XLOC_006493 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_006493
Unique Name	XLOC_006493
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000130:504456..519973-

gene from alignment at sc0000130:504456..519973-

Legend: gene

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>XLOC_006493 ID=XLOC_006493|Name=XLOC_006493|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=15518bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130:504456..519973- (Clytia hemisphaerica)
GGTTTCTTCCTAGAAAGAATATGATATCTCTTTTTTATGCCTTAGTGAAC
TCACATCTGACATACGGTATAACTTCATGGGGTTCCCCTGTAACCAATGG
CTTGGGTAGAATTAATGAATCTNAGTTAATCATGCAATACTGCTAAAAAA
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TTGAACCTTGTGGAGCTTTTTATCCACATAACATATAGTATTTCTAAATT
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GTAAAATAACGTATATATTATGTTTTTCCTTGTAACCTATATTCCATAAT
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TTGAAATTGAAATTGAAAATTGAAGCTTACCTGTGACCGGCGCCGCCATC
TTTCAAAATGGAAGGTGATTTTCTCTTTGGAGCGGTACCCCCTGAATTTA
TTTCTTCTCTATATAAAAAGTCTACAATCCGGGGTTCAAAATGACTAGAA
ATATGATAGTTTGACCCCCGGTTTTTAAGTTAAAAGTTTTCTCAGCCGGG
TGCTCAAAAAGTTTCGGTCTCGTAAAGAAAGTATAGAAACGCATGAACAT
TCTTTTTAATCACTGACTCCTGAAGGTCAGCATGGTTAGTGAATCCTCTA
TTTCATATCCTTGTATCATTTCGCTTTATTACTTTATGTCATATGATAAT
CTTTGAAATCTGTGGAGACATTTTCATTGACAAATTTTTTTTGGAAACTG
TTGTACCTGATATGAAGAATTTGTTTAAAATTATTCTAGGGTTTCACCAA
GTTTGTAGAAGCCGGACGTGTGACACTTGTCAATGGAGGAAAATACGATG
GAAAACTTGTTGTCATCGCCAATGTAGTTAATCAGTCAAGAGTATGTATA
CAATTTGATTTACCTTTTATATTTTGTGTAACTGAAGGGGGCTTTTTCAG
ATGGGACTTCAGTTCTCTAAAGAAAACCTTCTGATTGCAACTTTAATATC
AATCCTTTAAAGGGACCCTCAATTTATTTCTTAAGCCTTACTAAGACTAA
GGCCTGGGTCACCAACAACTTGTGTTCGTGTCATTTACAGCCCCAAAATG
TGATTTGGTCGGTCGCTTCTTGGCATATCTTTAACCATCTGAAAAATGTG
CTCTCAATATAGGCAGTCGAGCTGTGTTAAAATCATCAACAAGATGCACT
CTGAGCAAAGGTTTGTTCAGGTGACAAGAATCATCTGTAATGCAATTATT
TTGCATATCGTCGCGACCGCTCAAAAAGCATTAGTGCCTTTTAACACAAA
AAATCTTCAGAAAATTGTGGATAGAAATCTTAAAAACACTCAATGATCAA
AACGCTGGCTATGCTGCATCTACAAAATTATTTTAATAATATCGCCCTTT
CCGACTAGAAAAGGGTCAGATTTTTAAGATAAAAAGTGAGTCGGTCGGAG
GACGCAAACACAACTTATTTGTCACCGTGGCCTAAGAATTTAAAAATTGG
