XLOC_008755 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_008755
Unique NameXLOC_008755
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000215:294857..319874-

Legend: gene
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>XLOC_008755 ID=XLOC_008755|Name=XLOC_008755|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=25018bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000215:294857..319874- (Clytia hemisphaerica)
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GTGTAGACGTGATGAATAGCAGGTAGGAGATAAGCTTTCTGCATTTTGTA AAACGATCTCTCACTAATAAAGGCTACCTTGGCGATTCCCATCATCTCAC TTATTCGACGATAAGTAGCACCTGAACAGAGAACTGATGCTGCCATAAGA ATGTTCCCTTCAGCCATTCCTCTCACATCTGGTTGTGACTCCCATTTGGT TTCGTGATTATTCACACAAAGCTTTGTAACGATTATCTTAGTTCCTCGAG TGACACATTTCGTTATCGAGGCAATTTGGTGGCATAGAGAACAAAATGAA AGAAGTTGTGCTAGACAAGACCAGTAAACGATGAACTTTGTGTCTTTGTT GGGCAAGCCGATCGACTCCTCACTCTCTACATCACTATCTGAATCACTGT CTGTGGGATCGGGTTCGAATGTCAGATCTGATGGGTCGTCCTCTTCTTCA TCAGAGCTACTATCGATTACGTCCATCGGTTCCTTGTCATCACTACTTTC AATTTTAAACGTGACCATCACATCAGGTGGAAATGTTATTTCTGTATTTG TCTCTTTTACCTTTGTGTCTGTCTTTTTCTTCTCAAATTTCACTTTCAAT GGTCCTGGGAAATCAATGTTATGAGTTCTCTCTTTATCCTGTGAGTGATT GGGTTGGTCATGGTATTGTGTTCCCCGAGATGTCACTTTTTTGAAGGGTG TCCCAGCTGATATGGACTTGTCTACCATGACAGGTGCCTTTGAAACAGGT TCGATATTTTCGGTGCTGGTTGGCTCGACATTTCTCTCTTCGTAAACTTT TTCAATAAATTGTCGTTTATTTGCGCGCTCAGACCTTGCTTTTGACATTG GCCTTGACTTAGGTTCTTTCGAGAAGCAAAAAATGGTTGGCACTGCATCT TCCTTCAATTTTCGTTTCGATGGTATTCCCATAAGTTCAGCCTGTAAAAG TAAAAAAGCAAATTAAGCCAAAGTTGTTGTTAACACCCCTGTTTCATATG TGCTCAAAATCTTATAAGTCTAATCCAAACCATCCAAGTGACCTTATTGA GCCAGAATTTAGTGGATACTATCCCAAGTGAGTGAAAACACTACACCAAG GCACTGAGACAGGGGTGCTAAAGATATTTCAGCTGTGGGGGATTTCTCAC AAATGCGGGCTAGCTACGGCTATTAAGAGAGAAGGATCCCATTGGGATAA GGAAAGAGAAAAAACAAGCATTTACCTGGAGGTCTCGTTCGAAACAGGAG CTCTCAAAATGTTCTGAACAAAGCACAAGACTCTTTGGTAATTTTCCTTC CCTTCGTATATTTCGTTCCCATTGCTCTCGAAGGCTTGCATTCTTAGGAA GAGAGTGAAAACTGAGGGTTTTCTTTATTTGTTTGGTTGCGTCGTTTTTT GGTTCACTTTGAGTCTTGTCGTCATTCTTTTCGTGTTGCTTCTTCTTTTC CTTTGCTTTCTCCTCACCACGGTTGGTACAACCATAAGCACCGCAACTTG