTTCGATAGGCGAGCAGTTGAAATATTAGGGCTATTATATCG
TTGATTCAAAGTAACTTTAATAAATGGAAATCTGACAAACCTTCAGTTAG
AAAATAGTTGAGatgttcatttgttaaaaatGCATCATTAGTGCTTCAAT
GGACTATGTTCATTTGATTGGCTGATACCTGAAAGAAGGCGTGTGATTGG
TTGTCAGACATCATTGTTAACGATAAATTTTCGACTAACAATTCGATTGT
GTTGTAAGTCAAGAAATAAAGATATGGAATAAACTACATGCATATTATTT
GCCGTCTTGCATGAAGACATCAGATTGGTTCGTTATTGGATTGTTATCAT
TATTCATCAATATTGGGCAGAACTTTTATAAAACCCTGGTAGGAACTAGA
ATTGCCGAAGAAGCTCATTTCCTGATACTCCTGGAACTTTAATAAAATAA
TGAATACCTGAATGACAGGAATTTGATCTATGATAGAGATTTAGGATGGA
TCAGATATAAttgcaaagattttcaaaacttaTTTCATTTGAGTAACGTT
TTAATATTGAAGGACAACCTCAAGTCAAATGGTTTAGGACCagtcaattt
attaattttacTAAATTGATAAAGTTTAGAGGCTACAGTTTATTTTTCGT
TGAGGAATGATCGTACAAATTCAATTTTAAGGCCAC
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000541:150118..167265+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00025634 ID=TCONS_00025634|Name=TCONS_00025634|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17148bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000541:150118..167265+ (Clytia hemisphaerica)
TCTATCTTTGTATGAGTGATTGTTGTTTTGCCATCACAGCACAAACTTTA
TTTGCTGTAAAGATCTTCCATCCAGAACTGCCATGCTCTTTTGACCTTAT
AGTGGAATTTTCATCATCTGTTCTAGCTGATTTATCGCTTTGTTTAGTGG
TGCTTATAGCGATCTCCCGGTACATTCATACAAGACACATGATACGCGTA
AAGCAAATTATCACCCATACACGAGTCAACATCGCTTTTTTGTTGGCTTT
TATCGTAGCTGGATCAATGTCTTTAATATCATTGTTAGCTGATAGTAATG
GGGATGTCGACGCTTACCTACAGACAGAGATTTTCCAGACTTTTATTGGC
GTTCTTTTAATCGTGCTGGTTGTATTGATATACAGGCGTACAGAGCTTGT
TGCCAAACGACGTAAAGCCGTTTCAAGCTACATGATGCATTATACGGCAT
ATTCAGAGAAAGTTTTACGTAAAATCATGTTGTCTACTTTATGTACCCTG
CTGCCGCTTAGAATCCCGTTTTTCTGTTCAACCGTCATCAAAGCCGTCGT
GTCAGACCGAAGTGGCCGCCGTCTATCTTGGTGGATGCAATTTACACATT
TAGGGTGTTACGCCCTTTTTTGTTTGAGTGCGGGCGCCAACGCCCTTATC
TTCTTGTATAATAATAGGCACGCAAGTAAATTGATTCGATTTCAATGGGA
GAAGTTTACGATCTTCCTCGGTGTTCGGAAGCAAGGTAAAAGTACgttat
cattttttttctattctttatttctttattcCTCCCCGTAACTCAAACTT
TATCCTTATTCTGAAAGGGCTCCTAGTAGATTAGGCTAGGCAGATTCATG
TATTTCCTTTGTTAAGGTATGTCACAAATCTGACGTATTACAATGACTGT
AGGGGGGGTAATATGAGAGGAAACCTAACATTAAAGTATTTTAATAGCAC
ATTTTCTCAACAAAAACCTTTGCATCCCAAAGATTCTTATATAGCTATTT
GactatgaaaatttaatattcGTCCATAAGTGGTGCACCTTCCAATCCCC
CCTAGCTGTGAGCTGAAaggtaaaatttgaaatcactatcacgaaaatcg
ctaaaatttattcaaaaaatagcccaaatcacgcatcacacCTCAAATTA
TTTGGCCCTATCATGCATTTATcacaagcaaataaaaaaatgaagcaacc
CATACGATAAAAAATCCTATTTGCCCAAATCGCAGTCGGGGAGGTGACAT
TTCAAATATCAAGGTTTTCTTTTATTCACAGGGAATAGCtcgttttgaaa
