TCONS_00072108 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00072108
Unique Name	TCONS_00072108
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2491

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at scaffold_71:195240..205590+
coding sequence from alignment at scaffold_71:195240..205590+

transcript sequence

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AAAGATTGATGCGAAGCAAAAGTTGGAAATTTACAAGACCTTAAATGGAA
ATGAAAGTCATTCATCTGCCAAACAACAACACTTATTAAACTCATTATGC
TTCTGCTTGGAACAATATAACAAGGAGAAGTTGATATCTGATAATATTGG
AAGcttaaatgaatttttgatacTCCTGCAAGAAAAACTGGAAGATATGC
TACAATCAAACAAGAAATTTCATATCAGTGGTAGCATTTTTGATGTGATA
AACAACCTCCTAAAATGTGGCTCAACAGACTTCAATATCACATTCACTAT
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AACCCCTCACTCTGACAGAGCTTTTGTGTGGAACATGTGAATTGGTTATC
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TCAACTCGTCATCATGTACACCAATCAGAAAAAGTCTCAGTTTAATATCA
AAAAGatttttcagaatttttgtgATAAGTTATTGGTACTTATTCTTTGC
ACGCGATCTGTATTTCAAAGATTGTTACAACACGACGATATTGTTTCAGA
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ATTTGAAATTGATGCTTCAGCCAGTATCAGAAGAAACTCCAGCTAAGAAA
GCTAAATATCAAGTCTATTTCAAACAGTTATTTGATGTACTAAAGACCAG
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TCAAGGCAATTGTTGTTGGCTCAAGGTCATCAAATACTTCTCAGCTTACA
AACTACGAAGAACTACAAgttcttttcaaaatattagaaCTCACCCAGAC
GATCGATGTCTTAAATGAATCAACTGTGCATCAAATTCATGATAGTTTCA
CAATAGTTCAAGAATTGGACGTGTATCAGAGGATAGATGATAAGGAGAAC
AAACACCACATAAAAATGACTGAATTGATGAAACTCTTGGAAAATGGCTT
TAAAGATAGTAACATGAACGTCCAGATGAAAATGTTATCAATATTCAAGA
CAATGTTGCTGATTGATTATGGGATTGTGGAACCGTTTCTTGGCAAGCTG
TGGAGATACTGTCTAACTGAAGTTGAAGGAAGTACGATACAATTTGAACa
aaatgctttattggaagcTCTCTTGGAAAACTTTGCACAGTTAAGAAAGA
TGGAACTTTTGCTAGATGCTTTTCCGCTAGATACCGGACTGTCCTGTAAC
TTTCCCCACGACTTCACTGTAAGTTATTCAGAAGAGATCTCGAAACTACA
AACTTCACAAGTCATTCGATTGTTGAAAATATTCCAATCAAAGATGGAAT
CGATCACTGTTAAATCAGattcaaattttcaccagttTAGTTATCTGCTG
TTTTACCTTTTGGTAACAAACGCTTCAGTGGTGCCAGAAAACCTCTTCAC
GAAACCTGAGCTTGAAGAATTCATCCTTATCGTCACAGAAATCGGTCAAC
GATTTGTTGAGCTCAGTAAAACTCTTAAATCGGAGgaTAGTTTTGGTCAT
ATTTTGCTTTTGATCACAATGGGTGTCAACGAATGTTTCATGATCTTAAA
AGATCTATCATTGCTACCAAATGATGGAGATTGCCAAACTATTGGAAACA
CTCTCACAGAGCTTTGTAAAGAGATCAATGGTGCTGATGCAATGATAAAG