AAACCATTTTACTTTTACTGCTTCTACAATTAAATTCTTCACAAAATGAT TTTTCTTCTCTCTTAAAATCGTAAAATCCTTCTACTGTAAAACGAGAGAT GAGAGAGCCGTTTTGCTTATCATCTCATTATAACATTTGTTTAATCTGCC TTTTGCCTTTTATGACGTAAAATTCTGCGCTCGACCTAGTTTCCTGAATG TACAAAAGTGGGTCTTTTCAAAGCTTAATAAACGCAGAGATTGTTATGAC TTTTAGAAAAAAAGAGAAAGTTTTGTGAAGAGATTTTTTTGGGATGTGAT TTTTTAATGTGAAGCTTCATGAATTTTAATTCTTTAAAATTAGTGCCGTT CCCCTTATTGAAATTTCTTAAACTGGAGGTTCAGCATATGCTTAGCCAAG GCTAATTTGAGCCTGGGGAGTCTGGGGAGCCTGGATATGCTTATAAGCGT TATGCTTGTAAAAATAACATGTAGTTTTTTTCATGGAATCAAAAATTGTA GTTCAGTAACTTGCATGTCATGTAACACTTTATCAAGACCTCATCAATGA AATCCGTTGGAAAAATAAGAAAGAAAAAACATTTGAAGCTAACAATATTG AAATCTTATTTAATTGTGGGGCTTCATAATTGAGTATGGTCAGTTTAGAA AAGACTTGTGTTATGTTACAACGATTTAACTCTTCAGAGAACAGGATTTT TTACGAGGAAAATCTCTTTGAGTGGTTCTTAAAAGTTACCAAAAAGTTTT TCGTCTTAGACAGAAGATTTACTTTACAATTAGACATCAAAGAACCAGGA TTCTTGAAAGACTGGACTCTCAACTTTACGTGAATGCAAATTCGTTCGAG TTGCATGGAAATTTCTAGTTTATTAGGGTTTGTTGACGTGAGAGACAAGC AATCTTGTTCCAGTTGAGGAGATAATAAAGTTACAGAGTTTTTAGTTGCG GTGATTTTATTCCTTAATGAATTTTATGTCAGGAAGTTGTTCATCTTATA TTGGTGCTGATTGAGACACCGCGACATAGATCCTAACCTTTGACACGGGA TGTTGGTAGTAGGGAGGTCGTTACTTCTACTCTTTTTTGCAGATTGTACC ACTATATGAGATTTAGTAGAAGTTTGATTTAGAAGAGGTCTCGATGTTTT ATCATTATTCAATACGATGTTAAGTTGGGATATTCAACTTCACTTGCCTC CTACCATTGACGTTTAAGCCCTGAAGATGCTGGGGTTGAAACTATTGGAT GAGATACAAATGAAGCCACTTATTTCTCATCCAAAAAGCGTGAGCCGTGT GGTTTTACACGAACCTCGGGTTGAAAGTTAAATCTATCGCCAGATTTCGA AAAATATATATTATTCGAACTAAGTGCAAAACCTATGGCTTCATTTTTCC TCGCATGAGAAAGGTTGAATCTTGATCTTTGGGTTTCAAATCCAGTGCAT CATCCTCCATGAAATACGTTTTTCGAATATGATTGATTGTTTTATTTAGC TTGTAATAATTTAAACAAGATATGGCACTCTAATTTGTCTAATGCTCTCA AACTTCAAACTTTTAAAAGTCTTATCGAGTCCATTCTTCTATATGGCTTG GAGACTTAGACCAAGACAAAAACCATGCTAAAGAGCCTTAAAAGATGATG GCTGTTATACAAATCTTTTGAAAAGAGTCCAGAATCTTGATTGGCGCAAC CACTCAACCCTTCAAGAAATCTATCATGGACTCCCGAGAATTTCCTCTGT TTTGACCAGCAGGATGCTCTCTTTTTCAGGTCACTGCTTCCGTGCGAAAA ACGAAATCGTGTCAGAAATTTTACCTTGGTGTCCTGCAGGCCCTAGGCGC TCGAGAAAGCGCACATTTCTTGATATTTTGAAACGGGAAACAGCGCTAGA GATTGAGGAATTGGATATTGCAATGGCTGATCGAGAGCTGTGGAGGGAGG GCTATTGTTTATTTCCGACCTAGGTCCATTCGGACGTAGGTCGAAGGATG