XLOC_005666 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_005666
Unique NameXLOC_005666
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000102:253248..279437-

Legend: transcript
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>XLOC_005666 ID=XLOC_005666|Name=XLOC_005666|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=26190bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000102:253248..279437- (Clytia hemisphaerica)
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GTCTTGTTTAATTGAGGTTCACACCTGATTGACGCACTCGATTTTGCAGG CTGTATAAACCATAGCAAATACGGTTCTAACGAATCTTAGACTTTTTCTC AATACAGGAGCGAGTATCTTTTATAAATGAGAGGCCAGTCATCGTCCACA ATCATTGCATTGCCTTATACAAGGAGCGATGGCCAAGTGATCAAAGGCGT CAGCGTCTTAAACCTGAGGTTCGCGGTTCGAATTCCAGCTCCTTCCAATG TTCTGTTCAGTTTATAGATAACCGAGCCGGCTAGCCGTGGACCCCGTGCA AACAATCGAAAGACTGACTGAAAGTCCTAGATTACTGGGCTATCCACGTA AAATATCGATTCTACAAACTGATTGTGCTCCCATAAGGTCTACTATTACT TTGGAATTTTTCGATGCAAAACAAAAGGGCAATGAAATTCTTTGGAATGC TTCCCGACTCGAACTAATAATAGTCTCTTCCTAAATTTACAATACAATAC CATCATAATCTCCTTTTTTTACATAGTTGACAGACACGGGTTATATCAAG ACCAACGATATTGATTACCATGATGCATATTTGCTCAGCATTTCTGAGCT TGTGGTTGAAATTCCTGAAAATGATTTGAAAATCTCGGGTGATATTGATG GCTCACCAGGAAAACCAATGGGTGGCTTCTCCATCGCAATGTCTAATGAT GGAGTCAAATATTCAACCAATGAATCAATTTTCATCGTCTACGATAGTAA ATGTTTGCAATGTAATGCCAATAACATTCCAATTTGTGTTCGAAAGGTAA GTGTTTAGATATTAGATTTTGTGAACAGACTATGGTCAAATCTGTTGGAT AGAGCCCTGTTAAATATAGATTTATCTCTTGAACCTCGGGCAGCAACCAA CTTAGATTGATACAGTCAGAATTGTTGCACCAATCAACATTCATAGGGTC 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AATCATTAAAATACATCATTGTAGGTAATGCTGGAGATGTTGGTGAAAGT ACCGATCTGGCACTCATCCTCGGCCCTGTTTTTGGAGTCGTTTTCTTGGT CCCCTTAATGATTGCTTTNTCATCCTCGGCCCTGTTTTTGGAGTCGTTTT CTTGGTTCCCTTAATGATTGCTTTATATTTGTGTTGTCGAAGCAAGAAAC AGAAACGTGTTATAAACGACCCTTCTAACATGAGAATGAAAAAGATGTCT TTGATTGTGGAAACTGTTGAAGGGACATCCGCTTCTGGAAAAGTTACTCC AGTGGAAGGTATCGATAACAAAAGTATGAAAAAAGAGGATTAAGATATAT GGAAGATAACCAAACTTGTATGCAGTTTCTTCTAAGGAGATGTTTTGTGA AACTCAAATACTCATTTTACTTATGGAAGCTAGCCCTATTAGCCTGTGCT AGGAAAGAAAACTTTTATTTGTCTTCTTTGGCTATTCCAGAAAAAATTTG TACGCCCTTTATATTGAGGATGTCTTCTTGGGAAAGGCGATTACCCTGGA TTTTTGAAACTCGAAAACTATACCCCCTGGATTTTTTATTTCAGACATCA TATCTCCTCAACATAAGAGATACAAACTCTCGAGCAAACTCTTATAATTA ATAAATAATTCTTAAGTCCAGTCTCCACTGTTGCGCGAAATGGGCGACAG