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gene from alignment at Sc0000160:442035..451577- Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >gene:BL90310 ID=gene:BL90310|Name=gene:BL90310|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=gene|length=9543bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000160:442035..451577- (Branchiostoma lanceolatum) TCGGGGCACGGTAGGTTCGCAAACGTGAGTCTGTCCCAGTCTGTTTGCCG
GACAAATGTGACAGTTCGGACTTCTGTGGCGAGTGACGAGCCGAGCGGAG
AACAATGTCTCTGTTAACGTACGACGTGAGTTAAACACTTGAACTTTCTA
AAGCAAGAAGGGTACATTGATGTGTGCAACGAGTAGAACTAGCTGAAATT
ATAATCAGTCAAGTTGCTGCCCTCAGCCGAATGATTGTGTCTACTTCATT
TTACAAGAGGGACTATCTTGACAGCACAAATTGCACACGTATAGTGCAAT
GGTGCATTTAACGGCTTGGTGTACGTGAGAAAAATTACTCCAAACTTTAC
AGTTGGCTTCTTGTTCTGTTTTCCGTTCCGATGACCTGACTAAGGATTGT
AACAAACCATGGCCGCCAGGCATGGTTGATAGATAGTTAAGAGATACAAG
TTGTTGTTGTACTGAATTTCTTACTTTGTGATTCTTCCCTCGTATCAATA
CGCAGTGCGGCGTCAAAAATAGCCCCAATTGGCTCCCCTAGCGTAATAGA
ATATGAATAGGGCCGCAAAACAGAGTAGTTGGAACTTGTGTGTACAGAAA
GGGGTGACGATTTGAGGTGACATGTCAGGTGAAAACCTTCCAGCTGAGAT
ATCATGAACAAACAACATTAGACTGGGGGCCTTGACCCTCTGTAGTATGG
TCTTTTCTTCTGATACTGTCTAGCATTCACAAAAAGGTCCCAAAACAAAC
GAAAATGCTCACAAAATTAGACCTGCAAAGGCAAGGTGGTGCGTGAAAAT
GTAAGTTTGAAATCCCATACCTGAGTAATTTTAGTATTTAATAAATGCAT
TATCATTAAGTTAATTTAGTCTTGAATGCACTGAAAATGGCAGGATTTTG
TCATATAAAAGGCGCATTCATTGTGCACGTGTGTTCTGGAGAAATAATTA
TAGTTCTTTCTTTCTTGAGAGAGAATAGTGCACTTAGGATATCTATGGAA
GTTGGGCTTACCAGAATTATTGTATAGAAGAGTGATGTCGATAGAAAGAA
AATAGGTCTGTATATGATTGTACGAAAGATGATTTGCATTCAAAATATTT
TTATGTAAGTTGCACTTGTAAAAAGTATGGTGCCTCATTGATTGAGACAT
CTTGGCAAAGATATCGAGGCGATGTTACCGGAATTGCTTTGGCGCACGAA
ACGCTGTCAGTATACGTTATCCATACAATCCGTCATATTCTAGTGGCTTT
AACGTTATGTATGATTCAGTTCTGGTCCGGAAACCACGCTGAGGTAACTA
CTAGTGTTTGACAGATCTAATCAGTCTTTTGCAAGACATGCAACTCGCTA
GCAATGGACTAAATACAGGACATAAGAATGCGGAATTTAGGTATCTACGC
TGTCTAGGGGGGAGGGGGGCAAAGTTGTCCTAACCTGTTTATATATAATA
AAGATGACCTCTCCATGACTATTACATCCAGTCAAATTGTCAACCTAAAT
CTTTCGAGCTTAGGAGCGGATCTGAGCGGTGTAATACTTATGACCTACAT
GTAGTAAAGCCCCACGCCAAATCTGTACTAAATAGACTTAGTGCTAGTTG
GAAGTGGTAGGATTTGGCCCGCCCCTACAAAGGGCATACCCTTATATAAG
TGTATCGGGTTCTGACGTGCTTCAGATACGAAATGGCGGCTTACATCACT
CTCTAAACTACTCCTGTTATACTTATTACTACCTGTACATCAGGATTCAA
ACCACAACCTTGTGATCCAGACAGACCGATAAAAACAACACCACAACTCA
CAAGATAAATCATAGAGAAACGTTAAATGGCGCGAATCATTGTTGTTTGT
CGAGACACAAGGGGCCTGGGGCGAACGCATGTGTTGAGACGGATAATTAA
TCTGTTTCTGCGCTACATGAGACCTTTTAGTTCAGAGAAGTCAGACGGAG
AGCTAACGAGTCGACACCAGCCCTCCCAGGGGCTACATCTCCGCACGCAT
GAAAGAACAATTTGTATCAGGTTTTGAAGAAGCAGCTGCAAATGATGCAA
