TCONS_00065409 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00065409
Unique Name	TCONS_00065409
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4263

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_439:221260..232459-

transcript sequence

>TCONS_00065409 ID=TCONS_00065409|Name=TCONS_00065409|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4263bp
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CTCAGGAGAAATCGATGTTGTTTTCAAGAGACGTGCAAGTTCAGTTCGAG
TTCGCAGAAAGTCTTATCAGTACGTAACGCCCTGTACACACGATGATGTT
CTTGCATTTCGAAAGGCAACATGGAACTTGACGTCATCAGATAGTGAAGC
TCAACTTCGTGCTTCTTTGGAAGAATTTTGCGAGCCTCAAACACCACTGG
CGTCGATTCTCATGCTGCAAGTTCTGTACAATATTCACAAacgAATTTAC
GATGAGCCTCACGTGGAAAAGTATTACCGCATTTTCATCAAAGGGACCGT
CTTCGAAAGATATGTTTGGCAATTAGAGGGAGCTTCCAAATTCCTTCAGT
TTCTCGGATGGATTAAGTGTGGCAATTACATTGTCTTATCCAAGAGTTAT
CCAGTCGCTACAAGTCTTAAAGTCATCGAAAGTGTTCTCAGGCGAAAGAA
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CAAACGTTGACATCATTGGAGAAGATGAAGTAGTGGCCTCATTCACTAAG
GTTGAAAATGACATTGACAGTGGTGTTGAAGATGTCGAGGCCAGTCTTCG
ACGTAAGCCGAAATTGCGACGTGTCGAATCCAAAGAACATTTACTGGGTG
AAGAGGAATACGTCGTCGTTGATTTTGTCGGCAATGTCGAACTTTCCAGT
CGTAAGTCGTCAAGAGTTGAGCAACCAGATGATCTGCAGTTGGATGTCCA
CCTTGATGAGGAGGAACCGGAATCAGCAATTGGAATGACACCTCCTTCAT
CGCAATCGCCAACGTCGAATATATCCCCTACATTTGATGATATTTCAGAT
AACATTTATGTTGCTGCTTCACCAGAAAAGCCTTCAGTTGAGATCTCCAC
AAACGAGAAACCCGAAGAATCTCTTATCGAGAAATCAGACATTGACGTCC
CTTTCACAGACAACCAGGAACGAGCCGATGTAGAAATCAAGATTGATGTC
GACGTACCGGTTGCTCCAATTTCAGAATCTAAACCAGAGGAAGTTTTACC
AAAGCAATCAGATAATGTTGCTGAGAAGCCGAAAAGTAAAGGCTTGAAGG
GATTAAAAAACAGACGAAAAACTGAAGAGATACCAACTCCACCAAAGGCT
GAAACTCCACCACAAGCTGATTCACCCACTTTGATGTCTCGATCATCATC
CAACCGAAGTATCAGTTCGCGACGGAGTATTGATGAATCAGGCAGCAGAC
GTGGTTCACCTCGGACCAGTACGGTATtacaaaacaaacttttatttgat
CAAAAGGCTTCAGGTCAATTTAAAAAGAGTCCATCATCATCGTCGACAAC
CAGTTTGAATTCGTTGCGTGAAGGACGGCAGGAATCGTTGAGAGGCTCCA
ACGGAAGACCTGTATCAGGGACAGTTGCTGGTACTTTAAGCATGTTTGAA
GCCAATTCACCTGGAGGACGCTCCAAGAATGCTACTAAGAAAAAAGCTGA
TAACAATTGGGGCGCTTCCCTCGAAACGAAAGCTACACCCGTGGCGAAGG
TTGAAGAGCCGGCGCCGACACTGGAAAAACCACCCGTCGAAGAATCCAAA
CCAGTATCCACCGGCAAAAAGAAGCGATTTCCATTTAAGAAAAAGAAGTC
ATCcaatatttcaaacaaaaatatgtCGGAAACACCATCGGGAGACGTCC
