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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000252:308698..322049+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_009404 ID=XLOC_009404|Name=XLOC_009404|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=13352bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000252:308698..322049+ (Clytia hemisphaerica)
ACGGGCGGTGTGGTAAAGGCGGGCGCTTACCTTTATTAATTCTAACCGCC
CAAATTGATTGACAGGATGGTAGGGACAAAAGGATTGTACCAGTGCATGC
TGGGTGATTATCCTTTTTCTATCCACAATGCATAATCGGCCTCCTAATAT
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CTTAATTAAAGCCTTGTTTTGGTTTAAAATAAACGTGTTTACCTTGCTTT
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CCCtatctttcttgatttttatcCCTTTTTTTTCCTAGAAAACtttttac
cgtcaactgctctaacttgggacgattggtcgaaacatgggactgttgat
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ttttgataactccaccaagtttatcaatcatactttctgtcataacatgt
cacaataactttcactgatagtgtgcccttcttaacttttttgttttcat
tcaaaatgaccggacaccgattggagaattagaacgcccgccgcctaacc
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gagtgacgtcaaacgctccatcgttttgccactaatttggtcttcttcgt
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gaaatttatgacaaaatttgactaaaaggcaaaacatcttgaattttcct
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AATCTTCAAAAAGACACCCTTATGGATAGCACATACCTGTACCCTTCCCT
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TGTTGTGTTAGATTTATTATTCATGTAAGGCTTAGTTTAGAAGAcattga
aaattacaaaatgttaATATTTAAGTAAGCCTTTGACTAGAGAATGGCTT
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GTCTCATTAAACagttaaaatgttttcaacttataatgaaataataaaaa
aataaaaaaactttgccTCTTTCCTGAAAaggctcaaattttgaaatatt
ttatttatttcagagTGGAAAGTCTGACAGCTACACTGTTGAAACTAAGC
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taacgtgttgaaaacgagcatgcaaaacagcaaatgacATCATTGACCTC
ATTGACATgaatcaaagtgaagacaggaaaaaaattttcaaaatcaccgA
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cactgAGAgttacttctcattggttagatgcttgaaattttattaaatgg
TCTCCTACCGACCGGGCCTACAGAACAGGCGCAGGTTCACCCGGTTGAAC
ACgagtttcaaaaatcgtcaattttttacccattttttgcctttaCAGTT
TTGCCTGTAACATTAGTCTTTGGCCAATAAAATATTTAACCAGGCCTTAG
CAGCGGACCCCCCTCGTGAAAATGTCTTCAACTACAttcaactttccaat
aaaattctagcctggaaatccagactcaaaatttcagaaaagaaaatctt
tcctcaacatacaaagtttctaaaattttagagtggTGTGACTAAAAAAG
TTGGGTACAGTTTGCTTGATACTGCCTGtaagtgaacccttgttgacaga
ctatcaaaactttgaaaacccaggcagacacaaaTATAATTAAccaatta
ggtgcactcacatatgcAAGGAGAAAAAGCCGTAAAGCAGAAAAATAATC
