TCONS_00028683 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00028683
Unique NameTCONS_00028683
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length933

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00028683 ID=TCONS_00028683|Name=TCONS_00028683|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=933bp
CTTACAAAAGGTTTAACTTGAATAACAATAGTGGATCTAAACGGCCGTTT
CATAATGTAACGAAGAGAGAACATGTGCCATCGGAACACAATCAGGTCGA
TTGTGATTTGATCTCGCAACGATGATCGCAATCAGTTTACAGTATATATG
TAGAAAAATACCTTAGCTCAATTGGTAGAAATGGGAGTCAATCCATGTCA
GTTGACTGAGCTCACATAGTAATTTCTTGATAGTCTTTGGTAAATTAATT
TTCACCAAATCGTGGATAGGATAATTCAACAACACAACTTTCAACGCTGA
ATGTAAAAGGGTTTCGACCCCTCTtgttttcaatttgaaaacttttgtaa
aGTTATTTTTAGGGAAACCATCTTTATGGAAGCGATTCACGAAAGGATGG
TCTTCAAAACGGCTCTCGGTGTAAAAAACAATCAATTCGTTCGAGCACCG
CTTCAGCTTGAAATTTGTGACCAGAATATCATCGTTTGAATTCGACTTTA
GTTCTTGAATAAATTGTCCAGTAAAAGGATCAATGATATAAACGTCTTTG
TAACCCAGCAAGACCAAAGAATTTCCAGAAGTAACTTTCCACACCCATGG
TATATTGCCTGAATCTGGCATATTTGGGATGTTTTGTGGAAGACTTATTT
TGTGTAATAAATTCAAAGTATTTTGTTGAGAATTAAttgaaaaaacgaaa
atttctttcctcCCGCGATCAAGATTAACCAAGATCTCACCATTAGTCAA
ATCATAAGACCATTCAAAATCCTGACATAATTCATCCACGTCTTGCTTGG
CAAGAACCGTTCGGCTTTGTAAGGAATACACCACTAAACCATTCTTAGAA
TACATCAAGATTTTATCATGCTTAACATTGAAAATGGGCTAATAGTGGAG
CAAACATCAAGATTTTATCATGCTTAACATTGA
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000697:23664..38223-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00028683 ID=TCONS_00028683|Name=TCONS_00028683|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14560bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000697:23664..38223- (Clytia hemisphaerica)
CTTACAAAAGGTTTAACTTGAATAACAATAGTGGATCTAAACGGCCGTTT CATAATGTAACGAAGAGAGAACATGTGCCATCGGAACACAATCAGGTCGA TTGTGATTTGATCTCGCAACGATGATCGCAATCAGTTTACAGTATATATG TAGAAAAATACCTTAGCTCAATTGGTAGAAATGGGAGTCAATCCATGTCA GTTGACTGAGCTCACATAGTAATTTCTTGATAGTCTTTGGTAAATTAATT TTCACCAAATCGTGGATAGGATAATTCAACAACACAACTTTCAACGCTGA ATGTAAAAGGGTTTCGACCCCTCTTGTTTTCAATTTGAAAACTTTTGTAA AGTTATTTTTAGGGAAACCATCTTTATGGAAGCGATTCACGAAAGGATGG TCTTCAAAACGGCTCTCGGTGTAAAAAACAATCAATTCGTTCGAGCACCG CTTCAGCTTGAAATTTGTGACCAGAATATCATCGTTTGAATTCGACTTTA GTTCTTGAATAAATTGTCCAGTAAAAGGATCAATGATATAAACGTCTTTG TAACCCAGCAAGACCAAAGAATTTCCAGAAGTAACTTTCCACACCCATGG TATATTGCCTGAATCTGGCATATTTGGGATGTTTTGTGGAAGACTTATTT TGTGTAATAAATTCAAAGTATTTTGTTGAGAATTAATTGAAAAAACGAAA ATTTCTTTCCTCCCGCGATCAAGATTAACCAAGATCTCACCATTAGTCAA ATCATAAGACCATTCAAAATCCTGACATAATTCATCCACGTCTTGCTTGG CAAGAACCGTTCGGCTTTGTAAGGAATACACCACTAAACCATTCTTAGAA TACATCAAGATTTTATCATGCTTAACATTGAAAATGGGCTAATAGTGGAG CAAACATCGAACTGCGGTGTGCATCGAGGAAGAGAATTGATATTTGAAGA AATAAGCTTGGCAAAAATATTGGGCATTTTCGACATTTTCAAAAGTGCTT TTTTAAGTTGTAAGAAAAAAAATAAAATGTAAGAGAAAAAAATAAAACTT TAAGATTTCACGGAGATTGAATAACCCCTGTTTGATATTTGTTTCCTCCT CCGTTTGATTGGTTTTTCCTTTTCAAAATATTGAAGTCACACTAATTCAT AGTTCGGATCCCCCCTCTTTCTAAAGGAGGGATGACACCTTTCGAAAAAA TAAAGAAGAGAAGGATCGGAAATTTTCATGAAACAGGGGGTAGCAAGGAA