TCONS_00008636 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00008636
Unique Name	TCONS_00008636
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2394

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000086:674847..696886-
coding sequence from alignment at sc0000086:674847..696886-

transcript sequence

>TCONS_00008636 ID=TCONS_00008636|Name=TCONS_00008636|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2394bp
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gccAATCTGTGTTCCTTTGGTGAAAAACCCGTCTTATGGAAACTTGCAGC
GGTTTATTGAAGCAATCACATTTTTAGATAATGACTGCATCGGTGAAGAG
TCGTTATTTGAGTATGCTTTGTTTCCGTTCAAACTAACTTTCCGGCAAGC
AAAACTATGTGGGAACGAAGAGATTTTATTCTTCCAATGTTTATCAGCTT
TGTGCTGTAAAGCAGCTGATAAATCGATTGGAGTTGAAACTGTGATATGG
ATGCTGAATACATTCTCAATTTACTTCACGCCAAAACAAATGTGGGATGG
CAATGTCACAGTTGACAATATTCTAGCCTCGAAATCACTGGTAAAATCAG
AAGAGCATATAATAGCAGCATTAGAAATGATCAAACAACTATTGAATAAA
ACAAATCTTGAAGTTCTGCAAACCATTTACAATAAAGAGGATAATTTACC
GCTCCTTGGTCATGTGTTGtcgattattttgaaatttctagaGAAACAAA
GAAATAAAGAGTTATTGGTGACAGCTCTTGATGACATTCAACTTCTAAGT
GGTGGCAAGTTTACCACTTCATCCCTTGCTAATACTGTTGCATCATACAT
TCTTCACCTCAAATACTAACCAATCAACAAAATTATTGATCCCAGCTTTG
CAAATGTTTGGTAAAGTTACTAGCTTGGTATTGAATGATAATGACTTGCC
AAAACCTCCAAAACTGTCTTTGGATAATATACAGCAATTGCTTTTGGTCA
AAGTTGATGATACCAACGATGCAGATTCCTTAAATAAATCCAGCAAAGAC
GAAGACTCTCAAAGTATACAAAAACAACGCGATAAAAATTGGTACAAAAC
AACTTCAGCACACGTCAAAACTATTTTACAAAACGTTCTTCCAGTGTTGA
TATTACATAACAACCCCAAAACAAGGTTAGCATTGGTTGATTTTGTTGGA
ACACTGCTGAACAAATGTTTATTGGCATTGAAAGATTCGATACCCATTCT
TATGGATTCGCTTGCCAAATTTCTTAGTGATGATATAGATGAAGTGAAAA
TGAAGAGTCAACATTTGTTGGAACAAGTCAAAGATGATTTCAAAACTAAA
GGTAGCCTTGATATGACTGGTATTCTACAAAACAAACTCCATTCCATGTT
TCTATCTCTGCCACGGATAATGCATTCTGGGAACGATGACGTCAAAGAAG
CCCATCTGAACATCATCAAAGGATATTTAATAATCTTTGGTGACTCATTC
GAAGATTTCTTATCGTCCTCCTCGCACTTGAAAACATTCTTCTCTGCTCT
GCTGCAGATCTTGGAATTCGATacaaatgacgtcacacttgTGGAAGAGA
AGACCCAATTTTCACACCTTTCTCTAACCAACCAATCATACGACGGCAAA
CAGAACAATGATTTCACCGaatctaaaaaatatttcaaatacttCAGCAG
TAAAAACATACGGTTAGCAGtgaacgatatcatccaccaaaTGGTGAAAA
ATTGTAGTATTGACGTCATCATCGACCATTTAATTGGCGAATGTATTGAG
GATCACAGATGGAAACTACAAACTATTTTCGTTTTGAATGAAGTCATCAA
ATCTAGCCAGCAATTAAAAGATTTCAACGCTGAGCCTTACATCGACCAAA
TCTCTTCCATTTATTTACAAGACCACTTATGGAGGGTTCCCATCTCAAAC
CAGTACCTTCAATTTATCGAAACTCGACAAGAACAAAAAGATGAGGCTAA
AAACTCTGTAACTTTTGAGAGTTTATCACTTACCGACATCGACAAGCCTC
AAAATGAACCCTTTTCGTATAAAAACAGCCTGACCTTACCCTTTGAAACC
ATTAATCATAACATTCAATTGATATGCTTACTGTTGGAAGGCTTTTCTAC
ACACTCGTATATTTTAAGGACCAACTATAACATACACCTTATCAAAACGC
TATATCCTATCCTGGAGAAGGTTGGGTCTACCAATGCAACTATCAACAAA
ACAGCTTTAAGAACTTTAAACAATCTTTCGATGTATTGTAACTATGATTC
GCTATCAGATTTGATCCTATTCAACTCTGATTATCTCATCAATGCAGTGA
CCCTCCAGTTCCGTCACATGATGATCGACTCCGCCGCGCCGGCTGTTTTA
GCCGTCATCCTGAGACTCTGTGATAAAGACATTATGCCGATAGTATGTGA
TTCTGCCGCTGACGTGTTTCGTCTACTTGATGAATACCAAGAAGAAATTG
CTATTCAAATGTTGGAGGTTTTAAAGCAGTTTGCTTTAGCTGTCAACAAA
TGGTTTTGCTCTGAGCAAAATGAAACTGGTTCAAATGTGGACTC

