XLOC_006431 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_006431
Unique NameXLOC_006431
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000128:189859..200909-

Legend: gene
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>XLOC_006431 ID=XLOC_006431|Name=XLOC_006431|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11051bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000128:189859..200909- (Clytia hemisphaerica)
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TGAAAAAATGACTAATAATCAAACAAAAAAGGCACGAAACGGGAACAAGG TGAGAACCAAAGCTGTGACCGCCTAGAGGCCTGAGCACGAACGTGCGAAT GAAAATGAGGGCGAAACGAGTTTGAAAAAGACCATGAAACCTGGGCATGA ACATGCAATTGCAATGAAAAAAATGAAGGTCAGAAAATGAACTGAACTGA GCCAAAATGAAAACAAGGCAAGGCCAATGAAAAGGAAAAGGACTAAACGA GCCAGAGAGCCTGGGCACGAACATGCGTGAGTACAACGAAAGTCTAATGA AATGAATAAAATAAGTGAAAATCTAAGTTTTGAATAAATATTTTTGTAAA TTTTATGAATTTATAATATATATCTTTCTACAAATAAAAGTGAAATTTCA CTTTTGTCCCTAGGACAATGGAGCAAAATTGATTCGAATCGATTTTGCTC CATTGTCCCAGGGACAAAATCAGCGTGTCTTTTGGGTATTTCCCTCACTT TTTGTCCCATGAAACAAAAAAAGAAACCATGAGACACGCACTTTTTTTCT TGTGTTGGTGGGATGGAGCATGTTGTATTGCACCAACGCGAAAAAAAACT TCTCGTGTCCCCAAGCCTTTAAAGAACAACTTTGACTTGGTTTTCTTTCC AGAGATTATGATGGAATAGCTGACGGGAGAGACAATTGTCCATATTTCCC AAACGCAGCACAAGTTGACACTGATGGTGACAATATAGGTATGGCGCACA GCTTTTTTCGGGTTAAGGTGAAGTAAGTAAAGAAGCAATCTGATTGGCTG ATAAGAAACTGGTCATTCAGGCTAAAAATGTTCACGGGCTAGTTTCATCA TCAGGCTTGACTCTCTCAGCCTAGATTCGTCATTTTTTTATGGGAAAAAT AAATTCTAAAATAGTAAGACTGAATCTTGTGTTCTCTGTGTTCTTGTGTC CACCACGATGGAAAAAAGTAAATTCTAAAATAGTAAACCTGAATCTTGTG TTTTCTGTGTTCTTGTGTCCCCACGATGGGAAAAATAAATTCTAAAATAG TAAGACTGAATCTTGCGTTCTCTGTGTTCTTGTGTCCCCCACGATGCGAA AAATAAATTCTATAATAGTAAGACTGAATCTTGCGTTCTCTGTGTTCTTG TGTCCACACGATTGGAAAAATAGATTCTAAAATAGTAAGACTGAATCTTG TGTTCTCTGTGTTCTTGTGTCCACCACAATGGGAAAAGTAAATTCTAAAA TAATAAGGCTGAATGTTGTGTTCTCTGTGTTCTTGTGTCCACTGCAATGG GGAAAATAAATTTCAAAATAGTAAGACTGGATCTTGTGTTCTCTGTGTTC TTGTGTCCACTGCAATGGGAAAAATAAATTCTAAAATAGTAAACCTGAAT CGTTCTGTGTTCTTGTGTCCACTGCAATGGGGAAAATAAATTTCAAAATA GTAAGACTGAATCTTGCGTTCTCTGTGTTCTTGTGTCCACCACGATGGGA AAAATAAATTCTAAAATAGTAAGACTGAATCTTGTGTTCTCAGAACTCAA CCTCTTTCTGAACCAACAACACTTAAAAAATGAGATAGCAAAATCCGAAA