XLOC_012711 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_012711
Unique NameXLOC_012711
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000429:27040..69947-

Legend: gene
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>XLOC_012711 ID=XLOC_012711|Name=XLOC_012711|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=42908bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000429:27040..69947- (Clytia hemisphaerica)
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ATGCAGCGGCTGCAGCAGTAGCCATTCAAGATGTCAATAATAACAAACAT TTGCTAAGTAGAAACCAACTTCGATATGTTTGGAATACCAATCATACAGA TACGCACTGTGTTGAGAAAGAAGCAATCAAAATAATGATGGGTCAACTTA ACATGAATGTTTCTGGATTCATCGGATTTAACTGTTTTTGTCGTACAGTT AGTAAAATGGCAGGAGCTGTGAATTTACCACTTTTTTCTATGGTAAGTGT GTGTGTAAGCTCTAACACACTTATTTTCAGCATTCAGTTTTCAATGAATC AGAAATCAAAATAAGGTATGAAGTACTTCTTCTTTACTTCATCTTTAGTC AACCAATTTCTATACATTCATGATATTTCAAAAAAAGGGACAAGTTCTGT GTTTTTTAAGATACATTTCTGTTTGGCATGGCTCTAAAGTTATGTTTGAC TTTGATTATTAAGGTTTTTCAAAGTTTTTATATATAATCCTATTTTGGTA TTTAAAAAAGATCATGAAAGATGATTCATTCAATGTTTATATAAGTTAAA TGATAACATAAATTCAAAAGGACACAATTTATCAAATATTCCGGATCAAA TAGGCTATTGCATTTTATTATAATTTTCCAGCTGATTCTGTCCAACATGC AGGTCAGTTACCGTAAGTTGGTCTACTGTAATGTTGACATCCCTCCTCTA ATTTCTTTGCCTAGCAATTAGAGAGGAAAAATCTTTTGTCTATCAGTGAT TTTGACCTTCCAATTTTTCCTATCTCTAAAGAAGGGTGTCATAATTAGAA GAGGGATGTCAACATTAGACCAACCTAAGATGTATGAAATTTAAAATTGA GTGCGAGGATTTGCTGCTTGGTAGGGTAAGTTTTTGACAAGATTCCCTGA ATTGCCTGAATTCAAATCAAAGTTCTTTGTTCTCTTCATTTCTGCATCAA ACATCAACAAGGATGAATATGTACATTAAACTCTAAGATTTTCAAAAGGT TAAAAGTTTTAAAGCATAAAGGGTTTAAAAAAACAATTTTACTTTTCTTG CAGTTATATTCTTTTTTACTACTTATAAGATTTTTTCTAAAAAGCTCAAG AAAAAAATTTGGTTGTTACATTATTGATATTCCAGTTCTGGAAATCTCTT TTTCAGATGTGGGATTTCACAATCCATTTTCTAATGTTGGTATTTTTTTT ATTATAATAGATGAGACTTGATTAATAAGGATTTTAAAATGTAGCAATCT TTCCAGTTATTGTTCCAATCAAGCTAGGACTAATTCCCCTTCCCTTTAAA AAAGTGAGATATTGGAACAATGACCCATTGGAACCATGACCCAACTTCTT AAAAAGAAAGTCCTAGCCTCTATTTTTCATGTTTTTTTTCTGTTATCTTT TTTAAAACCACGCATTAGAGTCAAACAATGAACATGAGGTTTTGGATTTC ACGATTAGAGGTTTCAAGTTGGTAAAATGAAAAACTATATTTTGTTCTTT