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00008636-protein

>TCONS_00008636-protein ID=TCONS_00008636-protein|Name=TCONS_00008636-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=563bp
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DSQSIQKQRDKNWYKTTSAHVKTILQNVLPVLILHNNPKTRLALVDFVGT
LLNKCLLALKDSIPILMDSLAKFLSDDIDEVKMKSQHLLEQVKDDFKTKG
SLDMTGILQNKLHSMFLSLPRIMHSGNDDVKEAHLNIIKGYLIIFGDSFE
DFLSSSSHLKTFFSALLQILEFDTNDVTLVEEKTQFSHLSLTNQSYDGKQ
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FCSEQNETGSNVD

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000086:674847..696886-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

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>TCONS_00008636 ID=TCONS_00008636|Name=TCONS_00008636|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=22040bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086:674847..696886- (Clytia hemisphaerica)
ATTATAGAGTTAAAGATAATGCAATCATCAACAATATTTCAAAAATTGAA
GCCAATCTGTGTTCCTTTGGTGAAAAACCCGTCTTATGGAAACTTGCAGC
GGTTTATTGAAGCAATCACATTTTTAGATAATGACTGCATCGGTGAAGAG
TCGTTATTTGAGTATGCTTTGTTTCCGTTCAAACTAACTTTCCGGCAAGC
AAAACTATGTGGGAACGAAGAGATTTTATTCTTCCAATGTTTATCAGCTT
TGTGCTGTAAAGCAGCTGATAAATCGATTGGAGTTGAAACTGTGATATGG
ATGCTGAATACATTCTCAATTTACTTCACGCCAAAACAAATGTGGGATGG
CAATGTCACAGTTGACAATATTCTAGCCTCGAAATCACTGGTAAAATCAG
AAGAGCATATAATAGCAGCATTAGAAATGATCAAACAACTATTGAATAAA
ACAAATCTTGAAGTTCTGCAAACCATTTACAATAAAGAGGATAATTTACC
GCTCCTTGGTCATGTGTTGTCGATTATTTTGAAATTTCTAGAGAAACAAA
GAAATAAAGAGTTATTGGTGACAGCTCTTGATGACATTCAACTTCTAAGT
GGTGGCAAGTTTACCACTTCATCCCTTGCTAATACTGTTGCATCATACAT
TCTTCACCTCAAATACTAACCAATCAACAAAATTATTGATCCCAGCTTTG
CAAATGTTTGGTAAAGTTACTAGCTTGGTATTGAATGATAATGACTTGCC
AAAACCTCCAAAACTGTCTTTGGATAATATACAGCAATTGCTTTTGGTCA
AAGTTGATGATACCAACGATGCAGATTCCTTAAATAAATCCAGCAAAGAC
GAAGACTCTCAAAGTATACAAAAACAACGCGATAAAAATTGGTACAAAAC
AACTTCAGCACACGTCAAAACTATTTTACAAAACGTTCTTCCAGTGTTGA
TATTACATAACAACCCCAAAACAAGGTTAGCATTGGTTGATTTTGTTGGA
ACACTGCTGAACAAATGTTTATTGGCATTGAAAGATTCGATACCCATTCT
TATGGATTCGCTTGCCAAATTTCTTAGTGATGATATAGATGAAGTGAAAA
TGAAGAGTCAACATTTGTTGGAACAAGTCAAAGATGATTTCAAAACTAAA
GGTATTAGCTTTTGATGAAAAAGCCTGCTTTTTTAAATGATATTTTTTTT
ATTCTTTCTTTTGGGTTTGATATTGTTTATTCAGCACCAATTTAGCCTTA
ATTAAACTTATTAAACATATGTTTTAAGGTTATAATTGACAAAAGTTGCC
TTTAAATGATAAATAATAATAGGAAAACATCCACTCAACCACATACTGAT
TAGGAATTGCTTTGCAAAGGGTAAAAATATTCTGATAAGAACTAATTTCA
GAATTGAAACACCAATTTTTTAAAGAATGTTTCCTTCCGTTTTAAAAGCA
AGCTAGGTGTACAAATTTCAACATTATTGGTTTAGTTGTACAATCTATAC
CTATACACGTTTTATTAAACTAAGACAAAATCTTTGAATACCTCAGGTAT
ACCTCTTTGCATTTTAAGGCAAGCTTAGAAATTTTCTTAAAAAATGTTCT
TCTTTTCAGCATTTTGTATTGAGTATCTTAGTGCAATTATTTCAAAACAA
ATATTTCAAAAATCTCAAGCCCTAAAATGTGCTTGAATATTCTTAAATTT
TGGATCTGAAAGTCTAGCGTTCTTAAAGATGAAAAACGACATAGTTGTTT
GAATGTACTTCAATTTTTGGCCTCGAAGTCTGAAGTGTTCTTATAGTATG
TTAATTAAGAAAGTTGAAAATAATTTTCAACAATAACAAAGTGCTCTACC
AGAAGGAGCCTTGTATGTTACTTAAAAACACGTACTCTTTACCCGTTTTT
AGGTAGCCTTGATATGACTGGTATTCTACAAAACAAACTCCATTCCATGT
TTCTATCTCTGCCACGGATAATGCATTCTGGGAACGATGACGTCAAAGAA
GCCCATCTGAACATCATCAAAGGATATTTAATAATCTTTGGTGACTCATT
CGAAGATTTCTTATCGTCCTCCTCGCACTTGAAAACATTCTTCTCTGCTC
