TCONS_00069593 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00069593
Unique Name	TCONS_00069593
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1728

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at scaffold_502:166103..184076-
coding sequence from alignment at scaffold_502:166103..184076-

transcript sequence

>TCONS_00069593 ID=TCONS_00069593|Name=TCONS_00069593|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1728bp
TTCTAATTAATTAGTTTCGCCTGGTTACCCACGCCCTAATTATCAGCACT
ATTGTTTGTGTAACCATGGGAACAGGTAGTCGACGTGGAACGTCATTTTC
TTCCAGTGATGGGATGATGGCAATGCAGCGTAAAAATACAAAGattTCAC
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aacaacaacgacaatAACAATATAGTACGAAAGTCCAAGAAACCACATTG
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GCAAAAAGATGCTTACGAAGACTTCTTAAATGCCAGTGAAGGAATCATGG
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GACCACGTGGTCTCAAGATGGGACACTTTGTGTAGCAACATTGAGAAGTG
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tcgttaaaagcataaaatgaaacaatagattttgatgatataccacttgg
gagtaccttgctaacaacgtcaaaactt

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00069593-protein

>TCONS_00069593-protein ID=TCONS_00069593-protein|Name=TCONS_00069593-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=435bp
MGTGSRRGTSFSSSDGMMAMQRKNTKISPNSSFRICSPNQTFSNNNNNDN
NNIVRKSKKPHWNTSTRLHHMDPHLSQEVTMDVFSLTREIHTPIGPPMNA
SERATTPKDDKPMLPLKRSDILPNVKIYNLWSQHLSKDQITAEAAWNRCR
LITEEALEKFGERLDFLENVAAWEITAEILLEFQSLEEKKGEIEAGLFEV
EDYDIEIKEVAKATQNVAQYLAPIEEREELKMKIVTLRRRYFKVLQELCK
KKELFRWLLPLLEQYRDQGCDIKSWLDVTESRTEFLTSNFNNNEIIVKNE
DLIEEIKEELFVQKDAYEDFLNASEGIMDLLSSDDDVIIQIRTDHDHVVS
RWDTLCSNIEKCLNRLVYAKKVLSEQSRTINTDPEKIEKKIRNEAKQCTC
HKPFQITRVGEGKYTFGTSKIVRLVRVHXDELLLR

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_502:166103..184076-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