AACTCGTTAGTGCAACTCCGGTCAAGAGTGACTTTCAAGAGCGTGCTATT
GACGTCCCCACCGAAATTGTTCAAGCTACGGACGCTGCAGAACTAAAGGT
GGAAGAACCGATCaatgagaagaaaaagaaatcagGATCTTTAATGTCAC
GAATGAAAAGACGAAGTCGTAAAAGTTCCACTGAACATTCTGATAACGAG
TTGACCACATCGGTGGAGATTGCAGCCAAAGTTGAAGATCCTGTTATCGA
GGAATCGTCTACTCATTTACCGCCAATCGTTGATACTGGTGTTGATCAAA
CGTTACCAGAGCAGTCAGTTTCTATTGATGTCAAGCAACCTGAACCTTCA
CCAGCTCCTATTGAGTCTGACGCATCCTTTTCGATCGACAGTAGACAAGT
AGCTTCTGTTGAGGATTTGGTGTCACCAGAAGATGACCCACCAAGTCCTG
CTCAAGCCTCAGAGGAGGTGAAATCTTTGTTAGAAAGCATCATCGATCGT
AAACCATTCGAAGATAGTTCTTCTACcactaaaaagaagaaattaagatt
gaaaaagaaatcgaaaaataaaatagaaactGAGAAACCTCTTCCGTCAG
TTGAACTTGTCGTTACACCGACTCCCGTTAAAGAAGAAGTCGTTGACGAG
GGAATCTCCGAGAATAAAATCACTGATGACGTGTCGATTTCTGATTGGCC
AGAAGAAATGATGAATGATAacaacaatgacgtcatcgtagAGGACGAGA
AAAAAGTCGAACCGTTACCGACGATCGAAGGAGAGCTGGAAAGCCCGTTA
GCAACCAGTGAATTGATACCTCAAATATCAGTCGAACCAGCTGATGATAC
CGTCACTAATGACGTCACTGACGGACATGATGACGGAATGATGGACGTCA
GTTTACATGATGATAACGCTAGTAGTATTTATTCGCCCGACGATGACTCT
TTATCGATGACAGGCTCTATAAACactgagaaaaagaaaaagagacgCTT
CAAGTTTGGTCTTCGTAAAAGCAGTAGTAAGAAGAAAGAGAAACAACAAC
AGCTCTCCCCTCAAAACGAATCAGACATCTGGGAGCATAATGACGATCAt
aaattagaaaagaaaaattcgtCCAAGAAATTGAAGCGTCCCAAAAGTCT
TGATTTCCTTGCCGATGTCATCCACCCGAGTCATAAGAAAGATGATAAAA
AACAACGCCCGGTTTCTGTGGCGGAACACGCCGAAGAACAACCGCCTGCT
CCTAAATCGCCTACTAAGAGAAAAACATTAAGCTTattcaagaagaagaa
gaagcagtCGTCTTCGGATACATCAACTCATGACCGCACAATATCTGATG
TCGAATCTGATCAAGTTCCGTCACCCACTGATGTTTTTAAAATACCGGAC
GTGGTTGATGGCGGAAATAAAAACGGACATGCAACTTTATCAGTTGATCA
TTCAGAGCATAGTGTAAACACTGAAATGTCGCTATCTGTTAAATAATTTT
ATTGGAGACGCCATTCCTTTCTTagatatgttttttttagaaattagatt
ttttagaGATCCCCTTtttatgataaattttaaaatgagaGGTCCCTTTT
GGCAGATTGCCCCCGGTCTTATGTTTTTAAGCCTGACTTTTTAGCTTTAG
AGGTTTTTGTCTATAAGATTTTGATAGATTTTAGAATTATCTTTATTGTC
AACGCCTTTTATATTTTCCCATAGAATGATTAAATTTGCAGTGGTGAAAT
TTTTAAACCCTTTTGAAACACAGGATTCTTAAGATCCCTATTATTCGCTA
CTATCTGACACTCTCCTTTGTAAATGGTCTCTATATATTTTTAAGgtgag
tttttttcaattttcttcttgAACTTTTGTGCATAttttatagaaatatt
tttatagattttttttgctgtaaaacTTTAAAAGTGACTTAAAAGGTTTA
GAGCTttgttttggtgatttttttttttttttcacacgaTTTCATACGAA
CGTAAATCGAAAAATGTGCTCTTCAAAACCACGACATTCTGGACAAGCTA
GACACTTTGCCCCACGATCCACAATGTTTTTACCTTTTTATCGTTTACAT
