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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at Sc0000000:9581532..9591755- Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >gene:BL96617 ID=gene:BL96617|Name=gene:BL96617|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=gene|length=10224bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000000:9581532..9591755- (Branchiostoma lanceolatum)
AAAGCGGGAACGTCACCAGGTGGGGAACGTCAGGTAAGGCTGGTTTGAGG
CCAAGTCAGGAGCTGTCAAGCACGATAAAGGGACATTTTATCGGGAAAAA
AATTGAGGGGCCGGGGGGGAATTGATTTGAGCAAGCAGCATAATATACAG
TGACAGTTTACGCACTATGGCTGAACTATGTAACGGGACAAAGTACAGGA
AGAGGAGAGTTATGTCAGGGGGGGGGAGATAAATTGTAAAGTATGATGAC
AAATGGGGTTTCCAGCTTTACGTCCCCATCCGAAAGGACGAATTTTGCAA
CCCCTATTAAACATTAGTGCCCTCTTGATCCATGGAATCTGATCCATAAT
TAGTCTGACAATTCTTCCATGTGATAAAAAAGAAGTGTGATTCACCAAAT
TATAATTATCAGGTCCTAAGTTGATCCTAATTAGAGGACAAATAAAAAAA
AGATTTCGCAATTCTTGTGTTGGGGTTTCCATGTTACTAGTGTAGATTCA
GTTATTTTCATAGGGACTTTTTAAGCCCGCAGTTGAAACAACACTATAAT
AGTACAGCATTACATAGTCGCAGTGTCGTCAGTTCAAAGTGAAGAAGTCT
CAGCAAAAATAGGACCACTGTGAATGTTTGAATGTTTCAATATTTACAGA
ATAAAAAGACTCTTTTTACACAACCAAGTGATTTGTTCAACAGACGTTTT
GGTGACCATCTGTCACCTGCATCAAGGCAATTCTGACTGGTTCACTTTCC
ATTGAGGCACAGGTGTCGCTGCTTATAGATACGTTCCCAAATGCAAAGTA
TGTAATTGTATACTAGTAAATGTTACAGGGTTGCATCTATAAGCTTGACA
GCTGTGCTGCAGTGCAATGTGAACCAGTCAGAAAAGGGTCTTTTTATTCA
TGACTTACCAACCTAATGAAACATTTAAGTCACAGATTCAATATTTACAG
TATGTACCATCAAAGATGAACTTTCGTGTATATTTCCTGTCATGTAGGTC
CTAGTCATGGGTGACTCTTCAGCGTTCCGTAAGCGGTTTATCCGGTGGTT
AGAAGACAACCGAGGGTTCATCATCCTGGTCTTCTGTCTGCCTGCCAGCT
TCCTGTTCGACACCTGTCTGCAGCTCAGGTGAGGAGAGAGTATCTGTTTC
AGTTTTCTTTTTGTCATTTTCAGTTTAGGCCATGTTGATTTGATTATATG
GATGACATCCATGCGCGCATCAATGTTCGTCCATTTCCACGAAAAAAAAA
ATCTAGAAGTTTTCTACCATTCTGTAAATTGTGGAAAGCAGCTTTAAATT
AAGCAAAAATATACCGTAAATTGCAAAAAGATTTTTTTTGAAAACGGACA
CTAAATGTCTAGAATGCCAAACTCAAAGATCTGAAGAAGATATGAATGAC