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>TCONS_00069593 ID=TCONS_00069593|Name=TCONS_00069593|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17974bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_502:166103..184076- (Clytia hemisphaerica)
TTCTAATTAATTAGTTTCGCCTGGTTACCCACGCCCTAATTATCAGCAGT
ATGTAGTATTTCATTTATTGTTGATTTTAATAATTTAGTTAGTTTTAATT
AGAAGTTTTTCACACCTATTGGATTTTTTACATTGCATTGTACAAATGTA
ATATTGTGGACTGGATTATTCGCTGGCGATTGTGAATACTTTTGCAAATC
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AGAATAACTTCTATAAGAATATCAGGGTGAGATTTCGGGTTTAAAACAAT
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GCTCGGAGATGAATAACTCTGAAATCTGAGACACAGACACCCAGGGTCAG
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TTACATATAATTTTTTCAGATATATTATAATGAAAGTGATAAAATAATAT
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TTTTATAGCTTTCTTCTTATTATATTGGCGCTTATCTTTTTATCAGTTCT
TGGTTTAATTCTTTCTTTGGAATATTTCAATTAATTTGGAGTTGAAGATT
TTATTTTATGTATGGGACTTTGAAAATCGTTCTGACCATCAAGTTTGAAG
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TTGTGGGCGTGAGGCGGGTGTGGTTAGTTCTGGGGTGTAATATATACGCT
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AAATTCAACACAAATTTAGCATATAGTACATACCGGAAGCATAAAATGGC
ATTTTTATGAAAGTTTTGAGCCTTACTTGGAATAATTGACAATTTACAGT
TTTTAAAAAAGCTCTAAAATTCTTAGGTTCTGCAGCCAAACCCCATGAAG
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TTGGATTGTCCGAATCGATATCGAGAAAATTGTTGTCTGTAAGGAGATGC
GAAATGCGTTTATGTCAACAATTGTATTCGGATCATATTGTAGCTTACCC
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GCTTTCGGAAGTAGCTGCATAAACAAAAATTATTTTCCTTAAATGTCATT
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GATGCCTGACTTGATATTGTAAGCTCTCTAAGATTGAAGTCATCCATATT
TTGGTGTAGTCTTAGTTTATTGAAAATTTGAGAATTTAAAGTTTTTCAAG
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CTTCATTTACCAGCTATGAACGAGTTAGAAATGTTATCACTTTTCTGTCT
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TATCTTTGGATATCAAGATGAACGTTGATCTTGATACAATACTTCAGTCG
CGTGTCCCGTGAAAAATTACAAAAATGCGCTATCGGGTTGTTTTTCATCT
TTGGAATCCTTTTGAAAGGCGGTAGGCTTCTGCTCATCCTCTAGCGAAAA
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AAGGCGGACACTTTAATTCGTGAAAGGGTATTAGAGTAGTTTGTTTTTTT
TGCAGACAATTTTTTGTACTTTTTGGTACAATATAGTCTAGCATCAGTCG
GCCCGTACAACAACCACAAATTTAATTTTTTTCGCTTCGCCTAAGATAAT
TTCAAAGTGCAAGTTTCGATGCAATCAGTGGGCACCAACAGTTTTTAGTT
TTCTAACTCTCTTCACAGGGTCAGCGGGCAAGCAGTTAGGATTGGACAGT
ATGACGATTAATACAGCACACAGAAATTTTGATCTTCGAATCTCATATTT
TTTTGAATTTTTTTAAAGGCTCCTTTTTCTAATACAATTTTCCAATTTGA
GTCAAATGATGGATCGTGACTTTGATTTGTTTCAACAGCTCTGTTAATAA
TTCGGTTCCAAGGGTCTTCTTTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGGGGGGGGTGGGTTTCTTCGGAT
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CGCGTTTTGGATGGGAAATAAGTGGCTTCAATTTCTCTTGACTGAGAAGG
