XLOC_004836 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_004836
Unique NameXLOC_004836
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000086:674847..696886-

Legend: gene
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>XLOC_004836 ID=XLOC_004836|Name=XLOC_004836|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=22040bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086:674847..696886- (Clytia hemisphaerica)
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GTGCCTGAACATGAATAGAATAGTAGGTTATGATCACTGACCTTTATATC CCTGGACCAAGCTATATCCGCCATCTTTGATCGAAGTTTTTTGGAAGTTG GTAACCGTAAAGAAGCCATTGTAGTGAAACTTTGCCTACCGACAAACGGC GCTACATCACTAGTGGGCGAGCGAAATAAGAACTAGCGCTCTCTCCGCGG GTACCAATTTCAAAAAAACTCCGATCATAATATTTTGCTTGGTCGGCATT GAGTAACTTGGTCTAGGGATATATGAAGGTCAGTGGTTATGATATACACC TTTCGACTTTTAAAGCGTGAGTAGACTGGGTTAAAGTGAAAAAAACGTCA AATGTGTCTGAAGTTGTATGTATCGTCGATGGATGTTTTTCTTGTGTGCC TTACTTAAAAGACGCCACAGGTGGTTTGCGTGATGGTGTGATTGGATCTT TATTTTAAAGGGGATGGCGTGGTCTTTGATTTTTAAAAACGTGATACGTT ATAGATGAAATGAAATGAAATTTAACCTTTGTTCACCAAATTTGGACCAA AAAGTGTCTAAAGGTTGTGTGTGAAATTGCTTCAATAGTTGATTTTTTTG CATAAAGATAAAGTAAGGTTTAACAAGGGATATCTTAATAACGGGTTTCA AAAAAGTTTTTTCATTCCTTCAACAGATCTTGGAATTCGATACAAATGAC GTCACACTTGTGGAAGAGAAGACCCAATTTTCACACCTTTCTCTAACCAA CCAATCATACGACGGCAAACAGAACAATGATTTCACCGAATCTAAAAAAT ATTTCAAATACTTCAGCAGTAAAAACATACGGTTAGCAGGTAAGTCTTTA TTAAGGCCGTCCTAATAAGCGGGCCCAAGGTTGTTAGTAAGTCTGCGACC GCAATCTGAGGCGACCCGACAGCTCCTCTTTCCATAGCTATCTACCCAAA GGTAGGGAGGGCGCCACTCTTTCTCTCTGGATTTCTCCACTTACCCTTGA TCCTTCTCTTAATTGCTGAGCATCAATCAGAGAGGCATGAAGTACCATTT TGAGAATCTTTGGTATGACCCGGCTGGGCAGCCGCGTGGTTGTTAATCTT TCGATTTTCTCCATCCCCCAGACCTTACTAGGATCCCCCGTCTATTAATT TTTGAAAGTATTTTCAGCTGTCAAAGGAAGAGTCCCTTATTTTGCTCTAT ATGACCAAGGTTTAGTCCTTATTCGTGGGGGCACATTTTCCAACCCCCCC TGTAATTTGGTCTCTCCTTTTATTTAATTTTTTTGAAGATTCTCCAACCC GGTTGTTAGGGCACTTGAGGGTAACATCGAAAAAATCTTCAATTTATGCA ATTTTCGGGTAAAAAGTTTTCCTTGAAGGTACATAAGTAAGTTAAGAACT AAGTATAAGAAAATCCGAAGGCTTCAAAAATTTTGGGAAAATTTTACGAA GAAAAAAAACGATCTTATAGTTCGCTATGTTTTATTTCTTTCATCTCTCA AAGTGAACGATATCATCCACCAAATGGTGAAAAATTGTAGTATTGACGTC ATCATCGACCATTTAATTGGCGAATGTATTGAGGATCACAGATGGAAACT ACAAACTATTTTCGTTTTGAATGAAGTCATCAAATCTAGCCAGCAATTAA AAGGTTAATACGTTTTTTATAACAACAACATAGAAAATAGTCTCTTTAAC TCGAACCTCTTTTACTCGAATGCCTCCTTAAGTTGAACAAGTTTTCTAGT GCCTTCAGTTAGCACGACCTTACTGGATATATCGAAATTCCCTTGACTTG GACAAATTTGTGTTCGAGTTATGGAGACTCCACTGGAGCTGTAGCTGTAT GAATTCTGACCCTTTTTTGTATGAGGTTCACATTTCAGAAATAGTTTTGA CTAAAATGATATAGATTTTTATTCCTTTTTCAGTATCTTGGTATAAAAAA