XLOC_008109 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_008109
Unique NameXLOC_008109
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000188:72562..99822-

Legend: gene
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>XLOC_008109 ID=XLOC_008109|Name=XLOC_008109|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=27261bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000188:72562..99822- (Clytia hemisphaerica)
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CATTGGGAACATATGTTTCCAAATTCTCCTTTACAGAGGACTGATCATGG TCTGAGCTTCTCAATTTTCTAAATCTATCTCTAATTGGATTGAAATAGNG GGAACATATGTTTCCAAATTCTCCTTTACAGAGGACTGATCATGGTCTGA GCTTCTGAATTTTCTAAATCTATCTCTAATTGGATTGATATAAGCTCTTA TAGAATAATCTAGTTATAAAAGCTTCTCTAGATCCTTTACTTCATTATTT CGCTAATGTCGCATCCATTCTCTAAACAAATGATTAAACCTTGAAAAATG TCGCCAGAGTGTTACTTGATGATCGATTTATCCTTCAGATGACCCACCAT TTATTTCTTATACTTCAGTCTGCTATTATCTCTGTCATCTCTGCCATTGA AACTAAAAATAAAATATATCTTCATCTTTTTGCTGCTTTCCGAGCTGCAA AGAAGTAGCGGCTTCCTTCTCTTTACACTAAGAATACCTAATACGACCTC CCAAGAGTGACAACCCCTGGTTTCATTACTAATTTCGTTGGTACGCTGTG ATGAATTTGGCCTGATATTTTCGTTTGTTGTGGTAAGTGCCGAGAGACTT TGGAATTAAACATGAGAAATGATATTCCTTATTCTTAACACCCCTCACAG TGACCCGTCGGAGCTACTTCCCGCAGTGGCGATGAAAACTCTTATCAAGT GGCAATATTTTTGGAGTTTTTTTTTCTATTTAAATTCCAACAGGGATAAA GTCATATGGTTCTTTACCAGAGGGGTTAAAACTACTGGGCACTTTTCCAC TGAAGAAGATTCTTTGGCCAACTTTTCCAGTGGAGCGGGTTCTATTATTC ACTTATACGGTACCCAGATGCAGAAATTTTCATCCGACACGCTAAAGCTC TGAAGGTCGGGAAAATTTTCAACATCTGGAAGGTTTAGATTACGGAATTT GTAAGACCGCGTCAAGGATTTTGCAGTGGGAGGTCTGGTAACCCAGCCCT CGTTTTCGGGGATTGGCGGGTCCAACCGAAATTTTTTTAGCTTCATGCGG CGTAAGGGTAATTGAACCCGACTGGGGATGCGGCACATCACAGGCCGACT ATCTCCTCTCCGATGAGAAATTGGCCCGCTCCTTTAGAGCTTTAGTGTGG GCGGCCGCCAATACGCCATCGGAATATCAGATAAATTATTTACAGAAGCT TCGTGTATAAATACCGATGAAAGTTTTGGTCTTTATTGAGGTGCAAAAGC GTAAGCTCAGAAATTGAGCATAACAGGGCTCATCGGGCATATCCCAGCTT ATTGTGCTTATAAAGAAAGTGAAAATAATTTTCTCGTAGAAAAGAAACCT AAGAGAACAATACTGCGTATTTTTGTATGTTAGCCGTGTTGAACTCAATT CCTGATTCACAGTTTCGAATTTGAGAGGTAAACATTCAAAGCACTCAGTA TTTTCCATATTTAAAAAGCGTGTATGTCTTGGCAATCCCCAGTTATTAAG GAAATGCCAAGAAGACGGTTGTCCTGATGCGATTTTCCAGGAATAACGTT CCAATGCGAATAGTCCAGGAAAAAATGGCCAAAAACCCACCTTGAACGGA