GTTGTGATGGCATATACGCTGTACTCGGGCAATCAAAAAAGCTTCAACTT
CGCTTGTTACGCCACTTTCTGGAGTCTACGAAATGGTTCAAGGCTACTTT
CAATTTCTCAGTCAATTACAACTGAAAGTGTCGAGAGAGAGCGTCCCTAA
AGAGGGAACGTCGTCATATTTCTTGTCTATTAGCGCCGCCGTGACCAAGC
TTCTGCCTCCTTAATGGTAAGAGGTCGTCGCAGCGCTGCGATTTCCGTCA
CAAGTGGAGTCATCAAAGAGCTATTGGGTATTGATGTCTTCTCTTCTCCC
GCAGTACACGCATTGGTGAACTTCACGTGTACTGAGTGATTGACAGTTCA
AAATAAAGTTTTCACCATTATGGTCCGTCAGAAGTTGTGCGAACTGGTCC
CTGTGCATGTAGTTACGGAGAGGTAATACGCACAGGAGAACTCGAAGAAC
AATCAGTGAGGATTGTGTCAAATTTGTGGCTCTTTTGAGACTTCGAAAGT
AACGCTGGGCTCCGTTACCAGTTGTGTTTGTAGCCGCAGGTATCTTGTTA
GCTTAGAATGAATATTAATGGATCTGTGCAACTTCGACTCTTAAACCTCT
GTTAAAAATAGCGCTAGCCGACCGTGGTCTCTCAATTTTTATCATACCAT
GGTTGGGAGATGGTCTTAATGAAGGTCATTTGTGGTTGGGAGTTGATCGG
CGAGGCTGCCTTCTCCCTTAAAAACCGTGTGAGCCAGCCGACTATAAAGT
TTGAAATATAAAAATCGGGAGTGTCAAATTTTGGTTGGATGCAACCAGTG
GAGCTAACTATAGCTAGAATAGCTAGAGTAAATTCCAGGCTACTCCCAAC
CCAGCGACAACCTTGGTTGGGTCGGGAGTGGTCGGGAGCAAATTCGAAGG
TTCTGAATGTTTGACAGGGGCTTTATACAGTTCTAATAACTATGATATGT
GATCTTCTTATACCCACAACAGACACCGGTTAGCAAGCTCGGCAGACGTG
AAGTGACCGTTTCTCTGGACACCATCAGAGCCCTGCAGGAGATGGCGCGA
CGGCTGAACGAAAGCGTCACCACAACAAAAACTGCTGCACTACAGGTTAT
TTCTGTTTCCCAGTCACTCTAAGTTTGTGTACAAAGCTGATCATATGTTT
TATACGTAATAACCTTAACAGTAGTCTGGCTATATCAAGCTTTTTATATC
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AGGCTAGCATTAGCATTAGCGTTAGCGTTAGCGTTAGCGTTAGCATTAGC
GTTCGAATTAGCATTAGCGTTTAGCATTAGCGTTAGCATCAGCATTAGCG
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GAGCATAGCCCCATCACTATCAACTATCATATACGCGCATGACTTATTGC
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TTTAGCTAGATCACCATTCAATATTCAAAGCTAAAAACAACGGTAAACTT
TATACTAGTTTGATAACCATTCACACGGGCCAGCTATGGGGTGTTATACC
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GTGCAATTAAAAAGGCTTGGCAGAAAAAAAGCCGTTTTCATTATGAAATC
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CGAATAAAAGATTGTTCATTTTGTACTTTTACATCTTCTTTGTTATCTTC
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ATCCTGTTTTGATATCTCGTGTTCTGGACATGCTATGGAACTTATTTTTG
AGTGGTAGATAGATCTTTGGACAGAGAGTAAGTGGTGTGGGTTTGGGCCC
CCTAGCGGCTTTTTTGGAACTGCAGGAGCAGGTTTTGCGTTTGACTTTGA
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TAGATAGCTTGAGTGATAAAGTACATGATTAGATACTTCTTATGCAAATC
AGTATCTAAGTTGCATAATTAATGAGGAAAGTTTATACAGCCGCCAAATT
CCTTGATAGGACTCTGAAACATGTGACATATGTAACTGAGGAAGACAGAA
ATATTAATTGATATGAACTATGCAAATGAAGACCTCATTTGCATAATTAA
TGAGAAAATACTATAACAAGATGGCCTTNGATTTTTTGGTATGTGGATAG
CTTGTGTGATGCTTAGTATGATGTGACAATAATTATGCAAATTAGATTCT
ACGTTGCATAATTAATGAGGCGACTTTAAAAATCCGCTTTGTTCCATGAT
