XLOC_003878 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_003878
Unique NameXLOC_003878
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000072:323801..333003-

Legend: transcript
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_003878 ID=XLOC_003878|Name=XLOC_003878|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9203bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000072:323801..333003- (Clytia hemisphaerica)
TTAGTATTTCTTTACACGAGCTCCAAACCTGATTTAATAAACTTGAAATG
TATTAGATAGTCTAAGACTCTTCTCATTTGTTTATTTTCAGTGTTAAACA
AAACAAAATATAAAACAATATCACGTGATTAAAAATGAAAGTTTTGATTG
GAGGAGGAACTGGGTTCGTTGGGCGCCATCTTGAAAAAGCATTACGTCAG
CGTGGACACACTGTACAACTTATCTCACGTTCAAAAGGTAAAAACTGATT
GACGAAGTTTCCAGCGATTGAAAAAAGCTGGAAAAACAGGTTCTCGACAG
TTTTGCACGGAAATGCATTTAATTATGCATGCACGTCATTATGTAATAAT
GAGATGCATGCGCTATTCAGCCTTTATATTCTGTTCAAAAAATTGAGAAA
ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCATTATGTAATAATGAGATGCA
TGCGCTATTCAGCCTTTATATTCTGTTCAAAAAATTGAGAAAATCCTCGC
TCTTGCATTCACTCAAAGAAGTTAACATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT
TTTGTAAAGCATCGTGTATCTTGTGAGAAGAGGAAAACCAACATGGCTGA
GCAACAACAGAATGTCGTAGACTACAATCAACTGCAAGTTATAATACAAC
AATTAGTTCGCAACGAAATGCAACCAGCTATGCAACAAGCTGAGAATCGT
GCCAAACAGGCACTCGACCAAACAACAGCCAGTACTTCGACAAATTTTTC
AAAATTAAAAGCTAAATTGGATAAGCAGAGATTAAATGACAACATCACAT
TTACGAAAGCTGGCCACACCGATCAATTCAAACACAATCAACAAGTGTTG
GAGGTTATTGACGACACCTTAGAAGCNTCTTCAACAAATACTAGGAGTAA
ATCCGGTTAAAAAAACTATATAATTGAGTTATGCTTTATCGACATTACAA
AAAAGACAATTTATTCGTGTTATTAATTTTAAAAACAAACACTCGCAATC
TGCTGAATTTTTAGACTATAATAATATATTTTTATCATATGACTAACGTT
GTGTTCTTAAATTGCCATCATAAGCCCATTATTCGTGTTTATGATTTTTA
AGAATGTCACTGATTTATAATTTATGCCTTTGTATTGGCTAATGAACGCA
TGACAATTCGTCGAATGAGATATTTTACCTTGATCAAATTTGTTTTTATT
TTACTTTCTTTCTTTTTTCGACTTTTCGCATTTTTGAAAAGTTTTTTCTT
ACTTTGCCACTCCAGAGAGATTTTGGGAATTTGATCAATCTACCGAAAGT
CTATCTGTCGCCGGAAGAATTCAGGAATTTTCAAACTTCTGGGAAAATGA
ATTGAAAGCNTGCATTTTGAAAAGTTTTTTCTTACTTTGCCACTCCAGAG
AGATTTTGGGAATTTGATCAATCTACCGAAAGTCTATCTGTCGCCGGAAG
AATTCAGGAATTTTCAAACTTCTGGGAAAATGAATTGAAAGCGTCGAATT
TCGCCCTCGGTATCGTGCGGGAAGGCTACAAAATACCATTCGAATCGGAA
CCTCCTCCATTTTTCGCCAAAAACAACGCATCTAGCTTAAAGAATCAAGA
GTTTGTCAAAGATAGTATTGAAAAGCTTTTAGAAAACGGTTGTATTGAAA
AAGTGACAGAGCCACCTTATTGCATCAATCCGCTGACCGTTGCAGAAAGG
AATTCCAAACTTAGGCTAGTACTAGATCTCAGGCATGTAAACAAACACAT
TCAGCCAAACAAATTCACATACGAAAATATAAAACAGGTTTCTGAGATGA
TTAATAAAGACGATTTTCTAATTACCTTTGACCTCAAAAGTGGGTATCAT
CACGTACCAATTAACTTAAGATTTCAGACTTTTCTAGGATTCGCTTGGGA
ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGATGCATG
CGCTATTCAGCCTTTATATTCTGTTCAAAAAATTGAGAAAATCCTCGCTC
TTGCATTCACTCAAAGAAGTTAACTCATGCAAATTCAAACAATTTCGTTT
TCTATTTCATGCACTTATCTGGACCAACGTACCAACCGATGCACTTATCC
GGACGAACGTACCAATCCATACACTTATCCGGACGAACGTACCAATCGAA
AAGACACCGATTCAACATACAAAGAGAACTAAAGATCGGAATGGAAACCC
TAGCCACGGAAAGGACAACCAAAGATCAATAACATTGGAACAATCGGACG
AGCGCTTCTTCCTGGACTTCGAACAGAAGATCAATCAACGGCTCAGACGA
TCAACCACCAAGGAATACAATAGAATATACTAAAAGACGATCGATTACCA
AAACAAACGCCGGTCATTGGAGATTGACGCTCTTACCAACATTCACCACC