TGCTGCAGGTATTATTTACGTTAAGTTTTTTTCAATTATTCAATTTCAAA
GTCTGTCTAATGATTGGGCTAATTTGAAATTAGGAGTACCCTTCTACGTC
AAAGGGACGTAGCTTAATTCATGATATGCACCAATGGAGAGTCTTCTGAG
AACTTCTAAAATTTTCCACCCAATACGTCGCTTGAAAAATAGAAAAAGTG
ACGTATGGGGTGGAAATTTTTAAAAATTCTTGGAAGGCTCTCCAGTGGTG
CATATCATGAATTTGTAGGCCGTCATTGCAATGAAGTTTAAAATCGTCAA
GCTATCTGACGTTATTGAAAACTCTCAAGAGATCGTTTGAACAAAGAAAG
GTTTAATCATATTTATCGTATTTCCTTTTCTCTTAGCCATGCTTAAATAA
TCATTTTCTTCCGTACTTTTAAACATCGCATACTCAAAGAATTGTGTGAT
AATCTTTGCGCAAACACGTTGAGATGAATAGATGATAATATCATTGCCAG
GCTTCAATTTCAAAAATCATGAAAGCTATTCAAAGCAAGGAAATTCTGAC
TGGCTTAATTATATTTTTTCTGATCTCTCTTCAGCGTTTCGAAATAAGAT
GTGGTTCATTCCAAATACGCCGTGTTTTGTTTCAATTTTCAACTTTTTGT
GAAGCGAATTATGAGCGAAGCAGTTTTGTTATAGAGGGTGCACTACCGAT
CGAGAGAAAAATTGGAACCTGGGTAGATTCAATGTTTTATACTTATAGAC
CATACTGTCCAAAAATGTATGACAAGTGTTTGACTAAAAATATTGAGCGA
CCTTCAAAAATCAAACAAATTTCCATTTTCTACTACTGGATTTTATAACA
TGTTTGCACAAAAAAACCTGATCTAGTGATTGGATCGAGTGGATGCATGA
TTGTAAAATTTGGTATACATGTTGTTAATAAGATTATGGTAAAAGTCAAA
ATGTTTCAGAATGTCACAAAATGAGCTATTAGCAAAAAAGCAGGGCGGTG
GAAAACACCTTTAATAAACATAGCGTTAATGCATTATAACTCAATCAAAC
AAAAATTATGAATTTTTTTTTCCGAAAATAATGATATATTTCGAGNAAGT
GAAGCAGTTTTGCTATAGAGTGTGCACTACCGATCGAGAAAAAATTGGAA
CCTGGGTAGATTCGATGTTTTATACTTATAGACTATACTTTCCAAAAATG
TATGACAAGTGTTTGACTAAAAATATTGAGCGACCTTCTAAAAACTGGAT
TTTATAACAGGTCTGCACAAAAAAACCTAGTGATTGGATCGAGTGGATGC
ATCATTGTAAAATTTGGTATACATGTTGCTAATAAGATTATGGTAAAAGT
CAAAATGTTTCAGAATGTCACAAAATGAGCTATTAGCAAAAAAAGCAGCA
CGGCGGTGGAAAACACCTTTAATAAACATAGCGTTAATGCATTATAACTC
AATCAAACGAAAATTATGAATTTTTTTTTCCGAAAATAATGATATATTTC
GAGTATGAGTAGCAAGATAAAGTTTTCCTAACATTACAAAAAAATAAGTT
CTCAAACACCATTCCCCTTGAGAATTACAATATCAATGTCATGTCGTGAG
ATGAATTATTTTCCATAACGTTTGTTGTGAGGGTATGGACGTCCGTCAGG
TCCGTAAGGGTATCCGCCGTATGGGTAACCCCCTCCGTATGGATATCCAC
CTGGGTAATAAGGGCGACGTCTTCGGAAACCAAGTCGTCTTCGGAAACCG
TGTCGTCTTCGACGTCTTCGTCGGCGACGTCGCCAAAATAGCAATGGTTT
CGGATCGTTCAGGTCTGCTGTATTGAAATAATTTCAACAAATTTGTGAAG
TCAGATCTCACAATAATCAACAAATAAATTCTCTCGCAAAACTTGTGATG
GGCACCGATCAGTAAAAAGATCATCAGTATAATCACTTCCAAGAAAGAAG
AACGATGTAAGATTCAGATTCTATAGAAGACAAAAGCCAAGCTGATCCTT
AAGTTGTAATCTAAGTCTCATCTACGTAGAGAAAGCAAGTGAACATGTGA
AGAGGCCTGGAAACCAGGGAAAATAGAATAAGATATGAAACGGAGCAAAA
AACTCCATCAAGTGGATTATAGGATTTGCAACATACCTTCTTCATCTTTG
ATTTCGTCCAATGAGCTTTCATCTTGCTCCAAGATATCTTCTTCATCTTG
TGATGACGTCATCATGTCTTGTGATTGGTCGTCTTCTTCATCTTGTTGTT
GTTGATCGTCGAGAGCATTGTCTTGTTGTTCGCTCTCTTCGGTACCTGAA
CACAGAAATAGAAAAATTAAATTAAATAAGAAATATAATTATTACGACAA
ACATGATATATTCATTGTCTTCGCCTTGAAATGGTATCTGGTCTGTTAAC
GACAAGTTACAAAGATTCGACATTGTAAAACTTACAATGCACTGCGTAGA
CACAAAGTGCCAAAATCAGCAAAGCTTTCCAAATCTTCATTCTGTTGATT
GCCTTGCTTGCTTGAGCAAGTTGAATGATTTTCCAACTCAATAATTCTGA
CTTTTTATACTGCAATGAGACAAGGAAGTCTCGACTTTAATATGCAAATA
TAAGACTTCTCAGTGTCTCTCATTTCCGTACTACATGCCATTGGGAGGAT
ATACAAGAACTCATTTTAAAGATTACTAATTACTGCTTCCTTGTACAAAG
ATTTCATAATTTTATCACTTTGTAACGCTTAGCCTGAATATTCAAGCTGT
GAAATATTTTCTCTTTTGATATTTCTGCTATTTACAGCCTAGTCTACCTT
AAAAATGCTTGTAAATAATGGGAGCTTATTAAAAAATGTTTTTATAATGT
TAGCAAAACTTTTTTAGTCACTCATACTCGATATTATGTATCATTATTTT
CGAGCAAAAGATTTCTTCATAATTTTCTTTTGATTGAGCTACAATGACTT