TTTATCGACCTTGATACGCCATACTGCCtgttttttatcctttttcGTAC
GTTCTATAGATATACCATAAATTGTGttttaatttataattttgTGTAAA
CGTggttattttgttgttttaaattttgggaaataatttttttcatacac
TTCTATACTTTCATGCTGTTATATcgtatttttgtaaaattttaagcatt
tttttagaatttgtaAAACTCTTTCTTTCAAATCAACTTTCATTCATTCa
gaattttaataaatatttaatatttattcTAAATGATTTTCGTTCCATCC
TTAAAACCTACAAGGTGACAGATAAATGTTCGGTACCGTTCAAGtgttgt
acacattttttatcatAAGCAACTACCttcagggaagaaattttggcggg
aatttaatttggc

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_439:221260..232459-

Legend: exon

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>TCONS_00065409 ID=TCONS_00065409|Name=TCONS_00065409|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11200bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_439:221260..232459- (Clytia hemisphaerica)
AAAATGTCTGCTCGGTCGAGAAAAAGTTCTTGGAGTTCAACACCTAGTAG
CTCAGGAGAAATCGATGTTGTTTTCAAGAGACGTGCAAGTTCAGTTCGAG
TTCGCAGAAAGTCTTATCAGTACGTAACGCCCTGTACACACGATGATGTT
CTTGCATTTCGAAAGGTGGAGTATATTTATTGGATTTTCATGATAGTATT
ATCTTTGATCAGATTTTCTTTGTATCCAGTTAAGCTTTTTTAGAATTAGT
ATTTACAGTAAAAACGTACGTGGTTTTTTGTGTGATAAGATGTCTATGAG
ATAACATACCACTATAGTGCTTCTATTATAGATATAGATAGTAGATAACT
TCAGTCAAAATATTTGTTATTTTTAAAGCTGTTCCTGCCTTCCCGAGGTT
ACGCTTTTGACCTCACAGTATGATTAATTTTGTTTTACTCTTCGGCTATT
CTTTGGAATCCTTTCCATGAGAAGTATAAACAATTTAACCACAGAAAATA
AAGGGAAAATAGTGAGATTCGAGCATGATATTATTGTCCATTTGCACGTT
AAATGGGCACTCTTTGATACAATTTCAAAACCAAGAAACCTATACAGATC
CCTTGAAAACGATTTACACATTGCAGTAACAAAGTGCATTCTTGCAGCGA
TTCGGGTTTAGTCACGTCAACTTTAAAGGTCGGTTTTTGGAAATTTAAAA
TCAAAACTTAAATTCTGTGGAATCTCATCATTATGAAAGCTTCCGAAAAT
ACAATGACTATCTTTTACTTTGCTAGGCAACATGGAACTTGACGTCATCA
GATAGTGAAGCTCAACTTCGTGCTTCTTTGGAAGAATTTTGCGAGCCTCA
AACACCACTGGCGTCGATTCTCATGCTGCAAGTTCTGTACAATATTCACA
AGTGAGTCTTCACGGTTCTATCCTCTGATATCGAGTTGTTGTCACTGAAT
ACTCTCCGTTACCTAATAAGCCTCTCCTACCGAAAATTATATTGACACCC
CCCCCCCTCACTGCTTAGCCCAATGTTTTTTCACCCAGGACATTCATATC
TTTTTATTCTTTAGTTAAACCCTACGCTGGTTGTTGTGATGGACCCGCTT
TCTTTAAGATACCCAAAAATTCAATTTGTTTTATTTCTCTGTATGATTTA
TCTTTGCTACGAGACAAGAATCAAGCTTTTAATACATTGATGATGATAAA
TAATGTTCGGGATTTCGTTGATCAAAATCTACTAGCCTTAAACATTAGTC
TGTTAAACGGTTTACTAAGTATATATTTTGATCTTTACAGATCAGGTCGA
GATTTAATTGTTAAGTTTTCAAGGGTTTTAAATGTTATCTTTCTTATTTG
