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Sequence
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL96769_cuf23 >transcript:BL96769_cuf23-protein ID=transcript:BL96769_cuf23-protein|Name=transcript:BL96769_cuf23|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=331bp
LCTNTNGSFVCSCPEGLKLDNSGTDCVAADACLSLTCSPAEVATCAVISG
VETCTCAAGYALGTNATLCQDVNECDTVCNGTNIACTNTEGSHTCGCVAG
FYLETDGNGAVSCVATKSFSASIRITSWSYTAELADTTSAAFKTLAASVK
TMLDKLYLSKLGDAFMGTEITRFSNGSVVTNYNVNLSPASNETAGSLSAA
LSEAIQDSGGGGAFSFDPSSISVTDVDECASAGANSCHMQATCTNTEGSY
TCTCLSGYTDTSPAGTTPGSMCEADRPPAPGKDNTTLAIALGVTCGVLAI
MIVIALVFFILHKNKTGGTKITPVRKPSSSD Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000166:324153..332665+ Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL96769_cuf23 ID=transcript:BL96769_cuf23|Name=transcript:BL96769_cuf23|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=8513bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000166:324153..332665+ (Branchiostoma lanceolatum)
CTCTGCACCAACACGAACGGCTCCTTCGTCTGCTCCTGTCCGGAGGGACT
CAAACTGGACAACAGCGGCACAGACTGCGTCGGTGAGTAAGGAAAGCAGG
AAAGTAGGGGAAACAATTATGGACAAGTAGTTCTCAGATAACATATTGTC
CTCCTAGCGTTTTGTTCTTCGTTTCAAGTCATATGTCCTTTGTGAAGCCT
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ATGCTACAGTAGAAGCCACTTAATTGCACAGTGGATTAATGCACACTTCT
GTTAATTGCACGGAATCCCCAAATCCCAAACCACTTCCCGCTTGGTGGTG
CAGTCCAGCTGGGCAACTTCGCTTTGTTGCACCATCCGGATAATTGCACC
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GAATGATGATGATCCACTGTATATGGAATAAAGGAAAACAATAGACGACA
ACAAAGCAGAAAACACCTGACATGTACCTGTTGCACCTCCCAGCTGCGGA
CGCCTGCCTGAGCCTCACCTGTTCACCTGCGGAAGTGGCCACCTGTGCCG
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ACCAACGCCACCCTCTGCCAGGGTAAGGGCTTTACTCTGTACTCTGTTCA
TTGATTACCTAATCAATGTAGATATCGACATATCTATTGCCATTGCTTAT
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TTGATTGATTGATTAAATGATTGATGTGCATAGATTAAGATATTTGTATA
TCTACCAACAAGTAACACTGTTTCTACTTTCAATGTTATTTTAGGTTGAA
ACATCCCAAACCTGAAAACTTGTAAATGTGTCTTGTACAAGTTGTTTTCT
TAGAATATTTCAGTAGATAAATCTATTTATTCAGATTTATAACATTTGTG
GAAGGATTGACATAACAGGTGACTATCACCTTTTCAGACTGTAAGAAATG
GGGTTAGATTATCGCATTGATTTGTTTGCTGTGTTGTTTCAGACGTTAAC
GAGTGCGACACGGTGTGTAACGGGACCAACATCGCCTGCACCAACACGGA
GGGTTCCCACACCTGTGGCTGTGTGGCAGGCTTCTATCTGGAGACTGATG
GCAACGGGGCAGTCAGCTGCGAGGGTAGGTTTCTTTAGAATGACTCAAAG