ATGACTATTCAAATTGTAACTGAGGAAGAGAGGACTGTTAATAGATAGAA
AATATGCAAATGTTGGCCTAATTTGCATACTCAATGAGTAACTTCCATTA
TTCCACACTGGCAAATGACGGCAATTTCATACATTTAATACTTTTTTTGT
GGAATGAGGGAGTTATGTGAATGTGAACATCGTTGAATCAAATTATGCTA
ATAAGGGCCTCATTTGCATAATTGATGATAAATATTAGCATGACATTCTT
TGTTAAGCTTATACTTTGTTAAGCTCATACTTTGGACATGTTAAATCTTA
AGACAATCAGCTGGTATGATTTATAATTGATGAGAATCACAGAAATACGT
CAGTCATAAAGGTTAAAATCATTTGGCGAAGGTACGTGGTCTTGGAACTC
TAGTTTACTTTGAAATTGGCATTCTACGGCCTAACTATCCGTTTTCCGAA
ATATTTTTTTCGCGATTTTCTCATGTTTTACCTGCTTTCTATAATGTACA
GTATGTCCGAAACCCTTTTTTTGGAAACCGACGAAAATTAATGCGCCCGT
GAATGTCATCCATGTAATCAAATCAACATAACCTTTACATATAATCTTTT
CGCTTTAGCGATTCACTTGAAAGCTTAAAGATAAAATAAATGTTATTAGC
CGGTGACAGCGTACACATGTTCACGTAGTGTAGGTTTGGTGTTGCAACAC
GCTGCCATGGCCATCGTCAAAGCCGCGCGTCCTAATATCTTTTAGGTGAA
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GGTAATCCCCAAGCAGATCTCTGAGGGGCCAAAATCGTATCCTGTCATGA
ATTACAAGTGTTATTAGTTAGTTCCATTATGTAAGATATAGGAATTATAG
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CTAATAGCCAACGACGTATAGCCTTTTCAAGCGCCGCTACCCGTACGCGT
TACAGAGACAGAGACAGGGGTCGTGTGAGGACAGGTCTGGAGATGTCCTT
GCCGCTATAGGCAGTATAGTGTTATAATTGCAACTGGAAGACCAATTTGT
ACACAATCACAACGTACAGCTGGCAGTGCCGAGGGGGGCGATTAAAGCAG
AACGCGTAGATGTGGGGATCTCCAAGCAATTGATGAAGTACATGTTCTGC
TGGATGATCGAGAAGTAATCTCCAAGCAGATCTCTACGGTGACAAATCTC
TACGGCCCCCGTTATGCTTTGGTCCCATTTCCAATCCGGGGCCCGGCCGG
ATTGTTTGTGGGAACGAAAAATAAAAGACCACAAAAGACACAAAACGTAA
AATGTACGAGTACTCCTAACCATATATTGTGCAATGATACGCATTCTTTA
TTTTCCGTTTTCACAAACAGCTTGAAAAGGCTATACGTCGTTGGTTATTA
GGTAGATGCATCATACAAAGACATAGTACAGCAAAATTTGCCTGAAATTG
AGGTATTGTTTTAGGCGTAATGAATTAATTTGCATAGACATGTGAAAAGT
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GGCAGTTGGGCCATTAATAGATGACAACCTGCAAATAAGGTTACTATTTG
TATGATTAGTGTGAAAGTGCCATAATTCATCTGAGAGTTGAATGATGAGA
ATTCCATACTTGTTTATAGCAGCTGCTACAGCTACTAATTATACAAATAT
TGGCCTAATTTGCACTATTTAGGCAAAAGTGTCATCTAATTCATCTAAGT
GGTAAATGAAAGTACATGTAATTTCATACTTGTAGCACCTGTTAGTTAGT
TAAAGGTGTACATAACTATACATATATCATGTAAATGTGGAATTCATTTG
CATGATAAAACATGCCATGGAGGTATAAGGTTTTTGAACTCTTATTTCAT
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TGAATTTACCCTGCGATTTTCATTTTTATTGTATAGATTTGCGAGCAAGC
GGACGCCATGCAGCGGACTACACATGAACTGCAGTTAAAACTGAATAATA
TCTACACCAGAGAGGTCCATGCGGAGGCGATGGAAAATCAAGATAAATCG
GAGAGTTTACTGGGTAATGATTATGATATCTTATGTTTCTGCGGTTTGGC
AGGTTGCAAATATATATCGTTATCAAATATGTAGTTCGATGTTCAAATTG
GAGAACCGTAGGGTTCTGGCACAGCTGTGTATATTAATCTAATGACATAT
GATCATTATCTTCGCCAAGAAGGACGCTTTCTATTTGTTTGTAATTATCA
TGCTGTCTGTGGCTGAACAGCATAACACAAGAAATTGTCCTTTGTTTGAC
