XLOC_009058 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_009058
Unique NameXLOC_009058
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000231:36432..60491-

Legend: gene
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>XLOC_009058 ID=XLOC_009058|Name=XLOC_009058|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=24060bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000231:36432..60491- (Clytia hemisphaerica)
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CCGAAAATTAGTACATTCAATGAAAGAGATGGCCCTAAGTAAACAAAAAA ATGTGACGATATAAACTATTACACAAATCATAAAAAAGAAAATTCTTTAA AGGTTACCAGTAATTCTACCATGGAGGTGTCCAAAGGAGAATATACAGTG TAAGAACCCAGAAAATCTTTGATAAACCTTTGGTCTTTTTTTTTGGAACT TTGAGCCTTAAATTCTTTTTATCCTTTTTCTCTTAGGCAAAAGTGAAGTT GTCTTAGGTTTTACATCTAATTTTTTCTAATTTCACTTCATAGACATTCA ATATGCTCAGCGTTCCTTTTACATATCTCCACTTTTTGGTATTTTGAGCC TACACGTTTTTTTTTTTTAAAAGAACGTCAAAAATTTTCGAAGCCTTCGG ATGTTCTTAGTTTTTTGGATTTGAAGCCTAAAAATGTTCTTAAAATGTTC TTATTTTCAGCATTTTTTGAGCATTTTGATGTAATTTCTTAAGAAAATGC ACGTTTTTAAGTCTCCAAAGCCTTAGAATATTCTTAGAATGTTCTTAAAT TTTTGGGCCTCGAAGCCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAA AAAACGTGTAACTTTTCTCAGTCTTATAAAAAAGGAGTGTAGAGTGAAAT ATGTAGAAGGGACGGTAGGTGGCAATCTTTATCAGGCAAGGTCAGTCATC TGCACAATACCCCAGCTGGCACTTGACGTCATATCAACGTCCATTAGACA TGCATAATGTCCAAGTAACGTTATTTGAACGTTAAAACAACGTCGTTTGC TTGCTGCACAATAATCATAGTTTTAGTAGTTGATCGTGGTGGCAATGTTT TTATTTGGTTTAAAAAAAATGTTGATGATTATACATACTGGGTTCAGAAA AGGAACAAACAAAAAATTAGGAGTATGCGTTTTGACGTCATTCTAAGGTT TGTTAGCATTTCTGGTGATGTTATTCTTATATCGAAGGCCTCAGTTCAAT GGAAAAGTATCTTTATAAGCCACGTCGCAAAAAAAGCATCGAAAAAAAGT CACTGTTGTTTATCAAAAGTATTAAATCAAAATATAAACAGGATCTACAT TGGATTCCCTATGATTTTCTCTTGCAACTGGTTGGTCACCATATTGTCAT TTTTGTATGCCTTTAGTTTGTTTTTCTTTTGTTATGTTTTTTTGTGTATA CGTGTTTTCATGGAAATTAAGCTTTATGTAAACCTTTTGGTTTGAACGAG GGGTAATCTTGCTATAAAAAGAGATTGTCCGTATATCATTCTAGAATCAG GCTTCGTGCAATATAGAGAATCTAACTCAATACTGATTTATTGGTTAATT TGAAAGCTTTGGTAGATCTCTCAGTGATTTTTGAGAATCTGAAATTTTGT GCAGCATGAAGTACGATGAATCAAATCTTCTTTCTTTGTCTTCCAACACA ATGGAACTTATTCATGCGTTGAGTGATTGTTTCTTTGGGCCAATGACTGC TAATTGTCAATTGAAGAAAGGTAGATTGGTTGACAAAAGATTTTTTTTTT TTTTGGAATTGGTTCTTAAGTTTTGTTTTATTTGCGTTTTGTTTACAATC GTTTTGAGCTTCGAAAACTACCATTAGAAAATCAAGGACATACTGCCCAG