TGAAAGAAATAAATCTCTAAATACTCATTCAATACAGCATGAAGACGATA AATAAAAAATATGGCGGTAAGGCGTTATGGCGGTATTCGGAAAAAGAATC GGCGGGAAAATTTCCAAGACTGGCAAACTCTGCCGGCTGTAAACTCTTTT CGGCAAAAAGCTTGTTTGCGAATTTTCTTCGGCTTTGGGTTTATTTCTTA TATGTATAGTGATTTGTCTTAGACTATAGCATAGTTTATACACTATGTCT CTGTAATAAACAACCAGCCAATTGGTTCCTCACATAAAGGTATGAAAGAG CCTTTTTTTTTTTTTTTCAATAATCCATTCTCTCTCTCATTTCAGGTGAT ACTTGCGATACAGATGATGATAACGATGGGTTTGTCGATCAAGCAGACAA TTGTCCCCTTATGCATAACTTATTACAATTTGATATCGATGGTGAGTGAG ACCCATTGAGTTTAAAGTACAAAGTGCTAGATGCGAATCTTCAAATTTTA TCTTTACCTTCCCTACCTTCGGGTAAAACAGATCAAGAAAAGGAGACCTT TTTGTCATCCTCAACTGCGGTCGCAAACTTACTTACTATAACTGTTGACT CTCTCTAACTCGATCTTCAAACGACCAAAAATTTCATTCAAATTAGAGAA AGTTTCGAATTACGAAAGTAATTTAAACCACTTCCAGCTAAGGGGACCAA TATTTCAATTTTAATTTCGAATTACAGAAAAATTCGAATAATAGAGATTC GAATTAGAAAGGGTTACGAGACTGTATTACCATTCCTTTTTAGATAACCA ACGTGGCGATGTCTGTGAGTATGATTACGATGATGATGGTTACGACAGTC GTGTGGATTCCTGTCCACTTAACAACGCTATCTGGAGGACGAGCTTCCTC AAGCATCGAACCATACTTCTTAATAATCCTCGAGAACCAGCAAATCTATT GTGGAAAATTCATGACAAGGTAGGTAACATTTTACGTGGAGTTGGATTCT TGGTAACGTGGTTCGTTATATATATAGTAGTGTCTTTTATGAATATTTTC AAATTTCGGATATTTGCGGCGGCTAGCAAAATGCTAGTGTACCGGGCTCA GAATCACTGACAAACTACTTTGATGGTTCGAGCCGGGGTCAAATCCACAG TTTTGAAAAATGTTCTATGTTGTGAGGCGTTCTGAGCATTTAGATACATG TCCATAGGGTGCAAGGGAAGGAAATATCCACAATATTCCTCCAAGAAATT 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CGAAATAATGGGCGAAACCCAGCCAATGAGAAGGTTTGACGAATTTTTAT TTTGTGATTTATCGGCTCACTTAGACACTCATATAGAGGTTTTGCCAGCT CTAAGCCCCATAGAATCACTGATGCTACACTTAATATTTAAAACTTATTT CAATGGTAGAAATAGTCATTTTGAGAATATGGTTGTTCTATTTAAGTTTT AGCAAGGTTTTTAAACACTTATAAATAACACAAATACCCATATTCAAAAT GTTGGTTTTTAACGAGTCACAATGAGAGAATTTTTTCTTATCAGGTTCTG AAATGGAGTTCGCCATTTGACTGGCAACCTGGAAGCTCTTATAATTTGAA AATACACAGAAGACCATTAACAAATCAGTTAAGGTATGAATGTTTCAATT ATATCACACATTTTCAGTAAAAAGAATTTCCAAAGCAAAACCTTCGAAGA GACAACTTTCATGGTTGGGATCCTTTATAAGCATACCTTTTTACCTGATA TTCTCTGGCGTCAGCAGGCCCAGCGGAAGCGGGGAGACTGGGGAGACTTC AGCCTTCTCAATGAGATTTTTTTTCTCAAATTCCTAGCGAGTTTTATCTC ATTATGAGCCTTCAGCCTCCCCAATTTTAAGGTGGTTCCGCCTGGCCTGG TCAGTCAGTAATGTTTAATAAAGCTCTGGATACACGTGGACGAGGCTGGA AATACGACAGCTCTTCTCTTCAGTCAACTTTCTCTTATTTGAACCTCTAT AATTCGATGTTTTTGTAATTCGAACTAAAACTTTGGTCCCTTCAGCTGAA