AATAGTAACTGTTTTGTAAGTGCATTGTTAATTAGTCCCACGCATGCCAC
AGGACTCTATCTGGAGACTGATGGCAATGAGGCAGTCAGCTGCGTGGGTA
GGTTTCTTAAGCCACCGTCACAAATAAGAAATTCAGCTCGGCCGATGTCT
TGGCGAGCTTCGAATGTGCATTTCAATCAAAGTACGGCCGACGTTCTGTC
GATTATGCGAGCTTCAGGCGATTATTAGAAATCAAAGTTGATCCAAATAT
TAGCCTTTTACCAGCTTAGTCGATTCTGACTTCGTCCATGTTCAAGAGAT
GGGACCATCTCATGGGGGGTTTTTAGTATTCGACGGACGTCACCCGAGGC
GGGACACTCAGGCGATTTTGAAATTCGGCGAGCTTCGGGGGATCTACAAA
TTCGGCCGACGCTCCCATGAATTGTGACGCCTCCTTTACAGAATGAATTC
AGGCATAGTTGTATACATGTACCTACATGGTTGATTAGTAACACATTGGG
GCCCCACACATCACTAGCTGCTCATTGCATCAGACATCCTGATATCATAG
CTTCCAGACTACTACTGTTATTGGAGCCTACAAAAGGGAAAAGAAGCCGT
GGAAGACCAAAAGGCACCTTTATTGACACACTAAGAGCCGATACCAACCT
TACTGAAGTGAAGGAAATCAAGTCCCTGAGTGGCGTGGGGAAAGCTTTCA
AGTTTGGTTCGAGCGGGAGCTTGACCAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTAAAG
TAAAGTAAGTACATCACAGGGTTCTATCTGGAGACAGGTGACAACGCGAC
AGTCAGCTGTGTGGGTAGGTTTGTTACAAAAGGAATAGTTGCATAGTTAC
GTGGTTAACTCTAAGTACTAGTACATCAAGGTCCCACATGCTGTCAGATT
GGTTTGATTGCAACAAGGTCCGGCCAACATGCCAGGGGTCCAGGAGATAG
GAGCTTAAAGCAAATGTCTTTTTCTGTTGAAACAATAGGAAAATGATTGA
ACTTTTTTCCATGTTTTCTTCTAGCCACAAAGTCGTTCTCAGCTTCCATC
CGGATCACCAGTTGGAGCTACACGGCCGAACTTGCCGACACGACTTCTGC
CGCTTTCAAAACTTTGGCCGCTTCTGTCAAAACTATGGTAGGTTTACTCT
CTCACACACACACATACACACACACACACATACATACACACACGAAATCC
GCCGCCTTCAAAACTCTGGCCGCTTCTGTCAAAACTACGGTAGGTTCACT
CACTCACACACACACACACACATACACACACACACACACACACACACATA
CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACCACATCCGC
CGCTTTCAAAACTCTGGCAGCTTCTGTCAAAACTACGGTGGGTTGACTCA
CAGCACACTGTATCCATTAACATGTTACTTATGTCTCAACAATCCTACAT
GCTACAGTTTTGTCATAATAAGTTTATTTTCTTTGTTATACTTATGATTT
TACTGTTTTTGTAGTCTGGGCTCCATTGAAAATCAGTTTGCCAGAATTGA
ATGGGCCGCCCAGCTGTCTGAAAATTCAATAGATGAATGAAACATTATGA
TATTGATGATAACTTTTATTTCTAATTGTTCCTGATGCAATGTATAGCAG
CTTGTACAACAGTTCTGGAAAGTAATCAACTTTAAGGGCTCATTACAGTG
TAACACAGGATGAAAGTTTACACTTGGCAATGCTGGGACAGTACAGGTTA
GGGGCAGGTATGTCAGAAATACCCGGCACACAACTCCGGTTTTACATCTG
TATCTATAGCGCTGTCTTGTGTAAGAGCCTAAACAAATTCTTGCTATGCT
TGTGTTTTCCCCACACAGCTTGACCACACGCATCCAAACTCGGAGACGCG
TTCAAAACTAAAAAAAAACAACGTTTCCATACACAAAACCTTGGCACAGG
TAGAAATAATCCTCATTTCTCACAAAGGATATGTTCAAGTTTATACATGT
AATGTTTTCTCTGTTGTCTCACAGCTTGACAAATTGTACTTGTCCAAACT
CGGGGACGCGTTCATGGGCACGGAGATCACCCGCTTCAGTAACGGCAGCG