CAAATATGAAGAATCCATTCTTTGGTATACCATTCTCTGTCTGTTTAGTC
ATTGCTTCAACCATCCTGACCACCTAGATTTCATAATGTAGGCAACTTTT
TTTTAAAAATCTTTTTTCTAAATTTCAATTTCATTTCAACATTTTTTTTA
CACCTGTTTAAAAAAACCAACAGTATTTTCTGACATTCTGTAAGTAAACT
GGGCCCAGAAACATTTCAGAATCTTCAATGACGGTTAGCCATCCAGGTTG
TAAGATATGAAAGGTAACAGTTACTCAAGCAACTGGATACATTTTGGAAA
CAGTCAGATGTTCACTACCAATCGCTACCAGTCACTGACAAAAGGTAGTG
GATGCAACCTGAAACATCTGACCGTTTCCTAAATTTAAGCATAACCAAGC
AAGTTGCTTGAGTAACTGTTACCTTGCATTTCAGAATTATCTCTTCTTAT
TTTTACTTTCTATCTTCTCGCAACAGGAATTGGTTCCGTCGGACATTCCT
CTCGGCTCCTGAGAAGCACGATGAGCGTGTTCGTGACATCCAGCGGCGTA
TCCGGCAGTGGAACGACCAGCCCAAGGACAAACGGAAGCCCATGTGTACG
TCTCGCCCAAACTGGCTCAGTCTCTCCACAACGTTTTTCCAGAAGGTAAG
CTTACGTCCATGAAAACGTGCCCTAGCTAGATACGGCAGATAACAACTTG
CTGCCTCTACGGCCTCAAAAAGGCTATAGGACTTACCTTTACCTATTTTT
TTTCTTAAGGCTATTGTTACGGAGGTATTGTTTTCGGTCTGTTTGTTTGT
CTTGGTGACTGCAGGGCTCAAAATTCATTTTTGGAAATAGGTGCACTGGT
GCACCCAACCCAAAAAATTATTAGGTGCGGCACCACATAAAGTCAAGTTG
AATGTCAGCAAAACATAATTCTTGAAAAAGCGTCATACTTTTTGTTATGT
CAATATGATTGCGGATGATCTGTACAACATCCTGGAATATTTGTTTGTTC
ATTTTTTTTCACAGTATCAATATCAGAAGATCCCAGTCAACCTGTACAAC
ATCCTGGAATAGTTGTTAGTCTATTTGTTTGTTTGTTTACAGGACCAGTG
TGAGAAGATTCCAGTTGACCTGTACAACTAGTCTCCAACCAGACCCAATA
GATTGCAAAGACCGTATCCAACTGGAAGAAGGAGCTTGTAATGCAATCTT
GGGTTGCAAAACATACTTCCTCTGCCAGTTTGATACGGTCTTTATGCAAC
CTATAGATCTGCTTGGAGATTACTGTACAACATCCTTGAATATTTATTTA
TTCACTTGTTTCTTTGTTTGTTTATTAACAGGACCAGTGTGAGAAGATCC
CAGTCGACCTGTACAACATCCTTGACCTTGACGAGGAGCGACAGGTGGTC
CGCGTGGAGCCGATGGTTTCCGTTGGTGACATCACTCGCTACCTCATCCC
TCGTGGTAAGCCTTCTGTTAAAAACAACATTTTGGTTCATGATTACTCTA
AAAGTGAATTAGTGCATATAATGCACTTGCATAAGTTAAAGTTAAAGTCC
TCCCGCGCCACTTGGTGGAGCATATGGTGGTGCCCATTTTTGATTCACAG
CCCTTGGGTCACACAACTTTGTGCTAGTCTCTACAGAACTGGGGTAAGTC
TGCCGGTAGTAGTGTGTGTCTAACTTCCATAATACTTTTTCCCAAATGCT
GAGTGCTAAGCAGAGAAAGCAGTATGTACCATTTTAAAAGTCTTACCCGG
CCAGGGATCCAACTCACGACCTACCATGTGGAAGGCAAACACTCATTAGA
CCATTGCACCGTTAGTGGCATGAGACAGAAGTATATACTAGTACACCTTT