TACCTTAAGGTATGCCAGGGCTTGACAGAGTTGAGATTCAACCAAAGCAT
ATCCAGTAAAGATCAACTTTGTCAAATCAACAAAGAGCTGATGAGCAATA
TCGAGTCTGTATCgttaaaagaagaaaagattTCTACATTAGTTAATAAC
AAGACAATGTGGTCTGCCATTGCTGGCAAGATGTTggatcattttgaatt
ttgcttGATGTTACCTGAAGATAATCGAATAGTTACGGATGATGCAATCA
AATTACTGTTGACCGTGTTCCGTATGGGTGACGAGTCTCCAAAACGAATA
ACAAAAATCATTGAAAGTCATACTGTCTACAATTATCCTCTATTCCAATC
AAAAAGCGTTGAATTCTGGGAAGAAACTTTGACGACAACATCAAGCGAtg
aaattgcattgaaaagagACCTGAAGaaaatctcaaaactaAAGACGGAA
TACCTAACAGAAGAAAATTGGTTCAAATTATTCAATGTTCTTTATGATAA
GCGCCCAAGTATTACAAAACATAGTCAGAATAATGAGCTTTCAATAGTTC
ATACCAAACTGCTGACTCAGATGTTTCAAGATGCAGAGACTGCGTGTCAT
TCCAGTTGTGGAGTAcccttttcaaatgtttttgaaCACTTGCTGGATAC
TGGTTCCTCAATAACAAAGGTATTTTCGGTTGCTTTCCCGG

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00072108-protein

>TCONS_00072108-protein ID=TCONS_00072108-protein|Name=TCONS_00072108-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=830bp
DLRGRRHPQLLTSLSSAKIDAKQKLEIYKTLNGNESHSSAKQQHLLNSLC
FCLEQYNKEKLISDNIGSLNEFLILLQEKLEDMLQSNKKFHISGSIFDVI
NNLLKCGSTDFNITFTILDKLLLTPEWKKILFSKPLTLTELLCGTCELVI
SDKLALQEQSAFMTVIHQLVIMYTNQKKSQFNIKKIFQNFCDKLLVLILC
TRSVFQRLLQHDDIVSEIDQLIAVVIGHRDHVANLKLMLQPVSEETPAKK
AKYQVYFKQLFDVLKTSLISERKDLIIRSTPAIFKAIVVGSRSSNTSQLT
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WRYCLTEVEGSTIQFEQNALLEALLENFAQLRKMELLLDAFPLDTGLSCN
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FYLLVTNASVVPENLFTKPELEEFILIVTEIGQRFVELSKTLKSEDSFGH
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TKIIESHTVYNYPLFQSKSVEFWEETLTTTSSDEIALKRDLKKISKLKTE
YLTEENWFKLFNVLYDKRPSITKHSQNNELSIVHTKLLTQMFQDAETACH
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_71:195240..205590+

Legend: exonCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00072108 ID=TCONS_00072108|Name=TCONS_00072108|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10351bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_71:195240..205590+ (Clytia hemisphaerica)
gatctacgggggagaagACATCCACGTAAATCCATGGACtgataggctat
ttcccagaaaattttgtttggttttcaaTAAATGGGTCCAAAAATAAGAG
TGACCCTTAAAAGTTTTCTGGGCTGCCTTTCTAATATCAATCCATAGGGT
ATTAGGCATGTCTGGTCCAAATTTGGTGCTTTGTTCCAATTTTGCACGTT
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AATTTGAGGTAGCCTCTGTTTTTGCGACTTGATTGTTCTTTTGTCTCTAG