AAAATGGTATATAATATACTCTCTGTAATTCGAATCTTTCTCTAATTCGA GGAAGACTTTGTGTCCCTTTAACATCGAATTAAAGAGACAACTGTATGTT TTTTTTCTTAAAGAATACAAGTCAAAGGCGTGGATGGTGGTGCAACAGTA GACAGTGGTGTTCTTGAAGTTGACCAACAGAAAGGTGGCAAGATTGGTTT GTACGCAACATATACCAAAAATGTGATCTGGAGTTCATTGACCATCGAAT GTAATGGTAAGAGGATGTCTCTAATTTTACTATTTGTACTAGTAATAACA TGGTTTGGAGGGTGATTTGGGAGTAATAGTCCCGAGGTTCATTGAAAATA TTTCAAAAAAGCATGAACGTAGTGAGGGCTATTTGAAATGTTTTCAATGA AACAAGGGGCTATTATTCCCAAAATCATCCGAACGACCATGTTATTTGTC CTGGTTAATTATTATGGATAAATTAAAATTCAGCCACTCCTCCCTTTTCC TTATTTTGTTCACATATTTTTTCAAAGTTCCTTTTTATTTTTGCCATTTA ATAGAAGCTTAAATGACTATTAACCAATGAAAATATTCGAATTGTACAAC TATGAAATCAATTAGTTTTTATCTTTCCTTCCTTTCCTTTCTCTTTTCGC GGGGTGATTACAGCAGGGCTATTACGGATTAATCACCCCACTCCTCCCTT ACATTTCTAAGCTAAATGTAATCAGCCATATAATTAGGGAATGTAAGCAC GAATATATAAAATTGATTGGGAAATACTTGATTATCACACAGTTCTTAAT TAGCTCCAGTGTTCTCAGTTCTTTCGTCTCGGACAGATTTCAGTCTCAGC GAATTATAAAGAGACTGTCCCGCTCTTAGAATTTGGTTAACTTCAGCAAA ATATTGAAAATCTTGGCTAATTTATTATGTTGATTCTATTTTCCGTCTGA TATGAAAAACCCTGCTTTGACCATTAGCTTGTATAGCTGACAAGAAAATG AAGTGAAGTGAAGTTCAAATTGAAGTTCAAGGTTTAGTAAACTCCATTTG ATTGGAACCTTTATTAATCAACGAATCTTTCTGCATCTCAAACTAAAATA TTTCGTAAAGTCAGTTTTGAATTTCGTCATAATTCCTTTTTTTATCCGTT AAATCGAATTATAGAGATTCAATCAATATGAAATGGTAGATTAGAAAATA CTTAACAAATAGGTGGCCACCACTGTAAAAGAATAATAAAATCGACTCTC TCACAGGGTCATAAACTCTCCTAGTTTAGACCAAAGTTTGAAAATTTGGC TGAAAATTGCGGAAAATAGTCTCTCTGAATTTTTGAAATTCAGTCTCTGA CAGGGTCGATTTTTCGAACTTTGGCTTGGACTTACCCGTCACCTAGTAAA CCTATTACCTCCTTGGTTAGACTACACCCATGCATTGCCCCTGTGATCAT TTTCTTTTAGCAGGGAAAATATTTTCCCTATTCATTTCTAATGGGATTAA AGTAGTTTTGAAATTCCTAATGAGAATGAGGTTTAAAAAGTACGTTCCCA CTATAAGATTTTATTTGTAGATAAATAGAAACGAAAGTCAATTCATGATA GATTTGGCACGAGTCAGAAGCCGAAGCCAAGAATCATGCATTTCAACCAT CACATTTATGCACTGAAAATCTTTCACTAATGCACATCCCACTGATTTCC ACATTCGATACAAAACAATATCGGTTTCCGTAAGACGCAATTTCATTCAT ACATTTATACACACGTTTTGGTATAATCATGTTTACAAGGACAAAACCTT ATTAAGAAAAGTTAGTGTTAAGTCAAGGGAGTTTAGGGTACACGTTTGTA TATCTACATTGTTTTGCCTATGTGAGAGTTTGACAGTTTATTCTCACAAG GGGCCGTCTACATAGTACTAACGCACTAAAATGTCGAAAATCGAGTACCC CTTCCCCCTGTACGAAAGCGTACGCAAATGGCTATACCCCCTGGTAAGTA CGTACTTTTTCATTCACCCCCCTCCTCGGTTGAAGAAAATTTCGCTTGGT TCGGNTAATAAAATCGACTCTCTCACAGGGTCATAAACTCTCCTAGTTTA