Ttgaaaaaactagacggtgaaatagtttacggtctggatatccatgctaa
taaaattcatgtggttataatgtgagttaacagttaatgtgacagatcca
gaaatgaccattttcactgttcacGCGTTGAAacgatgaaaaatgtttca
atctagttcaaatttacccatgagctgcattttagtgtccattaacagat
tccagagtcagtttatatactttaaataattatgtgagtagagtttgaaa
aatcaagccaccaaccGTTTAATGCGACAAATCCAGAAATGACCCATCAC
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ttagcgctgggccaaaaaggcATAACAGAATTCTTTAGAGACAATAAAAg
tcacttttttataatttaaagTCTTTTTATGATTCAGAAAAGTATTGTCT
GATAACTGGACGCTAAAAAGACATGAAAAAGGTTCTACTTTGGGTGTGAA
AAGatcttattcaaaattaccaacAAAGGCTGACATTTGAATCTATAAAG
GGTTAAGTGTTTTAAATACCTTTTGTCTATTGATTTTAATCTGCAAACAA
CTACATTTCAACAAATAAATTGTTAATTGAACAAGACTAttgaccttttc
gcctttccatctgcAATCTTAAATTGTATGCAAGAAATTTTTGTCCTGGT
CATATATCATAGGAAAATATATGCAATAAGATATAATTAATTTAACTTGT
TTTAGACCGAACATTCATCTGATTTGGATACGTTGTTGAAAGACTACGAA
ACCTCATTAGAAAAAGGTTTGACAAATGAAAAGGCTGCTGCTAATTTGGA
AAGAGATGGACCCAATGCTCTGACTCCACCCAAAACAACACCTGAATGGG
TGAAATTTTGTCAGCAATTGTTTGGTGGCTTTTCCATGTTGCTATGGATT
GGTGCTATCCTTTGTTTTGCTGCTTTCACTGTACGCTATTTCCGTGAAGA
AGATCCTGCAATGGATGAGTTGTATTTGGGTATTGTGTTGGCTGTTGTTG
TCATCATTACTGGCTGTTTCTCCTACTACCAGGTGCGACATATTCTGAAT
ACTTTTACTTTTCTAAACACCTATTTTAAAATTCTACAGTTTAGTTCATG
TCAGGttaaacaaaaatatatatacaaGGCATAAATTGACTTGATTTTAA
AAACTCCTTATTTTTAGGAAGCTAAAAGTTCAAAGATtatggaaagtttc
aaaaagaTGATACCCCAAGAAGCTTGTGTTTTGAGAGGTGGAACCAAACT
CAACATCAATGCAGAAAATTGTGTTGTTGGTGACattgtttttgtgaaat
ttggtGACAGAGTTCCTGCTGATATTAGAATTCTTGAAGCTCAAGGATTC
AAGGTTTGTGTTCATAGCTTAGGATTTGTCATTTGAAGAAANCAGACAGA
Tagaaagttgcaaatgaaaggcctaccgcttagcgctgggccaaaaaggc
ATAACAGCATTCTTTAGAGACCATAAAAGtcacttttttataataaagTC
TTTTTATGATTCAAGAAAAGTATTGTCTGATAACTGGACGCTAAAAAGAC
ATGAAAAAGGTTCTGCTTTTGGTATGAAAAGatcttattcaaaattacca
acAAAGGCTGACATTTGAATCTATAAAGGGTTAAGTGTTTTAAATACCTT
TTGTCTATTGATTTTAATCTGCAAACAACTACATTTCAACAAATAAATTG
TTAATTGAACAAGACTAttgaccttttcgcctttccatctgcaatcttga
attgtatgcaagaAATTTTTGCCCTGGTTATATATCGTAGGAAAATATAT
GCAATAAGATATAATTAATTTAACTTGTTTTAGACCGAACATTCATCTGA
TTTGGATACGTTGTTGAAAGACTACGAAACCTCATTAGAAAAAGGTTTGA
CAAATGAAAAGGCTGCTGCTAATTTGGAAAGAGATGGACCCAATGCTCTG
ACTCCACCCAAAACAACACCTGAATGGGTGAAATTTTGTCAGCAATTGTT
TGGTGGCTTTTCCATGTTGCTATGGATTGGTGCTATCCTTTGTTTTGCTG
CTTTCACTGTACGCTATTTCCGTGAAGAAGATCCTGCAATGGATGAGTTG
TATTTGGGTATTGTGTTGGCTGTTGTTGTCATCATTACTGGCTGTTTCTC
CTACTACCAGGTTCGAATACTTTTACTTTTCTAAACACCTATTTTAAAAT
TCTACAGTTTAGTTAATGTCAGGttaaacaaaaatatatatagtatTTTC
AAGAGTTTAGCAAGGTTTAAATTGACTTGATTTTAAAAactctttatttt