GTTAAAGTTTCGCCTCTAGCACTTCGGGCTTCAAACTCAATGTATCCGAG
TCGGGTAGCCTAGTTATTCAGGCTGTAAATTTTTTTCTGATGTTTTTGGT
TTACCGTCTTGTTTTTCTAAGGCCATTTGAATTTCAAAATCAGAAGACAG
TACATGCGTAATTTGTCAATTTAAACACGATTGCGTCAAGCTAGAACTTT
GCCAAGTTGTACACGTTTTTATAAAAACAAACTATATCATAATATAAGGC
TTCGATGGTAACATATTTAGAATAAGTTACGGATTTAAAGGCTTTACAGA
GCCTAAAACACCCAATTTCTTAGGAAATACTCTTAAAATACTCAAAAAAT
GGAAGAAATAAGAACAATTTTAGGCTTAAATCTCAAAAAGTTAAGAACAT
CCGAAGGCTTCAAAAAATTTGGATGTTCTTTTAAAGAAAAACGTGTAAAT
AGCCAAAATATCANAGGCTTCAAAAAATTTGGATGTTCTTTTAAAGAAAA
ACGTGTAAATAGCCGAAATATCAAGATAGAAAAATAATTTACAGCATGGA
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TGTAATTCATAATCAAGTTGTGTAAATGAGCAGAAAGTTTATCATATTAT
CAATGGAATTAAAGTCATTAGTTAGGGCTTATTATCGATTTAATGCGATT
TTTGTATAGTGAGTTCCCTCGACGGTTAACGGTTTCTCTCTACTCATTCA
TTGCGCTTAATTGTCCCGTGCATTTAAAAAAGTTTTATGTGAGAATTCAA
AAACACCAACCGCGATGACACAAAAAGTGATTCTTGTGTTGCTTGCATCG
AGTAATTTTGAATGGTGAGTTTGAATTATTTTTTGTGAAAGGCATCTTTG
AATGAGTATCAGTGTGTAACAGACAAGAACACAGCTTGCTTGTCATAAGA
CGTAAATGGGTTAATGGTGTGTATTTTCTTGTGACTATGTTTATTTTGTT
AACGTGTAGTAGAAGGACAGAAAGGGACATCTACTTTGAAGCTCTGCTCT
TTGCTGGGGTGGTGTTTTTGAGAAATTGAACGCGAATTATTTGTAGAAAA
TCTTTTTGTGAGGTATGTTTTTTTTTCTAATTGTTTTTTCAAAGACTTGG
AGTTTTGGTATTCTATTTTTGAAATGTTCATATTATTCTCATTCACAGTT
TAGTTTACTGGATTTTTTCTATGGTGTTCTATACGTTATTTTAAAAAAGA
GCATCCAAAACTGTTGAAGCCTTTGGATGTTCTTAACTTTTCGAGTCTTT
AACCCAAAAATGTTATTAACATGTTCTTAATTTCACGATATTGTTAGTAT
TTTTGGGGAGAAATCGGTTTTTTCGAGTCCGCATAACCTTAAAGTGTTAC
TAAATTATTCTTAAGATTTAGGTCATTGAAGCCTTATGATCTTAGATAGT
TTGTTCTTATAAAAAACGTGTATGCCGACAGGCAGTTAGGCTATTCTTAT
GCCGCCAATTTCAATCCAAAATCGAAGATTTGTTTGTGCGCAGGCTTTTT
GAAGATGATCTCGGTTATCCCAATTGCTTGCTCATTTTCCCACTTCATAG
AGTTCACAGTGAATTCAACGAAATGTCTAAAAGGAAAAACAGTTAGAATT
TTAAATGAAAAGTCCAGGTGTTAAAAATAGCAAGAATGACATCAATAATT
GATCCAGCTCTTCGAGTTCTTCTAGTGTTTAATGTCAATTTGATTGAGAA
TGTCAATAGATGATCAGATTTTACTTATGAGAGGTGCCTGTGATTGCTTC
AGAAAAGACATTAGACAGTTTATTTTCGTATGGTGCCCATTGAAAAGAAA
ATACTGACAAGTTAATCAGAAGATACGAAAAAACATAGACAAAGTCAGAT
TCTCATATCCAGTTCATACTTGTTGATGCTTCTGAAGTAGCTACATACGC
ATAGTATTGTTTATAGAAGATAAAATTCCTTAGATAACGGCTTCGATATT
TCTTCGAAGAATTTTTTAAAATTGTTATCAAAATGGTATCGAACGTTGAT
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TGTGAGAATTCAAAAACACCAACCGCGATGACACAAAAAGTGATTCTTGT
GTCGCTTGCATCGAGTAATTTTGAATGGTGAGTTTGAATTATTTTTTGTG
AAAGGCATCTTTGAATGAGTATCAGTGTGTAACAGACAAGAACACAGCTT
GCTTGTCATAAGACGTAAATGGGTTAATGGTGTGTATTTTCTTGTGACTA
TGTTTATTTTGTTAACGTGTAGTAGAAGGACAGAAAGGGACATCTACTTT
GAAGCTCTGCTCTTTGCTGGGGTGGTGTTTTTGAGAAATTGAACGCGAAT
TATTTGTAGAAAATCTTTTTGTGAGGTATGTTTTTTTTTCTAATTGTTTT
TTCAAAGACTTGGAGTTTTGGTATTCTATTTTTGAAATGTTCATATTATT
CTCATTCACAGTTTAGTTTACTGGATTTTTTCTATGGTGTTCTATACGTT