TTTTTTAACCTTTTTTGCCTAAAGAAAAGGTTACGTCATAAAAAGGTTTC GTGCGAACAAAAGAAAAGTTGAAGGAAGTTCTACTTTTTTCATCCGTTAC GTCAATTTCGGCCAGGAATTACTTTATTTTTTAACAGACCAAGGACCGTC AAAAAGTTTTCACTCATGTCGCGCGAAAGTGGAGACCGGCATTTAGACTT CTATAACACATCAATGTTTAACTCAATCATAATACCAACTCTACTCTGGA CACGACGCTCTGCTCTAAAGAGGTATAGTGAAAACGATGATTTAGCCTAC TTCTTATTCATTGAACACCCCAACTTTTAGCCTAAAAAACAAAAACCCTA ATAAGTGCTTAGAGCTCAAGTAAATGGTATTTTTTGTTATAATTGAAATA TTGCAATGAAATATTTTATATCTTATTGTCGTTATTTTCCGAGATTGTAA AAAATTATTTGACTGAATTTACTTGAGTCTATCCAGGCCTTTTGTCATGT ACCCCTTGGATATCGTCTTTTGCTCATTTTTCTAACCCAATGTATATCCT CTCTTGTTTATTTCCCAAACTCCCTGTATATCCTCTCTTGACTTTTTCAT TTCCCTACCCCCCTTAAGTCCTCTCTGGTTCATTTCCCTAACCCCCTGTA TAACCTCACTTGTTTATTTCCCTGAACCCTGTATTTCCTCTCTTATCTAT TTCTCTAACCCCCTGGATAATACCTTTCTTATGAGGTGTGACTCTCTGGA TATTCAGATAGCATTGTGCCCTTGGATTTGTGATATCTTCAAGGATATGT TTTGGAAAAGCCCAAATATTATACAAATATTCTGAGATAAGTAATAGACC TTAAAACTTCACAAAGCACAAATGTTTCTTGAATGAATTGTGATTAAATT TGATTTTCAAGAAGTTCTTCAAAGGAGATTATAAAGATTAAATGCTCTTG TAGGGCTCTACAGCAGCCGAAAAAATTTCCAGAGATTTAAAAATCATTCC CAAAATGTGATTTTCTTTGTTTCTGCTGTTCGAGATATTTTTATCAAAAG TATTCATTTACTAGTAAACAAAATTATAAAGAGAAAAGCAGCTTTAAATT AAAAAAAAACAAGAAAAAAATTGCAGGACGGCTACCTATTACCCAGGGAA AAGATATTAGAAGTTCCTGGAACAAGGTACGTTATAGCATTTTGCTTACT CATTTAAAGTCTAGTAATATTTTACTAATTCCACTGGTTTTAAAGTCTAG TCACCATTTTAGGATGATTTTTCGCAAAAAGTTAAGAATATCCATGATGA AATGAAAAAACACCATTCTTATAAAAAAGCGTGTATATTATCGATCCATT CTCCTCAGCCTATTTGATTTGATCTTTAAATGCTCTTCAGATTTTTTCGC AAGTTTTCATCATCTATAAGTCCCCTTATAAGTAACTTTTTTATTATCTT TTTCTGGACCTTTTGCACTCCTTTGACTAGCAGCTGTGAGCATTCATAGA TCATGACCCTTCGTTATTTCTTTCCAGGTGATACTCTGGACAACAAAAGA TGTGTCTAAACAGAGTAGGCAGTGAAGATAAAGCACAACAAAACAAGGAA AATGACACCGCAACCAGACAAGAACAACAACAGGCGCAGGAGGCTCACAA TATGGATGATACAACATCAATAAAAGATGAAATTCAACAAGAGTGTGTCT GTTGTAGCGGTGGCATAAACTATAGTTTACTACCCTCCAAGCTCTTCTAC TTCTTCTTCTTCGCTGGGAACGGATCACTGATACCTTACCTTGTTTTATT TTTCAAACAATTGGGTTTGAATCCAAGTCAAGTTGGTATTGTCAGTGGAT TAAAACCCTTTATTTCATTCCTGTTTTCACCATTATGGGGCTACATCGCG GACAAATCAAGACGTACGAAATTCATCTTTGTCATCTCGCTATTAGCTTA TATAGGAGGCTATTTTGCATACTCGTTGGCACCAGTTAAGAATCTGTGTA AAGCAAGGAACAGCACAACACATGGCTCAACCCACCACCCGTTCATGTTT CACATGCATAAACGAAGTGTTTTATCTCAAAATTATAATCACTATAAACT TCATCTTGAGCAGAAATCTTCATCATCGAAATCCAATATCAACAGAAAGT 