XLOC_006608 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_006608
Unique NameXLOC_006608
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000132:221453..244990-

Legend: transcript
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>XLOC_006608 ID=XLOC_006608|Name=XLOC_006608|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=23538bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000132:221453..244990- (Clytia hemisphaerica)
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CAGTTGAAGTTTGAATATGTAAAAGAAAATGAATTAAAAATGACGAAAGC TAGATCGATTGACCTTCCATACCACATAAATAGTGAATGGAACAAACACC TACTTGGTGACGTCGACCATTGCCAACTGAATTTCAACATTCACACTTTA GTTAGTTGCCACCTGATTCAATCGGAATTGAACGATTGCTAAATGTTGAA AGAAAGTCAAGGGAATATTTAAGAGAACTTCTTTACGAGAAATTTTACTG TAATTTTCAGAAGATTTTTTAAATAGATAGATGGTGAAATTACAAAGTAA GTAGCATCGACCTGAAATTAAAACCTTTTTTTCTAAAAACGATGACCTGG CTTTTGATTACTGACATTTTAAATGTTCAGTATTCTTTAACTTTCACGTC TCAAAAGCTAACTATCGCCAAAAAGTCGTGACAAAAAAAAAAAGTTTACG GAAGTTTCGTGACGATTTTAAGGAAAATTGAGGCTGCCAAGACAAACTTG GCGTATACAAAGAAACTTTGTTTAGAAACGTGAAATATATTCACACTGCA AACATTGAAGGTTGGTACAAGTAGAGATAAAGACTACTTCAGTTGGAGCC AGCATAGAATACAGTATGCTTGAGTTCTAATCCAACTTATTCCATAGTAC TTGAGCAAAAAGAGTCAAAATAAGTTCAGTGAATACTTATGTGAGAAATG GTAACAACTGATTCTTTTGTGATTTGTGTTTGTCTGTTTTGTCATTTGAC AAGTGATTGGAGCAAACCTAAACATCCGAATGAATCCATCAGTCAACAAG ATATGTGATCTCATGTATTTTATACCATAACCCTCGACTTTTTCTCTTCG CTTCATATAGTCTCATACGCACACATGGCTTGTGATGTGCGGTCGATACA TGGTTTTCTATTTTCGAATGGGTAGACAAGAAATATAGAAGGTTTTGAGT TTGGTCAACAGTAGACTAGAGTAGTTTGAGAATATAGGACTCTTCGTTGC TTTAGTGACTGTTACCTGACACTGTTATTATATTTGGTTCTTGTGAAAAT ATTTTTGTATGAAAGTATGAAAGAATTAAAAAACAAAACGGGTATGATTC GTTTACGAATGCAGAAATACATGGAGAGAATAAGCGGTGATGAAAGTGCT GGTAGTGCTGGTGGTGGTGGTGCTGGTGGTGGTGGCAAATATTACGCCAG TGAAACAATCACCGAAGAAAGTGAAAACGATATCGACGTAAGTTCATGGT GTAAAGAAAGAAAGGAACTTGAACTCTTTTTTTACTTACTGGGGTCATTG AGGCTCAACCGGATTGTAATTTTACTAATTCTCATTTAATTTCTACTTGC AGGATCACGATTGCACGATGGAATCACGTCCAGGACCTGAGGGTGAATCT TCAAGAACAATGCCCACTTCTTCAGAGGTAAGGGATGAAACTTGTGACGG ATACCAAGGGATGATGTTTCCAAATAGGGTTGCAAATGGCCCCACACTTC GAATGGTCTTTATAAGGATTACACTTCATCTTAACTCAATGAACAAATGA AACTTTTGAGGATGATGAGGTTCATTGACCACAAGGGGCGTTCTTTAACG TGCTTTATGAGATTTTTATGACCAACAAATGATTATAAATTTGAATTTTT TTCTCATGATTTCCCATGGTATGGCTAAACTATGAATGGGTTTAGAAGTA TTGAGCCCTTCAACGTTATGATTACATGACATGGGCCTGTTCTGTACGAT TTCTCTGTTGATAAATTTTTGTAAAAGAAGGTGGTTCAATTCCTTTTTTG AAGTAAAATGTTTCTTAGGATTTGTCCGTACAATATCTTGTTTCAGTTTT GAAGTTTGAAACTGAGATTAGGCCAAAGGGGAAAGATTCTTTCCTCTAGG 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GTGAAAAAAATATTGACTAACCCAACTAGTCTAAGAATGTGTGACCAATG ATGATTCTGTCACTTTTTTCGATCGAATCGAGATACGCTTACAATCATTA TCTTCATTCTCTTCTTCCTTTTTATTATTCCAGGGAAATCGATTCGAGGT CGATTTACATATGGATATCGCTTCCGAGACACATTTAGATCTGGTCTGTA AATCTATCAATGAAATCAAAACAGAATATATTAAGAAAGAAAACAAGGTG ATAGCGAAACATGACAATAAAATTAAACTGGTGCAAGATTATATCTGTAA GCAGAATGTTGTTATCAAAGATCTTCACGAAACAAACCGTACGTTGGAAA CGAACTCAAGAAATATGCAAAACCAAATCAAAGACTTGGCGTCCAAAACG GAGATGTTTATGGAGGAAATTACTCGCTTGAAAGTACAGGCCAATCAACT