ACTTTGTGAACCATGGTTTTTTAGCTTCCTATGTACCTATAGATCACGGT TTGGGATGGTTTTCAGGCTGAACAGGTGATAAAACCCTAAAATTTGGNNN TTTTTCCTTCAAATTTTTAGGCATTTCTGACACTTTCGCTGGATAGCCCT GAAAGAGTACTTCAAGAAAATGGTATGGTTTGTTGGGTTACAAATTGTAG AAAGGGTAGATAGCAATTGGAGAAATGATCCTAAGAATTAACCCTGTTAG CCCCAACCAAGCTTTTTTGGCTCCTCTAGTCTTAATTTTTTATCTGGAAA 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TTTAAAAAATATGTGTGTTTAGACATGAAATTTTGGTTGCTTGGCGTGTT TTTATAGAAAAACTGGCCAAATTCGATATTTTTTTATAAGCACATTATCA ATTAGGTATCAATTAGATTGGCTCTTTCATTATTTATGATTTTTTGCACA AAGATGCATAACTATAAACCCTCGAATGTGACGGAGCTCGATTTTTCGAA AAAAACTTTTGTGGTAAATTTCAGCTAAAAAACGGCTAAAAAAGGGTTTT TTGGACTTTTAAAATATTGGATGATTGTTTTTTCTGACTTTTTGCATGAA AGTAGGTAAAAGATGGCTCAAGCTGATTTTTGTAAAAAATAATTTTTCAG CTCAAAAACGCATCTTTATCTATAAGAATCACTATTAATAAGCATACATC AATGTTTTGATGATATATGTTTTTTTGCTCACGAAATCTTAAATACGAAA GAATATTTCAAGAGCATGAAATTTTGGTTTCTAGACGTTTTTTTTATAAG AAACAAACGACTAATTTTAATAGATCATCACTATTTGTGTTCTGAATGAT TTTTTAATGGTCACGCAGATATCAATTATATGTGTGTTACATGCATAATC GTCAGCCGTGCAAAATTACTCGAATCTGATTGGTTTAGAGGAGTGCGATT AATCGTTAATTGCACTATTACCACTTTTTGCACTCTTCGGCGGGNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNCTTTTCTCTCCCAAGTCCTGTGTCAGAGACTTTTTTTTACTATA TAATAAAAAACAAAGACATTTTTTTCTTCAATATAAAAAAGAACAAAGAA ATTTTATGTTACAATAGCTTCTTTTAATTGAAAACAAAGAAAAATTACAC TGCGATGTTTTCTTTTTAAAGAGGTTTTCTAATGATTATTTACTGACGAT TACCTCGGAATCGTATGTTTTGTCGTGCAATTAACGATTTATCACTCGTA ACAAAGGAGAAAATACCGTAATTTGCACTCGTCCTTCGGACTCGTGCAAA TTACTTTTTTCTCCTTTGTTACTCGTGATTAATCGTTAATTGCACTCCAA ACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAT CGTCAGCCGTGCAAAATTACTCGAATCTGATTGGTTTAGAGGAGTGCGAT TAATCGTTAATTGCACTATTACCACTTTTTGCACTCTTCGAAGATCAAAT TTTCCCTTTTAGGGCGCGTTCAGACTGGAAAGTTAAACAAAGACACTGGT TTATTACAGTTCTTTGTAGGTTCACGAGATCTATTATAACACGGTAATTG ATTTTGCTTAAGGCTTCTCATTTGTTGATTTTTTATTGAGAGTTTCGATT TCACCTGTGATTGATTGATATTGGTATCCATACATCACTTGAAATCCGCA AACATATTTGTTCTAATGGTTTTTCCTCATTAACTGCATTCATCTTACAT CAACAACACCGTTTGCACTATTTCTAATTTTTTTTAAATCTTTTGTTTTA AGGGAAGCCTCTACCCTACCCTTAATACAATAGAGCTTACGACTTTTAAT TAAGGAAGGTCGATTAAAAGTTACAATACTACGCGTTCGACTCTTTGTTA AAGATTCTCCTATTAAGATTTTTATTAAGGAAGGTCTGTAGTGTGAACAC GACCTATGATTTACTAATGATTATTTACTGACGATTACCTCGGAATCGTA