atgattgtcaaAAATCTGTCAGAATAAAATTaaccaaaatattattttga
aattttctggcgTGATACTAAggcatcaaaacaaacaagaaaagttgcgt
tctctgaattattttttatttaaaaatttatgaGCTTTTCTCTAACAACT
ACCTACTCAATGTATAAGGGAAACGCTAAATTACCGAACGCAGGTGCAAG
AGCTAAAAATACTTTTGTGTCGTACCACTCCCTATTTTTCAtccagtttt
gatttttcaacaatttcGATATCTGACTATTTTGTACAGTGGCCAAAGtt
ccagaagcagccaccgaggcAAAACACGAAAAAGCCGTTCCTTTTTGCCa
gccaggagaaaatttctataaaatgaacATAATCGGGTTGTCCGGAACGG
CTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAtgagtaaaaccattagaacaaatatg
tttgcggatttcaagtgatgtatggataccaatatcaaccaatcacaggt
gaaatcgaaactctcaataaaaaataaaccaaagagaagccttaagcaaa
atcaattaccgtgttaataatagatctcgtgaacctacaaagaactgtaa
taaaccagtgtatttatccttcataaatctctttgtttaactttgataga
tttaattaagtaaactttccagtgtgaacgcgcccAAAGTTTCAGTGAAA
gcagaatacatgtttttttataagcattgcacttataagcatatctaggc
tcagatatagGGAAAAATttagcatatggcaagcattgNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNtca
agctttcgacctaagcatctctgagcctgttttcggatttttgtatgctt
ctaaaaaaaatcatgtaatatataaCCATTACAAGTTGGATTGTCTCATT
CGATCGTTTACCATAATATGTTCTCCGTCAATCAATCGAAATAGCACGAT
ATACTCTTTCTCCGATGGCAGTCTTTTGAGGTATGATCACGttgttatca
tttcaaatttcgtTCAAGAACTTCAACGTATGGCAGCATAAATGTCCAGC
ATCCAGTTAACAGCTAAAATGGAAAGGGAATTGCTTCAATCATAAGCCAT
GATCTGCATGGTTAAAAGCAGGCGTCATGATGGATAGTTTTAATTTTCTA
CCAAGAAGGCCACACGACACAGGATATCAATGGAACTGATCGTATCGGAT
GAAATGGTATGATGCGATAGAAAGGAATAACAAAAGCTCTCCAATACTGT
ATGCTTTCCTTAATTGCACCCTTAACACAAGTTAACTACTACAAAACTTT
CGTTGTTTTCTGGTATCTCAAaacacatttcttttattttctcaaccatt
aattcaagtttgaaaaaaaaaacaatttaattttaatttttttccatcat
CCGGTCTAGAGGTTCCTTTCCAATGTCTGTAAACCAAAAAATTACCTTCC
AAACCAGAAAATCGAAACATTTTTGCCCCTCCCTCTGAGACGTTTAGCcc
attattcttaaattttgccaaaaatatgcATACTTTTTAGAAAGTGATTC
AGCCCTTTGTAAGTTAACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNcattttcataaactttaatcaatttcttatg
ttattttcttatttctttgtGTATTATTTAAAGAGTTAAACCATTCAAAT
GAGACAGAAATCCAGACAGTAGAAAATATATAAACATAATCATCGTATGT
TTAGCAAGAATATTCCTTTGGCTAGTAAAACTTTGACGCAAAGCCAAATT
TTGAGGATGAATCTCTCCCTGTCACCTGAATGTAGGACACATGGCTGTTC
ATGTTTCAAAAGTATTTACCTATatagctataagcaaaaagcttgTACCC
ATGTCTTTTTTTAGCTATTAAAACATAATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNcagtg
gaggctaacatgcatagccctcaaatgaaaggcccggctggtcattaaaa
tacgaaaataaatcgaaacaaaaatggtagagtagagtagagctgcgttt
ttgcgtttaaaatgttgttttgatttgggtaCAGTCGActactctaactt
gggacgattggtcgaaacatgggactgttgcatatctggtctgtatattc