TGAAGTGATTGCACAAATGTACTTCATGAAAGTTAAAGTGCCATAAATGA
AGTTTTCAAACAGCAGTTGATAAAAAAAACCTCTCTTCCCCCTTCCTCTT
CAAAACAGTTGAAATTGAACTAGATACTAGATGTGGCTGTTTCTGTTCGG
AGGTCAAATTAATAAAGCCTTTGTTAGAATACAATAGCTATTTATAAGAA
CGAAGGAAATGTTTGGTTTTTGTTCACTTTAGGCATGTTGAGTGACTTCA
AGATTGACCCCTTTCCCCGCCATTTTGTCAGTCTGGGAAATCCTCTCTTA
TGTTAGGGTGGTCAGAGGAAATTTCAAACTTACTTGCAGAATACCAAAAC
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CGGATAAAATATTTTGCCGTGCCGCGAACAAAAAGTTTGAAAAAACTCAC
CCGCGAGTACTCATTTTCAAATTTTGAAGGAACATGAAGACATGATGTGC
TGACTTTTTCTGCAAAAGAAAGCTGAATAAATTCTCTACACTTTGGAAAA
AATAGTTATGTTAAAAGAGATTTCCTTCCTTGAGATATGTAAGCTTGAAT
ATTTTTTTTCGAAAATCTATGTTTTGTTACTGCCGCACGCGTAAGGCCCG
ACCTCGTTCCGAGGGCGTAAGCGCCTAATTGCATGGTTATAATTTACGCC
CGCTCCCTAGGGGTTCAGAATTCTCTAATTCGGGCGAAGGCATGGTTTAA
CGGGCAATCCATTTTTACGGAATCTTCTTCTACGATAAATTTTGAGTAAA
ACTGCCCTAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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AGCTTTCGGAAGGAATTGCGTGTCAAAAATATAAGAAATTTTAAAGCGTG
CAATTGCACGCTTACCGCGAAAGCCGTCACCCGTCAACTTACTTGCTTAA
CGCTTACCGCCGCCCGTTTCAGAACAAATTTCGATACGCGTGTATAAAAA
TTCTGCCATTTTGATAACTGTACGGCCTCGGAACATAAGCGTGCAATTGA
GAGGATTTCCCAGACTTTGTGTCTTTGTCCTGGGTCCGTCCTGGGTCCTC
AAGTAACTCATATCGTGCATTCTGATTGGTCAAAAAACAAAAGTGGATTT
TGTGTGTGTGAATTGCGTGTTTTCATTGGGCGAGATAAACTATTTCAGAT
TATTTTGACGCGCTGCTGCAGGAAACATATTTAATAAAATCAACAGTATT
CAATATGATTAAAGGTAATTGAAAAGTAATCCAAATGATTGACTCTTTTC
TATCAAGTTTTACCAGATAACAATTTTAATTGTTAATTCTACATGCATAT
ATTAGTCGCGCTGCTGAGGTCGATAAATGTTTCATTTCGTGACACACCTC
TTAGATTCCACTTTTTTCGATGGAAACTCAAATTAGTATATGTAGATTCC
AAAATCAAAAAGTTTCCACGATATTATCGTGCAAGTAACGAGTAAATGGC
AATTTTTTGCGTTTCCAGGCAAAATTGCAAGGCCTGGAAATTCATGATTT
TTGGGGGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GATGCAGATTGTGGGGAAATTCCCTGTTTTCCATCAGTTTTTTACCACAA
ATAGGCCAATAACTTAGAGCTCTATCATGTGATATAGGTCTTTTTTTAAT
TTGGAGACCCCCCAAAAATCATGAATTTCCAGGCCTTGCAATTTTGCCTG
GAAACGCAAAAAATCGCCATTTACTCGTTACTTGCACGATAATATCGTGG
AAACTTTTTGATTTTGGAATCTACATATACTAATTTGAGAGTTTCCATCG
AAAAAAGTGGAATCTAAGAGGTGTATATCACGAAAATCATTTTCTAGCCA
CTTTTTTCGACCTCAGCCGCGCGACTATATGTTTGCTTGAAACAAAATGA
AAGNTTTACACATGAGCTGCATTTCAGTCTCCATTAACATGATTCCATAA