taggaagCTAAAAGTTCAAAGATtatggaaagtttcaaaaagaTGATACC
CCAAGAAGCTACTGTTTTGAGAGGTGGAACCAAACTCAACATCAATGCAG
AAAATTGTGTTGTTGGTGACattgtttttgtgaaatttggtGACAGAGTT
CCTGCTGATATTAGAATTCTTGAAGCTCAAGGATTCAAGGTTTGTGTTCA
TAGCTTAGGATTTGTCATTTGAAGAAAGCTGGTATGGTCAAAGCCCCCTA
AAAATGTTCACTCCTCGAAGATTTCAAAAAGGTGCAGGAAAAAGACCTGT
TTTCGCTTACTAGTCTGCAAAAATCAAAAGGTGTGTGAATTTGTATCCAC
AAAAATTGATGGGGTTAAGGTCTGCAATTTCCAACACAATTCAGGTATGT
GTGATCAAATTTGCTGAGTTTAACAGATACTCATTTaactttttcaatat
attttaggTTGATAATTCTTCCCTTACTGGAGAGTCAGAACCACAAAGCA
GAACCCCAGAATGCTCCtcagaaaatcctttggagaCAAAGAATTTGGCT
TTCTTTTCTACTAATGCTGTTGAAGGTACTGCAACTGGTGTGGTAATCAA
CATTGGAGACAATACTGTTATGGGACGTATTGNGAATTGTATGCAAGAAA
TTTTTGCCCTGGTTATATATCGTAGGAAAATATATGCAATAAGATATAAT
TAATTTAACTTGTTTTAGACCGAACATTCATCTGATTTGGATACGTTGTT
GAAAGACTACGAAACCTCATTAGAAAAAGGTTTGACAAATGAAAAGGCTG
CTGCTAATTTGGAAAGAGATGGACCCAATGCTCTGACTCCACCCAAAACA
ACACCTGAATGGGTGAAATTTTGTCAGCAATTGTTTGGTGGCTTTTCCAT
GTTGCTATGGATTGGTGCTATCCTTTGTTTTGCTGCTTTCACTGTACGCT
ATTTCCGTGAAGAAGATCCTGCAATGGATGAGTTGTATTTGGGTATTGTG
TTGGCTGTTGTTGTCATCATTACTGGCTGTTTCTCCTACTACCAGGTTCG
AATACTTTTACTTTTCTAAACACCTATTTTAAAATTCTACAGTTTAGTTA
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TTTAAATTGACTTGATTTTAAAAactctttatttttaggaagCTAAAAGT
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GTGACattgtttttgtgaaatttggtGACAGAGTTCCTGCTGATATTAGA
ATTCTTGAAGCTCAAGGATTCAAGGTTTGTGTTCATAGCTTAGGATTTGT
CATTTGAAGAAAGCTGGTATGGTCAAAGCCCCCTAAAAATGTTCACTCCT
CGAAGATTTCAAAAAGGTGCAGGAAAAAGACCTGTTTTCGCTTACTAGTC
TGCAAAAATCAAAAGGTGTGTGAATTTGTATCCACAAAAATTGATGGGGT
TAAGGTCTGCAATTTCCAACACAATTCAGGTATGTGTGATCAAATTTGCT
GAGTTTAACAGATACTCATTTaactttttcaatatattttaggTTGATAA
TTCTTCCCTTACTGGAGAGTCAGAACCACAAAGCAGAACCCCAGAATGCT
CCtcagaaaatcctttggagaCAAAGAATTTGGCTTTCTTTTCTACTAAT
GCTGTTGAAGGTACTGCAACTGGTGTGGTAATCAACATTGGAGACAATAC
TGTTATGGGACGTATTGCTAACCTTGCATCTGGCTTAGGATCAGGAAAGA
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GCCGTGTTTTTGGGTGTTACCTTCCTTATCATCTCATTGGCTCTGGGTTA
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TCCCGGAAGGTCTCCTTGCCACTGTCACTGTAAGTTACGCTCATCAAAAC
TGTACTTATATTATGTATCAGCAGAACATTTTTTGCTTTGGCAATTTGAC
ACcaatgaatgaaattttgacattGCCAACCATCTGGTTCCTAATATCAT
ATTGGAATATCTTACAtaaagaaaaacaccaaaataaaatgttaaaatac
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TGCTGTCTATTGTTAACCTTTTAGGTTTGTCTGACCCTTACTGCAAAGAA
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TGATACAACTGAAGATCAGTCTGGAATCTCCCATGACAAAGGATCTGAAA