ATTTTAAAAAAGAGCATCCAAAACTGTTGAAGCCTTTGGATGTTCTTAAC
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ATGTTCTTAGATAGCTTCTTCTTATAAAAAACGTGCATGCCGACAGGCAG
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GTGCTCGGTTATCCCAATTGCTTGCTCATTTTCCCACTTCATAGAGTTCA
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GAAAAGTCCAGGTGTTAAAAATAGCAAGAGTGACATCAATAATTGATCCA
GTTCTTCGAGTTCTTCTAGTGTTTAATGTCAATTTGATTGAGAATGTCAA
TAGATTTTACTTTTGAAAGGTGGGTGCCTGTGATTCCTTCAGAAAAGACA
TTAGACAGTTTATTTCCGTATGGTGCCCATTGACAAGAAAAAACTGACAA
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ATCTTTTAATAAATGTGATTTTGAAGTCTATTAGCGATTTGCATTACTTG
GCATATGCTCATTTTTGGGATCCAGACGGTTTGCGTGAAAGATGCACGAA
TGAGATCTTTTAATTGTGATCATGCACGAATTTACAATATTTAATTGTCA
ATTTAGTTTCTGCTTACCATGGCACTTTCTGATGCTCCTTTACGTACGCC
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ACAAATCTTCCTAACTACTTTTGAATTCGAAAAACTATTTGAACAGTCTG
CTTCCTCGTGCATTGATATCATGCTTGATCATGCTTTAATTAATTGCTTG
ACCAAGCTTATCTTACTGCCCACTTGACAATATTGTTATGAGTCAAAAAG
TGCCACAAATTAAATTTGGTAGATGTTTTTCAAAATTTTCTTGATGATAG
TGATGTTGGTACAATTCTACAAAAAATTGATTTTCTTTTTCATTTTTTCA
AACTTTTTTAATTTTTTTTTATATTTAATGATATTCCATTCCTGATTATC
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TAGGCTTTTTTCTTTGCTCTAGATTATTTTAAGACAGACTTTGTTATTGT
TACTTTATTGTTTATGTGACTTTTCTTGGGGACGTTTTACAGATTTTAGA
CAGCTTTTGTCAGCTACTCTGTACTACCATTGCCTTTCCAATTTTAATAT
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AACCCGTATGATTAAAAAAAATGCCACTGTGTCTGTTTTTGTCAAGATTA
CGTCATTATATTGTATCAAAATGACTAATTTGTTACCGATGGGTTTCGTA
TTTATGATGTTGATAAATTTCCCAGACAGAGGTGATGAAATTCTGTCAAC
AATTCACTTATTTTGGTCATCATAAAAATCTTAATTAATGTCTGGAAACT
GGATTTGATACCAATAGTGGATTCCAGGGGGGTCAATATCGCCAAACTAG
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GGCAGCTGCTATTATATTGAATCTGATTTAGTAAATGATTTTGAGCATCT
GAAGTATTTTGATGTGATACAGGGGTGTCTAATAAAGCGAACTTAGCTTT
TTTTTCAGACAGTGCTTTTGATTATGAAGGGTAGAATATCAGAAAGCTGA
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TACGGATCGTTTTTCCTTTGAAGCCTGTGTTTGAATTACGTCATTTCAGA
GTTTGCTTTTCTACTTTTTTATTACGAAATCTCGTTTCAAATTCTTCCCC
CTGAAAAACAATTAGAATTTCTTAAGCAATGTGGCACGTTTTTTGATCAT
TTAAACATATTTTATGTGTTCTATAAAGAAAGCTGGACATTTTTTTCATT
TGTTTAACACTTGGATCAATCGAGGATAGCATTTGAATTGCGCGGAAATT
ATCATTCCGTCTAGAGGCAAATTACTTTTGGATCAAAAGTTAATCCAAGT
GAAGATTTTTTTGGAAGATTTCATTATGAAACGCCTTAAGAATAATTACT
TAAATGGCGCCTTGTCTGAGAGAAATAATCGTGTTCTTAGCCTGTCATGT
GACTCCAGCCTTCATACAATAAGCGATCGGAGATCGTCGGTAAGATTACC
TCTTAATTATCATAACTATCCCTTATTTATTAAATTTAATGATTATTCCC
AATTTTTTGATTTCCTCTATTCTTAATCCAGTGTTTCCGTAACTGAAATT
TAAATCATCCTATCGGATGTTTGAATGGATGAGATTTGTACTTTACTTCG
ATATGAGTTTTGTATTTTGTGGTGAAGAAACCATACAGCGAGGTTGTGTT
AAATTTTAGAACAATGGAGGTCTTTGAATATAATCCAGAGAAAATAGCCA