GGGGTAGCAAGGAAGGGGAATAGTTTAAAAAGGGGGGGGCTTACATATAT ATTGTAGATTATTTTCAAGCACTGTTATGAAATTTGGTCTTCATGAAAGG AAGTTTTCTGTTAGAGTAAGTCTGAGTCAAAAAGAAGAAAGAGGCTTATT ATTTCGCTTTCTCTCTCTAAAGATATTTCACATATATTTGTTAGCTATTT TTGTCCAAAATCCTTAGGGATAGGCATTTTTAAAGGTTAGGGGGGGGTGN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNTGTGCAAAAAATAAAAAAAAACTAATGAGCCAATCC CGAGAAAAGCTTGTAACAGACGAACGGACAACGGTCAAATTAAAGGACCT CCCAGTAGGTCCAAAAACAAGCAAATGGGAAAAGATTAACTATAGAGCCT GTGAATGCACGCAAGGAGCGAACCGTAGCAGGTGCAGGTAAGTAGAGAAT AGTTCTGGTTTCTTAAGGTTTGGAGGAAGTCCCTCGGTTCTAAGAAAGTT AAATGTACAATGATATACATTGATTTAAAAAATTTGAACTGTTATATTCT ACACTATATACAGTGCACTCTCCATAACTCGAACAAGCACGGGGAACACA AAGTGGTTGATTTAAGGAAATTTCGATTTATGGAGAAAGGTTTATAAGGC ATTGTTCGAGTTAAGGAAACATTCAAGTTACAAAAGTTCGAGTTAAAAAG ACTCCACTGTATTATAAGCAAACCTTTCTTGGCAAATGATATTTCCTGCT TAGCCATTCTTTGTTTCAAATAATCACACCATGCATCTCTGGGAAGCGGT TTCATCTCATTCAACATCTAGAGAAAAAAGAAAAATATGAAGGCGTAATC AAGGTGGAAGTTCGAGTCTCTGAAATAAAAACTCTAGATTTTTAAAAAAA CCAATGGAGGTAATCTCTCCCTGGGTCTTTTTAACGAACATTAACGGTCT TTCTGTGGTTTTCGAACTATAGTTGACTCTTGCTAATTCGAACTCGAATT GGGAGTCTTTTTGTTCGAATTAAAGAGAGATTCGAATACACCGTTTAGGA GTCTCGCTATCTCCACGGTGTTCCACCGTGAAAACGATAGGTAAAAATGT GCACTTTATAGTACTGTGGAAGGTTAATGAGAATTTTATGGATCTCTCCT GAAAATTTCACAAAAACTCATCAAGAGGAAAAGAAGTTATGATTAAAAGG AGTTCTTTACCTACCATTTCTCTGCTAGGTTTTCTTACGGGAACCGGAAT TTTACCTACCGTTTTTTGTTACGGGAAAGAGCGGTCGCTAAAATCAAAAC AATGGAAAATTGGTTGGACGCGTGCGCAGTCGACACTACTAAACGGTGTA TTGTAGTATTGAGAGTTTATCCTTGACAGGGACTGGGAATCAATTCAAAT AATAGAAAGATTTGAATAATAGAAGTTCGAATAAGCGAGTCTACTGTAAA ACAACCCTTCCAGTACCATTCACTGACCTTTATATATACCCTGGACAAAT TACTCGATAGCGGTGTAAATGCATCGAGAGCGCTAGGTCTACTTTTCCTC AAATTCTTTTGATGATGTAGCGGCGTTAGACGTTAATTTTTAGCATTGCA NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTAGCATTGCA ATGGCTTCTCCTTGGGTACCAATTCTAAAAAAACTCCAATCAAAGATGGC AGGTATTGCTTGGTCCAGGGTTATATAAAGGTCAGTGGTACCATTGTGGG ATATATACGTTAACACGAAGCTCTTCATTTGGCGTAATATAAAGTTCAGT TTATTTTCAATAATTTTCACGCCAAAACCATTCGCAAAAGGAAACAGATA CAACAGACGTTACCGCGTAATAAAATATGCCGTTGACATCTGGTACAGGC TAGTGACATGTAGGGACAGAAAAGAGAATTCATCATAACTCACCTTAAGA AATTCTTTTCTTTTTTTCGGGTTGTCAACCATGCCAATAAATTGGTCGAT TTTCTCGGACCTTTTGTCATTATCATTAAGTTGTGCAAGTTTTTCCATCA AAACTTTTAATATTGCGGGTTACTTTATTGCTTATCTAAACCGTGAGAGA GTAATATAGTTAAAAAACTCAACAATACTAGATGAAAAGATGTAAAGCAA ATTTCATAGAGAAAGATACAGCAGTTTAGGCGTTTACCCCATTCTTGCAA GACAAATCGAAAGGGTCCATTGATAAAAGCTCTGGTTTTTATTTTAATTG TGAATTAAAGTGGGCAGAAAGTTGACTGTTTAGGTCAAGACATCGTCCTC TTTGGACCTCAATTTCAATCTTTTTCAATTAAAGATTTTAACTGCCAACT TTCCGCCCACTTTTTGCCGACTGTAACAATTAGAATAGATGGCCGGCGGT TGTTCTTTTTTATTTTACTAGATAAGGTGAGGCTTAACATGAGTGACAAT TGGCCAGATATGTTGAAAATCTGTGCACAAGGGTCAGTAAATTACACGTT GATCTCCAGTACTCTTATATTATAGAGTCTGTTCCGCTAACACATTTGTG ATGGTGTAGCTAGGTATTTTCAATCTCGGACCAGCTTCGGTCTTAGTACT TTACATACCGATCAGAATCTTGTCATGTTCAAAATCCATTTCAGGACTAT AATCACATACCATGAAATACCCGTCAAAAATAAATCGATCCTGATATTCT TTGTTATTCTGAAAATAATTCTAGTTCTATTTAAGTTATGTTTATATGTA GAAAAAAAATATTAAAAATTTAAAAATAATGATGCATAAGTCATAAAAAG