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GGTAGTCTGTCCGCCGCGCTGTCCGAGGCCATCCAAGACTCTGGCGGCGG
TGGCGCGTTTTCGTTCGACCCCAGCAGCATCAGTGTGACTGGTGAGTTTA
AACTCTTTTTTTTTTCAACAGAAGCTACACAGCACTGACACACTCAATTT
TCTCACCTTGCTATGGGTACTTTGTTTTAGTTGAGCCACAACAATGCAAT
TTGTTGGTTTTTGTATTTACAAAGATTACGCTGAACTCAGGCCAATCAAT
GCTTTTACTGGGAGGTTCTTAATACTTAACGTGAGGAAATATATTAAGCT
TTCTCTGTATGACGTCATACATCAAAGTCTACAGTGGTGGGAAACATTGC
ACAGTGCACCTGTGTACCTGTATTAATGATTGTTACTGTTCCGCCCCACA
GATGTGGATGAGTGCGCCAGTGCAGGTGCGAACAGCTGCCACATGCAGGC
CACCTGCACCAACACGGAGGGCTCCTACATCTGTACAAACACCTGTACAC
CTGCACCTGTGTACCTGTACTAATGATTTTTACTGTTCCAACCCACAGAT
GTGGATGAGTGCGCCAGTGCAGGTGCGAACAGCTGCCACATGCAGGCCAC
CTGCACCAACACGGAGGGCTCCTACACCTGTACACCTGTACATTTGCACC
TGTGTACCTGTACTAATGATTTTTACTGTTCCACCCCACAGATGTGGATG
AGTGCGCCAGTGCAGGTGCAAACAGCTGCCACATGCAGGCCACCTGCACC
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GTACCTGTAATCATTGTTACTGTTCCACCCCACAGATGTGGACGAGTGCG
CCAGTGCAGGTGCGAACAGCTGCCACATGCAGGCCACCTGCACCAACACG
GAGGGCTCCTACACCTGTACCTGTCTCAGCGGCTACACGGACACCTCACC
TGCGGGCACCACGCCTGGCTCTATGTGTGAAGGTGGGTACAATCGTCAAT
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GCTAGATTCAAGTAACTGGCTAGCTGGCTCAATTACTCACTAATTATCTT
CAAGTTAGTAATTTGCCAGCTTCATTGCTTGTTATCTAGCTAATTTACCA
GCTCCTTGGTTAGCTAGCTAATTTGCCATATCCATTGCTAGTTATCTAGC
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GCTATTTATCTAGCTAGTTTACCAGCTCCTTGGTTAGCTAGCTAATTTGC
CAGCTCCATTGCTAGTTATCTAGCTAATTTGCCAGCTCCATTGCTAGTTA
TCTAGCTAATTTGCCAGCTCCATTGCTAGTTATCTAGCTAATTTGCCAGC
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GCTAATTTGCCAGCTCCATTGCTAGTTATCTAGCTAATTTGCCAGCTCCA
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ATTTGCCAGCTCCATTGCTAGTTATCTAGCTAATTTGCCAGCTCCATTGC
TAGTTATCTAGCTAATTTGCCATATCCAATGCTATTTATCTAGCTAATTT
GCCAGCTCCGTTGCTACTTATCTAGCTAATTTGCCAGCTCCGTTGCTACT
TATCTAGCTAATTTGCCATATCCAATGCTAGTTATCTAGCTAATTTGCCA
GCTCCGTTGCTACTTATCTAGCTAATTTGCCAGNTATCTAGCTAGTTTAC
CAGCTCCTTGGTTAGCTAGCTAATTTGCCAGCTCCATTGCTAGTTATCTA
GCTCATTTGCCAGCTCCATTGCTAGTTATCTAGCTAATTTGCCAGCTCCA
TTGCTAGTTATCTAGCTAATTTGCCATATCCAATGCTATTTATCTAGCTA
ATTTGCCATATCCAATGCTATTTATCTGGCTAATTTGCCAGCTCCATTGC
TATTTATCTAGCTAATAAATCAGCTTCATTGCTAGTTACTCAGTTAGTTT
GTCAGCTACATGACCAATGAACTAACCAGCTGTACATTTATTTACTGAAG
TTGTTTGGCTAGTTAGATAACCAGCTGTATGTACAGTTAAACTGTAGTTG
TTAGCTCCATAGTTTGATTAGATTGCTAACTTGAGTATAGTTGCCTCCAT