CTGATCTACAAAATGGTTTTCGTTGTGATTCTCAAATGATGGACTTGACG
CAAATCAAGAATTTAATTTCACAAGATGATATATGGACTTGGTGTAGTAC
CAAAGAGCAAATAAAATTGATTGTTTTGCTTGTGTTGGGCAAAAATCGTT
TTCTGGAATTGGTAAGGTTGCCTAGTTTTTTCAATAGTCCTTCATTGGTT
TAGCGAGGGACGATTTTCAAGAAAAATACTAAGTGTGTTTTTCACTTTAA
TTGGTACAACAGTAGTGAGCTCTATTTTGATATTTTTGCAATAAGAAACA
GTTAAAGTTTTCTATCCTTGTATCGGCAATTTTCAACGTTTTTGGATCGT
TCGGATTCAAGGTTGCTGTTCAATGATGGCGGGTTTTTTTCTATTTGTCA
AAAGAGTCCTTCACTGTATGGTAGATCTTTGATGCCTTTTTGATAGTATT
GCTTATTAATTGTTCATTAAAAAAAATGTTTAATCGTCTCTCTGATCATT
TTCAATACTCCGAAGCGATCAAAAAAAATTGCAAAATTACTTTGTTTGGT
ACTTGATGATTAATCACTCTGTCCTTTTCTTCAAATTAAATGAATAATTA
TAAAAATATTTTTGTCTCTAGTGTGCATATCGAAAATTGCAGTGGTTATT
TGTTGTCAAAACTGCTTGGTATGTCGAGTGTGTTGATTTATGCAACGAAT
TTGTAGTGTTTCGAGTTGCTTTATCGATGGGATCAATTTGTTATTTTAAG
TGATAAGATATACCATGTTGTTGATAGGCTACTGTGTGTCAATTTTCATC
TGCCTTGACATGCTTTTAAAGCGTTTTTGACTTTTCGAATATACAATACA
ATAGCTGACTTATTGCGATAACTTTGTTGTCTTCTCGCTCTAATAGATAC
AGGGTAGCAATGACCTCACCAAGACTGCTTTTCTACCAAAGTTGAAGAAT
TCAATTTTGATTTTAGTGTTTAGTTGAAATAAAGTTTAAGTCAGTTATAT
TGCTTCAGTAGAGATAGTTGGGAAAGACACCAAAGTCTTAAGCCACTATA
GTTAAAGACATTATATGAGATTGGTGTCTTGTATTATCAATTTCCTTCAA
TTTGAATCATAAATCTAGATTTTTGTTTCGGAGATCAGACAGGCTTAAGA
CGAGTCAATCATAATAAGAAGTATTAAGTCGACTTTGTTTGAAATGCTTA
CTTTCGAGCTTCCTTCCTCGTTGTTCTGTCTTTTTTGATCTTCTTTTTGG
TTTCTCATTTATATAGCTGGTAAAATATTTTGACAAAACTACTGAATCAT
CGTACTTTTCCGCTTTAGACCTACGCTTATGTTCGACTTTTCCTTCTAGT
TACGAAAACTCTCTATAGAGACCTCTTTTCATCAGGATATGATACCTAAG
TGTGATAAACCTGCAATCGACATTATCTAAGAGATTGAGTCAGACTCGTG
TTTAACTTCCCAATGAGTTAAGCAAACATTTAAATTTGAGAGACATAAAT
TTTTTTGTGTTTTTCGATATCAAATTTTTACTCTAGCGGTTAGTCTATAG
GTTAATTCTTGGTGCTAGGATAGTCGGTTTTCAAGTCTTGTTTTGACGTG
GTTGGTTTCGTGTAGTTCTCTAGTGCTATTGCTGTTAGATAACTGGTTTG
AATTTCTTGAATATAAAACTACGAGTCTTTGACCCTTTTTAAAAGAGACT
TGGGTCAGGTTATTACTTTATTATTTTTGAAGTTAGTTAAGAAATGGAAC
GGACTTGGTTCAGAATTATCCCGCATAGTGCCGAAACATATGTCTGCTTT
TTTACAGGAATTCGTAAGAGCTTTAAAAACAATCTGAACATCACATTTTC
AAAAATGACCTGACCTTTCTTAAATACGAGGCATTCAACCAACCCGTTTT
TGAGCTTTCCCAGCTGGCACACAACGTTGTTTCAACGTTCATCTAACGTT
ATACGGACGTTGTTTTGAACATTAGATACACGTTTTTTTTTTTATAAGAA
CAAACTATATAAGAACATAAGGCTTCGAGGCCCAAAAATTTAAGAACATT
CTAAGAACATTCTAAGGCTTTGGAGACTTAAAAACGTGCATTTTCTTAAG
AAATTACATCAAAATGCTCATAAAAAATGCTGCAAATAAGAACATTTTAA
GAACATTTTTAGGCTTCAAATCCAAAAAACTAAGAACATCCGAAGGCTTC
GAAAATTTTTGACGTTCTTATAAAAAAAAAAACGTGTAAACGTTGAAACA
ACGCTGGGTTGAGTAGAAATAATGATCACATTTGGAATGTATTTCACTTT
GTAAATTTCGAAAATTAAGAACAACCAAAGAATTTACTGGTTCTCGTAAA
GAAGCGTGTACTTTCTTTGAAATATCTTAACCAATAAGTAAAAACATCCT
TTCAGGGTTGATTCTAAAGTGAATTTTTCTTTGTTTTTCAACACACAGTT
CTGATTTCCCTCAGTTGCTTTTGTTTTTGTCCGTGTAGTGAAGATGTAAT
AATAATATTATGTATTACGGATATTCGTAGTTTCCTCATAACATACTATC
GCATAACTGTCCTCTTTTCTCTTTCAATTTTTTTTGGCAACTTTGATGTA
