XLOC_009168 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_009168
Unique NameXLOC_009168
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000237:190727..201276+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_009168 ID=XLOC_009168|Name=XLOC_009168|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10550bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000237:190727..201276+ (Clytia hemisphaerica)
cgctcataaaatgctgttatctgaaaaatatatgtgtgatttgaagtgcg atatctcacgaatgaaaagtgcatgaaggttgcctgatacaaNAAGATTT TCATTTACAACTTTCCAAGATATATTTGAAGATGACTGAACGTATCTCCA AGGACCGTTTCACATACGACCCTTATACACGTCTCACGTATGGTTACCTT GAATATTGTTTATGGAAAGAACAAAAAGATGATTGGGAAAGACTGAAGTC GGGGAATAATGGAGCGAATAGTCAAGGCAACGAGGCTAAGAATTGTTGGT CAAATTTtgaagacgaagaagaaaaagaagaagttcTAGAGACAGGTATG GATTGGTTACcgtattacacgaatattactaggcaagtattcaacggcct tgaaatttgaacGATCTGAAATTAGCActaatttttctgctttttcaagg aaacagcggctggttttaattaacgcggtttttattaacacgaaattttt caattcgtgttaataaaatgactagtaatgttcgtgtaataaggtaatta ATTTCATCTATTCATTAGGAAAATTTTTATCATAATGTGTTCATATACTT AAAAGATTCAAACCCCTTTACTGAGTTTTGTAGTTGTGAAAGTCTCCATT GTGCGTGATTCTTGGTACTCTGTatcagagtgtatctcacgtttatcgtt tcgtagtacatgtgcgcattgtctgtttgatgaagaatttcccgtacgga gacctctgcgatgaagtatgatttataaatagcaacacttctcttatCAT CTctcctctctcaccaacactccatcgcagcggtcggttttaaaaatctc aaatgagaaaagacaatgacattTGAGACAACAGACCTTCTACGGCAATG AGTTTTGAAAATAGCTGTAGGTCTGTATACAGATAAGATTCTTGGATGTA TGAGACGTATTCAATCGTATGAAATTGGTAGATTTTTCCGTGCTGTATAG ATTCCTAAAAACTTGTAAATACAGAATGGTGATCTTAAATAGGTTGGTTA CTTTCTTTGCACCTACAGATACGTCAGATCCAGTCGAACTGGTGTATCAC GCGGACCGCGCGCTCAGACATTGGAACAATATCGTGGAGAACACTGGTAC ATGGGATTTATTGCTACCCAAATACATGGAGATTTTTTCCTCTTATAACA TTGACAAAGAGGTCTGGAAACTACTTGAATTGCATGCTGGGAATAATTCG GACAATTATTTGTCGTACGTGTAAGTCAATTACCATTTGTTTGTAATAGT AATGATATGACATTGAGGGAAATTAGGGATTAATACCCcgagtttcattt tgaaatagtttgAAATAGCACGAACGAAGTGAGGGCTATTTCAAACTATT TCACAATGATATGAGGGGTATTAATCCTAATTTCACGAAATGTCATATCA TTCCTGGttaattatatgactgattttattattttttaaagagctATCCG AAATGGGGATTCCAGAAGTGAGACAGAAAATTTATGATGTTTTGCTATAA AAATATGATGTATTGCTTCAAAACACAAATCACTTTCAAATTGTTGCAGA TATTtcataaatataatatcaaacaacaaaaccaataATCCAAAATAATC CATAATACAACAATATTATTGGGAAGAAGATTCTTCCAAATTGTTTTTTC GGCTCCTTTGCAAAGACACCTGCATTATTATCAGCGAGTCAGGTTCATAA TCAGTGTCATTATTCTTTCTTTCGTATCTCCACACAAAATGTTCACAAAT GAAGTGTTCAAATTAGCTATCCTATATGATGGTTCGTATATTCTTTCGGA TATGTCCAATGTTCTCCCGTTCTCCTCAAGCCCACGAAACTCCGCCCATT