ATGATGATGATTATGATGATGATGATGATTTAGCAAATGTTTTTGATGGT TGCTGGATAACTTTCCTCATTTTTTATTCTACAGATAACATATGCATTTA ATATGAGCGAACAGAGAACGGCGTCCACTGCACCAACGACAACTTATATT GAAAGCAAAGAGGAAGAAGAAGACGAACGGGTACCAAGACCACATTCTGC AGGTGAGTTCGAACATGTTGAGCGGTCTAGAAGTTTACTTTTAGGTTCCA AATATACGCCTCCCCCGCTTGGAATTTTTTTTCGAAAATTTTCCAACCCC CCCGGACCTTATTAGGACCCCCCCCCCGTTTATTAATTTTAAGAATAATT TAAGCTTTCAAAGAGAAGGTCCCTTATTCGACTCTAAATATCCTGATTTT AGCCTATATTTACCTTATTTTGGGGCTTTCGTTATCACAATTTTCCCCCC CCCCCCCGTTTATTAATTTTAAGAATAATTTAAGCTTTCAAAGAGAAGGT CCCTTATTCGACTCTAAATATCCTGATTTTCGCCTATATTTACCTTATTT TGGGGCTTTCGTTATCACAATTTTCCCCCCCCCCCCCGTTTATTAATTTT AAGAATAATTTAAGCTTTCAAAGAGAAGGTCCCTTATTCGACTCTAAATA TCCTGATTTTCGCCTATATTTACCTTATTTTGGGGCTTTCGTTATCACAA TTTTCCCCCCCCCCCCCGTTTATTAATTTTAAGAATAATTTAAGCTTTCA AAGAGAAGGTCCCTTATTCGACTCTAAATATCCTGATTTTCGCCTATATT TACCTTATTTTGGGGCTTTCGTTATCACAATTTTCCCCCCCCCCCCCCGT TTATTTGGAGCCTAAGAGTACGCGGTGATTTAAACTGTCTGTCAGAGACA TTGACACGAATCTTGAATCATCGAACAAGGTCAGTACACTCTTCCCTCGT CCTTACGGTTCTAAGGGACTGATACCCACAGTCTCCTAAAGTCATAGGCA CAGTCACCTATATGCTTTTTGAGTTTCAGTCTCCCGAACTCCCGCGCGGC ATTTGAAATCAATAACTAATACCATTGAGTTGAAAGCCCCGAAGGATCTA TAGAGATGAAACTTCTCAGTGTGAAGTCAAAGTCAATGAAGCCACTTATT TTACATGCGGATGAAATTTGGCAAAAGCTTAAAGATAAAATAGAGTGTAA GCCTCGGATCTCAAAAAATGAATAAAGAAAATTTAAAAAAGCTGCCAGTC TCACAAGTCTCGTCGAGCCCTTTGTATACACATACATCACATTTCCCATT CAAACGTATACCTATTCTTAATTAACACGAATCCCAAATTGCGACATTTG ATTTAAGAAATTATATAACTTTTAAAATATCTTCTAATTATTTTGCCTTT ATCATTATCTCAATACCTCTATGATACAGTAAGATGGAGGGGGGGGGGTA ATAAATATTGAGTCAACTACAAATGATATATACACTTAAATTTAAATCGT CAAGGTCACGTCAAAGCCCAGGTTGAGTATTTAAAACGCTCACAAAAGAT AAGAACATAAAAATATGATTGAAATCAAGTTAAAAATAGTAGGTAAGGAC GTCCCGCAATATCTTTTATTTTGATAGAGAGAGTGAAATTCTATGAAAAA TACAATAAATTGTGGTTGAATCACTCTCGTTCAATAGATCACGCGAACAT GCCTTAGGAGTTATATAAAAGTAAGCTTTGATGCGTAATAGCATGTATAT CTGGATTGAAAGCGGAAAAATACTGATACACGCCAAAAAACAAAATACGT AATTTATCGGTGTTTTTAGAGGACAGGACCTCATTTTGAAATTCCATCTT AATGTACTTAAGGTGCCAAAAACATTTGTTTTTCTTTCAAATATATTTTT ATTTTTGCTGTGGTTTTCTGGCTGACTTGGTTTGAACAATTCTATCACGT GATTTAAATTATTTAAACATTTTGCTAATATAAGGGTAGGTTTTTGACAT