ACGTGTTACACAATACTAAAAGAAGTTGAAAAGGTGATGAAATTATTTGT
AAAGATTTGAATTTGATGAAGAACTTTTACTGAGAAAAGGAAATATTAAT
TTCCATAATTCTTGGAGTAGTCTAAGAGTTTAAGCAGTGGTATCAACTAA
ATGACTAAAATCACTTGATTTTCTGTATTTTTTATTTTGGGGTACTTCAA
CATTCCCATTGCTTTATGGTGGGTAAGATTTGCTTTTAAGAAAGTTTGAG
ACTTGAATTTCTGAAAGACTTGTTAGTCCATCGATTGAAAATGAATTTCT
CTTCATTCGGCTATTCTCTTTGTGTCTTTTCTTCATCTCGACATGAAAAG
TCTATTTCCCTTTAGCGAACTACACGTTTTTTTTTTTATAAGGAACACGT
TTATAAGGAACTCGAGGGTGAAAATGGTTCAAAAAATAAGGAATTGTTAA
GGAACTGCTCAGGCTGAGAATAAGTGGATTTGAAAATAATATACCTTATT
GGGACTAATTTGACCAAATTTTCATCTTTCAAGGAGCAAAAAGTTCAAAA
TTTCCTATGTAGAAAGGAACTCGATAAGGAAGTTTGAGACTGAAATTCTC
TGTAAAAATAAAGAACTCCAGGCTCAGAGCAAAGTTAAGGTTCCTTATAA
AAAAAAAACGTGTAGTGTTCTGCTACACGAGATCATTTTCTCTCACAAAG
TTATATTCTTAGACCTCAACATGTTTTTTCTCGGCACCGTAAGAAGTTCA
AACCTTCTCATGTATGAGAACCATTTTTCTTCTCTTTCTCGTCTGCTACC
TACCCTTAATTCTTCCTTTGAGGTTGTCTTCTGACGTCTACAAAAGAGTT
TGTCTTATAATAGTGGTTACATTGTCTCGAAACTTCAGTCCTTGTGATGG
GTGAAATCGAAAGATTAGCTGAAGATTTCTACACCCTATCTTTCTCTTTT
ATCGAGGAAGTGTTATTTTTGGTAAGACGAAACTGTTCGAATTGTTTTTA
AAGACATTGATAATTGCTGGTCGTTTGGGTTGTTTCGCTGCAATTAAAAC
GTTTGAAACCTTACTTTGAAGGCAGTAGGAAGTCAACGAATCTTGTTTAA
TTTTACTTAAGATTTTTCAGCTGTTTGCTTTTAGTGATCTCTGATTTTGT
TTATCGTGGGTTTTTAATCTTGATTACCCGTGAAATAGCTTTTAATTGAT
TGCTAAGTACGTCTCGTGAAGCATCATTTGAGGTTTTATCTGAAGTCTGG
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TGAATATTGTGTATTCTTGATGTTTTTTTTTTTAAATAACCGAACGCATT
TTTAGTATTGGATTTTAAACCTTCGAATACTTAACATGTTGTTTAAGCAC
TTCCTTATCCTCGTCTTTCAGATCATGTTATTAAAGAAATAGCTTAGTAG
AGAAATCCAGGGAGAGGAGGAGGAGGCCCTGGAAAGCTGAAGGAAAGAGA
GCCCTTGGATTACCCTCGACAAGGATGGCAAATTACCTTTTTTATTTCTT
TTTCATTTCAGATTTCACCGAACTCCTCATTTCGTATTTGCTCGCCAAAC
CAAACGTTCAGCAATAATAACAACAACGACAATAACAATATAGTACGAAA
GTCCAAGAAACCACATTGGAACACAAGCACTCGCTTACATCACATGGACC
CTCATTTATCACAAGAAGTCACTATGGATGTTTTCTCATTAACACGCGAA
ATCCACACGCCCATCGGCCCGCCCATGAACGCCTCTGAACGCGCCACAAC
GCCCAAAGACGATAAACCAATGTTACCTTTGAAGAGAAGTGATATTTTAC
CGAATGTAAAAATTTACAATTTGTGGAGTCAACACTTGTCTAAAGATCAG
GTACTATTTAATGTGATTCCTGGCTAAATATAGAATTTCTACTTCAAAAT
TTGAAAAATTACTACACAACTTCAACTAACTCTTTAATTTAAAGCTGCAT
TTTTGTATTTTTGGTTTATCACGTATTATAATTCGAATTCTAATAGAGTG
TGGCTTTTTCTATCCACTTTTTGATCCATCACTGCATCTCTATTGCTAAA
TCTATGGTATTGGAAGATTAGGTATTGTAAACAAAACAAAATTGCCAATT
AATTAAATTAAATATATCCTCAGTTCATCAATCTAATTATCGCGACAGAG
CCGATATATTTTATTGCTTTTTTCCGTTTTGTGCTCATGTTTGTAAATTT
CTTTCTATTCATTAAATGGAAAAAATTCTCATCTAGATTATCCGATTTTC
TAACCAGGTTCTTTTGATTGATTCCAAGGAACACAAATTTCATTGAAGCG
TGAAAACTTTATGTTGAAATAATCAGCATTTTAGACCAGAAAACCAGGAG
TTAGAACTAATCCGAAAATCACTTGCTAGTATTTTTGAGACAGGGGTGTT
ATACCATCAATATGGTTTTCTAACTAACGGCTCTTATCATCTGATAAATT
TTAAGTCAATCCCCAAGTCGATTTAGATAGTATTCCTGTTTAGCAACAGT
AGTTAAATCAGATCTTAAATCCGAAAAATTCACTTCTTGGTGAAAGATTC