TCTGAAAAGCATTTATCCAAATGTTCgcgtttttgtttttagaattttgc caTAATAAAAGAACAACATCATCCAATAGCTTGAATTTGTCGTcttcttt gtaaatttttcttgTACTTTTCCTCCTTTGACCAGACAGCTACTCAAAAT ATTTGTATCGAataatgtttactttttttgtgATCGAATGTTGCCAAAaa taatcgaatgttttgaaaattcgaaCGTACGTGGCGCGTGAAATTACGTT AGGAGAAAATggttttgatcaaaaatatttaggCGGGAGCGGGGTATTAC AAATCAAGCGGGGTATTACGAAATAATACCCCGCCGAAGGATAAGGGCAT GCAACCTAAATAAAACCAGTCATATAATTACAAGTTTGAATagagatttt taagaaaattaaaagctttaaactAAAGGAATTGCGACTACAGGCAGCAC AATGATACCTTTCCTCTTGTCAGTTGATGAGAGTTTTGAGtgtaatattt atttattaattttctcaaaatctcatttaaatagaccttttcataagtta cgtcacgaacatcacttgcctcgtattcaaacaattaccatggtgataaT GTCccttaagacatttttttttataaatataaagtagttttaataaaatc cgctgagAGTTAATCACCTGGTAatagtttcaaaacgaggcaagtgatgt tcgtgacgtaatttatgaaaaggtctattgttacATATTTCTAAATTCCT GATTTGCTTTATTTAAATATACTTCCAAATATGGACATTGGAAATGCATC CATTAGCAAGAATAATTCCTTTCTAAAGAACTAGTCCTTTTTTGCAATAG ATATCATTTCCAATATGTTTCGGCCTATACTGTCCTCAAGGACCAAAAAT AGGTGTGAACATTTCCTACTttcgaaaatttcgaaattcctAATATGGCG AAACTGGCTTTTTGGATATCTTCACCTTAATCTCTTGGGTATACTTTGGT TTTCTACGAAGCTGCACATACACTCAAACTAACCCAAGAATTTATAAGCG CTCTCAGGAACGTATCCCTCCCTCACTGAACAAGATTCAAGCTAGACTAG GTACCTCTCTCTCTTTCAGGTATCTGATCCTTTGGAACAACACTACAGGA GCAAATGAAATGGAAGACATGCTTCACGTCTATGAAAAACTAGCATCCTT AAATCCGTCTAACGCCTTGTTGCAAAGCTATATGGGTTATTTGAGAAAGT CGAGTAAGCAAATCTGTttttgaatacacgtttttttataagaacaaact gtataagaacgtaaggcttcgatggccaaaatgttaagaacatttcaagg ctttatggaccctaaaacacccaatttcttaggaaaatggacgaaaatac ccaaaaatggtgaaaaccaaaacatgttaagaacatttaagcttaaaaat aaaaaagttaaaggttttgttttaaataagagtgatatcgtttgcttact catcaattttgattcacCAGCTTTTTAACATCGTACGGATGTGGagtaag attggtcagaaagaggaaaagaaaaacagttttttgcttatatcagcata atataacaaaagggagacactgtcctggtatgaaatatgtgtctgatatg aaacaggaacacttatttaagaataaaacctttaagaataGAAGACTTCA AAGatcttggatgttcttatgaaaaatgtgtAAACATGTTCATGAATATT CTATACAATTAACAATATCTCAACATGCTTTGTCAGgcataaataaaaaa gtataaagcGCCTCCCTTTCTCTCCGCAGAACATTTTGGTGCATTACTAG ACTTGTTGGTCAGGCGTTTATCATACACGGAGTGCTCTCGAAGTTTTTTC GATTGGGATCTGCTGGCTTGTTTGCTGCAAGACAATCAACAGTTGGGTCC ACTCTTCCAGGGAAAACTCAGGTACGTTGACATTCATACCACAATCTCCA CCGACGCTTCTACTAACTTTCAAAGATTCCTCCAACCTTCAAATATTCTT CTAACCTTCAGGGCTCGAAGTagcggtcggacatcggacattgtccgacc caatttGCAACCCCTgtcggacattttgtccgacccagttgaaatcgtta tttcgagccatGAACCTTAACAGATTTTTCCAACTTTGAAAGATTCTTCG AACCTATCACGGACGGAAAAATTTGTATCTCTGCCACCTTAAAAAAGTGG AAAGTAGCATTTCcaagtttggaatttttttcagagACAAATGATAGATA