AGATGGCTAAACTGGGTATGGTTTAAGCTCCATAGTAATTAATAATAATA
ATAGTTTATTCCAAATTCATGCCCGTAGGCTAATTGCATGTTGACAACAA
TGTCGAAATACAAATGTAAGGTAAAACAAAGGTATACATGAATACAAAAT
CATTCTATATTGCTATTCTACAGTAAGTTTCTATATCTACGGTACTAATG
CGGGGTTTGATTTCTTCTCTGAAAGCAGTGGAAAATAAAAAGTCCCACAC
TTTCAATGATGAGTGGGCTGGATGATTTTAAAAGGAATATGAGTTTCTGT
GTATTTCTTAATTTAGAGATGTTTTTGGAGATTTCATATACTTTGAAATT
CGTGAATAATCTGTTTCTTTCGGTTTCAAATTCGGGACATTCGCATATAA
AATGTATTTCATTTTCCACTGCTTTCGTTGCACACTGTTTACATTAATGT
GTGAGTAGTTAACTAACCAGCTGTTTCCCCACCCCCAGCCGATCGCCCCC
CTGCCCCAGGGAAGGACAACACGACCCTGGCCATCGCGCTGGGCGTGACC
TGTGGCGTGCTCGCCATCATGATCGTCATCGCGCTCGTGTTCTTCATACT
GCACAAGAACAAAACCGTAAGGACATGTTTGTTTTTTGAGGTAGCGTGCG
TAGTCCAGTGGTTAGCGATCTTGCCTCTGGAACTAGAAGGCCCGGGTTCG
ATCCCGGCTGTGTAGCTCACCCGACATGCACGCTACCGTTAAAGATCGCA
GTCCTTAGGACGGGACGTTAAGCCGTGGTCCACTGTTCATTGTGCTTGTC
GAAAAGAGCTAGGGGAATTTCCCCGGTACACTGAACCTGTAAATACTGTA
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TCATTGAGTTCATTTGAGCTAAACTGGTTCGAGATCNTCACGACCAGTGG
AAGACTAGCTCATCTGTTCATTGAGTTCATTTGAGCTAAACTGGTTCAAG
ATTCCTTTCCTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTGCATATACTTTGTAGACACA
CTAGTTCTATATTTTCTATCGTTCGGTAATGAGCAAGAAAGAACATAATC
AAGATGTTTATTTGTCTGTTTGCTTGCCTGTTTTTTTGTATCATGTAGGG
TAAAACAAGCAAATTTTGTATTACTCTATTAGAATCGTCTACATCAGAAA
AGTTCTGTCATCACAATCCTAGTTTCAATTCTAAAAATATTAATTTCCTT
TTTTAAAGTTTGATTTTATTTGTCATTTTCAACTAAAGATGCATTTTTAC
TGTACCTCCATACGATATTAGTGTATTTTTCATGGTATTTCTGACTATAT
TCATGCATTGTTTCACTTTATTTGTTAACTATATGCATTTTTTCCATATA
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TGATGATGATGAGATTAATGTATTTTTTCGCTACATTGTTTAATTATGTT
CGTGTGTTTATTTTACAGGGAGGCACGAAGATAACCCCAGTCAGGAAGCC
ATCTTCGTCAGACTAGGAAACTGACCAACATCGGGGAAATTCCTTTCAAT
ATTGATTTCAACTTAAGAAAAGCCTTTGTATGAAATTGTAGGAAGATGGG
TGTGGCTCTATGTGTCCTTGTACTCTTAAAATAATGACCACTGCGATAGA
TTACTGTCTGTTTGGTGAAAAAACTAGGATTTAGAGCGTAATGATGATTT
AACAGTTGTAAGATTTGGTGTGGATTTTTATGTACGCTTACTCTATGTGT
GTCTCAATAATTAGTAAACTTTAAAACGTTTCATTTCTGTATCTAATATG
ATTCTTAAACAAAGTTGCTTATTGTAAAAAAAAGTATCCTGCTATTTTCT
TGTAGCAAGAGGCTATTTTTTCGGCCAGAACTCACGCAAAGGCCTGATGA
CGTCCGCTGTACAAGTGTACGACAGCGAACTGAGGGCGTTCTTATAAAAA
CTATTTTTTCATTTGTCATGTTCAACACTTCGGGTCCCTCGAAATCACCA
GTCCTATTCAGGAAATGACTCAATACTGCTGGCAGGTTACTTAGTGTAAA
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ATCATGTAAGATTCAGCTTTCTTGTGACAGAAAAGATTGCTACACGTTTA