ATACCCTATTATTATCAGGGCGATCTTTTCCATCACCCAGCTGTTTTTCT
TTCTGAAACATTTTGACTTTTACCATAATCTTATTAACAACATGTATATC
AAATTTTACAATCATGCATCCACTCGATCAAATCACTAGATCAGGTTTTT
TTGTGCAGACCTGTTATAAAATCCAGTTTTTTGAAGGTCGCTCAATATTT
TTAGTCAAACATTTGTCATACATTTTTGGAAAGCATAGTCAATAAAAAAT
CGAATCTACTCATTTTTTTCTCGATCGGTAGTGTATTTTACAGACCAAAT
TAAAAATTGGTGAAAATCACTAAAACATCTGAAAAATGTATTGGACGTAG
ACAAAATTTTTCACCCATGTAAAGGCTAATAAAGTACACAAGTTTGCAAA
TTTTATTCCCATACCTCAAACGGAGACTATTTTACGGACCAAAATCAAAA
TATACGTTTTTAGTCTGTAAAATCGCCATTTTTCAAAAATTTTCTTTTTA
ATTTTAGAATTCACAATGTAAATCTTAATTTTAGAATTCAAAAGAAAATC
ATAATTTGTAACTTTTGTGAAAATTTGGCATAATTTGCTTCATTAGATCA
AAAATTTTGAGTCGCTCGGTCTAAATTATATTTCCAGATAATTAAAAATG
GAAAGAAATGATTGATCTGGAAAAGTATTAAATTGTGAGCCACAAACACT
CAAAGAAAAGTACCTCCATATCATTTTGACGTCAAATCTTGTCTACATCG
TACTGACGTAGACAGGCTACAGTTTTTCTTCTTTGTGAATTCGAGTAAAA
GAACTGTTTGTTATCATACATTTTTTTAGCTCGAAGCTTCACGCTCTTCG
ACATGATATCAATCATTTTGATTTTGTTTTGACTTTAGAAAACGAGATAT
TTTTCTAGCCCTCATTCCCTTGCATTTTTCGCATGCGTCACTTTTTTGGT
CATAAAAATATTCTCCAGGCTTATCTATTTCGCAAAACATTGTACTTTCG
TCTTGGCTAAACCTATAAAATATGTTACGAGACCCCGGTGCTGAGCCCCC
TGCCTGCTACTGCTACAGTTTCTTCATTGTTACGCGTAAAGATGAAGTTG
TGTGTACAATCCAAAATTGGTATGCCTGTTCATCGGTCAATCTTTTTACT
GTTCAAAAGGTGGCAAAAAAGCTTTTCGAGATAGAGGGAATTTAAAGCAT
AGTTTTTAAAGCACTTGTTATATATTTAGCTATTTTTGTTATTTTGTTAT
TTAAGACCAACCAGTTCTACTGTGTTTTGACTTCAAATCTTGTCTTGATC
GTACTGACGTCGCTATGTTTTTGAACTTCAAGCGGCTGTATTTCTTTGTG
TGTTTTAGTCAGAGAGTTGTTGTAGTACATTTTTTTTGCTCAGAATTGAT
CTTTCAAATGATGATTTTCGTTTATTTTAACTTTTAAAAATAAACTATTT
CTCTACCTCTTATTTTCCCTTGCAGTTTTGCCTATGGCGTCACTATTTTT
GTCATAAAAAGTTTTCCCGGGCCAAATCTGTGTCCTCCCTCAAAAATATC
TTTTAATATACTGTTTTTTAGAATAGACTAAAATGGAGGTCGTAAAAAGG
ATGTCACGGGACCCCAGGCTTGGCCCCCTACTATGAGAAAAGAAGTTGTT
GCATATTTTTGGAAAGCTCTCAAAAAATTAAAAAACCCCCCTACCATTTT
CAGAACTTCGAAAATGACGGCTTGTTGTTCCGACTATATGATTAACATTC
TGCTTGCTTTCATTCACCATTTATTTTTCCATCGGTGCACTGAATAATGT
ATCTTGGTTTATCTATATATTGTGTTAAAACGTGTTCTAATTATATTATA
GATATTTACATAATCATCTGATTATTGATGTGATAAATATTCTGACAGTT
CCTTAAGACAAGGAAGTTTTAATCACCTTTATGGTATTTTCCTTGTCTCT
TTTCCGTGCTTCAAGCTTCCCTTCGTCCTAAAATAAATCACATTCTATTC
TAAATTCCAATTTCAATTTTCGTTAACCATTGCACAAAAATGAAACTTGA
CATCGGATGCAATTAAAATCCTGAGAGCTAATTATAACAAGGAAATTTCG
ATCAGGATTATTATATTTCCTCTAATTGTTATCTGCGTTATTTTACTAAT
TGCCTGCTTAGGGGTAAGTTTTGTTTCTTCTTCGTCGAGCTTTGTCTATA
TCACTGTATTTCAGGGATGAAAGAAATTCGACTCAGTTAGAGGGAAGGAG
CACATTGGATTGCTAGTCATTTAAACTTTGCTGGTGATAAGCTTATTCAA
TTCTTAAAATTCTTTGCACAAATATGTGTCACAGACCCTCGAATGTGATT
GGGCCCGATTTTTGAGAAACAAATTCTGGTAGATTTCAGCCAGAAAACGG
CTAAAAAAAGGATGTTTGGGCTTTGTGAAAAATTGCATAGTTCACTTTTT
CTGATTCTTTCCAAAAAATAGGGATATACCATTATAGGTAGAAGGCTGAC
GCAGATTTTTGAAATCAAAATTTTCGCGGCTCAACACATGAATCTTTAGC
TATAAGAATCATCATTTTTAAGCATAGGTAAATGTTCTTCATCCTAGTCA
CGCAATTCTTTACTAACTAAACACATGGTCTCAGCTTGTGAAGTTGCCAT
TTTGGATAACATTTATATTTGCGCATGAGATTTGGGTTGATAAATATTTG
ATAAGCTTTTAAAGAAAAGTAACAAGTAAAGGGGAACCCTAAATATAACC
GGAACCCGACTTAAGGAACAAATTTTGGGTCCTAATAATCGCTGAGATAA
ATTTGTCTCGAAAATTATTTTTAAGTCCAAAATTAATCTCTGGCAAAAAG
GCCCCAAAAATTCACAATGTATTTGAAAATATATTTGATTACCAAATTGA
GAATCGATTTGAATCCTTCCCAAAGTTTTGTAAAGTTCAATTAAAGNGAA
TTACTAAATCTTTTGAGAATCGATTTGAATCCTTCCCAAAGTTTTGTAAA