AAATTTTCAGACGAATTTACGATGAGCCTCACGTGGAAAAGTATTACCGC
ATTTTCATCAAAGGGACCGTCTTCGAAAGATATGTTTGGCAATTAGAGGG
AGCTTCCAAATTCCTTCAGTTTCTCGGATGGATTAAGGTAAGGATATTAA
ACAAGTCGTCCGGTGAGAATTATTTAGGGGTGATGTAAAGGAATAGGATA
AAAATCTCGTTTTTTAATGGGCGAGAACTTAACGTTTTTGATCTTTTAAG
CTCAAAAATCCAGTGAAGATCTTTTAAAATTATAAAGCCTTTAACATTTA
GCTGATTTGCTGAAAAATATTTTCCAAATGCCGTTACCTTTCTATATACA
CATATAAACGATATCAAAATTGGATATTTTTCGGATTTTAAACTTTTTCA
ACATAAGAATTGGTCATCAAAACGATACAAATGAATTTACAGTCGACTTC
ATCACCTTCGTCGGAAAGCAGGGGTTCAGAGTATATACCAACGGTCTTCT
TTTCAACCATAATCTCTTTTCATTTCATAGTGTGGCAATTACATTGTCTT
ATCCAAGAGTTATCCAGTCGCTACAAGTCTTAAAGTCATCGAAAGTGTTC
TCAGGTAGGCTTCAATTATTTCCTGGGGCGGGTGTGCAGAAGATTGATGG
TAACATGTGCCGCTTGGTTTTGGAGAAAGGGAATTCAATGCCAACGTTGT
TGATTTCTAGGATCTAAATGAGACTTGACAAATCTTCTGGCATAAAAACA
ATAAAGTTTTATTTAGGTGATCGCTTAGGCTGCTGGCATCCACCAACGGA
ATCATACTTCTTACACTATCTGGGGTTTTGTTTGTAGAGGTCAGGTCTGC
GATTCAGGCTTGTGATCGGTTAGCTCTTAAATATCAAATATAAGGCTCTT
ACTGTAAACTTTCTGAATTTTGCATATCCATCAGTTGATACACTCTCGAT
AACCGTTGTGAAATGCTGCTCAAAAATTTCTAGGAACTGAATTAAGGACA
ATGTCATCAATGATAATGCGCACCGAGTGAAAATTTTTATCTTGTAACCA
GATGTTGATTAAAGATTTATTGAAGGAAGTCTAAATCAGGGTGTTTGAAG
ATACACCTCTGTACGTTAGAGCTTTAATAGATTAAGGAGGATAGTGATTA
CACAAAATGAAGCTTGCACAGAAGAAGGTCTCCTTTTACCTGATATCATT
AGTTTTTTTTTCATTTTGTAAATTAGACTTCTTCAGTCAGGCTGTCCATT
CGAAAGCTTTAGACCCGAGCTGACCCAAGAAGTTTCGCATACTTTTTTGG
GGGGCAGGAGATGATTTGGCTATTTGGACGATGCACTGAGTCAAGTGTGC
CTTTGCCACGATTGTCAAGAACCCTTATTTTGTTTCTGCGATACTTTACT
TCTTGGAATCGATAAAGGTGGTTTTCCAAGCATTTGGCGAAGTTTGAATA
ATCTTTTGGAATGTCGTATCAGTATAAATGAAAGTATGATAAAATAATCA
TATGAAAGACCCTTCAAGCATCTTATTTATTTACTAAGGGAAGTAAGGGG
GGGTGGCTCGAGGCCCTCAAAATCTCAAGATTGACAAGTGCTATGACCTT
GAAATTTTGACCAGATATGGTAGATATGGATAATCGAAGATAATTTGCAA
AATTTTGGCTCGGCCACCTGTCTCGTTGGTATTTTACAGACCAGAATGTA
AACTTGAACAAAATCATGTCATGTTTTGACTGATTGACTCGTTCGAATTG
ACTGAAGTTTGATCCTGAAGGCTAAAATGTCATTAAAAAGAGGCTAGTAT
CAGAAAAAATTGGTTTCTGTGAGTTTTTGTTACTTTGCAGACTGGAATGT
TTTGGCTGCAAGCTTGTATCATCCATACCTAACACTTAATTTCAATTTCA
AGTCAATAGCATTTTCCAATCGCTAGATATAGTATCCTAGAGCTGATTTA
GGCAAAAAGGCCAATTTTAGGTCGGTGTGTAAAAATTGATCCAATGTACC
AAAAATATGTCACGTAGAGTTGCCTCACAAAATTTGAGCCAGAATAATTA
AAGCAGTGTTTTCGGTATTTCTAAAGAATGATGACGTCAGGTGGCAATGA