TAATTATCAATCACTGTTAAAATCGTCTTTTTTGAATTTTTTCTCTACTC CTTCAGTCTTTGTTCACTTTTTGATATATATTTTTTGAGGCTATGGTCTT CATGTATCAAATTTTACCTAACCCTAATCTTTTTTTATGCATTACATAAT AACCATTTGGACTTAAAATTTTTGTGTTTTTTATGACTTCTAAGGGCTGT CTACTGATTTTTTGAGTAATATGTCAAAGGCTTTTCCATCCTAAATTTAT TTATGTCTACTAAAAAAGATGGTAGTTTAGTCTCAAAGTCAGCGAACTTA ATTAGGAAAAATTTGCTATGATTTTCGTTTAGATAGGGACCAAGACTTAA AAAATGCCTGGTAATAAAAACAAATCAAGGAAAGGAACGAATCTGAAAAA 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TCATGAAACTCAATTTTTCCAATTCAAATGATTACTCTAACCAAATTAAA CAAAGAACCAGCGACTTTGATTAGAAATATGGAACTAACTTTTTAAGTAG ACTTCCCTTAGGCAAATCTGTACACATAGAATTGAAACGAAACAAAACCT TTTATGCACCTACAAAACCCATTAAAATGACATCATCATAATTTTAAATT AACAAGAAAAATGGTGTTTGTGCAAACTTGTCCTAGTTTAAAATTCAATT TAAAAGTAGAAGAATCTTTAAATTTCTGGTTTTCAACCAGATATAAAAAT AGCATACTCTAGTGTTCCACCTTAACTTTCCTTGAAATAGCCAGGGCTGG AATTATTTGAAGCTTTAGGGGTACCTACCTGGATGATCCTGCCTAGCAAC CAACTGCTGAGGAAAACACTTTTTCGTCTGCTACGCTGTTCAAAAACTAC CCAGACATATCTAACATATTCTCGAGCCCCTTATCGTCACTCTGACTTTC TATGGAAAAGATTCTCGTAGTATGGTAAATTATAGAATTAGAACTCTCAA TCAATACAGATACCATAAAATGGGGGTATATTTAGGGTGTACCTACCTGT CTTATTTTTACTATGGGATCCAAACCTTGTAATTGACGATACAGTGCATT AGCATACATTTTCACATTAGGGGTTTAAAGTTTAGTGACACTGTGAGGGC TAACCATGGTTTGGGCTAAGAGTGGAAATTTTTGAATTTGATACCTCTGC AATGCCTAAAAATGCACTTAAAAAGCAAAGTATCTTAAAATGACAAAATA AGGAAAAAATTATCCTTCAAAAATCTATTGGATGGGGGAGGGGCTAGCTA CGGCACTGTTATGAATAACTTTTCCTTTCTTCTTCTCTATTACAGAGTTG CCAAGAGATGGACCTCTCCAAGAAGACAGAATATCCAACCTTTGCACGAA CCACCACATTGAATCGTGACGTCATCTACATGATTATTACTATGCTTAAA AAGTTCAAGTGGAAAAAATTTGCTGTCATGTATGAGAGGTAATGACACCT TTTGCTAATACGTAATAGTCTGAACATGAGAAATTCGATTCCCTAAGAAT TTATAGTTTCAAATCACTCTCATTTTAGTGCTTTAACTGGTTTAGTGTGA AAACTACCTTCAAAAACGTATTCAATAGTCCAAGATGGTACTAGGCTATC AATTATACAGTTACCTCTCTCTAATTCGATCTTCAAGGGGCCAAGAATTT TCTTCGAACTACAGAAAGATTCGAATTAGAGAGAGTTGGCTGTATATCTT TGAGATGACGTTTCGGTGTGGTTTGCTCTGGTTACGTTTCTGACATTGCT TGCAGTATTTTTCCTGACTAGAACAACAACTATATCTTATAATTATCTTC TGTTATTTTTGTCATAACTAGGTCGCACATTTGGGACGCGGTATACACAG CACTGAAGAAGGAGAGCGAAAACATGGCAGATTTACAAATGACATTAATT AAAAGTTATGAGAAAACGGATAGTTTCTTGTATTATTACGACTCGTTGGA