TGTTTTTTCGTACAATTAACGATTAATCANCAAAACTATTTACTGACGAT TACCTCGGAATCGTATGGTTTGTCGTGCAATTAACGATTAATCACTCGTA ACAAAGGAGAAAATACCGTAATTTGCAAATTACTATTTTCTCCTTTGTTA CTCGTGATTAATCGTTAATTGCACTCCAAACTATGCGATTACTAGTACTA ACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATCACTTGTTTTTCATTTCATCATGGATA TTCTTAACTTTTTGATAAAAATAATCCTAAAATATTCTTACAACATTCTT AGGTTAGAGTCAAAATTCAAACTAGATTCAACATGTAATATATACAACTA AACCATTAAATGGCATTTTTGTGAAAGAAACTTTACTGGGGGATAGTTTG CAATTTACAGTTAAAAATGCTCTGAAATGGCATTCTTAGGTTAATCATCG ATGGGTTAAGTAGCCAAATTCCATGATGGTGATATTCTTAGTATTATTCT TAATTTTCCGCCAATTTCATCATGAGTATTCTTATAAAGTATATTCTTAT AAAAAAAGCGTGTATTACTCAAGTCATTTCTCTTCTAGGAAAATGTTTTT TGCCAAGACGCCTTTGTGTCTCAATCCCTTCANCTTCTAGGAAAATGTTT TTTGCCAAGAAGCCTTTGTGTCTCAATCCCTTCACTAGAAACGAAGCAAC CTTCATTTGAAAAATCACACCATTATTTGACACATGTTTTCATGTCTTCG ATTTGTTTCAATATTTCCCTTCTTGCCTTTTCACACTCTTCATTATTTGA TGATTTTCACAACCAGTTGCAAGCTTCAACTTCCATATCATCCCTCACTT GGGTACCATCATAGAACATTTTTCGTGTTTAATATCCGGACATGGCAACA TTCCATCTTTACTTTAGTAGCTGCAAGATTTAGATTGTTAATTCCATATA GTATTTTTTCGTAGTTTTAGAATTAAATTTTAGTATGTTGAAGTAGGTTG 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GGAGTTTTTCAACAATAATTTTTTACTCGGTGAAGTTCTTTTGTTGAGGA GGGTTATAGAGAATATAAAATGTAAGATCTCTACGCTTGTGTCTTTTGTT TTGTTTTGTCTATAATCAATATAACATATGCTTTTCTCGTTTTCATCTTA CATTTGATACTATAAAACTGTTTTCATTCCTTCCCTCTCTTCAAATCCAA ACGATTTGGAATGTTATTTTATTTATGGGAAGAATTTCATAGCTACGTCA ACGTGAAGTTAAACTCTTGCTCAACAATTAGATTAAGTTTAATCGTCAAG AGCTTCATCCTGTTGTCTTATGGTTGAATATCAATGTTTTTCACCAGTTC TTATGGTTTCACTCGTAATGACTTTTTACTGAGAGCACTGTGAATAGAAA TGAGAGGATCCTAAATTTTCTACTTTCTTTTAAAACGAACCTTCTGTTTC ATCGATGATAGGGCTCTTCAAAAAGATGGCACAGCGATTCTTTAATATCA CCCTAAATTTCTCTTTCTTCATTTTTCAGGAGGTTGCATTAAGAAAATAT GATGGAGAAGACATGGAATACATCTCATAATGTATTATGGCAAAGAAATG GTACAAATGGAACAACACGACTAGAATGCAATGTGATGACCACGCCCTTA ATCATTCTTTACTCGCTTGCGGCACTGTTCACGACCATTCTACTTATTGG TAACGCTTTTATCTTGATGTTCACCTTGAATCGCNTGGAACAACACGACT AGAATGCAATGTGATGACCACGCCCTTAATCATTCTTTACTCGCTTGCGG CACTGTTCACGACCATTCTACTTATTGGTAACGCTTTTATCTTGATGTTC ACTTTGAATCGGAAACGTAAAAGCACATATGACATTCTACTGATCTACCT CTCCACCTTCGATTTCTTGGCGGCTTTTACCATGATCCCTCGCATTTACA CCGAGATGACGATGTGCTCATCAAAATGGAAGTTTGGTTATATCGGTTGC