GTTCAATTAAAGTCTGTTCCAAAAAATAGCATCCACACATTTTGATTTTA
ATACATTGCTCTTGAAGGAGAAAACATAAAATGTAATAAAGTAATACCTC
GTTGAAAAACTAATTTTAAGCGGATGATTCTAAGCCTTCAAAATTCGAAA
TCACTAATAGACCAGCTCCTGGAGTGCGGGGTAGCACCACCTAGAGGCGT
CCTAAATTACAATACGATTTTCGTGTTGCTTAACATCTTTAGTTTATGGA
ATGGAAAGGTAAATAGCGTTTAAAGGGGGCTTTTGGTCTCCAGAGGGTCT
GAAGTAGGGGGTCCTTAAGCGCCAGTGTAAGGAATTACGATGGAATAGCC
GTTTTCCTGTCAACAACATCATCCTATATCTTTTGAACTAGCCAAGGAAA
TGACTTGAAATTTTGCAGAAATACTCAAATTAAGTAGTACAACTATTTGA
AAAAAATATTTTCAAAAAAAATTTTCCAGGGGTTTGCCTGAAGAAAAATA
GGCAAAAAACAGCCATTTTTACCTATTTTTGGCCTGTTTTGACCATTTGA
ACCAAATTGAAAACTTCAAAATGTTAAAAAACTCCATAAAAAATATGGAT
AACGTTGGACTTTATCAAAATCATGAAAAGATTTCAGTTTATGACGTCGT
TATTGGCACTTTTTAGGGTTTCAGGGGGTAAAAATTGCTATTTTTCCTCA
TTTTTCACCTATTTTGATCATTTAAACCCATTGAGGGGCACATAAAATAC
TCAAAAAGTGTTCAAATATAGAAAACGTTCGACTCTATCAAAACCATGAA
ATAATTTCAGTTTGTGACGTCATCATTGGCCCTTTTTAGGGTTTCAGGGG
GTAAAAATTGCTATTTTTCCTCATTTTTCACCTATTTTGATCATTTAAAC
CCATTGAGGGGCACATAAAATACTCAAAAAGTGTTCAAATATAGAAAACG
TTCGAATCTATCAAAACCATGAAATAATTTCAGTTTGTGACGTCATCATT
TCGTCATCAAAATCGTCAACCTTTTAGGGTTTCAGGGAGTAAAAATTGCT
ATTTTTGCTCATTTTTCACCTATTTTGATTATTTAAACCCATTGAGGAGC
ACATAAATCGTCAAAAAGTGTTCAAATAAGTGGAAGATTTTGGACTTCAT
CTATATCATGAAAAGGTTCAGTTTGTAACGTCATCACAAGCATTTCAGGG
GGTAAAAATTGCTGTTTTTGTCTATGATTAACAATCCATATAGAAATAAC
TAACAAAAATAACAAGAAGGATGGTACTAATTAATCTAAAATTCATCGTC
ATCATCGTCAGATGGTTCATAACTGTCCTCCTCAGGGTTGTCACATCTTC
TGTGTATACTTCATGAAGGAGTATTTTCTAGACATCATTTGGAAATACTT
CGTCTACCCATTTAATACTACCATCCTCATTCCAACCATGAAAGGCGATA
TCTGGATAATCTTTCATATTCTCCAACGAACATTTCCATACTTTAGCCAC
ATAGTCAGCTCTTAGTATGTGGAGCTTGAGAACAGATTTGCAGGGTGGTA
AGTTTGCTAGGTCGACAATTTTTCCTTTTTTTATTTCTTTTCGAAGATCT
TCTTTCACACGTTGTTAATATTTGATTCCTTGTAACATTATACAGCTTAC
ATACGAAACTTTCAAGTTGGTCGCCGACATCCTCCAATAAAGACCAGCTT
TCACCGAGTGCTGCAAAAGCGTCAAGAAACTCGCTGTTTTCTTTTATCAC
ATTGAAACATGTTGCCTTGCCCTTTCGGAAAAACGACGGGACATAGTCAT
TCCCCGTAAAAGAATGGAATCCGAACTTTTGATTGGTTGAGAGATGGGGA
TCTTGTTGAGATTAATCGTATTGCAGTTTTTCCCAACTCCATAATCCAAA
CACAATCTCGGAGATGAAGATACAAGGGCAACGGCGATTACAAATATATC
TGTATCACCGGAAGATGACCGAATCAGGACGGAGCCCTTTGTCGATTTGA
TAGCATCGTGAGCAAGCATGACTACCTAGAAATATGAAAAATAACTTTAT
CTAATCTAGTTTAAAGTCCTCTTTTTCACCCTATACGTTTGCTTTTCTAA
CCACGATGATATATGACATTCAAATTTAGTTAAAGTAGTAGCAGTAGTAC
CTTTGTGTCTGCTTCTTCCTGGTTTGAGGACAAGTGTGTAGCTAACGACG
GTGGTGAATTTTTTTTCATCTTGTAAGTAGAATTTTCCTTAGAGAAGTAA
ATCGTGGAACATTTCATTGAGTTGCAAGCCGTCTTGCTNGTGACCGAATC
AGGACGGAAACCTTTGTCGATTTGATAGCATCGTGATCATGCATGACTAC
CTAGAAATATGAAAAATAACTTTATCTAATCTAGTTTAAAGTCCCCTTTT
TCACCCTATACGTTTGCTTTTCTAACCACGATGATATATGATATTCAAAT
TTAGTAAAAGTAGTAGTAGTAGAAGTACCTTTGTGTCTGCTTCTTCCTGG
TTTGAGGACAAGTGTGTAGTTAACGACGGTGGTGAATTTTTTTTCATCTT
GTAAGTAGAATTTTCCTTAGAGAAGTAAATCGTGGAACATTTCATTGAGT
TGCAAGCCGTTTTGCTGTTGTCTTGAATGTGCTGAATGTTTTGTTTTCGC
CATTTTTCAAAAAGTTGTTGAAATTGCTTGCTATTCTTGTTTTTGACGAC
TTGTACGTGTCTGCGACTATGTCAACTCGTTTAAAATTCTTCGGAAAAGT
GGCTAATAATTTGTTGAATAAATCTTCCTACGTTTCGGGGATGGGACTAA
AAGATCGAATAGCTGTCATTAGATCGACAATGTAAGTTAAATCAGGCTTC
GGGTTGTTGTTTTGCTTCGGATCGTCGTGAGTAATCTTGTATTGGGCAAA
AATCGCTTCTACAAGCTTACTTTTGTTGGATTTTCTCCGTATACCATCAG
CCGAGCAAATACTCAGTGGGACAGGCGACAATGGATAAGTAAGAGCAGTA