ACACATTTTCGAACCGTTTTTAAATGAATGTCAACGGAAAGCGAGAAGTA AGCTCCTTCTTTAACATCTCTTTCAACCAACATTTTACATATAATATCCT CTCACAAAAGTCGTGAAAACCTTTCTACTTTCGAACTAACCACGTGCGGT TGAGTTTCATGAAAGATGTCACGGATCGTACAGGTTGGCCCTCCTACTAT AGGAGATTTATTATCGAATGAAGTATTTGCTATTGGCTAAAAGGTGTCTT TTAGGTTTTTCGCGTGGCCTTTTTTCGCTGATTCATTGATGTGGATCTGA AAAATACTGAATTTTAACGGTGTACACCTTTGAAATTCAAGTCGAACGTA ATTTATCAATTTAAACGGTTGTCGTTGTTGAAAAATCAATTTCTGACCAT TACATTTTGATGTTGGTCCTCTTTCATGTACACGAGACCTTCCTCAATAT TATATAAAAATGGTTAATCTGAAATTTAAGGTTAGCTTAACAGAAAATTT CTTAGTTTTTTCAGACACTAATTTTGAGATTTTTCCCTTTTGATTTGACA ACGACGACGATTTGAGAAGGACGCGTGAAGGATTAGCTGTGGTTTTTGTC CCCCTATTCCATTCTGTTCTAAATCCATTAACAGCTTATAGCTGAAGTTA CCGTTACTTTCGGTTGTGGTTTTTAGCCCTAACTATCAGCTGCGGCTTGT GAATTTTGGATGTATAACTGTCAACTGCGTTTATTAGTCCTACCTTGTCC TAAAGCAAATGCACGACTATTGATTCTATCACCTATGATATAATCTGAAA GGAATTTTCGTTTTAATGGCATCGTAAGCCTTTAACGACTGAGTGACGTC ACTAAGACTTAGATAATCGGCATCTTCAAAAAGTCATGTTTATAATCCAT CCCAGTCACGTATTGTTGCGGTTTCAGCTAATGACCTTTTTATCATCTAA TTAACGAAATCAACTGAACGAAACTAGTTAATCTATTTTTCTTCGAACTG GGTCTTTGAGGAAAAATTGTGTGACATGATAATAATGACGACACTATTTT TTCTTTTTCCAACGATTATATTTCTTTTTATCTTTTTCCCTTGTCCTTAA AGTTTTAAGGGTTTAAATTGTAACTCGCAGATATACTTAGATTTATCTCG TAAATCAGAGAAGTCCCTAAAAATGATGTACTTGGGGGGGGGGTAGAAAT TCTTTTTTACGGTCAGTGGGGGAGGGCTAAAAACCCTGGGAACACTATAA ATCGTGTATAAAGCCCTATTATAGCGTTTCGGTAAACAATCTCAGGTTTT TCATACTATAGTAAACTCTCGCTTATTCGAACTTCTATCATCCGAACTTA TTCCCAGTCCCCGTCAAGGAGAAACCTTCTTATAATATACTTTCCATAGT TCGAATCTTTCTGTAACTCGAACAAATAAGATTCCCCGATCGTGTTCGAA TTAGCGAGAGTCAACCGTATTTCATTTTTTCATTTACAGCCGTGTTATTG ATGTTGGAAATTCTTTTTTTATTGAGTTGTGGGGACTAAAGAACCCAGAG AAATTTATGGTGTGTATAAAGCCCTATGTAGCATTTCGAAACACCATCTA TGACATGGTTTTTCTTACTATTCCCTTCTTTCATTTTTCAGTCGTGTTAT TGATGTTGGACAAAGGGAAACTTCAACAATTTATGATGATGGCCAGCAAG AAGAATATGACAAACGGTGATTACGTATTTATCGCCGTTCATCCGTTCGC CACTAGCGAGACGTTTTTACGGAACACTCATAGTTTATACGATTACGTTT GGATCTTGCCGTGGATGGGTTACCATGGTGACGGGAACGGTGATAATTCA TTCTTCTTCGGCACTAAAGAAGAAATGGTGAAAGCATATCAAGGACTCTT CCTACTAATGCCTCAGGTATACATCTCTGTTTTTAAACAACCGCCAATCT