CATGGCAAGCCTTGGCGAAGATAGGAGCTCTGTGTAACCGTGCTGAATTC
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CTTGGACTAAAACAAAGAATCCATGAAATTTCCCTTAACAGataactgaa
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AAtttttgacatggattcatgtataaaacacctAATTTGGTCATctagtt
ccgttattacgggatttttaggttttgcctgaaaaggcttatgatgacgt
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TGCCTCTGAGActgctattttgaaatttgtcgAGCTTTCGGTTGGTGATG
TAATGGGTACCCGATCCAGAAACTCCAAAGTTATTGAAATTCCATTCAAC
TCAACAAACAAGTACCAAGTCTCCATTCACAAACAAGAAAGTGAAACTGA
CAAACGATACTTATTGGTCATGAAAGGTGCTCCAGAGAGAATTTTAGATC
GATGCTCCACCATATTGTTGCAAGGAGAGGAAAAACCATTGGATGATGAA
ATGAAAGAGGCTTTTAACGAAGCTTATCTTGAGCTTGGTGGACTTGGTGA
ACGTGTCTTAGGTTTCTGTCATTACTACCTCCCTGAAGACCAATTCCCTG
CTGGCTTTGAATTCGTTGCTGAGGATAAAGCCAATTTCCCTCTTGACAAT
TTATGCTTTGTTGGTTTAATGAGTATGATTGACCCTCCAAGAGCTGCTGT
ACCTGATGCGGTTGCTAAATGTCGAAGTGCTGGTAAGCATGTTACCGTTT
TGTACAAATGGGAGTCTATCAGCTTTTACCTAATAGTATCAATAGAAACT
CTTTTCCACAAAATTATAATGCTATATACTAAGTTCAGTCACACCAAATA
TGCTGTGGAATGAAATGAGCTGGTCTtgatgtttaaaagttttctcatTT
TACTTTTAAAGGAATCAAAGTTATCATGGTCACTGGTGACCATCCCATCA
CAGCAAAAGCTATTGCTAAAGGTGTTGGTATCATCTCGGAAGGAAACGAG
ACTGTTGAAGACATTGCTCAACGTTTGAACATCCCTGTTAGCGAAGTCAA
CGCACGTGATGCACATGCTGCTGTCGTTCATGGAAGTAAGTATTGATTGC
TGTTCATGGGACATTTTAGCACTCTAGTTTCAGGATTTTGTCTTGACGAT
TAAACCTGATTAAACGGCAAAAAGTCCAATTAAGCAGTTTTGGGAagttt
ttaaaaaggtttttgtGCTTCACAtctattttcaatgtttttaaccTTTC
TTTCTTAACCTTATTCTCCTTTGGCAGCTCAATTGAAAGATTACTCACAA
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TACCTCACCACAGCAGAAACTGATCATTGTTGAAGGATGTCAACGTCAAG
GAGCTATTGTTGCTGTTACTGGTGATGGTGTCAATGACTCGCCTGCTTTG
AAGAAGGCTGATATTGGTAAGTGAATTACTTCCAGTAATCTTGCTCTACT
AACTCTGTTGCCCTACAAACGTGCTCTAACCTCTATGAAGTTCTCATGTT
GGTTAATTAGGAGCTAGCTGCAGTTTAAAATTGACTTCAAGGATCTAAGC
GTAGTTTTCTGTAACTAGGTGTTGCTATGGGTATTGCTGGATCTGACGTC
TCCAAACAAGCCGCAGATATGATCCTTTTGGACGACAATTTTGCTTCCAT
CGTTACTGGTGTAGAAGAAGGACGTCTCATTtttgacaacttgaaaaaat
cCATTGCTTACACGTTGACCAGTAACATTCCTGAGATCTCTCCCTTCTTG
ATGTTCATCTTGTTGAGTATTCCACTTCCTCTTGGAACTATCACCATCTT
GTGTATCGATCTTGGAACTGATTTGGTACCCGCCATCTCTCTCGCTTACG
AAAAGGCCGAAAGTGACATCATGAAACGTAAACCACGTGACCCCATCCGT
GATAAATTGGTGAACGAACGTTTGATCAGTTTGGCTTACGGACAAATTGG
TATGATTCAGGTAGGTGATATAAAAGCTAGCTCCTTGACATTTCCATTTT
GTCTTGCTGTTGTTTGTTAGTGGCTCTGACTGCGTTAATAATTATAATAT
CTGATAGAATTAATAGATGCTGATGATGGTAAGAACCGAGTTACaagtgg
cccccaaaacgtaggttgtcattaaaatgagggttctgacctgtagattt