GACCAAAGTTTGAAAATTTGGCTGAAAATTGCGGAAAATAGTCTCTCTGA ATTTTTGAAATTCAGTCTCTGACAGGGTCGATTTTTCGAACTTTGGCTTG GACTTACCCGTCACCTAGTAAACCTATTACCTCCTTGGTTAGACTACACC CATGCATTGCCCCTGTGATCATTTTCTTTTAGCAGGGAAAATATTTTCCC TATTCATTTCTAATGGGATTAAAGTAGTTTTGAAATTCCTAATGAGAATG AGGTTTAAAAAGTACGTTCCCACTATAAGATTTTATTTGTAGATAAATAG AAACGAAAGTCAATTCATGATAGATTTGGCACGAGTCAGAAGCCGAAGCC AAGAATCATGCATTTCAACCATCACATTTATGCACTGAAAATCTTTCACT AATGCACATCCCACTGATTTCCACATTCGATACAAAACAATATCGGTTTC CGTAAGACGCAATTTCATTCATACATTTATACACACGTTTTGGTATAATC ATGTTTACAAGGACAAAACCTTATTAAGAAAAGTTAGTGTTAAGTCAAGG GAGTTTAGGGTACACGTTTGTATATCTACATTGTTTTGCCTATGTGAGAG TTTGACAGTTTATTCTCACAAGGGGCCGTCTACATAGTACTAACGCACTA AAATGTCGAAAATCGAGTACCCCTTCCCCCTGTACGAAAGCGTACGCAAA TGGCTATACCCCCTGGTAAGTACGTACTTTTTCATTCACCCCCCTCCTCG GTTGAAGAAAATTTCGCTTGGTTCGGACCTTTATTTCATACATGAAACTC AATGTTTATTAAAAAAACTTTTTCTTTTTCTGCGTATAAGAAGCGTGAAA GTCGGCAAAAAAGGGCTATAAAAATTTTCTCTGCGTACGTACATTTTCCT TCGACCCCTCCTCTCCCCCTGTACGCAAGCATACGCTTTTGGGAAGACCC CCCCCCTTAGTGCGTACGTACTATGTGGACGGCCCCCAATCTCTGATGAG AGTTTTTGTTTAATCTACAAAGGAGTGTACAAATGAGAATGTTTTTACTA TTCACCTTCGAAGGTGGACCGAGACCTTCTTCGACTTTCTCATTATTACT TACATAGGAGGTAAAGATAATTCATTCATAATTTTAGAATCGAAAATTGA ATAAAAGAAGACCCTGGAAGAAGAATCTCTGCAACAGCACCAGACAGTTG TAAGGCATCATAATTACCACATCGTTTGCCTGCTCTCGCTACAGACAGAC GTACTTTGAAGGCATTTTAGAAAAATGTGGACTCCTAGGTAAAAAGGCGG AGTTTCATTTTATGTAAATATTGTATCATTTTTTAAAGAATTTCGAAACT TGTAACAAGATATAACTTTTCAAATTAGGAAAGATGAATCTAGATTCCAA GAATGATTCTGCGCATAAGACTAAACTTCACATTTGTTTTATGATCGGGC TCTTCGAGAAAATGTTCTTCAGCCAACAGTGGAGGATACATTGTCAAAGG G
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00011476TCONS_00011476Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00011475TCONS_00011475Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00011474TCONS_00011474Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00011476-proteinTCONS_00011476-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000128supercontigsc0000128:189859..200909 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.35 1.75 0.67 0.6 5.61 3.3 0.8 0.75 0.81 0.9 0.8 1.1 0.74 0.53 0.95 1.39 15.94 2.43 0.53 0.28 15.59 13.81 6.65 10.41 9.75 9.02 1.19 1.05 0.63 0.97