AAGATCTTGCTACCCTTTTACGATGTGTCCGTCAATATATCAGTCTGTAT TTTGATCATTATATCACTGGACCGATGCAGAACGTTGACCAGACCGCTTC GGTCGTACGGTTCGCCCATCTCCATTCACACCATCGCTCTCAGCTGCATC GTGCTCTCCGTCATCGTCTATTTCGAGCGCTTCATGAAAGCGGAAGTGCG CGGTGGAGTATGTAATTATGTTTTAGACGGATCCCTCATCAACCTGTCAC CTGTGCTTGTTTGGGCGTTCCGAGACGTGACATTCTTAGTAGTTTTTACA ACCACTTCTCTCTTGATCAGAAACTCCTTCAAAAAAGCACCCGATCTATC AGAACAACAAATGCTTCGTAAGAAAGTGCAATCGAAAAAAGTGTACAAGA ATTTGCTGATGATGCAGATCACGTTTAGTGTTTTAGTCTTGCCGTTCGAT GTACTGTCCATCTCATCTCNGATGATGCAGATTACGTTTAGTGTTTTAGT CTTGCCGTTCGATGTGCTGTCCATCTCATCTCTTGGATTTGTGATGATTC ACAAGCAACGACTCACCTGGTAAGCTGCCTTTCATTTACAATCCTAATAT CATTTTAATCATTTTTTGAGTGAGCGTGTTTCTTTTAGAAAATATCATTT TAAAATAGTGAGAACGGAAGAAGTTTATGTCAACGAGTCTTGCTTTTTTT TTAAACCTGCTCTTCTCTGCCTCCTTGTGATCCTTGGAGAACCCTATGTA ACCTTTAGTGAAACAGTTGTTTTGTAGGAATCATATCATTGATTGCGAAA TGCCCCCGTTATCTGATGTGATGCATATGGTCTTTTTCTGAAAAGTTTGT CGCACTTTTATTAGACGAGTTAAAAAATATATTCTTCTTTTTCTTTTTTT CTTGCTTTTTTTTATAACATGGATTACACGTTACACTAACGAACAAATGA GACAAATCACTACTGACAAAAAAGACTTCCCCCGCTAGACANAAATGAAA CAAATCACTATGACAAAAAATAATAGCCTTTTCCCCCTCTAGGCGCTAAG TGATATCGCCAGAGGTAGTCACGTTATTTTATTTCGTTATCTTCTTTTTA CTTTTCAGGCAACCGTTCGAACTGCTTTCCAAGTATTTGTTTCTCTTGCA AATGTCGAACAGTTTGGCAAATTGTTTCATCTACTCACGTATTCATTACT ACATCAAGACATCGCGAAAACGATTTAACACCACTTCTAGAGAACGGAAC AACAACAGCAACAACAATAACCAAAACATTTCAAAATATCAGAAAAAGGA TGAATTGTACGAGAAAAAGTGAAATATAACCGGTCACAATACTGACATTG TACAATATTCCATTCTCACAACCAATACTTTTTAGAGAATAGTTTCATTT GAGAATCGGTTATGGACCCATTCAAGTCAATTAAAAACTTAGGGTGTTAC AAGACAACCTATTTTGACGTTATTATACAGAAATAAGATACAGCATGCTC TTTTAAAATTTTGATCCGCATTTTTATTTAAAATCAAATTGGTTTTTTCA AAAAAGGGAAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014497TCONS_00014497Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00014496TCONS_00014496Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014496-proteinTCONS_00014496-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000188supercontigsc0000188:72562..99822 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
9.56 9.3 6.34 5.97 5.48 3.98 6.26 6.93 9.4 9.68 12.2 10.94 17.71 20.12 17.74 24.81 12.25 14.41 20.91 17.69 11.63 11.58 11.29 10.96 9.99 10.25 5.4 6.11 14.29 16.55