TCAAGAAGAAATGAATGAATCACGTGACACTAATTTCACTGGATCTCTTT TATGGAAGATTAAGAACTTTTCGAAACACATGCAAAACGCAGTTAATAAA ACGGAACTTTCAGTATACAGCCCACCTTTCTTTACCAGTCGATACGGGTA CAAAGTAAGGGCGCAACTTTTCGTAAACGGACTTGGCTCGCAAACAGGAG AGTACATGGCTATATATTTCCATATTCTCCCTTCAGAACATGATGATATA TTAAGATGGCCTTTCAATCACAAAATCACTTTTTCTCTTCTCGAACAAAC GCCAGACCAGACGAACGTGACGTATACTTTAGTGCCGACGCCGAACGAGG ACAGTTATAAACGGCCTTCGGATAAAATGAGCGACGGAAAAGGTTTCAAT CGATTCATTTCGTTGGACGCCCTGAAAAAAGGGAAGTACATTAAAAATGA TTCGATATTTGTCAAAATTCGAGTTCATTGTAAAAATACGAGCAGGAATC ACGAATCTTAGTTTTTTATCTAAATTATCTTAACTTATCTTTTGTAAAAT AGATTTTCAATCAATCGCTTTTTGAAGCCCGTCTCTAGTCGAATAAGCCA TAGTTCAGGCGAAATATATGAAGTCACTGAATAATTTCATGTTTTGAGAA TTTCTTGGTTTCCTTCGGGAAAAATGATGACGACAACTTGAAAGATTGTT TTAGCCAGATCGATTTGTCTTTTTTTGACTTTCTGTAGAATATCATCTTA AAATAGATCTATATTAATATTATATTATAAGACTGTAAATTTACAATATA ATATTTCTACGTTAAAGAATTATTCGATGCATTTGAACATCATCTTGAAA ATTAAGAAGCACAATTGATCAATAGAAATCAAACTTCCGAAATCGCCTTG GAGAAAATACATGGAGTTATCTTCGATATTCCAAGGAATGATCGAACTTC AGGGTTTAAGAAAACTATCACCATCCCCATATATTCACAATGCATAATCC ATGATAATGCGCCAAGAACAAAGAAAATGTCTTACTCAAGATTGCAAATA AAATTCAATAGTGAACTTCATTCCCGAGGATATTTGGACTTGTATGACAA ATCCGTTTGCTCACACTAGCCAAATTTATCATCCAAAATATGTTTTCATG ATCGATCTTTTGCTTTGCGTCTATTAGTCGTTGGGTAAAATCGATGAGTC GTCGTAACGACATCAGCTTTGTCGTACTTTCTGGCAGGTGGCAAAAATTC TTTCATGTTATCTTGAGGATATTTCTCCTTGATCTTTTGCCGTGTTCCGT ACAGCTTCATATCATGACGTAATTTAAAGTAATCCATGACGTCATAAGCA ATAAGGACAGTCAGTGCAAGAATGACCAGAAGATCTTGAACGTCCATCCT CAAAATGTTCTTTCAGTGGAACTGCTCCAAACCATCAATCATTTTCTCCC TTTTTCCTTCAAATCGGTTTTGATATCTTAATATTAAAAGTGATTTGATA AATAAAACCTTAATGTTAATCCTGGCCCACTAACCCCTGTTATTCCATTT AACCTAAACTGTGAAAACGTTCAGCAAACTGTATAATCAAGATAGGAACT GTAAAAATAAAACTGAACGAATTGATCACTTTCTTTCTTCGACCAAAAGT AAAACTTCAGCCATCGCCAATGTTTCCCAAAATTGTTTACCATTTTGATT TAAAGTTCCAGACTCATTTCTTCAAGAAATTGAAAACTTGAACTTCAAGA AATCTGATCAGAAAAGATCATCCCAAAAGTTTCTATATCATCTCATAAAA GAAATTTTGAATTCTCGTCTTATTTTGATGAAGTGAAGTGAGACAAGAAA AAAGAGAAAAGGAAGCATGAAAAAACTGAGGTTTTGAAGAAAGGAAGACA AAAACACCTGCACCACTAACTAGACTAGAAGTAGTTATCACTTTCATCTC TTTTATTTTAAAGTTTATCATATTTCAACATTTTTTACCAGTCTGAACTT CCACTTCCAAAACTGTTTACTTGTCCTAGCAGTATGAACTTAAAAACTGT AATAAATCGATTGATAATTGATGAAAAGAATTCCTACTTATCAATAAATT CCATTTGATTCGATGATGAATTTACTTTAAATGGGCCCCACAGTTTGGGT GACAAAATGAAAGTTACGTCCCAGTACACCAATTGAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00011769TCONS_00011769Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00011768TCONS_00011768Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00011765TCONS_00011765Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00011764TCONS_00011764Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00011763TCONS_00011763Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000132supercontigsc0000132:221453..244990 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
4.61 4.89 1.81 1.21 9.23 7.61 20.19 20.06 7.91 8.47 7.32 7.9 14.37 13.17 11.49 14.77 21.49 28.42 21.16 22.29 15.29 16.11 10.5 10.27 6.85 7.16 17.89 18.3 33.06 32.72