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GAAATTTACAAGACCTTAAATGGAAATGAAAGTCATTCATCTGCCAAACA
ACAACACTTATTAAACTCATTATGCTTCTGCTTGGAACAATATAACAAGG
AGAAGTATgatatcaattttaaaaacctttaaataactgctgtttatgtt
tttgaatttcatttgagaaaatttgtcTAAATCGTTGACCCTTTTAGAAT
GGAATACATGATTGATTTATGATGAATTAAATAGGAACTTTGGAAATATA
TAGTTTTTCTAGGTTCCATTAGTATAATGACAATGACAATGTTTTGTATG
tatctttcaaaaagaaattatcacacagtttgaatttttcatgtTTCATG
TTTCAGGTTGATATCTGATAATATTGGAAGcttaaatgaatttttgatac
TCCTGCAAGAAAAACTGGAAGATATGCTACAATCAAACAAGAAATTTCAT
ATCAGTGGTAGCATTTTTGATGTAATTACacttttttatctgttttatcT
GTACTTTAAAAGACTGAACTGATTTTTCTAGGAGAACAAAATTATAAATT
CACTCTATTCCgatgagctagaatctgagaatttTTGGTTTGTTTGTATT
TCTACTCAAAAATTTGGGGGCAGCATGATTTGGCTGTTTGTTTTGGCTGA
AAGTTTTGACACTTGAATTCAAgagcttttttttctcaaatttcatggAA
TGGGTACATGTTTTAGCATGTTTTTGTGCCAAAACAAGGCTAAGATAAAC
TTAGAGTGCTTATTGGTTTGACCATTTGACTTACAATTGAATTAAAAGAT
CTACGCCTGTTTAGCAGATTGGATTTCCCATTGTcttttatcgattactc
aaatTATTTAACTACTCTTGTCTTTAGGTGATAAACAACCTCCTAAAATG
TGGCTCAACAGACTTCAATATCACATTCACTATCCTTGACAAGCTTCTCC
TAACACCAGAATGGAAGAAAATCCTATTTTCCAAACCCCTCACTCTGGTT
TGTTCAGTTTAACTTTTGTAAATCTTTAGCCAATATTATATGTTgtaagt
ggtcaaaggcgtcagcgtcttaAACCAGGGGTTCGCGGTTCCAATCCTta
ctccttccaatgttctgttcagttcatagaATAGCCAAGCCGGCTAGCCG
TGGAcctgtgaaaacaatcgaaaggctacctaaaagtcctagattactgg
gcaaTCCACGTTAAATATTCACTCTATCTACAGTATCTATCAATCTATAC
TGTGCCATACTGATCTCTAGAAGgctttttcctcaaaaattacagaaata
acatttaaaaaatctgttcaaaaaatcaatgGTCAAATATGATCAAATCC
AGAggtaattttagttttttacttTGATGGATCTCGATTAatcatatttt
tccatttctttaCAAGCCTGATAGCCTTTTTGTGGATATTCATTTTAGAT
AATTGTTGTGATTTGTCTTGTCCTTTTGTTttctctgtgtttctatttGA
ATAGTTCAAGGTTTCATACTTCTAGTTTATTTATATATTACTTTTTATAT
TATTTGTACTTATTTTTTAGACAGAGCTTTTGTGTGGAACATGTGAATTG
GTTATCTCTGATAAATTAGCTTTACAAGAACAGTCTGCATTCATGACTGT
AATACATCAACTCGTCATCATGTACACCAATCAGAAAAAGTCTCAGTTTA
ATATCAAAAAGGTATCATACTATTATTAATAaatatttgaatgttttttg
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GAATCTGCCCAATGtctttttgccaattttttcaCTACTATTACTTTTTA
GTGACTTTAGAGTGaactttttagtgatttacatTCCTTGGCTACATCAA
GGAATATATACATACATTCTGATAAATTTACGCTACTCTACCTATCAGCA
ATTCTTCACCAGAAATTCTTCACGTTTTCTTGTGATCAGGTTTTGTAAGT
ATAGCATGAAATCTGCAATAAAGCCTATTTGCtctttttttatcagattt
ttcagaatttttgtgATAAGTTATTGGTACTTATTCTTTGCACGCGATCT