TGCGAAATGTTTTCCCATTAAGGGCTCTTCATAGTGAATTTTAATATTTG
TCATGTACAAAATATAAATTTCTGCCTGATGTAGCTAACAAAACTTTGAC
ATGTTATACATTTTCTGTTAGACCAACTATCATTGAGTCTGAAAATTTAA
GAATCGCAAAGAAAAAATTTAATGAAGTAGAAAATTAAGACTTTTGCGAC
GAAGAGTATTTCAACTTATTTTATTTTAGCTTATTTTTGGCGAGAAGAAA
TATTTTGAAAAAACTTTTGTGGTAGATGGTGTATCTTTTGCCGAACTAAA
AATATATTTTCGGAAAATTTTGAAGATAGATTTATGGTCATATTCTCTCG
ATTTATTATAGATAACAGCAGAAGCGGCTTGGAACAGGTGTCGCTTGATC
ACCGAAGAAGCGTTGGAGAAGTTTGGTGAACGGTTAGACTTCTTGGAGAA
TGTGGCTGCATGGGAAATCACAGCTGAAATCTTATTGGAATTCCAATCGC
TGGAAGAAAAGAAAGGTGAAATAGAGGTCAGTGGTTCTTCTCTTTTCATC
TTTCTATTTTGGCGCATTATCAAATTTCTCTTATACATTTGATGTTGAAT
TCGGCTAAACAGAATACGTCTTTTGTGTTGACTCTCTTATTAGAGAAGAA
AATAGAATTGGACGTATTTAATTGCATTCTTGAAAACTGACAAACAGCTT
TCAGGTTTTCAAATATGTTTGAATTAAGCCGAAGCGGAATGAAAGCCCAG
CAAAAGTCTAATGTTTGTTCGCGATGCGTATACTTCGTACTGATTGTGAC
ATGGTGTTGTTTCTTCTGAAATGAACTTGAATTGACAAAGCGCTGATTCT
TCAAGACGGACTTACAGCATTGCTGACAGCGACTTACCAATGAAAGGCCT
GTCTATGCTGATTGGCCAAAAATACAACTCGCTCTCATTTTATGCTTAAT
TCTTCAGGCTGGTTTGTTTGAAGTTGAAGATTACGATATTGAAATCAAAG
AAGTTGCCAAAGCAACACAGAACGTCGCGCAGTATCTCGCTCCCATTGAA
GAGAGAGAAGAACTCAAAATGAAGATCGTTACTCTAAGACGACGTTATTT
CAAAGTTTTACAAGAATTATGCAAGAAGAAGGAACTTTTCAGATGGTTGT
TACCCTTGTTAGAGCAGTACCGCGACCAAGGATGTGATATTAAGAGTTGG
CTTGATGTCACGGAGTCACGAACTGAATTTCTCACATCAAATTTCAATAA
TAATGAAATTATTGTCAAAAATGAAGATTTGATCGAGGTACTTTCCTATG
ATACAATTTATTACCACAATCTATTTTCAGATACTATGACGATATATAGC
TTGCTTAAATTAGTTCTCTCTCAAAAGTCTCTAAATCCTATCTATTTTCG
GACCAATCGCGTGCGGTTGCGTCGCACGGAAGATGCTACGGATCCGAAGG
TCTGGTCCCCTAATATTTGATCTTTTTTTAAGAAATTTAAAATCTTTTAC
TCTCAGGAAATCAAAGAAGAACTTTTCGTGCAAAAAGATGCTTACGAAGA
CTTCTTAAATGCCAGTGAAGGAATCATGGATTTGTTATCAAGTGATGATG
ACGTCATCATTCAAATTCGGACAGACCATGACCACGTGGTCTCAAGATGG
GACACTTTGTGTAGCAACATTGAGAAGTGTTTGAACAGATTGGTATATGC
AAAGAAGGTGTTATCAGAACAATCGAGAACGATCAATACCGACCCTGAGA
AGATCGAGAAAAAGGTAACATATATCCAAATTCTTTTTCGAGATTGAGTG
AACTTAATAATCAAGACGAGGCTGGACAGTTCTGCTTTCATGACGGTTGA
CTGGTGAAAGTCTTGTAATGTCGATCGGCTTTTTAAAATAAATAAACCAT
AAGTGATGAGTCATACGTGGTAACAGAGAGGTGCTAAACCGTTTTCTCTA
CAAAAACCGTTTTCTCCGAAAAAAGAAATATTTCTCATGGACTTATCTCA
ATTTAATCCTGTCCCTTCTTAACCAATCCAAAAGGACTGTGAACTTTGTT
TTTGACGATTGCATCATTGTTGCCATTCTAGATTCGTAACGAAGCAAAAC
AATGTACTTGTCATAAACCTTTTCAAATCACTCGTGTTGGTGAAGGGAAA
TATACATTTGGAACTTCCAAGATTGTGCGGTTAGTTCGTGTCCATNTCGA
CGAACTCTTACTACGGTAAAAATGTAGGAAAGATGTTTATCACTAACCCC
AACTCTGTTCGTTTTATAACTTCTTGTAGGTTATGAAGTTCTTGATGTGT
ATTTAGAGTTNGTGTTGGTGGTGGATGGGAATATTTGTACGACTTCCTGT
TCAAAGCTGATCCATGTCGTGGTAAGTCCAAACTCTTTCTCAAAAAATAT
TTTTGTTCTGATTTCATAAGAGCATGAACATATAAACGACTGGACATCCA
TCTCCTTTGTCTTTTTGTAGAAAGGGCTGCTAGCTTCATTGCCGCCTCGT
TAAAAGCATAAAATGAAACAATAGATTTTGATGATATACCACTTGGGAGT
ACCTTGCTAACAACGTCAAAACTT