CTTATCAATTGCCAAAGATGCCAATTCATATTNTGTACCATAATGGCGCG
CATTCGTCAACAGAAATGGACATAAGGCATTTTTCTTCTATAAATTTCAC
TGGAAAATGGACTTAAGTATAAATTGCTTAATAAAAGTGATGAAAACAAT
CCCACAATTTCAATTAAGAAACTGATAAACAATGAGCAGGTAGGTATAAT
AAGTTTCTAGTCGTTTTATATCAAGAATCTATTCTTAATCTATCAATTCA
TAACATTTAAATTAGCTTAAGTCCACTTTATTCTAGCACATGTAAAAGTA
AAAAGCCTTATGTCCAAATTTGGACAGCTTTCTCCCAAATGAGATAAAAT
CCAAGAAATCTAAAGTCACCATTCAAAAGAGCACAGCCTTGTGTCCCAAA
AAATGTAAAAAAAAAAATTTTCAAAAAATGGACATAAGGCACTCTTATTC
TACTGCGACGATTTGGTGCATTTTTAAAAGTAAATCAAATCAATATTGGA
TAAATATTTCAAAAGTTATAAAAAAGATTCGTTTTCGGTGGAGGGCTCCC
AAGATTATATATATTTTGAAGAGTTAAGAATTTCGGGGCTCAAGGTCCCT
GGAAGTGAATTCCACTTGTTTGATTTGTATCCCATATACAAATCTTAATT
CTGCTACTGAATATGAGTGTTTCTGATACGTTTAGTGCAAGAAATGTCAG
GTCACTGTCTTGTTTGGAGTGTTTTGTTTGCTTTCGTTGGTTACTATTGA
CAAGTGTTTTAATTTTTTTCCTTTCCAAATTGGTTGTCTGTTTTCCATTA
CAAATAAAAACGTCACCAAACATCAAAATTTCGTTAAACCTTTAGTTGCC
ATGGAAATATTCCGTTTCTAGGTCGGGATAAGTAAATTGCCGTCACTTGG
AAAAGATTGTTGACTTCCTTAATTTAGCACTAGATTATTTTTCTGTTTGT
ATATTTACAATGGGGCTTCATAATGTTTTTGTTATGACCATCGTGAAATT
GCTGGCTTCTTTACTGCTTTGTAAGGTCATTATTTTTTGCAGAGATATTG
CTTGTGTTGTTTTCGCGCTATAGAAAACGACCTCCGTTGAAGAAGAATGA
AGCATTTCTCTATTGATGCAATTTTTGAGTTCGATATCGACATAGTCATT
AATATCGTGCGTACTTAGTTGCTAACCATTAAGAAATTGTAATTGCTTTA
ATTGATCAGTCCTCTAATTTGAGAGAGAAAAATTCATCTTTAATAAAATG
ATGTGGACATAACCTCCTGGATAGTTATACTGGTGCTTCATGGAACCGGG
GGTTTGATGATTTTTTTTTTGTATTAGCCAAGAACTAGATGATTGTTTGA
GTACAGACCTATAATGTGGTCACCAGATGTCATAGAGAGATTATTACAAG
AGTCATAGTGACAACAACATAAACTGTCTGATGTTTTATTTTGTCAAGAA
GTTTATTTTCATGAAATGTTTTATTATTTTTGTTTCTTTTTTTCACATCT
GGATTTGGTGTTAAACGATGTTTTCTTATCGAAATAAAGACCGAGATTTT
ATAGATTTGTGTAAATGTTTATCCAATTTGACGATAGGAGACTTGTTTTA
TGTGTGCGATCTTTATTTGATAGCAATTAATAAATAGGGAGGCGTTAGGA
AGAACTCATCTGGAGCTCTTGAAGAAGGCCTATTTTCAAGATAAGAGAGA
TCCTGGTTTTGATCTCTTTGATGTTCTCTGGTTTTGAACTTTTGAACGAT
TTGAACTTAATGATTAGAACTGGATGATCTTTGTTTGTGAATATTAGATT
TAGTTTATAAGAGATCTTATTTTATCAACTCTACCCTTCTAGTAAAATTC
TAAATCGTTTAAATTTCTCGAAAGTATCTTTCCAACGGAATTTTGATTCT
ATACGTGAACTTTGGATTTGTTAATCGATTTATCTTTTTCCTTGAAAAGA
TTTAGAAACAATAAGACACAAGAAAAACTGTGAATATTTGACTTATCTTA
TGCAATAAGAAGCTTTTTAAAAGCTGTTGGTATTTCAATAATGGATACTA
TATACTCCTGGTTTGGTCTCAGTCGTGAACAAGTTAACGAAGAAACGGAT
GAAGAGTAAATATCCAAGCTTCTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTAACT
TTTGAAAAAAAACGATCCATAGCGAACTAATTTTAGTGTGGACGCTCTAC
AATAGGACTAGTTTTCTAGAGAACTTAAATCACATTATCACCTAAAGTCA
TTACACTTAACCAAGTTATAGAATTCAAGGAAAGAGGTCCAGAGGAGAAT
ATTAAAATGGCTCACAAAGTAACGTTGAAGCCGGTAAAAGCTCCTGGTGT
TCAAGTCTCCCATTAGTCGGCAAAGAGGAAATCTATAAAATTCCACCCTA
AATAGAAATGTTGTTTCAATTTTCCTTTCTAATTGTTTTTTAGGCGAAAG
AAGAAAGCTGAGGGTGGTATCAGTCGTCAGACTTCCTTGAAAAACCGTCA
TCCAAACGTTGACATCATTGGAGAAGATGAAGTAGTGGCCTCATTCACTA
AGGTTGAAAATGACATTGACAGTGGTGTTGAAGATGTCGAGGTAGGTTGA
CCAATCAACTTTTTGATCAAAAATAAATTACATATTTTTAATGGGGAATC
GATTTTGGAGTTTGATAAGTGACCTTCAGCTCTTTTGCACTGTTTGAAAT
AGCTACACCTGAATTTCTATGAACAGTCCTGTGGTCCTTGAATACTGCCT
TTTGGTGTTTATTAGGGTTTTGAGTCATAAATGATTAAAAACCACCAGCC
AATGAAACATCAAACATCCATGCAACATCATAAATGCAACATACGTTCTG
TCAAACTTATTATCTAACGATGTCATTTAATAAACTGTCAGAAGGAGTTG
CTATTTACTAGTTGCCATGTTTTAAACGTCCAATTAACACAACTGACAGT
GGATTGTTTCCTGAATTTTGCAATTTAATTTTTCTCTCGTGGATCTGCTT
TTCAAATTCTTAAAAGTAATATTAACATTTTTTGAAACATTTAACCTTTA
ATCCTTAAACTTCGAAAATCCTACTACCTCTAAATGTTACTGAAACAGAA
TATTTCATACAAAGAAAATGTGGCCGAGAAGACTATTCTTTTAAAGTCTA
CCAAATCCACCTACCAGTTCGATTGTTCAAAAAAGATTTATTTTTGGTGA
AACTTTCTTTCTATATTCTTGCAGGAACATTCTACGTCATCCACGTCAAA
CGTCATGCGTCGTTTCGTGAGACGTATACGTCAAACTACCGATAAACGAT
ATCAATTTAACAATAACTATAACAAATAAACCTTCACAATGACTAATGGT
AATGAATAAAGTTTGCGCAGTATTAAAACCTTAAAACCTTAAAGTTAAAT
TCCATAAATTGGGGTAACTAATATTAGCAAGTGTGTAACTTTAACAGGAA
CTTTTATCTCGAAACATCGGAGTTTCCTGTCTGTAAATTATAATCAAGCT
AGAATGTAAAAGTATGTATCTTTAATTGACCAATTTTAATAGAAGAAAAT
TTAATCTGACAACATAAATAATGATAACGATAATGATAAAGTTGAACCCA
AAAGCTTATTCTGAAATCGAAATGTATTGATGTATGAATCTATAAGACAG
GGTTCAGACAGACCCTGGAAAACCTGGAAAACCTGGAAATATGATAAATT
TTCAGAAAGATCAGGGAAACTCAGGGAAACCCAGGGAAAAATTTTTTTTT
CCCCAGTCTGCTCAGGGAAACTCAGGGAATTTTATTTTTTGAAGAATGAA
TGGAAAAAACAGATTTAAAAGTTTTTTTAGTTTTAAAGTGTTTATTCATA
TGCAGTATTGGTAGCTTTAATTTTTACCTTAGGTTTACCATTTGATTTGT
GTGCCTTTTGTTTAAAGATACATCTCTTTTGACTCTGCTTAGTTTTTATG
GTTTGCTTGATACTCAGGGAAAAAATAGCTAAAATGAGGGATTTCTCAGG
GAAAAAACCTTTGAAAATTAATTAAAATTCAGGGAAACTCAGGGAATTTT
ATTTTCGAAGGTCTGTCTGAACCCTGTAAGACTTAAAACCCCATTAAAAC
CAACTCCTCTCTTTTCCTCTCTTCAGGCCAGTCTTCGACGTAAGCCGAAA
TTGCGACGTGTCGAATCCAAAGAACATTTACTGGGTGAAGAGGAATACGT