AACAGTTAATATAAAGTTTCTATTGACCGCTAGGTGTATAAGAAATTATC TTCTTCTTATTGTAAATGTGGGATCTAGACTGATCTAGAATCTTCGTCTT CGCAACGAAAACAAAAGTGTCATTTGCCGCCTTTGGAAGCCACATCAATC CTAGTCTCAATCACAGAACTTGACAAAACCGCCGGTAGCATAGACAAAAG AAATTTAGCTTATCAAGCATCCTTTGttaggagcacgaatccgttagtgg gtGTCTGCAGCCTAACGTAACACTGCCATACCAATGTAGTTATTTAACGG TCCAAGTTATCATGCTCAACAAAATCTTTGATACCCAACAGTCCTTACAA CGTACACAGTAAACTTTGAGAATTAGTTAAAATTATAGAAATGCTTGGAT AATAGAGGTTTCAATTAGCAAGAGTCAACTATCATGAAATGGTTCAGTGA TAATACTGTATATCTTAAAGGTATTTGGCAATAAAGTAAATATCCAATAA TAAGAAAGCAAGGCAATTTGCGTTATGAATTGAGCTATGGAAGGTATAAA ATGGTTTTAATCTGTAACGTACGTGTGAACAGGGTCTAAATTGATTCCAt gatttttcattatttcagaGCGAAGAGGTATTGGTTTGACTTACACTACC AAAATAATCAACTTGCATCGCAAGAAGGGTCCAAAGaacatgaagaagtt gaagccttgaaaatgaaagtagcAAAAATCGCCGACCTATGTGAGTTACT ATTCCGAGTAAAATCCACTGAATCCTACACACTTTATAAGAAATATCAGA TTTGTAGCATAGGTTTTGCACTCACTTTGTGGTAAAATTGAGATCCTATT TTTTTGTTCTCCGCTAGATGAGACAGTGACACTATAGTCTCTATTAGGAA GAAATGTGTTTGTTGTTGGTGGTTTTTAGATCTCCCTAACGTCTACCTTA AGAGGacttattttggtattttgcctaactaacttcttgagttcacaaaa aagcttcaaataaggcaaaatagaacagatttacgctgtcatttgccaaa attagttcccgccaaaattaaaaagattaatCAATCGCAaaaagttctcg ccaaaattaaaaattctcaGGATTTTTGCcactcgtcaaaattagttccc gccaaaataagttcccttatgGTATTTTAGAATCTGCaagatttttcttt gaatttaaacttttgaCTCTTTTGAAATTCTGTTCCGGAATTCAAAAAAG TGTCGGAAAgtcatttttatttaattacaAGAGATACTTTCGAGATTGGT AATCTTCCATACNAAATCCACTGAATCcactttataaaaaatatcagatT TGTAGCATAGGTTTTGCACTCACTTGGTGGTAAAATTGAGATCCTATTTT TTTGTTCTCCGCTAGATGAGACAGTGACACTATAGTCTCTATTAGGAAGA AATGTGTTTGTTGTTGGTGGTTTTTTGATCTCCCTAACGTCTACCTTAAG AGGacttattttggtattttgcctaactaacttcttgagttcacaaaaaa gcttcaaataagacaaaatagaacagatttacgctgtcatttgccaaaat tagttcccgccaaaattaaaaagattaatcaatcacaaaaagttctcgcc aaaattaaaaattctcaGGATTTTTGCcactcgtcaaaattagttccctt atgGTATTTTAGAATCTGCaagatttttctttgaatttaaacttttgaCT CTTTTGAAATTCTGTTCCGGAATTCAAAAAAGTGTCGGAAAgtcattttt atttaattacaAGAGATACTTTCGAGATTGGTAATCTTCCATACCCTCTT TTCTCTGTAGGCACTTTATTTGCACCACAAGATGATGAAGAAGGAACACT CCCTAACAATCAAATAGAACATACAATACAACTACCTTCTTTTAATGACG AGGATGATGAACAGCTCTCAACCTCTGCTTTGTCAGATACTGACAATGAG GATGAACTGGACTTTGATGTCGATGATGAGCTCCAGTTTGATTTCTTTCT CCAATCTGATTGTGAAGAAAACATCGATGTTGAACCTAACAGAGATAATG CAAATTGTGACGCTGAAAATTACGGAGTTGATCAATCTATAGGAATATCG AATGGTGGAGATAAAAGAGCTGATGGAATTGAATCTAGTGGAGATAACTC ATTGTCTCAAAATAGGAATGGAACTAGTGTCGAAAGCAATAAAACGATGA AAGTTGTCACTATCCCAGTTGCATCTATTCCGAAACCCCGATCCCAATCC