TTTTTTTAAATACCGCCCATCTTTTAAAAAAACCGCCCATCTCAATAGAC AAATCTTTTATAAAAAGAGCAGTTAGATTATTCCAATGAAAAACTTAAAA TATTCGAATATATGATTTCCTCGAATTACAACTTTTTCCCAGTTTTATCT ATGAGCGGACCTCTCTCCTAGAGAAAAATTACACCTGGTACCTAATGCAG ACCTAGGTTTTAATGCTTATTGTCATTTATTATATATGAGCGGACCTCTC TACGAGCAAAATAACATTGGGCTTTTCCAGAAATAGTCCGTGCCCTGCCC TGTTGAGGATATCGGATATCCAGGGAGTTAACGATTTTTGCTCAAAAGTG GATATCCAGGGGGTTAAATATCTACAAGGGAGCGGATATCCAGGGGGTGA GGTGTCTTTTCAAGTAAAAAATACGATATCCAGGGGTAAGCATCTTTATA AGAGAGGATATCCAGGGGGGTGAGCATATTTTAAGAGTGGATATCCAGGG GGTGTTTACTAATAAAGAAGGATATCCAGGGGGGTTCGATACTTCGAAAG ATCAATATCCTCAACAGTGGGGGAAATTTTTTTTCTGGAAAAGCCCATCG GGTACCCAAGGACAAACCTAGGTGTCCATGACATTGATCAATTTTACTTT TCCGAATTTGATTTTAAAAGTGATAGAAAGGGGTACAAACAGTATGCTTG TATAATATTATAAACCACTGCAGTCTCTCTGGTTTCACTAAAATCAAATC ACATTTTCGTTGTAGATCCCATCAGTAGAAGGAGATCAGCACAAGAAATT CAAGGATTTTCAAGACCGCGTCCGTAAAGGCATGTCTAGACCTCCATTCA ACAGTGAAGTTTACAATGGTGAACTTAAAGATGTTGTCAAATCAAAGAAA CAAGCCAAGGTAAGGGTTTGTTTTTCTTTTCGCTGCGATGCGTTCACTCA ATACTACCGAGTTTATGTATGTGTGTTTTTCAGCGACGGAGACGGTAAGG TTCTAATTTGACTAGATCATGACCAACCGAGGACAAGCGCAAACACATAA ACTCGCTACTGTCTGTTACTGGTCTGTTTGTTCTTCATTGTGTATTGACA CTATTGACACTATTGACACTCATAAAGTTAATATAAAAATTCGAAATTTT TACGACCAACATAAGCTTGTCACCGATCGCAATCATGGAATTATTTCCCT TTGTTGAACGAATTTTGTGTTCAAAAAGTGTCATCAAACTCATTTTGTTT CTTCACTTCCTCATTCAGCCACCACCAGAAGCTCACCAACTGTATGATGC AGTCATGTTGTACGCTCACGGATTGAACAAAACGTTATCCAAAGGATACA GTGTAACCAATGGATCTGATATTATCCAAAATATCCTCAACACTCGTCAC GAGAGTAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00022636TCONS_00022636Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00022635TCONS_00022635Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00022634TCONS_00022634Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00022636-proteinTCONS_00022636-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000429supercontigsc0000429:27040..69947 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.18 1.88 1.35 0.63 12.25 9.79 14.27 15.25 9.36 10.2 9.76 8.49 24.61 26.82 5.92 8.41 9.2 12.89 32.33 39.74 10.83 11.58 5.11 7.76 13.64 18.03 13.65 6.94 7.26 6.62