acttactgtaaaattgaaagtgaaatcatgtatttttaaTTACTCCGTTC
CTTAACTccaatcaaatgactttggaggttcggtgaaatggtggccgaat
tgccgttttaaatttttagatttcaagagaAGGAAATTTTCTATCTTTCT
TCAACAAGattactttaatataatgcaaattatgcatgtaagttttatat
taatacttcctttttgcatatgtttcgcatactttctaagggaatttcac
cacggccaGACAANAATgcaaattatgcatgtaagttttatattaatact
tcctttttgcatatgtttcgcatactttctaagggaatttcaccacgacc
agacaatctcaatcgaacggaattgacaatggaaccagtcgaaccaaatc
gagaacacaatcgaccgattgaaattcgattgtcgaacatTAATCCAAac
tccctaaaatctgataaataatcgatcacgaatcgatagttgatcgatta
actatttgattgatgattaatcaatttttgatcgatatgtaatcgatcaa
aagctgtgatcgatagccgatcgatttttaatcgatacttaatttaatcg
aagtataatcgatctataatcgataaacaatcgatgacaaaattgacagt
tatatcaatatgccttcttacctgtctttaaaaatataaattaaagtaat
cacggaaaaggacgcaaaaataaaagacataagtgtgagaacagagtaat
caaactcgttagaaaaagtatataccattagaagtcataaaaaatagacc
tgaataaatgcaatcgaaataccagagaacttcataattccccaaacaac
attacattacatgtcaaactcccattacataaattttacaattactacag
agtagactacgctcgccaccgaagagatTTATTTGGAAAgtgtaattaca
ttttattgttcgcttcttttttaaagattggccgggttggaaaagtatga
atttctttgtacatattttacctaccccaaatatttaggaggctgagttt
taaacaaatagtcaagttgaaacgaacgataaatgtatcaaggtctgttt
tatttaccccctggtgataacaaaagagacttaactcgatgttacaatcc
aattattgaaagtttacaagtctcggcctttttataatgagcgagacata
cgttctctgattacgcaattttcatattgacattttcgaggcattttgat
gtaactgattgatcgataaataatcgagctttgaaaaaatcttgagtatc
gattacctatcgattctatcggttaatcgatatctaatccccattgatta
cttatcaattatttatcgattactcaagattatcgattatatcgattaac
tacgcctggtttTTATACCTTAATTGCAGTAAAAATTGCTACTGCAATTT
AGggatttataagaatcactcaCTCTGTATCTTGCTGAAGAAGAGCATTG
CCATCATCATGTTCAGGTTCTAGACCACCAGTGACATcaacgaccctgga
caccgccgtacattgtacAGTGTTGTACGGTGGGTGTACGGTGGGTACGG
TGGGGTGTACGGTGGATTTCAAGTTAACCTATTTCACCACCGTACCAAAA
ACATTTTAACTTGATTTCAGTTTCAGAAAGCATGCaaatttttagatatt
caacCGTGGTCGGACTTACTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAATACACCTAA
AAACTTTATACACGTATAGTTGAATGATGTCAACAACTAATTCAGTTAAT
ATTAACACTGCTAAAGGATAAATAGATCCCTTTACAATACGAGTAtcagt
gaaaaatttcaaaaaacatttctgtTTCGCCATTTTACTCTCCAAGATCG
AGTTTTGAGCAAGACTAGTAACCGATCTTTTTTTCTCGCCTTGTACTGTA
AACGGTGAACTCGCGATtgagttttttaatattttgtcggAAAAAAGTAA
ACGGGTATATTTTGCTAGAAAATTCAACTGCATTATAAATTAATCGTTCC
TGGTTTCTGGAAAAGTACCCTACTGCAGTGGAACGggtcaatttttaata
aatcagctgaatcaaaacatcaaaatgagCCGTTCCCCTCCAGTAGGGTG
CTTTTCCAGGAAACATCTTGATCCGAGCTGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNagcaaactttttga
aattttcccggAACGCCTAGGccatttccagctgaggggggtCTCCGGAA
CGGCTTTTCCATCATTTGCCCTCGGTGGCTGCTTTCGAAGTTCACTGTAT
aataaaaaggttgaaattgaTTTGTCCAATAATACCCTTCGTTATCCAAC
TACCTAATGACGTTTTCGAATATTTTcaatatcagcttttttatagactt
ttCAGCATCACATCCCAGGATTAGGTCTAAAAACACTGGTCTTTTTCCCT
CTTTCCCATCCGCggcatttattttgaaatcggGCATATGCCTCCCACAG
CAAACGACTTTTGTCACCCTTTGCTTTTTTACACCTCAAATTagcaattt
caaacaaaaagaaaaagttttccaaaaatgCTTGCGTAATTCTTCCGAAC
ATTCTTTTCTCACTTAGTGCCAACTTTGGAAATACGTCTCCCcagtttga
ccaaaatttggtcaacCCACCACCCAAGATTAAGATGAGTGACATAGTCA
AGTTAGAGACAATTCAACTAAACAATGTGGGTGGTTGTcacttttgtttg
aaaaattatcCCTGTTTTATTTATCTAGAACTTAAAATTCGTTTCCGGAA
GAGTCCAATGGATGCGTTGATGGAATATAAAAGATTCTACTGATTTGACG
GTTCCAGTCCCTCATGTCTCGTGACCCATCCTGACTCAGGGAGCTGGTCT
ATCTATAAATGATCTGAAAATATTAAACAAGTCATCTAAACCCTTGACAT
CATAGATCTAAATCCTCAAAAAtctatatttttcatttgttttaggATCG
CAAGTCCGGCCCACGCCTGCAGAGGGCGTAATCCCGCCCTTAGTTCAACC
TGTCGTAACAACTGGATGGTACGATCAATATGTACCAACCGAAGCTCCCA
CAACCTTGAGTACCGCTGTTATAggaaaaaaggtatttttttgtctttta
acTGTAAATCCACTAAAATGTGTgtctgaaaataaatttcagatCGTTCA
CCAAACGTCTGTAAGATTTTGGCCTCAAATGTCGAATGATATTGAATATC
TGTATTAATATGAGTTCATTGTACTACAAAGAAAAGCATTGCACTTTTTA
AGTATAAAATGGTGCAGTACACTGGACCTTTAAGTAGTGCACACTGTCGG
GAACCGGGTTAGAGTCCGCTATATTTATGAtatacaccattgcaatgtct
tccaaggacccaacagctgattggttgtaagtgacgtaaataaaatcagt
caatgcgtcacttgcaaccaattaGCTGTTGGTTCCATGGAAGACATTTc
aatgatgcatatcatgaattgtatgTTTCTATATACCCACAAGATGAAAT
ACAgaagaaatacaaaaaaataacttttactTTAATCAAGGTATGGCGAG
ACGAACGGCGCGAGAAGAGATTGAAGAAGAAACGTAGACGCATGCGCCGA
CAACGACGGATGATGCAAGAGAAGAAACGAATGGAGCAGGAATCCAGACA
ACAAGAAGAGCCAGTACAAGAAAAACGTAAAGGGTGGCAACTATTGAAGG
CGTACGATAAACGGCGTCAAGAGGCCGAGTTGCTAGCGGCCGGATATTCC
TCATCTGGGGCCAGTCGTAGGAATAATGAGGATCATATCGTATCGTCGTT
GCGTTGCGATTACAGTCATCAGcatcaccatcaccatcatTCGGATGAAT
TGAGTTACGGCCCCCGATCGAAACGGATAGGGAAGTATGTTGTTCACTTC
CCTGCTATTTTTGATCGGTTTATATTAACGCAACGGCAACGGAACAGCTT
GAAAGAGCAATGCAATGAAGCGAAGATGTATGATGACCGAATGAGTGATT
CATCTTCCGTTGATCGTAGGCCAAGAAAACGAGTAACTTTCAAAATCATG
TCTTATCCAACAGCTGATAGCTGAAAGATACGAAGTTTGTTGCATTGCAT
CCCTTTGACAGTTTGAGATTTTTCGATAGGCGAGCAGTTGAAATATTAGG
GCTATTATATCGTTGATTCAAAGTAACTTTAATAAATGGAAATCTGACAA
ACCTTCAGTTAGAAAATAGTTGAGatgttcatttgttaaaaatGCATCAT
TAGTGCTTCAATGGACTATGTTCATTTGATTGGCTGATACCTGAAAGAAG
GCGTGTGATTGGTTGTCAGACATCATTGTTAACGATAAATTTTCGACTAA
CAATTCGATTGTGTTGTAAGTCAAGAAATAAAGATATGGAATAAACTACA