AAACGCCCTATCTTTAACAGACTTTGATTAAAAGACACAATGTGCGTAAC CAAGTAAAACTCAAACATCCCTTTTTGCATCGTTTCTTTTGTAGCGATGG TTTTTCCGAGTGTAATATATCCACCTTACTATAAAACGGCAAATATTGGC CATCCATGGATTTAATATAGATGGCTTCTCTATATTAAATCCATGGGTTA TCTAATAGCTTTAGAAGTAATAGACTTTATTCATGTCTATTTATGTAATT CAACTTTGATTGATTCAGTGTTTAGCTTGCCAAGGGAAATCGAAACTTAC TTAGTAAACCAAGAGTGTTATTGATTTTAACCAAGAATTAGAATAACAGG AAACGAGAAATTTTGACGTTCCAAAAAAAAAGGAACAACACAAATACTAG GTTACTTGCTGTCTTATAATTTTCAACAAATTACGAATTTTAAAAATTGT TTATGTTTTTTTCAAGTTTAGTCAAACTTTAATTATAACTGATTTCAAAG GGTTCATATGAACATATCATAAATCGACAGGCATATAATCATAACGAGCG CAAGTCTGATTTGCAATTGATTTGCAATGCAATCTTTTTCACCATTTAGG CGAAAATTATTACGTCATCATTCCTTTTAAGATAAAAATCATGGGCTCAA AATCAGACTTACGCATATAAATCAACCTTGTGAAAATTTCCCTGTACATT CCCAACATTATTATAAAGAATTAGATCTAAAAGTCAAGTTGCCATGAGTA GTGTTTCTTTCGTAGTAGAAAGACTTTATAGCAGCCCTCCATTACAAGGT TGAAAGTCGATGAAAATGGATACACTAGAGTGCCCTTCAACATTGTCAAG TTTTGTAAAGAGAAATCTTACGACCCTCGACTTGTTTTACATCTAACGTT CTTGTATTCTTCTGTTTAAATTAAAAAGCCCTTTTTGTTATAAAACACAA AAATAGCATCACAGTCTTCTAAACCCCCCCCCCCCCAAGGAGCAGTGCAT AAACAAAGCTTACGGACAGTTCTTGCGAAATTGGCCTAAAAAGTGAAATC AAATTCCTACAAAATTTTTATGAATGAATAAACAAAGAGTATAGTTTTCT GACAAGTAGAAAATTCGTAAAAGTTAAATTCTACAAAAAAATGTTTGCGC AAAAATTTGTTTCCATAAGGTTTGTAAATGGTAGGTGGTGCGAACATGAC CTAGAGTGAATGCTGAGTAAAATTGAAAGCATTCCTCTTCGGATAAAATG GGAGTAATCCTGCTAATACTATAGTGATGAACAATACCCGCTTTATCAAT GTAACTATTTTTAGTGAAAACGCATAATAGGTCGCGATGCGATAATATAA ACAAAAGCTGGCGTTGGATAAACAAGAATTTCTATTCTTCTCAAATACGC CATGACATTGATGCTTTGAAGGATTTGTTGTTTTTTGTGGTTTGGGAAGG GTACCACTTGTATATAAAAGCTAGAAACATGTACCTACTTCATATCACAC TTCTACTTCAAAACACAACAAAATTTGTGAGGTACTTTTGACTCTCTCAC ACTTATAACAAATACGATTTTCTAAATTGGTACTCTTTGATACTCACAGG TGACCCATCGATCAATACAACAATTTTACCGACAGTTCAGCCGAAAACCG AGTACGACCCGACATCACACGACATGCATGCGACAAACGAACAACTTGTA CAACAAATGCACCATCAAACGACGACAAAACCAATTCGAAAGAAACCAAG GATTTTATTTTCACAATCTCAAGTTATGGAGTTAGAGAAGAAATTTAAAG AACAAAAATATCTATCAGCTTCCGAACGTGACCAAATGGCATCAAAATTA AATCTAACACCAACACAGGTAAACTATAAATGACTTGCTCTTCTTTCCAA TGTGCATGTACATATATACGTATATCATTAGCCTTTGCTCATACTCGAGC CAAACCAACAAATTTAAAGGTCGTGCAAGTTGATCTCGGTAGGAGATTGG TCTTAGCTATATCTCATGCGACTATATTGTTAAGGACTTCTATCTGGTTA TTCAGTTAATTGATTCAAACCTATAGTTGCCAAACTTCCAGAATAAATTG