TCAACTTATTTGAAATAATTATGTGTCGAGTTTGACAAACGACAAACCAA
GCCACCAATCGCCAAACGAGACGGATCCAGATATAACCATTTTCACGCGT
AANGTTGAAAACGAGCGTGCAAAACAGCAAATGTATGACCCTGTTGACAT
GGATCAAAGTGAAGACAGGGAAAATTTTTCCAAAATCACCGCTGTTCTTC
TCATCGGTTAGACGCTTGAAATTTTATTGAATGGTCTCCTACCAATNTTT
TAGTGTCCATTACCAAATTCCAGAATCAGTTTACTTGAAATAATTATGTG
TTGAGTTTGAAAATCATACCACGTCCCACCACTGACCACTGCACCGTGGT
TTTGTTAACAGCCTGAACAGCGACAGATCCAGAAGTGATTGTTTTCTTAT
GTAGCATCAAGAAAAAAGTTCCAATCTTATTCAATTTTACACATCAGCTG
CATTTCAGTTTATTTATTTCTATATCAGAAGCCATTATTTCCTAANNNNN
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CAGCTCCGCTCGCAGCTCTACTCTACCATTTTTGTTTTGATTTAATTTTG
TATTTTAATGACCAGCCAGGTCTTTCATTTAAAGGGCTATGCATGTTAGC
CTACACTGATGCAAGTTATCCAATCTCACGTACCTAATAGCTGGGGGGTT
TGGAATAAGCGGGGGGAGGTTGGAAAAAATATCAAAACTTACTAAGCAGG
GGGGGGGTTTGGAATAAAAATGTCCTAGGTCGAAAATTTCCATAAATTAT
GCGCGCCCATAGAAAAATATTTTTAAAAACCCGCGAATATATAGTGAGTG
GGCGCTCTTTAACCAATTAGGTGCACTCACATATTCANNNNNNNNNNNNN
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AAAATATATTTTTTATAGCCAGTATCCGACTTTAGCAAGCTTTTCCCTCT
CCAGACGGCAAAATTAAAAAGTGCGGTACTGGTTTTAAGCGCTGTTTCTG
CCTAAAGTGACACACGGACAACGGACAGACAGAAAATTGCAAATGAAAGG
CCTACGCTTAGCGCTGGGCCAATAAAGCAAATCCAACTAATGTTAATCCC
TTTATTTATTTTTACACTTTTTAAGTGATTTTTGACTTGTAAGTGGTCAT
AGCTTTCGATTAAAATCTATGCTGAAGATAGTAAAATTTTCGAAATTTGT
TGACATCATCTTTTTCAATATTTTTTGCAATTTCTTTAATTTACATTGTA
TCTATCACATTTCAACATTTGAATATTAATAAATAATAGTTTAGAAGTTA
CCAGTATTTTCAAATCTTTTTGCAAATTTAGCTTGGTTTTATGTCAAGTT
TCATAATAAAGTCAAGAAACCTGATCTAGAGGACCTTTGACCCCAAAATA
AATTTGCACAAGTACTCTTAATAGTTTTACTAAAAGTCAGAAAGTTTTTT
ATCGTTTCAGAAAACTTAAGATTAACCTTACATCTCACTTTGATAGCTAA
AAACATTGACAAACATCCCAAATTATTTTTTTCTTAATTTTAAAGTTTTT
GATATGTCACCACGTCGCTAGACAAAATGATGTCGGAGATTTTAGTACTG
ACCCCCGGGCTCGAATAACCAATTCCCAATGTTTAAAAGTATTCATAATT
GCTACTGCTAATGATATTTATCTTACACCATAGGTTCTTGCAGATAACCC
AGTTGATGGAGTACCACGTCAACTTTTCTCATTCGCCCAGCTTACTTTGA
CCTCTCTCAAGATTAACATCCCTCCTGGTGCAAGAAGTGGAGCCATTCGC
AAGCAATTAGAAAAAGATGACATCAAGGGAAAATGGGGTGCTACTGCTTA
TGCTAAAAAGTTAGCCTTACGAGAAGCAAAACGAAACATGAATGATTTTG
ACAGATACAAATCTAAAGTTGCAAAACAAGTTGTAAGTACATTTCATGTA
ATCATTCCAATTTGAGACGTTGGCAGTCAGCAAACTAATGGAAAGAAAGT
