TCONS_00065572 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00065572
Unique Name	TCONS_00065572
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	5451

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_440:399838..439900+

transcript sequence

>TCONS_00065572 ID=TCONS_00065572|Name=TCONS_00065572|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5451bp
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AAGTGTGATTGCTCGAAAGAAAAAGAAGTCTTGAAACGTGACTACGAGGA
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GAGGACCGGTTAGGTTTTATCCGGACTTTGCAATTGATAACGGAACAGAA
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ACGGACAACGGAAATCGTCAATGTCGTTAGACGAAATGTATAATTTATTC
GGCGTGACGGAGAAAAATAATATGGAAACAAAAGTCTTACCGATGTGAAT
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c

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>TCONS_00065572 ID=TCONS_00065572|Name=TCONS_00065572|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=40063bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_440:399838..439900+ (Clytia hemisphaerica)
GAAAACTTGATAAAAATTagagagaagaaaaataaagcagTTAAAAATCG
GCAAAAATAAGCTGTCTGATACAAAACATCAGTCGTGTTTGCAGTAATgt
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TTGAATGTATGTATAAGAACTCTTGTGTAAAACAGTCTTCCCTATTCCCT
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GACCGGTTACGACGCTGTACCAGAATTCCACAAGAAATCCCGATATTTTC
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ATCGACGTTCAAAATCGAATGCACTCGGCCATAGAGACTTTATATGGCCT
TACAAACATAggcttttgttttttcttatcaTGGATGATTCAGCGTGAAT
ATTTTCAACCAAATTGACTGACATCGTCAGATTCTAGTTGACCAGATCGA
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GCATTTTAAGTAATCTACTTTAGGGATTGTTGATGCTGTATTTTAAAAGA
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AATACTTGCAAGGATATTTATATTCGTGAGCAAAATGTTTTCCAGTAGAA
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ACACTTGGTAAGTGATTTAATATTTATGTAATTTTCTATTAAGCAACCTT
GTTGCCCTCTAGCTGTGTGGCTGTTCTCTAATTCAAAAGTCTGCCTTATT
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_041090	XLOC_041090	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00065572 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00065572 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00065572 (transcript) - C. hemisphaerica