TTGTGGTTACTGTGTAATTGAGTACATGAGAATCTAGCCTCTAATTCTCT
CCAAGCAGATGTAAGGATCTGACTCCGTCTCATCATTGTTTTTGTTTACA
TGTATTTAGATTCAACCTTCTAGTAAATCTGACTAGTACTGGTAGTACGT
AGTGCACTTTTTAAACTCTAAATGCCCCCTAATTTTCTGCTCCTCCCTCT
GTGCAATTCTGACAAATGTTGGAGGAGGCAAAAAGTTTTAGAAGATCCAG
CCTGTCAGAGACTATAATAAGCGGGATCCTTGCATCTGCTTGGAGATTAT
AACTTCCTGTAGGTAAGACTAGAGTAAGAGAATCTGATAACTCTGTGTGA
TTACCCAGGATACACCCTGGCGGTGACCCTGGAGATCGCAGACGCGACCT
GCGGAGGTCTGGGGTTGGGCGCAGGGATGACGACCTACTCACACAGGGTC
AGTCCTGTTTTACTGTACGTGTATGTTACGCATGATGTGTTCTGACTTTT
TACGATTTCCCAGGATACACCTTGGCCGTTACCTTGGAGATTGCGGATGC
CACGTGCGGAGGTTTGGGGCTGGGCGTTGGCATGACGACGTACTCACATA
GGGTACGTACACGGTGAACTTATAGGCCTGATGAATTCAGTTCCTTGGTT
TGCAGATGAAGTACCTTGATTGACACACAAATCATTCTTGATTGACCCAC
AATGTTGATTTTATGTCTAGAAATCCATTCAAATAGAGTCTGATAAGGGA
TTGCTGAAACTATGTTCATTATGATATTATTATTATAAAGCTTTGGATGA
AACAACTTGTGACCATCTACTGCACAATGACTTCTCTCTTTCTTGCCATG
TCTCTCTCCTTCTACATACATTTACTGTTGATATTATTTGTAGAATCAAG
ATATAATTTCTTAGATGATAAACCTGATAGTGGAGTGAGTGTGTGCATGA
CTGTGGGATAATATACTTAATACATGTTATCTGATTGGATTGCTGACTTA
AAATCCTTTGTAAGCTCATACTAGACTAAGTATTTTGTCAAGTTGCAACC
TGATTTGCTCTTAGTGACATGTAAAGAAGAAAAATATTTATTGACTGAGC
TTTATCTAAAAAGTATATATATCGATCTTGTATTTTACTGTAAATCATGC
ACAAGGTTTAATACAGTAGTTAAATGATGTTGTCAACAAACAGTTATTCG
TTCTTCTTTAATATATATCATTGCACCTACTAGTATTAGAATTGTTGCAC
AACTAAGTTCTTCTTCTATCTGTATCCTCGACTACCACCAGGTGGGTTTC
TACCAGGAGGCGGTGGAGTCGTGGGACGTGTTGCTAGGCGACGGATCACT
GGTGCACGCCACCAAGGACAACGAGCACTCGGACCTGTACCACGCCCTGC
CCTGGTCACATGGTTCCCTGGGGCTGCTGGTTGCCATGGAGCTCAAAATC
ATCCCCGTCAAACCTTATCTTAAGGTAAGCTTTAAGGTTATGCCTTAGAG
TTTCTAGGGTATCTTATAATGTTTGATATTATGAACTGAAAGATTTGTAC
TTTCCTGGTTACATGGTTGCCTGGGGCTACTTGTGGCCATGGAGCTCAAA
ATCATCCTGGTCAAGGTCATGTCTTAGTCAGAGTTTCTAACTTCTTTCTT
AAGAAAAACTGAAACATTTAAACCTGTACCACGCCTTGCCCTGGCCCCAT
GATTCTCCAAGAGGTTATGCTTTTAAGTTCATTTATAAGAAGCTGAAACA
AATCTTGCTTAAATGAGCTGAAAGCAGCAATGTGAAAAACTACTTACAAT
