XLOC_008901 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_008901
Unique NameXLOC_008901
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000222:409308..415645-

Legend: gene
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>XLOC_008901 ID=XLOC_008901|Name=XLOC_008901|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6338bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000222:409308..415645- (Clytia hemisphaerica)
NNGGACACAAGAACACGGAGAACACAAGATTTGGATTCGGGAATTCTGCG AAAATGGGGCTGGCAGGAGGGCTTCACCCTCTTGCATAATAACCCACGAA GAATATAATTAGGACTCGACGTGTTAAAGTTAGTCAATTTTCTGTACTTT TTAATAATAAATATTTGCCATAATGAAGCTCGAAACAGCTTAAGCGCTTA AGTAAACAGCTGACACACAACGTTGTTTCAACGTTCATCTAACGTTATAT GGATGTTGTGAGCGTTAGATAAACGTTGAAAAACGTTGTGTGCCAGCTGG GTAGTTTAAATTTAATTAAAAACATGACTGCATGGTAGTATCTTAATTTG TTTTGTTTTAAATTTGAAAAACACTTCCTTTAAATTGCAATTTTTTCCTA AAGGTAGCCTACTATTCAAGCCGAACTAGTAAATAAAAAACGACATAGAT TCCACGATAAGCGTTTATTTCAACAACATGAAAACCTTAAGACATCTCCC GTATAATATTAATAAATTTTAGTTTAGGGTTTTAAGTTAAGGTTTTAATA CAATATATCGTATATTCAATATAGGTGAAATTAAGAATATAACACGACAT CTAATGGAGGAATGATATTGAATTTTTTCTTATGAGCGGAATTGAAAATG AAGAAGTTTGAAAGATCAAAATTCTTTTTGCTCTGCTTTCTTACGCTTTA TATTCAATACATCGGTGCTAAATTTTATTCAACACATTCGATCAAGCAAC CAGACACCAATTGTTTGGTAAAATTTTTGGAATCAAAAAGCAACTCACTA ACTGAGTGTATCTCACGATGTCGAATAAAAGGACGAAGAAATTTGATGGT TGACTACAGATGTTATTGTGTACCTCATGATGAAAAAGTTGAGGAGAATT GCAAGATTGTTGAATCTGAGNGTGAGCGTTAGATAAACGTTGAAAAACGT 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GCTTTTTCAAATTTTGATGACGCTCATTCCAGTAGAGTAGATTATGAGGC TTTGTAATTTCGATTTCTCAAGGATTCAAAATGACACATTTTTCCATTGA GTTAAGTTTTGAAATGCTTCCTTGGGATTCGGTTCATAGCGTTTAAAGTC AAAACAAGGTAGTAGTTGTCCGCTTTATCATTTGTTAAAAGGCCTATTGC TTAGGGGTACAAAAGTAAGATCATAAAAATCCAGATATTCTTTTTTGAAT GAATTGCATTTTTCAGAATCTAATCATGAACCTTGGAGAGCCTTACAAAG TACACAAAGATCAAGAACTACAAGTTTGGTACGGAAATGACGTGTTGGAT AACTGGGAAGGTAATTGTGTATCTGGTATCAAGCATTGTATAGATGTTTT TGTGAGGTACCATTGACTAAATTGGATCAATCAAGTATTTACAAAACCTC ACTATGCAAGTTCGGATTTTTTAATTTAGTAAAGAAAAACACTTAAATTA TCCAAACTTATTCACTTATTCACCACGCCGTTAACACAGCACCTCTGAAA ATTTTGCCACTGCAATATTTAGAATAAGATACAATGAATACTAAAGTAAT GTTGAAGATGAGCTGTTATATACACGTGAGAGGACCATCAGTGTATGCAT GAATATCCAACATTCAAAGCTTACTATTATCATAGAACTCATGCAGAAGG ACAAGTAACTTCAAACATTGGAACATCCGCGAATTATTTAGAGAATGTTT TAATTACCTGATTCATTTTTTATGGAGATTAATTACTCTTCTAAAATAAG TGAACCTCTCTGCTGTATCCGAGACTGCAATTTTCTTGAGACTTTAACAG TTACTAAAGCTGTTTCTTCAAATCATGAAAAAGCACTGCAACAGTAGTTG ACAAAATGCGCACTGTAAAGCTAAGGGCACAAAATTGGGGAAAAAGCGAA TTTTGGTTGGTGCCTTGTTAGAATGGAAATATGGGGAAAACGCAAATAAC ACCCCTGTGTCACAGACACGGTGGAAAAAATACCCTACATTTTCAACCCC ACTGGGAAATTGCCCTATGATTCTATCCCCATTGAAAATTGAATGGGAAA AATTGGACTCCAAAACCATCCACACTGGAATTTTTGAGCTGGAAACAATA GATTTTCTATCCCCATTGGGATTTCGATAGAAATTTTCGGAAATTTTCAT CCCCACTGAGGGAAAAGGTTCCACCGGGGCACTGAGACAGGGGTGTCAAA TAAGTTTTGAAATTTTTCAAAAGCCAATTTTAAAGGTGCACGTACACCGC TACTGTATAATAAGACAAAACTAGCGAACGAGCTGACAAGATGACAAAGC GACAAATCACCCGTTGTGCACATAGAGGAGTACCAAAAATATGAAAAATA GTTATTATAATGTGTTACTTTGATTTATTTTTTGCATACGTTGAATATAG GCCATATAGTGACCTCCCTGTTTGAAAGCTTGACAAGATGTTTCTGTGTT ATTTTTAAAAGAATTTGTCCGAATATAAATATTCTCAGTTAAAGTTAATT TTCTGTACTTTTAATAATTAAAATTTGCCATATTGAAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015941TCONS_00015941Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015940TCONS_00015940Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015939TCONS_00015939Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00015938TCONS_00015938Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00015939-proteinTCONS_00015939-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000222supercontigsc0000222:409308..415645 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.11 0.13 0.42 0.26 6.02 4.4 6.55 6.38 5.04 5.16 4.7 4.26 5.1 4.32 0.42 0.49 0.69 0.7 1.41 1.52 3.46 3.17 0.67 0.62 8.57 10.24 1.1 2.25 2.12 2.49