ATGCTGGTGCTTTTTTCTCGGACATTTATAAAGAAACTTCACTGATTGAG
GCTTAAGTTAAAGGACAGGGGTTAACACTGGTTAACAGTGACTATAAATT
TGTTTGCATGTGTCGACGATAAATGCATTTGAGTTACCTTAACCCTATTT
TTATCAGGGGTTGGTGTTTTCCACCAGGCTGGCACTCTTTTGGTTATAAC
TCATTGAAAAAAATGTTAAACACTCTGAAAGTTTTTGACTTTTAATATTA
TCTTATTAGCGGCATATATACCAAATTTTACAATTATACACCGACCAGAT
CAGGTTTTAGGACTTTTTGTGCAAGCATAGCATAAAATCCAGCCAACGGA
TTAGAATAGGTGGATTAAGAACTCATAGAAAACACTCCTCGTTAGGTTAT
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TTGGGAGCAACGAGAGAAGTTAATCCACCTATTCTAATCCGTTGATCCAG
CTAAAACACTGTAAAATCACAAAATCTTAAATTTAGCATAACTTTTGATA
TAGGCATCCAACTGACTTTAAATTTTGAAAAATGACGTCATTGTTTTTTG
AAAATATTTACTCATCTTTTGCATGGATTTTAAACGTCCATTTTGTTAGT
ATGTTAAAAATGTAAAAGATTTTCTTTTTTGCTTTCAGAAATTCAAAACA
GAAATGAAAAATCTCCATTTGTTCAACTTTAATTATTATTTTATTAAATG
GTACTTTTTCACTGGTCAGTGATAATTGTGAAATTTTGTGATGACGTCAT
CACCTTTATGATTACGTCATCAACCCAAATTATTTTCTATGAATTCCTTA
TATGGTAGAGAACATTTCTGCCAAGTTTCAAGTCCACAGCTTTTCTAGAT
CAAAAGTTATGCAAGGCTGGTGGAAAACACAACCCCCCCCCCTTGAGAAT
ACGAAACACAAAAAAGCCTGATAATAATAGGGTTAAGAGTATCATCATTC
TCTACATATTTGAATGTTTCGTTTTGGTTTTGAACTGACTACCGAATTTC
CCTCACATGGCATGGGCTAAACAATTTGTTTTGATGTTTGTGGTGCATTT
TAAGAGTTGTTAAAAGTTCAGGCACGTTAAAGCTAATGAGCAGTAGATTT
CGGTAACTGTCGTTCCCAAGTGCCAATATCATCAAAAGGAAGGATAAATG
CATATGAGATTGATGTTCTTTATCTGCTGGAAGCCTCCTTACATCCAAAT
TGATGAACATTTTCCGTGACAAGTTCTGAAATATGTGCTATGATGATTAA
TAACCTTAGGACACCTTCGGAGATCAGATTGATCTATGAGAGTGATTATG
GTAACTGAAGCATTTATGTCTAAAACTTATATAAAATGTGTGCTGTTGTC
TTTCTCTCGATCGTTTATTATTGGGCTTTCTGATTCAGGCACGTTAAAGC
TAATGAGCAGTAGATTTCGGTAACTGTCCATTCGTTCCCAAGTGCCAATA
TCATCAAAAGGAAGGATAAATGCATATGAGATTGAAATTCTCTATCTGCT
GGAAGCCTCCTTACATCCATCCAACTTGATAATAATTGTTCGTTACAGCT
CTGAAATATGTGCTATGATGATTAATAACCTTAGGACACCTTCGGAGATC
AGATTGGTCTATGAGAGTGATTATGGTAACTGAAGCATTTATGTCTAAAA
CTTAAATAAAATGTGTGCTGTTGTCTTTCTCTCGATCGTTTATTATTGGG
CTTTCTGATTCAGGCACGTTAAAGCTAATGAGCAGAAGTTTTCAGTAACT
GTCCATTCGTTCCCAAGTGCCAATATTATCAAAAGGAAGGATAAATGCAT
ATGAGATTGAAATTCTCTATCTGCTGGAAGCCTCCTTACATCCAAATTGA
TGAACATTTTCCGTGACAAGTTCTGAAATATGTGCTATGATGATTAATAA
CCTTAGGACACCTTCGGAGATCAGATTGATCTATGAGAGTGATTATGGTA