TGAGTAACTTTTGTGCTTGGTTGTACAGATTTGAACAAAATGTTTCAGAG
CGCAGCACAAGTCTTTGTTGCTACAACCAACAACAAAAGAAGGCTTAATA
TAGATGATGATGATGATGAATATGATCTTTCACTCATGACAATGTTGTTT
TTTCCTCCCAGCTGACCTACATCCCCGTCCATGGTCAGAAAGCCTACTGC
GACATGATGAGGGATCTCTCAGGGGCCTTGGACAAGACGGCAAAGGTGGA
GACATGTTGTTTGTCATACAATTTTCTCTCTAGTTTAATGACACGCACAA
ATACATTATTCTTCAATTTTACATCCTTGTTAAGCCCAAAATAGAGAAAT
AAATAAAAAGATTCAATCTGTATCAGGCATATTTGGCTGTCTTGGCAGAA
TAACCAGTACTGGTAAATCTAAAAGGATGACAGATTTCCAGGGTCTCTCG
AGTCTGCGAATGACCAGGAATCTTTAGGGTTGACCTTCAATATTCAATAT
TTAATTCTTTATTCAATTATGAAGATACACAAAAATGGTAACCAGAATGG
CATCAATATTCACAATTAAAACAACACTCCGACATGTACATCCCTGACAC
AACAGATGCCCATTACTGCATACTGGATTATTCTGTCTGATTGAATATGT
ATAGTTTGGAGAAAAGTCAGTTTTGAAGTCTTATTGACCATAAATAATTC
CCCATGTCTCTCTTCCCACACACCCCACCCAGCTCCCTGACTACCTGGAG
GCGACAGTGTTCTCCAAGGAAGAAGCTGTTGTGATGGTCGGGAACTTCAC
TGACGTCACCGACCCTAAGGAGAAGGCCAAAGTCAGTTTTACCTTAGGAA
AAAAAAACAGATTCTACCTTAAAGAAGACTTTTTGATGAACCTATAATAT
CCAAATGTTCATGTACCGAGTGTCTAGCTATCAAATACTTTGCTGTAAAG
TTTTGCATCAAATGCAAGAAAAGTCAAAACACCAGTGAACTGAGTCTCCC
AGGCTAGTATGATAGATTCAATGATTACTTAGATACCATTTCCACCACAC
ACAGATCAACCACCTGGCGAGCTGGTATAAGCCGTGGTTCTACAAGCACG
TGGAGACCTTCCTGCAGAAGGGTGAGGACTATGAGTACATCCCTCTGCGC
GAGTACCTCCTCAGGCACAACCGTGCCATCTTCTGGGTGGTGGAGTCCAT
GATACCCTTCGGAAACAACCCTCTCTTCAGGTGGGTTTCTACTGCATACA
TTTTGGTGTAACCCTTTATTTTCGGTATAATTATCAGCTTGCGCATGATG
TTAGTACAAGTGAGGGGCACAAGTAAACAAAAGGAGAAATAGACCTGTTA
ATGAGAATAAGGAAGCATTGAAAGACCTGATTTGATTCGATTTTTAAAGT
TTGAAGTCTACATCAAAAAGAAGGAAAATGTGACTTTTGGGCTGTAACTG
CAGCCATCTTCAAAGTAAAAGTGAAAGGTGGCTGTTTTATTTAAGGTTGT
TTGCCTGTATGTAGCCTGTCCCTGTATTGTATGTTTCAAACTTAAAGGAT
GATATGACTTGATTTATACCCGATTTATATCTTCTTGTCTACCTACACCT
GATGATTTAGTTTGATGATTTCCTGTTTTTCAGGCTGTTGTTCGGATGGC
TGTTACCACCCAAGCCGGCCTTCCTCAAGTTCACTACCACCCCAGGGGTC
AGGGCCATGACCTTTGCTAAACAGGTAACCTAATCACATCCTTGTCAAGT
TCACCACCATCCAAGGCTGTTTCCAGCTTTAGATTACTTTCCTTCCCACT