TCCCAATCAATAGCTTTTTCATACTTCGCAGAGAAGGAAAGAAGTGATCC
AATGATGTCACTGTTGTTGATTTGTCATCTTTTTTTGACTTCTCGAGTTG
CTGAAGCTGTTTTGAATGACTTGATTTTGTTCCTGGTAATTGGGTCGTGA
AACTTGGGGTCTTTTTTCTTCTTGGATTTCTTTTGGTTCGGCTCAGTTTC
TTCTGCTTCGCTGACATCTTGACCAGATTCCACGGAGCTCTCATCTGATT
CTTCTTCATTATCTGTATGTGCTTCTTTTGATGAATTTTCGGTCGATAAT
ATCAAAGTAAATTTCTTGTAACAGGTGTCATTTGAACTCCATGATTTTCT
GCTATTATTTCAGGTATACTGTCACACTGAGCTTTATGGTGGTTTTCGCC
TTTCAACTCCTCTCTTTTTGACTTTGCCTCCAAAATACGTTTCTCATTCT
GTTCATTAACTGTTTTTATTTCTGAATATTCACCCAAACCACTGTAATGT
ACTATGCATTTTCTTTTCTTTCTATTATTCATTTTTACTTATCTAAAAAA
GAAATCACAAGAGTTAATACTCTATAACTTGAAAAATTTAAAATTATATT
CTTTTAAAACTGTTACACCATGGAATTCATCGAATTTAAGTCACTTCTAA
TTACTATCATCTGCATTTTGAATTATCAATCTTGAAACATCTCTGAAAAA
TCTGCAACAGTTAAAAACAAAAGTCTTCTTGATCGAAAAAAGCTCTCTGA
TTTGTTTTTGTGTGAATATTTTCGGCGGGAACTTATCGAATGTTTTTGTT
CCAATCCTACCTTCGGATTAGATTTTCGAATAAAAAGATTCAAAACTACA
TAGAAAAAAATACGGAAAAATCTCGGAACGCATGAAATATTACTCGTATT
GCACTCGAAGTCATGCGACATTTTCTTGGGCTTTTGAGCATTTATGGGCT
CTTCCATGAGTTTTTATGGTCGAAATAGTTGAAAAATAGACANGGGTCTT
TTTTCTTCTTGGATTTCTTTTGGTTCGACTCAGTTTCTTCTGCTTCGCTG
ACATCTTGACCAGATTCCACGGAGCTCTCATCTGATTCTTCTTCATTATC
TGTATGTGCTTCTTTTGATGAATTTTCGGTCGATAATATCAAAGTAAATT
TCTTGTAACAGTGTCATTTGAACTCCATGATTTTCTGCTATTACTTCAGG
TATACTGTCACACTGAGCTTTATGGTGGTTTTCGCCTTTCAACTCCTCTC
TTTTTGACTTTGCCTCCAAAATACGTTTCTCATTCTGTTCATTAACTGTT
TTTATTTCTGAGTATTCACCCAAACCACTGTAATGTACTATGCATTTTCT
TTTCTTTCTATTATTCATTTTTACTTATCTAAAAAAGAAATCACAAGAGT
TAATACTCTATAACTTGAAAAATTTAAAATTATATTCTTTTAAAACTGTT
ACACCATGGAATTCATCGAATTTAAGTCACTTCTAATTACTATCATCTGC
ATTTTGAATTATCAATCTTGAAACATCTCTGAAAAATCTGCAACAGTTAA
AAACAAAAGTCTTCTTGATCGAAAAAAGCTCTCTGATTTGTTTTTGTGTG
AATATTTTCGGCGGGAACTTATCGAATGTTTTTGTTCCAATCTAACGTTC
GGATAAGATTTTCGAATAAAAAGATTCAAAACTACATAGAAAAAAATACG
GAAAAATCTCGGAACGCATGAAATATTACTCGTATTGCACTCGAAGTCAT
GCGACTTTTTCTTGGGCTTTTGAGCATTTATGGGCTCTTCCATGAGTTTT
TATGGTCAAATAGTTGAAAAATAGACAAAAACAGCAATTTTTTTACCCCC
TGAAACCCTAAAAAGTGCCAATTATGACGTCACAAACTGAAATTATTTCA
TGGTTTTGATAGAGTCAAACGTTTTCTATATTTAAATGGAGTTTTTGACG
ATTTATGAGCACTTCAGTGGGTTTAAAAGATCAAAATAGGTGAAAAATGA
GCAAAAATAGCCATTTTTACCCCCTGAAACCCTAAAAAGGAGCAATGATG
ACGTCACAAACTGAAATTATTTCATGGTTTTGATAGAGTCCAATGTTTTC
TATATTTAAATGGAGTTTTTGACGATTTATGAGCACTTCAATGGGTTTAA
AAGATCAAAATAGGTGAAAAATGGGCAAAAATAGCCATTTTTACCCCCTG
AAACCCTAAAAAGTGCCAATAATGACGTCAGAAACTGAAATCTTTTCATG
ATTTTGATAGAGTCCAACGTTTTCCATATTTTTATATGGAGTTTTTTAAC
ATTTTGTAGTTTTCAATTTGGTTCAAATGGTCAAAACAGGTCAAAAATAG
GTAAAAATGGCTGTTTTTTTGCCTATTTTTCTTCAGGCAAACCGCCGGAA
ATTTTTTTTTGAAAATATTTTTTTTTCAAATAGTTGTACTACTTATTTTG
AGTATTTCTGCAAAATTTCAAGTCATTTCCTTGGCTAGTTCAAAAGATAT
AGGCTGATGTTGTTGACAGGAAAACGGCTTTTCCCTAGTAATTTCTTTCC
CCCGCGCNNNNNNNNNNNNNNNNACAGGAAAACGGCTTCTCCATAGTAAT
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CCGGGCCAGCCTACACCCATATAAACAGTTCCTAACAACCCTCTAGACTC
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AGCCCAGAATTGGGCCCAAAATCCCCAATATTTTACCCCCTATAAGACCC
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TTATATCCGTAATTTCATTAGAGTTGGACAACATCGACTTTTTTTTTGCT
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000086:674847..696886-