GTATTTCAAAGATTGTTACAACACGACGATATTGTTTCAGAGATTGATCA
GTTAATAGCTGTTGTGATTGGACATAGGTAAGATTGGGATATCATATGCT
TTGTCCCCTGCAGCATCAAATTGCGATTTTCTTATTAACCCGGCCACTTC
TTTGccactgtttttttttgaagttttttgaatgTTCGATTTTGAACTAG
ATTTCATTATAGCacagttgaataattaaaatatatttcaaagatgtttt
tcataattatactttttcaactcaaagtaaACGTGATGGCAAACTATGTT
GTCACTCATGttggcatatgccgacatctggTAATTAGGTCGCTCCTTCA
TTTTTTccctggcaaataggtcgaaccttaaaaaatagGCATGacagtta
aagggttaacagtataaaaactttttctccACTGCtataaaaactaataa
aacacAAAGGACCACAAACTGTAATGAAAATCCTATCTAGAGCGAAtttt
gaattagagaaagattggaaacttgcaaaaaaagattcaaatattttggg
GATGATTGAAATGTTGAatgatctgaaattttgagaCCATAATATATTTT
ATAATCACAGGGACCACGTAGCAAATTTGAAATTGATGCTTCAGCCAGTA
TCAGAAGAAACTCCAGCTAAGAAAGCTAAATATCAAGTCTATTTCAAACA
GTTATTTGATGTACTAAAGACCAGTCTAATATCAGAGGTATGTACTTGTT
ATCAATCCACATAATCAACCACTAACTTACTTTTATATAATCTTGGCCTA
GCTATATTCACAATCTTTGATCGAAGATTTTCGAAAAGGGTATGCAATGG
TAGCACAACTCGATGTATAGATCAATTTATAATTCCTGTTTATTTATAGT
TTCTGTTGAAACCACttttcaccgctattgagtagtgctaccattagggt
acaacTTTacaaaaactctgatcaaagattttgtttagTCAGGATGGAGA
GACTTTGTtcgggatatataaaggtcagtgatatCAAACTTGTGACAGAT
TGCATAGGACTGATAAAAGGTTTACAATAGGAATTCCTGGACATTCTATT
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CAATATCATAAAATCAGTCAGTTAAACTTGTTCACATGCTCAAAAGCTTG
AGCACAACTATGCACAACatggaaaaagtttcttaaacaTAAATATGGTT
CAGACTTGGTTTGCTTTAGATACTAACTGAAAACATTCTGCACTGAAATG
AAATGTACCAAGAAAACTCTTTATCATACAAATCCTATTGCATAATGACT
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TAAAAGAAAGTCTTATTCTTTTAAGAAGATTTCCTTTTTCAGAGAAAAGA
TTTGATCATTAGAAGTACTCCTGCAATTTTCAAGGCAATTGTTGTTGGCT
CAAGGTATGATTTTAACTACTTTCTTCATATTGAATAGTTTAGGCCATAG
GGAGTAACTGTATTATCATTTTCAAGGTTAGATCTATGTGACTGTCGTAT
CATAGTTTGCTCCtcataaaattttcttgctttatTATTTAAgagaaatt
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GAACTACAAgttcttttcaaaatattagaaCTCACCCAGACGATCGATGT
CTTAAATGAATCAACTGTGCATCAAATTCATGATAGTTTCACAATAGTTC
AAGAATTGGACGTGTATCAGGTAAATAATGAACCTTTAATTGTAGATGAA
ATTCCAGAGCCCcatacaaaaacgtcaaaaaaatggacaaaattcttcga
aattcagtctctctaagggtcggttttaaaactttggctcggacatcTAG
TACCCCCGGGCTTTGTCAGGGGATTTTAAAAGGCAAAGTATACGGTCATC
CTATAGCGCTTTACCGAACGAAATTTAAACCTGTATTGAATAATCTTGGT
TTCACCACCTTTAGAGGATAGATGATAAGGAGAACAAACACCACATAAAA
ATGACTGAATTGATGAAACTCTTGGAAAATGGCTTTAAAGATAGGTAAAA