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TATGTTGCTTTGATTTGCTATTCACTGAGACTCTTTTACTATGGATTGTT AACGAGCCCCTGGTATGTGTTGGCTGCGGAGCCCCTCTCTGGGGTAACCA CTGCTGCGGCTTGGGCTGCAATGACGTCATACGTTGGCATCAATGCAGCA CCAGAAAGCGTAACCACCATGCAAGGTTTGAATTTTAATTCTCATTCTGA TATGTATAAAAGGGTGAACATTTTGAGAAAGGGGGGTTCAATCAACACCT GTCTGACTCTGACAAATAACGCTGTTTCGCCATATATCTGACGTTATTTA GGCGTTGTAAATAAACACTATATAAACGTTGAAACAACGTTGCATGTCAT CAAGAAGTGGATAGTAGCTAAAAATTAACTAAATGTAAATGGGTATAGCA TGTAGNGTGGATAGTAGCTAAAAATTAACTAAATGTAAATGAGTATAGAA ATTAGCATGTAACGTATACAAGAATTCTATGTAATAGGATAATACTATCT CATCATCAACGATGCTGCGTATCGAAGCACTTGAGTACAGACGACGTTTC TACAGGACATTCACAGGGAGCCAGCTTTTGCTCACCTCGCGGGACTTCTT TACGTTAACTTGAATTAAACAAGGCATGAAAATACCATGAAAGGCACACA AACCTTTTTTCCAACATCGCCAGTTATCTACTCCTACTTTTGTTGTCTAA ACTAGAGAGAATTAACAGTGATAATGCAATGGTTTCTAATTGGCGTTTCT AATAAACTCGAATTCGAAAATTTTAGTGGACTGATTCAGGCACAGGAATA TCTTTGTCATCACACTAAATTTTATATAAGTGTTAAATACTAAAATGTAT ATTACAATTTTTCCCATAGGAATTCTTCACGGTATTCATTGGGGACTTGG TCACGGAATCGGTGAACTGATTGGAGGTTTTATGGTATCCAGTCTCGGAG CAGCTGCAACTTTCAACATTTTTGGCGTGCTGACACTACTTCATTTATTA ATCTTTTGGCTCATCAATAATTATGCATCACGAAAGAAGCGTCTTGCCGA GGATGAAGTAGAGGATGTTGCAAACAAGACGAACATTGTCGAATAGATTG ATGTTTAGGAACAATAAAGTTTACAATGATATTTTGGGGTTTTTAATGTT TTCTAGAATTTAAAGTCTGAACAAGTACAAAAAATCTAGTAGCATTTTTA CTTTTCCTCTGAATGTATTGAATGTCACATTTTCAAGGAAATAATCCCAG AGAACCGACAAATCTTAGGGATTGCAACCAAACTCAACATGTATCAGAAT CAGTCTAACATAAGTTACTCTACTATCCGCCTCTAAGTTTATAGTCCGAA TATTTTATAGTAAAAAAAGCTCAGCTAAACAGACCAGTAAACCTTATTTC TCAAGAATTTCATAAATTATCTCAATGAGCCATCACGAAGATTTTACATG AGAATTCTATCTGAATAGATAATGCAGAATTAGATGGAGC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00010111TCONS_00010111Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010110TCONS_00010110Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010109TCONS_00010109Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010108TCONS_00010108Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010107TCONS_00010107Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000102supercontigsc0000102:253248..279437 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.33 0.4 0.26 0.2 0.02 0.03 1.87 1.88 1.62 2.18 3.79 1.47 8.56 7.66 13.13 18.4 13.58 13.34 11.35 12.31 4.14 4.47 4.69 6.22 9.13 7.9 1.46 1.41 16.07 13.04