CGTCGTTGATTTTGTCGGCAATGTCGAACTTTCCAGTCGTAAGTCGTCAA
GAGTTGAGCAACCAGATGATCTGCAGTTGGATGTCCACCTTGATGAGGAG
GAACCGGAATCAGCAATTGGAATGACACCTCCTTCATCGCAATCGCCAAC
GTCGAATATATCCCCTACATTTGATGATATTTCAGATAACATTTATGTTG
CTGCTTCACCAGAAAAGCCTTCAGTTGAGATCTCCACAAACGAGAAACCC
GAAGAATCTCTTATCGAGAAATCAGACATTGACGTCCCTTTCACAGACAA
CCAGGAACGAGCCGATGTAGAAATCAAGATTGATGTCGACGTACCGGTTG
CTCCAATTTCAGAATCTAAACCAGAGGAAGTTTTACCAAAGCAATCAGAT
AATGTTGCTGAGAAGCCGAAAAGTAAAGGCTTGAAGGGATTAAAAAACAG
ACGAAAAACTGAAGAGATACCAACTCCACCAAAGGCTGAAACTCCACCAC
AAGCTGATTCACCCACTTTGATGTCTCGATCATCATCCAACCGAAGTATC
AGTTCGCGACGGAGTATTGATGAATCAGGCAGCAGACGTGGTTCACCTCG
GACCAGTACGGTATTACAAAACAAACTTTTATTTGATCAAAAGGCTTCAG
GTCAATTTAAAAAGAGTCCATCATCATCGTCGACAACCAGTTTGAATTCG
TTGCGTGAAGGACGGCAGGAATCGTTGAGAGGCTCCAACGGAAGACCTGT
ATCAGGGACAGTTGCTGGTACTTTAAGCATGTTTGAAGCCAATTCACCTG
GAGGACGCTCCAAGAATGCTACTAAGAAAAAAGCTGATAACAATTGGGGC
GCTTCCCTCGAAACGAAAGCTACACCCGTGGCGAAGGTTGAAGAGCCGGC
GCCGACACTGGAAAAACCACCCGTCGAAGAATCCAAACCAGTATCCACCG
GCAAAAAGAAGCGATTTCCATTTAAGAAAAAGAAGTCATCCAATATTTCA
AACAAAAATATGTCGGAAACACCATCGGGAGACGTCCAACTCGTTAGTGC
AACTCCGGTCAAGAGTGACTTTCAAGAGCGTGCTATTGACGTCCCCACCG
AAATTGTTCAAGCTACGGACGCTGCAGAACTAAAGGTGGAAGAACCGATC
AATGAGAAGAAAAAGAAATCAGGATCTTTAATGTCACGAATGAAAAGACG
AAGTCGTAAAAGTTCCACTGAACATTCTGATAACGAGTTGACCACATCGG
TGGAGATTGCAGCCAAAGTTGAAGATCCTGTTATCGAGGAATCGTCTACT
CATTTACCGCCAATCGTTGATACTGGTGTTGATCAAACGTTACCAGAGCA
GTCAGTTTCTATTGATGTCAAGCAACCTGAACCTTCACCAGCTCCTATTG
AGTCTGACGCATCCTTTTCGATCGACAGTAGACAAGTAGCTTCTGTTGAG
GATTTGGTGTCACCAGAAGATGACCCACCAAGTCCTGCTCAAGCCTCAGA
GGAGGTGAAATCTTTGTTAGAAAGCATCATCGATCGTAAACCATTCGAAG
ATAGTTCTTCTACCACTAAAAAGAAGAAATTAAGATTGAAAAAGAAATCG
AAAAATAAAATAGAAACTGAGAAACCTCTTCCGTCAGTTGAACTTGTCGT
TACACCGACTCCCGTTAAAGAAGAAGTCGTTGACGAGGGAATCTCCGAGA
ATAAAATCACTGATGACGTGTCGATTTCTGATTGGCCAGAAGAAATGATG
AATGATAACAACAATGACGTCATCGTAGAGGACGAGAAAAAAGTCGAACC
GTTACCGACGATCGAAGGAGAGCTGGAAAGCCCGTTAGCAACCAGTGAAT
TGATACCTCAAATATCAGTCGAACCAGCTGATGATACCGTCACTAATGAC
GTCACTGACGGACATGATGACGGAATGATGGACGTCAGTTTACATGATGA
TAACGCTAGTAGTATTTATTCGCCCGACGATGACTCTTTATCGATGACAG
GCTCTATAAACACTGAGAAAAAGAAAAAGAGACGCTTCAAGTTTGGTCTT
CGTAAAAGCAGTAGTAAGAAGAAAGAGAAACAACAACAGCTCTCCCCTCA