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GCACAACGTACAAATGTATTAACTGTGCTATAGAAGTCGGAATACAGATT
GAAACACATGCCATAATACCTTTATCACAACTGTAAAAAAAGTTTGTTGA
AAAAATGTTTAAAAGTCTGTTAAGTTTTATAGAAAATATGTCTTACAATA
TAAACGATAAAAAATATAGTTTATTACAAGAAATCTTATTGTGAGTACTG
AATGTGCCATTGTTGAAATATATCGTGGAATAATATACATACAACAGGTA
CATAGACATTTGAGAAATTATGTTACACACATTTTGTCAACTACCGGTAA
AAGTAAAAATACCTGTTAATGTTCTTGAAGGTACCTTCCTTGGAGTAAAG
TAGCAGAAGAAATATTGGCTGGTAGTTTACTTTTAGTTGTGCAACAAAAA
TGCGGAAAGAACATCAATTTACCAACAACAATTCTCGGATATTTTTACTG
TAAATTAAGGATGTTATAAAATCTTTGCAGTAATTTAAACGTCCTACACA
TATATGTATAAAAAGATTTCGCACTTGGAACTATTTTGTCTGTAGAATTT
CTGCATGTTTGTTGATTGGTGTGTTTAAAAGGTGGCTGCACAATAAAGAC
TGTTCTCTTCAGA Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000166:324153..332665+ >transcript:BL96769_cuf23 ID=transcript:BL96769_cuf23|Name=transcript:BL96769_cuf23|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=996bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000166:324153..332665+ (Branchiostoma lanceolatum)
CTCTGCACCAACACGAACGGCTCCTTCGTCTGCTCCTGTCCGGAGGGACT
CAAACTGGACAACAGCGGCACAGACTGCGTCGCTGCGGACGCCTGCCTGA
GCCTCACCTGTTCACCTGCGGAAGTGGCCACCTGTGCCGTCATCTCAGGT
GTGGAGACGTGCACCTGTGCCGCCGGGTATGCGCTAGGCACCAACGCCAC
CCTCTGCCAGGACGTTAACGAGTGCGACACGGTGTGTAACGGGACCAACA
TCGCCTGCACCAACACGGAGGGTTCCCACACCTGTGGCTGTGTGGCAGGC
TTCTATCTGGAGACTGATGGCAACGGGGCAGTCAGCTGCGTGGCCACAAA
GTCGTTCTCAGCTTCCATCCGGATCACCAGTTGGAGCTACACGGCCGAAC
TTGCCGACACGACTTCTGCCGCTTTCAAAACTTTGGCCGCTTCTGTCAAA
ACTATGCTTGACAAATTGTACTTGTCCAAACTCGGGGACGCGTTCATGGG
CACGGAGATCACCCGCTTCAGTAACGGCAGCGTCGTCACCAACTACAACG
TGAACCTCTCGCCTGCGAGCAACGAGACGGCCGGTAGTCTGTCCGCCGCG
CTGTCCGAGGCCATCCAAGACTCTGGCGGCGGTGGCGCGTTTTCGTTCGA
CCCCAGCAGCATCAGTGTGACTGATGTGGATGAGTGCGCCAGTGCAGGTG
CAAACAGCTGCCACATGCAGGCCACCTGCACCAACACGGAGGGCTCCTAC
ACCTGTACCTGTCTCAGCGGCTACACGGACACCTCACCTGCGGGCACCAC
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ATGATCGTCATCGCGCTCGTGTTCTTCATACTGCACAAGAACAAAACCGG
AGGCACGAAGATAACCCCAGTCAGGAAGCCATCTTCGTCAGACTAG
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000166 | genome | Sc0000166:324153..332665 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Transcript id | BL96769_cuf23 |
| Biotype | protein_coding |
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