TTTTTTAGATTTTTTTTTTTTAATTAAAAGAACTAAATAAAAAAATACTC AAAAAATAGGTACACTAATCAATATGCGACAACAATATCATGTAATATAA TATGTTTCAAAACAAACCTTAAAATCACATTATGATCGGCAAAAAATGTA AAACAGAATTAAGTAAAGATTCAAGATTCAAAGGTAAAATTTTTGAGTGT TTTTTTTATCATACCCTTACAAAAGGTTTGACTTTAATAACAATAGTGGA TCTAAACGGCCGGTGCATAATGTAACGAAGAGAGTACATGTGCCATCGGA ACACAATAAGGTCGATTGTAATTTGATCTCGCAACGATGATCGCAATCAG TTTACAGTATATAATATGTAGAAAAATACCTTAGCTCAATTGGTAGAAAT GGGAGTCAATCCATGTCAGTTGACTGAGCTAACATAGTAATTTCTTGATA GTTTTCGGCNTGGGAGTCAATCCATGTCAGTTGACTGAGCTCACATAGTA ATTTCTTGATAGTCTTTGGTAAATTAATTTTCACCAAATCGTGGATAGGA TAATTCAACAACACAACTTTCAACGCTGAATGTAAAAGGGTTTCGACCCC TCTTGTTTTCAATTTGAAAACTTTTGTAAAGTTATTTTTAGGGAAACCAT CTTTATGGAAGCGATTCACGAAAGGATGGTCTTCAAAACGGCTCTCGGTG TAAAAAACAATCAATTCGTTCGAGCACCGCTTCAGCTTGAAATTTGTGAC CAGAATATCATCGTTTGAATTCGACTTTAGTTCTTGAATAAATTGTCCAG TAAAAGGATCAATGATATAAACGTCTTTGTAACCCAGCAAGACCAAAGAA TTTCCAGAAGTAACTTTCCACACCCATGGTATATTGCCTGAATCTGGCAT ATTTGGGATGTTTTGTGGAAGACTTATTTTGTGTAATAAATTCAAAGTAT TTTGTTGAGAATTAATTGAAAAAACGAAAATTTCTTTCCTCCCGCGATCA AGATTAACCAAGATCTCACCATTAGTCAAATCATAAGACCATTCAAAATC CTGACATAATTCATCCACGTCTTGCTTGGCAAGAACCGTTCGGCTTTGTA AGGAATACACCACTAAACCATTCTTAGAATACATCAAGATTTTATCATGC TTAACATTGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_016268XLOC_016268Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00028683-exon-sc0000697-1575043694:37319..38223TCONS_00028683-exon-sc0000697-1575043694:37319..38223Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00028683-exon-sc0000697-1575043694:23664..23691TCONS_00028683-exon-sc0000697-1575043694:23664..23691Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00028683-exon-sc0000697-1510915933:37319..38223TCONS_00028683-exon-sc0000697-1510915933:37319..38223Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00028683-exon-sc0000697-1510915933:23664..23691TCONS_00028683-exon-sc0000697-1510915933:23664..23691Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00028683-exon-sc0000697-1491911889:37319..38223TCONS_00028683-exon-sc0000697-1491911889:37319..38223Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00028683-exon-sc0000697-1491911889:23664..23691TCONS_00028683-exon-sc0000697-1491911889:23664..23691Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000697supercontigsc0000697:23664..38223 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.980048 1.05127 0.277415 0.651378 4.03103 2.34987 2.64601 3.24391 1.65174 2.19939 0.794336 1.20751 0.912519 1.04919 1.36343 2.17983 1.28751 2.14915 0.83345 1.1992 1.94251 1.31724 1.46082 1.68566 2.52536 1.69037 0.873496 0.717091 1.25094 0.886618
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR015943WD40/YVTN_repeat-like_dom
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0005515protein binding
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0005515 protein binding
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00028683 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top