TGCATATTATTTGCCGTCTTGCATGAAGACATCAGATTGGTTCGTTATTG
GATTGTTATCATTATTCATCAATATTGGGCAGAACTTTTATAAAACCCTG
GTAGGAACTAGAATTGCCGAAGAAGCTCATTTCCTGATACTCCTGGAACT
TTAATAAAATAATGAATACCTGAATGACAGGAATTTGATCTATGATAGAG
ATTTAGGATGGATCAGATATAAttgcaaagattttcaaaacttaTTTCAT
TTGAGTAACGTTTTAATATTGAAGGACAACCTCAAGTCAAATGGTTTAGG
ACCagtcaatttattaattttacTAAATTGATAAAGTTTAGAGGCTACAG
TTTATTTTTCGTTGAGGAATGATCGTACAAATTCAATTTTAAGGCCAC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_014387XLOC_014387Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00025634-exon-sc0000541-1491911889:150118..150858TCONS_00025634-exon-sc0000541-1491911889:150118..150858Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025634-exon-sc0000541-1510915933:150118..150858TCONS_00025634-exon-sc0000541-1510915933:150118..150858Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025634-exon-sc0000541-1575043694:150118..150858TCONS_00025634-exon-sc0000541-1575043694:150118..150858Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025634-exon-sc0000541-1491911889:165413..165549TCONS_00025634-exon-sc0000541-1491911889:165413..165549Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025634-exon-sc0000541-1510915933:165413..165549TCONS_00025634-exon-sc0000541-1510915933:165413..165549Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025634-exon-sc0000541-1575043694:165413..165549TCONS_00025634-exon-sc0000541-1575043694:165413..165549Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025634-exon-sc0000541-1491911889:166008..167265TCONS_00025634-exon-sc0000541-1491911889:166008..167265Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025634-exon-sc0000541-1510915933:166008..167265TCONS_00025634-exon-sc0000541-1510915933:166008..167265Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00025634-exon-sc0000541-1575043694:166008..167265TCONS_00025634-exon-sc0000541-1575043694:166008..167265Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000541supercontigsc0000541:150118..167265 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.0184109	0.035907	0	0	0.205476	0	0.0710102	0.0886386	0.0155145	0.0414174	0.055958	0	0.00579308	0.0381481	0	0	1.05964	1.06065	0	0	0.675539	0.962268	0.160834	0.0815715	0.104956	0	0	0	0.0408693	0.0208197
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00025634 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top