ACTGAAGCATTTATGTCTAAAACTTATATAAAATGTGTGCTGTTGTCTTT
CTCTCGATCGTTTATTATTGGGCTTTCTGATTCAGGCACGTTAAAGCTAA
TGAGCAGTAGATTTCGGTAACTGTCCATTCGTTCCCAAGTGCCAATATCA
TCAAAAGGAAGGATAAATGCATATGAGATTGAAATTCTCTATCTGCTGGA
AGCCTCCTTACATCCATCCAACTTGATAATAATTGTTCGTTACAGCTCTG
AAATATGTGCTATGATGATTAATAACCTTAGGACACCTTCGGAGATCAGA
TTGGTCTATGAGAGTGATTATGGTAACTGAAGCATCTATGTCTAAAACTT
ACATAAAATGTGTGCTGTTGTCTTTCGCTCGATCATTTATTATTGGGCTT
TCTGATTCAGGCACGTTAAAGCTAATGAGCAGAAGTTTTCAGTAACTGTC
CATTCGTTCCCAAGTGCCAATATCATCAAAAGGAAGGATAAATGCATATG
AGATTGATGTTCTTTATCTGCTGGAAGCCTCCTTACATTTTTTCCTCGGA
GCTTTTCTAGTATTTTCAGAATCTGTCTACTTCTGAGTTGGATGAGTACG
ATATACTTTGTTTAAATGTGTTAAGTGATGATTAGTAACCTTAGGACACC
TTCGGAGATCAGATTGATCTGTGAGAAGAATTATGGTAACTGATAACACA
ATTTCGTTCAACCATGCGTCTACCAACTCTTTAATTATGTTGTTTTAAGG
ATTAAGAACTTTTTAATCAATCGGGGTTGTCTTCAATGAAGTATAAGCCC
GAGGGGCTAGAAGTCAATCTCCCTGGTAGGATTTAAAGCCAACAAATCCT
ACCAAAGTTGCGCGGCCTTGAGCGGCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TCTACTATGTATAAATTAGTCGTCTAGCTTGCTAGACTACACAAATGGCA
GATTGAAACTGAAATTTACCGCTAAATTTCGAAAAAAATATTAATAGTAA
ACAAAGGAATTTCTAGATTCAATCTGTCGTCAAAAATGCGGCGCATTTTT
TAAGGCTTCACTTTTTCTTGCCTGATAAAGGTTAGAGATTGAACTCTATA
GCTTAAACTCAATGGTTGTCTTGTCGTGTCGTGTCGTGATTTACAAAATC
AGTCTAAATTATTATTTTTTTCTTCCTTTTTTTCAGAGAAATCGCAAGGT
GAAGGCCATCGTCAAGACTTTGAAGAAGAAATAAATATTGAAACCTTACA
TTTGAGAATCTATGTTTTTTCTCCATATCTTCTCTGCTATTGAAGGGTTA
AGTTTTGGGATGTTTAGT

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00011593	TCONS_00011593	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00011593-protein	TCONS_00011593-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000130	supercontig	sc0000130:504456..519973 -

Orthologs

The following orthologs are found for this feature:


Ortholog Name	Description	Organism
RPL14	60S ribosomal protein L14	Homo Sapiens

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
728.15	709.13	819.05	899.75	519.77	417.31	623.42	649.26	925.29	790.97	935.07	1130.56	1242.08	1265.11	1153.9	1161.89	1280.15	1298.66	650.35	708.36	1256.41	1216.52	959.68	890.61	872.89	924.3	1205.54	1120.69	802.69	805.84

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