GTCAACTTTAATTAAAGTACAGCACTGACAACGAGAAGAATATAGAACAG AAACTTAAAGTCATTCTCAGCTTACACTGAAACTCAGTCAAACTGATTTT CTTGAGAAATAAATGGGCGTTTTAGAAGGCGGAAAACATCAACATTTACC TTGTCTTATAGATATGGGGCGTGGAAATACACCCGCCAACATGAATGAAG ACTCAAGAAGCAGCCGAATGAGTCCAATCTCAATCAACGGTGATTTGTCA CCTTCACAAACCATGGGCAACATGCGTGCGTTGAGTTTCATGAATTCTGG TAAACGCGGTCGAAAGACGGACCGCGAGAGAGAAGAGGCGGGCGGTCGCC GGGAATGGAACGACAACGAAATATCCACTTTGATCGCTCTGTGGAGTGAC AATGACATTTTATACGACACGAATCACCCATTATACTACGTGCAAAGCGA ACGGAAGCTAGTCATGGAATTCATCAGTAAAGAAATGAACATATCTCAAA GAGACGTCAATGATAAAATGCATAGCCTGAGAACCTATTACTGTTCACAA CGTCAACGAACAGAGGCTTTAGACGCGAAATGTGTTGGAAGCAGTAGAGC TTTTCCACGTTGGAAGTTCTATGATAAAATGTCCTTCTTATACGAGAGTG TCACCAACAGGGCTGCTAAGAGCTCTTTAAACACTACAAGGCGTGGCCGG AAACCCCGGGAGCCCTCACGCGGTGAACAATTGACATCAATGGGTGATCC CTCACAACCGACCATACCGTATACTATGATACCTGGGAACGTCCGGAACG ATTATTCGCCGACGACAAGTTCCGCATTGCGGAATGAGCCCAATAACCTG CATTCAAACGCCCCGGAGCGCACGTTATACTCAGATGAACGTTTTGAAAA CACTAACGGACATTTAAGTCACTCAAGTTCTCCCTTCACGAAATACCAAA TAGTAAGCAGCCCTGAATCAACAGGGAGCACATCTCGGAAACGCCATTGT CCGGAGGATGTATGGGCGGAAGCGCCCTCTCTTACACCAAAAGACATTCA AACTCAACACTCGATACGTAAAGAGAACAATCATACACCGTTTAAAACAA TAGAAGTTCCGTTGAACACGGCGGACGAAATTTTCGGACATATGGTAGCT TGCTCGCTGGCTCAAATGTCGGACGAACAACAAAAAGAACATTTGAAACT CGAAATACAAAAACTGATTTACACTACTAGATTCAAGGCAGCAAATGGAA CTCTATAGCAACTATCCTCTTTCCCTCCAACTTCTGTAAATAATTATTTA TTTTCTTCGGTTCTTGAGAACATTTTCTTATTTGAATAAGTCGATTGGAA AAACTCGTTTTCGAGTTGTTCCGATTTCTTTGCATTTGACATTCGACTAA GTGCTTAATCCGCATTGCTTTTGTATGTTCTTTATTTTTCTTAGGTTTTT GTTGTACATTTGATAAAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015690TCONS_00015690Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015689TCONS_00015689Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015690-proteinTCONS_00015690-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000215supercontigsc0000215:294857..319874 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0.03 0.12 0.03 1.56 1.79 8.24 7.84 2.86 3.16 2.64 2.98 17.66 14.57 20.33 27.8 7.06 11.53 8.47 9.94 9.12 9.44 2.89 7.56 7.17 4.58 8.32 6.42 0 0.06