CATTGTTTGGGAGCCCATGTTATTGATATTGTCATTTTTAGCTTACGAAA
AATACATTTTCATCAATTTCATATTACCAGGGTATGAAGGTCAGATTTTT
TGGGACAAATTTTGTCATAGGACGGGTCTTGGAGATAGCCCTTGTACCAT
CTCAGGTCAGAGCCATGACCATTCACTAAAGAGATAATCTCTCACTTTGA
AATACAATTCATCGTCTAAATCTAAGTCATCTTTATCTATATTCCTGTTG
ACAAAGTATGAAATCCTTTGTTGACAGACATGCTGCCCCTATGGCTGCTC
AGCTATATGGGGCTGAGGAGGAGATCTCCAAATATGATTGATAGGAGTCA
CCACTGTGCAAGTCCTATTTGTTTGCTTGTGTGTATACACTGGTATTCCA
GGACATTGTCCTTCTCATGACAGCAATTGTTTGACACGTACCCCATCCTG
ATCTACCAATTGCTAATAACCTGATGAAACTATTCACGAATGTCTGTTTA
TTTCTAAATTGTTTGTTTCCAGGTGTTCCAGGACATTGTCCTCCCCATGA
CAGTTCTGGAGAAGTCGGTAGACCGTGCCGAGGAGTTGTTTGACACCTAC
CCTATCCTGATCTACCTATCATTGACAGTTCTAGATTTGTTTGTTTATTT
GTTTGTGTATTTACAGGTGTTCCAGGACATTGTCCTCCCCATGACAGTTC
TGGAGAAGTCTGTAGACCGTGCTGAGGAGTTGTTTGACACCTACCCTATC
CTGATCTACCCCTGCCGGATCTACGACCACGGACCCGCCATGGGGCAACT
CCGCTCTCCCAGACAGGACCAGATGTGCCCCGGGACCAACTATGGTGGGG
AAGCCTTTAATGCTTGATGGTTGTGCTGAAGCAAAGTTCAACTGTGTGAT
TCTTATTAGTAACTTGACAATGAATAATTTATGTTGTATCTGTATATACT
ATTCTTTTGCTGTGACCCAGTGGGTATGTGACTGTGTGCAAAAAGGTCTT
CATCCATTCAGTCAATACAAGGAGGTCCTCTTAACCTCCTTGGTCAATAC
AAACTTTAAAATTGGACTTGCTCAAATTTTTGACTGACCAACTATAGTCA
TTGTCAAAGAATGAGCAATTGATGTTGTTGAGGGTTTTTTTTTAATTGAA
AGGCCCTGCATCTGAAAGCAGATCATTTCATTTTCTCTTGCACGGGATAA
ATTGTTTTGTAGCTGTTTAATGACTGTTCTGCACTGTGTTAATTTTGGAT
GCATGATAGATTGATACCAGCAATCGCTGTGTACTGTGTTGTTCATACAT
GTATGTGGCCTCTGTCAGTCCATTATGGTAAAATCCTAATTCACATCAGC
CCTACAGCATCAGCTATGGCTAAACAGTTCTATACTAGAAAGTCCTATAC
TAAACAGTCCTATACTAGACGGTCCTATACTAGACAGTCCTATTAATAAT
AATAATTATTGGATCTCACTCCCTTACAGGTATGTTCTATGACCTGGGTG
TGTACGGAGTTCCAGGTCCAGTCAAGCGCCGGGAGCGTTACGATCCCGTC
CACGCCATGCGCAGTATGGAGAAGTAAGCATCTCTCTTTTTTTAATACAC
GACATGGTATAAATGTGGGACGGTGGCCTTAGCCTGGGTACCATCCTTTT
CAATTTTACGGGAGCAACTGAGAGAGCGAAGTAAAGCTAAAAAGGTTGGC
ACCCAGGCTACCTTGGTCTTGTAGTAAGGGTTTAAAAGCAGAAAAACAGA
AATAGATTTAAATAATTTGCCTGTTTTCCTAGTTGTATATCTAAGTTTTG