GACAACTTATTATCAAACATGGAATCGTGGATGTGTTTTATCAAGTTAAT
GAGTTAATGAATTTTGTATTCCTTAAACGAAAATTACAAATAGATTGATA
ACATTTTGAAGCTATGAAGCTCATACCTCGTAAAAGCCCATTATAATAAT
TATAATTTAAATTTATGATCTCTTACATTTGACGGTCAAACACTTGCAGA
TGGAATAATTTCGTTAGTAAAATATTTGTACATAAAGGGGAGAAGACCTT
TAACCTCCGAAGGTCGGGGTGACGGATGCCATTGGTTCGGAGATAATGTT
TCCTCCAGAATAAACAGCCACTGGGGGTTTTACGCTACACGCTTCNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTATTCGATGAAA
ATCTAATTCCCCTTGAAGATCGAATGCGTCAACTTTACATTCACTGATCA
CTTTCTTTGAATTCTGACCATAATTCTTTGATAAAAATCCTGTAGGTGCT
GACAGAGTGAGTTGGAGTGAACTAAAAGAAGAACAGAAGCTTCCTGAATG
TGACGCTCTTGTCAATCTATCAGGCGAATATATCTTGAATCCCTTCCGTC
TTTGGAATGCGAGTTATAAGAAAGATATTTACGATAGCCGGATTGGAACT
AACCAACTATTGACTGATTTGGTCACCAAAGGTAAAACATAACTTTATTT
AATTTTCTTTGGAGGTGACAAGAACTTTTAGTTATTTTTTGATGAAATTC
AAAAACCGATGTTGGATTTTATTCGTGTGTATATTTCCCTTGTGCTTTAC
CAACTCACTTGGAACAAGTCAGAATTTTCTCAGTTGCCTCATGAATGGCG
AGGGGGGGATTCTTTAAACTTATAAATTTAACCTAGTAAGTACTGTGCAG
TTTGGAACGTACCTCTGAAAACTACAAAATAAAGTAAATCCTGCTAATAA
CTTTTTTATGCTTGGAAAAAATTGATTAAAGAAGGTATGAGTCGATTGCG
GATGGCAAGTATGTAAGCCGAACTTCTTTATTTTAGCCACAACTCGACCA
TCCGTATGGGTATCTGCACACGCTGAAGGGATCTATCCACGGAGTCATCA
CAAAACATACGACGATCATTACCAGCCCGAAAGCAAAGAAGGTAACTATG
GGCAACAGTTATGTTACGATTGGGAAAAATCCGCCATGTTGCCTAGTGAC
GTCACTGATGTCCGCCACGTGGGCATTCGAATCGGGTTAGTACTTGGGCG
TGATGGTGGTTTTATACAGCAATCTTATTTACCGTTTTGGCTTGGTCTTG
GTGGAACGGTAGGCTCTGGTGATCAGAAATTCCCTTGGATTCATATTAAA
GACACTGCTAATATATTTGTCCATGCTATTGAGAATGATAACATGACTGG
CTTCTATAATGCTATTAGCCCTGGACAATGCAACTCTTCTGACTTTTCGC
GTGCTTTTGGTGCCGCCTTGAATCGACCTAGTTTTATGTGGGTACCTAGT
TTCGTGATTCAATTAATGACCGGGCGAGATCGTGCGCCATTTATATTGGA
AGGGTCACGAATTAAACCTACACGAACTTTGGAGTCTGGTTTTCAATTTG
AGTTCGAAGACATTGAACAAGCTATGGTTGATATTGTGAATACGAAATGA
GCTTTCTTCTAATTATTCTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTATTTCTGATTTG
TAAATCTTTTTTACCGAAAAAATAATTATTTGAGTGCACCGTGAACTCTT
TACAAGCGCCATCATTTAACCTAGTTTACTCAAATTTGACTCTAGTAGGT
ATTTTGTTGGAGAATTGAATTTATGTCCCGCTCGCTCATCTTTTCATTGA
ACAGGGGAAAATCGGAAATGATTCTTTGGATTCAAATTCAAAAATTCCCA
CTCCTTTACTTTTTGAAGAAACTGTTTTTTTTTGTTCATCACCACAAATT
TTCTGATACTCTTTCCCTAGAGAATTTGTGTAATTTTAAAGGTTTTCTCT
TTTTGTCATTTCACATGAAATACCTGCAAGTGCAATTACATCCAATTTGT
TTAGCTTTCTATAATCTCACCAATCATTTAGGACCTCGATTTTAAGTTTC
TTCTAATATCCAGTCGTCCACAAGTCGTCTCTCAAGGATTCTTAGAGATG
CATAAAGTTCAATGTTGACCTCGCTTTCAAACAAAATTTCAATCAACGTG
TTATGATTTTTTAGCAATGCAAGTTTTCTTTCGTCTGTGGAATCTGAAAT
TAGTGGAAAATATTTATCACGTTTTCCGAAAACATTATTTGTAATAAAGA
ATAGAAAATCCATAAATTTTATTTTGAAGAATAAATGATATGAACTAATA
GAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00006932TCONS_00006932Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000072supercontigsc0000072:323801..333003 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
SDR39U1PREDICTED: epimerase family protein SDR39U1 isoform X3 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
36.96	36.47	47.25	50.34	14.12	10.99	12.72	13.72	13.88	13.84	11.39	10.66	6.66	6.87	10.74	10.42	33.45	29.7	4.24	4.64	18.42	19.8	30.95	25.94	13.06	13.63	12.3	8.92	21.22	20.36