GAATTGGATGAACTGATGAAATCGGAACGTCAACAATATATGGATTTCGC TGAATGGCTAGAAGAAGAACGGTTGCTACATGCTCAAAGAGACTTGCCTG TAAGTGTTCTTTTGAACGGAATTGAATATCGGTGTGAAAAGATTGAAAGG GAAGAATTTTTCACTCATGTATCAAAAAATGACAATTCTCTTCGTGATCA GGAGGATGGATACGATGAGAATCTCCAGTTATTTAAAGACGAAGACTTTG TAACGATCCCAAAACCCGATCGGGAATCGGGTTACCATGGACGCAAGTTT ATTGAAGAACCATTACCCGATTGGGACTTAAAATCAAATAGACACTGCTC GTTACCACAACCCGATCTGAACTTTAGCTTCAATGGAGAGGAATCCATCG AAGGCTTAACGTTGCCTGGTCGGGACACGAATTACCATGATATTGAACCC AGTGACAGGCGCAAATCACCCGAACGGATAAATCACTTTAAGAACGATGC AAATTTTGATGAGACGACAAAAAGACGCGAGTTTAGCTTGACTGGATCCA TAAATGTTAATGAGCAGTTTCATTTGAGCTTTTCGTCAGACACGGAGGAG AGCAATCATGAAGTCATGTTTAAAAGAGAATCGAAAAGTGATGCCGCTCT CCCCAACTCTCTGCTAAATCTACATGGAGAAGTTGTAGGAACAGATTCGA TTGAGAATCTTGCCAATCTTGGTTCGAAAACAGTGAGGGAGGAGAGTTAC GTAAAACGAAGACGACGTCTAGTGTTTGAATCAGATACAGATGAAAGCTC TACGCGGGAGAGTGTTGTGCAAGACTCTGAAGATGAATGTTTATTCTCAC CGTCAACGTTGGAGAGCGGAAAACGTCATCATTTGCACTCCTTATTTGAC AAAGACGAAATTATAacttcaacacaaaaagacgaAAAACAACCGAAATA TGATTTCGAAAATCATGATAATAAAACTACGTTTCATCTTATCCATCAGA AGTATGAGACGGGAGACCTAGCTCCTTTGCTACCTTTCAATCGCACAGAA AACCGTGAACAAATTTCAGAGCTACCTACACTTGTACAGGTAAACAAAGG ACTGTACCATTGTGAACCTTATCACAGAAATGACTTTGTTAAAGCTATCA AGAATCAACAGAGAACGAAAACTCGACATAAACTTATTGTACATACTATG AAACCAGATTGGAAAGCCAGGCGTAGGAAACGCACGCAAATGGCTGAAAA CATTATTCAACGCTATTTTCGGAATTTGAAAAACGAAATTACGGAACGAA GATCTGGCGAGAGCTCAAATGAAATTCTACCATATTTAAGTACAGATCTT GAACAGTCTATTGTTAGTCATACCTCGATAAGTATTGATGTCGAAAACAC AGGTCAAAAGTCTTTGAAAAGGAAGAAGTGTACAAAACCTTTGCGTGGTG ATAATAAAGAATCAACATGTCTTAAGAAGCGATACTTGCAAGTTAAACGC CGAAACCATACCAGGCCTATAACGCAAGGCTCAATCTTGTTACGAAGGCA ATTGAAAAAGAGACGAGAGAAATTAGCGATGAGGAAGAAGAAAGAAGAGG AACATAAGACTCAATCGATTTGGGAAAGGACTCGAaattcattacgtaat gttaaaAATTTAATGGAAATTGCTAATGAAATTCGATCGTTTGATAGGCG AAGCACCAAAGAATTGACATCGTTTCTAGAACTTCAACACCGAGAGGAAT TAATTAGAGTGCGTAAATCGTTTGATGCTCCGAAAGGGTTTTCTTTTCAC GATATATCGAAtttatagtttgttttttttgcgtttttcatcaatttttt aacGAATTNTATCGAATttatagtttgttttttacgtttttcataaattt tttaaCGAATTTCAGTCGACATAGAGTGGACTTTCATTCATTATTATTCT TCAGGCGAATTCAGTGAATCCTTGAAGACAGTGAAACTTGGGGAAAACTA GGAAtgggcttttctagaaaaaaattgaatataaggGTTGGAGGAtacaa cattttttggaaatttaccggacattgtgaattttgacccccccggacaa cggatctaaccccctggacaagcatcagttgacccccggacattcaaaat caacCCTAATCAGAGAATGTTTGCCcctaaaacaaggcaaattttgcaga tttttcactacccggacaaaatatccaaaatatcCTCCAACGCCATGTAC AaagattttctggaagagcccaatgaagATTATAAGGAAACTTATACGAG