GTAATTTTGGAAATTTCTTTTGGAATTTCAAAGAGGTTCGGTTGATAGAT GGAATTTCTGGAACTGGGACTGAAGAATAAGTTCGAATTATAGAAAATTG AATTAATTTAGGCTCGAATTAGCAAGTCACACTTTCTTTGTTATAAAGGG TGGCAGAAAAATAGTTTGACTAAGTAGGAATTTAACTATCATTTTCATCA ATATTATTTCATACTTCTCTGTTCAATCAAATTATGTTACATAGCTTTCT AAGGTTAACTAGACAACAAGAACACGTTAGATGAACTTAATTATACCCCT GTCTCGCCAGAACACATTATTTTTAGCTGATTGATTTTCGAAGTTCTGGT CAGAATAAATTAAAATTTCTAGCTGAAACATATGCTCTCAGAACACAACG GAAAAAAAGGTCGCCTCGCCGGCTGCTTTCGCGGACTGTTTCTCTGAAAA CCCCTCTGATTTTCGTTATCTGGAACAATTTTCAGAGTGATTTTCATATT TTACAGGAAAAAGTTGGGGGGGGGGCGAAAACCCTCTCTTTGAGGGTATT TCAGAGCTTTCGAATAATTTTGAGTTTCATTTTCGTAAAATTTCGTAAAA TTTCGAAAAATTGGATAAAAGTGGAAAGTTTCATCGAAATTGGAGAAACT TGATTTTTGGGTCATATTTTGCCCCAAAAGCCCAGATTTGCCCCCCTAAA CCCCCCTTTTTGAGGGTATTTCGGGACTTTTGAAGAATTTTAAGTTTCAT TTTCGTATTCTACATGAAAAATTGGATAAAGGTGGAAAGTTTCATCGAAA TTGGAGAAACTTCATTTTTGGGTCATTTTTTGCCCCAAAAGCCCAGATTT GCCCCCCTAAACCCCCCTTTTTGAGGGTATTTCGGGACTTTTGAAGAATT TTAAGTTTCATTTTCGTATTCTACATGAAAAATTGGATAAAGGTGGAAAG TTTCATCGAAATTGGAGAAACTTCATTTTTGGGTCATTTTTTGCCCCAAA AGCCCAGAATTGGGCCCAAAATCCCCAATATTTTACCCCCTATAAGACCC AAATACACAAAAAACAATATTGCCATTCAATTCTACACCATTTAATTGTG TTATATCCGTAATTTCATTAGAGTTGGACAACATCGACTTTTTTTTTGCT TTTTTGCCCTGGGGACACTCATCGGGGACGCAAAGTCTTAAAGGGTTAAT GTTTTAATTATAATTCCTAGACTGGATTCATTACCAGTATCTCAAATCCA AATTTGAGAGTAATTGGTGTAATATTTACTTATTATAAATATCTTTGTGC CATTTCCTACTTTTAGATTTCAACGCTGAGCCTTACATCGACCAAATCTC TTCCATTTATTTACAAGACCACTTATGGAGGGTTCCCATCTCAAACCAGT ACCTTCAATTTATCGAAACTCGACAAGAACAAAAAGATGAGGCTAAAAAC TCTGTAACTTTTGAGAGTTTATCACTTACCGACATCGACAAGCCTCAAAA TGAACCCTTTTCGTATAAAAACAGCCTGACCTTACCCTTTGAAACCATTA ATCATAACATTCAATTGATATGCTTACTGTTGGAAGGCTTTTCTACACAC TCGTATATTTTAAGGACCAACTATAACATACACCTTATCAAAACGCTATA TCCTATCCTGGAGAAGGTTGGGTCTACCAATGCAACTATCAACAAAACAG CTTTAAGAACTTTAAACAATCTTTCGATGTATTGTAACTATGATTCGCTA TCAGATTTGATCCTATTCAACTCTGATTATCTCATCAATGCAGTGACCCT CCAGTTCCGTCACATGATGATCGACTCCGCCGCGCCGGCTGTTTTAGCCG TCATCCTGAGACTCTGTGATAAAGACATTATGCCGATAGTATGTGATTCT GCCGCTGACGTGTTTCGTCTACTTGATGAATACCAAGAAGAAATTGCTAT TCAAATGTTGGAGGTTTTAAAGCAGTTTGCTTTAGCTGTCAACAAATGGT TTTGCTCTGAGCAAAATGAAACTGGTTCAAATGTGGACTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008636TCONS_00008636Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008636-proteinTCONS_00008636-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000086supercontigsc0000086:674847..696886 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
10.25 9.24 13.48 12.9 4.53 3.47 4.95 5.6 2.85 2.62 2.9 2.13 2.49 2.44 4.11 4.95 3.99 4.55 1.37 1.47 4 3.94 12.34 10.02 4.8 6.65 1.53 1.47 8.86 10.06