AAATGTAACCAAACAAATAGTTCAAAATCCTCAATACAATTCGTAATTTA TTGTGTGATCGAAAGATTCCCGAAAAATCTTACAGAAATTTAGATCATTC ATTCATTGTGTATTCATTTTTTCTTTCCAGGTCAAAATTTGGTTCCAAAA CAAAAGGTACAAGTGCAAGAAACAATCACAAGAATCCAGGCGTGGAATCC ACCCACCTCCCTACGAATGGCCTTCACTCTTCAACCACCAACGTAATGTT CCTGTCTTAGTACAACCACCATCATGCCCGCCCCATTGCTATCGCCCTTC GCCACCATCGGTTAATTTAAACTCGCCTATCCCGAGTGAAAGCTATACCG GTTATTTTCCGGAAAGCTACACTGCTCCACATTACAATAACAATGTTTAT TCAACTTCACCTTATAACCAATGGCCGTGCTACAAGTGATACCATATTGA ATTAAAAATTACGGTGCTCAGTGGGATCTAATTGGTTGGATCAAGGAGTA AATGATGCTTTTTCTTCGTACGATGGTCTAAAAGTTCTAACGGGAAAAAT GAAGCTAGGTACATGTCAAGATGGACGGAAATGATGACCTAAACTGAAAA TTGAACCTTTTTCTAGAAGCAAGAAAGACTTATTTATTTTTTTACTAAAA GCGACCTGGCTGTCGCTCTTGCTTTCGAAATAAGAGAAGAACAAAATTCT TTATTTTGAAAAAACGGAGGAATGAAACACGCTGTAAATATTTTTTCATA TACATTGTACATATTTTTTGTTTTTTTGTTGTTGTTTTTAAGATAGAAAA GATAGGGTTTTAGGGAAATTATAATTGCTGTAAAATAGTGTGCGGACGAA TTTCTCAGAGGAAAATATTGTGATGGAGACCAAAGATTGACAATTTTTCC GTGGTCACACAGTAAAAAAGGCTTCTACAGCCTGGTTTCCATACAAAGGT TTATTACTTTTGGGTACTTTTAAAGGTCATGATTAAAACAAGGATGCTTT TGTTGGGATCTATTGTCAATGATCAAGTTTTGACAAGCTTTAGCCTGCTC CTGCAGCCAGTAGAAAAAATACTTTCACAATCGTCTTTTATGCTGTTTTT GGCTATAAAAACAATTTATGGGTCTTTTGATACTAAACATATCTCTGAGA ATAAACCTCTTGAAATATCATTTTTGGTGAGGACGCATTTTTAACTTATT TTGTTTTATCGCAATATATATTTTGAAAGAGATATTTTTTAAAAGAAATC TTTTTTTTTGTACAGAGTTACTGTTTATTAGGAATATTTTGTTGGAATTG ATATTAAAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016212TCONS_00016212Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016211TCONS_00016211Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016210TCONS_00016210Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016209TCONS_00016209Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016208TCONS_00016208Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016207TCONS_00016207Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
NK2a homeodomain transcription factor proteinTCONS_00016211-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000231supercontigsc0000231:36432..60491 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.03 0.06 0 0.03 1.35 1.74 0.2 0.17 0.35 0.35 0 0.21 18.27 13.65 23.22 18.81 6.1 6.88 2.97 5.12 0.82 0.91 0.81 1.97 2.47 3.33 0.08 0.09 0.17 0.27