CTAAAGTGATGACGCTAAAGCTTCAAACTTACACATGCAGTCTTCATAGT ACGAGTTTCATTTCATTGAAGGTTGAAGTTGAGCGAGTGAACTTGTTTTT TAATGACCAGCAACTGAAATTCATTCCTTGcgtttttttcagaatttttg agttttgataaatttgttaaCGTTTTTTagaattatatttatatatggtt tattattcttaaattttcaaaatgtttttttttgtatatcAGATTAAAAG GATATAACCACTTGTAAGTGGGTCATTCAGGTAAAATGAGGTACAGGGAT GCGCCACTGTTATGTGCCAACTGTTCAGGGTCATTTTGTTAATCTCTGAA AATACCGGACAGGATGGCAAATTTGTTGAATCTTGAAAGCTCGAAATACT TCTGATAGGGTCCAAATTGCATTTGACAGGTTTGATTTTCGCTTAAAATT GACAGGTTTGATGTTTTGAACTTCAATGGCCGTCAAAACCAGTACCTCCT GAATCCATAGGATTTAGGATAGGATTTGGTTTGAGTTTGTCAAGCCTATA ACAAACACAGACACTCAGGATAATTTTATTCTCTGATGAACGCTTTTACA CCCCCTGTGTCACAgctccggtggaactttttcccttggtagggataaaa attcctattgaaaccCCGATTGGGATATAAATTCTCTTGTTCCAAAATCC AGTTGGGATGGTATTGGAGTGCAATTCtttaacattgaattttgagtggg gatgaaatcaaagtcagttcccgagtggggctaaaattccagggtatttt cccactggggcgaaatttttgacaaattttccagtggggctggggtccca ttGGGTCTATGACACACGGgtgtacacccctgtgtcacagacccggtgga aatagaccttatcggagtttttaattttttcaaaaaagcgatgcattgtg ggattgtttcgagtgtattacaatagaattccctagaggaattcctaaga gatttctattgtaatacactcgaaactatcccacaatgcatcgctttttt agaaaaattaaaaactccgataaggtctattgaatcagattgaatttgtt ttcatccccatttgaaattcaatgaaaaaaaaaacatctccactggattt tttgacttttgaacaataaaatttctatccatATTGGGATTTTGATAAAC ATTTTCATCCTCAACAAGGGAGAAAGTCCCAcggggtctgtgacacaggg gtgttaaatgataaaatgataaaaattctcATTCTAACTGTGagaagaag ttccaccggggtcACGAGACTGGAGTGTCATATAGCTTTTTTGTCAAAGG ATGCTGTATAGTATATAGTGTAATAAGAACAAAACGGGTTTTGCATTTAT AACTGAACTTACTATAGAGGGATTGATGTTGGCAACCTATTCAGACACAA CAGTATTTTCTATGAAAATGTCAGCGGTTGGTATTTTTAAGAATtagtgt tttttgaaaattatttttagaatttatcaATAATAATCAGCCAGACGGTA ATGTAAATAATTTAAAACGATATATCTATAGAGAGATTTGCTTGCttgct ataatttttgaaaatgtctttCTTAGAAAAGAATCGTTTTTGAAACGTTG ACTCATTTAACTTTGTACTAATGTTTAGCTTATGTAACCACGGTTATACT TCATTCAAGTCAAGAGTCTGATTTTGCAATATCTTCTTAACAAGACCTCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016413TCONS_00016413Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016414TCONS_00016414Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00016415TCONS_00016415Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016414-proteinTCONS_00016414-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000237supercontigsc0000237:190727..201276 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.05 3.12 1.3 0.94 9.58 7.24 5.68 6.06 3.3 4.11 4.12 2.73 2.49 2.23 2.94 3.04 4.8 3.65 1.45 1.8 3.82 3.57 3.75 4.53 3.96 4.72 1.53 1.15 2.6 2.42