CACAATaataattattataaataaaGCACAAATTTCAATTTAAGCAGGGG
GTGGGGTGGATCATCCCTAAAATTGTTATGAAAAACTGGACAGTCAGAAA
CAATCAAGAACTCTAGCTGAAAAGTATGATATATTAAAATACCACCTCTC
TCGAAATACATAAAAACCCTTTAGCACTAACATGTTGACTTGACACTTTT
TATTAATATTTATAAGCTCTGTTAACTATTTGCaattaaatttaaataat
aATGATATGTGGTAGTattatattttgtgtttttctatCTTTAGTAACAT
GAACGTCCAGATGAAAATGTTATCAATATTCAAGACAATGTTGCTGATTG
ATTATGGGATTGTGGAACCGTTTCTTGGCAAGCTGTGGAGATACTGTCTA
ACTGAAGTATATTATTAAATTGATTGTTTGATCACTGTTTATATCTATCT
ATGTCTATATCTATATATTTCGTACTAAAAGGTCCTAGGACCCATTTATT
TACAGTTTAGTCTCCTGGTTTCGGGGAAGagttgatttgatgtttcaaAG
GGCGATGTTTTAGGATTTGTTATGTAATTATGCTGTGAGCTAAAATAGGT
agattttaagcctaatttgataAGTTCATTTGCTTTAAGTGTTCACTCGT
TCACTCTTGCCTACCGTGTGGAAACTATTCTCAAAGGAATCGTTATAATT
ACGCTGACATGGTTTCTACACGTTAATATTCTATTTTTTGTCAAACTATA
GGTTGAAGGAAGTACGATACAATTTGAACaaaatgctttattggaagcTC
TCTTGGAAAACTTTGCACAGTTAAGAAAGGTCTGTCTTGAGATAATTCCT
ACCTCCCCCCTAATAAAAATATCCACGTGTTTTGATATAtttcttttaga
aaatttgagagGTATTTATATTTCAACCCCCGTATTGAAAATCTCGTTTT
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gagAGATTTATATTTAACTCGCTTTCTTTTTAGATGGAACTTTTGCTAGA
TGCTTTTCCGCTAGATACCGGACTGTCCTGTAACTTTCCCCACGACTTCA
CTGTAAGGTATAGAGAAAtaaaatgggctgttccataaaaAATCTATTCA
GGGGGTggttggacgaaccttttcatttcaaaaaagattCTTGGAAATAT
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attcttttcatgccTTAAGAAAGGGTAggcgaactaaaatcagtcttatA
CCGcctggaaattttaaaacaatatcttccctcttggaaaaatgaaaaaa
aacttctttagACCCGTTGGAAATTCCTCTCAGGATACCTGCTGAAAATG
TTCCTCTACCCCCTgtttggatataaaatggaattgCCCAATATTTTGCT
gtttaaaatcatcaaatgatcttataattattttgatgtttgttGGTTTC
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TCTCGAAACTACAAACTTCACAAGTCATTCGATTGTTGAAAATATTCCAA
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TACCTAACCTACCTGCTAACTTTTTTCAGACGCCATTCTAACTTTGGATC
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GTTAGGGGAGCATCTGACTACATACAGGTCATAAGGTTCCATGAATAAGA
AGCTTTGTATAGTGTCCTGGTAGGTTGcccccttgaaaattgaaaaaaat
cctcTGCCTCCTTTAAGTCCTCCCCCCTAAGATTTCAACCCCcccctgaa
atttttttttgtgttcataCTTTTTGCTACTTGTATTCACGTTATCTTCG
TAAATACAATGacgatgaaaaaatgaagaagaaacttCCACAGAACGAAA
CTTTCCCAATCCTTTTCcaattttctggaaaaaacTCACTACAGATTTAA
TGACGATCATGTAACCTAATATTGGTGTTAAAACTTATGATTATTTCTTg
gagttttttgatttttttaggattgttttgaTAATGACGCTCATGTAATC