ATTGATTCCAGTTTCTAATACAGACTCTGAGGTGGCTTACAAGAAACTCA
AACTATTCGTCTGAGTGCATAAACAACAGCATAAACATCTTTAATATGTC
ATTTGTAGTCTTCCTATAGGATGACCAGATCTTGGTCTGAACTCAGGCTT
ATCCCTGAAGCCAATGGTTAGCCCTAAAGCTTCCTGTATATGCAGACATC
TTTAACCTTCTCCCTGCTGCCTAATCCTATAACCAATACAAATTTGGTGC
CAAATGACTACCTTAGCAAGCTGNAAATTACTACCTTAGCAAGCTGAAGT
TTAATGTTGTTCTGTGTTTAACCGATGCAATGGCCTAGTGAGTGTTTGCC
TTGCATTCGGTAGGTCGTGAGTTCGAACCCCGGCCGGGTCATACCAAAGA
CTCTAAAAATGGTACATACTGCTTTCTCTGCTTAGCACTCAGCATTTGGG
AAAGAGTATGGCAGTTAAACACACGCCACTACCAGTGAACTAGCCCCCTG
TAGTGACTTGCACAAAGTTGTGTGGCCCAAGGGCTTTGGAACCGGAGATG
GGCGCTACCTTATGCACATTCGGTGCGGGAAGGACTTAACTTTAACTAAT
TGTATGTTTAACTCATCAGGTTTATCCGTGAGGCCAGCGGTTATTCGTTC
CACTATGCTGACATCTTTCATGTTGTTCTGTGTTTAATTTCAGGTTTATC
CGTGAGGCCGTCTGTTATTCGTTCCTCTATGCTGACATCTTTAATGTTGT
TCTGTGTTTAACTCATCAGGTTTATCCGTGAGGCCGGCGGCTACTCCTTC
CTGTATGCTGACATCTTCATGACCCGTGAGGAGTTTGAGGAGATGTTTGA
CCTGACTCTGTATGAGAAGGTAAATGCTTTGTGATTTTCATTCAATGTCC
TTCATTCCTCGAGCCCTAAGACTTTACTACAGTAACGACTCCAAGTAGAC
CACACATCGAATATCTAGCACCTCAATTTAAACTAGAGTTGTAACAGAAC
TTTCTATTGATTTCACGGATTGTTATCGTATATATATTGAGACTTCCCTT
GTTGTGAACTGACTGGGCACTTGTTGCGAGCACTTTTTATCCTATATGAT
ACGTTTTCATAATTATTACATCTTCGTAGTAAGTAAAACTACGCCTAGAG
CGATTTTAAATTTGTTGCGTACTATAGAGGAATGTTAGTGTTTTGATGTT
TACAGTTAATTGTTGCAGTAATATTATGTAAATGAGCGTCAGGATGAGCG
TGCAATTCAGCCGTTAGGCTGCCATATGCTTGTGCAATAAATCAATACCA
ATACCATTTCAACCAGTGAACTGATCATGGTATAACTTTTTTTTCCTTCC
AAATCAGAGTGTATGTATATTACATGCAATGCTTTTTTATTAAGCTTAAA
GAGGACCGAGACACATTCTTATGTCTGTCCCGTTTTCATGCAGGTGCGTA
AGAAGTACCATGCCGAAGGAGCCTTCCCTCACCTGTACGACAAGGTCAAG
CCTGAGGTTGACGTCTTCGCTATTGGCAAGCAGTGCGCTGAGGAGTTTGA
GAAGTAGATCTGAAGACACATCTT
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000000 | genome | Sc0000000:9581532..9591755 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | gff3_genes |
| Gene id | BL96617 |
| Biotype | protein_coding |
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