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AAAAATGagtatgtttttgatggttggagacgaattcaaaataacatatt
tgcgtctgaaggacaTATTTCAacactaaaatttgataaaaattgcatat
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aTAAACCATTTAATATCATATTCCCGTTTTCCCTTCTGCAGGCCATTGCT
GGATTTTTCACCTACTTCGTCATCATGGCAGAGAACGGATGGTTACCAAC
CTACTTGGTGGGAATCCGCTCCCAATGGGATGACAAGCAGAACAATGCAG
TCCGCGATTCTTATGGTAGTGAATGGAGTTATGTTCAACGAAAGAATTTG
GAATTGACTTGCCACACTGCTTTCTTTACCACCATCGTTGTTGTCCAATG
GGCTGACGTCATTATTTCAAAAACCAGAAAGCTTTCTGTCTTCCAACAAG
GAATGAAGTAAGTgttattcttttttattattctgATGTGCAACTCGTGA
AGTAATGAAATCACAACTAAAATAGTTCTCGATAGCTCATTCGTAACGCT
TTCTTGGCTGAGCCTCGTTATCTTGCCTTTTCAAATGGCTTTCAATGATT
TTGCCGAAGGCGTGAAGATAGCagatatttattttaaatggtCTAACGAA
gtcttcattttgtttttttagcaaCTGGATGTTGAACTTCGGTTTAGTTT
TCGAAACGGTTCTTGCTGCCTTCTTGCAATACACCCCTGGATTGAACGAA
GGGTTGAAGCTGCGTCCACTGAATGCTTCGTGGTGGTTCTGTGGTGTCCC
ATTCTCTCTCTTGATCTGGGTTTACGATGAAATCAGAAGATACTTAATCA
GAAAGTATCCAGGAGGtacatcttcaattttcttcatGGTTCTTAGCGGG
CTCAGACTAACTCACCTTGAGTTGAAGATTTTTTCTGGCTTGGGTATTTA
CCTCATGTGTGATTATCTCTCATTATCCGTTTTCATTATCAAATTGTTCA
GTCTTTGAACCAAGTTTTCATTTCTATTTTCAGGATGGGTCGAGCACGAG
ACCTATTATTAGGAAACAACACACGGGTTAACAGAAAGTCGGACTTTGAA
CTTGGACATGGAAATGGAAAACattctcttttttatttttcccttATTTT
TTTCTAACTAGTTCTATTTTTTGTTAGAGTGCATTATATAAGCACTTTTC
CctactttcttttattttcgaagATACTTTTAGCATGCAAAAtctggttt
ttgtttttgtttttattggcaGAAGGTCGACACAAAGCCAGTCTTTGACA
ACCTTTCTTCAGATATAAATGGAAATTTTTCCCACCATCCACtagtctga
aaaataaagttTACGCATAATTAGACTCGAAATAATCTCCTCACAATACA
GTAATTATTTTTTgatcaacaacaaaagaaatccatttcccgaaacaaac
tcccttaaggtggtcgttaacaaactttttgaaaatgtcaaaaaatattc
aaattgaaatatctcaaaatgtaTAAATGACATATTGTTGAAACTTTGTA
TGATGGTACTTCATTATTATGttgttctaaaaatagaaaaaataataaaa
aatatcaaagacgggggtcatgacgtcacttctaaaaatagattCGAAAA
TCTCTTGGCAGAAAAATCTCAGCAACCAGAAGGAGTTAGCTTTTGATATT
NN
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000252 | supercontig | sc0000252:308698..322049 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
| Ortholog Name | Description | Organism |
|---|
| ATP1A1 | sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 isoform c | Homo Sapiens |
| ATP1A2 | sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 proprotein | Homo Sapiens |
| ATP1A3 | sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 isoform 3 | Homo Sapiens |
| ATP1A4 | sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4 isoform 1 | Homo Sapiens |
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