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ACCTTAAGGTATGACCTATTTTATGACTTGTTTGCCGCAACCAGGGGTGA
ATCTGAGATTAGAAATGGATACCGGAGACTGAACGCCTACAAACATCAAA
ATGATTCTTGAGTGAAGGTAGACAGtcggactgtgttcgaatcccaagca
cttcCAGGCAGGGTGCTAGGGAAAtttggtgatagactctctaccttcac
tcatatATCATTCTCTCTCAGTCCGTTAGTAGAACTCAAATTTCAGATGT
GGAACGATAAACTCGCTATACACTCTAaattatgagtttttttatattga
ttggTTTTGTTTCATTATCCCAATGAAGACCATAGGTTGTTGTTAGTTGT
TTAGTGTTACTTAAGTTTTTTCTAAATCCCTATCTCTCTTCAATTCAAAG
GTATGCCAGGGCTTGACAGAGTTGAGATTCAACCAAAGCATATCCAGTAA
AGATCAACTTTGTCAAATCAACAAAGAGCTGATGAGCAATATCGAGTCTG
TATCgttaaaagaagaaaagattTCTACATTAGTTAATAACAAGACAATG
TGGTCTGCCATTGCTGGCAAGATGTTggatcattttgaattttgcttGAT
GTTACCTGAAGATAATCGAATAGTTACGGATGATGCAATCAAATTACTGT
TGACCGTGTTCCGTATGGGTGACGAgtaagaaatttaatttttgcgcAAA
GGTGGAGAAGCAGGAGGGAGGACTAACCTAgatttatcaaattatcaagg
GTCAACCAACACTCTAGCAGGACTCTATAATTAGtggaaaatttttagaa
tttggaCCGGATTTTGGTTAGTCTTCTTGAAAAGCTAATATCGGGGAAAG
AATACATTTCTATTATGTTGATTTTTTACAGGTCTCCAAAACGAATAACA
AAAATCATTGAAAGTCATACTGTCTACAATTATCCTCTATTCCAATCAAA
AAGCGTTGAATTCTGGGAAGAAACTTTGACGACAACATCAAGCGAtgaaa
ttgcattgaaaagagACCTGAAGGTATTGTTACTACATTTGTAACTAAGT
ATCTTCGGAATTGTGTGGCCTTCTTGCTGCTTTCTTTGGTGAGAAAAACG
CTTTACACCACGCCAAATTTACTCTAAACGGCAGAAACTTTTAGAAATCT
AAGCAAAATGCCGGATAAATTCGGCCTCAAATCTGTAAAGAGTTCGTAGa
ttaataaaaagaaatttttgtcattgaAAAGACGTGAGGTTTTCTTAAAG
AATTTCCGCCGATAAGGTTAGACTCTGTAAGAAACCCTGAGTGAGTgcta
aactaaaaaaaacttatATAGATCTTATCAACTCTTTGATTCCATAAtaa
caaatttctttaaattcatattttttagaaaatctcaaaactaAAGACGG
AATACCTAACAGAAGAAAATTGGTTCAAATTATTCAATGTTCTTTATGAT
AAGCGCCCAAGTATTACAAAACATAGTCAGGTATTTTTCGTCACATCTAA
CCCGCTTCGAAATACTGTATACAACCTAACCTCTTTCGAGACAAACCTCC
CATAGTTATCTTTTGAGTTCCGATGTTTACGCTTCTTTTAATAAGAATCC
GTAAAaatttaattgtttttctttttaaactttcaggGTCAAATGACCTA
AGCATTATCTTAATAGATATATACATCTAGTTTACCTGACTTATAGACAC
AATAAATTCTTTGAGTTAGTATTTTATTAAAATCTGTGGCTCAGATTGAT
CTGTAAAGTTTGGCCCaattccagtctcttgttcttataaaataaaaaat
acagttTACTCTCGccaattcgaactcgaacgggggaTCTTATtttgttc
gaataacagagagattcgaattatagaagttcgaatatGCGAAAGTTTAT
TGTAGACAGACGTATTTTTCGTTCAACAGAAGGGGTTTAGAGAAATTATT
TCTAATAgtttctttctatttttcgcCAGAATAATGAGCTTTCAATAGTT
CATACCAAACTGCTGACTCAGATGTTTCAAGATGCAGAGACTGCGTGTCA
TTCCAGTTGTGGAGTAcccttttcaaatgtttttgaaCACTTGCTGGATA