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_502:166103..184076-

>TCONS_00069593 ID=TCONS_00069593|Name=TCONS_00069593|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=1308bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_502:166103..184076- (Clytia hemisphaerica)
ATGGGAACAGGTAGTCGACGTGGAACGTCATTTTCTTCCAGTGATGGGAT
GATGGCAATGCAGCGTAAAAATACAAAGATTTCACCGAACTCCTCATTTC
GTATTTGCTCGCCAAACCAAACGTTCAGCAATAATAACAACAACGACAAT
AACAATATAGTACGAAAGTCCAAGAAACCACATTGGAACACAAGCACTCG
CTTACATCACATGGACCCTCATTTATCACAAGAAGTCACTATGGATGTTT
TCTCATTAACACGCGAAATCCACACGCCCATCGGCCCGCCCATGAACGCC
TCTGAACGCGCCACAACGCCCAAAGACGATAAACCAATGTTACCTTTGAA
GAGAAGTGATATTTTACCGAATGTAAAAATTTACAATTTGTGGAGTCAAC
ACTTGTCTAAAGATCAGATAACAGCAGAAGCGGCTTGGAACAGGTGTCGC
TTGATCACCGAAGAAGCGTTGGAGAAGTTTGGTGAACGGTTAGACTTCTT
GGAGAATGTGGCTGCATGGGAAATCACAGCTGAAATCTTATTGGAATTCC
AATCGCTGGAAGAAAAGAAAGGTGAAATAGAGGCTGGTTTGTTTGAAGTT
GAAGATTACGATATTGAAATCAAAGAAGTTGCCAAAGCAACACAGAACGT
CGCGCAGTATCTCGCTCCCATTGAAGAGAGAGAAGAACTCAAAATGAAGA
TCGTTACTCTAAGACGACGTTATTTCAAAGTTTTACAAGAATTATGCAAG
AAGAAGGAACTTTTCAGATGGTTGTTACCCTTGTTAGAGCAGTACCGCGA
CCAAGGATGTGATATTAAGAGTTGGCTTGATGTCACGGAGTCACGAACTG
AATTTCTCACATCAAATTTCAATAATAATGAAATTATTGTCAAAAATGAA
GATTTGATCGAGGAAATCAAAGAAGAACTTTTCGTGCAAAAAGATGCTTA
CGAAGACTTCTTAAATGCCAGTGAAGGAATCATGGATTTGTTATCAAGTG
ATGATGACGTCATCATTCAAATTCGGACAGACCATGACCACGTGGTCTCA
AGATGGGACACTTTGTGTAGCAACATTGAGAAGTGTTTGAACAGATTGGT
ATATGCAAAGAAGGTGTTATCAGAACAATCGAGAACGATCAATACCGACC
CTGAGAAGATCGAGAAAAAGATTCGTAACGAAGCAAAACAATGTACTTGT
CATAAACCTTTTCAAATCACTCGTGTTGGTGAAGGGAAATATACATTTGG
AACTTCCAAGATTGTGCGGTTAGTTCGTGTCCATNTCGACGAACTCTTAC
TACGGTAA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_043342	XLOC_043342	Clytia hemisphaerica	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00069593-protein	TCONS_00069593-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_502	supercontig	scaffold_502:166103..184076 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
10.4115	10.1786	13.1607	18.6644	168.343	127.28	110.078	110.456	30.5713	40.2641	25.3948	21.774	17.7315	12.552	15.618	19.97	8.96555	10.301	6.30123	7.81637	3.89465	3.30209	14.995	12.3006	17.3498	18.3407	36.216	40.6533	12.7544	16.8525

Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR003108	GAS_dom

Vocabulary: **Molecular Function**
Term	Definition
GO:0008017	microtubule binding

GO Annotation

GO Assignments

This transcript is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
molecular_function	GO:0008017	microtubule binding

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00069593 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00069593 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00069593 (transcript) - C. hemisphaerica