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GAGGGTTCCCATCTCAAACCAGTACCTTCAATTTATCGAAACTCGACAAG
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ACCGACATCGACAAGCCTCAAAATGAACCCTTTTCGTATAAAAACAGCCT
GACCTTACCCTTTGAAACCATTAATCATAACATTCAATTGATATGCTTAC
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GCAGTAAAAACATACGGTTAGCAGGTAGCCTTGATATGACTGGTATTCTA
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TGGGAACGATGACGTCAAAGAAGCCCATCTGAACATCATCAAAGGATATT
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GGTGACTCATTCGAAGATTTCTTATCGTCCTCCTCGCACTTGAAAACATT
CTTCTCTGCTCTGCTGCAGATGTTTGGTAAAGTTACTAGCTTGGTATTGA
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AAGACGAAGACTCTCAAAGTATACAAAAACAACGCGATAAAAATTGGTAC
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ATTCTTATGGATTCGCTTGCCAAATTTCTTAGTGATGATATAGATGAAGT
GAAAATGAAGAGTCAACATTTGTTGGAACAAGTCAAAGATGATTTCAAAA
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TATCGAAACTCGACAAGAACAAAAAGATGAGGCTAAAAACTCTGTAACTT
TTGAGAGTTTATCACTTACCGACATCGACAAGCCTCAAAATGAACCCTTT
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TCAATTGATATGCTTACTGTTGGAAGGCTTTTCTACACACTCGTATATTT
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TCCTATTCAACTCTGATTATCTCATCAATGCAGTGACCCTCCAGTTCCGT
CACATGATGATCGACTCCGCCGCGCCGGCTGTTTTAGCCGTCATCCTGAG
ACTCTGTGATAAAGACATTATGCCGATAGTATGTGATTCTGCCGCTGACG
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GCAAAATGAAACTGGTTCAAATGTGGACTGAACGATATCATCCACCAAAT
GGTGAAAAATTGTAGTATTGACGTCATCATCGACCATTTAATTGGCGAAT
GTATTGAGGATCACAGATGGAAACTACAAACTATTTTCGTTTTGAATGAA
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ACGTCACACTTGTGGAAGAGAAGACCCAATTTTCACACCTTTCTCTAACC
AACCAATCATACGACGGCAAACAGAACAATGATTTCACCGAATCTAAAAA
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ATATGACTGGTATTCTACAAAACAAACTCCATTCCATGTTTCTATCTCTG
CCACGGATAATGCATTCTGGGAACGATGACGTCAAAGAAGCCCATCTGAA
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TATCGTCCTCCTCGCACTTGAAAACATTCTTCTCTGCTCTGCTGCAGATG
TTTGGTAAAGTTACTAGCTTGGTATTGAATGATAATGACTTGCCAAAACC
TCCAAAACTGTCTTTGGATAATATACAGCAATTGCTTTTGGTCAAAGTTG
ATGATACCAACGATGCAGATTCCTTAAATAAATCCAGCAAAGACGAAGAC
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_004836	XLOC_004836	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
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Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000086	supercontig	sc0000086:674847..696886 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
10.2461	9.24098	13.4796	12.8976	4.53173	3.46626	4.95478	5.60246	2.84822	2.62216	2.9004	2.12955	2.49393	2.44419	4.11361	4.95479	3.98892	4.5484	1.37468	1.47106	3.9976	3.94142	12.3436	10.0159	4.80387	6.65327	1.52985	1.4746	8.86455	10.0642

Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR011989	ARM-like
IPR016024	ARM-type_fold

Vocabulary: **Molecular Function**
Term	Definition
GO:0005488	binding

GO Annotation

GO Assignments

This transcript is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
molecular_function	GO:0005488	binding

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00008636 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: TTI1 (TELO2-interacting protein 1 homolog OS=Homo sapiens GN=TTI1 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 164.851 bits (416), Expect = 1.013e-41
Identity = 148/587 (25.21%), Postives = 275/587 (46.85%), Query Frame = 2

Query:  650 FFTSNTNQSTKLLIPALQMFGKVTSLVLNDNDLPKPPKLSLDNIQQLLLVKVDDTNDADSLNKSSKDEDSQSIQKQRDKNWYKTTSAHVKTILQNVLPVLILHNNPKTRLALVDFVGTLLNKCLLALKDSIPILMDSLAKFLSDDIDEVKMKSQHLLEQVKDDFKTKGSLDMTGILQNKLHSMFLSLPRIMHSGNDDVKEAHLNIIKGYLIIFGDSFEDFLSSSSHLKTFFSALLQILEFDTNDVTLVEEKT------QFSHLSLTNQSYDGKQNNDFTEXXXXXXXXXXXNIRLAVNDIIHQMVKNCSIDVIIDHLIGECIEDHRWKLQTIFVLNEVIKSSQQLK---------DFNAEPYIDQISSIYLQDHLWRVPISNQYLQFIETRQEQKDEAKNSVTFESLSLTDIDKPQNEPFSYKNSLTLPFETI---NHNIQLICLLLEGFSTHSYILRTNYNIHLIKTLYPILEKVGSTNATINKTALRTLNNLSMYCNYDSLSDLILFNSDYLINAVTLQFRHMMIDSAAPAVLAVILRLCDKDIMPIVCDSAADVFRLLDEYQEEIAIQMLEVLKQFALAVNKWF 2356
              T +  Q   +++ +L++F K  S ++ D  L +  K+                       K + +     +   R+ +W K T   +  +++ ++  + +H + K RL LV+ V  LL KC  +L +    L+ +L   ++D+  E++ +   +L    D     G+  +  IL   LHS+  SLPR+M+S +D  K + L+++ GYL + G      L+S +HL+    AL+Q+LE D  D+ +VEE+         S  +   Q ++  Q   F        +F+ + I + +  +   +    ++ +++DH +    +   ++ Q   +LNE++  +  L+           N E   + ++SI L+++  +    N YL  +   + ++   +  +    L      +   +  S+  + + P  TI   N NI  IC+ LEG    +Y L  ++ + L+  LYP+LEK G     I++ A  T+ ++   C YDSL  LI  NSDYL+N ++L  RH+ +    P VL V+LR  D +++P+V D   DV   LD++ ++ A   + VL     A+ +WF
Sbjct:  220 LITGDFKQGHSIVVSSLKIFYKTVSFIMADEQLKRISKVQ---------------------AKPAVEHRVAELMVYREADWVKKTGDKLTILIKKIIECVSVHPHWKVRLELVELVEDLLLKCSQSLVECAGPLLKALVGLVNDESPEIQAQCNKVLRHFADQKVVVGNKALADILSESLHSLATSLPRLMNSQDDQGKFSTLSLLLGYLKLLGPKINFVLNSVAHLQRLSKALIQVLELDVADIKIVEERRWNSDDLNASPKTSATQPWNRIQRRYFR-------FFTDERIFMLLRQVCQLLGYYGNLYLLVDHFMELYHQSVVYRKQAAMILNELVTGAAGLEVEDLHEKHIKTNPEELREIVTSI-LEEYTSQ---ENWYL--VTCLETEEMGEELMMEHPGLQAITSGEHTCQVTSFL-AFSKPSPTICSMNSNIWQICIQLEGIGQFAYALGKDFCLLLMSALYPVLEKAGDQTLLISQVATSTMMDVCRACGYDSLQHLINQNSDYLVNGISLNLRHLALHPHTPKVLEVMLRNSDANLLPLVADVVQDVLATLDQFYDKRAASFVSVLHALMAALAQWF 771

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00008636 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00008636 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
TTI1	1.013e-41	25.21	TELO2-interacting protein 1 homolog OS=Homo sapien...	[more]

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TCONS_00008636 (transcript) - C. hemisphaerica