CTGGTTCCTCAATAACAAAGGTAAGTTTCAAGTTCAAACGAGTCTGAGCA
TATGTTAAGGATGAATTCATACGAACACTAATTTTCACGAGAATCTAAAA
TTGTCGCTTTGACTACATGGGATTCTtcaagcgatttaaagtactTGAAA
GTTTGACCGATCTTGGCTCAATATTAAGAGCGGTTAAGtagtcaaaaaat
tttgttttagatcgGCCTTCGGATCATCTAGAAAATCTGTTTTTGAACTT
TCCTGGCCGCGTTCATAAACGTTCATGTTAGACCGGTCCTGGCTATTTGT
TAGTAACGATTACATCAAACATCTGTTATAAAGAGATGTTGGCCGGTTGA
TCGAGGCCGGTTTGGGACCGGAGGCTTTAGAATGGCCGATATATTAAATG
GACTCTTTCTTGACTCGGTCATTTACCGGCCCTTAAAAGATCTGTCCGAT
TTTAaggtacttaaaatcgcttggggagttaGAAATTAAGGCGTCTTTTT
CCCTATGATTTCTTTCATTGGCTTTGTTTAATACACCAATCGACCATTGC
GCCAAATCGTACATGATGATTGTTATGTTAAGAGTTTTACCAGGCCGTCT
AAGATGATACATATAATCATTTAATGCGTATTTGGCCCTGTTGAACTTGA
CCCCTCTAGGGTTGATTGATTTATTTCCATTAAAAGCAGGGTCATAATGT
AAGAATGTTGTATTAAAAGGTGTTACTTGGTCTCTGATTCGCTAAACTAG
CTAAAAGTATATACATAtgaaatacacatttttaaaagaaactcCAATTG
TTGAAGATCAGGGCTGTTGCTAAGGATTTTCTggatttcagccaaaaagt
tGCTTAtggattttgagaaaaattgttTGACTTTTTATCTCATTTAATAT
CCAGAATACCTCAAATGCCTCTTTTCCAGGTATTTTCGGTTGCTTTCCCG
G

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_71:195240..205590+

>TCONS_00072108 ID=TCONS_00072108|Name=TCONS_00072108|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=2490bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_71:195240..205590+ (Clytia hemisphaerica)
gatctacgggggagaagACATCCACAACTTTTGACATCACTTTCAAGTGC
AAAGATTGATGCGAAGCAAAAGTTGGAAATTTACAAGACCTTAAATGGAA
ATGAAAGTCATTCATCTGCCAAACAACAACACTTATTAAACTCATTATGC
TTCTGCTTGGAACAATATAACAAGGAGAAGTTGATATCTGATAATATTGG
AAGcttaaatgaatttttgatacTCCTGCAAGAAAAACTGGAAGATATGC
TACAATCAAACAAGAAATTTCATATCAGTGGTAGCATTTTTGATGTGATA
AACAACCTCCTAAAATGTGGCTCAACAGACTTCAATATCACATTCACTAT
CCTTGACAAGCTTCTCCTAACACCAGAATGGAAGAAAATCCTATTTTCCA
AACCCCTCACTCTGACAGAGCTTTTGTGTGGAACATGTGAATTGGTTATC
TCTGATAAATTAGCTTTACAAGAACAGTCTGCATTCATGACTGTAATACA
TCAACTCGTCATCATGTACACCAATCAGAAAAAGTCTCAGTTTAATATCA
AAAAGatttttcagaatttttgtgATAAGTTATTGGTACTTATTCTTTGC
ACGCGATCTGTATTTCAAAGATTGTTACAACACGACGATATTGTTTCAGA
GATTGATCAGTTAATAGCTGTTGTGATTGGACATAGGGACCACGTAGCAA
ATTTGAAATTGATGCTTCAGCCAGTATCAGAAGAAACTCCAGCTAAGAAA
GCTAAATATCAAGTCTATTTCAAACAGTTATTTGATGTACTAAAGACCAG
TCTAATATCAGAGAGAAAAGATTTGATCATTAGAAGTACTCCTGCAATTT
TCAAGGCAATTGTTGTTGGCTCAAGGTCATCAAATACTTCTCAGCTTACA
AACTACGAAGAACTACAAgttcttttcaaaatattagaaCTCACCCAGAC