ATAAAAATTGATATGCGGCTACGTCCTGACATAGCAAAGGTTTGGGGCAG
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AGTTGCAGGCGTTGAAATAGGATATATCAGGAAGTGAAGGAATGCTAATG
TTTGTGACTTGAAATGCCTTATCATTCCAGGCGAACTGTCGCTGATCACC
AGCAGGCGCCTGTCCAAATCCCCGAAGAAGAAAGGCCGGCGGTCCGCCTC
CCAGACCCGTCAGAGCCGAGACATGTTCTCATCTCCAAAAGGCTCGGACT
TTTGATCTAATCAAGATGGTCTCAAGCCTGGAGTGTCTTTTCTTCCATCT
AACGCCCCTATCTCACTGGAACCGCGGTACGTTGGCGGCCTCTCTGCGTC
CTAAAGTGAATTTGTGTTACCCTTCACTTTATAATGGGATTATCATGCAA
AACATATAAGTATCACTAAAAAGATAACAAACACACAAAGCGTAAAAAGA
TTTTTTTTTCTATCGATGAAATTCGTGGAGCGCGCTGTCAAATCGCCCGG
TCGCAGCGAAGTCGCCAACGTGCCGCGGGTCCATCCAGTGAGACTGGGGC
TTTAAGGCTTTGCATATCGCCCCAGTTCCCGTCCCCCTCCTACGTACTTG
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TTCTTCATGCAATCAAAGACGCCTGCTACACCCACTTATTCAGTAAACCC
TTAAGCACAGTTACAAGACAGCGTCTATCAAAATGTAAAGCTTTGGACTT
ACCCTCTATGAAAACTCGTAAAAATAACAATTTTGTAGCTTATTATGGGG
AGTATTTACCGCCTTTAAAACTGTCTGTTCGGAGGATCTTTGGCATAAGT
ACAAGACTGACTTTTATCATAGGTATGGAACAGCTTCAGTGATTGTACAT
TTTCAGAGAGCAACGGTTTGGTGTGCTTTGATTATGATTGGAGAAACTAA
TAAAACATGGACGCTATGTCTTGTTAAGACCGGAAGATTTAGTTTATTGC
GCGTGGCGCACTTTGGTATTAGCAATAAGGTAAAAGATATTGCAGAAACC
CAAAAGTTTTGTTTTCGTTCATTTAAGAATTTTAGTACTGGAGAAAGTAA
ACAAGTGTTGTAGTTCCACGTTTATGATGTCGCTTATAAATTCTGACACT
GAGGCCCCTGTCACACATAGCCGACCATGACCTCCCGACCTTCTCCAGAC
CTTGTTTGGGAGTACGTTAAATCAACCATGACTAAGGTCATCTGTGGTTG
GGAGTTGGTTGGCAAAGTTGCCTTCTAGTCTTTAAATGTCATCTATGACA
GCTGACTATGAATTTAAAAAAAAACGAATAAGTAGATAAAAGGAAAAGAC
GATGTTCTTCTTAGATGGCATCAGAGGAGCAAACTGAAGCTAGTCTAAGA
ATAGGATGGATTCCTGGATACTCCCAACCACCGACCTTGGTTGTATAGTG
GTCGGGAGGAAAGTCGTAAAAAGGTCTTGGATGTGTGACGGGAGCTTCAG
TAGCAAAGTCTTAACCAGTGTCTTCAATTACAAATAATTACTGGTGCATA
TATGGTTTAAGCTATCAGAAGGAACAAAATGCATTTTGAAATATTAATAT
GTCACATGAATACGTTTCATTAATGATCAATTTATATTCATTAAGTAACA
ATTCTTCATTTGCAATATTGCAATGTTGCATATTGAGTACCACTAGTTCT
ATTATCAAATATGATATTTGATACATGGTTTAGCTGATTTTACCGGCACG
GTCAAGGGTACTTCAAGGTTGAATATTGGGTTATCAATTAAACATATGTA
TGAACCACCCATTTGTATGACTTCTGGTGTTATACTTACCGAGAAAATAA
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GAATAGATATGTATTCAATTGATTTTTAGTTTGGTTCTGTAATTGAGGAT
ATTCGACAGTCTTTAATGGACATGCTTCAAAGAAGCACATGTTACAATAA
AGTAGCAGCCGAAAAATCTTTTTCAGCCAAGGTCACCCAGGAAAGATTGA
ACATGTCACCACAGGTCTTGCAATAGGTAGGAACGACCTCATG
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
Sc0000160 | genome | Sc0000160:442035..451577 - |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | gff3_genes |
Gene id | BL90310 |
Biotype | protein_coding |
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