XLOC_011076 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_011076
Unique NameXLOC_011076
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000333:129541..182939-

Legend: gene
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>XLOC_011076 ID=XLOC_011076|Name=XLOC_011076|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=53399bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000333:129541..182939- (Clytia hemisphaerica)
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNAGAAAAGAGACGCAACTTCACCCCTTCGATTCTTTTTATTTGGAG CTTGATTTTTTGTATATGGGTCTGTTTTCAACGACTAGTTTACTAGTCTA GAGTCCCCATAACTTTGAATAGTTGGAAACTCCACTGTATTAATACAGTT GATGCTCTCTAATTCGATCTTCAAGGGGAATTGGATTCTTTTCGAATAAG GGAGCGTCGTTTATGAGAGTTTCTTGTTAACGGGGACTAAATTTCATCAA ATAAGGGAGCCTATCGAATAGTAGAACGTCGAATAAGAGAGCTTCAACTG TATTAATATTCACATTTTCTCTTTAGACACAAAGCGGTATACACATACAA GCCTACCAACGAAGATGAAGTTGAACTCAACATCGGAGACATTGTCCACG TCCTTGAGAAATGTGATGACGGTTGGTTTATCGGAACCTCTGGACGTACC GGTGTGTTTGGAACGTTCCCGGGCAATTATGTCACGCCCGTATGATGATT CGAAACTGGTATGACGTATTGCTACACAATCTTGTTCAATATTTTCATTG GCAACTGTTATCAAGGAATTCGGTATCTTTTGAGAGATAAATATTGAATT TGGTTTCGATGATGTGGATTGGATGTTATGTGGAAGGCCATAAGGCCATA TAGGAAGGTAGATCTTGAGTCGATTATGTGACTGGACTTAAGAGTTATGG CGCAGGTTTATAACGAAATGAAAGGTTATAAGAGGTAATTCTAACAATGA ATCAGCTCTAAGAGATTTTGACTAAAACCAAGGAATAAAAACTAAAAGAA TATTATAATTTTTTTGTCACACATATTTCTGTTTGTTTGTGTCTTTATCA ATTTTTTGTATCATATGCACTTTATATAAACAAAATAATTTTTTCTTGTA TTTTTGTCTATTTTTTGTTGATTTTTTTTTTCTTTTTGTATGTTGTTTTT TTACTCAATTTCAATTCAAATATTAAGATTTTAGGTTTAATGATTATTGT CGCATATTTGTCATCTCTACTCTACCAAGAATCATTTGAGGCTTTTTAAT AAACCTTTTCTTACTATTAGACGGAAATTTTCATGTAAAGGGTTTGCCTT TTTTTTCCCAATTTTTTCATCTTTCAACTTTGTCGATTTTCTACCTGCTG CTAAAACTTCTTGTATATTTCTACAGAGAATAAAATTTTGTAAAATTCTT TTCTAAATTTAAACCCTCGATCCAGATTCACTATGGTTGGTTGCGACAGT GATTTTAACCTTTCATTTTATTTTACTTACTAGTTTCTTTGCTTTTGTTA ACAGTTCTGTCAAATTTTTAGGGGTATCATAACATGTAAATAGAAAAAAT TCTCTAAGATTTTCTCAGTATTTGTTAAACAGACTATTGCAGTGAAAAGC ATAGTCTCAAGGAAATCAAATATGCTTTTTATCGATACTGAGGTTTTATA TATTAACCTTATTACACGCTTTTTTTATGTTCTAGGCTACTTATATATGT GTAGGTGAATGAATTTCTGTTATAAAACGCTTGAATGTCTTGCATCTCAT AGTAAAAATTTGACTCGGGCAAACAACTTGGCTACAAGTTTTTTTATAAG AACATCCAAAATTTTTGAAGCCTTCGGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTT AAGCCTAAAAATGTTCTTATTTTGACCATTTTGTGAATATTTTTTATCAT TTTCCTAAGAAATAAGGTGTTTTTGAGTCCATAAAGCCTTTAAAATGTTC TTGACTTGTTCTTAACATTTTAGCATGTTCTTATATAGTTTGTTCTCATA TAGTTTGTTCTCATAAAAAAACTTGTAGCTAGTTAAGAGAGCTTCATGGT TTCGAAGTTCTGTAAGTCTAGATGAGAGATGTACTTTAAAATTGGTCATA TTTTCGACATCACAGCAACATAATAATTCTTTTCAAAAAGTCTCTTTGCT CTACTACTATGATTTTATTCAGTTTATCATAAAATGAAATTGTATAAAAA AACTTCTAGATAATTTGATAATATTGAGAAAAACATTTTCTATTCAAAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00019684TCONS_00019684Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019683TCONS_00019683Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019682TCONS_00019682Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019681TCONS_00019681Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019680TCONS_00019680Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019679TCONS_00019679Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019678TCONS_00019678Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019677TCONS_00019677Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00019676TCONS_00019676Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00019680-proteinTCONS_00019680-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000333supercontigsc0000333:129541..182939 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
16.87 16.14 27.85 27.07 33.78 24.74 51.43 55.35 37.08 46.55 32.52 25.98 48.23 46.06 27.71 28.98 45.62 39.66 44.97 48.01 46.11 47.65 22.07 28.88 50.83 45.69 45.48 49.93 50.49 56.77