GATCGATGTCTTAAATGAATCAACTGTGCATCAAATTCATGATAGTTTCA
CAATAGTTCAAGAATTGGACGTGTATCAGAGGATAGATGATAAGGAGAAC
AAACACCACATAAAAATGACTGAATTGATGAAACTCTTGGAAAATGGCTT
TAAAGATAGTAACATGAACGTCCAGATGAAAATGTTATCAATATTCAAGA
CAATGTTGCTGATTGATTATGGGATTGTGGAACCGTTTCTTGGCAAGCTG
TGGAGATACTGTCTAACTGAAGTTGAAGGAAGTACGATACAATTTGAACa
aaatgctttattggaagcTCTCTTGGAAAACTTTGCACAGTTAAGAAAGA
TGGAACTTTTGCTAGATGCTTTTCCGCTAGATACCGGACTGTCCTGTAAC
TTTCCCCACGACTTCACTGTAAGTTATTCAGAAGAGATCTCGAAACTACA
AACTTCACAAGTCATTCGATTGTTGAAAATATTCCAATCAAAGATGGAAT
CGATCACTGTTAAATCAGattcaaattttcaccagttTAGTTATCTGCTG
TTTTACCTTTTGGTAACAAACGCTTCAGTGGTGCCAGAAAACCTCTTCAC
GAAACCTGAGCTTGAAGAATTCATCCTTATCGTCACAGAAATCGGTCAAC
GATTTGTTGAGCTCAGTAAAACTCTTAAATCGGAGgaTAGTTTTGGTCAT
ATTTTGCTTTTGATCACAATGGGTGTCAACGAATGTTTCATGATCTTAAA
AGATCTATCATTGCTACCAAATGATGGAGATTGCCAAACTATTGGAAACA
CTCTCACAGAGCTTTGTAAAGAGATCAATGGTGCTGATGCAATGATAAAG
TACCTTAAGGTATGCCAGGGCTTGACAGAGTTGAGATTCAACCAAAGCAT
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TCGAGTCTGTATCgttaaaagaagaaaagattTCTACATTAGTTAATAAC
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aaattgcattgaaaagagACCTGAAGaaaatctcaaaactaAAGACGGAA
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GCGCCCAAGTATTACAAAACATAGTCAGAATAATGAGCTTTCAATAGTTC
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TCCAGTTGTGGAGTAcccttttcaaatgtttttgaaCACTTGCTGGATAC
TGGTTCCTCAATAACAAAGGTATTTTCGGTTGCTTTCCCG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_044784	XLOC_044784	Clytia hemisphaerica	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00072108-protein	TCONS_00072108-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_71	supercontig	scaffold_71:195240..205590 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.65774	0.545942	3.15371e-05	0.00180537	0.0146774	3.46687	2.97917	3.43235	4.62034	3.19084	0.00607141	4.67663	0.640393	5.08133	3.4268	4.20317	3.8301	4.17543	1.5535	0.0295668	0	0.572337	3.67445	2.21298	2.69381	0.686707	0.835863	0.367832	1.03097e-05	9.64912e-08

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00072108 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00072108 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00072108 (transcript) - C. hemisphaerica