AAACGAATCAGACATCTGGGAGCATAATGACGATCATAAATTAGAAAAGA
AAAATTCGTCCAAGAAATTGAAGCGTCCCAAAAGTCTTGATTTCCTTGCC
GATGTCATCCACCCGAGTCATAAGAAAGATGATAAAAAACAACGCCCGGT
TTCTGTGGCGGAACACGCCGAAGAACAACCGCCTGCTCCTAAATCGCCTA
CTAAGAGAAAAACATTAAGCTTATTCAAGAAGAAGAAGAAGCAGTCGTCT
TCGGATACATCAACTCATGACCGCACAATATCTGATGTCGAATCTGATCA
AGTTCCGTCACCCACTGATGTTTTTAAAATACCGGACGTGGTTGATGGCG
GAAATAAAAACGGACATGCAACTTTATCAGTTGATCATTCAGAGCATAGT
GTAAACACTGAAATGTCGCTATCTGTTAAATAATTTTATTGGAGACGCCA
TTCCTTTCTTAGATATGTTTTTTTTAGAAATTAGATTTTTTAGAGATCCC
CTTTTTATGATAAATTTTAAAATGAGAGGTCCCTTTTGGCAGATTGCCCC
CGGTCTTATGTTTTTAAGCCTGACTTTTTAGCTTTAGAGGTTTTTGTCTA
TAAGATTTTGATAGATTTTAGAATTATCTTTATTGTCAACGCCTTTTATA
TTTTCCCATAGAATGATTAAATTTGCAGTGGTGAAATTTTTAAACCCTTT
TGAAACACAGGATTCTTAAGATCCCTATTATTCGCTACTATCTGACACTC
TCCTTTGTAAATGGTCTCTATATATTTTTAAGGTGAGTTTTTTTCAATTT
TCTTCTTGAACTTTTGTGCATATTTTATAGAAATATTTTTATAGATTTTT
TTTGCTGTAAAACTTTAAAAGTGACTTAAAAGGTTTAGAGCTTTGTTTTG
GTGATTTTTTTTTTTTTTTCACACGATTTCATACGAACGTAAATCGAAAA
ATGTGCTCTTCAAAACCACGACATTCTGGACAAGCTAGACACTTTGCCCC
ACGATCCACAATGTTTTTACCTTTTTATCGTTTACATTTTATCGACCTTG
ATACGCCATACTGCCTGTTTTTTATCCTTTTTCGTACGTTCTATAGATAT
ACCATAAATTGTGTTTTAATTTATAATTTTGTGTAAACGTGGTTATTTTG
TTGTTTTAAATTTTGGGAAATAATTTTTTTCATACACTTCTATACTTTCA
TGCTGTTATATCGTATTTTTGTAAAATTTTAAGCATTTTTTTAGAATTTG
TAAAACTCTTTCTTTCAAATCAACTTTCATTCATTCAGAATTTTAATAAA
TATTTAATATTTATTCTAAATGATTTTCGTTCCATCCTTAAAACCTACAA
GGTGACAGATAAATGTTCGGTACCGTTCAAGTGTTGTACACATTTTTTAT
CATAAGCAACTACCTTCAGGGAAGAAATTTTGGCGGGAATTTAATTTGGC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_040996	XLOC_040996	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_439	supercontig	scaffold_439:221260..232459 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.495754	3.18029e-07	0.679225	1.19816	13.237	11.6784	4.20594	7.09287	2.49986	0.00034822	1.86451	1.74557	18.0022	23.0539	3.26813e-10	0.866157	0.255303	0.655299	24.6274	21.3523	0	0.119547	0.279312	0.175332	5.31154	0.00118457	0.223797	0	0	0

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00065409 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00065409 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00065409 (transcript) - C. hemisphaerica